Abstract Introduction. In major blood group incompatible bone barrow hematopoietic progenitor cells (HPC-BM) transplant efficient red blood cells (RBC) depletion is essential to minimize adverse effects during and after the product infusion. Different procedures are used to reduce RBC in this case, particularly the hydroxyethyl starch sedimentation (HES) technique is widely used but is very laborious and requires experienced personnel. In this work we show the results of our laboratory in the validation of another methodology for this purpose; processing with Sepax 2 automated equipment, using the SmartRedux v314 protocol. Materials and methods. We evaluated 9 BM hematopoietic progenitor cell products. Data of post processing recovery nucleated cells (NC) and CD34+ cells, viability results, microbiological studies and processing time were obtained. Besides the adverse reactions during the infusion of the products and their engraftment. Results. A mean reduction of GR of 92.5% (88.2 - 95.4%), a recovery of NC of 74.1% (60.1 - 84.3%) and a recovery of CD34+ cells of 83.6% (62.6 - 99.5%) was obtained. The mean viability of CD45+ cells was 93.3% (87% - 98%) and of CD34 cells was 97% (94% - 99%). All microbiology results were negative. After processing, the products were all infused to patients at our institution without relevant adverse reactions, with the median hematopoietic recovery being 15 days for absolute neutrophils and 28 days for platelets. All achieved complete chimerism. Discussion. Having the possibility of implementing a new methodology for the processing of BM progenitor cell products with major blood group incompatibility, the procedure was validated according to the INCUCAI regulations and voluntary standards. An option is proposed for the processing of these products, with advantages and disadvantages. Each center must evaluate and validate the procedure with best adjustment to its needs.

Resumen Introducción. En los trasplantes de células progenitoras hematopoyéticas de médula ósea (CPH-MO) con incompatibilidad mayor de grupo sanguíneo una depleción de glóbulos rojos (GR) eficiente es fundamental para minimizar los efectos adversos durante y posterior a la infusión del producto. Distintos procedimientos se utilizan para la reducción de GR en estos casos, particularmente la técnica de sedimentación con hidroxietil almidón (HES) es ampliamente utilizada, pero es muy laboriosa y requiere de personal experimentado. En este trabajo presentamos los resultados de nuestro laboratorio en la validación de otra metodología para este propósito, el procesamiento con el equipo automatizado Sepax 2, utilizando el protocolo SmartRedux v314. Materiales y métodos. Se evaluaron 9 productos de células progenitoras hematopoyéticas de MO. Se obtuvieron datos de recuperación post procesamiento de células nucleadas (CN) y células CD34+, resultados de viabilidad, estudios microbiológicos y tiempo de procesamiento, además de las reacciones adversas durante la infusión de los productos y datos del injerto de los mismos. Resultados. Se obtuvo una media para la reducción de GR de 92,5% (88,2 - 95,4%), una recuperación de CN de 74,1% (60,1 - 84,3%) y una recuperación de células CD34+ de 83,6% (62,6 - 99,5%). La media de viabilidad de células CD45+ fue 93,3% (87% - 98%) y la de células CD34+ 97% (94% - 99%). Todos los resultados de microbiología fueron negativos. Luego del procesamiento los productos se infundieron todos a pacientes de nuestra institución sin reacciones adversas relevantes, siendo la mediana de recuperación hematopoyética de 15 días para neutrófilos absolutos y de 28 días para plaquetas. Todos lograron quimerismo completo. Discusión. Ante la posibilidad de implementar una nueva metodología para el procesamiento de productos de células progenitoras de MO con incompatibilidad mayor de grupo sanguíneo se validó el procedimiento según establecen las normas de INCUCAI y los estándares voluntarios. Se plantea una opción para el procesamiento de estos productos, con ventajas y desventajas. Cada centro deberá evaluar y validar el procedimiento que mejor se ajuste a sus necesidades.

Resumen El trastorno depresivo mayor (TDM) ha ganado relevancia en los últimos años, ya que es una de las principales causas de discapacidad a nivel mundial y ejerce un impacto significativo en la vida diaria de quienes lo experimentan. La relación entre la disbiosis intestinal y el TDM ha surgido como un componente crucial en el ámbito de la salud mental. La microbiota intestinal, que abarca una amplia diversidad de microorganismos, establece una conexión bidireccional con el TDM a través del eje microbiota-intestino-cerebro, la neuroinflamación y alteración de la función cerebral. El presente trabajo tuvo como objetivo, analizar la relación entre los problemas de equilibrio de los microorganismos en el intestino (fenómeno conocido como “disbiosis”) y el TDM. Se adoptó un enfoque cualitativo que combinó análisis bibliográfico y descriptivo, priorizando fuentes primarias en psicología, neurociencia y microbiología. Se examinaron investigaciones en inglés y español desde 2019 hasta 2023 utilizando motores de búsqueda y bases de datos reconocidas. En este contexto, se observó que el uso de probióticos se ha vuelto cada vez más relevante como parte del tratamiento complementario para el TDM. Los probióticos, como Lactobacillus plantarum DP189 y la bacteria Roseburia intestinalis, ejercen un impacto positivo en la microbiota intestinal, integridad de la barrera hematoencefálica y producción de neurotransmisores. La revisión destaca el papel crucial de la microbiota intestinal en el TDM y la prometedora utilidad de los probióticos como tratamiento complementario. Esto sugiere nuevas perspectivas terapéuticas y subraya la importancia de futuras investigaciones para comprender mejor esta compleja interacción.

