Resumo O objetivo deste trabalho foi avaliar a resposta fotossintética de variedades de citros submetidas à inoculação dos isolados T30 e T3 de Citrus tristeza virus (CTV) caracterizados como tendo potencial para conferir proteção cruzada a citros contra isolados severos de CTV. Plantas de citros de laranja 'Campbell', limão 'Tahiti' e limão 'Galego' foram submetidas à inoculação de ambos os isolados por “patch”. Plantas não inoculadas foram utilizadas como controle. A expressão dos sintomas, as taxas fotossintética e de transpiração, e a condutância estomática foram avaliadas por IRGA. A densidade e o tamanho estomáticos foram avaliados por impressões epidérmicas. Os isolados de CTV também foram avaliados e caracterizados molecularmente por RT-PCR e sequenciamento de Sanger. As plantas de laranja 'Campbell' e limão 'Tahiti' permaneceram assintomáticas após as inoculações. Os tratamentos de inoculação com ambos os isolados de CTV não reduziram capacidade fotossintética, taxas de transpiração e condutância estomática, em comparação ao controle. A densidade e o tamanho estomáticos variaram de acordo com a espécie. T30 e T3 não afetam as respostas fotossintéticas de laranja 'Campbell' e limão 'Tahiti'; portanto, estes isolados têm potencial para promover proteção cruzada a variedades de citros contra isolados severos de CTV. T (CTV Campbell, Campbell , Tahiti 'Tahiti Galego 'Galego patch. patch . “patch” controle sintomas IRGA epidérmicas RTPCR RT PCR Sanger 'Campbell inoculações espécie portanto “patch

Abstract The objective of this work was to evaluate the photosynthetic response of citrus varieties to the inoculation of isolates T30 and T3 of Citrus tristeza virus (CTV) characterized as having potential to provide cross-protection against severe CTV isolates in citrus. Citrus plants of 'Campbell' orange, 'Persian' lime, and 'Key' lime were subjected to inoculations by both isolates by patch. Noninoculated plants were used as the control. Symptom expression, photosynthetic and transpiration rates, and stomatal conductance were evaluated by IRGA. Stomatal density and size were evaluated by epidermal impressions. The CTV isolates were also evaluated and molecularly characterized by RT-PCR and Sanger sequencing. 'Campbell' orange and 'Persian' lime plants remained asymptomatic after the inoculations. The inoculation treatments with both CTV isolates did not reduce photosynthetic capacity, transpiration rate, and stomatal conductance, in comparison with the control. Stomatal density and size varied according to the citrus species. T30 and T3 do not affect the photosynthetic responses of 'Campbell' orange and 'Persian' lime; therefore, these isolates have the potential to provide cross-protection to citrus varieties against severe isolates of CTV. T (CTV crossprotection cross protection Campbell 'Campbell Persian 'Persian Key 'Key patch control expression rates IRGA impressions RTPCR RT PCR sequencing capacity rate species therefore

Abstract. The importance of the Tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV) in the tomato and pepper crops in the world has created the need to investigate and test alternatives for its management. Preventive tactics are the best option to manage a viral disease, so the objective of this study was to evaluate the effectiveness of sodium hypochlorite, ethyl alcohol, quaternary ammonium salts, liquid soap and milk powder dissolved in water, applied by spraying and immersion of razor blades infested with the virus and inoculating mechanically on Nicotiana rustica and N. benthamiana leaves. A completely randomized design with five repetitions was used and the experimental unit was the area of a tobacco leaf delimited by a rectangle, and the response variable was the number of local lesions/cm2 (LL/cm2). A non-parametric analysis and a Kruskal Wallis test for comparison of means were used to evaluate the treatments, and significative differences were found (Ji<.0001). Sodium hypochlorite (spraying) and the subsequent application of milk prevented the appearance of local lesions and the transmission of ToBRFV. While the worst treatments were ethyl alcohol (immersion) with an average of 12 LL/cm2, and quaternary ammonium salts (immersion) with 3.22 LL/cm2. The rest of the treatments significantly reduced the number of LL/cm2 (<1), but did not prevent the appearance of systemic symptoms in the inoculated plants.

