Abstract Brycon amazonicus is a species native to Brazil, with significant socioeconomic importance and immense potential for fish production. It is the second most cultivated species in the Amazon. The lack of specific molecular markers limits genetic research. This study aimed to identify species-specific microsatellite markers for B. amazonicus and analyze the genetic diversity of four fish farms: Nova Mutum, Instituto Nacional de Pesquisa da Amazônia, Jatuarana, and Nova Airão. In addition, the transferability of these markers to species of the same genus (B. orbignyanus, B. falcatus, and B. gouldingi) was evaluated. Seventeen primer pairs were developed using the enriched library method. Eight of these were used for the genetic analysis of B. amazonicus stocks. In total, 47 alleles were identified. The mean endogamy coefficient (FIS) was negative and significant for Nova Mutum stocks. However, the populations of B. amazonicus in Instituto Nacional de Pesquisa da Amazônia (0.179), Jatuarana (0.099), and Nova Airão were positive and nonsignificant. Analysis of molecular variance showed that most of the variation was observed within the populations evaluated (57%), and genetic differentiation (FST = 0.423) among the stocks was high. Bayesian analysis indicated that the best number of genetic clusters was K = 3. Transferability testing showed successful amplification (90%) of the primers by estimating the allele size between 144 and 294 base pairs (bp) and a total of 24 alleles for the related Brycon species. This indicates the high potential of microsatellites for the analysis of diversity and population genetic structure in both the genus Brycon and family Characidae. Brazil production Amazon research speciesspecific B farms addition (B orbignyanus falcatus gouldingi method 4 identified FIS (FIS However 0.179, 0179 0.179 , 0 179 (0.179) 0.099, 0099 0.099 099 (0.099) nonsignificant 57%, 57 57% (57%) FST 0.423 0423 423 3 90% 90 (90% 14 29 bp (bp 2 Characidae 017 0.17 17 (0.179 009 0.09 09 (0.099 5 (57% 0.42 042 42 9 (90 1 01 0.1 (0.17 00 0.0 (0.09 (57 0.4 04 (9 0. (0.1 (0.0 (5 ( (0. (0
Resumo Brycon amazonicus é uma espécie nativa do Brasil, de grande importância socioeconômica e com grande potencial para a produção de peixes. É a segunda espécie mais cultivada na Amazônia. A falta de marcadores moleculares específicos tem limitado a pesquisa genética. O objetivo deste estudo foi desenvolver marcadores microssatélites específicos para B. amazonicus e analisar a diversidade genética em quatro fazendas de peixes: Nova Mutum; Instituto Nacional de Pesquisa da Amazônia; Jatuarana; e Nova Airão. Além disso, foi avaliada a transferibilidade desses marcadores para espécies do mesmo gênero (Brycon orbignyanus, Brycon falcatus e Brycon gouldingi). Dezessete pares de iniciadores foram desenvolvidos usando o método de biblioteca enriquecida. Oito desses foram usados na análise genética de estoques de B. amazonicus. Um total de 47 alelos foi identificado. O coeficiente de endogamia médio (FIS) foi negativo e significativo para os estoques de Nova Mutum. No entanto, as populações de B. amazonicus no Instituto Nacional de Pesquisa da Amazônia (0,179), Jatuarana (0,099) e Nova Airão foram positivas e não significativas. A análise de variância molecular mostrou que a diferenciação genética mais significativa foi encontrada dentro das populações (57%), e a diferenciação genética (FST= 0,423) entre os estoques foi alta. A análise bayesiana indicou como número de grupos genéticos como K = 3. Os testes de transferibilidade mostraram uma amplificação bem-sucedida (90%) dos primers, estimando o tamanho dos alelos entre 144 e 294 pares de bases (pb) e um número total de alelos 24 para as espécies Brycon relacionadas. Isso indica o alto potencial dos microssatélites para a análise da diversidade e estrutura genética de populações tanto no gênero Brycon quanto na família Characidae. Brasil peixes B Mutum disso orbignyanus gouldingi. gouldingi . gouldingi) enriquecida 4 identificado FIS (FIS entanto 0,179, 0179 0,179 , 0 179 (0,179) 0,099 0099 099 (0,099 significativas 57%, 57 57% (57%) FST= FST (FST 0,423 0423 423 alta 3 bemsucedida bem sucedida 90% 90 (90% primers 14 29 pb (pb 2 relacionadas Characidae 017 0,17 17 (0,179 0,09 009 09 (0,09 5 (57% 0,42 042 42 9 (90 1 01 0,1 (0,17 0,0 00 (0,0 (57 0,4 04 (9 0, (0,1 (0, (5 ( (0