RESUMO Objetivo: Verificar a utilização e identificar as vantagens dos métodos moleculares para diagnóstico de infecções congênitas no líquido cefalorraquidiano de neonatos. Fontes de dados: A revisão foi registrada na base PROSPERO (International Prospective Register of Systematic Reviews) sob CRD42021274210. A busca bibliográfica foi realizada nas bases de dados PubMed, Biblioteca Virtual em Saúde/ Centro Latino-Americano e do Caribe de Informação em Ciências da Saúde (BVS/BIREME), Scopus, Web of Science, Excerpta Medica database (EMBASE), Cochrane, ProQuest, e EBSCOhost. A busca foi feita no período de agosto a outubro de 2021 e atualizada em dezembro de 2022, respeitando as orientações do Preferred Reporting Items for Systematic Reviews e Meta-Analyises (PRISMA). A sequência da seleção dos estudos foi: 1) Remoção de duplicatas; 2) Exame de títulos e resumos; 3) Recuperação dos textos completos potencialmente relevantes; e 4) Avaliação do texto completo conforme critérios de elegibilidade por dois autores independentes. O critério de inclusão considerou ensaios clínicos randomizados e não randomizados, estudos longitudinais, transversais, revisados por pares, estudos em humanos, publicados em inglês, espanhol, italiano e português, com recém-nascidos de até 28 dias que sofreram neuroinfecções congênitas pelos agentes toxoplasmose, rubéola, citomegalovírus, herpes simples (TORCH), e outros como Treponema pallidum, Zika, parvovírus B-19, varicela zoster, Epstein-Barr, e SARS-CoV-2, diagnosticadas por reação em cadeia de polimerase (PCR). Dois avaliadores extraíram as seguintes informações: autor, ano de publicação, nacionalidade, sujeitos, tipo de estudo, métodos, resultados e conclusão. Síntese dos dados: O patógeno mais estudado foi Herpes Simples. Muitos artigos relataram somente sintomas iniciais inespecíficos, motivando a coleta de líquido cefalorraquidiano e realização da PCR para investigação etiológica. Conclusões: Os métodos moleculares são eficazes para detectar o genoma do patógeno no líquido cefalorraquidiano, o que pode impactar na evolução clínica e no prognóstico neurológico. Objetivo neonatos International CRD42021274210 CRD PubMed LatinoAmericano Latino Americano BVS/BIREME, BVSBIREME BVS/BIREME , BVS BIREME (BVS/BIREME) Scopus Science EMBASE, EMBASE (EMBASE) Cochrane ProQuest EBSCOhost 202 2022 MetaAnalyises Meta Analyises PRISMA. PRISMA . (PRISMA) 1 duplicatas 2 resumos 3 relevantes 4 independentes longitudinais transversais pares humanos inglês espanhol português recémnascidos recém nascidos toxoplasmose rubéola citomegalovírus TORCH, TORCH (TORCH) pallidum Zika B19, B19 B 19, 19 B-19 zoster EpsteinBarr, EpsteinBarr Epstein Barr, Barr Epstein-Barr SARSCoV2, SARSCoV2 SARSCoV SARS CoV 2, SARS-CoV-2 PCR. (PCR) informações autor publicação nacionalidade sujeitos estudo conclusão Simples inespecíficos etiológica Conclusões neurológico CRD4202127421 (BVS/BIREME (EMBASE 20 (PRISMA (TORCH B1 B-1 SARS-CoV- (PCR CRD420212742 B- SARS-CoV CRD42021274 CRD4202127 CRD420212 CRD42021 CRD4202 CRD420 CRD42 CRD4

ABSTRACT Objective: To verify the use and identify advantages of molecular methods for congenital infections diagnosis in cerebrospinal fluid of neonates. Data source: The review was registered in the International Prospective Register of Systematic Reviews (PROSPERO), under CRD42021274210. The literature search was performed in databases: PubMed, Virtual Health Library/ Latin American and Caribbean Center on Health Sciences Information (VHL/BIREME), Scopus, Web of Science, Excerpta Medica database (EMBASE), Cochrane, ProQuest, and EBSCOhost. The search was carried out from August to October 2021 and updated in December 2022, respecting the Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses (PRISMA) guidelines. The selection sequence was: 1) Duplicate title removal; 2) Examination of titles and abstracts; 3) Full-text retrieval of potentially relevant reports; and 4) Evaluation of the full text according to eligibility criteria by two independent authors. Inclusion criteria considered randomized and non-randomized control trials, longitudinal, cross-sectional, and peer-reviewed studies in humans, published in English, Spanish, Italian, and Portuguese, with newborns up to 28 days old who