Abstract Recent molecular tools and technologies have marked the discovery of the origin and domestication processes of a wide variety of species, using either genomic or mitochondrial molecular markers to provide input for selection programs, as well as the management and conservation of animal breeds. This study aimed to analyze genes of mitochondrial DNA of the following sheep (Ovis aries) breeds: Pantaneira, Bergamácia, Dorper, White Dorper, Ile de France and Hampshire Down, to obtain their population genetic parameters and investigate the origin of these sheep populations reared in the State of Mato Grosso do Sul. The analysis of mitochondrial DNA allowed to infer their phylogenetic relationships and revealed significant differences among them when compared with each other and with sequences obtained from GenBank. Through the formation of haplotypes, it was noted that the Pantaneira breed served as the maternal basis for the formation of the other breeds reared in the region, and it was possible to suggest a European origin for the sheep populations studied.

O sequenciamento de Sanger, ou identificação das bases moleculares do DNA por terminação da cadeia, é um dos métodos amplamente utilizados para estudos moleculares. O uso da região citocromo b do DNA mitocondrial como marcador molecular se justifica pela presença de regiões conservadas e variáveis que podem ser sequenciadas e utilizadas em análises filogenéticas em diferentes níveis taxonômicos. O objetivo deste trabalho foi avaliar a variação do DNA mitocondrial por meio de sequenciamento de Sanger. Para tanto, amostras de tecido sanguíneo de ovinos do grupamento genético Pantaneiro (n=14), Bergamácia (n=4), Dorper (n=5) e Ile de France (n=5) foram utilizadas para extração de DNA. Logo em seguida as amostras foram submetidas a procedimentos de amplificação, purificação e sequenciamento. As análises estatísticas foram realizadas nos programas BioEdit 7.3.1.0 e MEGA 5.10. A utilização de primers internos e externos possibilitou o sequenciamento de 86% da região do citocromo b, o que indicou menor perda de nucleotídeos que acontece na reação de sequenciamento com apenas um par de primers. Os cálculos de diversidade média da região sequenciada permitiram observar baixa variação genética na população, evidenciando a natureza conservada do DNA herdado maternalmente. O sequenciamento parcial da região do citocromo b foi capaz de mostrar a variação do DNA mitocondrial em ovinos de 4 raças diferentes e proporcionou gerar dados para a realização de estudos futuros de origem e evolução dos animais.