Abstract Introduction: Various anthropic pressures affect the aquatic ecosystems of the foothills of Colombia. The response to environmental stressors is still unknown in bioindicator organisms such as Leptohyphidae. Objective: To determine the diversity of Leptohyphidae nymphs of the Quenane-Quenanito river, in two contrasting hydrological periods and its relationship with some physicochemical variables. Methods: In December (2014) and February (2015), organisms were collected with a Surber net at six stations along the current. Alpha and beta diversity was analyzed and redundancy analysis and generalized linear model were applied to establish the relationship between taxa and environmental variables. Results: Were identified 369 organisms belonging to four genera (Amanahyphes, Traverhyphes, Tricorythopsis, and Tricorythodes), two species, and eight morphospecies. Amanahyphes saguassu is reported for the first time for the Meta department. High diversity of Leptohyphidae nymphs was recorded in the transition to drought season and greater abundance in drought. Beta diversity indicated that the configuration of the assemblage changes spatially and temporally. Conclusions: Leptohyphidae organisms prefer fast habitats, particularly in the dry period where they find food (leaf litter, detritus) and shelter to establish themselves successfully; anthropic activities such as urbanization notably affect diversity. The high diversity recorded in this small river in the foothills of the plains reflects the need to increase this type of works and collection efforts of study material in the region.

Resumen Introducción: Varias presiones antrópicas sufren los ecosistemas acuáticos del piedemonte llanero en Colombia. La respuesta a estresores ambientales aún se desconoce en organismos bioindicadores como Leptohyphidae. Objetivo: Determinar la diversidad de ninfas de Leptohyphidae del río Quenane-Quenanito, en dos periodos hidrológicos contrastantes y su relación con algunas variables fisicoquímicas. Métodos: En diciembre (2014) y febrero (2015) se recolectaron organismos con red Surber en seis estaciones a lo largo del río. Se analizó la diversidad alfa y beta y se aplicó análisis de redundancia y modelos lineales generalizados con el fin de establecer la relación entre los taxones y las variables ambientales. Resultados: Se identificaron 369 organismos pertenecientes a cuatro géneros (Amanahyphes, Traverhyphes, Tricorythopsis y Tricorythodes), dos especies y ocho morfoespecies. Se reporta por primera vez para el departamento del Meta Amanahyphes saguassu. Se registró la mayor diversidad de ninfas en la transición a la sequía y la mayor abundancia en sequía. La diversidad beta señaló que la configuración del ensamblaje cambia a nivel espacial y temporal. Conclusiones: Los organismos de Leptohyphidae prefieren hábitats de corrientes, particularmente en el periodo de sequía, donde hallan alimento (hojarasca, detritos) y refugio para establecerse exitosamente; actividades antrópicas como la urbanización afectan notablemente la diversidad. La alta diversidad registrada en este pequeño río de piedemonte llanero refleja la necesidad de incrementar este tipo de trabajos y esfuerzos de recolección de material de estudio en la región.

Abstract Introduction: Bioindicator monitoring is a crucial conservation strategy within natural protected areas. Various taxonomic groups have been investigated as bioindicators due to their distinctive attributes, including ease of sampling, differential responses to disturbances, associations with species richness, and accessible taxonomy. Objective: To compare the potential of four taxa (Chilopoda, Scarabaeidae, Carabidae, and Pompilidae) as environmental bioindicators, considering their ease of collection, presence of changes in community composition due to disturbances, including species with preferences for disturbed or conserved areas; and to correlate their diversity with the diversity of other taxa. Methods: The study was conducted at the Manu Learning Centre Biological Station in the Manu Biosphere Reserve, which comprises three areas along a disturbance gradient. Specimens were collected using pitfall traps, yellow pan traps, Malaise traps, and monoliths from May to June in 2021. Ease of collection was measured in terms of richness and abundance; changes in the community composition were assessed using similarity analysis, non-metric multidimensional scaling, and beta diversity partitioning; presence of species with preferences was analyzed using correspondence analysis and G. Williams’ goodness-of-fir test; and diversity correlation using the Spearman index. Results: Among the taxa investigated, Scarabaeidae and Pompilidae were the easiest to collect. Changes in composition were observed in all taxa but were significant only in Chilopoda and Scarabaeidae. All taxa exhibited species with preferences for disturbed and undisturbed environments. There was a high correlation in diversities among Carabidae, Scarabaeidae, and Chilopoda. Conclusions: Our findings underscore the diverse responses exhibited by taxa along a disturbance gradient. Notably, Scarabaeidae and Chilopoda emerged as particularly robust bioindicators within the studied ecosystem.

Resumen Introducción: El monitoreo de bioindicadores es una herramienta importante para la conservación de áreas naturales protegidas. Diferentes grupos taxonómicos fueron estudiados como bioindicadores por presentar: facilidad de muestreo, respuestas variadas a la perturbación, riqueza asociada a otras especies, y taxonomía accesible. Objetivo: Comparar el potencial de cuatro taxones (Chilopoda, Scarabaeidae, Carabidae y Pompilidae) como bioindicadores ambientales, tomando en cuenta su facilidad de recolección, presencia de cambios en la composición de sus comunidades por perturbaciones, presencia de especies con preferencia por áreas perturbadas o conservadas; y diversidad correlacionada con la diversidad de los otros taxones. Métodos: El trabajo se realizó en la estación Biológica Manu Learning Centre en la Reserva de Biosfera del Manu, que comprende tres áreas en un gradiente de perturbación. Los ejemplares fueron recolectados con trampas pitfall, bandejas amarillas, trampas Malaise y monolitos, de mayo a diciembre del 2021. La facilidad de recolección se midió en términos de riqueza y abundancia; los cambios en la composición de sus comunidades mediante el análisis de similitud, escalamiento no métrico multidimensional, y partición de la diversidad beta; presencia de especies con preferencia con el análisis de correspondencia y el ajuste de bondad G de Williams; y finalmente la correlación de las diversidades con el índice de Spearman. Resultados: De los taxones estudiados, las de más fácil recolección fueron Scarabaeidae y Pompilidae. Existen cambios en la composición en todos los taxones, pero son importantes solo en Chilopoda y Scarabaeidae. En todos los taxones hay especies con preferencia por ambientes perturbados y no perturbados. Existe una alta correlación de las diversidades de Carabidae, Scarabaeidae y Chilopoda. Conclusiones: Todos los grupos responden de diferente forma a los gradientes de perturbación, Scarabaeidae y Chilopoda fueron los que tuvieron mejores características para ser considerados buenos bioindicadores.

