Resumo O gene do hormônio de crescimento (GH) desempenha um papel vital na regulação do metabolismo animal e do tamanho corporal, tornando-se um potencial candidato para influenciar o desempenho do gado. Este estudo teve como objetivo investigar os polimorfismos dentro do gene GH e suas associações com 10 características biométricas na população de gado Sumbawa da Indonésia. Dados de características biométricas e amostras de sangue foram coletados de 112 indivíduos de gado Sumbawa, e suas sequências genéticas do gene GH foram analisadas usando dois conjuntos de primers para amplificação. Sete polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) foram identificados no gene GH: g.442C>T, g.446G>C, g.558C>T, g.649C>A, g.1492C>A, g.1510C>A e g.1578G>A. Todos os SNPs estavam localizados na região intrônica, exceto o SNP g.558C>T, que foi encontrado na região da sequência de codificação (CDS). O SNP g.558C>T é classificado como uma variante sinônima. A análise de haplótipos revelou um forte desequilíbrio de ligação entre os SNPs g.558C>T e g.649C>A. As distribuições de genótipos e alelos de todos os SNPs estavam de acordo com o equilíbrio de Hardy-Weinberg (p > 0,05, χ2 < 15,56), exceto para os SNPs g.446G>C e g.1492C>A. O estudo de associação mostrou que o SNP g.442C>T afetou significativamente (p < 0,05) as características HL, BL, SH e PH no gado Sumbawa. Além disso, o g.446G>C e o g.558C>T também foram encontrados associados às características PH e CC, respectivamente. Os polimorfismos detectados no gene GH podem ter implicações para programas de seleção visando melhorar as características biométricas desejadas no gado Sumbawa. A melhoria da produtividade pecuária pode ser feita através da compreensão da diversidade genética e sua relação com as características fenotípicas. (GH corporal tornandose tornando se 1 Indonésia 11 amplificação (SNPs g442CT gCT g 442C T C g446GC gGC 446G G g558CT 558C g649CA gCA 649C g.649C>A g1492CA 1492C g.1492C>A g1510CA 1510C g1578GA gGA 1578G g.1578G>A intrônica CDS. CDS . (CDS) sinônima HardyWeinberg Hardy Weinberg p 005 0 05 0,05 χ 15,56, 1556 15,56 , 15 56 15,56) HL BL disso CC respectivamente fenotípicas CT GC CA GA (CDS 00 0,0 155 15,5 5 0, 15,
Abstract The growth hormone (GH) gene plays a vital role in regulating animal metabolism and body size, making it a potential candidate for influencing livestock performance. This study aimed to investigate the polymorphisms within the GH gene and their associations with 10 biometric traits in the Sumbawa cattle population of Indonesia. Biometric trait data and blood samples were collected from 112 Sumbawa cattle individuals, and their GH gene sequences were analyzed using two sets of primers for amplification. Seven single nucleotide polymorphisms (SNPs) were identified in the GH gene: g.442C>T, g.446G>C, g.558C>T, g.649C>A, g.1492C>A, g.1510C>A, and g.1578G>A. All SNPs were located in the intronic region except for SNP g.558C>T, which was found in the coding sequence (CDS) region. The SNP g.558C>T is classified as a synonymous variant. Haplotype analysis revealed a strong linkage disequilibrium between SNPs g.558C>T and g.649C>A. Distributions of genotypes and alleles of all SNPs were in agreement with the Hardy-Weinberg equilibrium (p > 0.05, χ2 < 15.56), except for SNPs g.446G>C and g.1492C>A. The association study showed that the SNP g.442C>T significantly (p < 0.05) affected HL, BL, SH, and PH traits in Sumbawa cattle. Additionally, the g.446G>C and g.558C>T were also found to be associated with PH and CC traits, respectively. The polymorphisms detected in the GH gene could have implications for selection programs to enhance desired biometric traits in Sumbawa cattle. Improving livestock productivity can be done by understanding genetic diversity and its relationship with phenotypic characteristics. (GH size performance 1 Indonesia 11 individuals amplification (SNPs g442CT gCT g 442C T C g446GC gGC 446G G g558CT 558C g649CA gCA 649C A g.649C>A g1492CA 1492C g.1492C>A g1510CA 1510C g.1510C>A g1578GA gGA 1578G g.1578G>A CDS (CDS variant HardyWeinberg Hardy Weinberg p 005 0 05 0.05 χ 15.56, 1556 15.56 , 15 56 15.56) HL BL SH Additionally respectively characteristics CT GC CA GA 00 0.0 155 15.5 5 0. 15.