Resumen. La importancia del Tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV) en el cultivo de jitomate y pimiento ha creado la necesidad de investigar y probar alternativas para su manejo, por lo que el objetivo del presente estudio fue evaluar la efectividad del hipoclorito de sodio, alcohol etílico, sales cuaternarias de amonio, jabón líquido y leche en polvo disuelta en agua, aplicados por aspersión e inmersión en navajas infestadas con ToBRFV e inoculadas sobre Nicotiana rustica y N. benthamiana. Se utilizó un diseño completamente al azar con cinco repeticiones y la unidad experimental fue el área de una hoja de tabaco delimitada por un rectángulo, la variable respuesta fue el número de lesiones locales/cm2 (LC/cm2). Se utilizó un análisis no paramétrico y una prueba de Kruskal Wallis de comparación de medias para evaluar los tratamientos, encontrando diferencias significativas (Ji<.0001). El hipoclorito de sodio (aspersión) y la posterior aplicación de la leche evitaron la aparición de lesiones locales y la transmisión del ToBRFV. Mientras que los peores tratamientos fueron el alcohol etílico (inmersión) con un promedio de 12 LC/cm2 y las sales cuaternarias de amonio (inmersión) con 3.22 LC/cm2. El resto de los tratamientos redujeron significativamente el número de LC/cm2 (<1), pero no evitaron la aparición de síntomas sistémicos en las plantas inoculadas.

RESUMO O virus do tomate rugoso marrom (tomato brown rugose fruit virus - ToBRFV) é um vírus emergente que ameaça a produção de tomate e pimenta em diferentes países. Este trabalho teve como objetivo avaliar o efeito da infecção do ToBRFV na morfologia vegetal e na qualidade do fruto em oito variedades de pimenta malagueta e propor uma escala diagramatica para avaliar a severidade em folhas infectadas considerando a porcentagem de área foliar afetada. Dezesseis tratamentos foram testados, que incluíram oito variedades de pimentão e duas condições experimentais (inoculadas e não inoculadas). Cinco dias após o transplante, plantas de cada variedade de pimenta foram inoculadas mecanicamente com ToBRFV e as variáveis morfológicas e de qualidade dos frutos foram avaliadas. A comparação das médias de cada variedade inoculada versus não inoculada foi realizada com o teste t de Student (P ≤ 0,05) para grupos independentes. O ToBRFV infectou todas as variedades inoculadas causando lesões necróticas locais, clorose, mosaico, mosqueamento, necrose do caule, ampulação, deformação, enrolamento e necrose da folha; da mesma forma, foram observadas plantas assintomáticas. O ToBRFV afetou significativamente a altura, número de entrenós, número de flores, peso fresco da raiz, peso médio do fruto, número de sementes e diâmetro polar-equatorial do fruto. A variedade de pimenta habanero apresentou a menor severidade da doença, enquanto a maior severidade foi observada na variedade de pimenta serrano ‘Tampiqueño’.

ABSTRACT Tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV) is an emerging virus that threatens tomato and chili production worldwide. The objective of this work was to evaluate the effect of ToBRFV infection on plant morphology and fruit quality in eight varieties of pepper and to propose a diagrammatic scale to evaluate severity in infected leaves considering the percentage of affected leaf area. Sixteen treatments were tested, consisting in eight varieties of chili and two experimental conditions (inoculated and non-inoculated). Five days after transplanting, each chili variety was mechanically inoculated with ToBRFV and morphological and fruit quality variables were evaluated. The comparison of means of each inoculated versus non-inoculated variety was performed with the t-Student test (P ≤ 0.05) for independent groups. ToBRFV infected all inoculated plants causing local necrotic lesions, chlorosis, mosaic, mottling, stem necrosis, ampulation, deformation, rolling and leaf necrosis depending of the variety; likewise, asymptomatic plants were observed. ToBRFV significantly affected height, number of internodes, number of flowers, fresh root weight, average fruit weight, number of seeds, and polar-equatorial diameter of the fruit. The habanero chili showed the least severity, while the highest severity was shown in the serrano chili ‘Tampiqueño’.

