Abstract: BRS 500 B2RF is a high-yielding cotton cultivar with transgenic resistance to lepidopteran pests and tolerance to the herbicide glyphosate. Additionally, BRS 500 B2RF has resistance to Ramularia leaf spot and partial resistance to root-knot nematode. It represents an important contribution to sustainable cotton production in Brazil.

Abstract BRS 372 and BRS 416 are cotton cultivars with high lint yield and genetic resistance to the main cotton diseases in Brazil, particularly to Ramularia Leaf Spot. They have stable yields, good fiber quality and can contribute to a sustainable cotton disease management in tropical environments.

Abstract Cultivar BRS 433FL B2RF is a high-quality fiber upland cotton with high lint yield potential and resistance to several diseases. The introgressed transgenic events Bollgard II® and Roundup Ready Flex® confer enhanced resistance to lepidopteran pests and tolerance to the herbicide glyphosate, respectively. Fiber length exceeds 32.5 mm and fiber strength 33 gf tex-1.

RESUMO Para a semeadura direta é preciso adequada quantidade de palha sobre o solo, e devido ao longo ciclo do algodoeiro, sua persistência deve ser alta. Entretanto, como a decomposição dos resíduos vegetais ao longo do tempo pode variar entre as plantas de cobertura, o ajuste de modelos que melhor a descreva é essencial. Dois modelos de regressão não-linear, exponencial (ME) e Michaelis-Menten (MM), foram ajustados à decomposição de matéria seca de plantas de cobertura no sistema de semeadura direta do algodoeiro, em condições do Cerrado goiano. Três experimentos foram instalados no ano de 2012, cada um consistido de uma espécie de planta de cobertura, sendo Urochloa ruziziensis (braquiária ruziziensis), Pennisetum glaucum (milheto) e Cajanus cajan (guandu). Em cada ensaio, procedeu-se a amostragem da palha da planta de cobertura aos 20, 50, 70, 110, 140 e 170 dias após a semeadura do algodoeiro, para determinação da matéria seca remanescente. Para as três plantas de cobertura o modelo MM apresentou melhor ajuste que o ME. As estimativas dos tempos de meia-vida das palhadas via MM diferiram entre as plantas de cobertura, indicando que cada uma possui velocidade de decomposição específica. Para o milheto, o guandu e a braquiária, as estimativas de tempo de meia-vida pelo ME foram superiores às do MM em 9, 12 e 12 dias, respectivamente.

ABSTRACT No-tillage cotton systems require soil coverage with cover crop residue for a longer time due to the late cycle of cotton. However, decomposition rates may vary between cover crops, and the adjustment of models to describe it is critical to no-tillage cotton management. Two non-linear regression models, exponential (EM) and Michaelis-Menten (MM), were adjusted to dry matter decomposition of cover crops in a cotton no-tillage system, in Brazil. Three field trials were performed in 2012 for the cover crops Urochloa ruziziensis (brachiaria), Pennisetum glaucum (pearl millet), and Cajanus cajan (pigeon pea). Samples of cover crop were collected at 20, 50, 70, 110, 140, and 170 days after sowing upland cotton to measure dry matter decomposition. MM showed better adjustment than EM for all cover crops. The estimations of half-life parameters were different between the cover crops, suggesting that each cover crop has its own rate of decomposition. For pearl millet, brachiaria, and pigeon pea, the half-life estimation by exponential model was over the MM in 9, 12, and 12 days.

Abstract Transgenic cotton cultivars BRS 430 B2RF and BRS 432 B2RF, medium and late season respectively, were developed by EMBRAPA in partnership with Bahia Foundation, aiming to create a high-yielding germplasm. The Bt toxins Cry1Ac and Cry2Ab target lepidopteran pests and the CP4-EPSPS gene confers tolerance to the herbicide glyphosate.

Abstract Cotton cultivar BRS 368RF was developed by EMBRAPA in a partnership with the Bahia Foundation, aiming to create high-yielding germplasm by adding transgenic traits addressed to Brazilian Savanna (cerrado) of the Northeast and North regions. BRS 368RF is a midseason cultivar and has yield stability and transgenic tolerance to glyphosate.

