Resumen Introducción Hasta la fecha, solo unos pocos estudios han reportado la correlación entre el polimorfismo A/G del gen de la proteína de membrana asociada a vesículas-8 (VAMP-8, por sus siglas en inglés) y el infarto agudo de miocardio. Si bien, en teoría, VAMP-8 juega un papel fundamental en la patogénesis del infarto agudo de miocardio a través de la activación, secreción y agregación plaquetaria. Objetivo Investigar la relación entre el polimorfismo A/G del gen VAMP-8 y el riesgo de infarto agudo de miocardio. Métodos: Se llevó a cabo un estudio transversal en Siful Anwar General Hospital entre junio del 2013 y mayo del 2014. Se utilizó la técnica de polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción con la enzima Mae II para genotipificar los polimorfismos A/G del gen VAMP-8 en grupos de infarto agudo de miocardio y de control. Se aplicó una prueba de regresión logística múltiple para analizar la relación entre el polimorfismo A/G del gen VAMP-8 y el riesgo de infarto agudo de miocardio. Resultados Se incluyeron un total de 35 controles y 97 pacientes con infarto agudo de miocardio de nuestro Hospital durante el periodo del estudio. Nuestros resultados encontraron que el polimorfismo A/G del gen VAMP-8 no estaba relacionado con el riesgo de infarto agudo de miocardio. Por otra parte, tampoco pudimos establecer una relación entre el polimorfismo A/G del gen VAMP-8 y tanto tabaquismo como hipertensión en pacientes con infarto agudo de miocardio. Asimismo, en el contexto de infarto agudo de miocardio prematuro, tampoco se confirmó la correlación. Conclusión: En nuestra población, no existe una relación entre el polimorfismo A/G del gen VAMP-8 y el riesgo de infarto agudo de miocardio.

Abstract Introduction Until now, only few studies have reported the correlation between vesicle-associated membrane protein-8 (VAMP-8) A/G gene polymorphism and acute myocardial infarction. Whereas, theoretically, VAMP-8 plays a pivotal role in the pathogenesis of acute myocardial infarction through platelet activation, secretion, and aggregation. Objective To investigate the association between VAMP-8 A/G gene polymorphism and the risk of acute myocardial infarction. Methods A cross-sectional study was carried out at Saiful Anwar General Hospital during June 2013 - May 2014. A Mae II enzyme with restriction fragment length polymorphism method was used to genotype VAMP-8 A/G gene polymorphisms in acute myocardial infarction and control groups. A multiple logistic regression test was used to analyze the association between VAMP-8 A/G gene polymorphism and the risk of acute myocardial infarction. Results A total of 35 controls and 97 acute myocardial infarction patients from our Hospital during the period were enrolled for our study. Our results found that VAMP-8 A/G gene polymorphism was not associated with the risk of acute myocardial infarction. Moreover, we also failed to confer the association between VAMP-8 A/G gene polymorphism and both smoking and hypertension among patients with acute myocardial infarction. Furthermore, in the setting of premature acute myocardial infarction, the correlation also failed to confirm. Conclusion In our population, there is no association between VAMP-8 A/G gene polymorphism and the risk of acute myocardial infarction.

Resumen La apicultura en México se sostiene con subespecies de abejas (Apis mellifera L) europeas y africanizadas. Debido a la dificultad en la diferenciación morfológica de las poblaciones Europeas (E) y Africanizadas (A) de A. mellifera, el objetivo de este trabajo fue realizar un análisis comparativo entre la técnica morfométrica FABIS, contra el diagnóstico empleando el polimorfismo en la longitud de los fragmentos de restricción (RFLP) del ADN mitocondrial (ADNmt). Se emplearon muestras de abejas procedentes de 135 colonias comerciales (CC), 15 colonias pie de cría (CPC) y 3 colonias silvestres (CS) localizados en diferentes municipios del estado de Tabasco (N=153). Ambos métodos de diagnóstico, identificaron a las CPC como europeas y las CS como africanizadas, pero en las CC el método FABIS no pudo definir 9 colonias, dándolas como sospechosas (S) y otras 50 no coincidieron con el resultado del método molecular, por lo que, en total ambos métodos coincidieron en 94 identificaciones (61.44 %). El agrupamiento bayesiano basado en el análisis de las doce variables morfométricas mostró que las categorías A-CC y E-CC, forman un grupo cercano a la categoría E-CPC; mientras que la categoría A-CS presentó la mayor distancia formando un grupo aislado. Por lo tanto, abejas de CC tienen características morfométricas tendientes a abejas E-CPC. Este trabajo también pretende ser una contribución a la falta de registros sobre la africanización en el estado de Tabasco. Se recomienda emplear el método molecular para discriminar entre abejas E/A, por no estar afectado por los factores ambientales.

Abstract Beekeeping in Mexico is based on subspecies of European (Apis mellifera L) and Africanized bees. Due to the difficulty in the morphological differentiation of the European (E) and Africanized (A) populations of A. mellifera, the objective of this work was to perform a comparative analysis between the FABIS morphometric technique, against the diagnosis using the restriction fragment length polymorphism (RFLP) of mitochondrial DNA (mtDNA). Samples of bees from 135 commercial colonies (CC), 15 breeding colonies (BRC) and 3 wild colonies (WC), located in different municipalities of the state of Tabasco (N= 153), were used. Both diagnostic methods identified BRCs as European and WCs as Africanized, but in CCs, the FABIS method could not define 9 colonies, considering them as suspicious (S) and another 50 did not coincide with the result of the molecular method, so, in total, both methods coincided in 94 identifications (61.44 %). The Bayesian grouping based on the analysis of the twelve morphometric variables showed that the categories A-CC and E-CC form a group close to the category E-BRC; while the category A-WC presented the greatest distance, forming an isolated group. Therefore, CC bees have morphometric characteristics tending to E-BRC bees. This work is also intended to be a contribution to the lack of records on Africanization in the state of Tabasco. It is recommended to use the molecular method to discriminate between E/A bees, as it is not affected by environmental factors.

