Resumo Aves silvestres são importantes para a saúde pública devido ao seu potencial de transmissão de microrganismos patogênicos aos seres humanos. As aves aquáticas, como o guará (Eudocimus ruber), forrageiam e se reproduzem próximo de áreas antropizadas e estas, quando contaminadas, podem transmitir bactérias patogênicas às aves. O objetivo deste trabalho foi identificar o perfil de bactérias aeróbicas cloacais em filhotes de guará na colônia mista da Ilha Jarivatuba, em Joinville, Santa Catarina. Foram coletados swabs cloacais de filhotes de guará na estação reprodutiva de 2015/2016 (n=16) e 2016/2017 (n=34), todos de aves de aspecto clínico normal, e plaqueados em ágar sangue, MacConkey e Salmonella-Shigella em aerobiose. Foram isolados os seguintes microrganismos: Escherichia coli, Proteus vulgaris, Proteus spp., Klebsiella sp. Enterococcus spp. e Staphylococcus spp. A ocorrência de E. coli, Enterococcus spp. e P. vulgaris podem ser representantes da microbiota natural da espécie, uma informação desconhecida. Entretanto, a localização da colônia de aves aquáticas, na foz do rio Cachoeira, com o aporte de efluentes domésticos e industriais da cidade de Joinville sem tratamento adequado, pode indicar modificação dos perfis bacterianos. Torna-se evidente a necessidade de avançar com a sua tipificação fenotípica e genotípica dos isolados, para análises comparativas com estirpes presentes nos efluentes sanitários da região. Os resultados poderão contribuir para a conservação da espécie e outras aves aquáticas da área, permitindo a elaboração de projetos de conservação, gestão do ambiente costeiro e marinho, além de subsidiar medidas preventivas efetivas no combate as perdas de filhotes e potenciais epidemias zoonóticas.
Abstract Wild birds are important for public health because of their potential to transmit pathogenic microorganisms to humans. The waterbird scarlet ibis (Eudocimus ruber) forages and breeds near urban areas and if they settle near polluted waters, the viability of adults and their young can be negatively affected. Hence, the aim of this study was to evaluate the cloacal aerobic bacteria profile of nestling scarlet ibis in a mixed colony in Jarivatuba Island, in Joinville, Santa Catarina, Brazil. Cloacal swab samples were collected from clinically normal scarlet ibis nestlings during the breeding season of 2015/2016 (n=16) and 2016/2017 (n=34), and plated onto blood, MacConkey, and Salmonella-Shigella agar plates. Escherichia coli, Proteus vulgaris, Proteus spp., Klebsiella sp., Enterococcus spp. and Staphylococcus spp. were isolated and may be representative of the normal microbiota of E. ruber, although the normal profile is unknown for the species. However, the location of this colony in an area without adequate sewage treatment, which receives domestic effluents, may indicate a modified bacterial profile. Further studies are needed, to better understand the host's natural microbiome, as well as on the bacterial isolates, in order to characterize any association with the contaminated water. These results lay the foundation for successful species conservation projects in the area by providing insights that will help improve the viability of nestlings in each reproductive season.