Resumo: O objetivo deste trabalho foi identificar marcadores polimórficos de sequências simples repetidas (SSR) para identificação varietal de algodão e avaliação da distância genética entre as variedades. Inicialmente, 92 marcadores SSR foram genotipados em 20 cultivares de algodão do Brasil. Desse total, 38 locos foram polimórficos, dos quais dois deles foram amplificados por um único par de iniciadores; o número médio de alelos por loco foi 2,2. Os conteúdos de informação polimórfica (PIC) e de poder de discriminação (DP) foram, em média, 0,374 e 0,433, respectivamente. A distância genética média foi de 0,397 (mínima de 0,092 e máxima de 0,641). Um painel de 96 variedades originárias de diversas regiões do mundo foi avaliado por 21 locos polimórficos derivados a partir de 17 pares de iniciadores selecionados. Entre essas variedades, a distância genética média foi de 0,387 (mínima de 0 e máxima de 0,786). Os dendrogramas elaborados a partir de média aritmética não ponderada (UPGMA) não refletiram as regiões do Brasil (20 genótipos) ou do mundo (96 genótipos), onde as variedades ou linhagens foram selecionadas. O procedimento de reamostragem bootstrap mostra que a identificação dos genótipos é viável com 19 locos. Os marcadores polimórficos avaliados são úteis na identificação varietal de um painel amplo de variedades de algodão e podem ser aplicados em estudos de diversidade da espécie.

Abstract: The objective of this work was to identify polymorphic simple sequence repeat (SSR) markers for varietal identification of cotton and evaluation of the genetic distance among the varieties. Initially, 92 SSR markers were genotyped in 20 Brazilian cotton cultivars. Of this total, 38 loci were polymorphic, two of which were amplified by one primer pair; the mean number of alleles per locus was 2.2. The values of polymorphic information content (PIC) and discrimination power (DP) were, on average, 0.374 and 0.433, respectively. The mean genetic distance was 0.397 (minimum of 0.092 and maximum of 0.641). A panel of 96 varieties originating from different regions of the world was assessed by 21 polymorphic loci derived from 17 selected primer pairs. Among these varieties, the mean genetic distance was 0.387 (minimum of 0 and maximum of 0.786). The dendrograms generated by the unweighted pair group method with arithmetic average (UPGMA) did not reflect the regions of Brazil (20 genotypes) or around the world (96 genotypes), where the varieties or lines were selected. Bootstrap resampling shows that genotype identification is viable with 19 loci. The polymorphic markers evaluated are useful to perform varietal identification in a large panel of cotton varieties and may be applied in studies of the species diversity.

Propõe-se um critério de escolha do número de repetições, r, e de progênies avaliadas, Nr, dadas P parcelas experimentais, com Nr=P/r, e n progênies a serem selecionadas; discute-se sua aplicação na seleção de progênies de populações conduzidas em bulk, oriundas de dois genitores homozigóticos. Conhecida a herdabilidade em nível de parcela, h²0 , há um n crítico abaixo do qual o ganho com a seleção é maior avaliando-se P/(r+1) progênies com r+1 repetições que P/r progênies com r.Foram simulados diferentes cenários de h²0 , nas gerações F2 e F∞, considerando-se ausência de dominância. Mostra-se que, sob qualquer valor de h²0 , se n > 18.5% de P, maiores ganhos são obtidos tomando-se Nr = P, evidenciando a possibilidade do uso de delineamento em blocos aumentados em fases iniciais de programas de melhoramento. Quanto maior h²0 , seleções mais intensas são necessárias para justificar o uso adicional de repetições.

A determination criterion was proposed for the number of replications, r, and of evaluated progenies, Nr, given P experimental plots, with Nr=P/r, and n progenies to be selected; its application was discussed in the selection of progenies of bulk populations, derived from two homozygous parents. For a known heritability at the plot level, h²0, there is a critical n below which the gain is greater with selection evaluating P/(r+1) progenies in r+1 than P/r progenies in r replications. Different h²0 scenarios were simulated in the F2 and F∞ generations, assuming no dominance. It was demonstrated that at any h²0 , if n > 18.5% of P, larger gains are obtained by assuming Nr = P, showing that the augmented block design could be used in the early stages of breeding programs. The higherh²0, the higher must be the selection intensity to justify the use of additional replications.

O objetivo deste trabalho foi estimar a estabilidade e a adaptabilidade da produção de vagens e de sementes de genótipos de amendoim rasteiro com base em metodologias de regressão não linear e análise AMMI. Foram utilizados dados de produtividade de 11 ensaios, distribuídos em seis ambientes e três safras agrícolas, realizados na região Nordeste, no período das águas. Efeitos significativos de genótipos (G), ambientes (A) e da interação GA foram detectados nas análises e indicaram comportamento diferente entre os genótipos em condições ambientais favoráveis e desfavoráveis. Os genótipos BRS Pérola Branca e LViPE‑06 são os mais estáveis e adaptados ao ambiente semiárido, enquanto o LGoPE‑06 é material promissor para a produção de vagens, embora seja altamente dependente de ambiente favorável.

The objective of this work was to estimate the stability and adaptability of pod and seed yield in runner peanut genotypes based on the nonlinear regression and AMMI analysis. Yield data from 11 trials, distributed in six environments and three harvests, carried out in the Northeast region of Brazil during the rainy season were used. Significant effects of genotypes (G), environments (E), and GE interactions were detected in the analysis, indicating different behaviors among genotypes in favorable and unfavorable environmental conditions. The genotypes BRS Pérola Branca and LViPE‑06 are more stable and adapted to the semiarid environment, whereas LGoPE‑06 is a promising material for pod production, despite being highly dependent on favorable environments.

