Abstract Introduction. Evaluating onion cultivars (Allium cepa L.) in different environments to understand their adaptation is important due to the crop’s relevance in food supply across various countries, the reduction in its genetic diversity, the loss of beneficial traits, and resistance to diseases and pests. Objective. To assess the agronomic performance of onion cultivars under different environments to identify the best ones in terms of adaptation, yield, and interaction. Materials and methods. From November 2017 to August 2018, at the La Selva Research Center of the Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA), Rionegro, Antioquia, Colombia, twenty-one onion cultivars plus two controls were evaluated: Peruana of the Aggregatum group and Yellow Granex of the Cepa, under open-field and protected conditions with plastic roofing, using multilocation trials in a randomized complete block design and four replications. Evaluations were consucted on categories such as bulb weight, number, length, and diameter, along with the interaction of cultivars and environments. Results. In othe open field, due to lower temperatures compared to those recorded under protected conditions resulted in higher yields of weight and number of bulbs. Under protected environments, Aggregatum group cultivars behaved as if they were from the Cepa group, producing fewer large-size bulbs. The adaptation of cultivars varied by environment: in the open field, L55 and L63 cultivars exhibited the best yields, while under protected conditions, RPT20 and RPT11 showed the best adaptation. Conclusion. Environments significantly influenced the behavior of Aggregatum group cultivars, with higher production of extra-large bulbs. Temperature contrasts in protected enviroments with plastic roofing affected cultivars yields, while open-field conditions were more favorable.

Resumen Introducción. La evaluación de cultivares de cebolla (Allium cepa L.) en diferentes ambientes para conocer su adaptación es importante debido a la relevancia del cultivo en la alimentación en diferentes países, la reducción de su diversidad genética, la perdida de sus rasgos benéficos y la resistencia a enfermedades y plagas. Objetivo. Evaluar el comportamiento agronómico de cultivares de cebolla bajo diferentes ambientes, para identificar los mejores en adaptación, rendimiento e interacción. Materiales y métodos. De noviembre 2017 a agosto de 2018, en el Centro de Investigación La Selva de la Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria (AGROSAVIA), Rionegro, Antioquia, Colombia, se evaluaron veintún cultivares más dos testigos de cebolla: Peruana del grupo Aggregatum y Yellow Granex del Cepa, bajo condiciones de campo abierto y protegido con techo plástico, con ensayos multilocacionales en un diseño de bloques completos al azar y cuatro repeticiones. Se evaluó por categorías: peso, número, longitud y diámetro de los bulbos; junto con la interacción de los cultivares y los ambientes. Resultados. En campo abierto, por presentar temperaturas menores a las registradas en las condiciones protegidas, se obtuvieron los mayores rendimientos de peso y número de bulbos. En ambientes protegidos, los cultivares del grupo Aggregatum, se comportaron como si fueran del grupo Cepa, al producir pocos bulbos de gran tamaño. La adaptación de los cultivares fue diferente en los ambientes: en campo abierto los cultivares L55 y L63 presentaron los mejores rendimientos, mientras que bajo condiciones protegidas, RPT20 y RPT11 fueron los que mejor se adaptaron. Conclusión. Los ambientes influyeron significativamente en el comportamiento de los cultivares del grupo Aggregatum con una mayor producción de bulbos extragrandes. Los contrastes de temperaturas que se presentaron en los ambientes protegidos con techo plástico, afectaron los rendimientos de los cultivares, mientras que las condiciones ambientales a campo abierto fueron favorables.

Abstract Background: Lobelia villaregalis is an endemic and endangered species in Jalisco, Mexico. Knowing the structure and genetic diversity of populations of species at risk can contribute to improving strategies for their conservation. This information has not been generated for L. villaregalis. Questions: 1) Does L. villaregalis present low levels of genetic diversity?, 2) Are there genetic differences between its populations?. Studied species: Lobelia villaregalis T.J. Ayers (Campanulaceae: Lobelioideae), herbaceous perennial. Study site and dates: During 2018-2020, field work was carried out in El Bosque La Primavera Natural Protected Area, in Zapopan, Jalisco, in order to locate new populations of the species and collect leaf material. Methods: The diversity and genetic structure of 87 individuals in five populations were evaluated using ISSR molecular markers. Results: The average genetic diversity of L. villaregalis is low (He = 0.057, P = 48.17 %, I = 0.110) as well as the total diversity (HT = 0.069). Molecular analysis of variance showed that most of the genetic variation (92 %) occurred within populations. The Mantel test indicates that there is no correlation between the genetic distances and the geographical distances for the five populations of the species (R = 0.64, P = 0.18). With the genetic assignment analysis, 4 groups were identified, however there is no genetic structure (GST = 0.060). Conclusions: Lobelia villaregalis requires urgent actions of conservation to maintain the genetic diversity present in all its populations, giving the highest priority to three of them.

