RESUMO A hepatite E é uma zoonose emergente que afeta diversas espécies de mamíferos, inclusive o ser humano. É ocasionada por um vírus da espécie Orthohepevirus A que possui diversos genótipos e subgenótipos. No Brasil é descrito o genótipo HEV-3, cujo principal reservatório é o porco doméstico. Testes moleculares e sorológicos demonstram o HEV-3 em diferentes estados, tanto em animais quanto em humanos. No estado de São Paulo, existem diversos estudos sobre a epidemiologia da hepatite E em humanos, mas faltam informações sobre o HEV-3 em suínos. Assim, o objetivo deste trabalho foi verificar a ocorrência de HEV por meio da técnica de RT-PCR e posterior sequenciamento em um banco de amostras de fezes de suínos colhidas entre 2008 e 2009, na região metropolitana de Campinas. Das 89 amostras analisadas, foi possível detectar o HEV-3 em sete e, pela reconstrução filogenética, foram encontrados os subgenótipos HEV-3b, HEV-3h, e HEV-3j. Uma amostra disponível no GenBank, proveniente de São Paulo, que ainda não havia sido subgenotipada, foi agrupada ao HEV-3i. Os subgenótipos HEV-3j e HEV-3i ainda não tinham sido relatados no país. O estudo demonstra uma grande diversidade genética do HEV no estado de São Paulo e reforça o caráter zoonótico da HEV-3.

RESUMO A mastite clínica bovina causada por Staphylococcus spp. é uma doença grave e generalizada no mundo da pecuária leiteira. A terapia antimicrobiana é de fundamental importância na prevenção e no tratamento da mastite infecciosa, mas o uso indiscriminado de antimicrobianos atua como fator determinante para a disseminação da doença. O presente estudo avaliou os perfis de resistência de 57 Staphylococcus spp. isolados de mastite clínica bovina em relação ao uso de betalactâmicos e gentamicina, relacionando características do fenótipo (testes de suscetibilidade in vitro) e genótipo (detecção e expressão de genes que codificam resistência - mecA, mecALGA251, blaZ, femA, femB, e aacA-aphD - usando PCR e RT-PCR, respectivamente). Um ou mais genes que codificam resistência a diferentes antimicrobianos foram detectados em 50 Staphylococcus spp. isolados. Os genes femA e femB foram os mais frequentes (75,4% para ambos). A expressão observada dos genes foi a seguinte: blaZ (60%), femA (39,5%), aacA-aphD (50%), femB (32,6%), mecA (8,3%) e mecALGA251 (0%). Considerando-se a relevância do gênero Staphylococcus para a mastite bovina, este estudo teve como objetivo elucidar aspectos referentes aos perfis genotípico e fenotípico desses microrganismos, a fim de contribuir para o desenvolvimento de estratégias eficazes para o controle da mastite.

ABSTRACT Bovine clinical mastitis caused by Staphylococcus spp. is a serious and widespread disease in the world of dairy farming. Antimicrobial therapy is of fundamental importance in the prevention and treatment of infectious mastitis, but the indiscriminate use of antimicrobials acts as a determining factor for the spread of the disease. The present study evaluated the resistance profiles of 57 Staphylococcus spp. isolated from bovine clinical mastitis to beta-lactams and gentamicin, relating characteristics of phenotype (in vitro susceptibility tests) and genotype (detection and expression of genes encoding resistance - mecA, mecALGA251, blaZ, femA, femB, and aacA-aphD - using PCR and RT-PCR, respectively). One or more genes coding for resistance to different antimicrobials were detected in 50 Staphylococcus spp. isolates. The femA and femB genes were the most frequent (75.4% for both). The observed expression of the genes was as follows: blaZ (60%), femA (39.5%), aacA-aphD (50%), femB (32.6%), mecA (8.3%), and mecALGA251 (0%). Considering the relevance of the genus Staphylococcus to bovine mastitis, this study aimed to elucidate aspects regarding the genotypic and phenotypic profiles of these microorganisms so as to contribute to the development of effective strategies for mastitis control.

Este artigo descreve a anteriormente desconhecida diversidade molecular de amostras brasileiras de Coronavírus canino (CCoV). Vinte e duas amostras foram submetidas à análise da sequência parcial do gene codificador da proteína de membrana, sendo 12 classificadas como CCoV Tipo II e 10 como CCoV Tipo I e uma possível sublinhagem tipicamente brasileira foi encontrada para o CCoV Tipo II.

