Resumen El objetivo de este estudio fue comparar el desempeño de dos sistemas MALDI-TOF MS en la identificación de bacterias anaerobias estrictas de interés clínico. La secuenciación del gen 16S ARNr fue el método de referencia utilizado cuando se observaron discrepancias o inconsistencias entre plataformas. Se recuperaron 333 aislados de muestras clínicas de diferentes centros de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires entre 2016 y 2021. Los aislados se identificaron por duplicado mediante dos sistemas MALDI-TOF MS: el BD Bruker Biotyper (Bruker Daltonics, Bremen, Alemania) y el Vitek MS (bioMèrieux, Marcy-l'Etoile, Francia). A través del sistema Vitek MS, los mismos fueron identificados a nivel de especie o complejo de especies en un 65,5% (n: 218) y de género en un 71,2% (n: 237), mientras que no se identificaron en un 29,4% (n: 98) y fue incorrecta en el 5,1% (n: 17). Mediante el sistema Bruker Biotyper, dichos valores fueron del 85,3% (n: 284), del 89,7% (n: 299), del 14,1% (n: 47) y del 0,6% (n: 2), respectivamente. La diferencia entre ambos métodos fue estadísticamente significativa (p<0,0001). En conclusión, los sistemas MALDI-TOF MS aceleran la identificación microbiana. Son especialmente útiles para los microorganismos de crecimiento lento, como las bacterias anaerobias, que son difíciles de identificar con los métodos tradicionales. El sistema Bruker demostró ser más preciso que el Vitek MS. Para que estos métodos sean realmente efectivos es fundamental actualizar las bases de datos de ambos sistemas e incrementar el número de espectros de referencia dentro de las plataformas.

Abstract The aim of this study was to compare the performance of two MALDI-TOF MS systems in the identification of clinically relevant strict anaerobic bacteria. The 16S rRNA gene sequencing was the gold standard method when discrepancies or inconsistencies were observed between platforms. A total of 333 isolates were recovered from clinical samples of different centers in Buenos Aires City between 2016 and 2021. The isolates were identified in duplicate using two MALDI-TOF MS systems, BD Bruker Biotyper (Bruker Daltonics, Bremen, Germany) and Vitek MS (bioMèrieux, Marcy-l’Etoile, France). Using the Vitek MS system, the identification of anaerobic isolates yielded the following percentages: 65.5% (n: 218) at the species or species-complex level, 71.2% (n: 237) at the genus level, 29.4% (n: 98) with no identification and 5.1% (n: 17) with misidentification. Using the Bruker Biotyper system, the identification rates were as follows: 85.3% (n: 284) at the species or species-complex level, 89.7% (n: 299) at the genus level, 14.1% (n: 47) with no identification and 0.6% (n: 2) with misidentification. Differences in the performance of both methods were statistically significant (p-values <0.0001). In conclusion, MALDI-TOF MS systems speed up microbial identification and are particularly effective for slow-growing microorganisms, such as anaerobic bacteria, which are difficult to identify by traditional methods. In this study, the Bruker system showed greater accuracy than the Vitek system. In order to be truly effective, it is essential to update the databases of both systems by increasing the number of each main spectrum profile within the platforms.

Resumo A cultura sanguínea de rotina é usada para a detecção de infecções na corrente sanguínea por bactérias aeróbias e anaeróbias e por leveduras patogênicas comuns. Estudo retrospectivo realizado em hospital público de Maceió-AL, por meio da coleta de dados de todos os prontuários com culturas sanguíneas positivas. Das 2.107 culturas sanguíneas realizadas, 17% foram positivas com Staphylococcus coagulase negativo (51,14%), seguido por Staphylococcus aureus (11,21%) e Klebsiella pneumoniae (6,32%). As bactérias Gram-positiva predominaram entre as culturas de sangue positivas, destacando-se o grupo das Staphylococcus coagulase-negativo. Enquanto as bactérias Gram-negativas apresentaram um número maior de espécies entre as culturas de sangue positivas.

Abstract Routine blood culture is used for the detection of bloodstream infections by aerobic and anaerobic bacteria and by common pathogenic yeasts. A retrospective study was conducted in a public hospital in Maceió-AL, by collecting data of all medical records with positive blood cultures. Out of the 2,107 blood cultures performed, 17% were positive with Staphylococcus coagulase negative (51.14%), followed by Staphylococcus aureus (11.21%) and Klebsiella pneumoniae (6.32%). Gram-positive bacteria predominated among positive blood cultures, highlighting the group of Staphylococcus coagulase-negative. While Gram-negative bacteria had a higher number of species among positive blood cultures.

RESUMEN Se presenta el caso de un paciente joven inmunocompetente, con antecedente de tuberculosis pulmonar, que acude al hospital por un cuadro clínico subagudo de fiebre persistente, baja de peso, disnea y abolición del murmullo vesicular. La tomografía de tórax mostró un extenso empiema en hemitórax izquierdo. Se le toman muestras para detección de gérmenes comunes y se le colocan un tubo de drenaje torácico y se inicia antibioticoterapia. La prueba de MALDI-TOF MS identificó a Parvimonas micra, una bacteria anaerobia, comensal de la flora oral, asociado a periodontitis severa, escasamente reportado en empiema pleural, especialmente, en personas inmunocompetentes. En la evaluación odontológica se realizó el diagnóstico de gingivitis y pericoronaritis de la tercera molar. El paciente evolucionó favorablemente. Se sugiere que, en casos de empiemas pleurales subagudos o crónicos, se debe considerar, además de las micobacterias, como agente etiológico al Parvimonas micra, y optar por exámenes como MALDI-TOF MS o secuenciamiento del 16S rRNA, colocación de tubo de tórax, cobertura antibiótica empírica y evaluación odontológica.