Abstract Major depressive disorder (MDD) has gained relevance in recent years, as it is one of the main causes of disability worldwide and has a significant impact on the daily lives of those who experience it. The relationship between gut dysbiosis and MDD has emerged as a crucial component in the field of mental health. The gut microbiota, which encompasses a wide diversity of microorganisms, establishes a bidirectional connection with MDD through the microbiota-gut-brain axis, neuroinflammation and alteration of brain function. The objective of this work was to analyze the relationship between problems with the balance of microorganisms in the intestine (a phenomenon known as “dysbiosis”) and MDD. A qualitative approach was adopted that combined bibliographic and descriptive analysis, prioritizing primary sources in psychology, neuroscience and microbiology. Research in English and Spanish from 2019 to 2023 was examined using recognized search engines and databases. In this context, it was observed that the use of probiotics has become increasingly relevant as part of complementary treatment for MDD. Probiotics, such as Lactobacillus plantarum DP189 and the bacteria Roseburia intestinalis, have a positive impact on the intestinal microbiota, blood-brain barrier integrity, and neurotransmitter production. The review highlights the crucial role of gut microbiota in MDD and the promising utility of probiotics as a complementary treatment. This suggests new therapeutic perspectives and underlines the importance of future research to better understand this complex interaction.

RESUMEN Introducción: El estudio de los viajeros es importante y ha resultado una variable asociada significativamente con el número de casos de covid-19. Objetivo: Caracterizar a los viajeros infectados por el SARS-CoV-2 según variables epidemiológicas y sociodemográficas de interés. Métodos: Se realizó un estudio ecológico de series temporales, de viajeros procedentes del exterior, residentes en Santiago de Cuba o cuyo destino final era esta provincia, que arribaron al país entre el 11 de marzo del 2020 y el 11 de noviembre del 2022. Las fuentes de información fueron los registros de viajeros establecidos por el Centro Provincial de Higiene, Epidemiologia y Microbiología de esta provincia y del Laboratorio Provincial de Microbiología. Resultados: Fueron recibidos 64 984 viajeros, de los cuales 568 resultaron positivos, con predominio de los asintomáticos y del diagnóstico al quinto día del arribo. Conclusiones: El control sobre los viajeros influyó en el patrón de transmisión de la enfermedad; en tanto, la realización de una segunda prueba al quinto día permitió hallar un porcentaje elevado de positividad. Algunas características de la morbilidad en este grupo de casos se diferenciaron de la incidencia en la población general, tales como las formas clínicas, la edad y la distribución espacial.

ABSTRACT Introduction: The study of travelers is important and has been a variable significantly associated with the number of covid-19 cases. Objective: To characterize the travelers infected with SARS-CoV-2 according to epidemiologic and sociodemographic variables of interest. Methods: An ecological study of temporary series was carried out, of travelers from abroad, residents in Santiago de Cuba or whose final destination was this province, that arrived at the country between March 11, 2020 and November 11, 2022. The sources of information were the travelers’ records established by the Provincial Center of Hygiene, Epidemiology and Microbiology of this province and the results of polymerase chain reaction tests of the Provincial Laboratory of Microbiology. Results: Sixty-four thousand nine-hundred eighty four travelers were received, of which 568 were positive, with prevalence of the asymptomatic and the diagnosis at the fifth day of arrival. Conclusions: The control on the travelers influenced in the pattern of transmission of the disease; as long as, the realization of a second test at the fifth day allowed to find a high percentage of positivity. Some characteristics of morbidity in this group of cases differed from the incidence in the general population, such as the clinical forms, age and space distribution.