Resumen Antecedentes: Lobelia villaregalis es una especie endémica y en peligro de extinción en Jalisco, México. Conocer la estructura y diversidad genética de las poblaciones de especies en riesgo puede contribuir a mejorar las estrategias para su conservación. Esta información no se ha generado para L. villaregalis. Preguntas: 1) ¿Presenta L. villaregalis niveles bajos de diversidad genética?, 2) ¿Existen diferencias genéticas entre sus poblaciones? Especies de estudio: Lobelia villaregalis T.J. Ayers (Campanulaceae: Lobelioideae), herbácea perenne. Sitio y años de estudio: Durante 2018-2020 se realizó trabajo de campo en el Área Natural Protegida Bosque La Primavera, Zapopan, Jalisco, para localizar nuevas poblaciones de la especie y recolectar material foliar. Métodos: Se evaluó la diversidad y estructura genética de 87 individuos en cinco poblaciones utilizando marcadores moleculares ISSR. Resultados: La diversidad genética promedio de L. villaregalis es baja (He = 0.057, P = 48.17 %, I = 0.110) así como la diversidad total (HT = 0.069). El análisis de varianza molecular mostró que la mayor parte de la variación genética (92 %) ocurrió dentro de las poblaciones. La prueba de Mantel indica que no hay correlación entre las distancias genéticas y las distancias geográficas para las cinco poblaciones estudiadas (R = 0.64, P = 0.18). Con el análisis de asignación genética se identificaron 4 grupos, sin embargo, no existe estructura genética (GST = 0.060). Conclusiones: Lobelia villaregalis requiere acciones urgentes de conservación para mantener la diversidad genética de todas sus poblaciones, dando máxima prioridad a tres de ellas.

RESUMEN El establecimiento de nuevas Áreas Protegidas (AP) representa un paso inicial crucial para contrarrestar la pérdida y fragmentación de hábitats naturales, con el fin de conservar ecosistemas de vital importancia para la biodiversidad y preservar las culturas tradicionales. La gestión efectiva de una AP puede generar beneficios significativos tanto para la diversidad biológica que la habita como para la sociedad en general, asegurando la continuidad de los ecosistemas productivos. Este estudio se propone describir de manera exhaustiva las políticas nacionales relacionadas con las AP en Ecuador y las estrategias clave para la conservación de la biodiversidad. Se llevó a cabo una revisión bibliográfica de enfoque descriptivo, cualitativo y exploratorio, que incluyó la consulta de artículos científicos, libros, informes técnicos y documentos gubernamentales pertinentes. Los resultados resaltan el papel fundamental de las AP como refugios esenciales para la vida silvestre, así como su función protectora ante los efectos del cambio climático, permitiendo la evolución de la diversidad genética en respuesta a las presiones de la selección natural. Las principales amenazas a la biodiversidad comprenden cambios en el uso de la tierra debido a la agricultura y la urbanización, la propagación de especies invasoras, la explotación excesiva de recursos y la contaminación ambiental.

ABSTRACT The establishment of new Protected Areas (PAs) represents a crucial initial step to counteract the loss and fragmentation of natural habitats, in order to conserve ecosystems of vital importance for biodiversity and preserve traditional cultures. The effective management of a PA can generate significant benefits for both the biological diversity that inhabits it and for society in general, ensuring the continuity of productive ecosystems. This study aims to comprehensively describe national policies related to PAs in Ecuador and key strategies for biodiversity conservation. A descriptive, qualitative and exploratory literature review was carried out, including consultation of scientific articles, books, technical reports and relevant government documents. The results highlight the fundamental role of PAs as essential refuges for wildlife, as well as their protective function in the face of the effects of climate change, allowing the evolution of genetic diversity in response to the pressures of natural selection. The main threats to biodiversity include changes in land use due to agriculture and urbanization, the spread of invasive species, overexploitation of resources, and environmental pollution.

Abstract The city of Parras de la Fuente, Coahuila is characterized by having criollo avocado trees with different morphological properties. However, very little information is available on their fruit nutritional and sensory characteristics. The objective of this work was to perform the bromatological, mineral, phytochemical and sensory characterization of 7 avocado landraces. The proximal analysis was carried out using standardized tests by the AOAC (2019), while the phytochemical content was determined using HPLC/MS equipment. Subsequently, the samples were evaluated using a hedonic test. The bromatological analysis showed significant differences in the total of the samples for the different response variables, which indicates the great genetic diversity among the sampled trees. The mineral that were determined in the highest concentration were Potassium, Magnesium and Calcium. Thirty-eight different phytochemical compounds were identified in the fruits, with a greater presence of flavones. While the sensory analysis showed a significant difference among the avocado landraces for the evaluated attributes. The flavor and texture attributes were the most important for the consumer preference. Different environmental factors (soil, climate, altitude, latitude, maturity) modify the nutritional composition of the avocado and its organoleptic characteristics. The results of this work may help propagation, fruit diversification and development of companies focused on this fruit in Parras de la Fuente, Coahuila.

Resumen La ciudad de Parras de la Fuente, Coahuila, se caracteriza por tener árboles de aguacate criollo con diferentes propiedades morfológicas. Sin embargo, es muy poca la información que se tiene sobre las características nutrimentales y sensoriales de los frutos de estos árboles. El objetivo del presente trabajo fue caracterizar bromatológica, mineral, fitoquímica y sensorial 7 aguacates criollos, obtenidos de diferentes árboles. El análisis proximal se realizó mediante pruebas estandarizadas por la AOAC (2019), mientras que el contenido de fitoquímicos se determinó en un equipo HPLC/MS. Posteriormente, las muestras se evaluaron mediante una prueba hedónica. El análisis bromatológico arrojó diferencias significativas en el total de las muestras para las diferentes variables de respuesta, lo que indica la gran diversidad genética entre los árboles muestreados. Los minerales que se determinaron en mayor concentración fueron Potasio, Magnesio y Calcio. Se identificaron 38 compuestos fitoquímicos diferentes en los frutos, con mayor presencia de flavonas, mientras que el análisis sensorial arrojó una diferencia significativa entre los criollos en las variables evaluadas. Los atributos de sabor y textura resultaron los más importantes para la preferencia del consumidor. Diferentes factores ambientales (suelo, clima, altitud, latitud, madurez) modifican la composición nutrimental del aguacate y sus características organolépticas. Los resultados de este trabajo pudieran ayudar a la propagación, diversificación frutícola y desarrollo de empresas enfocadas en este fruto en Parras de la Fuente, Coahuila.