ABSTRACT We present the case of a young immunocompetent patient, with a history of pulmonary tuberculosis, who attended the hospital with a subacute clinical picture of persistent fever, weight loss, dyspnea and abolition of vesicular murmur. Chest CT scan showed an extensive empyema in the left hemithorax. Samples were taken for detection of common germs. Then, a chest drainage tube was placed and antibiotic therapy started. The MALDI-TOF MS test identified Parvimonas micra, an anaerobic bacterium, commensal to the oral flora, associated with severe periodontitis, but rarely reported in cases of pleural empyema, especially in immunocompetent patients. Gingivitis and pericoronaritis of the third molar were diagnosed during oral evaluation. The patient progressed favorably. Parvimonas micra should be considered as a possible etiological agent in cases of subacute or chronic pleural empyema, in addition to mycobacteria. Tests such as MALDI-TOF MS or 16S rRNA sequencing, chest tube placement, empirical antibiotic coverage and an adequate oral evaluation should be considered in these cases.

Abstract This case series included a tomographic, microbiological, and histopathological description of 15 secondary apical periodontitis (SAP) lesions obtained by apical microsurgery performed in 10 patients to better understand the etiology and pathogenesis of SAP. Preoperative tomographic analyses were performed through Cone beam computerized tomography - Periapical index (CBCT-PAI), and apical microsurgeries were then carried out. The removed apices were used for microbial culturing and for molecular identification using PCR for the detection of 5 strict anaerobic bacteria (P. gingivalis, P. intermedia, P. nigrescens, T. forsythia, and T.denticola) and 3 viruses Herpes simplex viruses (HSV), Cytomegalovirus (CMG) and Epstein-Barr Virus (EBV) by nested PCR. The removed apical lesions were histologically described. Univariate statistical analyses were performed by using STATA MP/16 (StataCorp LLC, College Station, TX, United States). CBCT-PAI analyses revealed PAI 4 and PAI 5 score lesions that involved cortical plate destruction. Eight SAPs were positive by culture, while nine SAP lesions were positive by PCR. Fusobacterium species were the most frequently cultured organisms in 7 SAP lesions, followed by D. pneumosintes in 3. In contrast, by single PCR, T. forsythia and P. nigrescens were detected in 5 lesions, T. denticola in 4 lesions, and P. gingivalis in 2 lesions. Twelve periapical lesions were granulomas, and the remaining three SAP lesions were radicular cysts. In conclusion, this case series study revealed that secondary apical lesions presented tomographic involvement of PAI 3 to 5, and that most SAP lesions were apical granulomas containing anaerobic and facultative microorganisms. microbiological 1 (SAP CBCTPAI, CBCTPAI CBCT , (CBCT-PAI) out P (P intermedia T T.denticola Tdenticola HSV, HSV (HSV) CMG (CMG EpsteinBarr Epstein Barr EBV (EBV described MP16 MP 16 MP/1 StataCorp LLC Station TX States. States . States) destruction culture D contrast cysts conclusion microorganisms (CBCT-PAI (HSV MP1 MP/

Resumo Esta série de casos incluiu uma descrição tomográfica, microbiológica e histopatológica de 15 lesões de periodontite apical secundária (SAP) obtidas por microcirurgia apical realizada em 10 pacientes para melhor compreender a etiologia e patogénese do SAP. As análises tomográficas pré-operatórias foram realizadas através de tomografia computadorizada de feixe cônico - índice Periapical (CBCT-PAI), e as microcirurgias apicais foram então realizadas. Os ápices removidos foram utilizados para a cultura microbiana e também para a identificação molecular por PCR para a detecção de 5 bactérias anaeróbias rigorosas (P. gingivalis, P. intermedia, P. nigrescens, T. forsythia, e T.denticola) e 3 vírus Herpes simplex (HSV), Cytomegalovirus (CMG) e Epstein-Barr Virus (EBV) por PCR aninhada. As lesões apicais removidas foram descritas histologicamente. Foram realizadas análises estatísticas univariadas utilizando STATA MP/16 (StataCorp LLC, College Station, TX, Estados Unidos da América). As análises CBCT-PAI revelaram lesões PAI 4 e PAI 5 que envolveram a destruição da placa cortical. Oito SAPs foram positivos por cultura, enquanto nove lesões de SAP foram positivas por PCR. As espécies de Fusobacterium foram os organismos mais frequentemente cultivados em 7 lesões SAP, seguidas por D. pneumosintes em 3. Em contraste, por PCR simples, T. forsythia e P. nigrescens foram detectados em 5 lesões, T. denticola em 4 lesões, e P. gingivalis em 2 lesões. Doze lesões periapicais foram granulomas, e as restantes três lesões SAP foram cistos. Em conclusão, este estudo de série de casos revelou que as lesões apicais secundárias apresentavam envolvimento tomográfico de PAI 3 a 5, e que a maioria das lesões de SAP eram granulomas apicais contendo microrganismos anaeróbios e facultativos. tomográfica 1 (SAP préoperatórias pré operatórias CBCTPAI, CBCTPAI CBCT , (CBCT-PAI) P (P intermedia T T.denticola Tdenticola HSV, HSV (HSV) CMG (CMG EpsteinBarr Epstein Barr EBV (EBV aninhada histologicamente MP16 MP 16 MP/1 StataCorp LLC Station TX América. América . América) cortical D contraste simples cistos conclusão facultativos (CBCT-PAI (HSV MP1 MP/

ABSTRACT We present the case of a young immunocompetent patient, with a history of pulmonary tuberculosis, who attended the hospital with a subacute clinical picture of persistent fever, weight loss, dyspnea and abolition of vesicular murmur. Chest CT scan showed an extensive empyema in the left hemithorax. Samples were taken for detection of common germs. Then, a chest drainage tube was placed and antibiotic therapy started. The MALDI-TOF MS test identified Parvimonas micra, an anaerobic bacterium, commensal to the oral flora, associated with severe periodontitis, but rarely reported in cases of pleural empyema, especially in immunocompetent patients. Gingivitis and pericoronaritis of the third molar were diagnosed during oral evaluation. The patient progressed favorably. Parvimonas micra should be considered as a possible etiological agent in cases of subacute or chronic pleural empyema, in addition to mycobacteria. Tests such as MALDI-TOF MS or 16S rRNA sequencing, chest tube placement, empirical antibiotic coverage and an adequate oral evaluation should be considered in these cases.