Resumen: Introducción. La determinación de los factores de riesgo de la obesidad en la población iraní como problema de salud de la comunidad es crucial dada su complejidad. El gen receptor de la vitamina D (VDR) se ha mencionado como posible causante de dicha enfermedad. Objetivo. El objetivo del estudio fue investigar la asociación de los polimorfismos Apal, Bsml y Taql, con el gen VDR y la obesidad en una población iraní. Materiales y métodos. Se analizaron genotipos de 348 individuos obesos (BMI>30 kg/m2) y 320 no obesos (BMI: 18,5-24,9 kg/mf) mediante reacción en cadena de la polimerasa y polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción (PCR-RFLP). Para medir los niveles de glucemia en ayunas, tiroglobulina (TG), colesterol total, colesterol HDL y colesterol LDL, se utilizó un analizador bioquímico automático. Resultados. Los índices de masa corporal, glucemia en ayunas y TG fueron significantemente más elevados en el grupo de los obesos que en el de control. En los individuos obesos, la incidencia del genotipo AA fue de 47,1 % y la del genotipo combinado Aa+aaa fue de 52,9 %, en tanto que en el grupo de control estas cifras fueron, respectivamente, de 30 y 70 % (p=0,024; IC95% 1,100-3,933; la razón de probabilidades (OR) fue de 2,08. La frecuencia de los alelos “A” y “a” para el polimorfismo Apal en ambos grupos fue estadísticamente significativa (alelo A Vs. A; p=0,017). No se observó ninguna relación significativa entre los genotipos Taql y los alelos en los sujetos obesos y, tampoco, en los controles. Conclusión. El polimorfismo Apal del gen VDR (rs 7975232C/A) sería un factor de riesgo para la obesidad. El alelo y el genotipo AA en dicho polimorfismo se asociaron con los fenotipos de obesidad.

Abstract: Introduction: Identifying obesity risk factors as a health problem facing communities is crucial given its complexity. The vitamin D receptor gene has been reported as a possible cause of this disease. Objective: To study the association of the VDR gene ApaI, BsmI, and TaqI polymorphisms with obesity in an Iranian population. Material and methods: We analyzed the genotypes of 348 obese (BMI≥30 kg/m2) and 320 non-obese people (BMI: 18.5-24.9 kg/m2) using PCR-RFLP. We measured FBS, TG, total cholesterol, and HDL and LDL cholesterol levels in an automatic biochemical analyzer. Results: We found significantly higher BMI, FBS, and TG levels in the obese group compared to the control. In the obese individuals, the frequency of genotype AA was 47.1% and that of the combined Aa+aa genotype, 52.9% while in the control group they were 30% and 70%, respectively (p=0.024, 95% confidence interval (CI)=1.100-3.933, odds ratio (OR)=2.08). A and a alleles frequencies for the ApaI polymorphism were statistically significant in the two groups (allele A vs. a; p=0.017). No significant relationship was observed between TaqI genotypes and alleles in the control and obese subjects. Conclusion: We found that VDR ApaI (rs7975232 C/A) polymorphism appeared to be a risk factor for obesity. Especially, the A allele and the AA genotype in ApaI were associated with the obesity phenotypes.

Abstract Background: Human papilloma virus (HPV) is one of the most frequent sexually transmitted infections, especially among young people. Aims: To describe the prevalence of genital HPV infections, to identify clinical-epidemiological factors associated with them and to determine the frequency of viral strains. Methods: Endocervical samples were studied of 505 women between 15 and 49 years old, who attended the laboratory of the Institute of Social Security, residents of Posadas, Misiones, for the study of vaginal exudate, between January 2012 and June 2013. A 450-base pair fragment within the HPV L1 region was amplified. Genotype detection was performed through the study of the restriction fragment length polymorphism (RFLP). Results: The prevalence of total HPV carriage was 30.7%, and of these 71.6% corresponded to high risk (mainly HPV 16 [35.1%], 58 [10.8%] and 31 [8.1%]). HPV detection was higher in women aged 15 to 24 years (OR: 1.48, 95% CI: 1.01-2.18) and with more sexual partners (OR: 1.81, 95% CI: 1, 02-3.22). There was no association with pregnancy, stability of the couple, contraceptive methods, age at onset of sexual intercourse, or smoking. Conclusions: The identification and typing of HPV in this study provides information regarding the high prevalence of HPV and the substantial proportion of cases with oncogenic genotypes among sexually active women in this region of Argentina.

Resumen Introducción: El virus papiloma humano (VPH) causa infecciones transmitidas sexualmente. Objetivos: Conocer la prevalencia de infecciones genitales por VPH, identificar factores clínico-epidemiológicos asociados a dicha prevalencia y determinar la frecuencia de los tipos virales. Material y Métodos: Se estudiaron muestras endo-cervicales de 505 mujeres entre 15 y 49 años, que concurrieron para estudio de exudado vaginal al laboratorio del Instituto de Previsión Social, residentes de Posadas, Misiones, entre enero de 2012 y junio de 2013. Se amplificó una sección de 450 pares de bases del genoma viral perteneciente al fragmento L1 del VPH. La detección del genotipo se realizó mediante el estudio del polimorfismo de la longitud de los fragmentos de restricción (RFLP). Resultados: La prevalencia de la portación de VPH total fue 30,7%, y de éstos 71,6% correspondió a los de alto riesgo (principalmente VPH 16 [35,1%], 58 [10,8%] y 31 [8,1%]). La detección del VPH fue mayor en mujeres de 15 a 24 años (OR: 1,48; IC 95% :1,01-2,18) y con más parejas sexuales (OR:1,81; IC 95%: 1,02-3,22). No hubo asociación con el embarazo, la estabilidad de la pareja, métodos anticonceptivos, edad de inicio de las relaciones sexuales ni tabaquismo. Conclusiones: Los resultados de identificación y tipificación de VPH en este estudio aportan información sobre una prevalencia elevada de VPH en mujeres sexualmente activas, así como porcentajes elevados de genotipos oncogénicos en esta región.