SUMMARY: Owing to extensive overexploitation and continuous habitat loss in recent decades, Dalbergia stevensonii has become endangered in Central America and its place of origin. Genetic diversity is essential for ensuring the long-term survival of the species and is vital in breeding programs. However, knowledge of the genetic diversity of D. stevensonii is limited, as no study has been conducted to estimate the population variability in Guatemala. This study is the first to determine the genetic diversity and structure of wild populations of D. stevensonii in Guatemala using molecular markers. The genetic diversity of 90 wild D. stevensonii trees from six populations located in their natural range is currently being evaluated. Genetic diversity was moderate, with an average of 5.83 alleles per locus, a mean Shannon index value of 1.42, and observed and expected heterozygosity of 0.32 and 0.37, respectively. AMOVA indicated that only 6 % of the genetic variation was between populations, and genetic distance values (pairwise FST) suggested moderate differentiation between populations. STRUCTURE and DAPC analyses revealed the existence of three clusters for the 90 samples, while the genetic differentiation among populations is attributed more to genetics than to geographic distance. Conservation of the genetic diversity of D. stevensonii is critical to ensure its long-term survival, and the success of breeding programs focused on improving the traits and characteristics of the species, such as growth rate, wood quality, and resistance to pests and diseases. These findings provide a crucial genetic basis for conservation, management, and restoration of this endemic species.

RESUMEN: Debido a la sobreexplotación y continua pérdida de hábitats en las últimas décadas, Dalbergia stevensonii está en peligro de extinción en América Central, su lugar de origen. La diversidad genética es un factor esencial para garantizar la supervivencia de la especie a largo plazo y es vital en los programas de mejoramiento. Sin embargo, el conocimiento sobre la diversidad genética de D. stevensonii es limitado, ya que no se ha realizado ningún estudio para estimar la variabilidad de las poblaciones en Guatemala. Este es el primer estudio realizado en Guatemala para determinar la diversidad genética y la estructura de las poblaciones silvestres de D. stevensonii utilizando marcadores moleculares. Actualmente, se está evaluando la diversidad genética de 90 árboles silvestres de D. stevensonii procedentes de seis poblaciones situadas en su área de distribución natural. La diversidad genética es moderada, con una media de 5,83 alelos por locus, un valor medio del índice de Shannon de 1,42 y una heterocigosidad observada y esperada de 0,32 y 0,37 respectivamente. El análisis AMOVA mostró que solamente el 6 % de la variación genética se presenta entre poblaciones, y los valores de distancia genética (FST por pares) sugieren una diferenciación moderada entre poblaciones. Los análisis STRUCTURE y DAPC revelaron la existencia de tres conglomerados para las 90 muestras, mientras que las diferenciaciones genéticas entre poblaciones se atribuyeron más a la distancia genética que a la geográfica. La conservación de la diversidad genética de D. stevensonii es fundamental para garantizar su supervivencia a largo plazo y el éxito de los programas de mejoramiento centrados en la mejora de los rasgos y características de la especie, como la tasa de crecimiento, la calidad de la madera y la resistencia a plagas y enfermedades. Estos hallazgos proporcionan una base genética crucial para la conservación, gestión y restauración de esta especie endémica.

Resumen La diversidad genética es importante para la adaptación de una especie a los cambios ambientales, por lo que el conocimiento del nivel y distribución de la diversidad es útil para elaborar estrategias de conservación y manejo de una especie; sin embargo, la información sobre diversidad genética es escasa para especies arbóreas que habitan en el bosque tropical caducifolio, como es el caso de lináloe [Bursera linanoe (La Llave) Rzed., Calderón & Medina], una especie que crece en dos subprovincias bióticas en el bosque tropical seco de los estados de Guerrero, Morelos, Puebla y Oaxaca en México. Por lo anterior, el objetivo del presente estudio fue estimar la diversidad y estructura genética de Bursera linanoe en poblaciones naturales en dos subprovincias bióticas. En 2019 se recolectó follaje de 92 árboles de lináloe en cuatro poblaciones en las subprovincias bióticas Balsasana y Cañadiana. Posteriormente, el ADN se extrajo del follaje con el protocolo CTAB. Cinco intermicrosatélites (ISSR) se utilizaron, y los fragmentos fueron separados en geles de agarosa. Los siguientes estimadores de diversidad genética se calcularon: porcentaje de loci polimórficos (P), heterocigosidad esperada (He), número efectivo de alelos por locus (Ne) e índice de Shannon (IS); además, se estimó el FST de Wright y se realizó un análisis de varianza molecular (AMOVA). También, la estructura genética se evaluó con el software STRUCTURE. Los valores de los estimadores de la diversidad genética para lináloe fueron: P = 100 %, He = 0.352, Ne = 1.618 e IS = 0.522, el valor de FST fue 0.160. La partición de la diversidad genética fue de 74 % dentro de poblaciones, 21 % entre poblaciones y 5 % entre subprovincias. Cuatro grupos (K) se formaron con los árboles de lináloe de las cuatro poblaciones. El número de migrantes fue 1.3 por generación. Se encontró una diversidad genética alta y una diferenciación alta entre poblaciones de Bursera linanoe.