RESUMEN El Tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV) es un virus emergente que amenaza la producción de tomate y chile en todo el mundo. Esta investigación tuvo como objetivo evaluar el efecto de la infección del ToBRFV en la morfología de la planta y calidad de frutos en ocho variedades de chile y proponer una escala diagramática para evaluar la severidad en hojas infectadas considerando el porcentaje de área foliar afectada. Se probaron 16 tratamientos, que incluyeron ocho variedades de chile y dos condiciones experimentales (inoculado y no inoculado). Cinco días después del trasplante, cada variedad de chile se inoculó mecánicamente con ToBRFV y se evaluaron variables morfológicas y de calidad de frutos. La comparación de medias de cada variedad inoculada versus no inoculada se realizó con la prueba t-Student (P ≤ 0.05) para grupos independientes. El ToBRFV infectó a todas las variedades inoculadas ocasionando lesiones locales necróticas, clorosis, mosaico, moteado, necrosis de tallo, ampulación, deformación, enrollamiento y necrosis de hoja; asimismo, se observaron plantas asintomáticas. El ToBRFV afectó significativamente la altura, número de entrenudos, número de flores, peso fresco de raíz, peso promedio de fruto, número de semillas y diámetro polar-ecuatorial del fruto. La variedad chile habanero mostró la menor severidad, mientras que la mayor severidad se observó en la variedad de chile serrano ‘Tampiqueño’.

Abstract. Several Corynespora cassiicola isolates obtained from roselle (Hibiscus sabdariffa) and nine associated weeds to this crop were morphological and phylogenetically analyzed. The fungal isolates were divided into two groups: group one included 37 isolates obtained from H. sabdariffa and eight obtained from other host plants including Solanum lycopersicum, Chromolaena odorata, Senna alata, Eugenia oerstediana, Passiflora viridiflora, Momordica charantia, Ricinus communis and Gossypium hirsutum; in this case, the predominant colonies were gray, dense texture and polygonal in shape. Group two included two isolates obtained from H. sabdariffa and one from Hyptis suaveolens; in this group the colonies were mainly cream and pale brown, dense and round. Comparative analysis with isolates of C. cassiicola from other countries showed that group one isolates were mainly associated with those isolated from the Solanaceae family, while those from group two were related to those of the Cucurbitaceae family. To our knowledge, this is the first study on the morphological and genetic characterization of C. cassiicola in Mexico.

Resumen. Se analizaron morfológica y filogenéticamente diferentes aislados de Corynespora cassiicola obtenidos de jamaica (Hibiscus sabdariffa) y nueve malezas asociadas al cultivo. Los aislados fúngicos se dividieron en dos grupos: el grupo uno incluyó 37 aislados obtenidos de H. sabdariffa y ocho obtenidos de otros hospedantes como Solanum lycopersicum, Chromolaena odorata, Senna alata, Eugenia oerstediana, Passiflora viridiflora, Momordica charantia, Ricinus communis y Gossypium hirsutum; en este caso, las colonias predominantes fueron de color gris, textura densa y forma poligonal. El grupo dos, incluyó a dos aislados obtenidos de H. sabdariffa y uno de Hyptis suaveolens; en este grupo, las colonias fueron principalmente de color crema y café pálido, densas y redondeadas. El análisis comparativo con aislados de C. cassiicola de otros países mostró que los aislados del grupo uno referidos anteriormente se asociaron principalmente con aquellos aislados de la familia Solanaceae, mientras que los del grupo dos se relacionaron con los de la familia Cucurbitaceae. Para nuestro conocimiento este es el primer estudio sobre la caracterización morfológica y genética de C. cassiicola en México.

RESUMO A mancha de folhas e cálices da jamaica, causada por Corynespora cassiicola, é a principal limitante fitossanitária da cultura da vinagreira (Hibiscus sabdariffa) no Estado de Guerrero, México, provocando perdas significativas na produção. Para seu controle, se avaliou a eficácia biológica de vários produtos químicos (convencionais e alternativos) na safra de 2014 e 2015. O estudo foi conduzido nos municípios de Ayutla e Tecoanapa, Guerrero, sob condições de campo e de pressão do inoculo natural. As Substâncias químicas (tratamentos) foram aplicadas em intervalos de 7 e 14 dias. Em cada tratamento, a gravidade nas folhas e cálices, bem como o peso fresco e seco para cada unidade experimental foi registrado. O ensaio se estabeleceu num desenho experimental de blocos causalizados com quatro repetições. Os dados foram submetidos a análise de variância e testes de separação (Tukey-Kramer, α = 0.05). A menor severidade da doença e o maior ganho no peso fresco e seco de cálices foi observado nos tratamentos com mancozebe, clorotalonil e benomyl alternado com oxicloreto de cobre.

