Abstract Sharks of the genus Sphyrna are under intense exploitation globally. In Brazil’s northern coast, this genus represents a high proportion of fisheries landings and comprises four species. However, due to difficulty of specific identification when specimens are landed, most of the records are limited to the genus level. Here we analyzed the effectiveness of ITS2 (Internal Transcribed Spacer 2 of rDNA) fragment length protocol (Abercrombie et al., 2005) for identifying hammerhead shark species, comparing with the analysis of COI (Cytochrome oxidase subunit I) and ITS2 sequences. We evaluated samples of muscle tissue acquired in the main fishing ports of Maranhão: Carutapera, Raposa e Tutóia. Sampling was conducted between March 2017 to March 2018 and complemented with material deposited in collection (2015). COI results indicated the occurrence of endangered species which are prohibited to be landed. These include Sphyrna mokarran (67%), S. lewini (15%), S. tudes (3%), and S. tiburo (15%). For the ITS2 marker, we investigated the optimization of the protocol developed by Abercrombie (2005) for to improve the use in this geographical area througout design of a new primers. globally Brazils Brazil s coast However landed level ITS Internal rDNA al al. 2005 Cytochrome I sequences Maranhão Carutapera Tutóia 201 2015. 2015 . (2015) 67%, 67 67% , (67%) S 15%, 15 15% (15%) 3%, 3 3% (3%) 15%. marker (2005 primers 200 20 (2015 6 (67% 1 (15% (3% (200 (201 (67 (15 (3 (20 (6 (1 ( (2
Resumo Os tubarões do gênero Sphyrna estão sob intensa exploração em todo o mundo. No litoral norte do Brasil, esse gênero representa grande proporção dos desembarques pesqueiros e compreende quatro espécies. Porém, devido à dificuldade de identificação específica no momento do desembarque dos espécimes, a maioria dos registros limita-se ao nível do gênero. Aqui analisamos a eficácia do protocolo baseado no comprimento de fragmentos de ITS2 (Abercrombie et al., 2005) para identificar espécies de tubarão-martelo, comparando com a análise das sequências COI e ITS2. Foram avaliadas amostras de tecido muscular adquiridas nos principais portos pesqueiros do Maranhão: Carutapera, Raposa e Tutóia. A amostragem foi realizada entre março de 2017 a março de 2018 e complementada com material depositados em coleção (2015). Os resultados do COI indicaram a ocorrência de espécies ameaçadas cujo desembarque é proibido. Estes incluem Sphyrna mokarran (67%), S. lewini (15%), S. tudes (3%) e S. tiburo (15%). Para o marcador ITS2, investigamos a otimização do protocolo desenvolvido por Abercrombie (2005) para melhorar o uso nesta área geográfica através do desenho de novos primers. mundo Brasil Porém espécimes limitase limita se ITS al al. 2005 tubarãomartelo, tubarãomartelo tubarão martelo, martelo tubarão-martelo Maranhão Carutapera Tutóia 201 2015. 2015 . (2015) proibido 67%, 67 67% , (67%) S 15%, 15 15% (15%) 3% 3 (3% 15%. (2005 primers 200 20 (2015 6 (67% 1 (15% (3 (200 2 (201 (67 (15 ( (20 (6 (1 (2