RESUMO A criptococose é causada por leveduras do complexo Cryptococcus neoformans/C. gattii e se apresenta nas formas cutânea, respiratória e disseminada. Um homem imunocompetente de 44 anos com lesão facial e pneumonia latente foi hospitalizado e erroneamente diagnosticado com paracoccidioidomicose. Tomografias computadorizadas mostraram envolvimento pulmonar e neurológico, e culturas/tinta da China, teste do antígeno criptocócico e técnica de polimorfismo de comprimento de fragmentos de restrição dogene urease (URA5-RFLP) confirmaram C. neoformans genótipo VNI. Hemocultura indicou Klebsiella pneumoniae resistente à ampicilina (infecção relacionada com a assistência à saúde). Fluconazol foi administrado, mas após detecção de resistência, optou-se por anfotericina B (dose cumulativa/1500 mg). O paciente recebeu alta com remissão clínica (75 dias) e administração de anfotericina B por um ano (fase de manutenção).

ABSTRACT Cryptococcosis is caused by yeasts of the Cryptococcus neoformans/C. gattii complex, presenting cutaneous, respiratory and disseminated forms. A 44-year-old immunocompetent male with facial lesion and latent pneumonia was hospitalized and misdiagnosed with paracoccidioidomycosis. Computerized tomography scans showed pulmonary and neurological involvement, and cultures/China ink, cryptococcal antigen test and restriction fragment length polymorphism of urease gene (URA5-RFLP) confirmed C. neoformans genotype VNI. Hemoculture indicated ampicillin-resistant Klebsiella pneumoniae (healthcare-associated infection). Fluconazole was administered, but after resistance detection, amphotericin B was chosen (cumulative dose/1500 mg). The patient was discharged with clinical remission (75 days) and amphotericin for one year (maintenance phase).

RESUMEN La criptococosis es causada por levaduras del complejo Cryptococcus neoformans/C. gattii y se presenta en las formas cutánea, respiratoria y diseminada. Un hombre inmunocompetente de 44 años de edad con lesión facial y neumonía latente fue hospitalizado y erróneamente diagnosticado con paracoccidioidomicosis. Tomografías computarizadas mostraron afectación pulmonar y neurológica, y culturas/tinta china, prueba del antígeno criptocócico y URA5-polimorfismos en la longitud de los fragmentos de restricción (RFLP) confirmaron C. neoformans genotipo VNI. El hemocultivo indicó Klebsiella pneumoniae resistente a la ampicilina (infección asociada a la atención en salud). El fluconazol le fue administrado, pero tras detección de resistencia, se optó por anfotericina B (dosis acumulativa/1500 mg). Al paciente le dieron el alta en remisión clínica (75 días) y administración de anfotericina B durante un año (fase de mantenimiento).

ABSTRACT. The polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) technique was used to identify 3 species in the genus Opisthonema (Opisthonema bulleri, Opisthonema medirastre, and Opisthonema libertate) in the southern Gulf of California. Two specific primer pairs were designed to amplify the COI mitochondrial gene and 3 restriction enzymes (HpaII, RsaI, and AvaII) were selected to compare the RFLP patterns among the species. Different polymorphism levels were detected among samples. Easily analyzed specific restriction profiles were created, which differentiated unequivocally among the 3 target species. The approach undertaken here using PCR-RFLP is relatively cheap, fast, and robust, providing a useful technique for the identification of species in the genus Opisthonema.

RESUMEN. Se aplicó la técnica de reacción en cadena de la polimerasa-polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción (PCR-RFLP, por sus siglas en inglés) para identificar 3 especies del género Opisthonema (Opisthonema bulleri, Opisthonema medirastre y Opisthonema libertate) en la región sur del golfo de California. Se diseñaron 2 pares de iniciadores específicos para amplificar el gen mitocondrial COI y se seleccionaron 3 enzimas de restricción (HpaII, RsaI y AvaII) para comparar los patrones de RFLP entre las especies. Diferentes niveles de polimorfismo fueron detectados entre las muestras. Se generaron perfiles de restricción específicos fáciles de analizar, los cuales pudieran distinguir de manera inequívoca las 3 especies objetivo. El enfoque llevado a cabo aquí usando PCR-RFLP es relativamente barato, rápido y robusto, y proporciona una técnica útil para la identificación de las especies del género Opisthonema.

