ABSTRACT Objectives: to compare the sociodemographic and clinical severity indicators of hospitalized people with HIV in relation to clinical outcomes and urgent hospital admission. Methods: a retrospective cohort study was conducted with 102 medical records of HIV-infected individuals hospitalized in a hospital in southern Brazil. In addition to descriptive analysis, Fisher’s exact test, Pearson’s Chi-square, and logistic regression were used. Results: the data showed a significant direct effect on severity indicators in the following variables: male sex (p=0.013), skin color (p=0.023), level of education (p=0.000), urgent admissions (p=0.000), late diagnosis (p=0.001), diabetes mellitus (p=0.001), hypertension (p=0.004), kidney disease (p=0.002), high viral load (p=0.006), CD4+ count below 200 (p=0.005), fever (p=0.016), weight loss (p=0.013), co-infection with hepatitis C (p=0.004), and mortality (p=0.007). Conclusions: three sociodemographic and thirteen clinical markers were identified as being associated with the risk of clinical deterioration in hospitalized people with HIV. Objectives admission Methods 10 HIVinfected infected Brazil analysis Fishers Fisher s test Pearsons Pearson Chisquare, Chisquare Chi square, square Chi-square used Results variables p=0.013, p0013 p p=0.013 , 0 013 (p=0.013) p=0.023, p0023 p=0.023 023 (p=0.023) p=0.000, p0000 p=0.000 000 (p=0.000) p=0.001, p0001 p=0.001 001 (p=0.001) p=0.004, p0004 p=0.004 004 (p=0.004) p=0.002, p0002 p=0.002 002 (p=0.002) p=0.006, p0006 p=0.006 006 (p=0.006) CD4 CD 20 p=0.005, p0005 p=0.005 005 (p=0.005) p=0.016, p0016 p=0.016 016 (p=0.016) coinfection co infection p=0.007. p0007 p=0.007 . 007 (p=0.007) Conclusions 1 p001 p=0.01 01 (p=0.013 p002 p=0.02 02 (p=0.023 p000 p=0.00 00 (p=0.000 (p=0.001 (p=0.004 (p=0.002 (p=0.006 2 (p=0.005 (p=0.016 (p=0.007 p00 p=0.0 (p=0.01 (p=0.02 (p=0.00 p0 p=0. (p=0.0 p=0 (p=0. p= (p=0 (p= (p

RESUMO Objetivos: comparar os indicadores sociodemográficos e de gravidade clínica de pessoas com HIV hospitalizadas, em relação ao desfecho e à admissão urgente na internação hospitalar. Métodos: coorte retrospectiva, realizada com 102 prontuários de pessoas infectadas pelo HIV hospitalizadas em um hospital no sul do Brasil. Além da análise descritiva, utilizou-se o teste exato de Fisher, Qui-quadrado de Pearson e regressão logística. Resultados: os dados mostraram efeito direto significativo para indicadores de gravidade nas variáveis: sexo masculino (p=0,013), cor da pele (p=0,023), nível de escolaridade (p=0,000), internações de forma urgente (p=0,000), diagnóstico tardio (p=0,001), diabetes mellitus (p=0,001), hipertensão arterial (p=0,004), doença renal (p=0,002), carga viral elevada (p=0,006), CD4+ menor que 200 (p=0,005), apresentar febre (p=0,016), perda de peso (p=0,013), coinfecção por hepatite C (p=0,004) e óbito (p=0,007). Conclusões: identificaram-se três marcadores sociodemográficos e treze clínicos associados ao risco de agravamento clínico em pessoas hospitalizadas com HIV. Objetivos hospitalar Métodos retrospectiva 10 Brasil descritiva utilizouse utilizou se Fisher Quiquadrado Qui quadrado logística Resultados variáveis p=0,013, p0013 p p=0,013 , 0 013 (p=0,013) p=0,023, p0023 p=0,023 023 (p=0,023) p=0,000, p0000 p=0,000 000 (p=0,000) p=0,001, p0001 p=0,001 001 (p=0,001) p=0,004, p0004 p=0,004 004 p=0,002, p0002 p=0,002 002 (p=0,002) p=0,006, p0006 p=0,006 006 (p=0,006) CD4 CD 20 p=0,005, p0005 p=0,005 005 (p=0,005) p=0,016, p0016 p=0,016 016 (p=0,016) (p=0,004 p=0,007. p0007 p=0,007 . 007 (p=0,007) Conclusões identificaramse identificaram 1 p001 p=0,01 01 (p=0,013 p002 p=0,02 02 (p=0,023 p000 p=0,00 00 (p=0,000 (p=0,001 (p=0,002 (p=0,006 2 (p=0,005 (p=0,016 (p=0,00 (p=0,007 p00 p=0,0 (p=0,01 (p=0,02 (p=0,0 p0 p=0, (p=0, p=0 (p=0 p= (p= (p