RESUMEN Se presenta el caso de un paciente joven inmunocompetente, con antecedente de tuberculosis pulmonar, que acude al hospital por un cuadro clínico subagudo de fiebre persistente, baja de peso, disnea y abolición del murmullo vesicular. La tomografía de tórax mostró un extenso empiema en hemitórax izquierdo. Se le toman muestras para detección de gérmenes comunes y se le colocan un tubo de drenaje torácico y se inicia antibioticoterapia. La prueba de MALDI-TOF MS identificó a Parvimonas micra, una bacteria anaerobia, comensal de la flora oral, asociado a periodontitis severa, escasamente reportado en empiema pleural, especialmente, en personas inmunocompetentes. En la evaluación odontológica se realizó el diagnóstico de gingivitis y pericoronaritis de la tercera molar. El paciente evolucionó favorablemente. Se sugiere que, en casos de empiemas pleurales subagudos o crónicos, se debe considerar, además de las micobacterias, como agente etiológico al Parvimonas micra, y optar por exámenes como MALDI-TOF MS o secuenciamiento del 16S rRNA, colocación de tubo de tórax, cobertura antibiótica empírica y evaluación odontológica.

Resumo Introdução O emprego de biofilmes polimicrobianos, utilizando a saliva como inóculo, é um modelo promissor para o estudo de biofilmes cariogênicos in vitro. Entretanto, ainda não existe uma padronização para seleção de doadores de saliva. Objetivo O objetivo deste estudo foi estabelecer uma metodologia para seleção de doadores de saliva utilizando fatores salivares microbianos e características in vitro do biofilme. Material e método Para doação de saliva foram selecionados vinte voluntários. Os voluntários permaneceram 24 horas sem escovar os dentes e ficaram em jejum por 2 horas antes da coleta da saliva. Foram avaliados os seguintes parâmetros: viabilidade das bactérias anaeróbias totais e mutans streptococci; concentração inibitória mínima (CIM) e concentração bactericida mínima (CBM) da clorexidina; capacidade de formação de biofilme por meio da biomassa; e a suscetibilidade dos biofilmes à clorexidina. Resultado A viabilidade bacteriana da saliva, a capacidade de formação de biofilme e a suscetibilidade do biofilme à clorexidina foram apresentadas como média e intervalo de confiança (95%). A diferença entre a viabilidade do biofilme (mutans streptococci e bactérias totais) após tratamento com NaCl 0,9% e diacetato de clorexidina 0,2% foi comparada pelo teste t de Student com nível de significância estabelecido em 5%. A viabilidade total de bactérias anaeróbias (mediana) foi de 7,28 log 1+UFC/mL (unidades formadoras de colônia/mL). A viabilidade dos mutans streptococci na saliva apresentou mediana de 5,47 log 1+UFC/mL. Para capacidade de formação de biofilme a mediana da biomassa foi de 0,1172 A570. Conclusão O tratamento com clorexidina reduziu significativamente os mutans streptococci e a viabilidade total das bactérias. A metodologia para seleção do doador de saliva foi estabelecida com sucesso. polimicrobianos inóculo Entretanto parâmetros CIM (CIM CBM (CBM 95%. 95 95% . (95%) 09 0 9 0,9 02 0,2 5 5% (mediana 728 7 28 7,2 1UFCmL UFCmL 1 UFC mL unidades colônia/mL. colôniamL colônia/mL colônia colônia/mL) 547 47 5,4 01172 1172 0,117 A570 sucesso (95% 0, 72 7, 54 4 5, 0117 117 0,11 A57 (95 011 11 0,1 A5 (9 01 (

Abstract Introduction The utilization of polymicrobial biofilms, with saliva as an inoculum, represents a promising model for in vitro studies on cariogenic biofilms. However, there is still no standardization for selecting saliva donors. Objective The aim of this study is to establish a methodology for the selection of saliva donors using microbial salivary factors and in vitro biofilm characteristics. Material and method For saliva donation, twenty volunteers were selected. Volunteers remained 24 h without brushing their teeth and fasted for 2 h before saliva collection. The following parameters were evaluated: total anaerobic bacteria and mutans streptococci viability; minimum inhibitory concentration (MIC) and minimum bactericide concentration (MBC) of chlorhexidine; biofilm forming capacity by biomass assessment; and the susceptibility of biofilms to chlorhexidine. Result Saliva bacterial viability, biofilm forming capacity and biofilm susceptibility to chlorhexidine were presented as mean and confidence interval (95%). The difference between biofilm (mutans streptococci and Total bacteria) viability after treatment with NaCl 0.9% and 0.2% chlorhexidine diacetate was compared using the Student t-test with a significance level established at 5%. Total anaerobic bacteria viability (median) was 7.28 log 1+CFU/mL (colony forming units/ mL). Mutans streptococci viability in the saliva showed a median of 5.47 log 1+CFU/mL. Biofilm forming capacity showed that biomass had a median of 0.1172 A570. Conclusion Treatment with chlorhexidine significantly reduced mutans streptococci and total bacteria viability. The methodology for the selection of the saliva donor was successfully established. inoculum However characteristics donation selected collection evaluated MIC (MIC MBC (MBC assessment 95%. 95 95% . (95%) 09 0 9 0.9 02 0.2 ttest t test 5 5% (median 728 7 28 7.2 1CFUmL CFUmL 1 CFU mL colony units mL. mL) 547 47 5.4 01172 1172 0.117 A570 A (95% 0. 72 7. 54 4 5. 0117 117 0.11 A57 (95 011 11 0.1 A5 (9 01 (