Summary Genetic diversity is important for the adaptation of a species to environmental changes, thus knowledge of the level and distribution of diversity is useful for developing conservation and management strategies for a species; however, information on genetic diversity is scarce for tree species that habit in the tropical deciduous forest as is case of linaloe [Bursera linanoe (La Llave) Rzed., Calderón & Medina], a species that grows in two biotic subprovinces in the dry tropical forest of the states of Guerrero, Morelos, Puebla and Oaxaca in Mexico. Therefore, the objective of this study was to estimate the genetic diversity and structure of Bursera linanoe in natural populations at two biotic subprovinces. In 2019, foliage was collected from 92 linaloe trees in four populations of the biotic subprovinces Balsasana and Cañadiana. Subsequently, the DNA was extracted from the foliage with the CTAB protocol. Five inter-microsatellites (ISSR) were used, and the fragments were separated on agarose gels. The following estimators of genetic diversity were calculated: percentage of polymorphic loci (P), expected heterozygosity (He), effective number of alleles per locus (Ne) and Shannon index (SI). In addition, the Wright’s FST was estimated, and an analysis of molecular variance (AMOVA) was performed. Also, the genetic structure was evaluated with the STRUCTURE software. The values of the genetic diversity estimators were P = 100 %, He = 0.352, Ne = 1.618 and SI = 0.522, the FST value was 0.160. The partition of genetic diversity was 74 % within populations, 21 % between populations and 5 % between subprovinces. Four groups (K) were formed with the linaloe trees of the four populations. The number of migrants was 1.3 per generation. High genetic diversity and high genetic differentiation between population of Bursera linanoe were found.

Resumen El pasto banderita [Bouteloua curtipendula (Michx.) Torr.] cuenta con gran variabilidad morfológica y genética en los pastizales del norte de México, lo cual sugiere que existe la posibilidad de selección de genotipos resistentes a condiciones de zonas áridas; sin embargo, la información sobre su eficiencia fotosintética y características estomáticas es escasa. El objetivo del presente estudio fue relacionar la eficiencia fotosintética, características estomáticas y producción forrajera en poblaciones de pasto banderita. Se utilizó un diseño de bloques completos al azar con cuatro repeticiones. Se establecieron 216 macetas en invernadero donde se evaluaron como tratamientos 51 poblaciones de pasto banderita del estado de Chihuahua, México y tres variedades comerciales como testigos. Se evalúo la eficiencia fotosintética y las propiedades estomáticas; además, se cuantificó la acumulación de forraje. Se realizaron análisis estadísticos descriptivos, análisis de correlación, componentes principales, análisis de agrupamiento y análisis multivariado de la varianza. Las medias para disipación de calor no regulada (YNO, 0.223) y disipación de calor regulada (YNPQ, 0.447) indicaron que estas variables son proporcionales a la eficiencia fotoquímica del fotosistema II (YII, 0.330). Los valores máximos y mínimos en producción de forraje fueron 9.8 y 17.92 g por planta y altura de planta de 7.3 y 23 cm, respectivamente. Existe correlación positiva entre área estomática (AE) y disipación de calor regulada con altura de planta y producción de forraje. En el análisis de componentes principales los dos primeros explicaron el 58.8 % de la variación total. Se encontraron 11 poblaciones sobresalientes en disipación de la energía regulada controlando la fotoinhibición, sin poner en riesgo la producción de la planta.

Summary Sideoats grama [Bouteloua curtipendula (Michx.) Torr.] has great morphological and genetic variability present in the grassland of Northern Mexico, suggesting the possibility of selection of genotypes resistant to arid zone conditions; however, information on its photosynthetic efficiency and stomatal characteristics is scarce. The objective of this study swas to relate photosynthetic efficiency, stomatal characteristics and forage production in sideoats grama populations. A randomized complete block design with four replications was used. Two hundred and sixteen pots were established in a greenhouse where 51 populations of sideoats grama from the state of Chihuahua, Mexico were evaluated as treatments along with three commercial varieties as controls. Photosynthetic efficiency and stomatal properties were evaluated, and forage accumulation was quantified. Descriptive statistical analyses, correlation analysis, principal component, cluster and multivariate analysis of variance were performed. Means for unregulated heat dissipation (YNO, 0.223) and regulated heat dissipation (YNPQ, 0.447) indicated that those variables are proportional to the photochemical efficiency of photosystem II (YII, 0.330). The maximum and minimum values in forage production were 9.8 and 17.92 g per plant, and those values for plant height were 7.3 and 23 cm, respectively. Positive correlation exists between stomatal area and regulated heat dissipation with plant height and forage production. In the principal component analysis the first two principal components explained 58.8 % of the total variation. Eleven outstanding populations were found in regulated energy dissipation, controlling photoinhibition without jeopardizing plant production.

Summary Background and aims: In the Atacama Desert certain plant species can be found in small and isolated areas, limited to regions with water availability. The degree of connectivity within and between these natural populations depends on their pollen and seed dispersal abilities, as well as on the barriers imposed by the landscape. Prosopis flexuosa is a species of high economic and ecological importance included in the algarrobo Conservation and Management program. The main objective of this work is to analyze the genetic variability and mating system of P. flexuosa in the Atacama Desert. M&M: Genetic diversity parameters as well as the mating system were evaluated in a natural population (Quillagua) based on microsatellite molecular markers. The hierarchical distribution of genetic variance and kinship coefficients were analyzed. Results: The results indicate high levels of genetic diversity (HE = 0.67-0.65; Ar = 3.83.7), high outcrossing rates (tm = 0.97, ts = 0.85), low biparental inbreeding (11.6%) and multiple paternity. The proportion of full sibs decreases when considering seeds from the same or different pods (89[PRESERVECIRC]16%). Only the variance between families is significant (p < 0.001) and mean kinships estimated show that progenies within families are not only constituted by half sibs. Conclusions: The results are discussed and related to the limited pollen and seed dispersal and their implication for the management of this resource. The study of the mating system parameters of this Chilean desert population suggests that the low population density and the environment fragmentation would not be influencing their mating capacity.