RESUMO Introdução: Doenças cerebrovasculares têm sido ligadas a diversos genes. A cromogranina A (CHGA) é utilizada como um marcador em doenças cardiovasculares. Portanto, avaliar o polimorfismo e verificar a associação com essa patologia é muito importante para melhor compreensão dessa doença. Objetivo: O foco do estudo foi identificar a associação entre o polimorfismo na região codante posição -264 do gene CHGA (Glu264Asp) e o acidente vascular encefálico hemorrágico (AVEH)/aneurisma no Distrito Federal, Brasil. Métodos: Estudo caso-controle de base populacional, envolvendo 45 casos com AVEH e/ou aneurisma. Para a genotipagem dessas amostras, utilizou-se a técnica laboratorial reação em cadeia da polimerase-polimorfismo de comprimento de fragmento de limitação (PCR-RFLP). Nível de significância de 5% foi adotado. Resultados: A ausência do genótipo CC do polimorfismo Glu264Asp CHGA nos participantes do estudo e a presença significativa do genótipo heterozigoto GC foram verificadas. No entanto, a distribuição dos genótipos não diferiu estatisticamente nos grupos. Conclusão: O polimorfismo Glu264Asp CHGA parece não contribuir para a gênese da expressão da proteína CHGA nesse grupo de pacientes, mas revela se existe ou não uma possível associação da patologia em questão e se a mutação contribuirá para a terapia gênica e melhorará a qualidade de vida dos pacientes.

ABSTRACT Introduction: Cerebrovascular diseases have been associated with several genes. Chromogranin A (CHGA) has been used as maker in cardiovascular disease. Therefore, evaluating the polymorphism and verifying its association with this pathology is very important to better understand this disease. Objective: The aim of this study was to identify the association between coding region polymorphism in -264 position of the CHGA gene (Glu264Asp) and hemorrhagic stroke (HS)/aneurysm in the Federal District, Brazil. Methods: This is a population-based case-control, involving 45 cases with HS and/or aneurysm. Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method is used for genotyping these samples. A significance level of 5% was adopted. Results: The absence of the CC genotype the Glu264Asp CHGA polymorphism in the study participants and the significant presence of the GC heterozygote genotype were observed in this study. However, the distribution of genotypes did not differ statistically in the groups. Conclusion: The Glu264Asp CHGA polymorphism does not seem to contribute to the genesis of the CHGA protein expression in this patients group, but to understand whether or not there is a possible association of the pathology in question and whether the mutation will contribute in the gene therapy and thus to improve patients’ quality of life.

RESUMEN Introducción: Enfermedades cerebrovasculares han sido vinculadas a diversos genes. La cromogranina A (CgA) es utilizada como un marcador en enfermedades cardiovasculares. Por consiguiente, evaluar el polimorfismo y verificar la asociación con esa patología es muy importante para la mejor comprensión de la enfermedad. Objetivo: El enfoque del ensayo fue identificar la asociación entre el polimorfismo en la región codificante en la posición -264 del gen CHGA (Glu264Asp) y el accidente cerebrovascular hemorrágico (ACVH)/aneurisma en Distrito Federal, Brasil. Métodos: Estudio de caso-control de base poblacional, involucrando 45 casos con ACVH y/o aneurisma. Para el genotipaje de las muestras, se utilizó la técnica de laboratorio reacción en cadena de la polimerasa-polimorfismos en la longitud de los fragmentos de restricción (PCR-RFLP). Nivel de significación elegido: 5%. Resultados: Ausencia del genotipo CC del polimorfismo Glu264Asp CHGA en los participantes del ensayo y presencia significativa del genotipo heterocigoto GC. Sin embargo, la distribución de los genotipos no difirió estadísticamente en los grupos. Conclusión: El polimorfismo Glu264Asp CHGA parece no contribuir para la génesis de la expresión de la proteína CgA en este grupo de pacientes, pero revelar si existe o no una posible asociación de la patología en cuestión y si la mutación contribuirá para la terapia genética y mejorará la calidad de vida de los pacientes.

ABSTRACT Objective: To investigate the correlations between polymorphisms at position 49 in exon 1 and position 318 in the promoter of the cytotoxic T lymphocyte-associated antigen 4 (CTLA-4) gene and autoimmune thyroid diseases in a Han Chinese population. Methods: Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism was utilized. The MseI and BbvI restriction endonucleases were used to detect and analyse position 49 in exon 1 and position 318 in the promoter as well as the T/C alleles of the CTLA-4 gene in peripheral blood samples from 112 patients with Graves' disease (GD), 101 with Hashimoto's thyroiditis (HT) and 100 healthy individuals. Results: At position 49 of exon 1, the frequencies of the GG genotype and the G allele in the GD group (χ2 = 12.147; p = 0.002) were statistically significantly higher than those in the control group (χ2 = 9.925; p = 0.002), while no statistically significant differences were found between the frequencies of the GG genotype and the G allele in the HT group (χ2 = 1.195; p = 0.550) and those in the control group (χ2 = 0.984; p = 0.321). No statistically significant differences in the promoter (−318) or the T/C alleles were observed among the three groups. Position 49 in the 17th codon of exon 1 of the CTLA-4 gene may be a candidate susceptibility marker in patients of Han ethnicity with GD. Conclusion: This finding helps us to better understand the genetic risks for GD and provides a direction for targeted gene therapy.

RESUMEN Objetivo: Investigar las correlaciones entre los polimorfismos en la posición 49 en el exón 1 y la posición 318 en el promotor del gen del antígeno 4 asociado al linfocito T citotóxico (CTLA-4), con las enfermedades autoinmunes de la tiroides en una población China de Han. Métodos: Se utilizó la reacción en cadena de la polimerasa-polimorfismo de la longitud de los fragmentos de restricción. Las endonucleasas de restricción de MseI y BbvI se utilizaron para detectar y analizar la posición 49 en el exón 1 y la posición 318 en el promotor, así como los alelos T/C del gen CTLA-4 en muestras de sangre periférica de 112 pacientes con enfermedad de Graves (EG), 101 con tiroiditis de Hashimoto (TH) y 100 individuos sanos. Resultados: En la posición 49 de exón 1, las frecuencias del genotipo GG y el alelo G en el grupo de EG (χ2 = 12.147; p = 0.002) fueron estadísticamente significativamente más altas que las del grupo de control (χ2 = 9.925; p = 0.002), pero no se encontraron diferencias estadísticamente significativas entre las frecuencias del genotipo GG y el alelo G en el grupo de TH (χ2 = 1.195; p = 0.550) y las del grupo de control (χ2 = 0.984; p = 0.321). No se observaron diferencias estadísticamente significativas en el promotor (−318) ni en los alelos T/C entre los tres grupos. La posición 49 en el codón17.° del exón 1 del gen CTLA-4 puede ser un marcador de susceptibilidad candidato en pacientes de la etnia Han con EG. Conclusión: Este hallazgo nos ayuda a comprender mejor los riesgos genéticos de la EG y ofrece una dirección para la terapia génica dirigida.

