ABSTRACT: Quantile Random Forest (QRF) is a non-parametric methodology that combines the advantages of Random Forest (RF) and Quantile Regression (QR). Specifically, this approach can explore non-linear functions, determining the probability distribution of a response variable and extracting information from different quantiles instead of just predicting the mean. This evaluated the performance of the QRF in the genomic prediction for complex traits (epistasis and dominance). In addition, compare the accuracies obtained with those derived from the G-BLUP. The simulation created an F2 population with 1,000 individuals and genotyped for 4,010 SNP markers. Besides, twelve traits were simulated from a model considering additive and non-additive effects, QTL (Quantitative trait loci) numbers ranging from eight to 120, and heritability of 0.3, 0.5, or 0.8. For training and validation, the 5-fold cross-validation approach was used. For each fold, the accuracies of all the proposed models were calculated: QRF in five different quantiles and three G-BLUP models (additive effect, additive and epistatic effects, additive and dominant effects). Finally, the predictive performance of these methodologies was compared. In all scenarios, the QRF accuracies were equal to or greater than the methodologies evaluated and proved to be an alternative tool to predict genetic values in complex traits. ABSTRACT (QRF nonparametric non parametric RF (RF QR. QR . (QR) Specifically nonlinear linear functions mean epistasis dominance. dominance dominance) addition GBLUP. GBLUP G BLUP. BLUP F 1000 1 000 1,00 4010 4 010 4,01 markers Besides nonadditive effects Quantitative loci 120 03 0 3 0.3 05 5 0.5 08 8 0.8 validation 5fold fold crossvalidation cross used calculated effect effects. effects) Finally compared scenarios (QR 100 00 1,0 401 01 4,0 12 0. 10 1, 40 4,

RESUMO: Quantile Random Forest (QRF) é uma metodologia não paramétrica, que combina as vantagens do Random Forest (RF) e da Regressão Quantílica (QR). Especificamente, essa abordagem pode explorar funções não lineares, determinando a distribuição de probabilidade de uma variável resposta e extraindo informações de diferentes quantis em vez de apenas prever a média. O objetivo deste trabalho foi avaliar o desempenho do QRF em predizer o valor genético genômico para características com arquitetura genética não aditiva (epistasia e dominância). Adicionalmente, as acurácias obtidas foram comparadas com aquelas advindas do G-BLUP. A simulação criou uma população F2 com 1.000 indivíduos genotipados para 4.010 marcadores SNP. Além disso, doze características foram simuladas a partir de um modelo considerando efeitos aditivos e não aditivos, com número de QTL (Quantitative trait loci) variando de oito a 120 e herdabilidade de 0,3, 0,5 ou 0,8. Para treinamento e validação foi usada a abordagem da validação cruzada 5-fold. Para cada um dos folds foram calculadas as acurácias de todos os modelos propostos: QRF em cinco quantis diferentes e três modelos do G-BLUP (com efeito aditivo, aditivo e epistático, aditivo e dominante). Por fim, o desempenho preditivo dessas metodologias foi comparado. Em todos os cenários, as acurácias do QRF foram iguais ou superiores às metodologias avaliadas e mostrou ser uma ferramenta alternativa para predizer valores genéticos em características complexas. RESUMO (QRF paramétrica RF (RF QR. QR . (QR) Especificamente lineares média epistasia dominância. dominância dominância) Adicionalmente GBLUP. GBLUP G BLUP. BLUP F 1000 1 000 1.00 4010 4 010 4.01 SNP disso Quantitative loci 12 03 0 3 0,3 05 5 0, 08 8 0,8 5fold. 5fold fold fold. 5-fold propostos epistático dominante. dominante dominante) fim comparado cenários complexas (QR 100 00 1.0 401 01 4.0 10 1. 40 4.

ABSTRACT The aim of this study was to estimate the additive and permanent maternal effect, age, sex and year of the campaign on the body weights at birth, weaning and first shearing and fleece weight in Huacaya alpacas from the La Raya Research and Production Centre in Puno, Peru, at an altitude between 4100 and 5000 above the sea level. In total, 1494 sheared offspring corresponding to two campaign periods were evaluated. The productive characteristics were subjected to a mixed model, where the campaign and the sex of the calf were adjusted with their age at weaning and first shearing and included as fixed effects. The random effects were maternal additive genetic value and mother’s age as permanent maternal effects. The variance components were estimated by the Restricted Maximum Likelihood (REML). The average age of tuis alpacas at weaning was 240.1 ± 0.3 days, while the age at first shearing was 278.7 ± 0.3 days, during which they had a linear growth of 0.11-0.12 kg of body weight increase. The maternal heritability was 0.32 ± 0.058,0.49 ± 0.050, 0.39 ± 0.056 and 0.19 ± 0.064 for the body weights at birth, weaning and first shearing and fleece weight, respectively. The campaign had an influence on the productive characteristics evaluated, while the sex of the offspring was preponderant only at weaning, with the females being the best performers. The additive and permanent maternal genetic effects were more prevalent in body weight of the animal compared to its fleece weight.

