RESUMO A Fapesp é hoje a mais sólida agência de apoio a pesquisa do país. Foi forjada ao longo de quase oito décadas, com forte inspiração do positivismo em suas origens. Seu modelo jurídico influenciou todas as demais fundações estaduais similares do país, associando a garantia constitucional de estabilidade orçamentária e a gestão autônoma que destina 95% de seus recursos orçamentários à pesquisa, em todas as áreas do conhecimento. Em 60 anos, a agência acumulou sucessos em programas como a formação de recursos humanos qualificados, pesquisa básica e aplicada competitiva em bioenergia, agricultura, medicina, biodiversidade, oceanografia, astronomia, física, matemática, computação, ciências sociais, além do apoio à inovação e à cooperação entre academia e empresas. A Fapesp foi o berço da internet, da genômica e da bioinformática no país, e recentemente teve papel proeminente na reação da sociedade paulista à pandemia de Covid-19.

ABSTRACT Fapesp is today the most solid research agency in Brazil. Strongly inspired by Positivism in its origins, it was forged over nearly eight decades. Its legal model influenced all other similar State foundations in the country, associating the constitutional guarantee of budgetary stability with an autonomous management that allocates 95% of its budget to research, in all areas of knowledge. In 60 years, the agency has accumulated successes in programs such as capacity building, competitive basic and applied research in bioenergy, agriculture, medicine, biodiversity, oceanography, astronomy, physics, mathematics, computing, social sciences, in addition to supporting innovation and cooperation between academia and businesses. Fapesp was the cradle of the internet, genomics and bioinformatics in Brazil, and has recently played a prominent role in the response of São Paulo’s society to the Covid-19 pandemic.

Objetivo : Este estudo avalia polimorfismos (SNPs) do NR3C1 na população brasileira, que possui origem étnica heterogênea. Materiais e métodos : SNPs do NR3C1 foram avaliados em brasileiros de ancestralidade caucasiana, africana ou japonesa (n = 380). Em um subgrupo (n = 40), os genótipos foram comparados à sensibilidade aos glicocorticoides (GC), previamente avaliada por cortisol plasmático (PF) e salivar (SF) após supressão com dexametasona (DEX), ensaio de afinidade do receptor ao GC (K d ) e inibição por DEX de 50% da proliferação de mononucleares estimulada por concanavalina-A (IC 50 ). Discriminação alélica de p.N363S (rs6195), p.ER22/23EK (rs6189-6190) e BclI (rs41423247) foi realizada por PCR em tempo real. Éxons 3 a 9 e transições éxon/íntron foram amplificados e sequenciados. Resultados : Frequências genotípicas (%) foram: rs6195 (n = 380; AA:96,6/AG:3,14/GG:0,26), rs6189-6190 (n = 264; GG:99,6/GA:0,4), rs41423247 (n = 264; CC:57,9/CG:34,1/GG:8,0), rs6188 (n = 155; GG:69,6/GT:25,7/TT:4,7), rs258751 (n = 150; CC:88,0/CT:10,7/TT:1,3), rs6196 (n = 176; TT:77,2/TC:20,4/CC:2,4), rs67300719 (n = 137; CC:99,3/CT:0,7), e rs72542757 (n = 137; CC:99,3/CG:0,7). Enquanto rs67300719 e rs72542757 foram exclusivos dos nipodescendentes, p.N363S e p.ER22/23EK estavam ausentes nesses indivíduos. p.ER22/23EK foi exclusivo dos descendentes de caucasianos. Equilíbrio de Hardy-Weinberg foi observado, exceto nos nipodescendentes para rs6188 e rs258751 e nos afrodescendentes para p.N363S. K d , IC 50 , PF ou SF basal ou após DEX foram semelhantes entre os genótipos. Entretanto, a dose média de DEX que suprimiu PF ou SF diferiu entre os genótipos BclI (P = 0,03), sendo maior nos carreadores GG (0,7 ± 0,2 mg) comparada aos GC (0,47 ± 0,2 mg) e CC (0,47 ± 0,1 mg). Conclusão : As frequências genotípicas dos SNPS de NR3C1 na população brasileira são semelhantes a outras populações. BclI foi associado à alteração da sensibilidade ao GC no eixo hipófise-adrenal.