Resumen Introducción y Objetivos: En el desierto de Atacama ciertas plantas viven aisladas y acotadas a regiones con disponibilidad de agua. La conectividad dentro y entre poblaciones depende de las barreras impuestas por el paisaje y de su capacidad de dispersión. Prosopis flexuosa es una especie con alta importancia económica y ecológica incluida en el Programa de Conservación y Manejo del algarrobo. El objetivo de este trabajo es analizar la variabilidad genética y sistema de fecundación de P. flexuosa en el Desierto de Atacama. M&M: Se evaluó la diversidad genética y el sistema de fecundación sobre la base de marcadores moleculares microsatélites en una población natural (Quillagua). Se analizó la distribución jerárquica de la varianza genética y los niveles de las coancestrías. Resultados: Los resultados indican altos niveles de diversidad genética (HE = 0,67-0,65; Ar = 3,8-3,7), fecundación principalmente cruzada (tm = 0,97, ts = 0,85), baja endogamia biparental (11,6%) y paternidad múltiple. La proporción de hermanos completos disminuye cuando se consideran semillas del mismo o diferente fruto (89[PRESERVECIRC]16%). Solamente la varianza entre familias resulta significativa (p < 0,001) y las coancestrías promedio estimadas dan cuenta que las progenies familiares no están conformadas solamente por medios hermanos. Conclusiones: Los resultados son discutidos y relacionados con la dispersión limitada del polen y semillas y su implicancia para el manejo. El estudio del sistema de fecundación de esta población del desierto chileno sugiere que la baja densidad poblacional y la fragmentación del ambiente no influirían en su capacidad de apareamiento.

Abstract This paper presents the first results on the maternal continental origin of the main localities in the province of Tierra del Fuego (TDF): Río Grande (RG) and Ushuaia (USH), by typing of mitochondrial haplogroups (Hg) in 333 participants. The estimation of Hg was carried out using PCR-APLP and sequencing of the HV1 region, evidencing a significant frequency of maternal Hg of American origin at the provincial level (64.9%). At the local level, a higher proportion of autochthonous lineages was observed in RG (75.1%) compared to USH (57.5%). From the genealogical information of the participants, it was verified that the most frequent geographical origin of both participants and ancestors is the Central region of Argentina. The differences observed between the two localities, which are only 200 km away, in a province with low demographic density, once again highlight the importance of knowing the genealogical information of the participants, as well as the founding history and economic activities of each locality that have motivated the arrival of migrants, to achieve a better contextualization and understanding of the current genetic composition of the province of TDF. Rev Arg Antrop Biol 26(1), 071, 2024. https://doi.org/10.24215/18536387e071

Resumen En este trabajo se presentan los primeros resultados sobre el origen continental materno de las principales localidades de la provincia de Tierra del Fuego (TDF): Río Grande (RG) y Ushuaia (USH), mediante la tipificación de haplogrupos mitocondriales (Hg) de 333 participantes. La estimación de los Hg se realizó mediante PCR-APLP y secuenciación de la región HV1, evidenciando una significativa frecuencia de Hg maternos de origen americano a nivel provincial (64,9%). A nivel local, se observó una mayor proporción de linajes autóctonos en RG (75,1%) respecto de USH (57,5%). A partir de la información genealógica de los participantes, se evidenció que el origen geográfico más frecuente tanto de los participantes como de los ancestros, es la región Centro de Argentina. Las diferencias observadas entre dos localidades que distan a sólo 200 km, en una provincia de baja densidad demográfica, ponen en evidencia una vez más la importancia de conocer la información genealógica de los participantes, así como la historia fundacional y las actividades económicas de cada localidad que han motivado la llegada de migrantes, para una adecuada contextualización y comprensión de la actual composición genética de la provincia de TDF. Rev Arg Antrop Biol 26(1), 071, 2024. https://doi.org/10.24215/18536387e071

Abstract The objective was to know the population structure of Holstein animals in the family dairy system, to identify possible origins of the genetic material, to know the degree of inbreeding and to identify possible traces of selection in the genome, which allow glimpses of the traits that have been improved over the years. The study included 270 animals genotyped with the GGP-50K® chip. After genotype quality control, 43,548 autosomal SNPs were included. To know the population structure, analyses of mixtures and principal components (PCs) were performed. To know genomic inbreeding and detect traces of selection, information on runs of homozygosity (ROH) was used. Mixture analysis was performed with the Admixture software, and PC, ROH and inbreeding analyses were performed with SVS-v7.6.8. Mixture analysis showed evidence of six components, all linked to Holstein bulls families with different country of origin. The PCs did not show stratification of the population by herd. The mean inbreeding coefficient was 0.59 ± 0.53 %. In the regions of the genome with ROHs most frequent in the population (≥20 animals), numerous associations, QTLs and genes related to milk production and composition, fertility parameters, susceptibility to diseases, body conformation, feed efficiency and some characteristics of carcass composition have been reported. The results reflect the existence of a wide genetic diversity in this population and the possibility of carrying out genetic improvement work through selection without affecting inbreeding levels.

