ABSTRACT: The Amazonian manatee (Trichechusinunguis) is an aquatic mammal threatened with extinction. However, few studies have investigated the pathogens in this species, which may affect both animal and human health. This study aimed to evaluate the frequency, distribution, and patterns of antimicrobial susceptibility of Staphylococcus spp. and Escherichiacoli colonizing the nasal and rectal cavities of Amazonian manatees kept in captivity at the National Institute for Amazonian Research (INPA) in the state of Amazonas, Brazil. Rectal and nasal swabs from 44 manatees of different ages were used in this study. The genus Staphylococcus was isolated from the nasal swabs of 32 (72.7%) animals, with two individuals harboring more than one species of Staphylococcus. S. sciuri was the most commonly isolated species. Resistance to penicillin was observed in 13 (40.6%) isolates, more frequent than the other antimicrobials tested (P = 0.01). E. coli was isolated from the rectal swabs of all animals, with phylogroup B1 being the most frequent among the strains obtained (P = 0.0008). Four isolates (6.8%) were positive for virulence factors, three of which were classified as enterotoxigenicE. coli (ETEC) and one as enteropathogenicE. coli (EPEC). To our knowledge, this is the first study to evaluate Staphylococcus spp. and E. coli in Amazonian manatee samples. This study revealed nasal colonization by Staphylococcus spp., mainly S. sciuri, and diarrheagenicE. coli isolates, including antimicrobial-resistant strains. ABSTRACT Trichechusinunguis (Trichechusinunguis extinction However health frequency distribution spp INPA (INPA Amazonas Brazil 4 3 72.7% 727 72 7 (72.7% animals S 1 40.6% 406 40 6 (40.6% P 0.01. 001 0.01 . 0 01 0.01) E B 0.0008. 00008 0.0008 0008 0.0008) 6.8% 68 8 (6.8% factors enterotoxigenicE ETEC (ETEC enteropathogenicE EPEC. EPEC (EPEC) knowledge samples diarrheagenicE antimicrobialresistant resistant 72.7 (72.7 40.6 (40.6 00 0.0 0000 0.000 000 6.8 (6.8 (EPEC 72. (72. 40. (40. 0. 0.00 6. (6. (72 (40 (6 (7 (4 (
RESUMO: O peixe-boi amazônico (Trichechus inunguis) é um mamífero aquático ameaçado de extinção. Apesar disso, poucos estudos investigaram patógenos nessa espécie que podem impactar a saúde animal e humana. O objetivo deste estudo foi avaliar a frequência, distribuição e padrões de suscetibilidade antimicrobiana de Staphylococcus sp. e Escherichia coli pertencentes à microbiota nasal e retal de peixes-bois da Amazônia mantidos em cativeiro no Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA) (Amazonas, Brasil). Foram utilizados suabes retais e nasais de 44 peixes-boi de diferentes idades. O gênero Staphylococcus foi isolado do swab nasal de 32 (72,7%) animais, sendo que dois indivíduos apresentaram mais de uma espécie de Staphylococcus. S. sciuri foi a espécie mais comumente isolada. A resistência à penicilina foi observada em 13 (40,6%) isolados, sendo mais frequente do que os outros antimicrobianos testados (P = 0,01). Escherichia coli foi isolada dos suabes retais de todos os animais, sendo o filogrupo B1 o mais frequente entre as cepas obtidas (P = 0,0008). Quatro isolados (6,8%) foram positivos para fatores de virulência, três dos quais foram classificados como E. coli enterotoxigênica (ETEC) e um isolado como E. coli enteropatogênica (EPEC). Este é o primeiro estudo a avaliar Staphylococcus spp. e E. coli de amostras de peixe-boi da Amazônia. O estudo revelou colonização nasal por Staphylococcus sp., principalmente S. sciuri, e por isolados diarreiogênicos de E. coli, incluindo cepas resistentes a antimicrobianos. RESUMO peixeboi peixe boi Trichechus inunguis extinção disso humana frequência sp peixesbois peixes bois INPA (INPA Amazonas, Amazonas (Amazonas Brasil. Brasil . Brasil) 4 peixesboi idades 3 72,7% 727 72 7 (72,7% animais S 1 40,6% 406 40 6 (40,6% P 0,01. 001 0,01 0 01 0,01) B 0,0008. 00008 0,0008 0008 0,0008) 6,8% 68 8 (6,8% virulência E ETEC (ETEC EPEC. EPEC (EPEC) spp 72,7 (72,7 40,6 (40,6 00 0,0 0000 0,000 000 6,8 (6,8 (EPEC 72, (72, 40, (40, 0, 0,00 6, (6, (72 (40 (6 (7 (4 (