RESUMEN Objetivos: comparar los indicadores sociodemográficos y de gravedad clínica de personas con VIH hospitalizadas, en relación con el desenlace y la admisión urgente en la hospitalización. Métodos: cohorte retrospectiva, realizada con 102 expedientes médicos de personas infectadas por el VIH hospitalizadas en un hospital en el sur de Brasil. Además del análisis descriptivo, se utilizó la prueba exacta de Fisher, la prueba de Chi-cuadrado de Pearson y la regresión logística. Resultados: los datos mostraron un efecto directo significativo para los indicadores de gravedad en las siguientes variables: sexo masculino (p=0,013), color de piel (p=0,023), nivel de escolaridad (p=0,000), internaciones urgentes (p=0,000), diagnóstico tardío (p=0,001), diabetes mellitus (p=0,001), hipertensión arterial (p=0,004), enfermedad renal (p=0,002), carga viral elevada (p=0,006), CD4+ menor de 200 (p=0,005), presentar fiebre (p=0,016), pérdida de peso (p=0,013), coinfección por hepatitis C (p=0,004) y mortalidad (p=0,007). Conclusiones: se identificaron tres marcadores sociodemográficos y trece clínicos asociados con el riesgo de agravamiento clínico en personas hospitalizadas con VIH. Objetivos hospitalización Métodos retrospectiva 10 Brasil descriptivo Fisher Chicuadrado Chi cuadrado logística Resultados variables p=0,013, p0013 p p=0,013 , 0 013 (p=0,013) p=0,023, p0023 p=0,023 023 (p=0,023) p=0,000, p0000 p=0,000 000 (p=0,000) p=0,001, p0001 p=0,001 001 (p=0,001) p=0,004, p0004 p=0,004 004 p=0,002, p0002 p=0,002 002 (p=0,002) p=0,006, p0006 p=0,006 006 (p=0,006) CD4 CD 20 p=0,005, p0005 p=0,005 005 (p=0,005) p=0,016, p0016 p=0,016 016 (p=0,016) (p=0,004 p=0,007. p0007 p=0,007 . 007 (p=0,007) Conclusiones 1 p001 p=0,01 01 (p=0,013 p002 p=0,02 02 (p=0,023 p000 p=0,00 00 (p=0,000 (p=0,001 (p=0,002 (p=0,006 2 (p=0,005 (p=0,016 (p=0,00 (p=0,007 p00 p=0,0 (p=0,01 (p=0,02 (p=0,0 p0 p=0, (p=0, p=0 (p=0 p= (p= (p

RESUMO: A raiva bovina é endêmica na maioria dos estados brasileiros, inclusive no Rio Grande do Sul (RS), que enfrentou um surto de raiva sem precedentes entre 2011 e 2018. Descrevemos um PCR quantitativo de transcrição reversa em tempo real (RT-rtPCR) para detecção do vírus da raiva (RABV) em bovinos. Os primers foram desenhados visando uma região altamente conservada do gene da nucleoproteína (N) de RABV obtido de bovinos. O limite de detecção correspondeu a 13 cópias de DNA e a repetibilidade intra e inter-ensaios foi adequada (CV <9%) em todas as diluições testadas. Não foi observada amplificação de outros patógenos associados a doenças neurológicas em bovinos ou contaminação cruzada. Amostras de cérebro de bovinos com suspeita de raiva (n = 21) foram testadas em triplicata no RT-rtPCR e pelo teste de anticorpo fluorescente padrão ouro (DFAT), resultando em 100% de sensibilidade e especificidade do RT-rtPCR. O teste de 41 amostras de cérebro bovino adicionais submetidas ao teste de DFAT de rotina rendeu 37 (90,2%) resultados concordantes (30 positivos / sete negativos) e quatro (9,7%) inconclusivos em DFAT e RT-rtPCR positivo. Esses resultados mostraram boa concordância entre os testes e maior sensibilidade do RT-rtPCR. Este ensaio representa uma alternativa para a detecção do vírus da raiva, seja como teste confirmatório ou para diagnóstico em larga escala em regiões endêmicas.