RESUMEN El objetivo de este trabajo fue estimar el efecto materno aditivo y permanente, edad, sexo y año de la campaña sobre los pesos al nacimiento, destete y primera esquila y peso de vellón en alpacas Huacaya del Centro de Investigación y Producción La Raya, en Puno, Perú, a una altitud entre 4100 y 5000 msnm. Se evaluaron 1494 crías esquiladas correspondientes a dos periodos de campaña. Las características productivas fueron sometidas a un modelo mixto, donde se incluyó como efectos fijos a la campaña y el sexo de la cría ajustado con su edad al destete y primera esquila. Los efectos aleatorios fueron valor genético aditivo materno y edad de la madre como efecto materno permanente. Los componentes de variancia se estimaron por la Máxima Verosimilitud Restringida (REML). La edad promedio de las alpacas tuis al destete fue 240.1 ± 0.3 días, mientras que la edad a la primera esquila fue 278.7 ± 0.3 días, durante el cual tuvieron un crecimiento lineal de 0.11-0.12 kg de incremento de peso vivo. La heredabilidad materna fue 0.32 ± 0.058, 0.49 ± 0.050, 0.39 ± 0.056 y 0.19 ± 0.064 para los pesos al nacimiento, destete y primera esquila y peso de vellón, respectivamente. La campaña tuvo influencia sobre las características productivas evaluadas, mientras que el sexo de la cría fue preponderante solo al destete, siendo las hembras las de mejor rendimiento. Los efectos genéticos aditivos y permanentes maternos fueron más preponderantes en peso vivo del animal en comparación a su peso de vellón.

ABSTRACT The aim of this study was to estimate genetic parameters and predict genetic merit for milk production adjusted to 305 days (PL) in crossbred cattle as selection criteria. Records of productive data was used from 289 purebred and crossbred animals with 349 lactations between 2000 and 2019. To obtain the PL, the incomplete gamma equation proposed by Woods was applied. The statistical and animal models included the random effects: additive genetic, permanent and temporary environments, while the fixed effects were breed composition, lactation and year of initiation of lactation. To analyze the variance components for the calculation of heritability (h2) and repeatability (r) for PL, the VCE v. 6.0 program was used and the breeding values through the animal model using the MTDFRELM software. Eleven inbred animals were reported with a mean inbreeding coefficient of 0.107 ± 0.115. The mean PL was 2972.1 ± 51.1 kg. Differences were found in breed composition (p<0.05), number of lactations and year of initiation of lactation (p<0.01). The h2 was 0.26 ± 0.16 and r was 0.51 ± 0.15. The predicted genetic values for evaluated animals ranged between -241.5 and +266.5 kg of PL, highlighting the trihybrid breed composition between Holstein, Jersey, Monbéliarde and Red Swedish. Most of the breeding values are pronounced from the fourth lactation. It is concluded that the additive genetic effect is moderately heritable, which indicates the feasibility of increasing the PL, through the adequate selection of elite animals.

RESUMEN El objetivo del estudio fue estimar parámetros genéticos y predecir el mérito genético para producción de leche ajustada a 305 días (PL) en bovinos mestizos como criterio de selección. Se utilizó información productiva de 289 animales entre puros y mestizos con 349 registros de lactancias entre los años 2000 y 2019. Para obtener la PL se aplicó la ecuación gamma incompleta propuesta por Woods. Los modelos estadístico y animal incluyeron los efectos aleatorios: genético aditivo, ambientes permanente y temporal, mientras que los efectos fijos fueron: composición racial, lactancia y año de inicio de lactancia. Para analizar los componentes de la varianza para el cálculo de la heredabilidad (h2) y repetibilidad (r) para PL se utilizó el programa VCE v. 6.0 y los valores de cría a través del modelo animal mediante el software MTDFRELM. Se reportaron 11 animales endogámicos con coeficiente de consanguinidad promedio de 0.107 ± 0.115. La PL media fue de 2972.1 ± 51.1 kg. Se hallaron diferencias en composición racial (p<0.05), número de lactancias y año de inicio de lactancia (p<0.01). La h2 fue de 0.26 ± 0.16 y r de 0.51 ± 0.15. Los valores géticos predichos para animales evaluados variaron entre -241.5 y +266.5 kg de PL, destacándose las composiciones raciales trihíbridas entre Holstein, Jersey, Monbéliarde y Sueco rojo. La mayoría de los valores de cría se pronuncian a partir de la cuarta lactancia. Se concluye que el efecto genético aditivo es moderadamente heredable, lo que indica la factibilidad de aumentar la PL, a través de la adecuada selección de animales élite.

