Abstract (Introduction): Bycatch and discards are a socio-environmental concern that threatens the sustainability of marine life and fishing grounds. Approaches to this problem have focused on biological and/or ecological aspects. We considered it necessary to explore the problem from the social dimension and for this purpose we explored social representations. (Objective): The aim of this study is to explore the social representations of bycatch and discards in a group of businessmen and workers in the capture stage of the Argentine industrial fishing activity. We ask how they evaluate bycatch and fishing discards, what are their causes and if they observe possible solutions. (Methodology): Within the framework of a project of the Federal Fishing Council, we conducted focus groups with businessmen, business chambers, SOMU workers and captains of the industrial fishing activity. (Results): The results of the focus groups conducted in 2021 reveal three main causes of this problem. First, the lack of reliable data on actual discard levels raises concerns about sustainability and overfishing. Second, the low utilization of selectivity devices is attributed to their operational inefficiency and possible labour barriers. Finally, economic and organizational pressures, such as company profitability and workers’ salaries, justify the discard of non-target species, exacerbating the problem. (Conclusions): The work contributes to an understanding of the main reasons for bycatch and discards, which is essential to advance solutions. We understand that solutions are not simple and involve a sincere debate among stakeholders.

Resumen (Introducción): Las capturas incidentales y los descartes pesqueros son una preocupación socioambiental que amenaza la sostenibilidad de la vida marina y de los caladeros. Los abordajes a esta problemática estuvieron centrados en aspectos biológicos y ecológicos. Consideramos necesario explorar la problemática desde la dimensión social y para ello, exploramos las representaciones sociales. (Objetivo): El objetivo de este estudio fue explorar las representaciones sobre capturas incidentales y descartes pesqueros en un grupo de empresarios y trabajadores de la etapa de captura de la actividad pesquera industrial argentina, específicamente, cómo evalúan este problema, sus causas y posibles soluciones. (Metodología): En el marco de un proyecto del Consejo Federal Pesquero, se realizaron grupos focales con seis cámaras empresariales y personal jerárquico de empresas asociadas, así como trabajadores del SOMU y capitanes que operan en alta mar. (Resultados): Los resultados de los grupos focales realizados en 2021 revelaron tres principales causas de dicha problemática. Primero, la falta de datos confiables sobre los niveles reales de descarte genera preocupaciones sobre la sostenibilidad y la sobreexplotación. Segundo, la escasa utilización de dispositivos de selectividad se atribuye a su ineficacia operativa y a posibles barreras laborales. Finalmente, las presiones económicas y organizacionales, como la rentabilidad de las empresas y los salarios de los trabajadores, justifican el descarte, exacerbando el problema. (Conclusiones): El trabajo aporta a un entendimiento sobre las razones de la captura incidental y los descarte, esencial para avanzar en soluciones. Entendemos que las soluciones no son simples e implican un sincero debate entre actores.

Abstract Introduction. Livestock farming with Creole cattle is practiced in rural areas with challenging characteristics for species management. Objective. To describe the production system and the socio-cultural and technical-economic factors affecting the production of Nunkiní Creole cattle (Bos taurus). Materials and methods. The study was conducted from November 2020 to October 2021 in nine livestock production units of Nunkiní, Calkiní municipality, Campeche, Mexico. Information was obtained from an interview form with social, cultural, technical, and economic study variables, applied to selected producers. Data were analyzed using descriptive statistics and ANOVA. Results. Livestock farming was carried out by men (100 %), with an average age of 58.44 years. The average years of experience were 34.61. Younger producers had higher levels of education and less experience, and were responsible for the production units of higher technological levels. The size of the livestock production unit ranged from five to twenty-two cattle (average of 14). Feeding management followed a transhumance scheme, with cattle being free-ranging on ejido lands and from May to December and semi-stabled from January to April, grazing on cultivated pastures and supplemented with agricultural residues. With the zootechnical management implemented by the producers, an average pregnancy rate of 83 % was achieved. The main product marketed was fresh meat in cuts and direct sale to consumers, with an average price of 2.675 USD$/kg. Conclusion. It is traditional extensive system that takes advantage of the common use of grasslands. It involves experienced but older producers, with small investments, and serves to strengthen their family economy. This activity is threatened by the lack of revaluation of Creole cattle and the introduction of exotic breeds in the area to maximize production.

Resumen Introducción. La ganadería con bovinos criollos se práctica en espacios rurales con características difíciles para el manejo de las especies. Objetivo. Describir el sistema productivo y los factores socioculturales y técnico-económicos que afectan la producción del bovino criollo de Nunkiní (Bos taurus). Materiales y métodos. El estudio se realizó entre noviembre del 2020 a octubre del 2021, en nueve unidades de producción pecuarias de Nunkiní en el municipio de Calkiní, Campeche, México. La información se obtuvo de una cédula de entrevista con variables de estudio sociales, culturales, técnicas y económicas, aplicada a productores seleccionados. Los datos se analizaron mediante estadística descriptiva y ANDEVA. Resultados. La crianza del ganado la realizaron hombres (100 %), con edad promedio de 58,44 años. Los años de experiencia promedio fueron de 34, 61. Los productores jóvenes tuvieron mayor escolaridad y menor experiencia, y se encargaron de las unidades de producción de mayor nivel tecnológico. El tamaño de la unidad de producción pecuaria varió de cinco a veintidós bovinos (media de 14). El manejo alimenticio tuvo un esquema de trashumancia, donde de mayo a diciembre estuvieron libres en tierras ejidales y de enero a abril se manejaron semiestabulados, con pastoreo en potreros cultivados y suplementados con residuos agrícolas. Con el manejo zootécnico implementado por los productores, se obtuvo un promedio de 83 % de preñez. El producto principal comercializado fue carne fresca en cortes y venta directa al consumidor, con un precio promedio de 2,675 USD$/kg. Conclusión. Es un sistema tradicional extensivo que aprovecha el uso común de los agostaderos. Con productores de experiencia, pero de edad avanzada, de pequeña inversión y le sirve para fortalecer su economía familiar. Dicha actividad se ve amenazada por la falta de revalorización del bovino criollo y la introducción de razas exóticas en la zona para maximizar la producción.