ABSTRACT: Bovine rabies is endemic in most Brazilian States, including Rio Grande do Sul (RS), which has faced an unprecedented rabies outbreak between 2011 and 2018. We described a real-time reverse transcription quantitative PCR (RT-rtPCR) for detection of rabies virus (RABV) in bovine samples. The primers were designed targeting a highly conserved region of the nucleoprotein (N) gene of RABV obtained from cattle. The detection limit corresponded to 13 DNA copies and the intra- and inter-run repeatability was adequate (CV<9%) in all dilutions tested. Amplification of other pathogens associated with neurological disease in cattle or cross-contamination was not observed. Brain samples from cattle suspicious of rabies (n=21) were tested in triplicate by the RT-rtPCR and by the gold-standard direct fluorescent antibody test (DFAT), resulting in 100% of sensitivity and specificity of the RT-rtPCR. Testing of additional 41 bovine brain samples submitted to the routine DFAT testing yielded 37 (90.2%) concordant results (30 positive/7 negative) and 4 (9.7%) inconclusive in DFAT and RT-rtPCR positive. These results showed a good concordance between the tests and a higher sensitivity of the RT-rtPCR. This assay represents an alternative for RABV detection, either as a confirmatory test or for large-scale diagnosis in endemic regions.

RESUMO: As abelhas mostram-se fundamentais em diversos aspectos, especialmente com relação à biodiversidade de plantas e polinização. Recentemente, estão sendo enfrentadas imensas perdas no número de colônias brasileiras, principalmente nos estados do sul do país, com forte atividade apícola. Há indicativos de que, dentre as razões para as perdas, possam estar envolvidos patógenos que afetam a saúde das abelhas. Dentre eles, o microsporídio Nosema e o vírus da realeira negra (BQCV) destacam-se pela prevalência. Neste estudo, foram avaliadas 92 colônias, de 17 apiários do sul do Brasil, a respeito da infecção por Nosema ceranae, Nosema apis e BQCV. Foram realizadas extrações de ácidos nucleicos e síntese de cDNA a partir de amostras de abelhas adultas, seguidos de Reação em Cadeia da Polimerase-Transcriptase Reversa (RT-PCR). Oito amostras positivas para BQCV foram submetidas a sequenciamento. Os resultados mostraram que N. ceranae e BQCV estão circulando na região sul do país, podendo ser a razão para as perdas de colônias. N. apis não foi encontrado. N. ceranae foi encontrado em 57.6% (53/92) das colônias e BQCV em 32.6% (30/92). Foi encontrada coinfecção por ambos em 25% (23/92) das colônias estudadas, fator que sugere a diminuição da longevidade do hospedeiro por ação sinérgica dos patógenos. As amostras submetidas ao sequenciamento indicaram similaridade de 96.8 a 100% entre elas, além de forte similaridade com sequências da Ásia, Estados Unidos, Alemanha e Peru. Este estudo relata a circulação de N. ceranae e BQCV nos apiários do sul do Brasil, além de ser a primeira análise filogenética da sequência do BQCV brasileiro.