Abstract Introduction: More and more studies include functional diversity to understand biodiversity patterns. However, in Tolima department, little research has been conducted on this aspect in bird communities, creating a knowledge gap to this important facet of biodiversity. Objective: To determine changes or patterns in the taxonomic and functional diversity of bird communities at the Centro Universitario Regional del Norte (CURDN) for eight years. Methods: The data were organized to identify changes in the bird community over time and during different climatic periods (high and low precipitation). Several indices of taxonomic and functional diversity (alpha and beta) were used. Non-Metric Multidimensional Scaling (NMDS) and Non-Parametric Analysis of Similarity (ANOSIM) were applied to evaluate the impact of climatic periods and temporal variation. Results: During the sampling, 2 691 individuals were recorded. We found that there was no difference in the taxonomic and functional alpha diversity. However, the results of these two facets of biodiversity revealed opposing patterns that are structuring bird communities. The partitioning analysis of taxonomic beta diversity revealed a process of species turnover, while functional beta diversity revealed functional nestedness. Conclusions: Functional diversity suggested that anthropogenic activities in the CURDN act as filters that structure bird communities. These findings highlight the importance of considering these two facets of biodiversity to determine changes or patterns in bird communities over a long period.

Resumen Introducción: Cada vez son más los estudios que incluyen la diversidad funcional para comprender los patrones de la biodiversidad. Sin embargo, en el departamento del Tolima, se ha investigado poco este aspecto en las comunidades de aves, lo que crea un vacío de conocimiento acerca de esta faceta de la diversidad biológica. Objetivo: Determinar cambios o patrones en la diversidad taxonómica y funcional de la avifauna del Centro Universitario Regional del Norte del Tolima (CURDN) durante un periodo de ocho años. Métodos: Los datos fueron organizados de manera que permitieran determinar cambios en la comunidad de aves a lo largo del tiempo y en diferentes épocas climáticas (alta y baja precipitación). Se emplearon diferentes índices de diversidad taxonómica y funcional (alfa y beta). Para evaluar el efecto de las temporadas climáticas y establecer diferencias entre los años, se utilizó el Escalamiento Multidimensional No Métrico (NMDS) y el Análisis de Similitud no paramétrico (ANOSIM). Resultados: Durante el periodo de estudio, se registraron 2 691 individuos. No se encontraron diferencias en la diversidad alfa, tanto taxonómica como funcional. Sin embargo, los resultados de estas dos facetas de la biodiversidad revelaron patrones opuestos que están estructurando la comunidad de aves. El análisis de partición de la diversidad taxonómica beta reveló un proceso de recambio de especies, mientras que la diversidad beta funcional determinó un anidamiento funcional. Conclusión: La diversidad funcional señaló la posibilidad de que las actividades antropogénicas llevadas a cabo en el CURDN actúan como filtros que estructuran la comunidad de aves. Estos hallazgos resaltan la importancia de considerar estas dos facetas de la biodiversidad para determinar cambios o patrones de las comunidades de aves durante un amplio periodo de estudio.

Abstract Background: Epiphytic mosses are one of the most common groups in forest environments but among the most neglected by researchers in Mexico. Questions: What is the epiphytic mosses diversity, measured in richness, turnover, and community composition in Mexican forests? Species of study: Epiphytic mosses. Study site and years: Humid mountain forest, pine-oak and tropical evergreen forests. Study period: 2015 to 2021. Methods: Through a literature review and field work we compiled data on epiphytic mosses in three forest types in Mexico. We assessed the data using alpha and beta diversity analysis, indicator species, and community composition. Additionally, we explored the influence of elevation and forest type on the observed diversity patterns. Results: We report a richness of 147 species of epiphytic mosses across three types of Mexican forests. The humid mountain forest was the best sampled forest with the highest moss species richness. Although species richness is different for the forests studied, species turnover is similar among them. We demonstrated that elevation and forest type are highly correlated with species richness of epiphytic mosses. Conclusions: The epiphytic mosses studied here collectively represent over 15 % of the moss richness of Mexico. Forest type and elevation seem to be the drivers of this widely distributed richness. Finally, we call for more in-depth studies of the forests presented here, as well as those in other latitudes including variables such as humidity and host traits, to provide a more complete picture of an overlooked Mexican flora.

Resumen Antecedentes: Los musgos epífitos son uno de los grupos más comunes en ambientes forestales, pero de los más desatendidos de México. Preguntas: ¿Cuál es la riqueza, recambio y composición de la comunidad de musgos epífitos en los bosques de México? Especies de estudio: Musgos epífitos. Sitios y años de estudio: Bosque húmedo de montaña, de pino-encino y tropical perennifolio. Periodo de estudio: 2015-2021. Métodos: Mediante una revisión bibliográfica y trabajo de campo recopilamos datos de musgos epífitos en tres tipos de bosques de México. Evaluamos los datos mediante análisis de diversidad alfa y beta, especies indicadoras y composición de la comunidad. Además, exploramos la influencia de la altitud y el tipo de bosque en los patrones de diversidad observados. Resultados: Reportamos una riqueza de 147 especies de musgos epífitos para tres tipos de bosques de México. El bosque húmedo de montaña es el mejor muestreado y con la mayor riqueza de musgos. El recambio de especies es similar entre los bosques estudiados. Constatamos que la elevación y el tipo de bosque están relacionados con la riqueza de musgos epífitos. Conclusiones: Los musgos epífitos estudiados aquí representan más del 15 % de la riqueza de musgos de México. El tipo de bosque y la elevación parecen ser los impulsores de esta riqueza ampliamente distribuida. Finalmente, continuar la exploración de los bosques estudiados aquí, así como de aquellos en otras latitudes incluyendo variables como la humedad y rasgos de los árboles hospederos, es urgente para mejorar el conocimiento de esta flora mexicana.