Objective : The Brazilian population has heterogeneous ethnicity. No previous study evaluated NR3C1 polymorphisms in a Brazilian healthy population. Materials and methods : We assessed NR3C1 polymorphisms in Brazilians of Caucasian, African and Asian ancestry (n = 380). In a subgroup (n = 40), we compared the genotypes to glucocorticoid (GC) sensitivity, which was previously evaluated by plasma (PF) and salivary (SF) cortisol after dexamethasone (DEX) suppression tests, GC receptor binding affinity (K d ), and DEX-50% inhibition (IC 50 ) of concanavalin-A-stimulated mononuclear cell proliferation. p.N363S (rs6195), p.ER22/23EK (rs6189-6190), and BclI (rs41423247) allelic discrimination was performed by Real-Time PCR (Polymerase Chain Reaction). Exons 3 to 9 and exon/intron boundaries were amplified by PCR and sequenced. Results : Genotypic frequencies (%) were: rs6195 (n = 380; AA:96.6/AG:3.14/GG:0.26), rs6189-6190 (n = 264; GG:99.6/GA:0.4), rs41423247 (n = 264; CC:57.9/CG:34.1/GG:8.0), rs6188 (n = 155; GG:69.6/GT:25.7/TT:4.7), rs258751 (n = 150; CC:88.0/CT:10.7/TT:1.3), rs6196 (n = 176; TT:77.2/TC:20.4/CC:2.4), rs67300719 (n = 137; CC:99.3/CT:0.7), and rs72542757 (n = 137; CC:99.3/CG:0.7). The rs67300719 and rs72542757 were found only in Asian descendants, in whom p.N363S and p.ER22/23EK were absent. The p.ER22/23EK was observed exclusively in Caucasian descendants. Hardy-Weinberg equilibrium was observed, except in the Asian for rs6188 and rs258751, and in the African for p.N363S. The K d , IC 50 , baseline and after DEX PF or SF did not differ between genotype groups. However, the mean DEX dose that suppressed PF or SF differed among the BclI genotypes (P = 0.03). DEX dose was higher in GG- (0.7 ± 0.2 mg) compared to GC- (0.47 ± 0.2 mg) and CC-carriers (0.47 ± 0.1 mg). Conclusion : The genotypic frequencies of NR3C1 polymorphisms in Brazilians are similar to worldwide populations. Additionally, the BclI polymorphism was associated with altered pituitary-adrenal axis GC sensitivity.

Muitos estudos relatam o aumento da expressão de S100 A7 (psoriasina) em lesões neoplásicas. Destacam-se trabalhos em carcinoma da mama, espinocelular da bexiga, pele e cavidade oral. Não foi demonstrada expressão da S100 A7 em câncer de laringe. OBJETIVO: Identificar a expressão da proteína ligadora de cálcio S100 A7 e sua correlação com carcinomas espinocelular da laringe. MATERIAL E MÉTODOS: Amostras de tecido neoplásico de 63 pacientes foram submetidos à imunohis toquímica com o anticorpo S110 A7. Os resultados foram classificados e comparados. RESULTADOS: O grupo bem diferenciado teve a maior pontuação de falha no tratamento. O grupo moderadamente diferenciado apresentou escores mais elevados do que o grupo pouco diferenciado. Pontuações mais altas predominaram nos estágios I e II no grupo moderadamente diferenciado, enquanto a distribuição do escore foi mais homogênea em estados avançados (III e IV). Em relação às falhas no tratamento, o grupo pontuação zero (04/03 complicações: 75%) diferiu significativamente da pontuação restante (13/59: 22%). CONCLUSÕES: A S100 A7 foi expressa em 93,7% dos casos de câncer de laringe, com maior positividade nos tumores mais diferenciados e taxa significativamente menor de falha no tratamento. A pontuação obtida não teve impacto sobre a sobrevivência.

Many studies have reported increased expression of S100 A7 (psoriasin) in neoplastic lesions. Among them are studies on breast carcinoma, bladder squamous cell carcinoma, skin tumors and oral cavity squamous cell carcinoma. The expression of S100 A7 has not been described for laryngeal cancer. OBJECTIVE: This study aims to identify the expression of the calcium-binding protein S100 A7 and its correlation with squamous cell carcinomas of the larynx. MATERIAL AND METHODS: Specimens from 63 patients were submitted to immunohistochemistry testing with antibody S100 A7. Results were classified and compared. RESULTS: The group with highly differentiated tumors had the highest treatment failure scores. Moderately differentiated tumors had higher treatment failure scores than poorly differentiated tumors. Higher scores were predominantly seen on stages I and II in moderately differentiated tumors, whereas score distribution was more homogeneous in advanced stage disease (III and IV). Regarding failure in treatment, the group scoring zero (3/4 complications: 75%) differed significantly from the remaining groups (13/59: 22%). CONCLUSIONS: S100 A7 marker was expressed in 93.7% of laryngeal cancer cases, with higher positive correlation rates in more differentiated tumors and significantly lower rates of treatment failure. Scores had no impact on survival rates.