ABSTRACT: Bees are fundamental in several aspects, especially in relation to plant biodiversity and pollination. Recently, immense losses are being faced in the number of Brazilian colonies, mainly in southern states of the country, which has a strong beekeeping activity. There are indications that, among the reasons for the losses, pathogens that affect the health of bees may be involved. Among them, the microsporidium Nosema and the black queen cell virus (BQCV) stand out for their prevalence. In this study, 92 colonies of 17 apiaries from southern Brazil were evaluated for infection by Nosema ceranae, Nosema apis and BQCV. Nucleic acid extractions and cDNA synthesis were performed from adult bee samples, followed by Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) and multiplex PCR. Eight BQCV positive samples were subjected to sequencing. The results showed that N. ceranae and BQCV are circulating in the Southern region of the country, which may be the reason for the loss of colonies. N. apis was not found. N. ceranae was found in 57.6% (53/92) of the colonies and BQCV in 32.6% (30/92). Co-infection was found in 25% (23/92) of the colonies studied, a factor that is suggested to be reducing the hosts’ longevity due to the synergistic action of the pathogens. The samples submitted to sequencing indicated similarity of 96.8 to 100% between them, in addition to strong similarity with sequences from Asia, United States, Germany and Peru. This study reports the circulation of N. ceranae and BQCV in apiaries in southern Brazil, in addition to being the first phylogenetic analysis of the Brazilian BQCV sequence.

RESUMO: Alphaherpesvírus felídeo 1 (FeHV-1) e calicivírus felino (FCV) afetam gatos mundialmente. O objetivo deste estudo foi identificar a frequência de ocorrência de FeHV-1 e FCV em gatos com sinais clínicos de doença respiratória, oral e/ou ocular. Amostras foram coletadas de gatos atendidos em ambulatório e clínicas veterinárias e submetidas à detecção molecular e isolamento viral. Dos 49 gatos avaliados, 45 (92%) foram positivos para ao menos um dos vírus; 82% (40/49) foram positivos para o FeHV-1 e 41% (20/49) para o FCV. Destes, 31% (15/49) foram casos de coinfecção. Para o FeHV-1, 45% (18/40) dos gatos foram positivos na coleta do swab ocular, e o mesmo percentual (9/20) foi obtido para o FCV a partir do swab oral. FeHV-1 e/ou FCV foram isolados em 35% (17/49) das amostras. O principal sinal clínico observado foi secreção ocular em 71% (35/49) dos gatos, caracterizada como serosa, purulenta ou serossanguinolenta e, em alguns casos, associada à lesão e quemose. Nossos resultados demonstram a alta ocorrência de FeHV-1 e FCV em gatos domésticos na região Sul do Brasil e indicam que devem ser implementadas medidas para melhorar o diagnóstico, a prevenção e o manejo contra essas importantes doenças.

ABSTRACT: Felid alphaherpesvirus 1 (FeHV-1) and feline calicivirus (FCV) affect cats worldwide. The aim of this study was to evaluate the frequency of occurrence of FeHV-1 and FCV in cats with clinical signs of respiratory, oral and/or ocular disease. Samples were collected from cats cared for in veterinary ambulatory and clinics and submitted to molecular detection and viral isolation. Of the 49 cats evaluated, 45 (92%) were positive for at least one of the viruses; 82% (40/49) were positive for FeHV-1 and 41% (20/49) for FCV. Of these, 31% (15/49) were coinfection cases. For FeHV-1, 45% (18/40) of the cats tested were positive from the collection of eye swab, and the same percentage (9/20) was obtained for the FCV by the oral swab. FeHV-1 and/or FCV were isolated in 35% (17/49) of the samples. The main clinical sign observed was ocular secretion in 71% (35/49) of cats, characterized as mild serous, purulent or serosanguineous, and in some cases associated with ocular injury and marked chemosis. Our findings demonstrate the high occurrence of FeHV-1 and FCV in domestic cats in southern Brazil and indicate that measures should be implemented to improve the diagnostic, prevention and management against of these important diseases.