Abstract Introduction: The creation of protected natural areas within urban environments has played an essential role in providing small reservoirs of native vegetation and refuges for endemic species. However, knowledge of how land management and landscape design can influence the different community structures of urban parks is scarce. Objective: To analyze, through ant communities, the influence of urbanization in a protected natural area (PNA) located in an urban zone. Methods: From April to July 2022, using bait traps and pitfall traps along 100 m transects, the presence of ant species was recorded in the El Refugio State Park Natural Area in Tamaulipas, Mexico. Alpha diversity was assessed using Hill numbers, while beta diversity was evaluated using the Jaccard index. Additionally, indicator species were identified through the indicator value (IndVal). Multiple correspondence analysis was conducted to associate the presence of species with environmental variables and vegetation types, and contingency tables were created to relate ant presence to vegetation cover size. Results: In total 18 565 individuals were captured (five subfamilies, 22 genera, and 29 species). Species richness and diversity decreased in sites with low vegetation cover, such as in Tamaulipan thornscrub; secondary vegetation retained greater species richness. Indicator species found in secondary vegetation and grassland areas were mainly composed of species that tolerate high temperatures and generalists such as Forelius mccooki and Tetramorium spinosum. The presence of these species is primarily associated with temperature, humidity, and vegetation cover. A relationship between the presence of ant species and vegetation cover size was evident. Conclusion: The structure and composition of ant communities vary according to the type of vegetation structure, particularly in areas that have undergone greater anthropogenic damage. Therefore, the conservation of landscapes, as well as monitoring of these areas, should be considered in future research.

Resumen Introducción: La creación de espacios naturales protegidos en entornos urbanos desempeñan un papel esencial, proporcionando reservorios de vegetación autóctona y refugios de fauna endémica. Sin embargo, es escaso el conocimiento sobre cómo la gestión del suelo y el diseño del paisaje influye en las diferentes estructuras comunitarias de parques urbanos. Objetivo: Analizar a través de comunidades de hormigas la influencia de la urbanización en un área natural protegida en zona urbana. Métodos: De abril a julio de 2022, en transectos de 100 m se colocaron trampas de cebo y Pitfall, se registró la presencia de especies de hormigas del Parque Estatal “El Refugio” (PER), Tamaulipas, México. La diversidad Alfa se evaluó mediante números de Hill y la diversidad Beta con el índice de Jaccard. Se identificaron especies indicadoras con el Valor Indicador (IndVal). Se realizó un análisis de correspondencia múltiple asociando la presencia de especies con variables ambientales y tipos de vegetación. Se realizó una tabla de contingencia para relacionar la presencia de hormigas con el tamaño de cobertura vegetal. Resultados: En total, se capturaron 18 565 individuos (cinco subfamilias, 22 géneros y 29 especies). La riqueza y diversidad de especies disminuyó en sitios con baja cobertura vegetal, como en matorral espinoso tamaulipeco; la vegetación secundaria conservó mayor riqueza de especies. Áreas de vegetación secundaria y pastizal registraron especies indicadoras, principalmente especies generalistas y tolerantes a las altas temperaturas como Forelius mccooki y Tetramorium spinosum. La presencia de especies está asociada con la temperatura, humedad y cobertura vegetal. Se evidenció una relación entre presencia de especies de hormigas y tamaño de cobertura vegetal. Conclusiones: La estructura y composición de las comunidades de hormigas varía de acuerdo con la estructura vegetal, principalmente en áreas que han sufrido mayor daño antropogénico. La conservación de los paisajes y el monitoreo de estas áreas, deben ser considerados en futuras investigaciones.

Abstract Introduction: Terrestrial isopods (Oniscidea) play important roles in the ecological processes of the soil in tropical ecosystems and are employed as indicators of environmental impact. Despite their importance, studies on the ecology of this suborder in the Neotropics are scarce. Objective: To assess spatial changes in alpha and beta diversity of Oniscidea in the supralittoral zone across Archipiélagos Coralinos (ARCO), Magdalena (MAG), and Morrosquillo (MOR) ecoregions in the Colombian Caribbean. Methods: We conducted Direct Intuitive Searches of specimens and measured soil temperature and moisture in 19 transects with logs, leaf litter, coral remains, and decomposing plant material. Results: A total of 1 970 individuals representing 17 species were collected, with Tylidae, Halophilosciidae, and Ligiidae being the most abundant families. Alpha diversity orders were higher in ARCO than MAG and MOR ecoregions. MAG and MOR differed in observed richness. The structure of the assemblage varied in dominant species and abundances. In ARCO, the indicator species were Tylos niveus, Littorophiloscia denticulata, Halophiloscia trichoniscoides, and Ligia baudiniana; in MOR, it was Tylos marcuzzii, and in MAG, it was Littorophiloscia tropicalis. High beta diversity (> 60 %), with significant differences in the assemblage structure among ecoregions, was confirmed by the NMDS, which distinctly separated each group. CCA analysis revealed a negative relationship between most species with soil temperature and moisture, with a positive relationship observed with T. marcuzzii. Conclusions: This is the first effort to describe spatial changes in the diversity of oniscideans in the supralittoral zone of the Neotropical region, providing a baseline for future studies. This information could be instrumental in identifying priority areas for conservation efforts.