Abstract The fishing industry produces byproducts that accumulate and cause environmental pollution problems; however, could be used as an alternative source of nutrients in ruminants. The objective of the present study was to evaluate the response over ruminal microbiome, apparent digestibility and productivity of Katahdin lambs fed different levels of shrimp shell meal (HCC). Four male lambs with live weight of 22 ± 2.5 kg were assigned in a repeated Latin square design (4 animals x 4 treatments). The animals were assigned for 16 days per period to diets with 0, 5, 10 and 20 g 100 g DM of HCC, the treatments were: HCC0, HCC5, HCC10 and HCC20, respectively. The greatest daily weight gain was found in the HCC5 treatment (P ≤ 0.05). However, the highest dry matter intake was observed in animals with the HCC20 diet (P ≤ 0.05). In the apparent digestibility of the dry matter there was no difference between treatments (P > 0.05), neither in the concentration of total bacteria (P > 0.05), while the concentration of cellulolytic bacteria and chitin-degrading bacteria was higher in the animals from HCC20 treatment (P ≤ 0.05). The results indicate an adaptation of the ruminal microbiome to high doses of HCC, therefore, HCC can be used in diets for sheep without effect on rumen metabolism and microbial, nutrient digestibility and animal performance.

Resumen La industria pesquera genera subproductos que al acumularse causan problemas de contaminación ambiental; sin embargo, podrían ser una fuente de nutrientes para rumiantes. El objetivo de este estudio fue evaluar la respuesta sobre el microbioma ruminal, la digestibilidad aparente y productividad de borregos Katahdin alimentados con diferentes niveles de harina de caparazón de camarón (HCC). Cuatro borregos machos con peso vivo de 22 ± 2.5 kg fueron asignados en un diseño cuadrado latino (4 animales x 4 tratamientos) repetido. Los animales fueron asignados durante 16 días por periodo a dietas con 0, 5, 10 y 20 g 100 g-1 de MS de HCC, los tratamientos fueron: HCC0, HCC5, HCC10 y HCC20, respectivamente. La mayor ganancia diaria de peso se tuvo en los animales del tratamiento HCC5 (P ≤ 0.05). Sin embargo, el mayor consumo de materia seca se observó en los animales con la dieta HCC20 (P ≤ 0.05). En la digestibilidad aparente de la materia seca no hubo diferencia entre tratamientos (P > 0.05), ni en la concentración de bacterias totales (P > 0.05), mientras que la concentración de bacterias celulolíticas y de bacterias degradadoras de quitina, fue mayor en los animales del tratamiento con HCC20 (P ≤ 0.05). Los resultados indican una adaptación del microbioma ruminal a dosis altas de HCC, por tanto, se puede usar HCC en dietas para borregos sin efecto en el metabolismo y microbiana ruminal, la digestibilidad de los nutrientes y en el desempeño de los animales.

Abstract Introduction. One of the most common pathologies of the pericardium is pericarditis, which can present as acute, subacute or chronic pericarditis, pericardial effusion, cardiac tamponade or constrictive pericarditis. However, it is a rare condition in the pediatric population. Methods. A series of cases of patients with pericarditis who were taken to pericardiotomy, pericardial drainage and anterior partial pericardiectomy, between July 2014 and June 2023 is presented. Demographic and clinical variables were collected, microbiological isolates and the management received were evaluated. Results. A total of 12 patients underwent minimally invasive surgical management; of these, 58% belonged to indigenous communities and lived in rural areas. Half had associated pneumonia. In most cases, no microbiological isolation was obtained. Conclusion. The need for surgical management is determined by the impact on the hemodynamic variables related to the effusion and pericardial compromise. Partial pericardiectomy by thoracoscopy is an alternative in these cases.

Resumen Introducción. Una de las patologías más frecuentes del pericardio es la pericarditis, que puede presentarse como pericarditis aguda, subaguda o crónica, derrame pericárdico, taponamiento cardíaco o pericarditis constrictiva. Sin embargo, es una condición infrecuente en la población pediátrica. Métodos. Presentamos una serie de casos de pacientes con pericarditis que fueron llevados a pericardiotomía, drenaje pericárdico y pericardiectomía parcial anterior, entre julio de 2014 y junio de 2023. Se recolectaron las variables demográficas y clínicas, se evaluaron los aislamientos microbiológicos y el manejo recibido. Resultados. Un total de 12 pacientes fueron llevados a manejo quirúrgico mínimamente invasivo; de estos, 58 % pertenecían a comunidades indígenas y residían en zonas rurales. La mitad tenían neumonía asociada. En la mayoría de los casos no se obtuvo aislamiento microbiológico. Conclusión. La necesidad de manejo quirúrgico está determinada por la repercusión en las variables hemodinámicas relacionadas con el derrame y el compromiso pericárdico. La pericardiectomía parcial por toracoscopia es una alternativa en estos casos.