RESUMO: Descreve-se um surto de actinobacilose com manifestação clínica de cara de hipopótamo diagnosticado em uma propriedade localizada no município do Capão do Leão, Rio Grande do Sul em setembro de 2016. Os bovinos permaneciam durante a maior parte do ano em restevas de arroz e quando as áreas eram ocupadas com novas lavouras eram transferidos para áreas onde havia pequenas matas nativas. Foram afetados três bovinos adultos que apresentavam aumento de volume na região nasolabial e maxilar e havia, também, tumefação dos linfonodos regionais. A evolução da enfermidade era de aproximadamente seis meses. Nos fragmentos coletados para cultura houve isolamento de Actinobacillus lignieresii. O diagnóstico foi baseado nos achados clínicos, na avaliação histopatológica caracterizada pela presença de piogranulomas com reação de Splendori Hoepli no centro, no isolamento bacteriano, identificação de Actinobacillus lignieresii por reação em cadeia da polimerase (PRC) e sequenciamento genético.

ABSTRACT: Actinobacillosis outbreak with clinical manifestation of hippopotamus-like face observed in a property located in the municipality of Capão do Leão, Southern Brazil, in September 2016, is described. The cattle herd remained for most of the year in rice stubble. When these areas were occupied with new crops, they were transferred to areas where there were small native forests. Three cattle were affected. They presented a volume increase in the nasolabial and maxillary region, and there was also regional lymph node swelling. The evolution of the disease occurred in approximately six months. In tissue fragments collected for culture, Actinobacillus lignieresii was isolated. The diagnosis was based on clinical findings, histopathological evaluation characterized by the presence of piogranulomas with Splendore Hoepli reaction in its center, bacterial isolation, and identification of A. lignieresii by polymerase chain reaction (PRC) and genetic sequencing.

RESUMO: As abelhas são insetos de grande importância na agricultura, cumprindo um papel muito importante na polinização e na renovação do ecossistema. No entanto, em diversos países têm sido relatadas perdas significativas de colônias e declínio da população de abelhas melíferas e nativas, nos últimos anos. Com isso, surgiram novos estudos sobre este assunto. A maioria dos pesquisadores relata que as perdas prematuras estão ligadas a diversos fatores, dentre eles os vírus, que causam grande impacto nas colônias. Este artigo visa expor as novas identificações de vírus, algumas rotas de transmissão, a associação dos mesmos a parasitas e a sintomatologia das enfermidades que afetam a saúde de abelhas melíferas, bem como os vírus que já foram descritos no Brasil.

ABSTRACT: Bees are very important insects for agriculture, fulfilling an important role in pollination and renewal of the ecosystem. However, in several countries significant losses of colonies and population decline of honeybees and native bees have been reported in recent years. Most researchers reported that premature losses are linked to several factors, including viruses that have a great impact on the colonies. This article reports the identification of new viruses, some transmission routes, the association of these parasites with the symptoms of the diseases that affect the health of honeybees, as well as viruses that have been described in Brazil.

Abstract Three dog shelters in Rio Grande do Sul were investigated for associations between the occurrence of respiratory viruses and shelter environmental conditions. Nasal secretions randomly collected during the cold season were tested via PCR, and this data collection was followed by nucleotide sequencing of the amplicons. In shelter #1 (poor sanitary and nutritional conditions, high animal density and constant contact between dogs), 78% (58/74) of the nasal samples were positive, 35% (26/74) of which were in single infections and 44% (32/74) of which were in coinfections. Shelters #2 and #3 had satisfactory sanitary and nutritional conditions, outdoors exercise areas (#2) and animal clustering by groups (#3). In shelter #2, 9% (3/35) of the samples were positive for Canine parainfluenza virus (CPIV), and 6% (2/35) were positive for Canid herpesvirus 1 (CaHV-1). In shelter #3, 9% (7/77) of the samples were positive for Canine adenovirus type 2 (CAdV-2), and 1% (1/77) were positive for Canine distemper virus (CDV). The amplicon sequences (CPIV and CDV nucleoprotein gene; CAdV-2 E3 gene; CaHV-1 glycoprotein B gene) showed 94-100% nucleotide identity with GenBank sequences. Our results demonstrate that CPIV, CAdV-2 and CDV are common in dog shelters and that their frequencies appear to be related with environmental and nutritional conditions. These results indicate the need for control/prevention measures, including vaccination and environmental management, to minimize these infections and improve dog health.