Resumen Introducción: Los isópodos terrestres (Oniscidea) juegan un papel importante en los procesos ecológicos del suelo en ecosistemas tropicales y han sido empleados como indicadores de impacto ambiental. A pesar de su importancia, los estudios sobre la ecología de este suborden en el Neotrópico son escasos. Objetivo: Evaluar los cambios espaciales en la diversidad alfa y beta de Oniscidea en la zona supralitoral en las ecorregiones Archipiélagos Coralinos (ARCO), Magdalena (MAG) y Morrosquillo (MOR) en el Caribe colombiano. Métodos: Realizamos Búsquedas Intuitivas Directas de especímenes y medimos la temperatura y la humedad del suelo en 19 transectos con troncos, hojarasca, restos de coral y material vegetal en descomposición. Resultados: Recolectamos un total de 1 970 individuos representando 17 especies, siendo Tylidae, Halophilosciidae y Ligiidae las familias más abundantes. Los órdenes de diversidad alfa fueron mayores en ARCO, en comparación con las ecorregiones MAG y MOR. MAG y MOR difirieron en la riqueza observada. La estructura del ensamblaje varió en especies dominantes y sus abundancias. En ARCO las especies indicadoras fueron Tylos niveus, Littorophiloscia denticulata, Halophiloscia trichoniscoides y Ligia baudiniana; en MOR fue Tylos marcuzzii y en MAG fue Littorophiloscia tropicalis. El NMDS confirmó una alta diversidad beta (> 60%), con diferencias en la estructura del ensamblaje entre ecorregiones, que separó claramente cada grupo. El ACC reveló una relación negativa entre la mayoría de las especies con la temperatura y humedad del suelo, observándose una relación positiva con T. marcuzzii. Conclusiones: Este es el primer esfuerzo por describir los cambios espaciales en la diversidad de oniscídeos en la zona supralitoral de la región Neotropical, proporcionando una línea base para futuros estudios. Esta información podría ser fundamental para identificar áreas prioritarias para los esfuerzos de conservación.

Abstract Maize is considered the third most important grain crop in the world due to its economic, food and industrial interest. Throughout its phenology this crop is attacked by pests and diseases, which could have adverse effects on production. In order to control these problems, conventional management is generally used, causing ecological imbalances. For this reason, it is necessary to consider sustainable alternatives based on the knowledge of beneficial entomofauna. This research aimed to conduct a prospective analysis of the coccinelides associated with maize cultivation in the canton of Santa Ana, Ecuador. For this purpose, the coccinelides present under two different conditions were evaluated; with and without insecticide application. Five sampling techniques were used according to the research protocol and taxonomic classification was carried out. The data were interpreted using descriptive statistics, in addition, alpha and beta diversity was assessed. In the study, 297 individuals were found, gathered to: 1 order,1 family, 13 genera and 11 species. The greatest abundance was found in undisturbed conditions, determining that the most efficient trapping technique for their capture was the use of chromatic traps. This type of research is important to derive biological control programs in economically important crops.

Resumen El maíz es considerado el tercer cultivo de grano más importante del mundo debido a su interés económico, alimentario e industrial. A lo largo de su fenología este cultivo es atacado por plagas y enfermedades, que pueden generar efectos adversos sobre la producción. Para el control de estos problemas, generalmente se acude al manejo convencional, los cuales ocasionan desequilibrios ecológicos. Por esta razón, es necesario considerar alternativas sostenibles fundamentadas en el conocimiento de la entomofauna benéfica. Esta investigación tuvo por objetivo realizar un análisis prospectivo de los coccinélidos asociados al cultivo de maíz en el cantón Santa Ana, Ecuador. Para su efecto, se evaluaron los coccinélidos presentes en dos condiciones distintas: con y sin aplicación de insecticida. Se utilizaron cinco técnicas de muestreo, de acuerdo con el protocolo de investigación, y se procedió con la clasificación taxonómica. Los datos fueron interpretados mediante estadística descriptiva; además, se valoró la diversidad alfa y beta. En el estudio se encontraron 297 individuos, congregados a: 1 orden,1 familia, 13 géneros y 11 especies. La mayor abundancia se presentó en condiciones no intervenidas, determinándose que la técnica de trampeo más eficiente para su captura fueron las trampas cromáticas. Este tipo de investigación es importante para derivar programas de control biológico en cultivos de importancia económica.

Resumen Introducción: El aumento de bacterias resistentes a múltiples fármacos destaca la necesidad de mejorar las terapias antimicrobianas. Las bombas de eflujo, que reducen la concentración de antimicrobianos en las bacterias, son clave en la resistencia, mecanismos que disminuyen la concentración de antimicrobianos en las bacterias, contribuyendo a la resistencia. Objetivo: Evaluar el efecto del inhibidor de bombas de eflujo Phenylalanine-arginine β-naphthylamide sobre la resistencia bacteriana a los antibióticos ceftazidima, clortetraciclina, ciprofloxacina, ceftriaxona, ampicilina y gentamicina en bacilos gram negativos con múltiples genes de BLEE aisladas. Materiales y Métodos: Se realizó un estudio experimental con el propósito de analizar los aislamientos de bacilos gram negativos multirresistentes asociados a infecciones procedentes de una Institución prestadora de servicios de salud de Boyacá, para esto, a partir de 81 aislamientos bacterianos se detectaron genes de resistencia antibiótico en 70 cepas mediante reacción en cadena de la polimerasa convencional y secuenciación tipo Sanger. Resultados: En los 70 aislamientos analizados se evidenció la presencia de determinantes genéticos de resistencia a antibióticos betalactámicos como: bla TEM bla SHV1, bla SHV2 y bla CTM-X , con predominancia del gen bla SHV . Conclusiones: El ensayo de interacción mostró qué en cepas multirresistentes, la terapia conjunta con inhibidores de bombas de expulsión puede ser una alternativa para el tratamiento, sin embargo, debido a la gran diversidad de las bombas de eflujo, se deben evaluar otras familias de inhibidores para identificar los que sean eficientes en un mayor número de cepas.

