Abstract The blood bacterial microbiota of the Texas tortoise (Gopherus berlandieri) in Tamaulipas, Mexico, was characterized by next-generation sequencing. In 2019, blood was collected from 6 free-living tortoises. DNA was extracted, the V3-V4 region of the 16S rRNA gene was amplified, and Illumina sequencing was performed. The results showed 9 phyla, 20 classes, 42 orders, 81 families, 176 genera and 299 bacterial species. Firmicutes was the most abundant phylum in the blood of G. berlandieri; this taxon has been recorded as predominant in the intestine, excrement, nasal exudates and saliva of other species of the genus Gopherus. The dominant bacterial genera were Caldalkalibacillus, Anaerobacillus, Nesterenkonia and Bacillus. These taxa have been recorded in alkaline and halophilic soils, such as those found in G. berlandieri burrows. All of these bacterial taxa can enter the bloodstream of G. berlandieri via intestinal, oral and nasal translocation. Likewise, 3 bacterial taxa (Coxiella sp., Ehrlichia sp. and Anaplasma phagocytophilum) that are transmitted by arthropod vectors, as well as the potentially pathogenic Salmonella enterica were recorded. This information is the first bacteriological reference for the blood of G. berlandieri, and is expected to be useful for health and conservation programs.
Resumen La microbiota bacteriana sanguínea de la tortuga texana (Gopherus berlandieri) en Tamaulipas, México, fue caracterizada mediante secuenciación de siguiente generación. En 2019 se colectó sangre de 6 tortugas silvestres. Se extrajo el DNA, se amplificó la región V3-V4 del gen 16S rRNA y se realizó secuenciación con Illumina. Los resultados mostraron 9 phyla, 20 clases, 42 órdenes, 81 familias, 176 géneros y 299 especies bacterianas. Firmicutes fue el phylum más abundante en la sangre de G. berlandieri; este taxón ha sido registrado como predominante en intestino, excremento, exudados nasales y saliva de otras especies de Gopherus. Los géneros bacterianos dominantes fueron Caldalkalibacillus, Anaerobacillus, Nesterenkonia y Bacillus. Estos taxa se encuentran en suelos alcalinos y halófilos como los que se presentan en las madrigueras de G. berlandieri. Todos estos taxa bacterianos podrían ingresar al torrente sanguíneo vía translocación intestinal, oral y nasal. En la sangre de esta tortuga se registraron 3 taxa (Coxiella sp., Ehrlichia sp. y Anaplasma phagocytophilum) que se trasmiten por artrópodos y el patógeno potencial Salmonella enterica. Esta información es una primera referencia bacteriológica de la sangre de G. berlandieri y se espera que sea de utilidad en programas de salud y conservación.