The aim of this study was to estimate the genetic parameters (heritability and genetic correlations) for characters associated with the uniformity of fibre diameter in fleece of young (tuis) alpacas of the Mallkini farm (Puno, Peru). Samples were taken from the thigh, mid-rib and shoulder of 1127 animals at the first shearing (573 males and 554 females) born in 2015 and 2016. The samples were analysed under the IWTO-12 standard of the Sirolan Laserscan equipment. The pedigree file had 10 481 alpacas giving a coefficient of inbreeding of 0.16%. The genetic parameters were estimated using ASReml and Pedigree Viewer software. The characters evaluated were the fibre diameter and its standard deviation, coefficient of variation and comfort factor. The genetic analysis was carried out using a multivariate animal model, which includes the additive genetic effect of the animal as a random effect; year of shearing, group/category and sex as fixed effects, and age of shearing as a linear covariable. The heritability for all the characteristics by body area was moderate (0.12 to 0.38) and for the mean of the three body areas was also moderate, except for the coefficient of variation (0.17 to 0.43). The genetic correlation between the fibre diameter and the standard deviation showed a high and positive value (0.80), while for the comfort factor it had a high and negative correlation (-0.93) and for the coefficient of variation was negative and low (-0.06). In conclusion, there is a high degree of genetic correlation between the fibre diameter and its standard deviation, so that selecting for both characters would reduce the variability of fineness in the fleeces

El objetivo del presente estudio fue estimar los parámetros genéticos (heredabilidad y correlaciones genéticas) para caracteres asociados a la uniformidad del diámetro de fibra en el vellón de alpacas tuis del fundo Mallkini (Puno, Perú). Se utilizaron muestras de las zonas corporales de muslo, costillar medio y paleta de 1127 animales a la primera esquila (573 machos y 554 hembras) nacidos en 2015 y 2016. Las muestras fueron analizadas bajo la norma IWTO-12 del equipo Sirolan Laserscan. El archivo de pedigrí contaba con 10 481 alpacas dando un coeficiente de consanguinidad de 0.16%. Los parámetros genéticos se estimaron mediante los softwares ASReml y Pedigree Viewer. Los caracteres evaluados fueron el diámetro de fibra (DF) y su desviación estándar (DE), coeficiente de variación (CV) y factor de confort (FC). El análisis genético se realizó utilizando un modelo animal multivariado, que incluye el efecto genético aditivo del animal como efecto aleatorio; año de esquila, punta y sexo como efectos fijos, y edad de esquila como covariable lineal. Las heredabilidades para todas las características por zona fueron moderadas (0.12 a 0.38) y para las zonas en conjunto resultaron también moderadas, excepto para el coeficiente de variación (0.17 a 0.43). La correlación genética entre el diámetro de fibra y la desviación estándar mostró un valor elevado y positivo (0.80), mientras que para el factor de confort fue alto y negativo (-0.93) y para el coeficiente de variación fue negativo y bajo (-0.06). En conclusión, existe un alto grado de correlación genética entre el diámetro de fibra (DF) y su desviación estándar (DE), de modo que seleccionando por ambos caracteres se lograría reducir la variabilidad de finura en los vellones

Resumo A região Centro-Oeste tem se destacado como produtora de carne bovina e, para tanto, produzir com eficiência tem sido a meta dos produtores. Nesse sentido, objetivou-se estimar parâmetros e tendências genéticas para pesos aos 240 (P240) e 420 (P420) dias de idade em bovinos da raça Nelore, criados na região de Goiás, Brasil. Utilizaram-se 48.580 dados para P240 e 28.685 para P420. Os parâmetros genéticos foram obtidos por análises univariadas em que o modelo continha os efeitos fixos de grupo de contemporâneos (estação de nascimento - águas e seca -, ano de nascimento, sexo e fazenda) e a covariável idade da vaca. Como efeito aleatório, utilizou-se o efeito aditivo direto e materno para P240 e apenas direto para P420. As tendências genéticas foram obtidas por meio da análise de regressão do valor genético do animal sobre ano de nascimento. Os resultados obtidos de herdabilidade direta foram 0,15 ± 0,02 para P240 e 0,24 ± 0,00 para P420. O ganho genético anual foi de 0,274 kg para P240 e de 0,506 kg P420. Os resultados indicam a possibilidade de se obterem maiores ganhos genéticos por meio da seleção, que está sendo mais eficiente sobre o P420.