ABSTRACT Introduction: Fournier’s gangrene is a polybacterial infection, usually caused by anaerobic and aerobic bacteria, characterized by scrotal and perineal necrotizing fasciitis. Its treatment is based on surgical intervention by excision of the necrotic area and early antibiotic therapy. There are several strategies to reconstruct the defect resulting from debridement, and it should be noted that tissue losses greater than 50% are usually reconstructed with flaps. Methods: Retrospective analysis of the series of cases of scrotal reconstruction after Fournier’s gangrene performed by the authors throughout 2020, totaling eight patients. Results: The most used flap was thigh fasciocutaneous flap, which presented a partial necrosis rate of 14.29%, without total necrosis. In one of the cases, it was possible to reconstruct a spongy urethra with gracilis muscle without fistulization, preventing the patient from undergoing a definitive urethrostomy. As for complications, the occurrence of minor complications that required simple revision procedures was common. The prevalence of 75% of diabetes mellitus in our series is highlighted, which may have negatively interfered with the healing process. Conclusion: Scrotal reconstruction with flaps is important to accelerate wound healing from Fournier gangrene debridement and to maintain the pouch aspect necessary for testicular thermoregulation. Our primary option was thigh fasciocutaneous flap, which proved to be safe. And minor complications were frequent in this series, without compromising the final result. Introduction Fourniers s infection bacteria fasciitis therapy 50 Methods 2020 patients Results 1429 14 29 14.29% fistulization urethrostomy common 75 highlighted process Conclusion thermoregulation safe result 5 202 142 1 2 14.29 7 20 14.2 14.

RESUMO Introdução: Gangrena de Fournier é uma infecção polibacteriana, geralmente causada por bactérias anaeróbias e aeróbias, sendo caracterizada por fasciite necrosante escrotal e perineal. Seu tratamento é embasado em intervenção cirúrgica com excisão da área necrótica e antibioticoterapia precoces. Diversas são as estratégias de reconstrução do defeito resultante do desbridamento, devendo ser salientado que perdas teciduais maiores do que 50% costumam ser reconstruídas com retalhos. Métodos: Análise retrospectiva da série de casos de reconstrução escrotal após gangrena de Fournier procedidos pelos autores ao longo de 2020, totalizando oito pacientes. Resultados: O retalho mais utilizado foi o fasciocutâneo de coxa, que apresentou taxa de necrose parcial de 14,29%, sem necrose total. Em um dos casos foi possível reconstruir uma uretra esponjosa com músculo grácil sem fistulização, evitando que o paciente fosse submetido a uma uretrostomia definitiva. Quanto às complicações, foi comum a ocorrência de intercorrências menores que necessitaram de procedimentos revisionais simples. Destaca-se a prevalência de 75% de diabetes mellitus em nossa casuística, o que pode ter interferido negativamente no processo cicatricial. Conclusão: A reconstrução escrotal com retalhos é importante para acelerar a cicatrização da ferida proveniente do desbridamento de gangrena de Fournier e para manter o aspecto de bolsa necessário para a termorregulação do testículo. Nossa opção primária foi o retalho fasciocutâneo de coxa, que se mostrou seguro. Pequenas intercorrências foram frequentes nesta série, sem comprometimento do resultado final. Introdução polibacteriana aeróbias perineal precoces 50 Métodos 2020 pacientes Resultados coxa 1429 14 29 14,29% total fistulização definitiva complicações simples Destacase Destaca 75 casuística cicatricial Conclusão testículo seguro final 5 202 142 1 2 14,29 7 20 14,2 14,

Abstract Desulfovibrio spp. are strict anaerobes that are ubiquitous in nature. They can reside in the human or animal gastrointestinal tract and, as they are also environmental bacteria, may be present in soil and water. They can persist asymptomatically in the intestine or behave as opportunistic pathogens associated with primary bacteremia and intraabdominal infections. Several Desulfovibrio spp. infections may be underestimated due to their slow growth rate and because many laboratories do not routinely perform anaerobic cultures. Simple tests such as motility detection on a fresh subculture, Gram stain to confirm cell morphology, presence of H2S in SIM agar and production of a red fluorescence in alkaline pH under UV light would be indicative of Desulfovibrio spp.

Resumen Desulfovibrio spp. son bacterias anaerobias estrictas, ubicuas en la naturaleza, quepueden formar parte del tracto gastrointestinal humano o animal, pero también son bacteriasambientales presentes en el suelo y en el agua. Pueden persistir de manera asintomática enel intestino o comportarse como patógenos oportunistas, asociados con bacteriemia primariae infecciones intraabdominales. El número de infecciones por Desulfovibrio spp. puede estarsubestimado debido a su lenta velocidad de crecimiento y a que muchos laboratorios no realizancultivos en anaerobiosis de manera rutinaria. Pruebas sencillas, como el examen de la movilidaden fresco y de la morfología celular en la coloración de Gram, sumadas a la presencia de SH2en agar SIM y a la observación de una fluorescencia roja a pH alcalino bajo luz UV, seríanindicativas de Desulfovibrio spp. Se describe el caso de una bacteriemia por Desulfovibriodesulfuricans en una mujer con cuadro clínico de sepsis abdominal por apendicitis gangrenosacon fallo multiorgánico.