Abstract Introduction: The rise of bacteria resistant to multiple drugs underscores the need to enhance antimicrobial therapies. Efflux pumps, which decrease the concentration of antimicrobials in bacteria, play a key role in resistance. Objective: The objective of this study is to evaluate the effect of the efflux pump inhibitor Phenylalanine-arginine ß-naphthylamide on bacterial resistance to antibiotics ceftazidime, chlortetracycline, ciprofloxacin, ceftriaxone, ampicillin, and gentamicin in gram-negative bacilli with multiple ESBL genes isolated. Materials and Methods: An experimental study was conducted to analyze multi-resistant gram-negative bacillus isolates associated with infections from a healthcare institution in Boyacá. From 81 bacterial isolates, antibiotic resistance genes were detected in 70 strains through conventional polymerase chain reaction and Sanger sequencing. Results: The analysis of 70 isolates revealed the presence of genetic determinants for beta-lactam antibiotic resistance such as bla TEM1 , bla SHV1 , bla SHV2 y bla CTM-X ,, with a predominance of the bla SHV gene. Conclusions: The interaction assay showed that in multi-resistant strains, combination therapy with efflux pump inhibitors could be an alternative for treatment. However, due to the diverse nature of efflux pumps, other families of inhibitors should be evaluated to identify those effective across a larger number of strains.

RESUMEN Introducción: El desarrollo de vacunas seguras y eficaces contra el SARS-CoV-2 supuso un enorme reto para enfrentar la pandemia de la COVID-19. La aparición de nuevas variantes del SARS-CoV-2 representa un reto en la evaluación de la efectividad de las vacunas, diferentes candidatos vacunales y terapéuticos desarrollados por la comunidad científica. Objetivos: Caracterizar la diversidad genética de aislamientos virales cubanos en el periodo comprendido entre junio de 2020 y diciembre de 2022. Métodos: Se obtuvo el ARN de SARS-CoV-2 de 27 aislamientos a partir de sobrenadante de cultivo celular y se secuenció el gen S. Las secuencias generadas se emplearon para la identificación y posterior caracterización molecular de las variantes genéticas del virus mediante análisis filogenético y el uso de las herramientas disponibles en la base de datos GISEAD. Resultados: Las variantes detectadas en los aislamientos cubanos de SARS-CoV-2 estudiados se correspondieron a las identificadas en los estudios de vigilancia genómica realizados en las diferentes etapas pandémicas de la COVID-19 en Cuba. El 33,3 % de los aislamientos secuenciados correspondieron a los diferentes linajes de la variante Ómicron, seguido de la variante Beta B 1.351 (29,6 %), otros linajes de SARS-CoV-2 (25,9 %), Alfa B 1.1.7 (7,4 %) y Delta B.1.575 (3,7 %). Se detectó la mutación D614G en todos los aislamientos de SARS-CoV-2 estudiados. Conclusiones: La caracterización molecular de los aislamientos cubanos de SARS-CoV-2 tiene una elevada diversidad genética. Posibilita evaluar in vitro e in vivo los candidatos vacunales y agentes terapéuticos desarrollados por la industria biofarmacéutica cubana.

ABSTRACT Introduction: The development of safe and effective vaccines against SARS-CoV-2 posed a huge challenge to face the COVID-19 pandemic. The appearance of new variants of SARS-CoV-2 represents a challenge in evaluating the effectiveness of vaccines, different vaccine and therapeutic candidates developed by the scientific community. Objectives: Characterize and analyze the genetic diversity of Cuban viral isolates, in the period between June 2020 and December 2022. Methods: SARS-CoV-2 RNA was obtained from 27 isolates from cell culture supernatant and the S gene was sequenced. The generated sequences were used for the identification and subsequent molecular characterization of the genetic variants of the virus through phylogenetic analysis and the use of the tools available in the GISEAD database. Results: The variants detected in the Cuban SARS-CoV-2 isolates corresponded to those identified in the genomic surveillance studies carried out in the different stages of the COVID-19 pandemic in Cuba. 33.3% of the sequenced isolates corresponded to the different lineages of the Omicron variant, followed by Beta B 1.351 (29.6%), other SARS-CoV-2 lineages (25.9%), Alpha B 1.1.7 (7.4%) and Delta B.1.575 (3.7%). The D614G mutation was detected in all SARS-CoV-2 isolates studied. Conclusions: The molecular characterization of the Cuban isolates of SARS-CoV-2 has a high genetic diversity. It makes it possible to evaluate in vitro and in vivo vaccine candidates and therapeutic agents developed by the Cuban biopharmaceutical industry.

ABSTRACT: The aim of this research was to determine the alpha and beta diversity of mangrove trees in the Tumbes mangrove forest. The mangrove forest area was divided into three zones: A, B and C, in which 41 sampling points (PM) were taken. Mangrove trees were counted and measured, and the alpha diversity indices were determined: Shannon-Wiener (H'), Simpson (DS) and Pielou (J’), as well as the similarity of the PM. Beta diversity is determined with the indices: Jackard (IJ) and quantitative Sorensen (S). It is considered that the alpha diversity of the mangrove forest was low (H'=1.0260, SD =0.6158 and J’=0.9339), with zone A being the one with the lowest diversity (H'=0.3048, SD=0.8531 and J’=0.2774), due to its less anthropic impact and due to the dominance of Rhizophora mangle over the other species, it was observed that the PM were very similar within each zone, with lower diversity in zone A. The beta diversity evaluated using IJ was 1, indicating that the diversity of species does not change between the zones, while the S index showed that there is a greater change in diversity between zone A and the remaining zones. These results can allow local and regional authorities to make decisions to protect said mangrove forest. On the other hand, it would also be advisable to carry out research to determine the impact that alterations in mangrove species biodiversity may have on the organisms that inhabit this mangrove forest.