RESUMEN El manchado de hojas y cálices de la jamaica, causado por Corynespora cassiicola, se considera la principal limitante fitosanitaria del cultivo de jamaica (Hibiscus sabdariffa) en el Estado de Guerrero, México, causando pérdidas significativas de la producción. Para su control, se evaluó la efectividad biológica de diversas substancias químicas (convencionales y alternativas) durante los ciclos de producción 2014 y 2015. El estudio se realizó en los municipios de Ayutla y Tecoanapa, Guerrero, bajo condiciones de campo y presión natural de inóculo. Las substancias químicas (tratamientos), se aplicaron a intervalos de 7 y 14 días. En cada tratamiento, se registró la severidad en hojas y cálices, así como el peso fresco y seco de cada unidad experimental. El ensayo se estableció bajo un diseño bloques al azar con cuatro repeticiones. Para el análisis de los datos se realizó un análisis de varianza y pruebas de separación de medias (Tukey-Kramer, α=0.05). La menor severidad de la enfermedad y mayor peso fresco y seco de cálices se obtuvo en plantas tratadas con mancozeb, clorotalonil y benomilo alternado con oxicloruro de cobre.

Abstract. Currently, it is of strategic importance to have fast and accurate diagnostic tools that allow us to know if the material of interest is infected with a quarantine or economic important virus. For this reason in the present work we designed a pair of specific oligonucleotides for the detection of ToBRFV by RT-PCR, considering a region of the coding sequence of the RdRP located in the ORF1 and the methodology to detect it was standardized. Additionally, the amplicons were cloned and sequenced, the products were used to predict the evolutionary relationship between ToMMV, ToMV, TMV and ToBRFV by the Maximum Likelihood method. The results indicated that the oligonucleotides designed in the present work allows the identification of fast and specific ToBRFV.

Resumen. En la actualidad es de importancia estratégica contar con herramientas de diagnóstico rápido y preciso que permitan conocer si el material de interés está infectado con algún virus de importancia cuarentenaria o económica. Por tal motivo, en el presente trabajo se diseñó un par de oligonucleótidos específicos para la detección del ToBRFV por RT-PCR, considerando una región de la secuencia codificante de la RdRP localizada en el ORF1 y la metodología para detectarlo fue estandarizada. Adicionalmente, los amplicones fueron clonados y secuenciados, los productos fueron usados para predecir la relación evolutiva entre ToMMV, ToMV, TMV y ToBRFV por el método Maximum Likelihood. Los resultados indicaron que los oligonucleótidos diseñados en el presenté trabajo permiten la identificación de manera rápida y específica del ToBRFV.

Abstract. In a high-tech greenhouse located at Atlacomulco, Mexico State, incidences from 60 to 90% of plants showing symptoms associated to begomoviruses have been observed. The objectives of this study were to identify the begomoviruses present, to know if they are transmitted by seed, to determine the species of whitefly and if they are carriers of the virus. Leaves of adult symptomatic plants were analyzed with universal primers for begomoviruses. Seeds of fruits from positive plants were seeded to obtain seedlings; seeds and seedlings were analyzed by PCR for begomoviruses. Adults whiteflies were analyzed with specific primers to the mitochondrial gene of the cytochrome C oxidase subunit I and universal primers for begomoviruses. Sequences of PCR products from symptomatic plants had 99% of identity with Tomato severe leaf curl virus (ToSLCV). No begomoviruses were detected in seed and seedlings. Sequences from the whiteflies present in the greenhouse had an identity of 99% with Bemisia tabaci and they were carriers of ToSLCV. This is the first report of ToSLCV infecting tomato grown in greenhouse in Mexico.

Resumen. En un invernadero de alta tecnología ubicado en Atlacomulco, Estado de México, se han observado incidencias del 60 al 90% de plantas con síntomas típicos de begomovirus. Los objetivos del presente estudio fueron identificar begomovirus presentes, conocer si se transmiten por semilla, determinar la especie de mosca blanca y si ésta es portadora de los virus. Hojas de plantas adultas con síntomas se analizaron con oligonucleótidos universales para begomovirus. Semillas de frutos de plantas positivas a begomovirus se sembraron en almácigos para obtener plántulas, éstas y parte de las semillas se analizaron por PCR para detectar begomovirus. Adultos de mosca blanca se analizaron con oligonucleótidos específicos del gen mitocondrial de la subunidad I del citocromo C oxidasa y con oligonucleótidos universales para begomovirus. Las secuencias de los productos obtenidos por PCR de plantas con síntomas tuvieron una similitud de 99% con el Tomato severe leaf curl virus (ToSLCV). No se detectaron begomovirus en semilla y plántula. Las secuencias obtenidas por PCR de mosca blanca en el invernadero tuvieron 99% de similitud con Bemisia tabaci y los individuos analizados fueron portadores del ToSLCV. Este es el primer reporte del ToSLCV asociado a tomate en invernadero en México.