Resumen El objetivo fue conocer la estructura poblacional de los animales Holstein del sistema de lechería familiar, identificar posibles orígenes del material genético, conocer el grado de consanguinidad e identificar posibles huellas de selección en el genoma, que permitan vislumbrar las características que se han mejorado a través de los años. El estudio incluyó 270 animales genotipados con el chip GGP-50K®. Después del control de calidad de genotipos, se incluyeron 43,548 SNP autosómicos. Para conocer la estructura poblacional se realizaron análisis de mezclas y componentes principales (CP). Para conocer la consanguinidad genómica y detectar huellas de selección, se usó información de corridas de homocigosidad (ROH). El análisis de mezclas se realizó con el software Admixture, y los de CP, ROH y consanguinidad se realizaron con SVS-v7.6.8. El análisis de mezclas mostró evidencia de seis componentes, todos ligados a familias de sementales Holstein con diferente país de origen. Los CP no evidenciaron estratificación de la población por hato. El coeficiente de consanguinidad promedio fue de 0.59 ± 0.53 %. En las regiones del genoma con ROH más frecuentes en la población (≥20 animales), se han reportado numerosas asociaciones, QTL y genes relacionados con producción y composición de la leche, parámetros de fertilidad, susceptibilidad a enfermedades, conformación corporal, eficiencia alimenticia y algunas características de composición de la canal. Los resultados reflejan la existencia de una amplia diversidad genética en esta población y la posibilidad de realizar trabajos de mejoramiento genético a través de selección sin afectar los niveles de consanguinidad.

Resumen: A pesar de todo el conocimiento generado en torno a las técnicas de injerto en especies vegetales, existe poca investigación que evalúe los resultados encontrados. El objetivo de este trabajo fue analizar, mediante técnicas bibliométricas, la información publicada en artículos científicos donde se evalúo alguna técnica de injerto, para identificar metodologías de análisis, tipos de injertos, especies vegetales y la aplicación de los resultados encontrados. La palabra clave utilizada para la búsqueda de los artículos científicos fue ‘grafting’, y se consideraron publicaciones hasta diciembre de 2022. De 1994 a 2022 se identificaron 293 artículos científicos, la frecuencia de su publicación mostró una tendencia exponencial (R2 = 0,54). Se encontró que se evalúan variables asociadas al portainjerto, injerto y sobrevivencia de la nueva planta formada, que son evaluadas cada vez con mayor frecuencia con técnicas multivariadas por el interés de detectar las variables más significativas a partir de un número elevado de variables analizadas. Se documentaron 11 técnicas de injerto: púa, hendidura, empalme, inglés, yema, in vitro, microinjerto, en T, chapado, chip y entube. Las especies de mayor análisis correspondieron a frutícolas (cítricos), hortícolas (tomate), forestal (nogal), y ornato (rosa). Sin embargo, el 63,47% de los artículos científicos se limitaron a hacer análisis descriptivos sobre prendimiento, compatibilidad y sobrevivencia de los materiales vegetativos. Lo anterior, deja un área de oportunidad para desarrollar investigación sobre los procesos de mejora genética en la búsqueda de caracteres agronómicos de interés (fruto y crecimiento), o bien en la diversidad genética orientada a la productividad y/o conservación.

Abstract: Despite all the knowledge generated about grafting techniques in plant species, there is little research that evaluates the results found. The objective of this work was to analyze, through bibliometric techniques, the information published in scientific articles in which a grafting technique was evaluated, to identify analysis methodologies, types of grafts, plant species, and the application of the results found. The keyword used for the search of scientific articles was ‘grafting’, and publications up to December 2022 were considered. From 1994 to 2022, 293 scientific articles were identified, the frequency of their publication showed an exponential trend (R2 = 0,54). It was found that variables associated with rootstock, graft and survival of the newly formed plant are evaluated, with an increasing use of multivariate techniques in order to detect the most significant variables. Eleven grafting techniques were documented: bark grafting, cleft grafting, splice grafting, whip and tongue grafting, budding, in vitro grafting, micrografting, T-budding, side-veneer grafting, chip budding, and tube grafting. Fruit (citrus), horticultural (tomato), forest (walnut), and ornamental (rose) crops were the most widely analyzed. However, 63,47% of the scientific articles were limited to descriptive analyses on success rate, compatibility and survival rate of vegetative materials. This provides the opportunity to conduct research on genetic improvement processes in the search for agronomic traits of interest (fruit and growth), or on genetic diversity aimed to improve productivity and/or conservation.

Abstract Species of the genus Anisakis (Nematoda: Anisakidae) are indirect life-cycle marine parasites. Planktonic crustaceans serve as first intermediate hosts, while fish and cephalopods as second intermediate or paratenic hosts, and finally the cycle is completed in cetaceans, marine mammals that are the main definitive hosts of the genus. In the life cycle, Anisakis larvae can be ingested by humans as accidental hosts, which can cause anisakiasis, a zoonosis acquired through the consumption of raw or marinated fish and cephalopods. These nematodes have a cosmopolitan distribution; however, their diversity has been poorly studied in the southern hemisphere. Therefore, diversity of Anisakis spp. larvae present in two host species in Chile was evaluated by combining morphometric and genetic analysis. For this purpose, Anisakis spp. larvae were collected from the abdominal cavity of hake Merluccius gayi and the Humboldt squid Dosidicus gigas from fishing ports in the Biobío Region, Chile. Morphometric characterization of Anisakis spp. larvae consisted of measuring the length of the esophagus, esophageal ventricle, tail, total length and maximum body width. The nuclear ITS (ITS1- ITS2) and mitochondrial COX2 molecular regions were used for genetic analysis. Morphometric results revealed that Anisakis larvae extracted from D. gigas were significantly longer than those collected from M. gayi, suggesting high host-dependent phenotypic variability. Molecular and phylogenetic analyses determined the presence of Anisakis pegreffii in both host, however, demonstrated low genetic differentiation and nucleotide diversity among sequences, indicating low genetic variability for the data set. This work constitutes the first molecular record of A. pegreffii in intermediate / paratenic hosts from the coast of Chile.

