ABSTRACT: The Amazonian manatee (Trichechusinunguis) is an aquatic mammal threatened with extinction. However, few studies have investigated the pathogens in this species, which may affect both animal and human health. This study aimed to evaluate the frequency, distribution, and patterns of antimicrobial susceptibility of Staphylococcus spp. and Escherichiacoli colonizing the nasal and rectal cavities of Amazonian manatees kept in captivity at the National Institute for Amazonian Research (INPA) in the state of Amazonas, Brazil. Rectal and nasal swabs from 44 manatees of different ages were used in this study. The genus Staphylococcus was isolated from the nasal swabs of 32 (72.7%) animals, with two individuals harboring more than one species of Staphylococcus. S. sciuri was the most commonly isolated species. Resistance to penicillin was observed in 13 (40.6%) isolates, more frequent than the other antimicrobials tested (P = 0.01). E. coli was isolated from the rectal swabs of all animals, with phylogroup B1 being the most frequent among the strains obtained (P = 0.0008). Four isolates (6.8%) were positive for virulence factors, three of which were classified as enterotoxigenicE. coli (ETEC) and one as enteropathogenicE. coli (EPEC). To our knowledge, this is the first study to evaluate Staphylococcus spp. and E. coli in Amazonian manatee samples. This study revealed nasal colonization by Staphylococcus spp., mainly S. sciuri, and diarrheagenicE. coli isolates, including antimicrobial-resistant strains. ABSTRACT Trichechusinunguis (Trichechusinunguis extinction However health frequency distribution spp INPA (INPA Amazonas Brazil 4 3 72.7% 727 72 7 (72.7% animals S 1 40.6% 406 40 6 (40.6% P 0.01. 001 0.01 . 0 01 0.01) E B 0.0008. 00008 0.0008 0008 0.0008) 6.8% 68 8 (6.8% factors enterotoxigenicE ETEC (ETEC enteropathogenicE EPEC. EPEC (EPEC) knowledge samples diarrheagenicE antimicrobialresistant resistant 72.7 (72.7 40.6 (40.6 00 0.0 0000 0.000 000 6.8 (6.8 (EPEC 72. (72. 40. (40. 0. 0.00 6. (6. (72 (40 (6 (7 (4 (

RESUMO: O peixe-boi amazônico (Trichechus inunguis) é um mamífero aquático ameaçado de extinção. Apesar disso, poucos estudos investigaram patógenos nessa espécie que podem impactar a saúde animal e humana. O objetivo deste estudo foi avaliar a frequência, distribuição e padrões de suscetibilidade antimicrobiana de Staphylococcus sp. e Escherichia coli pertencentes à microbiota nasal e retal de peixes-bois da Amazônia mantidos em cativeiro no Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA) (Amazonas, Brasil). Foram utilizados suabes retais e nasais de 44 peixes-boi de diferentes idades. O gênero Staphylococcus foi isolado do swab nasal de 32 (72,7%) animais, sendo que dois indivíduos apresentaram mais de uma espécie de Staphylococcus. S. sciuri foi a espécie mais comumente isolada. A resistência à penicilina foi observada em 13 (40,6%) isolados, sendo mais frequente do que os outros antimicrobianos testados (P = 0,01). Escherichia coli foi isolada dos suabes retais de todos os animais, sendo o filogrupo B1 o mais frequente entre as cepas obtidas (P = 0,0008). Quatro isolados (6,8%) foram positivos para fatores de virulência, três dos quais foram classificados como E. coli enterotoxigênica (ETEC) e um isolado como E. coli enteropatogênica (EPEC). Este é o primeiro estudo a avaliar Staphylococcus spp. e E. coli de amostras de peixe-boi da Amazônia. O estudo revelou colonização nasal por Staphylococcus sp., principalmente S. sciuri, e por isolados diarreiogênicos de E. coli, incluindo cepas resistentes a antimicrobianos. RESUMO peixeboi peixe boi Trichechus inunguis extinção disso humana frequência sp peixesbois peixes bois INPA (INPA Amazonas, Amazonas (Amazonas Brasil. Brasil . Brasil) 4 peixesboi idades 3 72,7% 727 72 7 (72,7% animais S 1 40,6% 406 40 6 (40,6% P 0,01. 001 0,01 0 01 0,01) B 0,0008. 00008 0,0008 0008 0,0008) 6,8% 68 8 (6,8% virulência E ETEC (ETEC EPEC. EPEC (EPEC) spp 72,7 (72,7 40,6 (40,6 00 0,0 0000 0,000 000 6,8 (6,8 (EPEC 72, (72, 40, (40, 0, 0,00 6, (6, (72 (40 (6 (7 (4 (