Resumen Objetivos . Describir la actividad antimicrobiana in vitro del extracto metanólico de las hojas de Bixa orellana L. contra las bacterias anaerobias asociadas a la vaginosis bacteriana y Lactobacillus spp. Materiales y métodos . Se incluyeron en el estudio ocho cepas de referencia ATCC; Gardnerella vaginalis, Prevotella bivia, Peptococcus niger, Peptostreptococcus anaerobius, Mobiluncus curtisii, Atopobium vaginae, Veillonella parvula y Lactobacillus crispatus, y 22 aislamientos clínicos; once aislados de Gardnerella vaginalis y once aislados de Lactobacillus. La susceptibilidad antimicrobiana se determinó mediante el método de difusión en agar. La concentración mínima inhibitoria (CMI) y la concentración bactericida mínima (CBM) fueron determinadas utilizando el método de dilución en agar y un método de dilución modificado, respectivamente. Resultados . Todas las cepas de referencia ATCC tuvieron un alto nivel de susceptibilidad al extracto, con excepción de P. vibia, V. parvula y L. crispatus. Interesantemente, los aislamientos clínicos de G. vaginalis y la cepa ATCC de G. vaginalis fueron los más susceptibles al extracto dados los bajos valores de CMI (1,0 - 2,0 mg/mL) y CBM (1,0 - 4,0 mg/mL), mientras que, los aislamientos clínicos de Lactobacillus spp. y la cepa ATCC de L. crispatus fueron los menos susceptibles debido a los altos valores de CMI (32,0 mg/mL) y CBM (≥ 32,0 mg/mL). Conclusiones . Los experimentos in vitro sugieren que el extracto posee propiedades antibacterianas selectivas dada su alta actividad contra bacterias anaerobias asociadas a vaginosis bacteriana y baja actividad contra especies de Lactobacillus.

ABSTRACT Objective. To describe the in vitro antimicrobial activity of the methanolic extract of Bixa orellana L. leaves against anaerobic bacteria associated to bacterial vaginosis and Lactobacillus spp. Materials and methods. Eight ATCC reference strains; Gardnerella vaginalis, Prevotella bivia, Peptococcus niger, Peptostreptococcus anaerobius, Mobiluncus curtisii, Atopobium vaginae, Veillonella parvula, and Lactobacillus crispatus, and twenty-two clinical isolates; eleven Gardnerella vaginalis and eleven Lactobacillus strains, were included in the study. The antimicrobial susceptibility was determined by the agar diffusion method. The minimum inhibitory concentration (MIC) and minimum bactericidal concentration (MBC) were determined by using agar dilution and a modified dilution plating method, respectively. Results. All ATCC reference strains showed high levels of susceptibility to the extract, except P. vibia, V. parvula and L. crispatus. Interestingly, all G. vaginalis clinical isolates and the G. vaginalis ATTC strain were the most susceptible to the extract, given their low MIC (1.0 - 2.0 mg/mL) and MBC (1.0 - 4.0 mg/mL) values, whereas, the Lactobacillus spp. clinical isolates and the L. crispatus ATCC strain were the least susceptible bacteria given their high MIC (32.0 mg/mL) and MBC (≥ 32.0 mg/mL) values. Conclusions. In vitro experiments suggest that the extract possesses selective antimicrobial properties given its high activity against bacterial vaginosis-associated anaerobic bacteria and low activity against Lactobacillus species.

Resumo Introdução: As infecções cervicais profundas constituem um grupo de doenças com graves complicações e mortalidade, que podem ocorrer como resultado de doenças comuns na comunidade e que têm opções de tratamento médico e cirúrgico. Objetivo: Detectar bactérias anaeróbias e comparar a eficácia do tratamento médico-cirúrgico em diferentes faixas etárias. Método: Foram sistematicamente registrados idade dos pacientes, sexo, queixas, achados do exame físico, queixas na hospitalização, histórico de uso de antibióticos, doenças adicionais, exames radiológicos e análise dos exames, tipo de tratamento, agentes antibióticos selecionados no tratamento, resultados de cultura bacteriana, duração da hospitalização, complicações e taxas de mortalidade. No estudo, culturas bacterianas anaeróbias, difíceis de obter rotineiramente, mesmo considerando-se condições especiais de transporte e meios, foram obtidas. Foram avaliados prospectivamente 74 pacientes internados no Departamento de Otorrinolaringologia da Universidade de Mersin, entre 01.07.2016 e 07.07.2017, devido a infecção cervical profunda. O estudo incluiu 37 pacientes do sexo feminino e 37 do masculino. A idade dos pacientes variou de 1 a 69 anos e a média foi de 31. Resultados: De acordo com a análise dos dados obtidos, houve uma relação estatisticamente significante entre os pacientes com doenças adicionais e as modalidades de tratamento dos pacientes (p = 0,017). A taxa de tratamento cirúrgico foi maior nesse grupo de pacientes. Em pacientes com histórico de uso de antibióticos, verificou-se que aqueles do grupo pediátrico permaneceram mais tempo hospitalizados em comparação aos adultos (p = 0,036). Nos pacientes adultos submetidos à cirurgia, verificou-se que o eixo longo absortivo era mais longo em mm do que nos pacientes que receberam tratamento médico isolado (p = 0,008). Conclusão: As infecções cervicais profundas constituem um grupo de doenças que são preocupantes na saúde pública, com sua mortalidade e morbidade. Garantir a segurança das vias aéreas dos pacientes deve ser a primeira intervenção. Os abscessos localizados lateralmente à cápsula tonsilar podem não apresentar drenagem sem a tonsilectomia.