RESUMEN Introducción: la necesidad de contar con técnicas de laboratorio rápidas, sensibles y específicas para la detección de patógenos de difícil diagnóstico llevó a la creación del Laboratorio de Biología molecular en el Centro Provincial de Higiene, Epidemiología y Microbiología de Villa Clara. Objetivo: caracterizar la evolución y la importancia de la Microbiología molecular en el Laboratorio del Centro Provincial de Higiene, Epidemiología y Microbiología de Villa Clara de junio de 2018 a diciembre de 2023. Métodos: estudio descriptivo transversal realizado en el Laboratorio de Biología Molecular de Villa Clara en el período comprendido de junio de 2018 a diciembre de 2023 a partir del total de muestras procesadas por reacción en cadena de la polimerasa, se emplearon varias plataformas tecnológicas y diversos estuches comerciales. Resultados: en 2018 se implementó el diagnóstico molecular con dos plataformas, Rotor Gene-Q® y Gene Xpert® MTB/RIF, y en 2021, se dispuso de cuatro, al introducir el SLAN y la plataforma COBAS 4800®. El laboratorio adquirió relevancia por la llegada de la pandemia por el nuevo coronavirus de 2019: se procesaron 511 225 muestras de exudado nasofaríngeo y 14 568 determinaciones para el diagnóstico de los virus de inmunodeficiencia humana, de hepatitis C y B y del papiloma humano que se realizaron en la plataforma COBAS 4800®. En el año 2023 se fortaleció la capacidad de detección de patógenos y se identificó la cocirculación comunitaria de influenza A y B, del virus parainfluenza tipo 4, el coronavirus OC 43, el SARS-CoV-2 y el dengue. Conclusiones: el aumento progresivo de la capacidad resolutiva del Laboratorio de Biología molecular, junto a la implementación de nuevas plataformas diagnósticas, ha permitido fortalecer la detección de patógenos de interés clínico y perfeccionar la vigilancia centinela virológica.

ABSTRACT Introduction: the need to have rapid, sensitive and specific laboratory techniques for the detection of pathogens that are difficult to diagnose led to the creation of the Molecular Biology Laboratory at the Provincial Center of Hygiene, Epidemiology and Microbiology of Villa Clara. Objective: to characterize the evolution and importance of Molecular Microbiology in the Laboratory of the Provincial Center of Hygiene, Epidemiology and Microbiology of Villa Clara from June 2018 to December 2023. Methods: cross-sectional descriptive study carried out at the Villa Clara Molecular Biology Laboratory in the period from June 2018 to December 2023 based on the total samples processed by polymerase chain reaction, several technological platforms and various kits were used. commercial. Results: In 2018, molecular diagnosis was implemented with two platforms, Rotor Gene-Q® and Gene Xpert® MTB/RIF, and in 2021, four were available, when the SLAN and the COBAS 4800® platform were introduced. The laboratory became relevant due to the arrival of the 2019 new coronavirus pandemic: 511,225 nasopharyngeal exudate samples and 14,568 determinations were processed for the diagnosis of human immunodeficiency viruses, hepatitis C and B, and human papilloma carried out on the COBAS 4800® platform. In 2023, the pathogen detection capacity was strengthened and the community cocirculation of influenza A and B, parainfluenza virus type 4, the OC 43 coronavirus, SARS-CoV-2 and dengue was identified. Conclusions: the progressive increase in the resolution capacity of the Molecular Biology Laboratory, together with the implementation of new diagnostic platforms, has allowed us to strengthen the detection of pathogens of clinical interest and improve virological sentinel surveillance.

ABSTRACT Foundation: Scientific journals constitute the means par excellence for the socialization and dissemination of the research’s results carried out both at the undergraduate and postgraduate levels; the publication of an article constituting the final step of the research. Objective: To characterize, from bibliometric, the professionals’ scientific production of the Hygiene, Epidemiology and Microbiology Provincial Center from 2018 to 2022. Methods: A descriptive, retrospective study of the health professionals’ scientific production was carried out in the Hygiene, Epidemiology and Microbiology Provincial Center publications database. Results: The greatest predominance of publications is in scientific journals (77.78%), the greatest scientific production year was 2018 with 30.16%. Scientific production activity has been decreasing. There is a tendency for researchers to work collaboratively, all contributions have multiple authorship. Medisur magazine was the most predominant with 43%, followed by The Biologist with 22.22%. Conclusions: There is a decrease in the number of publications, evident over the years. The Medisur magazine continues to be one of the most used by authors when publishing.