had congenital neuroinfections by toxoplasmosis, rubella, cytomegalovirus, herpes simplex (TORCH), and others such as Treponema pallidum, Zika, parvovirus B-19, varicella zoster, Epstein-Barr, and SARS-CoV2, diagnosed by polymerase chain reaction (PCR). Two evaluators extracted the following information: author, year of publication, nationality, subjects, study type, methods, results, and conclusion. Data synthesis: The most studied pathogen was herpes simplex. Several articles reported only nonspecific initial symptoms, motivating the collection of cerebrospinal fluid and performing PCR for etiological investigation. Conclusions: Molecular methods are effective to detect pathogen genomes in cerebrospinal fluid, which can impact clinical evolution and neurological prognosis. Objective neonates source PROSPERO, PROSPERO , (PROSPERO) CRD42021274210 CRD databases PubMed Library VHL/BIREME, VHLBIREME VHL/BIREME VHL BIREME (VHL/BIREME) Scopus Science EMBASE, EMBASE (EMBASE) Cochrane ProQuest EBSCOhost 202 2022 MetaAnalyses Meta Analyses PRISMA (PRISMA guidelines 1 removal 2 abstracts 3 Fulltext Full reports 4 authors nonrandomized non trials longitudinal crosssectional, crosssectional cross sectional, sectional cross-sectional peerreviewed peer reviewed humans English Spanish Italian Portuguese toxoplasmosis rubella cytomegalovirus TORCH, TORCH (TORCH) pallidum Zika B19, B19 B 19, 19 B-19 zoster EpsteinBarr, EpsteinBarr Epstein Barr, Barr Epstein-Barr SARSCoV2, SARSCoV2 SARSCoV SARS CoV2, CoV2 CoV SARS-CoV2 PCR. . (PCR) information author publication nationality subjects type results conclusion synthesis symptoms investigation Conclusions prognosis (PROSPERO CRD4202127421 (VHL/BIREME (EMBASE 20 (TORCH B1 B-1 SARS-CoV (PCR CRD420212742 B- CRD42021274 CRD4202127 CRD420212 CRD42021 CRD4202 CRD420 CRD42 CRD4

ABSTRACT: Canine parvovirus 2 (CPV-2) is a highly contagious enteric virus that causes high morbidity and mortality, especially in dogs under six months of age. Recovery from this illness is dependent on several factors, including the patient’s prognosis for adequate therapy. The aim of this study was to evaluate the risk factors associated with the death outcome in CPV-2 positive dogs in a case-control study conducted at the Veterinary Hospital of the Universidade Federal de Lavras (HV-UFLA) in Lavras, Minas Gerais, Brazil. Twenty-six dogs with CPV-2 symptoms that arrived at the HV-UFLA between 2017 and 2018 were evaluated for inclusion in the study. Data on medical history, clinical signs, blood count and rapid test of parvovirus and faecal test for polymerase chain reaction (PCR) were collected for all the animals. All the dogs received treatment at the HV-UFLA, and the overall fatality rate due to canine parvovirus was 30.77%. Descriptive analysis and univariate and multivariate statistical analyses (logistic regression) were performed to assess the variables that were possibly associated with an unfavourable prognosis (death). In the univariate and multivariate analyses, Systemic Inflammatory Response Syndrome (SIRS) was observed to be a significant risk factor for an unfavourable prognosis in canine parvovirus, as it increased the risk of death by 12.96 times (95% CI 1.85-133.70; P < 0.01) compared with patients who did not exhibit SIRS. Thus, SIRS was strongly associated with an unfavourable prognosis, suggesting that it can be used as a prognostic indicator for canine parvovirus in veterinary practice. ABSTRACT CPV2 CPV (CPV-2 mortality age patient s therapy CPV- casecontrol case control HVUFLA HV UFLA (HV-UFLA Gerais Brazil Twentysix Twenty 201 history signs PCR (PCR animals HVUFLA, UFLA, 3077 30 77 30.77% logistic regression death. . (death) (SIRS 1296 12 96 12.9 95% 95 (95 1.85133.70 18513370 1.85 133.70 1 85 133 70 1.85-133.70 0.01 001 0 01 Thus practice (CPV- 20 307 3 7 30.77 (death 129 9 12. (9 85133 1.85133.7 1851337 185 1.8 13370 133.7 8 13 1.85-133.7 0.0 00 (CPV 30.7 ( 8513 1.85133. 185133 18 1. 1337 133. 1.85-133. 0. 30. 851 1.85133 18513 1.85-133 1.8513 1851 1.85-13 1.851 1.85-1 1.85-