Ainda são insuficientes, nas condições do Cerrado baiano, as informações sobre fontes, doses e formas de aplicação de P para o algodoeiro, importantes para o aumento da produtividade e qualidade da fibra. Em vista disso, o objetivo deste trabalho foi definir fontes, doses e formas de aplicação de P para a cultura do algodoeiro em solo de textura média do Cerrado da Bahia. Para tanto, foi conduzido um experimento, em plantio convencional, utilizando-se o fatorial 2 x 4 x 2 + 7 (fontes P x doses x formas de aplicação + sete tratamentos adicionais (combinações de proporções das fontes e mais o tratamento controle (sem P)), com quatro repetições. As fontes avaliadas foram superfosfato triplo (ST), fosfato de Arad (FA) nas doses de 60, 120, 180 e 240 kg ha-1 de P2O5 aplicadas a lanço ou no sulco de semeadura. Os tratamentos adicionais foram constituídos de proporções de ST e FA para a dose de 100 kg ha-1 de P2O5. Foram avaliadas características de produção (altura de plantas, estande, produtividade, percentagem de fibra, peso médio do capulho), teor de P foliar e P disponível no solo e características de qualidade da fibra. Não houve efeito significativo de fontes, doses e formas de aplicação sobre a produtividade do algodão em caroço. Quanto s características de qualidade da fibra, o uso de fosfato de Arad melhorou a percentagem de fibra e o micronaire, enquanto o superfosfato triplo aumentou o comprimento da fibra. A combinação das duas fontes resultou em maior peso médio do capulho para as proporções 25+75 e 75+25 (ST+FA) em relação 50+50 (ST+FA).

In the Cerrado of Bahia, there is a lack of information about sources, doses and forms of P application to the cotton crop that are important for increasing yield and fiber quality. In this study, an experiment was carried out in conventional tillage, using a 2 x 4 x 2 + 7 factorial scheme [P sources x doses x application forms plus seven additional treatments: combinations of proportions of sources and the control (without P)], with four replications. The P sources that were tested included the triple superphosphate (TS), Arad phosphate (AF) at doses of 60, 120, 180 and 240 kg ha-1 P2O5 broadcasted on the surface or the seed rows. The additional treatments consisted of proportions of TS and FA for the 100 kg ha-1 P2O5. Production characteristics were evaluated (plant height, stand, yield, fiber percentage, medium cotton boll weight), P leaf content and P available in the soil and fiber quality characteristics. There was not significant effect of sources, doses and application methods on cotton yield. Considering the fiber quality characteristics, the use of Arad phosphate improved the fiber percentage and micronaire, while the triple superphosphate increased fiber length. The combination of the two sources resulted in higher medium cotton boll weight to 25 +75 and 75 +25 (TS + AF) proportions compared to 50 +50 (TS + AF).

A troca de informação sobre biodiversidade e a utilização de recursos genéticos podem ser melhor realizadas se os laboratórios que geram as informações puderem demonstrar que seus resultados são confiáveis através de metodologias adequadas de validação. Para definir critérios que sirvam para demonstrar a confiabilidade de resultados em laboratórios onde são realizadas pesquisas com marcadores de DNA, foram analisados erros associados à quantificação de DNA em gel de agarose e à repetitividade e robustez da reação da polimerase em cadeia (PCR) utilizando primers baseados em marcadores microssatélites (SSR). O erro associado à quantificação de DNA foi menor quando 100 ng foram quantificadas, e aumentou para quantidades de DNA maiores, com a tendência de subestimar sua quantidade. O limite de quantificação, entendido como as menores diferenças de quantidade de DNA que o método detecta, variou expressivamente com pequena variação da quantidade de DNA. A incerteza associada ao PCR foi estimada por sua repetitividade, que mostrou-se sensível à quantidade de DNA da reação. A baixa robustez da PCR quanto à quantidade de DNA demonstra a necessidade prioritária de avaliação deste parâmetro. As considerações feitas podem ser auxiliares para que laboratórios de marcadores moleculares utilizem procedimentos de validação.