Este trabalho avaliou a imunogenicidade de vacinas para os herpesvírus bovino 1 e 5 (BoHV-1, BoHV-5) e vírus da diarreia viral bovina 1 e 2 (BVDV-1, BVDV-2), disponíveis no mercado brasileiro. Para isso, novilhos de raças de corte foram alocados em grupos de 10-12 animais e vacinados duas vezes, com intervalo de 30 dias, com cada uma das oito vacinas disponíveis. Amostras de soro coletadas 30 dias após a segunda dose foram submetidas ao teste de virusneutralização (VNT), frente a cepas de BoHV-1, BoHV-5, BVDV-1 e BVDV-2. Com exceção de duas vacinas que induziram soroconversão em 8/10 e 9/10 dos animais, as demais induziram anticorpos neutralizantes contra o BoHV-1 em todos os animais vacinados (títulos médios geométricos [GMTs] entre 1,7 e 4,8). Quatro vacina s induziram anticorpos reagentes com o BoHV-5 em todos os animais (GMTs de 1,0 a 4,2), enquanto três vacinas induziram soroconversão parcial em 5/10, 6/10 e 7/10 animais. Apenas uma vacina induziu resposta sorológica detectável frente ao BVDV-1 em todos os animais vacinados (GMT=6,7). Soroconversão parcial ao BVDV-1 foi detectada em quatro grupos vacinais (6/10, GMT 4,0 6/10, GMT 5,6 e 4/10, GMT 1,8). Uma vacina induziu resposta em apenas um animal (título de 40) e três vacinas não induziram anticorpos detectáveis contra o BVDV-1 em nenhum animal. Atividade neutralizante frente ao BVDV-2 foi detectada apenas em três grupos vacinais, e parcialmente (10/10, GMT 6,5; 5/10, GMT 1,6 e 2/10, GMT 1,0). Cinco vacinas não induziram atividade neutralizante detectável frente ao BVDV-2 em nenhum dos animais imunizados. Esses resultados demonstram que o componente BoHV-1 da maioria das vacinas comerciais possui imunogenicidade adequada. No entanto, o componente BVDV da grande maioria das vacinas não induz resposta neutralizante consistente frente ao BVDV-1 e, principalmente, frente ao BVDV-2. Fica evidente que as estratégias de formulação e/ou produção de vacinas, principalmente com relação ao BVDV, devem ser urgentemente revistas

This study evaluated the immunogenicity of vaccines for bovine herpesvirus 1 and 5 (BoHV-1/5) and viral diarrhea virus 1 and 2 (BVDV-1/2) available in the Brazilian market. Calves were divided into groups (10-12), vaccinated twice with a 30 days interval. Samples collected 30 days after the second dose were submitted to virus neutralization test against BoHV-1, BoHV-5, BVDV-1 and BVDV-2. With the exception of two vaccines that induced seroconversion in 8/10 and 9/10 of the animals, the other induced antibodies against BoHV-1 in all vaccinated animals (geometric mean titers [GMTs] 1.7 and 4.8) and four induced antibodies against BoHV-5 in all animals (GMTs 1.0 to 4.2), whereas three vaccines induced partial seroconversion (5/10, 6/10 and 7/10 animals). Only one vaccine induced antibody response to BVDV-1 in all vaccinated animals (GMT=6.7). Partial seroconversion to BVDV-1 was detected in four vaccine (6/10, GMT 4.0; 6/10, GMT 5.6 and 4/10, GMT 1.8). A vaccine induced response in only one animal and three vaccines did not induce antibodies against BVDV-1 in any animal. Antibodies to BVDV-2 were detected only in three vaccine groups, and partly (10/10, GMT 6.5; 5/10, GMT 1.6 and 2/10, GMT 1.0). Five vaccines did not induce antibodies to BVDV-2 in any of the animals. Results demonstrate that the BoHV-1 component of commercial vaccines seems to have acceptable immunogenicity. However, the BVDV component of most vaccines does not induce consistent response against BVDV-1, especially, to BVDV-2. It is evident that strategies for production of vaccines, particularly to BVDV must be urgently revised