Abstract Brachyspina syndrome is a hereditary recessive disease of recent identification in the Holstein breed. It is caused by a deletion of 3.3Kb in the FANCI gene located in the bovine chromosome 21. The mutation was identified in Holstein populations of Europe, North America and Asia. Given the economic importance of the defect and its wide distribution, the objective of this work was the identification of carrier animals in the genetic selection nucleus of the breed in Uruguay and the molecular verification of the deleterious allele in animals of the national herd. In the present study, 2598 records of Holstein bulls were analyzed from the list of parents of the dairy genetic evaluation system, records of bulls belonging to the Holstein semen catalogs available for Uruguay from 2014 to 2018; and 71 cows belonging to the general herd. Twenty-eight brachyspina carrier bulls were found of a total of 377 bulls with genetic information from the list of parents and four carrier cows of a total of 71 genotyped in our laboratory. A decrease in the income of semen from carrier animals to the country between 2014 and 2018 was demonstrated. The significant frequency of carrier animals in Uruguay evidences the need to implement strategies to gradually eliminate the population defect.

Resumen El síndrome de braquiespina es una condición genética de la raza Holstein, detectada en el año 2006. Es causado por una deleción de 3.3 Kb en el gen FANCI localizado en el cromosoma bovino 21. La mutación fue identificada en poblaciones de Holstein de Europa, América del Norte y Asia. Dada la importancia económica del defecto y su amplia distribución mundial, el objetivo de este trabajo ha sido la identificación de animales portadores en el núcleo de selección genética de la raza en Uruguay y el diagnóstico molecular del alelo deletéreo en animales del rodeo nacional. En el presente estudio se analizaron 2598 registros de toros Holstein del catálogo de padres del sistema de evaluación genética lechera, los registros de toros pertenecientes a los catálogos de semen Holstein disponible para Uruguay de los años 2014 al 2018; y 71 vacas pertenecientes al rodeo general. Se encontraron 28 toros portadores de braquiespina de un total de 377 toros con información genética del catálogo de padres y cuatro vacas portadoras de un total de 71 genotipificadas en nuestro laboratorio. Se demostró una disminución en el ingreso de semen de animales portadores al país entre los años 2014 y 2018. La frecuencia significativa de animales portadores en Uruguay evidencia la necesidad de implementar estrategias que permitan eliminar gradualmente el defecto de la población.

Resumen: Se evaluó el efecto de la inclusión de afrechillo de arroz en la dieta sobre el comportamiento productivo y características de carcasa en lechones de la raza Pampa Rocha. Se utilizaron 16 animales desde el destete a los 42 días y hasta los 77 días de edad, los cuales se alojaron en boxes en un sistema de cama profunda de paja de trigo. Se empleó un diseño experimental de bloques completos al azar con dos tratamientos y cuatro repeticiones. Los tratamientos consistieron en dietas con diferente contenido lipídico (T0 = 0 % de afrechillo de arroz; T15 = 15 % de afrechillo de arroz). Para evaluar el comportamiento productivo se realizó un análisis de varianza y una comparación de medias para las variables consumo diario de ración (CD), ganancia de peso diaria (GD) y eficiencia de conversión (EC). Las características de carcasa evaluadas fueron peso y espesor de grasa dorsal, y se analizaron a través de una comparación de medias por tratamiento. Para GD y EC, se observaron diferencias durante la semana 5, no presentándose diferencias en el promedio del período experimental. Para el CD no se registraron diferencias a través de las semanas y en el promedio del período experimental. Las características de carcasa no difirieron estadísticamente entre tratamientos. En función de los resultados se concluye que el afrechillo de arroz podría considerarse como alternativa en la elaboración de raciones para lechones.

Abstract: This study assessed the effect of bran rice inclusion in the diet on the productive behavior and carcass characteristics of Pampa Rocha piglets. Sixteen animals were used from weaning up to 42 days and 77 days of age, which were housed in boxes in a deep bed system of wheat straw. A randomized complete block design with two treatments and four replications was used. Treatments consisted of diets with different lipid content (T0 = 0 % rice bran; T15 = 15 % rice bran). Productive behavior was evaluated through analysis of variance and comparison of means for daily food consumption (DC), daily weight gain (DG) and conversion efficiency (CE). Weight and backfat thickness were the evaluated carcass traits, and they were analyzed through a comparison of means per treatment. The DG and CE showed differences during week 5, although they showed no differences in the experimental period average. For DC, no differences were recorded during the weeks or the average of the experimental period. Carcass traits did not differ statistically between treatments. Based on the results, rice bran could be considered as an alternative in the preparation of ration for piglets.