A suscetibilidade individual ao câncer envolve fatores como mudanças na expressão dos oncogenes e genes supressores de tumores e, também, diferenças em genes específicos que regulam a ação de enzimas metabólicas e de reparo do DNA. Estudos epidemiológicos relacionando polimorfismos genéticos e câncer têm mostrado riscos relativos tênues. Pesquisas abordando simultaneamente a prevalência de polimorfismos genéticos e a exposição a fatores ambientais podem conduzir a resultados relevantes para a compreensão da etiologia do câncer e dos mecanismos da carcinogênese e, ainda, trazer novas contribuições sobre o prognóstico da doença. No presente artigo, discute-se a lógica da epidemiologia molecular na pesquisa em câncer, ressaltando-se o exame de polimorfismos genéticos nos estudos caso-controle e de coorte, bem como os fatores que podem introduzir vieses e confusão. Assim como na pesquisa epidemiológica clássica, na epidemiologia molecular é necessário avaliar aspectos relacionados à precisão e à acurácia na fase de planejamento do estudo.

Individual cancer susceptibility seems to be related to factors such as changes in oncogenes and tumor suppressor genes expression, and differences in the action of metabolic enzymes and DNA repair regulated by specific genes. Epidemiological studies on genetic polymorphisms of human xenobiotics metabolizing enzymes and cancer have revealed low relative risks. Research considering genetic polymorphisms prevalence jointly with environmental exposures could be relevant for a better understanding of cancer etiology and the mechanisms of carcinogenesis and also for new insights on cancer prognosis. This study reviews the approaches of molecular epidemiology in cancer research, stressing case-control and cohort designs involving genetic polymorphisms, and factors that could introduce bias and confounding in these studies. Similarly to classical epidemiological research, genetic polymorphisms requires considering aspects of precision and accuracy in the study design.

A suscetibilidade individual ao câncer envolve fatores como mudanças na expressão dos oncogenes e genes supressores de tumores e, também, diferenças em genes específicos que regulam a ação de enzimas metabólicas e de reparo do DNA. Estudos epidemiológicos relacionando polimorfismos genéticos e câncer têm mostrado riscos relativos tênues. Pesquisas abordando simultaneamente a prevalência de polimorfismos genéticos e a exposição a fatores ambientais podem conduzir a resultados relevantes para a compreensão da etiologia do câncer e dos mecanismos da carcinogênese e, ainda, trazer novas contribuições sobre o prognóstico da doença. No presente artigo, discute-se a lógica da epidemiologia molecular na pesquisa em câncer, ressaltando-se o exame de polimorfismos genéticos nos estudos caso-controle e de coorte, bem como os fatores que podem introduzir vieses e confusão. Assim como na pesquisa epidemiológica clássica, na epidemiologia molecular é necessário avaliar aspectos relacionados à precisão e à acurácia na fase de planejamento do estudo.

Individual cancer susceptibility seems to be related to factors such as changes in oncogenes and tumor suppressor genes expression, and differences in the action of metabolic enzymes and DNA repair regulated by specific genes. Epidemiological studies on genetic polymorphisms of human xenobiotics metabolizing enzymes and cancer have revealed low relative risks. Research considering genetic polymorphisms prevalence jointly with environmental exposures could be relevant for a better understanding of cancer etiology and the mechanisms of carcinogenesis and also for new insights on cancer prognosis. This study reviews the approaches of molecular epidemiology in cancer research, stressing case-control and cohort designs involving genetic polymorphisms, and factors that could introduce bias and confounding in these studies. Similarly to classical epidemiological research, genetic polymorphisms requires considering aspects of precision and accuracy in the study design.