The identification of pathogens of viral (Rotavirus, Coronavirus), parasitic (Toxocara spp.) and bacterial (Escherichia coli, Salmonella spp., Rhodococcus equi) origin shed in feces, and the virulence profile of R. equi and E. coli isolates were investigated in 200 samples of sand obtained from 40 parks, located in central region of state of Sao Paulo, Brazil, using different diagnostic methods. From 200 samples analyzed, 23 (11.5%) strains of R. equi were isolated. None of the R. equi isolates showed a virulent (vapA gene) or intermediately virulent (vapB gene) profiles. Sixty-three (31.5%) strains of E. coli were identified. The following genes encoding virulence factors were identified in E. coli: eae, bfp, saa, iucD, papGI, sfa and hly. Phylogenetic classification showed that 63 E. coli isolates belonged to groups B1 (52.4%), A (25.4%) and B2 (22.2%). No E. coli serotype O157:H7 was identified. Eggs of Toxocara sp. were found in three parks and genetic material of bovine Coronavirus was identified in one sample of one park. No Salmonella spp. and Rotavirus isolates were identified in the samples of sand. The presence of R. equi, Toxocara sp, bovine Coronavirus and virulent E. coli isolates in the environment of parks indicates that the sanitary conditions of the sand should be improved in order to reduce the risks of fecal transmission of pathogens of zoonotic potential to humans in these places.

A semi-intensive wildlife boars farm presented a clinical history of high mortality in 70 - 90 days-old pigs (> 50 %). Two 90 days-old animals with weight loss and wasting were necropsied and the samples tested for PCV2 by polymerase chain reaction (PCR). The genetic material of PCV2 was sequenced and classified into the PCV2a genotype together with PCV2 sequences obtained from samples of Poland, Brazil, Slovenia and Greece wild boars.

Caracterizou-se filogeneticamente o vírus da raiva, isolado de morcegos hematógafos (Demodus rotundus). Cento e noventa e nove D. rotundus foram capturados em cinco abrigos, no Norte e Noroeste do Estado do Rio de Janeiro e sul do Espírito Santo. Sete deles foram positivos para a raiva. Amostras desses vírus foram sequenciadas e comparadas com sequências provenientes de diversos estados brasileiros. As sequências de vírus da raiva isoladas, na região norte do Estado do Rio de Janeiro, mostraram características que as distinguem de amostras de vírus isoladas em outras regiões do país, no entanto foram idênticas às isoladas de bovinos no noroeste do Rio de Janeiro.

Rabies samples isolated from vampire bats captured in the Rio de Janeiro State were phylogenetically analyzed. One hundred and ninety nine vampire bats were captured from five shelters from North and Northwest of Rio de Janeiro and South of Espírito Santo States. Seven of them were positive for rabies. Theses samples were sequenced and compared with rabies virus sequences from several Brazilian states. The sequences of rabies virus, isolated in the present work, from North of Rio de Janeiro State, showed characteristics that differ of the sequences isolated from bats from other Brazilian regions. However, they were identical to samples isolated from cattle in Northwest of Rio de Janeiro state.

RESUMO O presente relato refere-se ao primeiro isolamento no Brasil do herpesvírus eqüino tipo 1 (HVE-1) proveniente de um caso clínico de mieloncefalopatia herpética em uma égua, que evoluiu para o óbito. O isolado do HVE-1, denominado 07/05, foi obtido a partir de uma amostra de líquor na primeira passagem em células Vero, confirmando-se sua identidade pela PCR e pela prova de neutralização viral. Como o isolamento viral a partir do líquor geralmente não é bem sucedido, conforme demonstrado em vários relatos de casos, o presente achado sugere que a doença neurológica foi causada por uma amostra particularmente neurovirulenta de HVE-1.

ABSTRACT This report describes the first Brazilian equine herpesvirus type 1 (EHV-1) isolation from a single fatal equine herpes myeloencephalopathy case in a mare. The isolation of EHV-1 was confirmed from the first passage of cerebrospinal fluid (CSF) sample in Vero cells by PCR and virus neutralization assay. As virus isolation from CSF is unlikely to be successful, as has been shown in several case reports, this circumstantial evidence suggests that the neurological disease was caused by particularly neurovirulent strain of EHV-1.

Descreve-se a pesquisa de BCoV e rotavírus em 13 mostras fecais de vacas de surtos de disenteria utilizando uma nested PCR dirigida ao gene RdRp e PAGE, respectivamente. Todas as amostras fecais foram positivas para BCoV e nenhuma delas apresentou-se positiva para rotavírus em PAGE. O encontro de coronavírus bovino em amostras fecais de vacas com disenteria sugere que este vírus possa ser o agente primário envolvido na etiologia dos casos aqui relatados.