RESUMEN: El objetivo de la investigación fue determinar la diversidad alfa y beta de los árboles de mangle en el manglar de Tumbes. El área del manglar se dividió en tres zonas: A, B y C, en ellas se tomaron 41 puntos de muestreo (PM). Se contaron y midieron los árboles de mangle y se determinaron los índices de diversidad alfa: Shannon-Wiener (H’), Simpson (DS) y Pielou (J’), así como la similitud de los PM. La diversidad beta se determinó con los índices: de Jackard (IJ) y cuantitativo de Sorensen (S). Se determinó que la diversidad alfa del manglar fue baja (H’=1,0260, DS=0,6158 y J’=0,9339), siendo la zona A la de menor diversidad (H’=0,3048, DS=0,8531 y J’=0,2774), por su menor impacto antrópico y por el dominio de Rhizophora mangle sobre las otras especies, se observó que los PM fueron muy similares dentro de cada zona, con menor diversidad en la zona A. La diversidad beta evaluada mediante IJ fue de 1, indicando que la diversidad de especies no cambia entre las zonas, en tanto que el índice S mostró que hay un mayor cambio en diversidad entre la zona A y las restantes zonas. Estos resultados pueden permitir a las autoridades locales y regionales tomar decisiones a fin de poder proteger a dicho manglar. Por otro lado, también sería conveniente realizar investigación para determinar el impacto que la alteración de la biodiversidad de las especies de mangles pueda tener en los organismos que habitan en este manglar.

Resumen Presentamos un análisis de la diversidad y de los patrones biogeográficos de 260 especies de aves residentes de los bosques tropicales de México, realizado a partir de datos históricos (recolectados entre el siglo XVIII y 2007) y registros de presencia de la última década (2013-2023). Realizamos comparaciones del número y cambio de composición de especies, considerando las matrices de distribución “histórica” y “actual”, y un análisis de parsimonia de endemismos. De acuerdo con los datos históricos, la mayor riqueza de especies se localiza en la vertiente del Golfo de México y la península de Yucatán, mientras que los bosques estacionalmente secos de la costa del Pacífico y la Cuenca del Balsas presentaron los valores más altos de especies endémicas. Sin embargo, los datos recopilados en la última década muestran una disminución significativa del número de especies en todas las áreas analizadas. La estimación de la diversidad beta indicó valores elevados de cambio en la composición de especies para las matrices evaluadas. La hipótesis biogeográfica obtenida indica la existencia de 2 grandes grupos: i) vertiente pacífica de México y la Cuenca del Balsas y ii) norte de la provincia Veracruzana, el norte del Istmo de Tehuantepec y la península de Yucatán.

Abstract We present an analysis of diversity and biogeographic patterns of 260 resident bird species in the tropical forests of Mexico, based on historical data (collected between the 18th century and 2007) and presence records from the last decade (2013-2023). We performed comparisons of the number and composition change of species, considering the “historical” and “current” distribution matrices, and a parsimony analysis of endemicity. According to historical data, the highest species richness is located on the slope of the Gulf of Mexico and the Yucatán Peninsula, while the seasonally dry forests of the Pacific coast and the Balsas Basin presented the highest values of endemic species. However, data collected in the last decade show a significant decline in the number of species in all areas analyzed. The beta diversity estimation indicated high values of change in species composition for the matrices evaluated. Biogeographic hypothesis obtained indicates the existence of 2 main groups: i) Pacific slope of Mexico and the Balsas Basin and ii) north of the Veracruzan province, the north of the Isthmus of Tehuantepec and the Yucatán Peninsula.

ABSTRACT Introduction: S. aureus has emerged as a persistent threat, demonstrating a remarkable ability to develop resistance throughout the evolution of antibiotics. From the first confrontations with penicillin to the current challenges with strains resistant to vancomycin and daptomycin, the study of the resistance mechanisms of this pathogen has acquired critical importance. Objectives: To document changes in S. aureus resistance patterns over time and identify critical stages in the development of resistance to different antibiotics. Materials and methods: The reviewed articles were selected by identifying articles published between 2010 and 2023. Several relevant databases were used, including PubMed, Scopus, Embase, Cochrane Library, and SciELO. Observational studies, review articles, and clinical guidelines were included. Specific search strategies were developed for each database using keywords and search terms related to S. aureus and its antimicrobial resistance as well as the types of studies of interest. Relevant data were extracted from the selected studies, including information on resistance patterns, resistance mechanisms, clinical impact, and therapeutic strategies. The collected data were analyzed and synthesized to document changes in S. aureus resistance patterns over time and identify critical stages in the development of resistance to different antibiotics. Results: One hundred articles were included where a temporal evolution of resistance is evident, from the first strains resistant to penicillin to the current strains resistant to vancomycin and daptomycin. These studies provided a detailed analysis of the key molecular mechanisms driving antimicrobial resistance, such as beta-lactamase production, alterations in penicillin-binding proteins, and cell membrane modifications. The findings highlight a significant evolution in the ability of S. aureus to adapt to different antibiotics over time, underscoring the complexity and diversity of resistance mechanisms developed by this bacterium. Conclusions: The evolution of S. aureus resistance has followed a pattern marked by critical stages, from the appearance of penicillinase-producing strains after the introduction of penicillin to the emergence of MRSA with methicillin and of VISA and VRSA with vancomycin. These changes highlight the ability of S. aureus to adapt to new antibiotic pressures. The review highlights the urgent need to develop innovative and sustainable antimicrobial strategies to control this growing threat. Understanding resistance mechanisms is crucial to developing more effective and personalized approaches for the treatment of infections caused by this germ.