Abstract Introductıon: Deep neck infections are a group of diseases with serious complications and mortality, which can occur as a result of common diseases in the community and which have surgical and medical treatment options. Objectives: Patients ages, genders, complaints, physical examination findings, hospitalization complaints, history of antibiotic use before the application, additional diseases, radiological tests and analysis of examinations, type of treatment method, antibiotic agents selected in treatment, bacterial culture results, duration of hospitalization, complications, mortality rates were systematically recorded. In the study, anaerobic bacterial factors, which are difficult to produce in routine, were produced by considering special transport conditions and culture media. Methods: A total of 74 patients who were hospitalized in the Department of Otorhinolaryngology, University of Mersin, between 01.07.2016 and 01.07.2017 for deep neck infection were evaluated prospectively. The study included 37 female and 37 male patients. The ages of the patients ranged from 1 to 69 and the mean age was 31 years. Results: According to the analysis of the obtained data, there was a statistically significant relationship between the patients with additional diseases and the treatment modalities of the patients (p = 0.017). The surgical treatment rate was increased in this group of patients. In patients with a history of antibiotic use, it was found that patients in the pediatric group were in hospital longer in terms of length of stay compared to adults (p = 0.036). In adult patients who underwent surgery, the absorptive long axis was found to be longer in mm than in patients receiving isolated medical treatment (p = 0.008). Conclusions: Deep neck infections is a disease group that seriously concerns public health, with significant mortality and morbidity. Ensuring airway safety of patients should be the first intervention. Abscesses located lateral to the tonsil capsule may not drain adequately without concomitant tonsillectomy.

ABSTRACT Viridans group streptococci (VGS) are a heterogeneous group of saprophytic facultative anaerobic bacteria that are part of the normal flora of the oral cavity. The increased resistance to multiple antibiotics in this group of bacteria becomes important in prolonged antibiotic therapies inpatient where these common microorganisms are replaced by multi-resistant bacteria. Objectives: To determine the percentage of VGS strains isolated from oral cavity resistant to antibiotics used in hospital infectious diseases. Material and methods: This is a descriptive cross-sectional study that included 60 hospitalized patients with a history of antibiotic therapy for more than 3 weeks. The samples were processed following standardized protocols for collection, isolation and identification of oral cavity VGS and a protocol of antibiotic susceptibility testing. The results are shown in tables and graphics of absolute and relative frequencies. Results: The main indication for antibiotic therapy was orofacial infection with a 28.33%. Penicillin was the antibiotic further used either in single, combined or multiple therapies in all patients. A total of 108 samples (1.8 per patient swabs) were collected. The predominantly identified specie was Streptococcus mutans. The 96.3% of all VGS strains were sensitive to all antibiotics included in the panel. Conclusion: Using different combinations and types of antibiotic therapy inpatient has no effect on the susceptibility of VGS isolated from oral cavity separate from treatment.

RESUMEN Los estreptococos del grupo viridans (EGV) son un grupo heterogéneo de bacterias saprófitas anaerobias facultativas que forman parte de la flora normal de cavidad oral. El incremento de la resistencia antibiótica de este grupo de bacterias cobra importancia en pacientes hospitalizados con terapia antibiótica prolongada, en los cuales estos microorganismos pueden ser sustituidos por bacterias multirresistentes. Objetivos: Determinar el porcentaje de cepas de EGV aisladas de cavidad oral resistentes a los antibióticos utilizados en el tratamiento de diversas patologías infecciosas hospitalarias. Material y Métodos: Estudio observacional descriptivo en el que se incluyeron 60 pacientes hospitalizados con historia de terapia antibiótica por más de 3 semanas. Las muestras se procesaron siguiendo protocolos estandarizados de recolección, aislamiento e identificación para EGV de cavidad oral y un protocolo de pruebas de sensibilidad antibiótica. Los resultados se muestran en tablas y gráficas de frecuencia. Resultados: La principal indicación para terapia antibiótica intrahospitalaria fue infección orofacial: 28,33%. La penicilina fue el antibiótico más utilizado ya sea en terapia única, combinada o múltiple en todos los pacientes. Se aislaron en total 108 cepas de EGV, con un promedio de 1,8 cepas por paciente. La especie predominantemente identificada fue S. mutans. El 96,3% de las cepas de EGV fue sensible a todos los antibióticos incluidos en el panel. Conclusiones: El uso de distintas combinaciones y modalidades de terapia antibiótica no tiene efecto en la susceptibilidad de EGV aislados de cavidad oral en pacientes hospitalizados, independiente de la duración del tratamiento.

Resumen La tricomicosis o tricobacteriosis palmelina es un motivo de consulta poco frecuente en los servicios de dermatología, es importante reconocerla y diferenciarla de otras patologías ya que puede ser difícil de diagnosticar. La tricomicosis o tricobacteriosis es una condición infecciosa superficial asintomática, rara, causada en la mayoría de los casos por Corynebacterium flavescens (también llamada Corynebacterium tenuis), perteneciente a la familia corinebacteriaceae, las cuales, son bacterias gram positivas, pleomórficas, inmóviles, no encapsuladas, aerobias o anaerobias facultativas. Afecta pelos de la región axilar, zona púbica, escrotal e interglutea; se debe al aumento de la población bacteriana de la microbiota normal, adherida a la cutícula del pelo. Esta afectación es propia de climas húmedos, afectando predominantemente a adultos jóvenes, de sexo masculino, deportistas y homosexuales en un entorno de pobreza y hacinamiento. El objetivo del presente reporte es comunicar un caso de tricomicosis palmelina flava en región púbica en un adulto joven y describir las características clínicas de esta patología relativamente poco conocida.