Abstract Introduction. Chickpea has been considered a restricted host species for nodulation, although recent studies describe a greater bacterial diversity associated with the crop to increase the knowledge about this symbiosis in orden to obtain efficient isolates in its contribution. Objective. To characterize and identify an isolate obtained from chickpea plant nodules and evaluate its effectiveness under field conditions. Materials and methods. The research was conducted in the laboratories of two centers: the Institute of Fundamental Research in Tropical Agriculture “Alejandro de Humboldt,” Cuba, and the National Center for Genetic Resources, Mexico, as well as under field conditions in two campaigns during the years 2018 and 2020 to demonstrate its effectiveness in crop interaction in the first center. The isolate R3 was taxonomically identified through the sequencing of four genes. For laboratory experiments, a completely randomized design was used, while plant trials were conducted under a randomized block design. The results were subjected to analysis of variance, and means were compared using the Tukey test (p<0.05). Results. The isolate R3 showed variability in terms of its morpho-physiological and biochemical characteristics. Furthermore, it exhibited significant differences compared to the other treatments in the growth and yield indicators evaluated in chickpea. Conclusions. Rhizobium pusense associated with chickpea nodules was identified for the first time in Cuba. The strain demonstrates growth at pH levels between 5.5 and 9.0 and temperature ranges from 29 °C to 38 °C, indicating its tolerance to these factors. Its inoculation in chickpea stimulates nodule formation and increased yield-related variables.

Resumen Introducción. El garbanzo se consideró durante muchos años una especie de hospedero restringido para la nodulación, aunque estudios recientes describen una mayor diversidad bacteriana asociada al cultivo que permita incrementar los conocimientos acerca de esta simbiosis para obtener aislados eficientes en su contribución. Objetivo. Caracterizar e identificar un aislado obtenido a partir de nódulos de plantas de garbanzo y evaluar su efectividad en condiciones de campo. Materiales y métodos. La investigación se desarrolló en los laboratorios de dos centros: Instituto de Investigaciones Fundamentales en Agricultura Tropical “Alejandro de Humboldt”, Cuba y en el Centro Nacional de Recursos Genéticos, México, así como en condiciones campo en dos campañas durante los años 2018 y 2020, para demostrar su efectividad en la interacción del cultivo en el primer centro. El aislado R3 se identificó a nivel taxonómico mediante la secuenciación de cuatro genes. Para los experimentos en condiciones de laboratorio se utilizó un diseño completamente aleatorizado, mientras que los ensayos con plantas se realizaron bajo un diseño de bloques al azar. Los resultados fueron sometidos a un análisis de varianza y las medias se compararon según el test de Tukey (p < 0,05). Resultados. El aislado R3 mostró variabilidad en cuanto a sus características morfo-fisiológico y bioquímicas. Además, tuvo respuesta con diferencias significativas con respecto al resto de los tratamientos en los indicadores de crecimiento y rendimiento evaluados en el garbanzo. Conclusión. Se identificó por primera vez en Cuba Rhizobium pusense asociado a nódulos de garbanzo. La cepa mostró un crecimiento positivo a pH entre 5,5 y 9,0 y rangos de temperatura desde 29 ºC hasta 38 ºC, lo que evidencia su tolerancia a estos factores. Su inoculación en garbanzo estimuló la formación de nódulos e incrementó variables del rendimiento.

Abstract Introduction. Wild species are important in the ecosystem, and their preservation requires the development of effective techniques. Objective. To determine the in situ and ex situ germination characteristics and field growth of Porcelia mediocris N.A. Murray and Compsoneura trianae Warb. in Arosemena Tola, Napo, Ecuador. Materials and methods. The study was carried out between 2019 and 2020, with seeds collected from the primary forest of P. mediocris and C. trianae. Germination tests were conducted in a greenhouse and in the primary forest, measuring seed emergence, tray growth, and performing an analysis of variance between the testing sites. Seedlings were transplanted into three different soil covers at the Amazon Center for Teaching, Research, and Productivity, with measurements taken for height, stem diameter, number of leaves, and survival. Growth curves were created, and an analysis of variance was performed on the final growth measurements among the different soil covers. Results. For P. mediocris, greenhouse-grown plants showed fewer days to the emergence (67.6), but those grown under guaba cover had a greater height (19.45 cm) and germination percentage (70 %) at end of the trial. For C. trianae, plants grown at the collection site had greater height (13.38 cm) and number of leaves at the end of the evaluation. Field growth did not show differences between soil covers, with survival rate of 47 % for P. mediocris and 75 % for C. trianae. Conclusions. P. mediocris showed better germination percentages under guaba cover, while C. trianae exhibited greater growth in the primary forest, with the germination site not affecting post-transplant growth for either species.

Resumen Introducción. Las especies silvestres son importantes en el ecosistema, estas requieren el desarrollo de técnicas que permitan su preservación. Objetivo. Determinar las características de germinación in situ y ex situ y el crecimiento en campo de las especies Porcelia mediocris N.A. Murray y Compsoneura trianae Warb. en Arosemena Tola, Napo, Ecuador. Materiales y métodos. El estudio se realizó entre 2019 y 2020, se colectaron semillas en el bosque primario de P. mediocris y C. trianae. Se desarrollaron pruebas de germinación en invernadero y en bosque primario, se midió la emergencia de las semillas, crecimiento en bandeja y se aplicó un análisis de varianza entre los sitios de ensayo. Las plántulas fueron trasplantadas en tres diferentes coberturas de suelo en el Centro de Enseñanza, Investigación y Productividad de la Amazonía, se tomaron medidas de crecimiento en altura, diámetro del tallo, número de hojas y supervivencia, se elaboraron las curvas de crecimiento y se realizó un análisis de varianza en las medidas finales de crecimiento entre las diferentes coberturas. Resultados. En P. mediocris, las plantas desarrolladas en invernadero reportaron menos días a la emergencia (67,6), pero las desarrolladas en la cobertura guabas tuvieron mayor altura (19,45 cm) y porcentaje de germinación (70 %) al final de la prueba. En C. trianae las plantas desarrolladas en el sitio de colecta tuvieron mayor altura (13,38 cm) y número de hojas al final de la evaluación. El crecimiento en campo no mostró diferencias entre coberturas y tuvo una supervivencia del 47 % en P. mediocris y 75 % en C. trianae. Conclusiones. P. mediocris reportó mejores porcentajes de germinación en la cobertura guabas y C. trianae tuvo mayor crecimiento en el bosque primario, sin que el sitio de germinación influyera en el crecimiento posterior al trasplante en ambas especies.