Resumen La deficiencia en la adhesión leucocitaria bovina (BLAD) y en la enzima arginosuccinato sintetasa (Citrulinemia) son enfermedades de herencia autosómica recesiva que han sido descritas a nivel mundial en la raza Holando. El objetivo de este estudio fue optimizar e implementar una metodología de genotipado para la identificación de animales portadores de los alelos causantes de estas enfermedades en una población cohorte de terneras de recría de la raza Holando de la cuenca lechera de Cerro Largo. Las muestras de ADN de 190 terneras Holando fueron extraídas a partir de sangre fresca, siguiendo normas y protocolos del Banco de ADN de la Unidad de Biotecnología INIA Las Brujas. El genotipado fue realizado mediante análisis PCR-RFLP con las enzimas de restricción TaqI para BLAD y Eco47I (AvaII) para Citrulinemia. La confirmación del genotipado fue evaluada mediante secuenciación de los productos amplificados de ambas enfermedades. Se detectó la presencia del alelo mutante para BLAD en una sola ternera de recría y no se encontró portadoras de Citrulinemia en la población analizada. Este trabajo representó el primer relevamiento de la prevalencia génica de las enfermedades BLAD y Citrulinemia en la región Este del Uruguay

Summary Deficiency in bovine leukocyte adhesion (BLAD) and arginosuccinate synthase enzyme (Citrullinemia) are autosomal recessive diseases that have been described worldwide in the Holstein breed. The objective of this study was to optimize and implement a methodology of genotyping for the identification of animals carrying the allele causing these diseases in a population cohort of calves Holstein of dairy farm in Uruguay basin. DNA samples from 190 Holstein calves were extracted from fresh blood following rules and protocols DNA Bank Unit Biotechnology INIA Las Brujas. Genotyping was performed by PCR-RFLP analysis with restriction enzymes TaqI for BLAD and Eco47I (AvaII) for Citrullinemia. Results of RFLP genotyping were confirmed by sequencing of the amplified products of both diseases. The presence of the BLAD mutant allele was detected in only one calf while no Citrullinemia carriers were found in the analyzed population. This study represented the first survey of the prevalence of BLAD and Citrullinemia diseases of dairy cattle in the eastern region of Uruguay

In this study, we genetically characterized the Uruguayan pig breed Pampa Rocha. Genetic variability was assessed by analyzing a panel of 25 microsatellite markers from a sample of 39 individuals. Pampa Rocha pigs showed high genetic variability with observed and expected heterozygosities of 0.583 and 0.603, respectively. The mean number of alleles was 5.72. Twenty-four markers were polymorphic, with 95.8% of them in Hardy Weinberg equilibrium. The level of endogamy was low (FIS = 0.0475). A factorial analysis of correspondence was used to assess the genetic differences between Pampa Rocha and other pig breeds; genetic distances were calculated, and a tree was designed to reflect the distance matrix. Individuals were also allocated into clusters. This analysis showed that the Pampa Rocha breed was separated from the other breeds along the first and second axes. The neighbour-joining tree generated by the genetic distances DA showed clustering of Pampa Rocha with the Meishan breed. The allocation of individuals to clusters showed a clear separation of Pampa Rocha pigs. These results provide insights into the genetic variability of Pampa Rocha pigs and indicate that this breed is a well-defined genetic entity.

The present study aimed to detect BoHV-1 and BoHV-5 latent infections in Uruguayan beef cattle. Trigeminal ganglia (TG) were collected from 62 cattle heads in a slaughterhouse. Viral genomes were detected by a type-differential nested PCR (nPCR) targeting the UL44 gene of BoHV-1 and BoHV-5. Viral DNA was detected in 64.5% (40/62) of the animals. Thirty cattle heads (48.4%) contained only BoHV-1 DNA, whereas nine (14.5%) contained DNA of both BoHV-1 and BoHV-5. One cattle head (1.6%) contained BoHV-5 DNA only. Detection of neutralising antibodies was performed on sera of the examined cattle heads by a standard serum neutralization test. Neutralising antibodies were detected in 16 of the viral DNA-carrying animals, corresponding to 40% of the samples from which viral genomes were identified. The type-specific genomic prevalence was substantially different from that reported in a similar study carried out in Brazil and may be associated to the predominant European type of breeds farmed in Uruguay, as opposed to Brazilian cattle which is often crossbred (Bos Taurus x Bos indicus). Therefore, despite both BoHV-1 and BoHV-5 do circulate in Uruguay and sometimes both viruses can co-infect cattle, BoHV-5 infections seem less frequent than BoHV-1 infections.