RESUMO: Pombos urbanos são conhecidos pela sua capacidade de carrear e disseminar diversos agentes zoonóticos. Estudos tem sugerido que pombos são também relevantes na disseminação de estirpes resistentes a múltiplas drogas. No presente estudo, pombos no ambiente de um hospital veterinário foram amostrados em três diferentes períodos e testados para a presença de Escherichia coli patogênica, Salmonella spp., Staphylococcus spp. e Clostridioides (Clostridium) difficile. Isolados de E. coli de 19 pombos (40.4%) foram positivos para o gene codificador da toxina EAST1. O gene codificador de intimina (eae) do patotipo E. coli enteropatogênica foi encontrada em um isolado (2.1%). Salmonella spp. foi encontrada em nove pombos (19.1%), sendo todos isolados do primeiro período de captura (P < 000.1). S. Typhimurium foi isolado de seis animais e S. Heidelberg de três. A tipagem molecular de isolados de Salmonella spp. por ERIC-PCR demonstrou que oito estirpes possuíam alta similaridade genética entre si, sugerindo a ocorrência de um surto de salmonelose nos animais carreadores. Vinte Staphylococcus (42.5%) foram isolados de 18 animais (38.3%). Oito diferentes espécies foram detectadas, sendo S. xylosus a mais frequente. Duas estirpes de C. difficile não-toxigênica (4.3%) foram isoladas. Uma estirpe de S. Typhimurium, uma de S. aureus e um isolado de C. difficile foram classificados como resistentes a múltiplas drogas antimicrobianas. O presente estudo sugere que pombos capturados no ambiente do hospital veterinário podem atuar como reservatórios e disseminadores de bactérias patogênicas e envolvidas em infecção hospitalar, incluindo E. coli diarreiogênica e Staphylococcus sp., C. difficile e Salmonella spp multirresistente.

ABSTRACT: Pigeons are known for their capacity to harbor and spread several zoonotic agents. Studies have suggested that pigeons are also relevant disseminators of multidrug-resistant strains. In this study, pigeons surrounding a veterinary hospital were sampled and tested for the presence of pathogenic Escherichia coli, Salmonella spp., Staphylococcus spp., and Clostridioides (Clostridium) difficile. E. coli isolates from 19 (40.4%) pigeons tested positive for the E. coli heat-stable enterotoxin 1 (EAST1)-encoding gene. The intimin-encoding gene (eae) of enteropathogenicE. coli (EPEC) was found in one isolate (2.1%). Salmonella spp. were found in nine (19.1%) pigeons, all from the first capture event (P < 000.1). S. Typhimurium and S. Heidelberg were isolated from six and three pigeons, respectively. Enterobacterial repetitive intergenic consensus (ERIC-PCR) of the Salmonella spp. isolates suggested that eight of the nine strains had a high genetic similarity, supporting the hypothesis of an outbreak of salmonellosis in these pigeons. Twenty (42.5%) staphylococcal isolates were recovered from 18 (38.3%) pigeons. Eight different species were detected, with S. xylosus being the most frequent. Two (4.3%) C. difficile strains were isolated. Three isolates, one each of S. Typhimurium, S. aureus, and C. difficile, were classified as multidrug-resistant strains. The present research suggested that pigeons residing in urban areas can act as reservoirs and disseminators of pathogenic bacteria, including nosocomial pathogens, such as diarrheagenicE. coli and multidrug-resistant Staphylococcus spp., C. difficile, and Salmonella spp.

RESUMO: Nas últimas décadas, houve um aumento global na adoção de répteis como animais de companhia, principalmente tartarugas e jabutis. Considerando a popularidade dos répteis como animais de estimação no Brasil e a notável falta de dados sobre estafilococos potencialmente patogênicos nesses animais, o objetivo deste estudo foi isolar e avaliar a susceptibilidade antimicrobiana de espécies estafilocócicas de jabutis (Chelonoidis carbonaria) saudáveis no Brasil. Durante um período de 12 meses (fevereiro de 2019 a fevereiro de 2020), suabes cloacais de 66 jabutis saudáveis foram coletados no Centro de Triagem de Animais Silvestres em Belo Horizonte, Minas Gerais, Brasil. Os suabes foram plaqueados em ágar manitol salgado para isolamento de estafilococos e a identificação das espécies foi realizada usando MALDI-TOF MS. A susceptibilidade aos antimicrobianos foi investigada pelo método de difusão em disco, e a presença do gene mecA foi investigada por PCR para detectar resistência à meticilina. Dos animais testados, 72,7% foram positivos para o isolamento estafilocócico. Todos os isolados eram estafilococos coagulase-negativos (CoNS), sendo Staphylococcus sciuri (81,3%) e S. xylosus (12,5%) as espécies mais frequentemente isoladas. A maioria dos isolados (56%) foi resistente a pelo menos um antimicrobiano. Alta frequência de resistência foi observada para penicilina (35,5%) e tetraciclina (29,1%). Todas as estirpes foram sensíveis à cefoxitina, cloranfenicol, ciprofloxacina, eritromicina e gentamicina. Todos os isolados foram negativos para o gene mecA. O presente trabalho sugere que jabutis saudáveis são colonizados principalmente por CoNS, especialmente S. sciuri. Metade dos isolados foram resistentes a pelo menos um antimicrobiano, levantando questões sobre o possível papel desses animais como reservatórios de genes de resistência aos antimicrobianos.