RESUMEN Introducción: S. aureus ha emergido como una amenaza persistente, demostrando una notable habilidad para desarrollar resistencia a lo largo de la evolución de los antibióticos. Desde los primeros enfrentamientos con la penicilina hasta los desafíos actuales con cepas resistentes a la vancomicina y la daptomicina, el estudio de los mecanismos de resistencia de este patógeno ha adquirido una importancia crítica. Objetivos: documentar los cambios en los patrones de resistencia de S. aureus a lo largo del tiempo, además de identificar las etapas críticas en el desarrollo de la resistencia a diferentes antibióticos. Materiales y métodos: el proceso de selección de artículos revisados se llevó a cabo identificando artículos publicados entre 2010 y 2023. Se utilizaron varias bases de datos relevantes, incluyendo PubMed, Scopus, Embase, Cochrane Library y Scielo. Se incluyeron estudios observacionales, artículos de revisión y guías clínicas. Se desarrollaron estrategias de búsqueda específicas para cada base de datos utilizando palabras clave y términos de búsqueda relacionados con S. aureus y su resistencia antimicrobiana, así como los tipos de estudios de interés. Se extrajeron datos relevantes de los estudios seleccionados, incluyendo información sobre los patrones de resistencia, mecanismos de resistencia, impacto clínico y estrategias terapéuticas. Los datos recopilados se analizaron y sintetizaron para documentar los cambios en los patrones de resistencia de S. aureus a lo largo del tiempo y para identificar las etapas críticas en el desarrollo de la resistencia a diferentes antibióticos. Resultados: se incluyeron 100 artículos donde se evidencia una evolución temporal de la resistencia, desde las primeras cepas resistentes a la penicilina hasta las actuales cepas resistentes a la vancomicina y la daptomicina. Estos estudios proporcionaron un análisis detallado de los mecanismos moleculares clave que impulsan la resistencia antimicrobiana, tales como la producción de beta-lactamasas, las alteraciones en las proteínas de unión a penicilina y las modificaciones en la membrana celular. Los hallazgos destacan una evolución significativa en la capacidad de S. aureus para adaptarse a diferentes antibióticos a lo largo del tiempo, subrayando la complejidad y la diversidad de los mecanismos de resistencia desarrollados por esta bacteria. Conclusiones: la evolución de la resistencia de S. aureus ha seguido un patrón marcado por etapas críticas, desde la aparición de cepas productoras de penicilinasa tras la introducción de la penicilina, hasta el surgimiento de MRSA con la meticilina y de VISA y VRSA con la vancomicina. Estos cambios destacan la capacidad de adaptación de S. aureus a nuevas presiones antibióticas. La revisión subraya la necesidad urgente de desarrollar estrategias antimicrobianas innovadoras y sostenibles para controlar esta creciente amenaza. Comprender los mecanismos de resistencia es crucial para desarrollar enfoques más efectivos y personalizados en el tratamiento de las infecciones por este germen.

Abstract Fire is an important component of ecosystems, however, for many years it was perceived as a threat and an attempt was made to exclude it, affecting the process of ecological succession, and increasing the fuel load. One of the most used strategies to restore the fire regime is prescribed burning, nonetheless the consequences on the different components of the ecosystem are still not clearly known. For this reason, in the present work the effect of a prescribed burn on the biodiversity of beetle morphospecies in a Pinus montezumae forest was evaluated, through the collection of insects in traps baited with frontalin. Statistically, significant differences were found in the morphospecies biodiversity index of the area with prescribed burning and the surrounding area to which the fire was not applied. More specimens were collected in the burned area, mainly representatives of the families Bruchidae and Curculionidae (specifically Scolytinae). In the site without prescribed burning, only 18 families of Coleoptera were present out of the 21 that were registered in the burned area, however, the Non-metric Multidimensional Scaling (NMDS) analysis showed that the composition of both communities was similar.

Resumen El fuego es un componente importante de los ecosistemas, sin embargo, durante muchos años se percibió como una amenaza y se intentó excluir, afectando el proceso de sucesión ecológica y aumentando la carga de combustibles. Una de las estrategias más utilizadas para restaurar el régimen del fuego son las quemas prescritas, pero aún no se conocen claramente las consecuencias en los distintos componentes del ecosistema. Es por esto, que en el presente trabajo se evaluó el efecto de una quema prescrita sobre la biodiversidad de morfoespecies de coleópteros en un bosque de Pinus montezumae, a través de la recolecta de insectos en trampas cebadas con frontalina. Se encontraron diferencias estadísticamente significativas en el índice de biodiversidad de morfoespecies del área con quema prescrita y el área aledaña a la que no se le aplicó el fuego. Se recolectaron más especímenes en el área con quema, sobre todo representantes de las familias Bruchidae y Curculionidae (específicamente Scolytinae). En el sitio sin quema prescrita se presentaron solo 18 familias de Coleoptera de las 21 que se registraron en el área quemada, sin embargo, el análisis de Escalamiento Multidimensional No-métrico (NMDS) mostró que la composición de ambas comunidades fue semejante.