El presente estudio tuvo como objetivo detectar la presencia de BoHV-1 y BoHV-5 en infecciones latentes de ganado vacuno en el Uruguay. Se analizaron 62 muestras de ganglios trigéminos (TG) de cabezas de bovinos colectados en un frigorífico. Utilizando un tipo diferencial de PCR (nPCR) focalizando en el gen UL44 de BoHV-1 y BoHV-5 se detectaron los diferentes genomas virales. ADN viral fue detectado en 64,5% (40/62) de los animales. Treinta muestras (48,4%) contenían solo el ADN de BoHV-1, mientras que nueve (14,5%) contenían ADN de ambos BoHV-1 y BoHV-5. Una sola muestra (1,6%) contenía apenas ADN de BoHV-5. La detección de anticuerpos neutralizantes se realizó en los sueros mediante la técnica de seroneutralización in vitro. Anticuerpos neutralizantes fueron encontrados en 16 de los animales portadores de ADN viral, lo que corresponde a 40% de las muestras con genoma viral identificado. La prevalencia genómica específica del tipo viral fue sustancialmente diferente de la que se informó en un estudio similar llevado a cabo en Brasil y puede estar asociada con el tipo de razas europeas predominante criadas en Uruguay, en contrapartida a los bovinos brasileños que son cruzados (Bos taurus x Bos indicus). Sin embargo, y a pesar de que tanto BoHV-1 y BoHV-5 pueden ser causas de coinfecciones ocasionales en Uruguay, BoHV-5 mostró una significativa menor prevalencia comparado con BoHV-1.

Bovine herpesvirus type 1 (BoHV-1) is the etiological agent of Infectious Bovine Rhinotracheitis (IBR). Depending on the genotype, it produces a wide variety of clinical syndromes, such as conjunctivitis, abortion and balanoposthitis. Vaccination against BoHV-1 is a common practice, so in order to differentiate infected from vaccinated animals, many BoHV-1 proteins were studied to develop marked vaccines. VP22, the major tegument protein codified by UL49 gene, is a non essential protein for virus multiplication, but induces a relevant immune response in the host. Therefore the variability of the gene UL49 of three BoHV-1 Uruguayan isolates (Uy1999, Uy2002 and Uy2004), was analyzed. Recombinant VP22 was expressed in a prokaryotic system and was recognized by sera of BoHV-1 immunized rabbits by Western blot analysis. Uy1999 (BoHV-1.1), Uy2002 and Uy2004 (BoHV-1.2), have 93.8%, 95% and 88.2% nucleotide similarity to the international Los Angeles BoHV-1.1 reference strain. The phylogenetic analysis showed that Uy1999 is grouped with BoHV-1.1 strains, while Uy2002 and Uy2004 isolates are grouped distant from other BoHV-1.1. The use of VP22 deleted vaccines and a serological technique able to detect antibodies against it, is an excellent alternative to be used in bovine vaccination programmes.

Herpesvirus bovino tipo 1 (BoHV-1) es el agente responsable de la Rinotraqueitis Infecciosa Bovina (IBR) y de un amplia variedad de síndromes, como conjuntivitis, aborto y balanopostitis, según el genotipo que se encuentre presente. La vacunación contra BoHV-1 es una tarea de rutina en el manejo de ganado, por lo tanto se han estudiado varias proteínas de BoHV-1 con el objetivo de desarrollar vacunas marcadas que permitan la diferenciación entre animales vacunados e infectados. VP22 es la proteína principal del tegumento del virus y es codificada por el gen UL49. No es esencial para el ciclo de replicación viral pero induce una respuesta inmune significativa en el huésped. Por consiguiente se analizó la variabilidad del gen UL49 en tres aislamientos uruguayos de BoHV-1 (Uy1999, Uy2002 y Uy2004), se expresó una VP22 recombinante que fue reconocida por sueros de conejos inmunizados con BoHV-1 mediante su análisis por Western Blot. Los resultados obtenidos muestran que Uy1999 (BoHV-1.1), Uy2002 y Uy2004 (BoHV-1.2), tienen 93.8%, 95% y 88.2% de similitud en la secuencia de nucleótidos al compararlos con la cepa de referencia internacional Los Ángeles BoHV-1.1. El análisis filogenético mostró que Uy1999 está agrupado con cepas BoHV-1.1, mientras que Uy2002 y Uy2004 están agrupadas distantes de los otros BoHV-1.1. El uso conjunto de vacunas a las cuales se les ha eliminado VP22 y de técnicas capaces de detectar anticuerpos contra la proteína eliminada es una excelente alternativa a usar en los programas de vacunación bovina.