Resumen Las especies del género Anisakis (Nematoda: Anisakidae) son parásitos marinos con ciclo de vida indirecto. Los crustáceos planctónicos intervienen como primeros hospedadores intermediarios, mientras que peces y cefalópodos intervienen como segundos hospedadores intermediarios o paraténicos, finalmente el ciclo se cierra en los cetáceos, mamíferos marinos que son los principales hospedadores definitivos del género. En el ciclo de vida, las larvas de Anisakis pueden ser ingeridas por el hombre interviniendo como huésped accidental, lo que puede ocasionar anisakiasis, una zoonosis adquirida a través del consumo de peces y cefalópodos crudos o marinados. Estos nemátodos tienen una distribución cosmopolita, sin embargo, su diversidad ha sido escasamente estudiada en el hemisferio Sur. Por tanto, se evaluó la diversidad de las larvas de Anisakis spp., presentes en dos especies de hospederos de Chile, combinando el análisis morfométrico y genético. Para ello, se recolectaron larvas de Anisakis spp. en la cavidad abdominal de la merluza Merluccius gayi y el calamar de Humboldt Dosidicus gigas, procedentes de terminales pesqueros de la región del Biobío, Chile. La caracterización morfométrica de las larvas de Anisakis spp., consistió en la medición de la longitud del esófago, ventrículo esofágico, cola, longitud total y ancho máximo del cuerpo. Para los análisis genéticos se usó la región molecular nuclear ITS (ITS1-ITS2) y mitocondrial COX2. Los resultados morfométricos revelaron que las larvas de Anisakis extraídas de D. gigas fueron significativamente de mayor longitud que las recolectadas en M. gayi, sugiriendo una alta variabilidad fenotípica hospedador-dependiente. Los análisis moleculares y filogenéticos determinaron la presencia de Anisakis pegreffii en ambos hospedadores, sin embargo, demostraron una baja diferenciación genética y diversidad nucleotídica entre las secuencias, indicando una escasa variabilidad genética para el conjunto de datos. Este trabajo constituye el primer registro molecular de A. pegreffii en hospedadores intermediario o paraténicos de la costa de Chile.

Abstract Diarrheagenic Escherichia coli comprises a heterogeneous group of pathotypes or pathogenic variants that share phenotypic characteristics with marked differences in virulence genes, colonization sites, pathogenesis, clinical presentation, and epidemiology of infection. The most studied pathotypes are Shiga toxin-producing E.coli (STEC), enterotoxigenic E.coli (ETEC), enteropathogenic E.coli (EPEC), enteroaggregative E.coli (EAEC), and enteroinvasive E.coli (EIEC). The objective of the study was to characterize the isolates of diarrheagenic E.coli from an outpatient pediatric population with diarrhea attended in two public hospitals from Buenos Aires, Argentina. Diarrheagenic E.coli pathotypes were investigated by amplifying characteristic virulence gene fragments: intimin (eae), heat-labile toxin (lt), heat-stable toxins (stp, sth), invasion plasmid antigen H (ipaH), transcriptional activator R (aggR) and Shiga toxins (stx1, stx2). Molecular subtyping of isolates was performed using PFGE (XbaI). Diarrheagenic E.coli was detected in 14% (84/601) of cases. The EAEC pathotype was prevalent, while ETEC, STEC, EPEC and EIEC were found in a lower proportion. EAEC isolates exhibited a high degree of genetic diversity. All pathotypes were found in children under 5years of age, while only EAEC, EIEC and ETEC were detected in the older population. Future studies that include the characterization of isolates from a greater number of genes and populations from other geographical areas will be necessary to determine the relevance of diarrheagenic E.coli in Argentina.

Resumen Escherichia coli diarreogénica abarca un grupo heterogéneo de patotipos o variantes patogénicas que comparten características fenotípicas con marcadas diferencias en genes de virulencia, sitios de colonización, patogenia, presentación clínica y epidemiología de la infección. Los patotipos más estudiados son E.coli productora de toxina Shiga (STEC), E.coli enterotoxigénica (ETEC), E.coli enteropatogénica (EPEC), E.coli enteroagregativa (EAEC) y E.coli enteroinvasiva (EIEC). El objetivo del estudio fue caracterizar los aislamientos de E.coli diarreogénica provenientes de población pediátrica ambulatoria con diarrea, atendida en dos hospitales públicos de Buenos Aires, Argentina. Los patotipos de E.coli diarreogénica se investigaron mediante la amplificación de fragmentos de genes de virulencia característicos: intimina (eae), toxina termolábil (lt), toxinas termoestables (stp, sth), antígeno plasmídico de invasiónH (ipaH), activador transcripcional R (aggR) y toxinas Shiga (stx1, stx2). La subtipificación molecular de aislamientos se realizó mediante PFGE (XbaI). E.coli diarreogénica fue detectada en el 14% (84/601) de los casos. El patotipo EAEC fue prevalente, mientras que ETEC, STEC, EPEC y EIEC fueron hallados en menor proporción. Los aislamientos de EAEC presentaron un alto grado de diversidad genética. Todos los patotipos fueron hallados en niños menores de 5años, mientras que solamente EAEC, EIEC y ETEC fueron detectados en población de mayor edad. Futuros estudios que incluyan la caracterización de aislamientos a partir de un mayor número de genes y población de otras áreas geográficas serán necesarios para determinar la relevancia de E.coli diarreogénica en Argentina.