Abstract The Midwest region has excelled as a beef producer and producing efficiently has been the goal of livestock farmers. This study aimed to estimate the genetic parameters and trends for weights at 240(W240) and 420(W420) days of age in Nellore cattle, reared in Goias state, Brazil. A total of 48,580 data for W240 and 28,685 for W420 were used. Genetic parameters were obtained by univariate analysis. The model included the fixed effects of contemporary group (birth season-dry and wet-, year of birth, sex and farm) and covariate age of cow. Direct and maternal effects were used as random effect for W240 and the direct effect for W420. The genetic trends were obtained by regression analysis of the genetic value of the animal on the year of birth. The results of direct heritability were 0.15 ± 0.02 for W240 and 0.24 ± 0.00 for W420. The annual genetic gain was 0.311 kg for W240 and 0.511 kg for 420 days of age (W420). The results indicate the possibility of obtaining higher genetic gains through selection; however, the selection is being more efficient at W420.

The objective of this study was to estimate genetic parameters for milk production and reproduction traits using phenotypic and pedigree information from the Dairy Overo Colorado breed from southern Chile. Single- and multi-trait mixed models were used to analyze the data. Analyses were performed using ASReml software. The heritability estimates for milk yield, fat yield, protein yield, fat content, protein content, age at first calving and calving interval were 0.29 ± 0.04, 0.34 ± 0.04, 0.30 ± 0.04, 0.56 ± 0.04, 0.56 ± 0.04, 0.01 ± 0.07 and 0.002 ± 0.02, respectively. The genetic correlations between yield traits were high and positive (≥ 0.81). The genetic correlations of milk yield with fat content (-0.32) and protein content (-0.34) were unfavorable. The genetic correlation estimates between age at first calving and yield traits were negative, ranging between -0.71 and -0.29. The phenotypic correlations between calving interval and milk yield traits were slightly positive (0.06-0.09), suggesting a weak relationship between reproduction and yield in this population. Genetic variation was significantly greater than zero for milk production traits. Genetic improvement for age at first calving and calving interval may be slow because small differences between animals and low reliabilities are expected for estimated breeding values for these traits due to heritabilities close to zero. The design of an efficient breeding program for yield traits based on artificial insemination for this population is feasible using either progeny testing or genomic breeding value prediction to select sires.

El objetivo de este estudio fue estimar parámetros genéticos para características de producción de leche y reproducción en la raza Overo Colorado Lechero del sur de Chile. Se utilizaron modelos de una y múltiples características para analizar los datos. Los análisis se realizaron usando el programa ASReml. Los estimados de heredabilidad para producción de leche, producción de grasa, producción de proteína, contenido de grasa, contenido de proteína, edad al primer parto e intervalo entre partos fueron 0.29 ± 0.04, 0.34 ± 0.04, 0.30 ± 0.04, 0.56 ± 0.04, 0.56 ± 0.04, 0.01 ± 0.07 y 0.002 ± 0.02, respectivamente. Las correlaciones genéticas entre las características de producción fueron altas y positivas (≥ 0.81). Las correlaciones genéticas de la producción de leche con el contenido de grasa (-0.32) y el contenido de proteína (-0.34) fueron desfavorables. La correlación genética entre edad al primer parto y las características de producción fueron negativas entre -0.71 and -0.29. Las correlaciones fenotípicas entre el intervalo entre partos y las características de producción de leche fueron ligeramente positivas, (0.06-0.09), lo que sugiere una relación débil entre reproducción y producción en esta población. La variación genética es significativamente mayor a cero para las características de producción de leche. El mejoramiento genético para edad al primer parto e intervalo entre partos será lento, debido a que se esperan pequeñas diferencias entre animales y bajas confiabilidades para los valores genéticos estimados, debido a que los valores de las heredabilidades son cercanos a cero. El diseño de un programa eficiente de mejoramiento genético para características de producción basado en inseminación artificial para esta población es factible usando pruebas de progenie o predicciones del valor genético aditivo usando evaluaciones genómicas para la selección de sementales.