Abstract The coral Porites sverdrupi is the only scleractinian endemic to the Gulf of California. Over the last 2 decades its populations have been restricted to 3 areas, La Paz Bay, Loreto Bay, and Concepción Bay. As this species faces a high risk of extinction, there is an urgent need for biological, ecological, and genetic information for the guidance of conservation efforts. This is the first study on genetic diversity and connectivity in the species. For this, we analyzed coral colonies from Loreto Bay and Concepción Bay. Our results show that there is high genetic diversity in P. sverdrupi at both sites, with significant genetic structure between them. This condition is caused by a combination of short pelagic larval duration, low dispersal potential between the populations, and local adaptation. Our results emphasize the need for more research in order to establish adequate conservation strategies.

Resumen El coral Porites sverdrupi es el único coral escleractinio endémico del golfo de California. En las últimas 2 décadas sus poblaciones se han restringido a 3 áreas, bahía de La Paz, bahía de Loreto y bahía Concepción. Debido a que esta especie enfrenta un elevado riesgo de extinción, existe una urgente necesidad de generar información biológica, ecológica y genética que guíe los esfuerzos de conservación de la especie. Este es el primer trabajo sobre la diversidad y la conectividad genética en la especie, para lo cual analizamos las colonias coralinas de bahía de Loreto y bahía Concepción. Nuestros resultados muestran alta diversidad genética en ambas poblaciones de P. sverdrupi, con una estructura genética significativa entre ellas. Esta condición es causada por el tiempo de duración larval corto, el potencial de dispersión bajo entre las poblaciones y la adaptación local. Nuestros resultados enfatizan la necesidad de realizar más investigación para establecer estrategias adecuadas de conservación.

Resumen Introducción. La composición genética del huésped determina, entre otros aspectos, el perfil clínico del dengue, lo cual se debería al efecto de variantes en los genes que codifican citocinas proinflamatorias. Objetivo. Evaluar la asociación entre las variantes de tres polimorfismos en los genes candidatos TNFA, IL6 e IFNG con la gravedad del dengue en una población colombiana. Materiales y métodos. Se evaluaron los polimorfismos rs1800750, rs2069843 y rs2069705 de los genes TNFA, IL6 e IFNG, respectivamente, en 226 pacientes con dengue. Los genotipos se tipificaron usando la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y los polimorfismos de la longitud de los fragmentos de restricción (Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP). Para determinar el riesgo de diferentes fenotipos del dengue, se compararon las frecuencias alélicas con la prueba de ji al cuadrado, y los genotipos y los haplotipos, con regresión logística. Por último, los análisis se ajustaron utilizando datos de autoidentificación o del componente genético ancestral. Resultados. El alelo A del rs2069843, ajustado por autoidentificación, se asoció con casos de dengue hemorrágico en afrocolombianos. En la muestra completa, dicho polimorfismo, ajustado por componente genético ancestral, fue reproducible. Además, hubo asociaciones significativas entre las combinaciones alélicas GGT y GAC de los rs1800750, rs2069843 y rs2069705 en pacientes con dengue hemorrágico, con ajuste por componente genético ancestral y sin él. Además, la combinación alélica AGC produjo 58,03 pg/ml más de interleucina 6 que la GGC, independientemente de los componentes genéticos europeo, amerindio y africano. Conclusión. Las variantes de los polimorfismos GGT y GAC de los rs1800750, rs2069843 y rs2069705 en los genes TNFA, IL6 e IFNG, respectivamente, se correlacionaron con la gravedad del dengue en esta muestra de población colombiana.

Abstract Introduction: The genetic makeup of the host contributes to the clinical profile of dengue. This could be due to the effect of variants in the genes encoding pro-inflammatory cytokines. Objective: To evaluate the association between the variants of three polymorphisms in TNFA, IL6 and IFNG candidate genes with dengue severity in a sample of Colombian population. Materials and methods: We evaluated the rs1800750, rs2069843, and rs2069705 polymorphisms in TNFA, IL6 and IFNG candidate genes, respectively, in 226 patients with dengue infection. The genotypes were typed using both polymerase chain reaction (PCR) and restriction fragment length polymorphism (RFLP). To determine the risk of different dengue phenotypes, we compared allele frequencies with chisquare and genotypes and haplotypes using logistic regression. Finally, these analyzes were adjusted with data from self-identification or the ancestral genetic component. Results: The A allele in the rs2069843 polymorphism, adjusted by self-identification, was associated with dengue hemorrhagic fever cases in Afro-Colombians. In the entire sample, this polymorphism, adjusted by the ancestral genetic component, was reproducible. In addition, there were significant associations between GGT and GAC allelic combinations of rs1800750, rs2069843, and rs2069705 in dengue hemorrhagic fever patients, with and without adjustment by ancestral genetic component. Additionally, the AGC allelic combination produced 58.03 pg/ml of interleukin-6 more than the GGC combination, regardless of European, Amerindian and African genetic components. Conclusions: The variants of GGT and GAC polymorphisms of rs1800750, rs2069843, and rs2069705 in the TNFA, IL6 and IFNG genes, respectively, were correlated with the susceptibility to dengue severity in a sample of Colombian population.