In order to assess the genetic variability of the Cimarron Uruguayo dog breed, we analyzed all the available pedigree records (n= 6079) using ENDOG v4.5 software. The results suggest over representation of certain breeding animals and loss of founder genotypes. Mean F of the reference population, consisting of live breeding animals, was 0.03, which has increased in recent generations. The population has had a favourable evolution with regard to number of individuals, although it is very heterogeneous and requires the application of mating criteria tending to the minimization of inbreeding levels per generation.

Para evaluar la variabilidad genética de la raza canina Cimarrón Uruguayo, se analizó la totalidad de la información genealógica disponible (n= 6079) utilizando el programa informático ENDOG v4.5. Los datos recabados sugieren sobrerepresentación de determinados reproductores y pérdida de genotipos fundacionales. La F media para la población de referencia viva apta para la reproducción fue de 0,03, la cual ha aumentado en generaciones recientes. La población ha tenido una evolución favorable en relación a crecimiento en número de individuos, aunque es muy heterogénea y requiere la aplicación de criterios en los cruzamientos que tiendan a minimizar el nivel de consanguinidad por generación.

The Uruguayan Creole cattle genetic reserve, located in the department of Rocha, has a high level of genetic variation, as previous studies using polymorphic markers showed. Cattle from this reserve were taken to commercial farms in the North of Uruguay during the 60'. These animals where used in crosses with commercial breeds (Aberdeen Angus, Hereford, Caracú) and zebu (Bos indicus) cattle for meat production. We analyzed a sample of Creole cattle from Rocha and from two crossbred populations from Northern Uruguay (Rivera and Cerro Largo) using three molecular markers associated with marbling: diacyl-glicerol acyl transferase (DGAT1), thyroglobulin (TG) and leptin (LEP). We describe a novel and cost-effective genotyping method based on TETRA-ARMS PCR for LEP polymorphism. The Creole cattle reserve showed higher frequencies of alleles and genotypes associated with low marbling scores in all markers. Both crossbred populations showed the same trend for DGAT1, but higher frequencies for alleles and genotypes associated with higher marbling in TG and LEP. Genetic diversity indexes were low to moderate (minimum He= 0.000 for DGAT1 in Rivera crossbred population; maximum He= 0.632 for TG in Cerro Largo crossbred population). No significant departures from the expected values were detected according to F IS and Hardy-Weinberg tests, except for one case (TG in Cerro Largo population). F ST values showed the high genetic similarities between both crossbred populations and their differentiation from the purebred Uruguayan Creole reserve. Genetic introgression of commercial breeds, plus selection objectives tending to increase productivity, had affected the frequencies of the markers analyzed in the crossbred populations. On the other hand, reproductive isolation, absence of artificial selection and the incidence of genetic drift and natural selection had modelled the population parameters of the Uruguayan Creole cattle reserve.

En Uruguay existe una reserva genética de bovinos Criollos ubicada en el Departamento de Rocha. Estudios previos basados en marcadores moleculares altamente polimórficos mostraron que dicha población presenta una alta diversidad genética. En la década del 60 se produjo una migración de bovinos Criollos de la reserva a establecimientos ganaderos del norte del país. Este ganado fue utilizado en cruzamientos comerciales con las razas Aberdeen Angus, Hereford, Caracú y cebuinas, estando sus productos introducidos en el mercado cárnico uruguayo. Se presentan datos de la caracterización genética de la reserva y de dos poblaciones cruza (Rivera y Cerro Largo) para tres marcadores moleculares asociados al veteado de la carne: diacilglicerol acetil-transferasa (DGAT1), tiroglobulina (TG) y leptina (LEP), así como una metodología de genotipado novedosa y eficaz para el polimorF ISmo del gen LEP mediante TETRA-ARMS PCR. La reserva de Criollos mostró una predominancia de los alelos y genotipos asociados a carne de bajo tenor graso en todos los marcadores. Las dos poblaciones cruza de Criollo con razas comerciales mostraron la misma tendencia para el gen DGAT1, pero mayores frecuencias de los alelos y genotipos que generan un incremento del veteado para TG y LEP. Los índices de diversidad genética resultaron de bajos a moderados (He mínima= 0,000 para DGAT1 en la población cruza de Rivera; He máxima= 0,632 para TG en la población cruza de Cerro Largo). No se observan diferencias significativas de los valores esperados para los parámetros poblacionales, según índices F IS y prueba de equilibrio Hardy-Weinberg, salvo en un caso (TG en el rodeo de Cerro Largo). Los valores de F ST muestran la similitud genética entre las dos poblaciones cruza y su diferenciación con respecto a la reserva de Criollos Uruguayos puros. La introgresión de razas comerciales y los objetivos de selección en pos de una mayor productividad afectaron las frecuencias de los marcadores analizados en los rodeos cruza. Por otro lado, el aislamiento reproductivo, la ausencia de selección artificial y la incidencia de la deriva y la selección natural han moldeado los parámetros genéticos de la reserva de Criollos Uruguayos.