RESUMO Este trabalho objetivou selecionar progênies F2 de feijão-vagem para caracteres relacionados à produção de vagens e grãos através do procedimento REML/BLUP. O experimento foi conduzido na área experimental do Instituto Federal Fluminense (IFF), localizado no município de Bom Jesus do Itabapoana-RJ. Foram semeadas linhas de 55 genótipos, entre eles, 42 progênies F2 oriundas de cruzamentos dialélicos, além dos 13 parentais, utilizados como testemunhas. Cada linha foi composta por 24 plantas, sem repetições e o espaçamento utilizado foi de 1,0x0,5 m. As plantas foram colhidas e avaliadas individualmente para as características produção de vagens verdes por planta e produção de grãos por planta. Foi realizada a seleção entre e dentro de progênies via BLUP utilizando-se o programa Selegen-REML/BLUP. Com base na Máxima Verossimilhança Restrita (REML), foi possível estimar os coeficientes de variação genético e residual de 19,43% e 33,53%, respectivamente para produção de vagens verdes por planta e produção de grãos por planta. Utilizou-se 7,9% de intensidade de seleção, totalizando 100 plantas selecionadas com base no valor genotípico individual. A acurácia estimada para a seleção de progênies foi de 0,5014 para a produção de vagens e 0,5130 para produção de grãos, indicando dificuldades na seleção dos caracteres devido à alta influência ambiental sobre as características de produção. Apesar disso, a predição dos valores genéticos estimados por meio do Melhor Preditor Linear Não-Viesado (BLUP), apontou os cruzamentos Feltrin x UENF 15-23-4, UENF 7-5-1 x UENF 9-24-2 e Feltrin x UENF 14-3-3 como as progênies mais promissoras, com ganhos de 65,66 g, 61,49g e 57,63 g, respectivamente na produção de vagens verdes e 52,45 g, 46,96 g e 49,29 g, respectivamente na produção de grãos. O ganho genético aditivo predito com a seleção foi de 36,05% na produção de grãos, e 33,5% na produção de vagens verdes. Conclui-se que a seleção via BLUP para a produção de vagens e grãos possibilitou a predição e obtenção de ganhos genéticos significativos para o melhoramento do feijão-vagem nas próximas gerações.

Selection indices were derived in order to improve the production of beef from Braunvieh cattle considering their birth weight (BW), adjusted weaning weight at 240 d (WW240) and at one year of age, the age at first calving (AFC9B) and calving interval (Cl); relative economic values and genetic parameters were also derived. The animal model included the contemporary group, direct additive, maternal additive, permanent environmental and error effects; in addition to the covariate age of the cow at calving. 15 selection indices with restrictions on genetic change, birth weight, age at first birth or both, and others without restrictions were formulated using the different groups of calculated economic values. Within the first group of economic values, the accuracy of the selection indices without restrictions varied from 0.342 to 0.464, and with restrictions from 0.192 to 0.717. Whereas within the second group of economic values, the accuracy of the indices without restrictions varied from 0.516 to 0.602, and with restrictions from 0.351 to 0.635. There is no observed genetic deterioration for reproduction characteristics, even though they are not included in the selection criteria. Reproduction characteristics seem to be of secondary importance in the selection of beef cattle, after growth characteristics.

Se derivaron índices de selección para mejorar la producción de carne en bovinos Suizo Europeo considerando el peso al nacer (PN), al destete ajustado a 240 d (PD240) y al año de edad, la edad al primer parto (EPP) e intervalo entre partos (IP); se derivaron valores económicos relativos y parámetros genéticos. El modelo animal incluyó los efectos de grupo contemporáneo, aditivo directo, aditivo materno, ambiental permanente y el error; además de la covariable edad de la vaca al parto. Se construyeron 15 índices de selección con restricción en el cambio genético, peso al nacimiento, edad al primer parto o ambos, y otros sin restricción, usando los diferentes grupos de valores económicos calculados. Con el primer grupo de valores económicos, la exactitud en los índices de selección sin restricción varió de 0.342 a 0.464, y con restricción de 0.192 a 0.717. En tanto que con el segundo grupo de valores económicos, la exactitud en los índices sin restricción variaron de 0.516 a 0.602, y con restricción de 0.351 a 0.635. No se observó un deterioro genético de las características de reproducción, aunque no sean incluidas en el criterio de selección. Las características de reproducción parecen ser de importancia secundaria en la selección de bovinos de carne, después de las características de crecimiento.

ResumoObjetivou-se avaliar as características produtivas e reprodutivas de fêmeas 1/2 Holandês x ¼ Nelore, ¼ Gir (Nelogir). Avaliou-se os efeitos de ordem e época de parto, do reprodutor da raça Gir e do reprodutor da raça Holandesa, avô materno e pais das matrizes 1/2 Holandês x Nelogir, respectivamente. A produção de leite total, com duração da lactação média de 288 dias, foi de 3.426,9kg de leite. A ordem de parto influenciou a produção média diária que foi maior no segundo parto e a duração da lactação, superior nos animais de primeiro parto. O período de início das águas apresentou menor duração da lactação e produção por dia de intervalo de parto. A produção de leite total não variou de acordo com o reprodutor Gir, pai da Nelogir, e foi superior nas matrizes filhas de reprodutores Holandeses com PTA positivo para leite. Ao primeiro parto o pico de produção foi de 13,03kg aos 45 dias de lactação, e a partir do segundo parto a produção foi decrescente desde o parto. Conclui-se que, em condições tropicais, as características produtivas e reprodutivas sustentam a iniciativa de produção de animais 1/2 Holandês x Nelogir a partir de matrizes compostas Nelogir e que a escolha do touro da raça Holandesa para produção de F1 HNG deve ser baseada no valor genético aditivo para produção de leite (PTA leite).