Abstract Trichomycosis or palmelin trichobacteriosis it is an infrequent reason for consultation in dermatology services, important to recognize and differentiate it from other pathologies since it can be difficult to diagnose. Trichomycosis or trichobacteriosis is a rare, asymptomatic superficial infectious condition, caused in most cases by Corynebacterium flavescens (also called Corynebacterium tenuis), belonging to the Corynebacteriaceae family, which are gram-positive, pleomorphic, immobile, non-encapsulated bacteria, aerobic or facultative anaerobic. It affects hairs in the axillary region, pubic, scrotal and intergluteal area; It is due to the increase in the bacterial population of the normal microbiota, attached to the hair cuticle. This affectation is typical of humid climates, predominantly affecting young adults, males, athletes and homosexuals in an environment of poverty and overcrowding. The objective of this article is to report a case of trichomycosis palmellina flava in the pubic region present in a young adult and to present the clinical characteristics of this relatively unrecognized condition.

RESUMO Doenças peri-implantares, causadas por bactérias de biofilme relacionadas a implantes dentários, são uma das principais causas de perda tardia de implantes. Nesse sentido, as doenças peri-implantares são divididas em mucosite peri-implantar, quando afeta apenas tecidos moles, e peri-implantite, quando há comprometimento ósseo, o que pode levar ao fracasso da terapia com implantes dentários. Assim, a remoção do biofilme é essencial para a saúde peri-implantar, permitindo sucesso a longo prazo na terapia com implantes. A fim de melhorar a visualização do biofilme oral, que geralmente é transparente ou incolor, agentes reveladores têm sido rotineiramente utilizados. No entanto, esses agentes têm potencial alergênico e podem causar manchas extrinsecamente em materiais restauradores e protéticos, levando a prejuízo estético. Assim, o uso da fluorescência tem sido estudado como alternativa para visualização do biofilme oral. Este relato descreve o uso da fluorescência óptica de campo amplo para visualização do biofilme oral associado a implantes e dentes em uma consulta de acompanhamento de rotina de uma paciente parcialmente edêntula com mucosite peri-implantar. Além disso, este relato evidenciou que a fluorescência óptica de campo amplo pode ser utilizada dentro da rotina clínica de atendimento de pacientes com implantes dentários. Nesse sentido, a fluorescência óptica de campo amplo permitiu a visualização fácil e imediata do biofilme oral maduro para sua remoção adequada, a avaliação da qualidade da restauração do selamento do orifício de acesso do parafuso do implante e a identificação de lesões cariogênicas, sem risco de reações alérgicas ou manchamento de próteses e restaurações.

ABSTRACT Peri-implant diseases, caused by bacteria from biofilm related to dental implants, are one of the main causes of late loss of implants. In this sense, peri-implant diseases are divided into peri-implant mucositis, when it affects only the soft tissues, and peri-implantitis, when there is a bone involvement, which can lead to the failure of dental implant therapy. Thus, biofilm removal is essential for peri-implant health, allowing long-term success in implant therapy. To improve the visualization of oral biofilm, which is usually transparent or colorless, disclosing agents have been routinely used. However, disclosing agents have allergenic potential and can cause staining extrinsically in restorative and prosthetic materials, leading to aesthetic impairment. Thus, the use of fluorescence has been studied as an alternative for visualization of oral biofilm. Therefore, this report describes the use of wide-field optical fluorescence for visualization of oral biofilm associated with implants and teeth, in a routine appointment and follow-up of a partially edentulous patient with peri-implant mucositis. In addition, this report showed wide-field optical fluorescence can be used in a clinical routine of care of patients with dental implants. In this sense, wide-field optical fluorescence allowed easy and immediate visualization of the mature oral biofilm for its adequate removal, evaluation of the quality of restoration to sealing of screw access-hole of implant and identification of cariogenic lesions, without risk of allergic reactions or staining of prostheses and restorations.

RESUMO Nos últimos anos há um interesse crescente no uso de diversos resíduos agroindustriais. No Brasil, as indústrias de alimentos acumulam uma enorme quantidade de resíduos, principalmente as de processamento de frutos cítricos.Entre as possibilidades de valorização destes resíduos, a digestão anaeróbia é uma alternativa promissora na geração de energia renovável e controle da poluição. Nesse sentido, esse estudo avaliou a digestão anaeróbia de água residuária citrícola, visando à produção biológica de hidrogênio a partir de três inóculos: (1) Clostridium Acetobutylicum ATCC 824,(2) Clostridium Beijerinckii ATCC 10132 e (3) consórcio anaeróbio obtido da água residuária citrícola. O experimento foi realizado em 51h, em triplicatas de reatores anaeróbios em batelada, alimentados com 2 fontes distintas de carbono: glicose (10,7 g DQO L-1) e água residuária citrícola (10,0 g DQO L-1), headspace preenchido com N2 (99,99%), pH inicial 7,0 e mantidos a 37°C, sob modo estático. Nos reatores alimentados com glicose foram verificados geração de hidrogênio apenas com os inóculos 1 e 2, que foram, respectivamente, de 36,8 mmol L-1 e 64,1 mmol L-1. Nos reatores operados com água residuária citrícola foram obtidos 21,2; 15,7 e; 37,6 mmol H2 L-1 com os inóculos 1; 2 e 3, respectivamente. Além disso, foram verificadas gerações expressivas de etanol para todos os inóculos testados nos reatores alimentados com glicose. Na caracterização do consórcio anaeróbio citrícola foi verificado predomínio de bacilos Gram + e quantificados os gêneros de bactérias anaeróbias geradoras de H2 (UFC mL-1): Clostridium sp. (3x105), Bacteroides sp. (4x105), Lactobacillus sp. (4x105), Streptococcus sp. (5x104), e Veillonella sp. (3x105), revelando diversidade elevada de bactérias anaeróbias produtoras de hidrogênio presentes na água residuária agroindustrial. Tais resultados ressaltam que a geração de hidrogênio pode ocorrer em vias metabólicas distintas com consequente favorecimento na geração de biocombustíveis como etanol ou butanol.