Os sítios frágeis (FS) são regiões de cromossomo onde a compactação normal da cromatina não é realizada. O FRAXA (Fra Xq27.3, cromossomo sexual X) é um dos FS mais estudados em seres humanos. O FRAXA apresenta expansão do trinucleotídeo CGG localizado no gene FMR-1. Em bovinos, existem estudos informando sobre fragilidade cromossômica em BTAX associada com diversas patologias e alterações na fertilidade. A microdissecação cromossômica é uma valiosa técnica para isolar fragmentos de cromatina. Neste trabalho, combinou-se a técnica de microdissecação de cromossomo com DOP-PCR para executar a análise molecular da região do sitio frágil cromossômico BTAXq31-34. Naquela região estão presentes seqüências do polimorfo DNA-RAPD (rico em GC), em que as seqüências do gene FMR-1 estão ausentes. Os resultados mostram a utilidade da técnica de microdissecação-DOP-PCR para a caracterização molecular de sítios frágeis cromossômicos em bovinos.

Fragile sites (FS) are chromosomal regions where the normal compactation of chromatine is not observed. FRAXA (Fra Xq27.3, X sexual chromosome) is one of the most studied FS in humans. FRAXA is an expansion of the trinucleotide CGG located in the gene FMR-1. In cattle, sites of chromosomal fragility were reported in BTAX, associated with different pathologies and fertility impairment. Chromosomal microdissection has became a valuable tool for isolating chromatine fragments. In this work, it was combined the chromosomal microdissection technique with DOP-PCR in order to carry out a molecular analysis of the fragile chromosomal region BTAXq31-34. In that region, polymorphic DNA-RAPD sequences (GC rich) are present and sequences of the gene FMR-1 are missing. The results showed the usefulness of the microdissection-DOP-PCR technique for molecular characterization of fragile chromosomal sites in cattle.

Common fragile sites are regions of the eukaryotic chromosome with a tendency to show breaks or gaps when inductors such as 5’azacytidine are added to the lymphocyte culture media. Recently, chromosome fragile sites have been correlated with hereditary defects affecting humans and domestic animals (mental retardation syndrome, parakeratosis, baldy calf syndrome and low fertility). A spontaneous fragile site in the sexual chromosome X (FRA Xq 3.1) was observed in lymphocyte cultures of Uruguayan Holstein-Friesian cattle. In the present study, the chromosome fragility expression in lymphocyte cultures of Uruguayan Holstein-Friesian female cattle treated with 5’azacytidine was analized. A number of different fragility regions were scored considering autosomes and sexual X chromosomes.

Los sitios frágiles comunes se definen como regiones del cromosoma eucariota con tendencia a sufrir fracturas o quiebres frente a sustancias inductoras adicionadas al medio de cultivo linfocitario como la 5’azacitidina. Actualmente en humanos y animales domésticos las regiones de fragilidad cromosómica han sido correlacionadas con heredopatologías diversas (síndrome de retardo mental, paraqueratosis hereditaria, síndrome de calvicie en terneros, alteraciones de la fertilidad). En bovinos de la raza Holando-Uruguaya ha sido descrita la presencia de un sitio frágil en el cromosoma sexual X (FRA Xq 3.1) con manifestación espontánea en cultivos linfocitarios. En la presente comunicación se analiza la respuesta de fragilidad cromosómica en cultivos linfocitarios de una hembra bovina (raza Holando-Uruguaya), sometidos a la inducción de 5’azacitidina. Se contabilizan regiones de fragilidad a nivel autosómico y en el cromosoma sexual X.