RESUMO: O parvovírus canino 2 (CPV-2) é um vírus entérico altamente contagioso que causa alta morbidade e mortalidade, principalmente em cães com menos de seis meses de idade. A recuperação desta doença é dependente de vários fatores, incluindo a determinação do prognóstico do paciente para terapia adequada. O objetivo deste estudo foi avaliar os fatores de risco associados ao desfecho óbito em cães com CPV-2 em um estudo de caso-controle realizado no Hospital Veterinário da Universidade Federal de Lavras (HV-UFLA), em Lavras, Minas Gerais. Vinte e seis cães com sintomas de CPV-2 que chegaram entre 2017 e 2018 ao HV-UFLA foram avaliados para inclusão no estudo. Dados sobre histórico médico, sinais clínicos, hemograma e teste rápido de parvovirose e fezes para reação em cadeia da polimerase (PCR) foram coletados para todos os animais. Todos os cães receberam tratamento estabelecido pelo HV-UFLA e a taxa geral de letalidade por parvovirose canina foi de 30,77%. Análise descritiva e análise estatística univariada e multivariada (regressão logística) foram utilizadas para avaliar variáveis possivelmente associadas a um prognóstico desfavorável (óbito). Na análise univariada e multivariada, a Síndrome da Resposta Inflamatória Sistêmica (SIRS) foi observada como fator de risco significativo para prognóstico desfavorável na parvovirose canina, pois aumentou 12,96 vezes o risco de morte (95% IC 1,85-133,70; P < 0,01) em comparação com aqueles pacientes que não apresentaram SIRS. Assim, a SIRS foi fortemente associada com um prognóstico desfavorável, sugerindo que pode ser utilizada como indicador prognóstico na parvovirose canina na prática veterinária. RESUMO CPV2 CPV (CPV-2 mortalidade idade adequada CPV- casocontrole caso controle HVUFLA, HVUFLA HV UFLA , (HV-UFLA) Gerais 201 médico clínicos PCR (PCR animais 3077 30 77 30,77% regressão logística óbito. . (óbito) (SIRS 1296 12 96 12,9 95% 95 (95 1,85133,70 18513370 1,85 133,70 1 85 133 70 1,85-133,70 0,01 001 0 01 Assim veterinária (CPV- (HV-UFLA 20 307 3 7 30,77 (óbito 129 9 12, (9 85133 1,85133,7 1851337 185 1,8 13370 133,7 8 13 1,85-133,7 0,0 00 (CPV 30,7 ( 8513 1,85133, 185133 18 1, 1337 133, 1,85-133, 0, 30, 851 1,85133 18513 1,85-133 1,8513 1851 1,85-13 1,851 1,85-1 1,85-

Abstract Despite of the global unity against COVID-19 pandemic, the threat of SARS-CoV-2 variants on the lives of human being is still not over. SARS-CoV-2 pandemic has urged the need of rapid viral detection at earliest. To cope with gradually expanding scenario of SARS-CoV-2, accurate diagnosis is extremely crucial factor which should be noticed by international health organizations. Limited research followed by sporadic marketing of SARS-CoV-2 rapid pharmaceutical detection kits raises critical questions against quality assurance and quality control measures. Herein we aimed to interrogate effectivity and specificity analysis of SARS-CoV-2 pharmaceutical rapid detection kits (nasopharyngeal swab based) using conventional gold standard triple target real-time polymerase chain reaction (USFDA approved). A cross-sectional study was conducted over 1500 suspected SARS-CoV-2 patients. 100 real time-PCR confirmed patients were evaluated for pharmaceutical RDT kits based upon nasopharyngeal swab based kits. The SARS-CoV-2 nasopharyngeal swab based rapid diagnostic kit (NSP RDTs) analysis showed 78% reactivity. Among real time PCR confirmed negative subjects, 49.3% represented false positivity. The positive predictive analysis revealed 67.82%, while negative predictive values were 64.40%. The NSP RDTs showed limited sensitivities and specificities as compared to gold standard real time PCR. Valid and authentic detection of SARS-CoV-2 is deemed necessary for accurate COVID-19 surveillance across the globe. Current study highlights the potential consequences of inadequate detection of SARS-CoV-2 and emerging novel mutants, compromising vaccine preventable diseases. Current study emphasizes need to wake higher authorities including strategic organizations for designing adequate measures to prevent future SARS-CoV-2 epidemics. COVID19 COVID 19 COVID-1 SARSCoV2 SARSCoV SARS CoV 2 SARS-CoV- earliest SARSCoV2, 2, realtime USFDA approved. approved . approved) crosssectional cross sectional 150 10 timePCR 78 reactivity subjects 493 49 3 49.3 positivity 6782 67 82 67.82% 6440 64 40 64.40% globe mutants diseases epidemics COVID1 1 COVID- SARS-CoV 15 7 4 49. 678 6 8 67.82 644 64.40 67.8 64.4 67. 64.