AbstractIt was aimed to evaluate the productive and reproductive traits of 1/2 Holstein x ¼ Nellore, ¼ Gir (Nelogir) females. They were evaluated the effects of order and season of calving, of Gir and Holstein sires grandfathers and fathers of the1/2 Holstein x Nelogir matrices, respectively. Total milk production, with average lactation length of 288 days, was 3,426.9kg of milk. The order of calving influenced the daily average production which was higher in the second calving and lactation length was superior in the first calving. The beginning of rain period (November to January) showed lower lactation length and production a day of calving interval. Total milk production did not vary according to Gir sire, Nelogir’s father, and was higher in the matrices daughters of Holstein sires with positive PTA for milk. In the first calving the production peak was of 13.03kg at 45 days of lactation, and from the second calving the production was descending one. In tropical conditions, productive and reproductive traits support the initiative of farm animals 1/2 Holstein x Nelogir from matrices composed Nelogir and that the choice of Holstein bull to produce F1 HNG should be based on the genetic value milk production (milk PTA).

Registros de peso ao nascer (PN) e pesos padronizados para 210 (P210); 365 (P365) e 550 (P550) dias de idade na raça Nelore foram usados com o objetivo de estimar componentes de variância dos efeitos genéticos e predição de valores genéticos dos reprodutores. O modelo incluiu os efeitos fixos de grupo contemporâneo e idade da vaca ao parto, como covariável, além dos efeitos aleatórios genético aditivo direto e genético materno, de ambiente permanente materno e ambiente temporário. As estimativas das médias e desvios-padrão para PN; P210; P365 e P550 foram iguais a 32,76 ± 3,74; 184,30 ± 29,02; 240,31 ± 41,85 e 322,12 ± 60,77, respectivamente. Em todos os pesos, verificou-se considerável variabilidade genética aditiva. A variância de ambiente permanente materno apresentou maior relevância sobre o peso a desmama, sendo praticamente inexistente após o desmame. Para a variância genética materna, a estimativa para o peso ao nascer foi mais significativa quando comparada com o peso a desmama. Os valores estimados de herdabilidade para PN; P210; P365 e P550 foram iguais a 0,37 ± 0,02; 0,36 ± 0,03; 031 ± 0,01 e 0,38 ± 0,02, respectivamente. As correlações genéticas entre peso ao nascer e outros pesos foram de baixa magnitude, com altos valores dos pesos em outras idades. O uso de reprodutores de maior valor genético para o efeito materno total permite utilizar reprodutores mais positivos para peso ao desmame e também para o ano e peso ao sobreano.

Records of birth weight (BW) and weights standardized to 210 (W210); 365 (W365) and 550 (W550) of age in the Nellore breed were used to estimate variance components of genetic effects and predict genetic values of sires. The model included the fixed effects of contemporary group and cow age at calving as co-variable, and the additive and maternal genetic, permanent maternal environmental, and temporary environmental random effects. Estimates of means and standard deviations for BW, W210; W365 and W550 were 32.76 ± 3.74; 184.30 ± 29.02; 240.31 ± 41.85 and 322.12 ± 60.77, respectively. A significant additive genetic variability was detected for all weights. The permanent maternal environmental variance showed greater relevance on weaning weight, and it was practically inexistent after weaning. For the maternal genetic variance, the estimate for birth weight was more significant as compared with weaning weight. The estimated heritability values for BW, W210; W365 and W550 were 0.37 ± 0.02; 0.36 ± 0.03; 031 ± 0.01 and 0.38 ± 0.02, respectively. Genetic correlations between birth weight and other weights were of low magnitude, with high values of weights at other ages. The use of sires of higher genetic value for total maternal effect makes it possible to use sires that are more positive for weaning weight and also for year and yearling weight.

O objetivo deste trabalho foi estimar os parâmetros genéticos e predizer o valor genético de populações e indivíduos oriundos de populações segregantes de trigo, com o uso da metodologia de modelos mistos ("restricted maximum likelihood"/"best linear unbiased prediction", REML/BLUP). Trinta e seis populações segregantes de trigo e quatro controles foram avaliados na geração F3, em delineamento de blocos ao acaso, com informações de indivíduo retiradas de dentro das parcelas. Os caracteres avaliados foram: produção de grãos, índice de colheita, número de perfilhos e altura de planta. Observou-se a existência de variabilidade genética entre populações em todos os caracteres avaliados. A herdabilidade média variou de 39,15 a 92,78%, e a acurácia, de 62,57 a 96,32%, na seleção de populações. A herdabilidade individual no sentido restrito foi baixa dentro das populações, em todos os caracteres. A acurácia na seleção individual apresentou magnitude média, quanto ao caráter altura de plantas, e baixa quanto aos demais caracteres. A herdabilidade individual contribui para maior ganho nos caracteres altura de planta e índice de colheita com o uso do BLUP individual, em comparação ao BLUP de populações. As populações segregantes Embrapa22/BRS207, Embrapa22/VI98053, Embrapa22/IVI01041, BRS254/BRS207, BRS254/VI98053, BRS254/UFVT1Pioneiro e BRS264/BRS207 destacam-se por apresentar valor genético aditivo elevado em dois ou mais caracteres.