Abstract Background: A growing body of evidence suggest that obese individuals are under risk of renal parenchymal disorders when compared to nonobese counterparts. Microalbuminuria is the early marker of renal involvement. Although most of obese patients carries multiple risk factors for microalbuminuria, some obese individuals without risk factor may progress to microalbuminuria. The present study was performed to examine the role of ICAM-1 gene 1462A>G (K469E) polymorphism on microalbuminuria in obese subjects without diabetes mellitus, hypertension, hiperlipidemia and older age. Methods: Ninety eight obese and 96 nonobese individuals without a comorbidity enrolled into the study. Serum ICAM-1 level was measured by enzyme linked immunoabsorbent assay (ELISA) method. ICAM-1 gene 1462A>G (K469E) polymorphism was examined by restriction fragment length polymorphism-polymerase chain reaction (RFLP-PCR). Nepholometric method was used to examine urinary albumin loss, and microalbuminuria was measured by albumin to creatinine ratio. Results: Obese individuals had significantly higher microalbuminuria and proteinuria level compared to nonobese subjects (p: 0.043 and p: 0.011; respectively). GG genotype of ICAM-1 carriers have significantly higher microalbuminuria compared to individuals with AA or AG genotype carriers (p: 0.042). Serum ICAM-1 level was significantly correlated with creatinine and microalbuminuria (p: 0.002 and p: 0.03; respectively). Logistic regression analysis indicated a 7.39 fold increased risk of microalbuminuria in individuals with GG genotype of ICAM-1 gene 1462A>G (K469E) polymorphism. Conclusions: GG genotype of ICAM-1 gene K469E polymorphism is associated with increased microalbuminuria in obese individuals without another metabolic risk factor.

Resumen Introducción: Un conjunto de datos en aumento indica que los individuos obesos corren más riesgo de sufrir trastornos del parénquima renal si se los compara con sus homólogos no obesos. La oligoalbuminuria es un primer rasgo de afectación renal. Aunque la mayoría de los pacientes obesos presentan múltiples factores de riesgo de oligoalbuminuria, esta puede manifestarse en algunos individuos obesos sin factores de riesgo. El presente estudio se realizó para analizar el papel del polimorfismo 1462A>G (K469E) del gen ICAM-1 en la oligoalbuminuria de individuos obesos sin diabetes mellitus, hipertensión, hiperlipidemia ni vejez. Métodos: Para el estudio fueron reclutados 98 individuos obesos y 96 individuos no obesos sin comorbilidad. Se midió el nivel sérico de ICAM-1 mediante el ensayo de inmunoabsorción enzimática (ELISA). Se analizó el polimorfismo 1462A>G (K469E) del gen ICAM-1 por reacción en cadena de la polimerasay polimorfismo de longitud de los fragmentos de restricción (RFLP-PCR). El método nefolométrico se utilizó para analizar la pérdida urinaria de albúmina, y la oligoalbuminuria se midió con la tasa de albúmina/creatinina. Resultados: Los individuos obesos presentaron unos niveles de oligoalbuminuria y proteinuria considerablemente más elevados que los individuos no obesos (p: 0,043 y p: 0,011, respectivamente). La oligoalbuminuria en los portadores del genotipo GG de ICAM-1 fue bastante mayor que la de los portadores del genotipo AA o AG (p: 0,042). El nivel sérico de ICAM-1 se correlacionó notablemente con la creatinina y la oligoalbuminuria (p: 0,002 y p: 0,03, respectivamente). El análisis de regresión logística mostró un riesgo 7,39 veces mayor de oligoalbuminuria en los individuos con el genotipo GG del polimorfismo 1462A>G (K469E) del gen ICAM-1. Conclusiones: El genotipo GG del polimorfismo 1462A>G (K469E) del gen ICAM-1 se asocia con un aumento de la oligoalbuminuria en personas obesas sin otro factor de riesgo metabólico.

ABSTRACT Objective: Coronary artery disease, the leading cause of morbidity and mortality worldwide, is an inflammatory disease. The X-ray repair cross complementing 1 (XRCC1) gene plays the role of scaffolding protein for the base excision repair (BER) and single strand break (SSB) repair. Methods: The study population consisted of 402 participants living in the same region and classified into case group (n = 201) and control group (n = 201). Phenol-chloroform method was used to extract DNA from blood samples of the study participants. The X-ray repair cross complementing 1 genotypes were determined using polymerase chain reaction/ restriction fragment length polymorphism (PCR/RFLP) methods. Results: No statistically significant difference was found between the study groups in terms of allele and genotype frequencies in XRCC1 Arg194Trp polymorphism. However, distribution of XRCC1 399Gln allele frequency was found to differ at a statistically significant level between the case and the control groups (p = 0.003; OR = 1.56). Regarding the Arg/Arg genotype in Arg399Gln polymorphism, a statistically significant difference was detected in the distribution of Gln/Gln genotype (p = 0.017; adj OR = 3.11). Statistically significant differences were also recorded for Arg399Gln polymorphism among the smoking male participants with hypertension (p = 0.009; p = 0.031; p = 0.032, respectively). Conclusion: The study suggests that XRCC1 399Gln/Gln genotype may be a significant risk factor for coronary artery disease.