Abstract Introduction. Seedlings formation under controlled conditions is crucial for cultivating species like strawberry. With LED artificial lighting technology allowing greater control over light, variations in components such as wavelength and intensity can be manipulated to generate seedlings with different characteristics. However, there is a need to generate information for the development of precise and efficient light control practices. Objective. The evaluate strawberry seedling formation under different intensities of violet, blue, and red LED light. Material and methods. The study was conducted in 2020 at the Plant Genetics Laboratory of the Department of Agronomy at the Universidad de Guanajuato, Guanajuato, Mexico. Seeds from San Andreas variety fruits were collected, and seedlings were grown under violet, blue, and red LED light at high, medium, and low intensities. Color determinations of cotyledon area, Chroma saturation index, and Hue angle were performed. Additionally, physio-technical, chemical, and antioxidant activity variables were measured. Results. The most suitable treatments were high and medium intensity violet light, as well as high intensity blue light, with germination range exceeding 60 %. Seedlings did not elongate or thin out and exhibited the largest cotyledons areas and chlorophyll concentrations. Furthermore, these light treatments consumed, on average, 31.2 % less electrical energy. Conclusions. In addition to white light, the most suitable treatments for strawberry seedlings formation were high and medium intensity violet light, as well as high intensity blue light. It is suggested to evaluate violet and blue light treatments in other cultivars to confirm their positive effect on strawberry seedlings. Red light limited germination and showing higher antioxidant activity.

Resumen Introducción. La formación de plántulas en condiciones controladas es fundamental para cultivar especies como la fresa. Dado que la tecnología de iluminación artificial LED ha permitido un mayor control de la luz, la variación de componentes como la longitud de onda y la intensidad pueden ser manipulados para generar plántulas con diferentes características. Sin embargo, es necesario generar información para el desarrollo de prácticas precisas y eficientes en el control de la luz. Objetivo. Evaluar la formación de plántulas de fresa en diferentes intensidades de luz LED violeta, azul y roja. Materiales y métodos. El estudio se realizó durante 2020 en el Laboratorio de Genética Vegetal del Departamento de Agronomía de la Universidad de Guanajuato, Guanajuato, México. Se recuperaron semillas de frutos de la variedad San Andreas y se sembraron plántulas en luz LED violeta, azul y roja a intensidades alta, media y baja. Se realizaron determinaciones de color del área del cotiledón, índice de saturación de color y ángulo Hue. Además, se midieron variables fisiotécnicas, químicas y actividad antioxidante. Resultados. Los tratamientos más adecuados fueron luz violeta de intensidades altas y medias; así como luz azul de alta intensidad, debido a que el porcentaje de germinación superó el 60 %. Las plántulas no se alargaron ni adelgazaron, presentaron las mayores áreas de cotiledones y concentraciones de clorofila. Además, estos tratamientos de luz consumieron en promedio 31,2 % menos energía eléctrica. Conclusiones. Además de la luz blanca, los tratamientos más adecuados para la formación de plántulas de fresa fueron la luz violeta a alta y media intensidad, así como la luz azul a alta intensidad. Se sugiere evaluar los tratamientos de luz violeta y azul en otros cultivares para confirmar el efecto positivo en las plántulas de fresa. La luz roja limitó la germinación y mostró mayor actividad antioxidante.

Abstract Introduction: Aquatic birds (AB) are usually associated with wetlands, which provide refuge, food, and/or nesting sites for resident and migratory species. Despite their ecological importance, there is little knowledge on AB in some tropical environments, such as those found on the Colima coast. Objective: To investigate the spatial and temporal composition of the AB community in Juluapan Lagoon, Colima, Central Mexican Pacific. Methods: Monthly counts were conducted between June 2017 and May 2018 during low-tide conditions to record habitat use by AB. Species richness and bird counts were obtained to compare sampling areas; mean richness and number of individuals were compared between seasons. Results: We detected 53 species and 5 750 individuals. The highest species richness and relative abundance values were obtained in winter at the lagoon area farthest from the connection with the marine system, where anthropogenic activity is lower. Diversity was greater in zones 2 and 3 in spring, summer, and fall. Muddy flats were the most used environment, and the most frequent activity was resting. Nesting activity was only recorded in the middle of the lagoon at the mangrove during spring. “Shorebirds” and “waders” were the most dominant groups in the bird community of the Juluapan lagoon. Conclusions: This coastal wetland is a site of great biological importance for aquatic birds; thus, conservation measures should be implemented, and there should be a continuous study of the effects of anthropogenic pressure.

Resumen Introducción: Las aves acuáticas (AA) son usualmente relacionadas a los humedales debido a que éstos funcionan como sitios de refugio, alimentación y anidación de diferentes especies residentes y migratorias. Sin embargo, el conocimiento sobre las aves acuáticas en algunos humedales es nulo. Objetivo: Investigar la composición espacio-temporal de la comunidad de AA en la laguna Juluapan, Colima, en el Pacífico Central Mexicano. Métodos: Entre junio de 2017 y mayo de 2018 se llevaron a cabo conteos mensuales en condiciones de marea baja para registrar el uso de hábitat de las AA. Se obtuvieron valores de riqueza de especies y número de individuos para realizar comparaciones entre zonas de muestreo, así como el promedio del número de especies y número de individuos para comparaciones entre temporadas. Resultados: Se registraron un total de 53 especies y 5 750 individuos. Los valores de riqueza de especies y densidad de individuos fueron más altos durante invierno, en la zona más alejada al ambiente marino, donde la actividad antropogénica es menor. La diversidad tuvo valores más altos en la zona 2 y 3, durante primavera, verano y otoño. El ambiente más explotado por las aves fueron las planicies lodosas; y el descanso fue la actividad más frecuente. Asimismo, la actividad de anidación sólo se registró en el manglar de la zona media durante primavera. Las “aves playeras” y “aves zancudas” fueron los grupos más predominantes en la comunidad de aves de la laguna Juluapan. Conclusiones: Este humedal costero es un sitio de gran importancia biológica para aves acuáticas, por lo que resulta necesario la implementación de medidas de conservación, así como el estudio de los efectos por la presión antropogénica.