Onze amostras de sistema nervoso central de cães coletados entre 2000 e 2004 foram positivas pela RT-PCR, a qual amplificou um fragmento de 480pb do gene N do vírus da cinomose canina (VCC). A análise filogenética baseada na seqüência parcial do gene N mostrou quatro principais agrupamentos genéticos. Todas as amostras de cães segregaram no agrupamento I, com identidade média de nucleotídeos de 95,8% e 95,6% com as amostras vacinais Onderstepoort e Lederle, respectivamente. O agrupamento II agregou todas as amostras relacionadas aos guaxinins. O agrupamento III agregou amostras orientais e o agrupamento IV agregou as amostras vacinais Onderstepoort e Lederle, com identidade média de nucleotídeos de 99,7% entre elas. Este é o primeiro relato de análise filogenética de amostras de VCC no Brasil.

Eleven central-nervous-system samples collected from stray dogs between 2000 and 2004 were found positive by RT-PCR, which amplified a 480bp fragment of the N gene of canine distemper virus (CDV). Phylogenetic analysis based on partial N-gene sequences showed four major clusters. All dog strains segregated into cluster I, with a mean nucleotide identity of 95.8% and 95.6% with the Onderstepoort and Lederle vaccine strains, respectively. Cluster II contained all the raccoon-related strains, cluster III Orient strains and Cluster IV the Onderstepoort and Lederle vaccine strains, with a mean nucleotide identity of 99.7% between them. This is the first report of phylogenetic analysis of CDV strains in Brazil.

RESUMO Coronavírus têm um interesse especial em cavalos, uma vez que causam doenças em potros e adultos. Este estudo objetivou avaliar a existência de coronavírus, rotavírus, protozoários e bactérias em fezes de um potro com 3 dias de idade sofrendo de diarréia aguda. Uma reação de nested-RT-PCR para o gene da RNA-polimerase RNA-dependente foi aplicada para a detecção de coronavírus e as provas de PAGE, teste de flutuação em sacarose e bacteriologia clássica foram aplicadas para a pesquisa de rotavírus, protozoários e bactérias, respectivamente. Um coronavírus entérico do grupo II foi encontrado, sem outras infecções ou infestações simultâneas. O papel dos coronavírus neste caso clínico é discutido no presente artigo, bem como as possíveis vias de transmissão.

ABSTRACT Coronaviruses are of special interest in diarrhea of horses, once they cause disease in foals and in the adult. This study aimed to evaluate the existence of coronavirus, rotavirus, protozoa and bacteria in stool of a 3-day old foal suffering from acute diarrhea. A nested PCRassay for the RNA-dependent RNA-polymerase gene was applied to coronavirus detection and PAGE, sucrose flotation test and classical bacteriology for rotavirus, protozoa and bacteria detection, respectively. An enteric group II coronavirus was found with no concurrent infections. The role of coronavirus in this clinical case is discussed, as well as possible transmission routes.

RESUMO Os rotavírus são importantes agentes virais envolvidos nas gastroenterite infantil e da diarréia dos animais neonatos. O objetivo deste trabalho foi otimizar o isolamento de rotavírus levando-se em conta o número de amostras, diferentes tratamentos com tripsina, número de passagens seriadas e monitoramento das mesmas através de eletroforese em gel de poliacrilamida (PAGE). Foram utilizadas 20 amostras fecais diarréicas, positivas para rotavírus por meio de ELISA e PAGE, oriundas de bezerros e leitões, as quais foram submetidas a quatro protocolos usando tripsina. No tratamento 1 o inóculo foi mantido e o meio de manutenção não continha tripsina; no tratamento 2 o inóculo foi dispensado e o meio de manutenção sem tripsina; no tratamento 3 o inóculo foi mantido e o meio de manutenção continha tripsina na concentração de 5 µg/mL; no tratamento 4 o inóculo foi mantido e o meio de manutenção continha tripsina na concentração de 10 µg/mL. Todos os inóculos continham tripsina na concentração de 5 mg/mL. Dentre as amostras estudadas, 15 foram isoladas com sucesso, o que representa uma eficiência de 75% (15/20). Dentre os protocolos, o tratamento 3 foi o que apresentou melhor desempenho, considerando-se o número de passagens seriadas, a ausência de citotoxidade e significância estatística (p < 0,001), quando se aplicou o teste de Freedman e o teste de Wilcoxon. neonatos levandose levando PAGE. PAGE . (PAGE) diarréicas leitões µg/mL µgmL µg mL mgmL mg mg/mL estudadas sucesso 75 15/20. 1520 15/20 (15/20) desempenho considerandose considerando p 0,001, 0001 0,001 , 0 001 0,001) Wilcoxon (PAGE 7 152 15/2 (15/20 000 0,00 00 15/ (15/2 0,0 (15/ 0, (15 (1 (