OBJETIVO: A leucemia promielocítica aguda (LPA) apresenta uma boa resposta ao tratamento com o ácido all trans retinóico (ATRA). Entretanto, alguns pacientes desenvolvem uma complicação grave chamada síndrome do ácido retinóico (SAR). O objetivo deste estudo foi comparar as características hematológicas e imunofenotípicas de pacientes com LPA que desenvolveram a SAR com as daqueles que não a desenvolveram. MÉTODOS: Foram analisados retrospectivamente os prontuários, exames radiológicos, lâminas de esfregaço de sangue e medula óssea de 71 pacientes com LPA, dos quais a análise imunofenotípica havia sido realizada em 56 casos. Foram identificados oito casos de SAR que, do ponto de vista clínico, caracterizaram-se por insuficiência respiratória (n=8), insuficiência renal (n=2), febre (n=5), ganho ponderal (n=3), edema periférico (n=3) e derrame pleural (n=5). As seguintes variáveis foram comparadas entre pacientes com e sem SAR: dosagem de hemoglobina, contagens de leucócitos e plaquetas no sangue periférico, distribuição dos subtipos hipergranular e variante, percentagens de blastos CD33+, CD13+, CD117+ na medula óssea, intensidade e variação dos valores de fluorescência destes antígenos nas células leucêmicas, expressas através dos canais medianos (CMFs) e dos coeficientes de variação (CVs) de fluorescência, respectivamente. RESULTADOS: A incidência da SAR foi de 11,26% e o tempo médio para seu desenvolvimento 11,5 dias do início do tratamento. Todos os pacientes apresentaram desconforto respiratório agudo, por vezes associado à febre, ganho de peso, edema e insuficiência renal. Os achados radiológicos mais comuns foram: opacidades em vidro fosco, derrame pleural, espessamento peribrônquico e aumento da trama vascular pulmonar. Nenhuma das variáveis laboratoriais analisadas correlacionou-se significativamente ao risco de desenvolvimento da SAR, entretanto as Odd Ratios para CMF para o CD117 > 30 ua e CV para o CD33 < 50 foram de 7,14 (P=0,08) e de 7,86 (P=0,06), respectivamente. CONCLUSÃO: A incidência e as características da SAR neste grupo de pacientes brasileiros foi semelhante à descrita na literatura. Nenhum dos parâmetros estudados correlacionou-se significativamente a um maior risco de desenvolvimento desta complicação.

BACKGROUND: Acute Promyelocytic Leukemia (APL) is characterized by its good response to treatment with all trans retinoic acid (ATRA). However, some patients receiving ATRA develop a serious complication called retinoid syndrome (RS). The objective of this study was to compare the hematological and immunophenotypic features of APL patients who developed RS with those who did not. METHODS: We reviewed the medical records, roentgenograms, peripheral blood smears and bone marrow aspirates from 71 APL patients. Immunophenotypic analyses were available in 56 of these cases. Eight cases of RS were detected, whose clinical presentation was characterized by respiratory distress (n=8), impairment of the renal function (n=2), fever (n=5), weight gain (n=3), edema (n=3) and/or pleural effusion (n=5). The following variables were compared in patients with and without RS: hemoglobin levels, leukocyte and platelet counts, frequency of hypergranular and variant morphological subtypes, percentages of CD33+, CD13+, CD117+ blasts in the bone marrow, fluorescence intensity and variation of these markers in the leukemic cells, expressed as the median channel of fluorescence (MCF) and fluorescence coefficient of variation (CV), respectively. RESULTS: RS incidence was 11.26% and the average time for syndrome development was 11.5 days after starting ATRA treatment. All patients presented acute respiratory distress. Other symptoms included fever, weight gain, edema and renal insufficiency. The main radiological findings were ground glass opacities, increased vascular pedicle and peribronchial cuffing. There was no significant correlation between the variables selected and the risk of development of RS, however the Odds Ratios for patients presenting MCF for CD117 > 30 ua and CV for CD33 < 50 were of 7.14 (P=0.08) and 7.86 ( P=0.06), respectively. CONCLUSIONS: The incidence, as well as the clinical, radiological and laboratory features of RS in this group of Brazilian APL patients were similar to those described in literature. None of the variables studied were significantly correlated to a higher risk of developing RS.

As doenças hereditária da hemoglobina são as mais comuns doenças monogênicas e atualmente bem conhecidas do ponto de vista molecular, fato este que propiciou um avanço no seu controle e manuseio. A população brasileira caracteriza-se pela multiplicidade étnica e a caracterização da Hb D torna-se importante por este dado, associado ao fato de que os métodos de detecção das hemoglobinopatias comumente não identificam esta fração anormal que apresenta a peculiaridade de migração eletroforéticia em pH alcalino na mesma zona observada nas Hb S e G. Neste relato é apresentado um estudo familiar no qual é empregada metodologia adequada, o HLPC, que permite a identificação da Hb D.