RESUMEN Objetivo: La enfermedad de las arterias coronarias, la principal causa de morbilidad y mortalidad en todo el mundo, es una enfermedad inflamatoria. El gen de rayos X de reparación de complementación cruzada grupo 1 (XRCC1) desempeña el papel de proteína de andamiaje para la reparación por escisión de la base (REB) y la reparación de roturas simples de cadenas (RSC). Métodos: La población de estudio consistió en 402 participantes que vivían en la misma región, y que fueron clasificados en el grupo de caso (n = 201) y el grupo de control (n = 201). El método de fenol-cloroformo fue utilizado para extraer el DNA de las muestras de sangre de los participantes del estudio. Los genotipos de rayos X de reparación de complementación cruzada grupo 1, fueron determinados usando métodos de reacción en cadena de la polimerasa/ polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción (RCP/PLFR). Resultados: No se encontraron diferencias estadísticamente significativas entre los grupos de estudio en términos de alelos y frecuencias genotípicas en el polimorfismo XRCC1 Arg194Trp. Sin embargo, se halló que la distribución de la frecuencia del alelo de XRCC1 399Gln difería a un nivel estadísticamente significativo entre los grupos de caso y control (p = 0.003; OR = 1.56). Respecto al genotipo Arg/Arg en el polimorfismo Arg399Gln, se detectó una diferencia estadísticamente significativa en la distribución del genotipo de Gln/Gln (p = 0.017; adj OR = 3.11). También se registraron diferencias estadísticamente significativas para el polimorfismo Arg399Gln entre los participantes varones fumadores con hipertensión (p = 0.009; p = 0.031; p = 0.032, respectivamente). Conclusión: El estudio sugiere que el genotipo de XRCC1 399Gln/Gln puede ser un factor de riesgo significativo para la enfermedad de la arteria coronaria.

Introducción. La leishmaniasis es una enfermedad de gran prevalencia en Colombia, donde al menos seis especies diferentes la originan en el ser humano, con un amplio rango de características clínicas. La tipificación de la especie es importante, no solo desde el punto de vista epidemiológico, sino para el diagnóstico, dado que el tratamiento puede variar dependiendo de la especie identificada. En la identificación se han utilizado varias alternativas metodológicas con diferentes niveles de poder discriminatorio. Objetivo. Identificar especies de Leishmania mediante la amplificación molecular de un fragmento del gen hsp 70. Materiales y métodos. Se amplificó un fragmento del gen hsp 70 mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR- hsp 70) y se hizo el análisis de los polimorfismos de la longitud ( Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP) de los fragmentos de restricción de 81 aislamientos clínicos de Leishmania spp. de pacientes con leishmaniasis cutánea y mucocutánea para la identificación de las especies presentes. Resultados. Se obtuvo un solo amplicón para todas las muestras analizadas. La restricción enzimática de los 81 productos permitió la identificación de 70 con dos patrones de bandas que correspondían a dos alelos de Leishmania braziliensis (62 y ocho aislamientos, respectivamente), nueve aislamientos compatibles con L. panamensis y dos con L. guyanensis . El origen geográfico de los aislamientos coincidió con el de reportes previos sobre la distribución de dichas especies en Colombia. Conclusiones. La técnica de la PCR- hsp 70 y el análisis de RFLP fueron útiles para identificar las especies de Leishmania aisladas de muestras clínicas de Colombia y pueden aplicarse también en el estudio de cepas de vectores y reservorios de importancia epidemiológica.

Introduction: Leishmaniasis is highly prevalent in Colombia, where at least six different species can cause disease of varying clinical presentations in humans. The identification of the infecting species is quite important for prognosis, therapeutics and epidemiology. Different techniques with variable discriminatory power have been used for the identification. Objective: To carry out the molecular identification of Leishmania species through the amplification of a fragment of the hsp 70 gene. Materials and methods: Molecular amplification of the hsp 70 gene fragment (PCR- hsp 70) followed by restriction fragment length polymorphism analysis (RFLP) was done for identification purposes using DNA from 81 clinical isolates of Leishmania . Results: A single amplicon was obtained for all samples analyzed. The enzymatic restrictions of the 81 PCR products identified 70 with a banding pattern corresponding to L. braziliensis with two different patterns (62 and eight isolates, respectively), nine isolates compatible with L. panamensis and two with L. guyanensis . The geographical origin of the isolates is consistent with previous reports about the distribution of the corresponding species in Colombia. Conclusions: The PCR- hsp 70/RFLP technique used is a valid tool for the identification of Leishmania species isolated from clinical samples of patients in Colombia, which may also be applicable to the study of strains obtained from vectors and reservoirs with epidemiological significance.

Introducción. Se han descrito diez genotipos (A-J) del virus de la hepatitis B (HBV) que están distribuidos en todos los continentes. Una de las técnicas utilizadas para determinar el genotipo viral es el análisis del polimorfismo de longitud de los fragmentos de restricción, un método simple y económico, pero con algunas limitaciones. Objetivo. El objetivo inicial del estudio fue identificar el genotipo del HBV mediante RFLP en muestras de suero obtenidas de pacientes y donantes de sangre. Sin embargo, por las discrepancias observadas en los patrones de RFLP fue necesario realizar análisis filogenéticos y un análisis in silico de secuencias del HBV. Materiales y métodos. Se obtuvieron 56 muestras de suero. Tras la extracción de ADN, se amplificó un fragmento del ORF S del HBV mediante reacción en cadena de la polimerasa, cuyos productos se analizaron por RFLP con las enzimas Alw I, Bsr I, Cfr I, Hpa II y Sty I, y algunos se secuenciaron. Los patrones obtenidos se compararon con los reportados previamente. Se efectuó un análisis in silico de RFLP en consideración de las diferencias entre los patrones esperados y los observados. Resultados. Se identificaron los genotipos A y F, subgenotipo F3, en las muestras. Este resultado coincide con lo descrito en estudios previos en los que se ha demostrado que el genotipo F, subgenotipo F3, es prevalente en la población de la región andina del país, en tanto que el genotipo A predomina en el occidente (departamento del Chocó). Con base en el análisis in silico de 229 secuencias virales obtenidas del GenBank y las 11 secuencias de este estudio, se caracterizó un nuevo patrón de RFLP específico para el genotipo F, subgenotipo F3, y se describieron algunas modificaciones en el patrón de RFLP del genotipo A, subgenotipo A1. Conclusiones. Se caracterizó el patrón de genotipificación del genotipo F, subgenotipo F3, del HBV mediante RFLP, análisis in silico y secuenciación. Se requieren nuevos análisis in silico con un número mayor de secuencias para validar los patrones de RFLP de los genotipos y subgenotipos del VHB.