ABSTRACT In recent years there has been a growing interest in the use of various agro-industrial wastes. In Brazil, the food industries accumulate an enormous amount of waste, especially those that process citrus fruits. Among the possibilities for valuing these residues, anaerobic digestion is a promising alternative in the generation of renewable energy and pollution control. In this sense, this study evaluated the anaerobic digestion of citrus wastewater, aiming at the biological production of hydrogen from three inocula: (1) Clostridium Acetobutylicum ATCC 824, (2) Clostridium Beijerinckii ATCC 10132 and (3) anaerobic consortium obtained from citrus wastewater. The experiment was carried out in 51h, in triplicates of anaerobic batch reactors, fed with 2 different carbon sources: glucose (10.7 g COD L-1) and citrus wastewater (10.0 g COD L-1), headspace filled with N2 (99.99%), initial pH 7.0 and maintained at 37 ° C, under static mode. In the reactors fed with glucose, hydrogen generation was verified only with the inocula 1 and 2, which were, respectively, 36.8 mmol L-1 and 64.1 mmol L-1. In the reactors operated with citrus wastewater, were obtained 21.2; 15.7 e; 37.6 mmol H2 L-1 with inocula 1; 2 and 3, respectively. In addition, expressive generations of ethanol were verified for all inocula tested in the reactors fed with glucose. In the characterization of the citrus anaerobic consortium, a predominance of Gram + bacilli was verified and the genera of anaerobic H2-generating bacteria (UFC mL-1) were quantified: Clostridium sp. (3x105), Bacteroides sp. (4x105), Lactobacillus sp. (4x105), Streptococcus sp. (5x104), and Veillonella sp. (3x105), revealing a high diversity of anaerobic hydrogen-producing bacteria present in agro-industrial wastewater. Such results emphasize that the generation of hydrogen can occur in different metabolic pathways with consequent favor in the generation of biofuels such as ethanol or butanol.

RESUMO A produção de biodiesel tem crescido e ganhado destaque no cenário energético mundial. Com isso, seu principal coproduto, o glicerol bruto (GB), tem acompanhado esse aumento, ocasionando a formação de grandes estoques deste resíduo. Uma alternativa promissora para a sua redução consiste na utilização por processos biológicos anaeróbios visando à produção de biogás, tanto hidrogênio (H2) quanto metano (CH4). Sabe-se que a eficiência dessa bioconversão aumenta por meio da codigestão com outros resíduos orgânicos. Assim, o objetivo deste estudo consistiu na codigestão do GB, proveniente da produção de biodiesel a partir de óleos residuais domésticos, com vinhaça citrícola (VC), em dois estágios sequenciais. No 1º estágio (Ensaio 1), o reator anaeróbio foi operado em batelada, alimentado com 5 g DQO L-1 GB e 5 g DQO L-1 VC, na presença de cultura mista pertencente ao gênero Clostridium sp., a 37 °C, pH 5,5, headspace com N2, gerando 4,48 mmol H2 L-1 em 112 h de experimento, sendo consumidos 93,19 % de GB e 74,00 % de glicose. Um ensaio controle (Controle 1) foi montado com apenas 5 g DQO L-1 GB, não sendo verificada produção de H2. O efluente gerado no Ensaio 1 (200 mL) foi usado como substrato no 2º estágio (Ensaio 2) por um inóculo in natura identificado por consórcio de bactérias anaeróbias fermentativas e archaeas metanogênicas, no reator anaeróbio metanogênico (500 mL), headspace com N2, pH 7,0, a 37 °C, gerando 229,08 mmol CH4 L-1 em 624 h de operação. Além disso, 87,34 % da DQO e 93,75 % do metanol proveniente do GB foram consumidos. O efluente gerado pelo Controle 1 produziu apenas 40,58 mmol CH4 L-1 (Controle 2). Dessa forma, constatou-se que a codigestão elevou a geração de biogás, com consumos de resíduos orgânicos e tóxicos presentes no GB por meio dos sistemas integrados.

ABSTRACT The biodiesel production has grown and it gained prominence in the global energy scenario. As a result, its main co-product, crude glycerol (CG), has accompanied this increase, causing the formation of large stocks of this residue. A promising alternative for its reduction is the use by anaerobic biological processes aiming at the biogas production, as hydrogen (H2) as methane (CH4). It is known that the efficiency of this bioconversion increases through co-digestion with other organic waste. Thus, the objective of this study consisted in the co-digestion of CG, from the biodiesel production through waste cooking oils, with citrus vinasse (CV), in two sequential stages. In the 1st stage (Assay 1), the anaerobic reactor was operated in batch, fed with 5 g COD L-1 CG and 5 g COD L-1 CV, in the presence of a mixed culture belonging to the genus Clostridium sp., at 37 °C, pH 5.5, headspace with N2, generating 4.48 mmol H2 L-1 in 112 h of experiment, being consumed 93.19 % of CG and 74.00 % of glucose. A control assay (Control 1) was assembled with only 5 g COD L-1 CG, without H2 production. The effluent generated in Assay 1 (200 mL) was used as a substrate in the 2nd stage (Assay 2) by an inoculum in natura identified by a consortium of anaerobic bacteria and methanogenic archaea, in the anaerobic methanogenic reactor (500 mL), headspace with N2, pH 7.0, at 37 °C, generating 229.08 mmol CH4 L-1 in 624 h of operation. In addition, 87.34 % of COD and 93.75 % of methanol from CG were consumed. The effluent generated by Control 1 produced only 40.58 mmol CH4 L-1 (Control 2). Thus, it was found that co-digestion increased the biogas generation, with consumption of organic and toxic waste present in CG through integrated systems.