ABSTRACT: In the last few decades, there has been a global increase in the adoption of reptiles as companion animals, mainly turtles and tortoises. Considering the popularity of reptiles as pets in Brazil, and a notable lack of data about potentially pathogenic staphylococci in these animals, this study isolated and evaluate the antimicrobial susceptibility of staphylococcal species from healthy tortoises (Chelonoidis carbonaria) in Brazil. During a 12-month period (February 2019 to February 2020), cloacal swabs from 66 healthy tortoises were collected at the Wild Animals Screening Center in Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil. The swabs were plated onto mannitol salt agar for staphylococci isolation, and species identification was performed using MALDI-TOF MS. Antimicrobial susceptibility was investigated using the disk diffusion method, and the presence of the mecA gene was investigated by PCR to detect methicillin resistance. Of the tested animals, 72.7% were positive for staphylococcal isolation. All isolates were coagulase-negative staphylococci (CoNS), and Staphylococcus sciuri (81.3%), and S. xylosus (12.5%) were the most frequently isolated species. The majority of the isolates (56%) were resistant to at least one antimicrobial agent. A high frequency of resistance was observed for penicillin (35.5%) and tetracycline (29.1 %). All strains were susceptible to cefoxitin, chloramphenicol, ciprofloxacin, erythromycin, and gentamicin. All isolates were negative for the mecA gene. The present work suggests that healthy tortoises are mainly colonized by CoNS, especially S. sciuri. Half of the isolates were resistant to at least one antimicrobial, raising questions regarding the possible role of these animals as reservoirs of antimicrobial resistance genes.

RESUMO: Apesar da reconhecida importância de Clostridium perfringens como enteropatógeno de pequenos ruminantes, pouco se sabe sobre a frequência dos genótipos ou do papel de fatores de virulência adicionais de C. perfringens em cabras saudáveis, dificultando o diagnóstico laboratorial da infecção causada por esse micro-organismo. Dessa forma, o presente estudo teve como objetivo caracterizar C. perfringens de amostras de fezes de cabras adultas saudáveis. Amostras de fezes de 250 cabras saudáveis de 17 rebanhos diferentes em Minas Gerais, Brasil, foram submetidas ao isolamento e genotipagem de C. perfringens. C. perfringens tipo A foi isolado de 189 (75,6%) cabras, enquanto C. perfringens tipos C e D foram detectados em um animal (0.4%) cada. Todos os isolados foram negativos para os genes codificadores das toxinas NetB, NetE, NetF e enterotoxina. Os resultados apresentados confirmam C. perfringens tipo A como parte da microbiota de cabras saudáveis e sugere que C. perfringens tipos C e D são raramente encontrados em caprinos saudáveis.

ABSTRACT: Despite the known importance of Clostridium perfringens as an enteropathogen in small ruminants, little is known about the role of its additional virulence factors or the frequency of the various C. perfringens genotypes in healthy goats; this complicates the laboratory diagnosis of the infections caused by this microorganism. In light of this, the aim of the present study was to isolate and genotype C. perfringens from stool samples from healthy goats in Brazil. Stool samples from 250 apparently healthy adult goats from 17 different herds in Minas Gerais, Brazil were collected, and isolation and genotyping of C. perfringens was performed. C. perfringens type A was isolated from 189 (75.6%) goats, whereas C. perfringens types C and D were each detected in one goat (0.4%). All isolates were negative for enterotoxin-, NetB-, NetE-, and NetF-encoding genes. These results confirmed C. perfringens type A as part of the microbiota in these animals, and they suggested that C. perfringens type C and D are rarely isolated from healthy goats.