Abstract Introduction: Despite sensory enrichment being critical for ensuring the well-being of captive wild animals, smells are not being included in enrichment protocols for birds. For this group, neophobia can be a problem when it comes to implementing new enrichment devices. Objective: To explore how participation in an olfactory enrichment and latency times varies between bird taxonomic groups (Amazona spp. / Ara spp. / Ramphastos spp.). Methods: We exposed 257 birds to a scent enrichment, and we recorded which individuals engaged with it and the time they took to interact with it. Results: We discovered that participation by toucans in the enrichment was higher compared to amazons and macaws. Furthermore, latency time to interact with the enrichment was higher in amazons that in the other species. Our findings could suggest that toucans are neophilic species which could benefit from higher exploration rates. Amazons on the contrary seem to be particularly neophobic, possibly because of their less opportunistic feeding habits compared to toucans and their higher vulnerability to predation compared to macaws. Conclusion: These results point out that toucans would be more inclined to engage in environmental enrichments, while a more natural design using smells inside familiar objects could be a more successful enrichment for psittacids.

Resumen Introducción: A pesar de que el enriquecimiento sensorial es fundamental para garantizar el bienestar de los animales silvestres en cautiverio, los olores no son incluidos de forma rutinaria en los protocolos de enriquecimiento para aves. Además, en el caso de estos animales, la neofobia puede ser un problema a la hora de implementar nuevos dispositivos de enriquecimiento. Objetivo: Explorar cómo varía la participación y la latencia en la interacción con un enriquecimiento olfativo entre grupos taxonómicos de aves (Amazona spp. / Ara spp. / Ramphastos spp.). Métodos: Expusimos a 257 aves a un enriquecimiento olfativo y registramos qué individuos participaron y el tiempo que tardaron en interactuar con él. Resultados: La participación en el enriquecimiento fue mayor en los tucanes en comparación con las amazonas y los guacamayos. Además, el tiempo de latencia para interactuar con el enriquecimiento fue mayor en las amazonas que en las otras especies. Nuestros hallazgos sugieren que los tucanes son especies neofílicas que podrían beneficiarse de tasas de exploración más altas. Por otro lado, las amazonas parecen ser particularmente neofóbicas, posiblemente debido a sus hábitos alimenticios menos oportunistas en comparación con los tucanes y a su mayor vulnerabilidad a la depredación en comparación con los guacamayos. Conclusión: Estos resultados señalan que los tucanes serían más proclives a participar en enriquecimientos ambientales, mientras que un diseño que utilice olores dentro de objetos más naturales o familiares podría ser más exitoso para las psitácidas.

Abstract Introduction: Melina (Gmelina arborea) is a tree species of great interest for its wood and medicinal properties. In Costa Rica, there are genetically superior clones that are propagated without knowledge of the ontogenic and physiological age of the materials. Objective: To evaluate how age influences the content of phenols and lignins in leaves, petioles, stems, and roots of melina plants. Methods: The total phenolic and lignins contents were determined using Folin-Ciocalteu colorimetric method and alkaline extraction method, respectively. Plants of five different ages were chosen for the investigation (in vitro plants “year 0” and trees of a year and a half, four, seven and 20 years). Sampling was done in March and April 2021. Results: All parts of the plant analyzed contain phenolic compounds and lignins, regardless of their age. There was no positive correlation between age and phenol and lignin content for any development condition, since the highest values were not obtained in the oldest trees. Leaf extracts from in vitro plants and seven-year-old trees showed, respectively, the highest phenol and lignin contents for all conditions (P < 0.05). The lowest average values of phenolic compounds for all conditions were obtained in four-year-old trees. Regarding lignins, the lowest content occurred in the oldest roots, although the trend was not maintained for the rest of the plant parts. Conclusions: This study provides the first results of the content of phenolic compounds and lignins present in different tissues of a forest species of different ages. Therefore, they are the first reference values about the biochemical commitment for phenolic synthesis according to the age and the specific developmental stage of a woody plant.

Resumen Introducción: La melina (Gmelina arborea), es una especie de gran interés por su madera y propiedades medicinales. En Costa Rica, existen clones genéticamente superiores que se propagan sin el conocimiento de la edad ontogénica y fisiológica de los materiales. Objetivo: Evaluar la relación del contenido de fenoles y ligninas en hojas, peciolos, tallos y raíces de plantas con diferentes edades. Métodos: Los contenidos de fenoles y ligninas totales se determinaron mediante el método colorimétrico de Folin-Ciocalteu y el método de extracción alcalina, respectivamente. Para la investigación se eligieron plantas in vitro “año cero” y árboles de año y medio, cuatro, siete y 20 años. El muestreo se realizó en marzo y abril del 2021. Resultados: Se demostró que todas las partes de la planta analizadas contienen compuestos fenólicos y ligninas, independientemente de su edad. No hubo una correlación positiva entre la edad con el contenido de fenoles y ligninas para ninguna condición de desarrollo, pues los valores más altos no se obtuvieron en los árboles más longevos. Los extractos de hojas de las plantas in vitro y los árboles de siete años mostraron, respectivamente, los contenidos más altos de fenoles y ligninas para todas las condiciones (P < 0.05). Los valores promedio más bajos de compuestos fenólicos para todas las condiciones se obtuvieron en los árboles de cuatro años. Respecto a las ligninas, el contenido más bajo se presentó en las raíces más longevas, aunque la tendencia no se mantuvo para el resto de las partes de la planta. Conclusiones: La investigación muestra los primeros resultados del contenido de compuestos fenólicos y ligninas presentes en diferentes tejidos de una especie forestal de edades diferentes. Por lo tanto, son los primeros valores de referencia acerca del compromiso bioquímico para la síntesis fenólica según la edad y el estado de desarrollo específico de una planta leñosa.