RESUMEN Fundamento: Las revistas científicas constituyen el medio por excelencia para la socialización y difusión de los resultados de las investigaciones desarrolladas tanto en el pregrado como en el posgrado; la publicación de un artículo constituyendo el paso final de la investigación. Objetivo: Caracterizar, desde la bibliometría, la producción científica de los profesionales del Centro Provincial de Higiene, Epidemiología y Microbiología en el periodo 2018-2022. Métodos: Se realizó un estudio descriptivo, retrospectivo, de la producción científica de los profesionales de la salud en la base de datos de las publicaciones del Centro Provincial de Higiene, Epidemiología y Microbiología. Resultados: El mayor predominio de las publicaciones es en revistas científicas (77,78 %), el año de mayor producción científica fue el 2018 con un 30,16 %. La actividad de producción científica ha ido decreciendo. Existe la tendencia de los investigadores a trabajar en colaboración, el total de las contribuciones tienen autoría múltiple. La revista Medisur fue la que más predominó con un 43 %, seguida de The Biologist con un 22,22 %. Conclusiones: Existe un decrecimiento en cuanto al número de publicaciones, evidenciado al pasar de los años. La revista Medisur continúa siendo una de las más utilizadas por los autores para publicar.

ABSTRACT Corynebacterium urealitycum is a gram-positive bacillus, usually found as a colonizer on the skin. However, a pathogenic role has been described in susceptible patients, where it can cause urinary tract infection, nephrolithiasis, pyelitis, and encrusted cystitis. Methods: Retrospective cohort study of patients older than 18 years with positive urine cultures for C. urealyticumin the Laboratory of the Microbiology of the UC Health Network - CHRISTUS, between 2017 and 2020. Results: 6 positive urine cultures were obtained, corresponding to 5 patients. One case presented as encrusted pyelitis, with an associated reinfection, one case as lower urinary tract infection, and three as asymptomatic bacteriuria. All patients had some relevant risk factor. All patients presented urine tests with triple phosphate crystals and alkaline pH between 7.5 and 9.0. Conclusions: Patients with positive urine cultures for C. urelyticum represent a low percentage of all agents isolated from urine cultures. Although it may be asymptomatic, the development of encrusted pyelitis is a possible manifestation associated with an extended hospital stay. Urinalysis with alkaline pH and the presence of triple phosphate crystals is characteristic. More extensive clinical series and antibiotic susceptibility studies are necessary for a more standardized management of these patients. Finally, the authors’ key lesson is remembering how unusual bacteria, such as C. urealyticum, can cause serious complications secondary to their phytopathogenic mechanism of urine alkalinization.

RESUMEN Corynebacterium urealitycum es un bacilo gram positivo que suele hallarse como colonizador en la piel. No obstante, se ha descrito un rol patógeno en pacientes susceptibles, donde puede ocasionar cuadros de infección urinaria, nefrolitiasis, pielitis y cistitis incrustadas. Métodos: estudio de cohorte retrospectivo de pacientes mayores de 18 años con urocultivos positivos para C. urealyticum en el Laboratorio Microbiología de la Red de Salud UC - CHRISTUS, entre los años 2017 y 2020. Resultados: Se obtuvieron 6 urocultivos positivos, correspondientes a 5 pacientes. Un caso se presentó como pielitis incrustada, con una reinfección asociada, un caso como infección urinaria baja, y tres como bacteriuria asintomática. Todos los pacientes presentaban algún factor de riesgo relevante. Todos los pacientes presentaron exámenes de orina con cristales de fosfato triple y pH alcalino entre 7.5 y 9.0. Conclusión: Los urocultivos positivos para C. urelyticum representan un bajo porcentaje del total de los agentes aislados. Si bien la infección puede ser de curso asintomático, el desarrollo de pielitis incrustada es una manifestación grave con una fisiopatología propia. Es característico el examen de orina con pH alcalino y la presencia de cristales de fosfato triple, ambos asociados hallazgos asociados a su mecanismo fisiopatológico. Son necesarias series clínicas más extensas y estudios de susceptibilidad antibiótica para un enfrentamiento más estandarizado de estos pacientes. Finalmente, el aprendizaje clave para los autores es tener presente como bacterias poco usuales, como C. urealyticum, puede originar complicaciones graves secundario a su mecanismo fisio patogénico de alcalinización de la orina.

RESUMEN Objetivo: El propósito del artículo es describir la concepción sistémica que representa la lógica del proceso de formación de la competencia gestión personal del conocimiento microbiológico en estudiantes de la Licenciatura en Educación Biología. Métodos: En la investigación la modelación permitió configurar la concepción sistémica del objeto. Además, el método sistémico-estructural-funcional fue utilizado para el análisis integral del objeto, al determinar estructura, funciones y relaciones jerárquicas entre los componentes del proceso. También se emplearon métodos del nivel teórico como: analítico-sintético e inductivo-deductivo. Resultado: El aporte se vincula al proceso de formación de la competencia gestión personal del conocimiento microbiológico en estudiantes de la Licenciatura en Educación Biología y se materializa a partir de las relaciones de coordinación y complementariedad que se establecen entre la aprehensión del conocimiento microbiológico, la movilización de métodos para la gestión personal del conocimiento microbiológico y su contextualización formativa. Conclusión: La concepción sistémica que representa la lógica de la gestión personal del conocimiento microbiológico puede favorecer la integralidad en el desempeño gestión personal del conocimiento microbiológico en correspondencia con la dinámica de los problemas de la profesión en estudiantes de la Licenciatura en Educación Biología.