Abstract. Cucumber mosaic virus (CMV) causes one of the most important viral diseases in wild and cultivated plants worldwide. Research on CMV in Mexico has been scarce, and due to the economic impact on plant health and wide host range, it is necessary to carry out studies on its presence and distribution in the agricultural geographical areas of the state of Colima. In this study, four CMV isolates identified by RT-PCR, DNA sequencing and phylogenetic analysis are reported: CMV-Vin from periwinkle (Catharanthus roseus), CMV-Chi from jalapeño pepper (Capsicum annuum), and CMV-Tom from saladette tomato (Solanum lycopersicum). In addition, the presence of CMV from cantaloupe melon (Cucumis melo) (CMV-Mel) was confirmed. The nucleotide sequences from CMV-Vin, CMV-Chi, and CMV-Mel clustered with CMV isolates from subgroup IB, while CMV-Tom clustered with members of subgroup IA. A satellite RNA sequence, without necrogenic domain, was detected only in CMV-Vin (satRNA Vin). This study reports for the first time the presence of CMV in periwinkle, pepper and tomato plants, and of an RNA satellite from periwinkle in Colima, Mexico.

Resumen. El Cucumber mosaic virus (CMV) ocasiona una de las enfermedades virales más importantes a nivel mundial en plantas silvestres y cultivadas. En México son pocos los estudios que se han abordado con este virus, y dada su amplia gama de hospedantes e impacto económico, es necesario contar con mayor información de su presencia y distribución en zonas de importancia agrícola como las del estado de Colima. En este trabajo, se reportan nuevos aislamientos del CMV identificados por RT-PCR, secuenciación de DNA y su análisis filogenético: CMV-Vin en vinca (Catharanthus roseus), CMV-Chi en chile jalapeño (Capsicum annuum) y CMV-Tom en tomate saladette (Solanum lycopersicum). Se confirmó, además, la presencia del CMV en melón cantaloupe (Cucumis melo) (CMV-Mel). Los aislamientos CMV-Vin, CMV-Chi y CMV-Mel agruparon en el subgrupo IB, mientras que CMV-Tom agrupó en el subgrupo IA de CMV. De estos aislamientos, sólo CMV-Vin evidenció la presencia de un RNA satélite (satRNA Vin) sin dominio necrogénico. Este es el primer reporte de la presencia del CMV en vinca, chile y tomate y de un RNA satélite en vinca en Colima, México.

Abstract. In the Miguel Ángel Soto Arenas Orchid, of the UNAM Faculty of Sciences, plants with symptoms consisting of chlorosis, variegated, necrosis and mosaic have been detected. Several of these plants are endemic species of Mexico, and there is no information on their phytosanitary management. Therefore, the objective of the present study was to know the causal agent or agents of these symptoms through ELISA tests, RT-PCR, differential plants and phylogenetic analyzes. Odontoglossum ringspot virus (ORSV) and Cymbidium mosaic virus (CymMV) were detected in 89% of the sampled plants with symptoms. Differential plants (Nicotiana tabacum var. xhanti, N. glutinosa, Chenopodium quinoa, C. amaranthicolor and Datura stramonium) shown local lessions after six days of the mechanical inoculation in both viruses; And only using CymMV, N. benthamiana was systemically infected. The phylogenetic analyses showed that these viruses were grouped with isolates from Asian countries suggesting that the infection probably originated from the exchange of plant material between producers. This is the first report of CymMV and ORSV infecting Barkeria, Lycaste, Rossioglossum, Masdevallia, Leochilus, Stanhopea, Maxillaria, Epidendrum sec. Oerstedella, Dendrobium, Sobralia and Cuitlauzina in Mexico.