Introduction: Ten viral genotypes (A-J) distributed in all continents have been described for hepatitis B virus (HBV). One of the methodologies for determining the viral genotype is the restriction fragment length polymorphism (RFLP) technique, a simple and relatively inexpensive method, albeit with some limitations. Objective: The initial objective of the project was to identify the HBV genotypes by RFLP in serum samples obtained from patients and blood donors. However, due to the discrepancies of RFLP patterns it was also necessary to perform phylogenetic genotyping and in silico analysis of HBV sequences. Materials and methods: We obtained 56 serum samples. DNA extraction was followed by PCR amplification of a fragment of HBV ORF S. We analyzed PCR products by RFLP with Alw I, Bsr I, Cfr I, Hpa II and Sty I, and we sequenced some. We compared the patterns obtained with those in previous reports. We also performed RFLP analysis in silico since we found differences between the patterns expected and those obtained Results: We identified genotypes A and F, subgenotype F3, in the samples. This result is in agreement with those of previous studies carried out in Colombia; indeed, subgenotype F3 is the most frequent in the Andean region of the country, while genotype A is the most frequent HBV genotype in the western region (department of Chocó). Based on the in silico analysis of 229 HBV sequences from GenBank and 11 sequences of this study, we identified the RLFP pattern for genotype F, subgenotype F3, and we described some modifications of genotype A RFLP patterns. Conclusions: We identified the single nucleotide polymorphism pattern for genotype F, subgenotype F3, by in silico analysis and sequencing. Further robust in silico analyses are necessary to validate the RFLP patterns of HBV genotype and subgenotypes.

La obesidad resulta de los efectos combinados de los genes, el ambiente y el estilo de vida. La leptina (LEP) y el receptor de leptina (LEPR) son genes que han sido evaluados en la búsqueda de variantes que podrían estar relacionadas con la obesidad y sus complicaciones cardiometabólicas. Objetivo: Evaluar la posible asociación entre los polimorfismos G2548A del gen LEP y Gln223Arg del gen LEPR con el desarrollo de obesidad y resistencia a la insulina (RI) en niños y adolescentes pre-púberes. Métodos: Se estudiaron 314 niños de 2-11 años, clasificados según los parámetros antropométricos y bioquímicos en: a) sobrepeso/obesos sin RI (n=133), b) sobrepeso/obesos con RI (n=75) y c) controles sanos (n=70). La genotipificación fue realizada por reacción en cadena de la polimerasapolimorfismos de longitud de fragmentos de restricción (PCR-RFLP); se estudiaron las asociaciones entre genotipo y riesgo, y se compararon los promedios de las medidas antropométricas y bioquímicas. Resultados: La frecuencia genotípica para el polimorfismo G2548A del gen LEP fue 51% G/A, 33% G/G y 16% A/A; para el polimorfismo Gln223Arg del gen LEPR fue Gln/Arg 49%, Gln/Gln 31% y Arg/Arg 20%. Se encontró diferencia significativa en la distribución de los diferentes genotipos del gen de LEPR en los niños con sobrepeso/obesidad y RI con respecto al grupo control (OR= 2,6; IC 95%=1,17-5,75; p < 0.05). Conclusión: Se observó una asociación entre la presencia del genotipo Gln/Gln del gen LEPR con la RI (factor de riesgo cardiometabólico), presentando los niños con sobrepeso/obesidad y RI 2,6 veces más riesgo a presentar RI.

Obesity is a result of the combined effects of genes, environment and lifestyle. The Leptin (LEP) and leptin receptor (LEPR) are genes that have been extensively evaluated in search for variants that may be associated with obesity and cardiometabolic complications. Objective: To evaluate the possible association between polymorphisms G2548A of the LEP gene and Gln223Arg of the LEPR gene with the development of obesity and insulin resistance (IR) in prepubertal children and adolescents. Methods: We studied 314 children 2-11 years, grouped by anthropometric and biochemical parameters: a) overweight /obese without IR (n = 133), b) overweight /obese with IR (n = 75) and c) healthy controls (n = 70). Genotyping was performed by Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphisms (PCR-RFLP) method. Genotype-risk associations were studied. We then compared the average values for anthropometric and biochemical parameters. Results: The genotypic frequency for polymorphism G2548A of LEP gene was 51% for the G/A genotype, 33% G/G and 16% A/A genotype; for polymorphism Gln223Arg of LEPR gene was of Gln/Arg 49%, Gln/Gln 31% and Arg/Arg 20%. Significant difference was found in the distribution of different genotypes of the LEPR gene in children with overweight/obesity with IR compared to the control group (OR = 2.6; 95% CI = 1.17 to 5.75; p < 0.05). Conclusion: We observed an association between the presence of Gln/Gln genotype of the LEPR gene with insulin resistance (cardiometabolic risk factor) children, rendering these children with overweight/obese with IR 2,6 times more likely to be with insulin.