Abstract Introduction: Leptodactylus latinasus and Physalaemus cuqui are sympatric anuran species with similar environmental requirements and contrasting reproductive modes. Climatic configuration determines distribution patterns and promotes sympatry of environmental niches, but specificity/selectivity determines the success of reproductive modes. Species distribution models (SDM) are a valuable tool to predict spatio-temporal distributions based on the extrapolation of environmental predictors. Objectives: To determine the spatio-temporal distribution of environmental niches and assess whether the protected areas of the World Database of Protected Areas (WDPA) allow the conservation of these species in the current scenario and future. Methods: We applied different algorithms to predict the distribution and spatio-temporal overlap of environmental niches of L. latinasus and P. cuqui within South America in the last glacial maximum (LGM), middle-Holocene, current and future scenarios. We assess the conservation status of both species with the WDPA conservation units. Results: All applied algorithms showed high performance for both species (TSS = 0.87, AUC = 0.95). The L. latinasus predictions showed wide environmental niches from LGM to the current scenario (49 % stable niches, 37 % gained niches, and 13 % lost niches), suggesting historical fidelity to stable climatic-environmental regions. In the current-future transition, L. latinasus would increase the number of stable (70 %) and lost (20 %) niches, suggesting fidelity to lowland regions and a possible trend toward microendemism. P. cuqui loses environmental niches from the LGM to the current scenario (25 %) and in the current-future transition (63 %), increasing the environmental sympathy between both species; 31 % spatial overlap in the current scenario and 70 % in the future. Conclusion: Extreme drought events and rainfall variations, derived from climate change, suggest the loss of environmental niches for these species that are not currently threatened but are not adequately protected by conservation units. The loss of environmental niches increases spatial sympatry which represents a new challenge for anurans and the conservation of their populations.

Resumen Introducción: Leptodactylus latinasus y Physalaemus cuqui son especies de anuros simpátricos con requerimientos ambientales similares y modos reproductivos contrastantes. La configuración climática determina los patrones de distribución y promueve la simpatría de los nichos ambientales, pero la especificidad/selectividad determina el éxito de los modos reproductivos. Los modelos de distribución de especies (MDE) son una herramienta valiosa para predecir distribuciones espacio-temporales basadas en la extrapolación de predictores ambientales. Objetivos: Determinar la distribución espacio-temporal de los nichos ambientales y evaluar si las áreas protegidas de la base de Datos Mundial de Áreas Protegidas (DMAP) permiten la conservación de estas especies en el escenario actual y futuro. Métodos: Aplicamos diferentes algoritmos para predecir la distribución y superposición espacio-temporal de nichos ambientales de L. latinasus y P. cuqui dentro de América del Sur en el último máximo glacial (UGM), Holoceno medio, actual y futuro. Evaluamos el estado de conservación de ambas especies con las unidades de conservación de la DMAP. Resultados: Todos los algoritmos aplicados mostraron un alto rendimiento para ambas especies (TSS = 0.87, AUC = 0.95). Las predicciones de L. latinasus mostraron amplios nichos ambientales desde LGM hasta el escenario actual (49 % de nichos estables, 37 % de nichos ganados y 13 % de nichos perdidos), sugiriendo fidelidad histórica por regiones climático-ambientales estables. En la transición actual-futura L. latinasus incrementaría la cantidad de nichos estables (70 %) y perdidos (20 %), sugiriendo fidelidad por regiones de tierras bajas y la posible tendencia hacia el microendemismo. P. cuqui pierde nichos ambientales desde el LGM al escenario actual (25 %) y en la transición actual-futura (63 %), incrementando la simpatría ambiental entre ambas especies; 31 % de superposición espacial en el escenario actual y 70 % en el futuro. Conclusión: Los eventos de sequía extrema y las variaciones de precipitaciones, derivados del cambio climático, sugieren la pérdida de nichos ambientales para estas especies, actualmente no se encuentran amenazadas, pero no están adecuadamente protegidas por las unidades de conservación. La pérdida de nichos ambientales aumenta la simpatría espacial que representa un nuevo desafío para estos anuros y la conservación de sus poblaciones.

Abstract Introduction: The use of arthropods in ecological studies in the tropical dry forest (TDF) of Colombia focused mainly on spiders, butterflies, ants, and dung beetles; therefore, it is necessary to understand the seasonal dynamics of the other groups such as Geadephaga in this ecosystem. Objective: To evaluate the spatio-temporal variations and the effect of environmental conditions on the diversity of the Geadephaga communities in two TDF fragments in the Colombian Caribbean. Methods: This study was conducted during four sampling events between February and June 2018, each lasting four days, and four nights. Four sampling stations were selected in each locality (Reserva Campesina La Montaña = RCM and Reserva La Flecha = RLF), separated 350 m one from another, with square plots of 50 × 50 m. A light trap was installed in the center of each square, while pitfall traps were installed in the four vertices, and manual capture, beating sheets and leaf litter sieve were carried out. Results: A total of 348 Carabidae and 114 of Cicindelidae were captured. In both fragments, the richness and abundance presented the lowest values in dry season, while the highest values were observed during the rainy season. Tetracha affinis (Dejean, 1825) was the most abundant species in RCM during rainy season. Conclusions: The richness variation and abundance of Geadephaga corresponds to a seasonal pattern at both locations. A high dissimilarity between the communities of Geadephaga from the two fragments was found, despite having similar environmental conditions.