Biodiversity information exchange and the use of genetic resources can be improved if the laboratories are able to assure their results thought suitable methodologies of validation. Aiming to define criteria which demonstrate the reliability of results in laboratories which work with DNA markers, errors associated to the DNA quantification in agarose gel, PCR repeatability and robustness using microsatellite (SSR) markers were analyzed. The error associated to DNA quantification was smaller when 100 ng of DNA were quantified, and increased for greater amounts of DNA, tending to sub estimations. Quantification limits, or the smallest quantity detected by the method used, varied markedly with small variations on the DNA amounts. Uncertainty associated to microsatellite PCR reaction was measured by its repeatability, which was affected by the quantities of DNA in the reaction. The low robustness of the microsatellite PCR reaction due to sensibility to quantities of DNA showed the priority on evaluating this parameter. The presented methodologies may be useful to laboratories working with molecular markers implementing validation procedures.

O objetivo deste trabalho foi comparar diferentes métodos de estimação da adaptabilidade e estabilidade produtiva em 17 genótipos de algodoeiro avaliados em 23 ambientes do Cerrado brasileiro. Os efeitos de genótipos e ambientes e a interação genótipos x ambientes foram significativos. Os modelos da ecovalência e AMMI indicaram a cultivar BRS Cedro como a mais estável, enquanto as cultivares Delta Penta e BRS Ipê foram identificadas como as mais instáveis; nenhuma delas esteve entre as mais produtivas. De acordo com o método de Eberhart & Russell, Lin & Binns e Annicchiarico, as cultivares BRS 269 - Buriti e FMT 701 e o genótipo CNPA GO 2001-999 foram os mais indicados para plantio no Cerrado, e se destacaram entre as cinco mais produtivas na média dos ambientes. A identificação de adaptabilidades específicas, proporcionada pela análise AMMI, é de grande relevância no estudo do comportamento dos genótipos. Pelo conjunto de informações obtidas e pela facilidade de uso e interpretação, recomenda-se o emprego do método de Lin & Binns , que pode ser complementado pela análise AMMI.

The objective of this work was to compare different methods used to estimate adaptability and stability of 17 cotton genotypes evaluated in 23 locations of the Brazilian savannah. Genotype and environment effects and genotype x environment interaction were significant. According to ecovalence and AMMI models, cultivar BRS Cedro showed the best stability. Varieties Delta Penta and BRS Ipê were among the most unstable genotypes, but not among the most productive. Using the methods of Eberhart & Russel, Lin & Binns and Annicchiarico, genotypes BRS 269 - Buriti, FMT 701 and CNPA GO 2001-999 were the most stable and among the five most productive on average. The evaluation of the specific adaptabilities provided by the AMMI analysis is of great importance in the study of the behavior of genotypes. The amount of information generated and the facilities of interpretation favors Lin & Binns method, which can be complemented by an AMMI analysis.

O delineamento em blocos aumentados é amplamente utilizado em programas de melhoramento, geralmente com tratamentos não-repetidos correspondentes a unidades de seleção, e tratamentos repetidos sendo cultivares comerciais. Originalmente, uma análise intrablocos (modelo fixo) foi sugerida. No entanto, se os tratamentos não-repetidos e/ou blocos puderem ser considerados de natureza aleatória, modelos lineares mistos poderiam ser utilizados. Este estudo objetivou a avaliação de tal abordagem, utilizando simulação. Linhagens endogâmicas foram geradas aleatoriamente, bem como dados de marcação molecular, para estimar a matriz de covariâncias genéticas. Variaram-se a herdabilidade e o coeficiente b de heterogeneidade de solo de Smith; em cada condição, 100 simulações foram feitas, considerando 4 modelos lineares, variando respectivamente a natureza dos efeitos de bloco e de tratamentos não-repetidos (fixo -- F, ou aleatório -- A): FF, FA, AF e AA. Em relação ao modelo FF, os modelos mistos foram mais eficientes especialmente sob herdabilidade baixa a intermediária e alto b. Modelos mistos podem melhorar a inferência em programas de melhoramento utilizando o delineamento, e a escolha do modelo deve se basear no tipo de seleção. Se esta for truncada, o modelo AF deveria ser preferido; se não for, então o modelo AA é mais apropriado.

The augmented block design is widely used in breeding programs, with non-replicated treatments generally being selection units, and replicated treatments being standard cultivars. Originally, an intrablock analysis (fixed model) was proposed. Although non-replicated treatments and/or blocks can be considered of random nature, mixed linear models could be used instead. This work evaluated such an approach, using computer simulation. Populations consisted of sets of randomly generated inbred lines. Molecular marker data were also simulated to allow the estimation of the genetic covariance matrix. Different conditions were considered, varying heritability and the coefficient b of Smith of soil heterogeneity. For each condition 100 simulations were performed, considering four linear models, varying respectively the nature of the effects of blocks and non-replicated treatments (fixed - F, or random - R): FF, FR, RF and RR. In relation to FF, the mixed models were more efficient under low to intermediate heritability and high b. Mixed models could improve inference in breeding programs using the augmented block design and the choice of the model should rely on the kind of selection. If this is truncated, the RF model should be preferred; if it is not, then the RR model would be more suitable.