Resumen. En el Orquideario de Miguel Ángel Soto Arenas, de la Facultad de Ciencias UNAM, se han detectado plantas con síntomas consistentes en clorosis, variegado, necrosis y mosaico. Varias de estas plantas son especies endémicas de México y a la fecha no existe información sobre su manejo fitosanitario. Por lo tanto, el objetivo del presente estudio fue conocer a los virus asociados a estos síntomas mediante pruebas de ELISA, RT-PCR, plantas diferenciales y análisis filogenéticos. Se detectó al Odontoglossum ringspot virus (ORSV) y al Cymbidium mosaic virus (CymMV) en el 89% de las plantas con síntomas muestreadas. Las plantas diferenciales Nicotiana tabacum var. xhanti N. glutinosa, Chenopodium quinoa, C. amaranthicolor y Datura stramonium inoculadas mecánicamente con tejido foliar positivo a ambos virus mostraron lesiones locales seis días después de la inoculación y sólo CymMV infectó sistémicamente a N. benthamiana. El análisis filogenético mostró que estos virus se agruparon con aislamientos de países asiáticos lo que sugiere que la infección se originó probablemente por el intercambio de material vegetal entre productores. Este es el primer reporte del CymMV y ORSV infectando a Barkeria, Lycaste, Rossioglossum, Masdevallia, Leochilus, Stanhopea, Maxillaria, Epidendrum sec. Oerstedella, Dendrobium, Sobralia y Cuitlauzina en México.

Abstract. In Montecillo Texcoco, State of Mexico we observed daisy plants (Dimorphotheca sinuata) showing symptoms of phyllody, virescence and proliferation of axillary branches, all those induced by phytoplasmas. Therefore, the objective of this investigation was to detect the phytoplasma associated with these symptoms by PCR with primers P1/P7 and R16F2n / R2 (nested PCR). The 1200 bp PCR product was obtained from the PCR and it was digested with the restriction enzymes MseI (Tru91), AluI, Kpn1 and HaIII and restriction maps showed that the phytoplasma present in Dimorphoteca sinuata is Candidatus phytoplasma asteris (16Sr1-B). The sequences were deposited on the NCBI data base and had a similarity of 99% with Candidatus phytoplasma asteris group 16Sr1-B from Iran (MH638316.1). A phylogenetic analysis was performed with the Neighbour-Joining method in which the phytoplasm from daisy was grouped with Candidatus phytoplasma asteris. According to the symptoms observed in the field, analysis of restriction patterns, sequencing and phylogeny, the phyllody of daisy is associated with Candidatus phytoplasma asteris, phylogenetically related to the 16Sr1-B group.

Resumen. En Montecillo Texcoco, Estado de México se observaron plantas de margarita (Dimorphotheca sinuata) exhibiendo síntomas de filodia, virescencia y proliferación de ramas axilares putativos a los inducidos por fitoplasmas. Por lo que el objetivo de esta investigación fue detectar el fitoplasma asociado a estos síntomas mediante PCR con los iniciadores P1/P7 y R16F2n/R2. Se detectó la presencia de fitoplasmas en tejido foliar sintomático. El producto de PCR de 1200 pb obtenido de la PCR se secuenció y sometió a digestión con las enzimas de restricción MseI (Tru91), AluI, Kpn1 y HaIII, los patrones de restricción evidenciaron que el fitoplasma presente en Dimorphotheca sinuata es Candidatus phytoplasma asteris (16SrI). Las secuencias obtenidas fueron depositadas en la base de datos del NCBI y tuvieron una similitud del 99% con Candidatus phytoplasm asteris grupo 16Sr1-B de Irán (MH638316.1). Se realizó un análisis filogenético con el método de Neighbour-Joining, en el cual el aislamiento detectado en margarita, se agrupó con Candidatus phytoplasma asteris. De acuerdo con los síntomas observados en campo, análisis de patrones de restricción, secuenciación y filogenia, indican que la filodia en margarita está asociada a Candidatus phytoplasma asteris, relacionado filogenéticamente al grupo 16Sr1-B.

Abstract The production of tomato and pepper is of great importance worldwide. Recently, in Israel and Jordan, the presence of a new member of the Tobamovirus genus was reported in tomato crops, which was called Tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV). The fruits of infected plants can develop yellow areas, roughness, as well as necrotic or brown areas. In Yurecuaro and Tanhuato municipalities of Michoacan, crops of tomato and pepper have shown symptoms similar to those described, thus the objective was to determine if the ToBRFV is present in those places. Leaf tissue of tomato with symptoms was included and RT-PCR was performed with primers that amplify a segment of the ORF2 of the genome of this virus; further, grids were prepared for observation under the transmission electron microscope (TEM). The expected amplicon was obtained and the sequences had a similarity of 99 to 100 % with ToBRFV. At the TEM, rigid rod-shaped viral particles typical of tobamoviruses were observed. To our knowledge, it is the first report of the presence of ToBRFV associated to tomato and pepper plants grown in Mexico.