Resumen Introducción: El uso de artrópodos en estudios ecológicos en el bosque seco tropical (Bs-T) de Colombia se centra mayormente en arañas, mariposas, hormigas y escarabajos coprófagos; por lo tanto, es necesario comprender como es la dinámica estacional de otros grupos como Geadephaga en este ecosistema. Objetivo: Evaluar la variación espacio-temporal y el efecto de las condiciones ambientales sobre la diversidad de las comunidades de Geadephaga en dos fragmentos de Bs-T en el Caribe colombiano. Métodos: El estudio se llevó a cabo en cuatro eventos de muestreo entre febrero y junio de 2018; cada uno con una duración de cuatro días y cuatro noches. En cada localidad (Reserva Campesina La Montaña = RCM y Reserva La Flecha = RLF), se marcaron cuatro estaciones distanciadas 350 m, con parcelas de 50×50 m. En el centro de cada parcela se instaló una trampa de luz, mientras que en los cuatro vértices se instalaron trampas de caída, y se realizó captura manual, cernido de hojarasca y perturbación de follaje. Resultados: Se capturó un total de 348 ejemplares de Carabidae y 114 de Cicindelidae. La riqueza y la abundancia presentaron los valores más bajos durante el período seco, mientras que los mayores valores se observaron durante el período de lluvias, en ambos fragmentos. Tetracha affinis (Dejean, 1825) fue la especie más abundante en la RCM durante el período lluvioso. Conclusiones: La variación de la riqueza y abundancia de Geadephaga responde a un patrón estacional en ambos fragmentos. Se encontró una amplia disimilitud entre las comunidades de Geadephaga de ambos fragmentos, pese a tener condiciones ambientales parecidas.

Abstract Introduction: The Wood Thrush is a migratory bird that has experienced dramatic declines in its populations in recent decades. This species overwinters in forest fragments with intermediate levels of habitat modification in Central America. However, more studies detailing the use of remnant forests through time are needed to elucidate the threats this species faces in the wintering grounds. Objective: To understand the effects of environmental and forest structure variables on the occupancy of Wood Thrush in Northern Costa Rica. Methods: The study area was the Área de Conservación Guanacaste (ACG), located in Northern Costa Rica, in December 2016, and during the 2018-2019 migration season. We estimated Wood Thrush occupancy and detection probability in four locations of ACG (dry forest, cloud forest, and two locations in the wet forest) using single-season occupancy models. We also estimated Wood Thrush occupancy and probability of persistence in different months in three vegetation types (open area, secondary forest, and old-growth forest) in the wet forest of ACG using a multi-season occupancy model approach. Results: Wood Thrush occupancy was best described by precipitation in the four locations of the ACG; the probability of occupancy increased with precipitation. The average occupancy of Wood Thrushes varied with vegetation type: open area with shrubs and forest edge (0.69 ± 0.09), secondary forest (0.46 ± 0.1), and old-growth forest (0.61 ± 0.1). Wood Thrush probability of persistence responded partially to changes in precipitation, with an unexpected increase in persistence when the rainfall continued decreasing in the season. Conclusion: Wood Thrush occupancy was best predicted by changes in precipitation considering a larger spatial scale. Its probability of persistence partially varied with precipitation. An increase in persistence closer to Spring migration might be explained by the start of the breeding season of resident birds, potentially reducing territorial conflicts and conserving energy before migration. The long-term protection of wet forests in Northern Costa Rica is of paramount importance for the conservation of Wood Thrushes in their wintering grounds.

Resumen Introducción: El Zorzal del Bosque es un ave migratoria que ha experimentado caídas dramáticas en sus poblaciones en las últimas décadas. Esta especie pasa el invierno en fragmentos de bosque con niveles intermedios de modificación de hábitat en Centroamérica. Sin embargo, se necesitan más estudios que detallen el uso de los bosques remanentes a lo largo del tiempo para dilucidar las amenazas que enfrenta esta especie en las zonas de invernada. Objetivo: Comprender los efectos de variables ambientales y de estructura del bosque en la ocurrencia del Zorzal del Bosque en el Norte de Costa Rica. Métodos: El área de estudio fue el Área de Conservación Guanacaste (ACG), ubicada en el Norte de Costa Rica, en diciembre de 2016, y en la temporada migratoria 2018-2019. Estimamos la ocurrencia y la probabilidad de detección del Zorzal del Bosque en cuatro ubicaciones de ACG (bosque seco, bosque nuboso y dos ubicaciones en el bosque húmedo) utilizando modelos de ocurrencia de una sola temporada. También estimamos la ocurrencia del Zorzal del Bosque y la probabilidad de persistencia en diferentes meses en tres tipos de vegetación (área abierta, bosque secundario y bosque primario) en el bosque húmedo de ACG utilizando un enfoque de modelo de ocurrencia multi-estacional. Resultados: La ocurrencia del Zorzal del Bosque estuvo mejor descrita por la precipitación en las cuatro localidades del ACG; la probabilidad de ocurrencia aumentó con las precipitaciones. La ocurrencia media de zorzales varió con el tipo de vegetación: área abierta con arbustos y borde de bosque (0.69 ± 0.09), bosque secundario (0.46 ± 0.1) y bosque primario (0.61 ± 0.1). La probabilidad de persistencia del zorzal respondió parcialmente a cambios en la precipitación, con un aumento inesperado en la persistencia cuando las precipitaciones continuaron disminuyendo en la temporada. Conclusión: La ocurrecia del Zorzal del Bosque varió con la precipitación considerando una escala espacial mayor. Su probabilidad de persistencia varió parcialmente con la precipitación. Un aumento en la persistencia más cerca de la migración de primavera podría explicarse por el inicio de la temporada de reproducción de las aves residentes, lo que podría reducir los conflictos territoriales y conservar energía antes de la migración. La protección a largo plazo de los bosques húmedos en el norte de Costa Rica es de suma importancia para la conservación de los Zorzales del Bosque en sus zonas de invernada.