Abstract Introduction. During the development of the SARS-CoV-2 pandemic in Antioquia, we experienced epidemiological peaks related to the α, ɣ, β, μ, ƛ, and δ variants. δ had the highest incidence and prevalence. This lineage is of concern due to its clinical manifestations and epidemiological characteristics. A total of 253 δ sublineages have been reported in the PANGOLIN database. The sublineage identification through genomic analysis has made it possible to trace their evolution and propagation. Objective. To characterize the genetic diversity of the different SARS-CoV-2 δ sublineages in Antioquia and to describe its prevalence. Materials and methods. We collected sociodemographic information from 2,675 samples, and obtained 1,115 genomes from the GISAID database between July 12th, 2021, and January 18th, 2022. From the analyzed genomes, 515 were selected because of their high coverage values (>90%) to perform phylogenetic analysis and to infer allele frequencies of mutations of interest. Results. We characterized 24 sublineages. The most prevalent was AY.25. Mutations of interest as L452R, P681R, and P681H were identified in this sublineage, comprising a frequency close to 0.99. Conclusions. This study identified that the AY.25 sublineage has a transmission advantage compared to the other δ sublineages. This attribute may be related to the presence of the L452R and P681R mutations associated in other studies with higher evasion of the immune system and less efficacy of drugs against SARS-CoV-2.

Resumen Introducción. Durante el desarrollo de la pandemia por SARS-CoV-2 en Antioquia se presentaron picos epidemiológicos relacionados con las variantes α, ɣ, β, μ, ƛ y δ, donde δ tuvo la mayor incidencia y prevalencia. Este linaje se considera una variante de preocupación dadas las manifestaciones clínicas que desencadena y sus características epidemiológicas. Se han informado 253 sublinajes δ en la base de datos PANGOLIN. La identificación de estos sublinajes mediante análisis genómico ha permitido rastrear su evolución y propagación. Objetivo. Caracterizar la diversidad genética de los diferentes sublinajes δ de SARSCoV-2 en Antioquia y determinar su prevalencia. Materiales y métodos. Se recopiló información sociodemográfica de 2.675 muestras y de 1.115 genomas del repositorio GISAID entre el 12 de julio de 2021 y el 18 de enero de 2022. Se seleccionaron 501 por su alto porcentaje de cobertura (>90 %) para realizar análisis filogenéticos e inferencia de frecuencias alélicas de mutaciones de interés. Resultados. Se caracterizaron 24 sublinajes donde el más prevalente fue AY.25. En este sublinaje se identificaron mutaciones de interés como L452R, P681R y P681H, que comprendían una frecuencia cercana a 0,99. Conclusiones. Este estudio permitió identificar que el sublinaje AY.25 tiene una ventaja de transmisión en comparación con los otros sublinajes δ. Esto puede estar relacionado con la presencia de las mutaciones L452R y P681R que en otros estudios se han visto asociadas con una mayor transmisibilidad, evasión del sistema inmunitario y menor eficacia de los medicamentos contra SARS-CoV-2.

RESUMEN Introducción: El desarrollo de vacunas seguras y eficaces contra el SARS-CoV-2 supuso un enorme reto para enfrentar la pandemia de la COVID-19. La aparición de nuevas variantes del SARS-CoV-2 representa un reto en la evaluación de la efectividad de las vacunas, diferentes candidatos vacunales y terapéuticos desarrollados por la comunidad científica. Objetivos: Caracterizar la diversidad genética de aislamientos virales cubanos en el periodo comprendido entre junio de 2020 y diciembre de 2022. Métodos: Se obtuvo el ARN de SARS-CoV-2 de 27 aislamientos a partir de sobrenadante de cultivo celular y se secuenció el gen S. Las secuencias generadas se emplearon para la identificación y posterior caracterización molecular de las variantes genéticas del virus mediante análisis filogenético y el uso de las herramientas disponibles en la base de datos GISEAD. Resultados: Las variantes detectadas en los aislamientos cubanos de SARS-CoV-2 estudiados se correspondieron a las identificadas en los estudios de vigilancia genómica realizados en las diferentes etapas pandémicas de la COVID-19 en Cuba. El 33,3 % de los aislamientos secuenciados correspondieron a los diferentes linajes de la variante Ómicron, seguido de la variante Beta B 1.351 (29,6 %), otros linajes de SARS-CoV-2 (25,9 %), Alfa B 1.1.7 (7,4 %) y Delta B.1.575 (3,7 %). Se detectó la mutación D614G en todos los aislamientos de SARS-CoV-2 estudiados. Conclusiones: La caracterización molecular de los aislamientos cubanos de SARS-CoV-2 tiene una elevada diversidad genética. Posibilita evaluar in vitro e in vivo los candidatos vacunales y agentes terapéuticos desarrollados por la industria biofarmacéutica cubana.

ABSTRACT Introduction: The development of safe and effective vaccines against SARS-CoV-2 posed a huge challenge to face the COVID-19 pandemic. The appearance of new variants of SARS-CoV-2 represents a challenge in evaluating the effectiveness of vaccines, different vaccine and therapeutic candidates developed by the scientific community. Objectives: Characterize and analyze the genetic diversity of Cuban viral isolates, in the period between June 2020 and December 2022. Methods: SARS-CoV-2 RNA was obtained from 27 isolates from cell culture supernatant and the S gene was sequenced. The generated sequences were used for the identification and subsequent molecular characterization of the genetic variants of the virus through phylogenetic analysis and the use of the tools available in the GISEAD database. Results: The variants detected in the Cuban SARS-CoV-2 isolates corresponded to those identified in the genomic surveillance studies carried out in the different stages of the COVID-19 pandemic in Cuba. 33.3% of the sequenced isolates corresponded to the different lineages of the Omicron variant, followed by Beta B 1.351 (29.6%), other SARS-CoV-2 lineages (25.9%), Alpha B 1.1.7 (7.4%) and Delta B.1.575 (3.7%). The D614G mutation was detected in all SARS-CoV-2 isolates studied. Conclusions: The molecular characterization of the Cuban isolates of SARS-CoV-2 has a high genetic diversity. It makes it possible to evaluate in vitro and in vivo vaccine candidates and therapeutic agents developed by the Cuban biopharmaceutical industry.