ABSTRACT Objective: This article aims at describing a systemic understanding that represents the logic of the process of educating information seeking and processing competencies in biology teacher trainees. Methods: Modeling makes possible to devise a model for competency-based education related to individual seeking and processing of microbiology information. The systemic-structural-functional method was used to achieve a comprehensive understanding of the researched object; that is to describe its structure, functions and hierarchical relationships of the constituent elements. Theoretical level methods such as: analytical-synthetic and inductive-deductive were also used. Result: The contribution is linked to the process of educating information seeking and processing competencies for microbiology self-management. This may be accomplished by relating the processes of apprehending microbiological knowledge, mobilizing self-management information procedures and contextualizing competency-based education. Conclusion: The resulting systemic conception that represents the logic of personal management of microbiological knowledge may favor comprehensiveness in the performance of personal management of microbiological knowledge in correspondence with the dynamics of the problems of the profession in students of the Bachelor's Degree in Biology Education.

Resumen La interacción entre SARS-CoV-2 e infecciones invasivas por bacterias capsuladas (IIBC) continúa bajo estudio. Objetivos: comparar la incidencia de IIBC antes y durante la pandemia por COVID-19, evaluar la incidencia de coinfección con COVID-19 y la letalidad. Estudio transversal de registros de un laboratorio centralizado de Microbiología, que asiste a una red de centros asistenciales con 713 camas de internación para adultos y pediátricos, expandida 20% durante la pandemia. Tres periodos evaluados: 1) Pre-pandemia: 1-Marzo-2019 al 29-Febrero-2020; 2) Primer año de Pandemia: 1-Marzo-2020 al 28-Febrero-2021; 3) Pandemia 2021: 1-Marzo-2021 al 31-Julio-2021. Análisis estadístico descriptivo: Se analizaron 56.502 muestras (96% hemocultivos) correspondientes a 27.224 pacientes. De estas, 54 muestras (de 54 pacientes) fueron positivas para bacterias capsuladas. La incidencia de IIBC fue 167,4, 32,6 y 50,4 por cada 100.000 muestras para los periodos 1, 2 y 3, respectivamente. Doce IIBC ocurrieron durante la pandemia: 10 Streptococcus pneumoniae y dos Haemophilus influenzae, siete de ellos corresponden a coinfección SARS-CoV-2/S. pneumoniae, con una incidencia de 5,68 por cada 10.000 internaciones por COVID 19 (0,056%). La letalidad de las IIBC fue de 31, 29 y 60% para los tres periodos, respectivamente, 3/7 coinfectados fallecieron (43%). La letalidad por enfermedad neumocócica invasiva (ENI), sin COVID fue de 32,5%. Se evidenció una reducción significativa de la incidencia de IIBC luego del comienzo de la pandemia, coincidente con la implementación de las medidas sanitarias de contención de la pandemia. La incidencia de coinfección de SARS-CoV-2/S. pneumoniae fue baja y presentó mayor letalidad que las ENI sin COVID-19.

Abstract Interaction between severe acute respiratory coronavirus 2 (SARS-CoV-2) and IIEB remains under investigation. Objective: to compare IIEB incidence before and during COVID-19 pandemic, and assess incidence of coinfection with COVID-19 and case fatality. A cross-sectional study was performed on data from a centralized microbiology laboratory serving a network of healthcare centers comprising 713 pediatric and adult inpatient beds, expanded by 20% during the pandemic. Three periods were evaluated: (1) pre-pandemic: March 1, 2019-February 29, 2020; (2) pandemic year 1: March 1, 2020-February 28, 2021; (3) pandemic year 2: March 1, 2021-July 31, 2021. Descriptive statistical analysis was performed. 56502 samples (96% blood cultures) from 27224 patients were analyzed. Of these, 54 samples (from 54 patients) were positive for encapsulated bacteria. IIEB incidence was: 167.4, 32.6, and 50.4 per 100000 samples for periods 1, 2, and 3, respectively. Twelve IIEB episodes occurred during the pandemic period: 10 Streptococcus pneumoniae, and 2 Haemophilus influenzae, of which 7 were SARS-CoV-2/S. pneumoniae coinfections, with an incidence of 5.68 per 10000 COVID-19-related hospitalizations (0.056%). IIEB case fatality was 31%, 29%, and 60% for each period, respectively, 3/7 patients with coinfection died (43%). Case fatality for invasive pneumococcal disease (IPD) in patients without COVID-19, was 32.5%. Significant reduction in IIEB incidence was observed during the pandemic, coinciding with implementation of containment measures. The incidence of SARS-CoV-2/S. pneumoniae coinfection was low, with higher case fatality than IPD patients without COVID-19.