Resumen A nivel mundial, la producción de jitomate y chile es de gran relevancia. Recientemente, en Israel y Jordania se notificó la presencia de un nuevo miembro del género Tobamovirus en plantaciones de jitomate, al cual se le llamó Tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV). Los frutos de plantas infectadas manifiestan áreas amarillas, necróticas o de color marrón incluso rugosidades. En los municipios de Yurécuaro y Tanhuato, Michoacán, se han observado cultivos de jitomate y chile con síntomas similares a los antes mencionados por lo que el objetivo del presente trabajo fue determinar si el ToBRFV se encuentra presente en estas localidades. Se colectó tejido foliar de jitomate con síntomas y se realizó RT-PCR con iniciadores que amplifican un segmento del ORF2 del genoma de este virus; además, se prepararon rejillas para su observación al microscopio electrónico de transmisión (MET). Se obtuvo el amplicón esperado y las secuencias tuvieron una similitud de 99 a 100 % con ToBRFV. Al MET se observaron partículas virales en forma de varilla rígida típicas de tobamovirus. Hasta donde sabemos este es el primer reporte de la presencia del ToBRFV asociado a plantas de jitomate y chile cultivados en México.

Abstract The viruses of the Begomovirus genus have a worldwide distribution and to date it is known that they are transmitted exclusively by Bemisia tabaci. In Mexico, in 2016, a complex of begomoviruses associated with the yellowing of roselle (Hibiscus sabdariffa) was reported, in which Okra yellow mosaic Mexico virus (OYMMV) is present. The objective of this study was to know the carrier insects of begomoviruses associated with roselle. Insects were collected from plants with yellowing, vein clearing and mosaic and analyzed by PCR. Three species of leafhoppers that carry OYMMV were identified: Trypanalebra maculata, Kunzeana scimetara and Agallia excavata. In T. maculata and A. modesta, Sida golden mosaic Buckup virus (SiGMBuV) and Melon chlorotic leaf curl virus (MCLCuV) were detected, respectively. This is the first report of leafhoppers as carriers of begomoviruses.

Resumen Los virus del género Begomovirus tienen una distribución mundial y a la fecha se sabe que son transmitidos exclusivamente por Bemisia tabaci. En 2016, se reportó un complejo de begomovirus asociados al amarillamiento de la jamaica (Hibiscus sabdariffa L.) en México,entre los que se encuentra el Okra yellow mosaic Mexico virus (OYMMV). Con el propósito de conocer la entomofauna asociada al cultivo de jamaica portadora de begomovirus, se colectaron insectos en plantas con amarillamiento, aclaramiento de nervaduras y mosaico y se analizaron mediante PCR. Se identificaron tres especies de cicádelidos portadoras de OYMMV: Trypanalebra maculata, Kunzeana scimetara y Agallia excavata. Asimismo, se encontró que T. maculata y A. modesta son portadoras de los begomovirus Sida golden mosaic Buckup virus (SiGMBuV) y Melon chlorotic leaf curl virus (MCLCuV), respectivamente. Este es el primer reporte de cicadélidos portadores de begomovirus.

Abstract: In onion Allium cepa crops in the state of Morelos, Mexico, typical and severe symptoms associated with Iris yellow spot virus (IYSV) are observed. In this work the alterations caused by IYSV isolates from typical and severe symptoms in Nicotiana benthamiana, the differences in the N gene and their phylogeny were studied. Four typical and five severe isolates mechanically inoculated caused systemic infection. Severe isolates caused more severe symptoms in bioclimatic chamber. The N gene sequence of both isolates had 98-99% identity with the IYSV nucleoprotein and no changes in nucleotide sequence between them were observed. Both isolates were grouped with the IYSVBR genotype and had greater similarity with those reported in Canada and the United States.