The objective of this work was to estimate the genetic parameters and to predict the genotypic value of populations and individuals from wheat segregating populations, using the methodology of mixed models (restricted maximum likelihood/best linear unbiased prediction, REML/BLUP). Thirty-six wheat segregating populations and four controls were evaluated in the F3 generation, in a randomized complete block design, with individual information taken from within the plots. The evaluated traits were: grain yield, harvest index, number of tillers, and plant height. Genetic variability between populations was observed for all evaluated traits. The mean heritability varied from 39.15 to 92.78%, and accuracy varied from 62.57 to 96.32% in the selection of populations. The narrow-sense individual heritability was low within populations for all traits. The accuracy for individual selection had a moderate value for plant height, and low values for the other traits. Individual heritability contributes to a greater gain for the traits plant height and harvest index with the use of individual BLUP, in comparison to population BLUP. The segregating populations Embrapa22/BRS207, Embrapa22/VI98053, Embrapa22/IVI01041, BRS254/BRS207, BRS254/VI98053, BRS254/UFVT1Pioneiro, and BRS264/BRS207 stand out with high additive genetic value, for two or more traits.

Objetivou-se neste trabalho selecionar progênies de Coffea arabica para resistência à M. paranaensis em área cafeeira infestada usando a abordagem de modelos mistos de Henderson. Quarenta e um genótipos foram selecionados no Banco Ativo de Germoplasma de Café de Minas Gerais e avaliados individualmente quanto ao diâmetro de caule, número de ramos plagiotrópicos, caracterização da reação dos genótipos ao nematoide e produção por planta. Houve variabilidade genética entre os genótipos estudados para todas as características avaliadas, e entre as populações estudadas para as características produção e caracterização da reação dos genótipos ao nematoide, indicando possibilidades de obtenção de ganhos genéticos pela seleção nesta população. As correlações genotípicas entre todas as características estudadas foram significativas. Cafeeiros da população de Híbrido de Timor UFV 408-01 e progênies F3 derivadas do cruzamento entre Catuaí Vermelho e Amphillo MR 2161 foram os mais promissores em área infestada por M. paranaensis.

The purpose of this study was to select Coffea arabica progenies for resistance to M. paranaensis in an infested coffee growing area using Henderson's mixed model methodology. Forty-one genotypes were selected at the Coffee Active Germplasm Bank of Minas Gerais, and evaluated in regard to stem diameter, number of plagiotropic branches, reaction to the nematode, and yield per plant. There was genetic variability among the genotypes studied for all the traits evaluated, and among the populations studied for yield and reaction to the nematode, indicating possibilities for obtaining genetic gains through selection in this population. There was high rate of genotypic association between all the traits studied. Coffee plants of Timor Hybrid UFV408-01 population, and F3 progenies derived from crossing Catuaí Vermelho and Amphillo MR 2161 were the most promising in the area infested by M. paranaensis.

O objetivo do estudo foi avaliar a estrutura de grupos genéticos aditivos como uma alternativa para melhor ajuste de animais com paternidade desconhecida nas avaliações genéticas. As características estudadas foram: peso a desmama; peso ao sobreano; ganho de peso pós-desmama em 345 dias; perímetro escrotal ao sobreano e o escore visual de musculosidade ao sobreano. Um banco em que todos os animais tinham paternidade conhecida foi utilizado como grupo controle. A partir deste, três cenários foram criados em que 30; 50 ou 70% dos indivíduos foram aleatoriamente assumidos como animais com paternidade desconhecida. As estratégias consideradas de grupos genéticos aditivos foram: ano de nascimento do animal com paternidade desconhecida; fazenda de nascimento do animal com paternidade desconhecida; ano de nascimento e fazenda de nascimento do animal e um grupo controle negativo que manteve os animais com pais desconhecidos. A estratégia adequada de grupo genético aditivo foi escolhida como sendo aquela que resultou em um maior coeficiente de regressão e com valor genético aditivo mais próximos ao predito para os animais do grupo controle. Os resultados que incluíram a estratégia de grupo genético aditivo nos modelos de predição dos valores genéticos mostraram maior coerência com o grupo controle, frente a não inclusão destes nas análises. Dentre as estratégias propostas, ano de nascimento e fazenda de nascimento do animal e apenas ano de nascimento do animal com paternidade desconhecida obtiveram os melhores resultados.