Abstract We conducted a nested case-control study within a cohort with the aim of studying the association between illicit drug use and congenital syphilis (CS). Cases were diagnosed based on treponemal and non-treponemal tests conducted both in the mother and the newborn (NB). Multivariate analysis with logistic regression was performed. A total of 6171 births with a mean gestational age of 37.8 weeks were recorded and 62 CS events were diagnosed (incidence 10.5 events/1000 NB). Associated maternal factors were illicit drug use (OR 14.08, 95% CI 1.19-166.6), <5 prenatal visits (OR 2.9, 95% CI 1.12-7.53), more than two sexual partners (OR 3.76, 95% CI 1.62-8.71) and professional education level (OR 0.06, 95% CI 0.005-0.85). Among the mothers of the cases presented, the prevalence of illicit drug use was 22.6% and the most frequent drugs were methamphetamines and cannabis.

Resumen Realizamos un estudio de casos y controles anidado en una cohorte con el objetivo de estudiar la asociación del consumo de drogas ilícitas y sífilis congénita (SC). Los casos se diagnosticaron mediante pruebas treponémicas y no treponémicas en la madre y el recién nacido (RN). Se realizó un análisis multivariado con regresión logística. Se registraron 6.171 nacimientos con edad gestacional promedio 37,8 semanas y se diagnosticaron 62 eventos de SC (incidencia: 10,5 eventos/1.000 RN). Los factores maternos asociados fueron el uso de drogas ilícitas (OR = 14,08; IC 95% = 1,19-166,6), menos de cinco consultas en el control prenatal (OR = 2,9; IC 95% = 1,12-7,53), más de dos parejas sexuales (OR = 3,76; IC 95% = 1,62-8,71) y estudios universitarios (OR = 0,06; IC 95% = 0,005-0,85). Entre las madres de los casos, la prevalencia del consumo de drogas ilícitas fue de 22,6% y las más frecuentes fueron las metanfetaminas y la marihuana.

Resumen El objetivo de este estudio fue comparar el desempeño de dos sistemas MALDI-TOF MS en la identificación de bacterias anaerobias estrictas de interés clínico. La secuenciación del gen 16S ARNr fue el método de referencia utilizado cuando se observaron discrepancias o inconsistencias entre plataformas. Se recuperaron 333 aislados de muestras clínicas de diferentes centros de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires entre 2016 y 2021. Los aislados se identificaron por duplicado mediante dos sistemas MALDI-TOF MS: el BD Bruker Biotyper (Bruker Daltonics, Bremen, Alemania) y el Vitek MS (bioMèrieux, Marcy-l'Etoile, Francia). A través del sistema Vitek MS, los mismos fueron identificados a nivel de especie o complejo de especies en un 65,5% (n: 218) y de género en un 71,2% (n: 237), mientras que no se identificaron en un 29,4% (n: 98) y fue incorrecta en el 5,1% (n: 17). Mediante el sistema Bruker Biotyper, dichos valores fueron del 85,3% (n: 284), del 89,7% (n: 299), del 14,1% (n: 47) y del 0,6% (n: 2), respectivamente. La diferencia entre ambos métodos fue estadísticamente significativa (p<0,0001). En conclusión, los sistemas MALDI-TOF MS aceleran la identificación microbiana. Son especialmente útiles para los microorganismos de crecimiento lento, como las bacterias anaerobias, que son difíciles de identificar con los métodos tradicionales. El sistema Bruker demostró ser más preciso que el Vitek MS. Para que estos métodos sean realmente efectivos es fundamental actualizar las bases de datos de ambos sistemas e incrementar el número de espectros de referencia dentro de las plataformas.