Abstract Introduction: Biodiversity is being lost at an accelerating rate because of global change. Tools such as species distribution models (SDMs) have been widely used to improve knowledge about species’ conservation status and help develop management strategies to mitigate biodiversity loss. SDMs are especially important for species with restricted distributions, such as endemic species. Objective: To determine how potential distribution predicted by SDMs for eight threatened bat species differed from the distribution maps reported by the IUCN. Also, to infer the area of distribution and state of endemism of each specie, and to evaluate the importance of the Tumbesian region for their conservation. Methods: Based on presence records across the species’ entire ranges, we used SDMs to assess the conservation status of these eight species in the Tumbesian region of Ecuador and Peru. Results: The areas estimated by SDMs were 35-78 % smaller for four species (Eptesicus innoxius, Lophostoma occidentale, Platalina genovensium and Lonchophylla hesperia) and 26-1 600 % larger for three species (Amorphochilus schnablii, Promops davisoni and Rhogeessa velilla) than those reported by the IUCN. For Tomopeas ravus, the area estimated by the SDM and IUCN was similar but differed in spatial distribution. SDMs coincided with areas of endemism reported by previous authors for E. innoxius, R. velilla, and T. ravus, but were different for A. schnablii, P. genovensium, P. davisoni, and L. hesperia, due in part to projected distributions for these latter species in dry inter-Andean valleys according to the SDMs. Conclusions: The Tumbesian region represents a significant portion (40-96 %) of the predicted distribution of seven of the eight species studied, underscoring the importance of this region for bat conservation. Our results show likely distributions for these species and provide an important basis for identifying research gaps and developing conservation measures for threatened bats in the Tumbes biodiversity hotspot.

Resumen Introducción: La biodiversidad se está perdiendo a un ritmo acelerado como resultado del cambio global. Herramientas como los modelos de distribución de especies (MDEs) han sido ampliamente usados para mejorar el conocimiento sobre el estado de conservación de las especies y ayudar a desarrollar estrategias de gestión para mitigar la pérdida de biodiversidad. Objetivo: Determinar cómo la distribución potencial predicha por los MDEs para ocho especies de murciélagos amenazados difiere de los mapas de distribución reportados por la UICN. También, inferir el área de distribución y estado de endemismo de cada especie, y evaluar la importancia de la región tumbesina para su conservación. Métodos: Basados en registros de presencia del rango global de las especies, usamos MDEs para evaluar el estado de conservación de estas ocho especies en la región tumbesina de Ecuador y Perú. Resultados: Las áreas estimadas por los MDEs eran 35-78 % más pequeñas para cuatro especies (Eptesicus innoxius, Lophostoma occidentale, Platalina genovensium y Lonchophylla hesperia) y 26-1 600 % más grandes para tres especies (Amorphochilus schnablii, Promops davisoni y Rhogeessa velilla) que aquellas reportadas por la UICN. Para Tomopeas ravus, el área estimada por el MDE y la UICN fue similar, pero difirió en la distribución espacial. Los MDEs coincidieron con áreas de endemismo informadas por autores previos para E. innoxius, R. velilla y T. ravus, pero fueron diferentes para A. schnablii, P. genovensium, P. davisoni y L. hesperia, debido en parte a las distribuciones proyectadas para estas últimas especies en valles secos interandinos según los MDEs. Conclusiones: La región tumbesina representa una porción significativa (40-96 %) de la distribución predicha de siete de las ocho especies estudiadas, subrayando la importancia de esta región para la conservación de murciélagos. Nuestros resultados muestran las probables distribuciones para estas especies y proporcionan una base importante para identificar vacíos de investigación y desarrollar medidas de conservación para murciélagos amenazados en el punto caliente de biodiversidad de Tumbes.

Abstract Introduction: Various anthropic pressures affect the aquatic ecosystems of the foothills of Colombia. The response to environmental stressors is still unknown in bioindicator organisms such as Leptohyphidae. Objective: To determine the diversity of Leptohyphidae nymphs of the Quenane-Quenanito river, in two contrasting hydrological periods and its relationship with some physicochemical variables. Methods: In December (2014) and February (2015), organisms were collected with a Surber net at six stations along the current. Alpha and beta diversity was analyzed and redundancy analysis and generalized linear model were applied to establish the relationship between taxa and environmental variables. Results: Were identified 369 organisms belonging to four genera (Amanahyphes, Traverhyphes, Tricorythopsis, and Tricorythodes), two species, and eight morphospecies. Amanahyphes saguassu is reported for the first time for the Meta department. High diversity of Leptohyphidae nymphs was recorded in the transition to drought season and greater abundance in drought. Beta diversity indicated that the configuration of the assemblage changes spatially and temporally. Conclusions: Leptohyphidae organisms prefer fast habitats, particularly in the dry period where they find food (leaf litter, detritus) and shelter to establish themselves successfully; anthropic activities such as urbanization notably affect diversity. The high diversity recorded in this small river in the foothills of the plains reflects the need to increase this type of works and collection efforts of study material in the region.

Resumen Introducción: Varias presiones antrópicas sufren los ecosistemas acuáticos del piedemonte llanero en Colombia. La respuesta a estresores ambientales aún se desconoce en organismos bioindicadores como Leptohyphidae. Objetivo: Determinar la diversidad de ninfas de Leptohyphidae del río Quenane-Quenanito, en dos periodos hidrológicos contrastantes y su relación con algunas variables fisicoquímicas. Métodos: En diciembre (2014) y febrero (2015) se recolectaron organismos con red Surber en seis estaciones a lo largo del río. Se analizó la diversidad alfa y beta y se aplicó análisis de redundancia y modelos lineales generalizados con el fin de establecer la relación entre los taxones y las variables ambientales. Resultados: Se identificaron 369 organismos pertenecientes a cuatro géneros (Amanahyphes, Traverhyphes, Tricorythopsis y Tricorythodes), dos especies y ocho morfoespecies. Se reporta por primera vez para el departamento del Meta Amanahyphes saguassu. Se registró la mayor diversidad de ninfas en la transición a la sequía y la mayor abundancia en sequía. La diversidad beta señaló que la configuración del ensamblaje cambia a nivel espacial y temporal. Conclusiones: Los organismos de Leptohyphidae prefieren hábitats de corrientes, particularmente en el periodo de sequía, donde hallan alimento (hojarasca, detritos) y refugio para establecerse exitosamente; actividades antrópicas como la urbanización afectan notablemente la diversidad. La alta diversidad registrada en este pequeño río de piedemonte llanero refleja la necesidad de incrementar este tipo de trabajos y esfuerzos de recolección de material de estudio en la región.