Inherited disorders of hemoglobin, the most common monogenic disease, are now well understood at the molecular level, knowledge, which has led to considerable improvements in their control and management. The Brazilian population is multiethnic, and the correct characterization of the Hb D is important, mainly because the method available for detection of abnormal hemoglobins, present a migration in the same zone at alkaline pH, for Hb S, D, and G for example. In this paper we studied a family with an abnormal hemoglobin like S in alkaline electrophoresis, by appropriated methods including HPLC and molecular analysis, characterized as hemoglobin D Los Angeles.

Resistência à proteína C ativada associada à mutação do fator V Leiden (FVL) é a mais prevalente causa genética de trombose venosa conhecida, sendo encontrada em 20 a 60% dos pacientes com trombofilia. Adicionalmente, uma associação entre a mutação do FVL e predisposição aumentada para doença cardiovascular prematura em mulheres foi recentemente descrita. No presente estudo nós determinamos a prevalência da mutação do FVL em 440 indivíduos (880 cromossomos) de 4 grupos étnicos diferentes: caucasóides, negros africanos, asiáticos e ameríndios. Amplificação por PCR seguida de digestão com a enzima de restrição MnlI foi utilizada para definição do genótipo. A mutação do FVL foi encontrada em heterozigose em 4 de 152 caucasóides (2,6%), 1 de 151 ameríndios (0,6%) e esteve ausente em 97 negros africanos e 40 asiáticos. Nossos resultados confirmam que o FVL apresenta distribuição heterogênea em diferentes populações humanas, fato que pode contribuir para diferenças étnicas e geográficas na prevalência de doenças trombóticas. Adicionalmente, estes dados podem ser úteis para a definição de estratégias de rastreamento desta mutação em indivíduos sob risco para desenvolvimento de trombose, na população brasileira.

Inherited resistance to activated protein C caused by the factor V Leiden (FVL) mutation is the most common genetic cause of venous thrombosis yet described, being found in 20-60% of patients with venous thrombophilia. A relationship between the FVL mutation and an increased predisposition to arterial thrombosis in young women was recently reported. We assessed the prevalence of the FVL mutation in 440 individuals (880 chromosomes) belonging to four different ethnic groups: Caucasians, African Blacks, Asians and Amerindians. PCR amplification followed by MnlI digestion was employed to define the genotype. The FVL mutation was found in a heterozygous state in four out of 152 Whites (2.6%), one out of 151 Amerindians (0.6%), and was absent among 97 African Blacks and 40 Asians. Our results confirm that FVL has a heterogeneous distribution in different human populations, a fact that may contribute to geographic and ethnic differences in the prevalence of thrombotic diseases. In addition, these data may be helpful in decisions regarding the usefulness of screening for the FVL mutation in subjects at risk for thrombosis.

A determinação da distribuição do alelo ApoE em cinco tribos de índios sulamericanos revelou ausência do alelo ApoE2, acompanhada por freqüência alta do alelo ApoE3 e baixa do alelo ApoE4 na maioria das tribos, uma distribuição previamente relatada apenas para os esquimós Inuit da Groenlândia.

Determination of the ApoE allele distribution in five South American Amerindian tribes revealed absence of the ApoE2 allele, accompanied by high ApoE3 and low ApoE4 allele frequencies for most tribes, a distribution only previously reported for the Inuit Eskimo from Greenland.

A freqüência de marcadores virais para hepatite B (HBV), C (HCV), vírus da imunodeficiência humana-1 (HIV-1) e vírus linfotrópico-T humano (HTLV-1) foi avaliada em 32 pacientes brasileiros multitransfundidos, portadores de ß-talassemia. Adicionalmente determinou-se a concentração sérica de transaminase alani-na aspártica (ALAT) e de ferritina. Os resultados mostraram alta prevalência de marcadores para HBV (25,0%) e HCV (46,8%) e baixa prevalência de marcadores para HIV-1 e HTLV-1. Não se demonstrou correlação entre a presença de marcadores para hepatite e o número de unidades transfundidas ou com as concentrações séricas de ferritina e ALAT.

The frequency of viral markers for hepatitis B (HBV) and C (HCV), human immunodeficiency virus-1 (HIV-1) and human T-lymphotropic virus-1 (HTLV-1) was evaluated in 32 Brazilian ß-thalassemia multitransfused patients. Additionaly the serum concentrations of ferritin and alanine aspartate transaminase (ALAT) were determined. The results show a high prevalence of markers of infection by HBV (25.0%) and HCV (46.8%) and a low prevalence of markers for HIV-1 and HTLV-1. No correlations were demonstrated between the presence of the hepatitis markers and the number of units transfused or the serum concentrations of ferritin and ALAT.