Resumen: En cultivos de cebolla Allium cepa del estado de Morelos, México, se observan síntomas típicos y severos asociados a Iris yellow spot virus (IYSV). En esta investigación se estudiaron las alteraciones que ocasionan los aislamientos de IYSV procedentes de síntomas típicos y severos en Nicotiana benthamiana, las diferencias en el gen N y su filogenia. Cuatro aislamientos típicos y cinco severos inoculados mecánicamente causaron infección sistémica. En cámara bioclimática los aislamientos severos ocasionaron mayor severidad de síntomas. La secuencia del gen N de ambos aislamientos tuvo 98-99% de identidad con la nucleoproteína de IYSV y no se observaron cambios en la secuencia de nucleótidos entre ellos. Ambos aislamientos se agruparon con el genotipo IYSVBR y tuvieron mayor similitud con los reportados en Canadá y Estados Unidos.

Abstract: In order to determine the diversity of thrips species associated with Chrysanthemum [Dendranthema grandiflorum (Ramat.) Kitamura] var. Harman, at four locations in the municipality of Texcoco, State of Mexico, larvae and adults were collected biweekly in the periods from March to June and August to November 2011. The collected individuals were subjected to clarification techniques and mounted for identification. Seventeen species of thrips were identified, included in the genera Frankliniella with 13 species and Anaphothrips, Chrirothrips, Neohydatothrips and Leptothrips with one species each. Most abundant species were F. occidentalis and F. brunnescens (88.6%). The diversity and abundance of thrips was similar in the four localities. The ecological relevance of our findings is discussed.

Resumen: Con el objetivo de estimar la diversidad de especies de tisanópteros asociados al cultivo de crisantemo [Dendranthema grandiflorum (Ramat.) Kitamura] var. Harman en cuatro localidades en el municipio de Texcoco, Estado de México, se realizaron recolectas quincenales de larvas y adultos, en los periodos de marzo a junio y agosto a noviembre de 2011. Los individuos recolectados se sometieron a técnicas de aclaración y montaje para su identificación. Se identificaron 17 especies de trips, incluidas en los géneros Frankliniella con 13 especies; Neohydatothrips, Anaphothrips, Chrirothrips y Leptothrips con una especie cada uno. Las especies más abundantes fueron F. occidentalis y F. brunnescens (88.6%). La diversidad y abundancia de tisanópteros fue similar en las cuatro localidades estudiadas. Se discute la relevancia ecológica de nuestros hallazgos.

Abstract. In Morelos state, recently have been observed viral diseases in onion (Allium cepa); one of them is caused by the Iris yellow spot virus (IYSV) which belong to the Bunyaviridae family and the Tospovirus gender and is transmitted by Thrips tabaci Lindeman (Thysanoptera: Thripidae) to onion plants. In 2012, there was a 100 % incidence of IYSV and severity of over 90 % on 2,500 ha of commercial crop. The objective of this research was to identify the presence of IYSV through real time RT-PCR and sequencing of the virus. To accomplish this, leaves were sampled from commercial fields at Tepalcingo, Morelos, from transplanting to harvest. Total RNA extraction was done with TRIzol® Reagent. Virus detection was done using specific primers for the nucleoprotein gen of IYSV giving as a result the amplification of a specific product through real-time RT-PCR, and an expected strip of 896 bp, which after sequencing confirmed 99 % identity with the nucleoprotein gen of the virus. The IYSV virus was detected in onion plants from Tepalcingo, Morelos and the sequence obtained was registered in the database of the GenBank (JX946658).

Resumen. En el estado de Morelos recientemente se han observado enfermedades virales en cebolla (Allium cepa); una de ellas es la mancha amarilla causada por el Iris yellow spot virus perteneciente a la familia Bunyaviridae del género Tospovirus, el cual se trasmite a la cebolla por Thrips tabaci Lindeman (Thysanoptera: Thripidae). En el 2012 la incidencia de esta enfermedad fue de 100 % en las 2,500 ha cultivadas en la entidad con una severidad superior a 90 %. El objetivo de este trabajo fue detectar mediante RT-PCR en tiempo real y secuenciar la presencia de IYSV. Para su identificación se tomaron muestras de hojas de cebolla con manchas amarillentas alargadas, desde el trasplante hasta la cosecha en Tepalcingo, Morelos. La extracción de ARN total se realizó utilizando TRIzol® Reagent. La detección del virus se realizó con primers específicos al gen de la nucleoproteína de IYSV dando como resultado la amplificación de un producto específico mediante RT-PCR en tiempo real y una banda esperada de 896 pb la cual mediante secuenciación confirmó 99 % de identidad con el gen de la nucleoproteína de este virus. El IYSV fue detectado en plantas de cebolla en Tepalcingo, Morelos y su secuencia se registró en la base de datos del GenBank (JX946658).