Resumen: Antecedentes: El Parque Nacional El Chico (PNC), una de las primeras áreas naturales protegidas (ANP) en México, es relevante por los servicios ambientales y biodiversidad que alberga, por lo que es necesario conocer su flora. Preguntas: ¿Cuál es la riqueza y distribución de licopodios y helechos en los diferentes tipos de vegetación del PNC? ¿Cómo es la diversidad beta, en ambos grupos de plantas en el PNC, con respecto a otras ANP del estado de Hidalgo? Especies de estudio: Helechos y licopodios Sitio y años de estudio: Parque Nacional El Chico, 2008-2009, 2022 Métodos: Se recolectaron ejemplares en 18 localidades y siete tipos de vegetación y se determinaron a nivel de especie. Se estimó diversidad taxonómica, semejanza en composición de especies, diversidad beta y complementariedad, con técnicas estándar. Resultados: Se recolectaron 205 ejemplares que representan 63 especies de helechos y cinco de licopodios. Las familias representativas fueron Aspleniaceae, Dryopteridaceae, Polypodiaceae, Pteridaceae y Selaginellaceae (> 5 especies cada una). La riqueza fue alta en los bosques de Abies-Quercus, galería, Quercus y Abies (> 22 especies en cada uno). El número de especies por unidad de área fue elevado, comparado con otras ANP y regiones aledañas; la complementariedad fue alta con respecto a las dos ANP de mayor extensión territorial en Hidalgo. Conclusiones: El PNC alberga 60.2 % de las especies de licopodios y helechos de la cuenca de México, y presenta alta diversidad taxonómica y complementariedad, comparado con otras ANPs de la entidad, lo cual resalta su importancia como reservorio de biodiversidad.

Abstract Background: El Chico National Park (PNC), one of the first protected natural areas (ANP) in Mexico, is relevant for the environmental services and biodiversity it houses, so it is necessary to know its flora. Questions: What is the richness and distribution of lycophytes and ferns in the different types of vegetation in the PNC? How is the beta diversity, in both groups of plants in the PNC with respect to other ANP in Hidalgo State? Studied species: Ferns and lycophytes Study site and dates: El Chico National Park, 2008-2009, 2022. Methods: Specimens were collected in 18 localities and seven vegetation types, and determined to the species level. Taxonomic diversity, similarity in species composition, beta diversity and complementarity were estimated using standard techniques. Results: 205 specimens were collected, and 63 species of ferns and five of lycophytes were determined. The representative families were Aspleniaceae, Dryopteridaceae, Polypodiaceae, Pteridaceae, and Selaginellaceae (> 5 species each). Richness was high in Abies-Quercus, Gallery, Quercus, and Abies forests (> 22 species in each). The number of species per area unit was high, compared to other ANP and neighboring regions; the complementarity was high with respect to the two ANPs with the largest territorial extension in Hidalgo. Conclusions: The PNC is home to 60.2 % of the species of lycophytes and ferns in the Basin of Mexico, and presents high taxonomic diversity and complementarity, compared to other ANPs in the entity, which highlights its importance as a biodiversity reservoir.

Resumen Se evaluó el impacto de varios plaguicidas sobre la diversidad de la artropofauna asociada al cultivo de papa comercial, en Mollepata, provincia de Anta en Cusco-Perú, para determinar que gremios tróficos (GT) de la artropofauna son afectados. Los tratamientos fueron fipronil, propineb y convencional (rotación de varios plaguicidas). Se dispusieron 35 trampas de caída en cada tratamiento con la finalidad de recolectar la artropofauna presente en el cultivo de papa. Fueron realizadas cinco aplicaciones del tratamiento correspondiente y se efectuó un total de cinco revisiones con una frecuencia de catorce días entre ellas. Las familias más abundantes fueron Hemiptera: Cicadellidae (19,82 %), Coleoptera: Chrysomelidae (16,33 %) y Diptera: Sciaridae (11,92 %). El propineb fue el tratamiento que presentó, a nivel de familia, el mayor número total de individuos. Para todo el estudio, a nivel de GT la secuencia decreciente del total de familias fue: fitófago con 30 familias (32,97 %); depredadores 23 familias (26,37 %); detritívoros 20 familias (21,98 %); parasitoides 10 familias (9,89 %); polinizadores seis familias (6,59 %) y omnívoro dos familias (2,20 %). El propineb presentó los valores del número total de individuos más altos en los fitófagos y los parasitoides. Por otro lado, los índices de diversidad alfa no presentaron diferencias entre tratamientos para los gremios omnívoros, detritívoros, polinizadores y depredadores. Los índices de diversidad beta fueron variables, obteniendo en general una mayor similaridad entre el tratamiento de fipronil y el convencional. Los GT fitófagos y parasitoides fueron los que presentaron los valores más diferenciados al evaluar el efecto de los plaguicidas en la artropofauna del suelo con base a los índices de diversidad alfa.

Abstract The impact of several pesticides on the diversity of arthropofauna associated with commercial potato cultivation was evaluated in Mollepata, province of Anta in Cusco-Peru, to determine which trophic guilds (TG) are affected. The treatments were fipronil, propineb and conventional (rotation of several pesticides). Thirty-five pitfall traps were placed in each treatment with the purpose of collecting the arthropofauna in potatoes. Five applications of the corresponding treatment were carried out and a total of five check-ups were carried out with a frequency of fourteen days. The most abundant families were Hemiptera: Cicadellidae (19.82%), Coleoptera: Chrysomelidae (16.33%) and Diptera: Sciaridae (11.92%). Propineb was the treatment that presented, at the family level, the largest total number of individuals. For the entire study, at the level of TG, the decreasing sequence of the total number of families was: phytophagous with 30 families (32.97%); predators 23 families (26.37%); detritivores 20 families (21.98%); parasitoids 10 families (9.89%); pollinators six families (6.59%) and finally omnivorous with two families (2.20%). Propineb presented the highest values of the total number of individuals in phytophages and parasitoids. On the other hand, alpha diversity indices did not present differences between treatments for omnivores, detritivores, pollinators and predators. The beta diversity indices were variable, generally obtaining greater similarity between the fipronil and conventional treatment. The phytophagous and parasitoid TGs were those that presented the most differentiated values when evaluating the effect of pesticides on soil arthropofauna based on alpha diversity indices.