ABSTRACT Rotavirus is one of the most important etiological agents in infant gastroenteritis and diarrhea in neonatal animals. The purpose of this study was the optimization of isolation of rotaviruses in MA104 (fetal kidney Rhesus monkey) cells by the comparison of culture, taking into account the number of samples, different treatments with trypsin, number of serial passages, and positivity by polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE). Twenty diarrheic fecal samples of calves and piglets from São Paulo, State, Brazil, all positive for rotavirus in ELISA and PAGE, were submitted to four isolation protocols: in treatment 1, the inoculum was left on the monolayer and the maintenance medium was trypsin-free; treatment 2 was the same as treatment 1 except that the inoculum was discarded; in treatment 3 the inoculum was left on the monolayer and the maintenance medium had 5 µg/mL of trypsin; treatment 4 was the same as the monolayer treatment 3, except that the maintenance medium had 10 µg/mL of trypsin. Fifteen samples were successfully isolated, representing an efficacy of 75% (15/20). Treatment 3 was the most suitable because the lower number of serial passages and lower cytotoxity to the cells, with statistical significance (p < 0.001) using Freedman's and Wilcoxon's tests. animals MA MA10 fetal monkey culture trypsin PAGE. PAGE . (PAGE) Paulo State Brazil protocols trypsinfree free trypsin-free discarded µgmL µg mL isolated 75 15/20. 1520 15/20 15 20 (15/20) p 0.001 0001 0 001 Freedmans Freedman s Wilcoxons Wilcoxon tests MA1 (PAGE 7 152 15/2 (15/20 0.00 000 00 15/ (15/2 0.0 (15/ 0. (15 (1 (

RESUMO Desenvolveu-se uma reação de "nested PCR" direcionada para o gene do ectodomínio S1 da glicoproteína S dos coronavírus para a detecção de coronavírus bovino (BCoV) em amostras fecais. Foram desenhados um par de primers externos e um par de primers internos para regiões conservadas flanqueando a região hipervariável do gene S (GenBank accession No. M31053). Os primers externos produziram um fragmento de 885pb (nn 1204 ao 2088 do gene S) e os internos um fragmento de 488bp (nn 1329 ao 1816 do gene S, interno ao produto do primeiro PCR). Temperaturas ótimas de hibridação dos primers foram testadas em um termociclador com gradiente e utilizadas no protocolo final. Os limites de detecção para os primers externos e para o protocolo "nested" final foram testados com a amostra Kakekawa de BCoV diluída em base 2, em uma suspensão de fezes livre de BCoV. O protocolo final de "nested" foi testado em 22 amostras de fezes de bezerros diarréicos e não-diarreicos e em uma amostra de uma vaca com diarréia, resultando em 10 amostras positivas entre fezes diarréicas e não-diarreicas. O nested PCR aqui relatado é uma ferramenta específica e sensível para o diagnóstico de coronavírus bovino. Desenvolveuse Desenvolveu se (BCoV fecais GenBank No M31053. M31053 M . M31053) pb nn 120 208 bp 132 181 PCR. PCR) 2 nãodiarreicos não diarreicos diarréia 1 nãodiarreicas. nãodiarreicas diarreicas. diarreicas não-diarreicas M3105 12 20 13 18 M310 M31 M3

ABSTRACT A nested PCR targeted to the S1 ectodomain gene of the spike (S) glycoprotein of coronaviruses was developed to detect bovine coronavirus (BCoV) in stool specimens from cattle. One outer and one internal pair of primers were designed to conserved regions surrounding the hypervariable region of the S gene (GenBank accession No. M31053). Outer primers produced an 885bp-long product (nn 1204 to 2088 from S gene) and the internal primers a 488bp-long product (nn 1329 to 1816 from S gene, internal to the first PCR). Optimal annealing temperatures were tested in a gradient thermocycler and used in the final protocols. Outer primers and the final nested protocol detection limits were tested with the BCoV Kakegawa strain diluted two-fold in BCoV-free stool suspension. The nested PCR assay was tested in 22 clinical stool specimens from calves with or without diarrhea and 1 sample from a diarrheic cow, resulting in 10 positive samples both from diarrheic and non-diarrheic individuals. The nested PCR reported here is a specific and sensitive tool for bovine coronavirus diagnosis. (S (BCoV cattle GenBank No M31053. M31053 M . M31053) 885bplong bplong 885bp long bp nn 120 208 488bplong 488bp 132 181 PCR. PCR) protocols twofold two fold BCoVfree free suspension 2 cow nondiarrheic non individuals diagnosis M3105 12 20 13 18 M310 M31 M3