Abstract The aim of this study was to compare the performance of two MALDI-TOF MS systems in the identification of clinically relevant strict anaerobic bacteria. The 16S rRNA gene sequencing was the gold standard method when discrepancies or inconsistencies were observed between platforms. A total of 333 isolates were recovered from clinical samples of different centers in Buenos Aires City between 2016 and 2021. The isolates were identified in duplicate using two MALDI-TOF MS systems, BD Bruker Biotyper (Bruker Daltonics, Bremen, Germany) and Vitek MS (bioMèrieux, Marcy-l’Etoile, France). Using the Vitek MS system, the identification of anaerobic isolates yielded the following percentages: 65.5% (n: 218) at the species or species-complex level, 71.2% (n: 237) at the genus level, 29.4% (n: 98) with no identification and 5.1% (n: 17) with misidentification. Using the Bruker Biotyper system, the identification rates were as follows: 85.3% (n: 284) at the species or species-complex level, 89.7% (n: 299) at the genus level, 14.1% (n: 47) with no identification and 0.6% (n: 2) with misidentification. Differences in the performance of both methods were statistically significant (p-values <0.0001). In conclusion, MALDI-TOF MS systems speed up microbial identification and are particularly effective for slow-growing microorganisms, such as anaerobic bacteria, which are difficult to identify by traditional methods. In this study, the Bruker system showed greater accuracy than the Vitek system. In order to be truly effective, it is essential to update the databases of both systems by increasing the number of each main spectrum profile within the platforms.

Resumen En este trabajo se describe el primer caso de esporotricosis felina causada por Sporothrix globosa fuera del área epizoótica de Buenos Aires. A diferencia de los casos documentados de Sporothrix brasiliensis, en este no hubo evidencia clínica ni serológica de transmisión zoonótica por arañazos o mordeduras del gato enfermo a su dueño ni al veterinario que lo atendió. Con este reporte se espera contribuir a un mejor conocimiento sobre el perfil patogénico de S. globosa.

Abstract We describe here the first case of feline sporotrichosis caused by Sporothrix globosa, occurring outside the epizootic area of Buenos Aires province, Argentina. Unlike cases reported with Sporothrix brasiliensis, on this occasion there was no clinical or serological evidence of zoonotic transmission through scratches or bites from the sick cat to the attending veterinarian or the person responsible for its care. This report aimed to improve the knowledge about the pathogenic profile of S. globosa.

Resumen Las infecciones por Entamoeba se producen en todo el mundo, con mayor frecuencia en países de bajo nivel socioeconómico y salud pública deficiente. Dado que se ha reconocido a Entamoeba histolytica como la única especie patógena del género, es importante realizar un diagnóstico diferencial respecto de otras especies de Entamoeba morfológicamente idénticas. Este estudio tuvo como objetivos determinar la prevalencia de especies de Entamoeba en 2 poblaciones de Argentina, realizar su diagnóstico diferencial por PCR y caracterizar los aislados de Entamoeba secuenciando un fragmento del gen SSU ARNr. Se obtuvieron 493 muestras fecales seriadas de individuos de las provincias de Buenos Aires (n=210) y Misiones (n=283). Las muestras se examinaron por métodos convencionales (sedimentación de formalina-etil acetato y flotación de Willis) y mediante PCR específicas para diferenciar especies de Entamoeba. Los aislamientos de Entamoeba se caracterizaron por secuenciar un fragmento del gen SSU ARNr. La prevalencia general de la infección por Entamoeba fue del 12,4% y fue mayor en Buenos Aires que en Misiones (14,8 vs. 10,6%). Se informó por primera vez un caso de Entamoeba histolytica en Buenos Aires, confirmado por PCR y análisis de secuencia. Además, se registraron nuevos datos genéticos sobre Entamoeba coli y Entamoeba dispar. El análisis filogenético reveló una congruencia entre las características morfológicas y las secuencias del gen SSU ARNr. A través de este estudio, hemos sumado información acerca de la distribución de estas especies en nuestro país y en la región de las Américas.

Abstract Entamoeba infections occur worldwide, with higher frequency in countries of low socioeconomic status and poor public health. Since Entamoeba histolytica has long been recognized as the only pathogenic species, making a differential diagnosis of other morphologically identical Entamoeba is important. This study aimed to determine the prevalence of Entamoeba species in two populations from Argentina, make a differential diagnosis by PCR and characterize Entamoeba isolates at the SSU rRNA gene. A total of 493 serial fecal samples were obtained from individuals in the provinces of Buenos Aires (n=210) and Misiones (n=283). Samples were examined by conventional methods (formalin-ethyl acetate and Willis flotation) and specific PCRs to differentiate Entamoeba species. Entamoeba isolates were characterized by sequencing a fragment of the SSU rRNA gene. The overall prevalence of Entamoeba infection was 12.4%, being more prevalent in Buenos Aires than in Misiones (14.8% vs. 10.6%). A case of E. histolytica confirmed by PCR and sequence analysis was reported for the first time in Buenos Aires. Moreover, new genetic data on Entamoeba coli and Entamoeba dispar were recorded. The phylogenetic analysis revealed a congruence between morphological characteristics and SSU rRNA gene sequences. This study increases the amount of information on the distribution of these species in Argentina and the region of the Americas.