The paper aims to analyze the structure of additive genetic groups as an alternative to include animals with unknown parentage in genetic evaluation. Several traits were studied: weaning weight; yearling weight; post-weaning weight gain in 345 days; scrotal circumference at 18 months of age; and visual muscling scores at 18 months of age. As a control group it was used a database where all animals had known paternity. Thus, three scenarios were defined where 30%; 50% or 70% of the observations were randomly taken as animals with unknown parentage. For these three simulated databases, the strategies considered to define additive genetic groups were: effect of year at birth; effect of farm at birth; effect of year and farm at birth; and a negative control group, which considered animals with unknown paternity. The most appropriate strategy for additive genetic group was chosen as the one that resulted in a higher regression coefficient and additive genetic value closest to the predicted for those animals in the control group. The results considering the strategy of additive genetic show large agreement with the control group. Among the strategies proposed, farm of birth and year of birth of the animal with unknown parentage achieved the best results.

Objetivou-se obter parâmetros genéticos para caracteres agronômicos e de valor nutritivo da folha e do colmo de progênies de Brachiaria humidicola e comparar a seleção das melhores por um índice de seleção aditivo considerando-se apenas os caracteres agronômicos e em conjunto com os principais de valor nutritivo. Avaliaram-se 50 progênies do cruzamento cv. BRS Tupi x H31. O delineamento foi em blocos ao acaso com oito repetições. Foram realizados sete cortes em intervalos de 30 a 35 dias no período de chuvas e dois com intervalos de 60 dias no período seco. Observou-se variabilidade genética entre progênies para os caracteres. As herdabilidades médias de progênies variaram de 49,14% a 75,56% para caracteres agronômicos e de 19,59% a 71,11%, para os de valor nutritivo. Houve coincidência de nove das dez melhores progênies quando se usou o índice para somente os caracteres agronômicos ou conjuntamente com os principais caracteres de valor nutritivo.

The objectives of this study were to estimate genetic parameters for agronomic and nutritive value traits for leaves and stems of Brachiaria humidicola progenies and to compare the selection using an additive index considering the agronomic traits alone or combined with the main nutritive value traits. Fifty progenies of the cross cv. BRS Tupi x H31 were evaluated. The experiment was arranged in a randomized block design with eight replications. The forage was cut seven times, at intervals of 30 - 35 days in the rainy season and two intervals of 60 days in the dry season. Trait variability among the progenies was confirmed. The mean progeny heritability ranged from 49.14% to 75.56% for the agronomic and from 19.59% to 71.11% for nutritive value traits. Nine of the ten best lines coincided in the selection for agronomic traits alone and in the selection including the main traits of nutritive value.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a interação genótipo × ambiente (IGA) quanto ao peso ajustado aos 365 dias de idade, em bovinos da raça Nelore Mocha do Nordeste do Brasil, por meio de modelos de norma de reação, via regressão aleatória com abordagem bayesiana. Os modelos analisados incluíram o efeito fixo de idade da vaca (linear e quadrático) e os efeitos aleatórios genético aditivo e de grupo de contemporâneos. O modelo de norma de reação com variância residual homogênea e um passo (MHNRHO1P) proporcionou melhor ajuste aos dados do que os modelos com variância residual heterogênea e o modelo animal padrão (MA). As estimativas de variância genética (64,41±13,24 kg² a 842,31±58,29 kg²) e herdabilidade (0,11±0,01 a 0,63±0,02) aumentaram com a melhoria do gradiente ambiental. As correlações de Spearman variaram de 0,69 a 0,99, entre as classificações dos reprodutores com maiores valores genéticos nos MA e MHNRHO1P, nos diferentes ambientes, o que indica alteração na classificação, especialmente dos valores genéticos obtidos pelo MA nos ambientes superiores. A identificação desse nível de IGA torna necessárias as avaliações específicas dos indivíduos e rebanhos para os ambientes de baixo, médio e alto nível de produção.

The objective of this work was to evaluate the genotype × environment interaction (GEI), for the adjusted weight at 365 days of age, in Polled Nellore cattle from Northeastern Brazil, by using reaction norm models through random regression in a Bayesian approach. The analyzed models included the fixed effect of cow's age (linear and quadratic), and the genetic additive and contemporary group random effects. The one-step reaction norm models with homogeneous residual variance (RNHM1sHm) yielded better data adjustments than the models with heterogeneous residual variance, and the standard animal model (AM). The estimates of genetic variance (64.41±13.24 kg² to 842.31±58.29 kg²) and heritability (0.11±0.01 to 0.63±0.02) increased as the environmental gradient improved. Spearman correlation values ranged from 0.69 to 0.99, among the classification of breeders with the highest breeding genetic values in AM and RNHM1sHm, in distinct environments, indicating changes in classification, particularly in the genetic values obtained by AM in high-quality environments. The identification of such degree of GEI requires that specific evaluation of individuals and herds are performed for environments of low, medium and high production.