Abstract Introduction: A recent revision of the generic classification of the Trochilidae based on DNA sequences revealed many inconsistencies with the current generic classification, largely based on plumage characters subject to homoplasy, especially in the Trochilini, the largest tribe. A thorough generic reorganization brought the classification into accord with the phylogeny, but due to lack of genetic data, two species remained unclassified. One of these was the Mangrove Hummingbird, “Amazilia” boucardi, endemic to Costa Rica and included in the IUCN red list of threatened species. Objective: To obtain molecular evidence to clarify the generic relationships of “A.” boucardi. Methods: We isolated DNA from tissues of this species and amplified 4 nuclear and 4 mitochondrial fragments and compared these with homologous fragments from 56 species in the Trochilini, constructing phylogenetic trees with maximum likelihood and Bayesian methods. Results: Our phylogenetic analyses confirmed the placement of boucardi in the Trochilini and definitely excluded it from Amazilia but placed it with high confidence in the genus Chrysuronia Bonaparte, 1850, within which its closest relative is C. coeruleogularis, which also inhabits mangroves. Conclusions: Our genetic data based on nuclear and mitochondrial regions clearly indicate the relationship of A. boucardi and L. coeruleogularis. Moreover, it is also supported by their habitat distribution in the mangroves of the Pacific coast of Costa Rica and Western Panama. Therefore, we suggested to exclude A. boucardi as “incertae sedis”.

Resumen Introducción: Una revisión reciente de la clasificación de la familia Trochilidae con base en secuencias de ADN demostró muchas incongruencias con la clasificación genérica previa, que había sido hecho con base en caracteres del plumaje muy sujetos a homoplasia, especialmente en la tribu más grande, Trochillini. Una reorganización de los géneros logró llevar su clasificación genérica a la concordancia con la filogenia, pero debido a la ausencia de datos genéticos, dos especies permanecieron sin clasificar. Una de estas fue el colibrí de manglar Amazilia boucardi, una especie endémica de Costa Rica, considerada como amenazada en la lista roja de la UICN. Objetivo: Obtener evidencia molecular para esclarecer las relaciones genéricas de A. boucardi. Métodos: Se aisló ADN de tejidos de esta especie y se amplificaron 4 fragmentos de ADN del núcleo y 5 de la mitocondria, y se compararon con fragmentos homólogos de 56 especies en la tribu Trochillini, generando árboles filogenéticos con métodos de máxima verosimilitud y bayesiano. Resultados: Los análisis filogénticos obtenidos confirmaron la ubicación de boucardi en Trochilini y definitivamente la excluyó del género Amazilia, pero la ubicó con un alto grado de confianza en el género Chrysuronia Bonaparte, 1850, dentro los cuales su pariente más cercano es C. coeruleogularis, que también habita manglares. Conclusiones: Nuestros datos genéticos basados en regiones nucleares y mitocondriales indican claramente la relación entre A. boucardi and L. coeruleogularis. Es más, lo anterior se sustenta por su distribución en los manglares de la costa Pacífica de Costa Rica y oeste de Panamá. Por lo tanto, sugerimos excluir a A. boucardi como “incertae sedis”.

Abstract Introduction: Chacón-Monge et al. (2024) sought to test the accuracy of DNA barcoding for species identification in Pacific Central American shallow water echinoderms. They used cytochrome c oxidase I (COI) sequences derived from new material collected as part of the BioMar-ACG project in Costa Rica. Using their set of 348 echinoderm sequences, they compared species identification results from two online platforms: the National Center for Biotechnology Information (NCBI) GenBank using the nucleotide Basic Local Alignment Search Tool (BLASTn), and the Barcode of Life Data Systems (BOLD) Identification Engine. Objective: The present article is a response to their results and conclusions. Methods: We reinterpreted the results from the authors’ Appendix 2 to enable an objective comparison between the BOLD Identification Engine and BLASTn in GenBank. Results: While the authors found that both platforms were limited by the number of reference sequences available in their respective databases, they concluded that GenBank outperformed BOLD for identification; however, we identify several methodological flaws in their analysis. These include pseudoreplication amongst query sequences, contaminated sequences stemming from sampling errors, and a lack of standardization when interpreting results from the two platforms. Their assessment of the BOLD Identification Engine was also limited by improper selection of a reference database. Conclusion: Addressing these errors, we reinterpret their results and demonstrate that there is no difference in performance between the two platforms.

Resumen Introducción: Chacón-Monge et al. (2024) intentaron probar la precisión de los códigos de barras de ADN para identificar especies de equinodermos de aguas poco profundas del Pacífico Centroamericano. Para ello, utilizaron secuencias de citocromo c oxidasa I (COI) provenientes de material recolectado recientemente como parte del proyecto BioMar-ACG en Costa Rica. Utilizando 348 secuencias de equinodermos, compararon los resultados de identificación de especies de dos plataformas en línea: GenBank del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) empleando la herramienta de búsqueda de alineación local básica de nucleótidos (BLASTn) y la herramienta de identificación del Sistema de Datos del Código de Barras de la Vida (BOLD). Objetivo: El presente artículo es una respuesta a sus resultados y conclusiones. Métodos: Reinterpretamos los resultados presentados por los autores en Apéndice 2 para comparar objetivamente el sistema de identificación de BOLD y el de BLASTn en GenBank. Resultados: Si bien los autores encontraron que ambas plataformas estaban limitadas por la cantidad de secuencias de referencia disponibles en sus bases de datos, concluyeron que GenBank superó a BOLD en la identificación de especies; sin embargo, notamos varias fallas metodológicas en su análisis. Estas incluyeron la pseudorreplicación entre las secuencias consultadas, el uso de secuencias contaminadas derivadas de errores de muestreo y falta de estandarización al interpretar los resultados de las dos plataformas. Su evaluación del sistema de identificación de BOLD se vio limitada por la selección inadecuada de una base de datos de referencia. Conclusión: Teniendo en cuenta estos errores, reinterpretamos sus resultados y demostramos que no existe una diferencia significativa en el rendimiento de ambas plataformas.