Resumo Apesar da unidade global contra a pandemia de COVID-19, a ameaça das variantes do SARS-CoV-2 na vida do ser humano ainda não acabou. A pandemia de SARS-CoV-2 alertou para a necessidade de detecção viral rápida o mais cedo possível. Para lidar com o cenário de expansão gradual do SARS-CoV-2, o diagnóstico preciso é um fator extremamente crucial que deve ser observado pelas organizações internacionais de saúde. Pesquisa limitada seguida de comercialização esporádica de kits de detecção farmacêutica rápida de SARS-CoV-2 levanta questões críticas contra a garantia de qualidade e as medidas de controle de qualidade. Aqui, objetivamos questionar a eficácia e a análise de especificidade dos kits farmacêuticos de detecção rápida de SARS-CoV-2 (baseados em swab nasofaríngeo) usando a técnica de reação em cadeia da polimerase em tempo real padrão-ouro convencional (aprovado pelo USFDA). Um estudo transversal foi realizado em 1.500 pacientes suspeitos de SARS-CoV-2. Cem pacientes confirmados por PCR em tempo real foram avaliados para kits farmacêuticos de RDT baseados em kits baseados em swabs nasofaríngeas. A análise do kit de diagnóstico rápido baseado em swab nasofaríngeo SARS-CoV-2 (NSP RDTs) mostrou 78% de reatividade. Entre os indivíduos negativos confirmados por PCR em tempo real, 49,3% representaram falsa positividade. A análise preditiva positiva revelou 67,82%, enquanto os valores preditivos negativos foram de 64,40%. Os NSP RDTs mostraram sensibilidades e especificidades limitadas em comparação com a PCR em tempo real padrão-ouro. A detecção válida e autêntica do SARS-CoV-2 é considerada necessária para a vigilância precisa de COVID-19 em todo o mundo. O estudo atual destaca as possíveis consequências da detecção inadequada de SARS-CoV-2 e novos mutantes emergentes, comprometendo doenças evitáveis por vacina. O estudo atual enfatiza a necessidade de alertar autoridades superiores, incluindo organizações estratégicas, para projetar medidas adequadas para prevenir futuras epidemias de SARS-CoV-2. COVID19, COVID19 COVID 19, 19 SARSCoV2 SARSCoV SARS CoV 2 SARS-CoV- acabou possível SARSCoV2, 2, saúde Aqui padrãoouro padrão ouro aprovado USFDA. USFDA . USFDA) 1500 1 500 1.50 SARSCoV2. 2. nasofaríngeas 78 reatividade 493 49 3 49,3 positividade 6782 67 82 67,82% 6440 64 40 64,40% padrãoouro. ouro. COVID-1 mundo emergentes vacina superiores estratégicas COVID1 SARS-CoV 150 50 1.5 7 4 49, 678 6 8 67,82 644 64,40 COVID- 15 5 1. 67,8 64,4 67, 64,

ABSTRACT Background: Helicobacter pylori is an etiologic agent of gastroduodenal diseases. The microorganism, considered a type I carcinogen, affects about 50% of the global population. H. pylori virulence factors are determinant for the clinical outcome of the infection. The outer inflammatory protein A (oipA) gene encodes an outer membrane adhesin and is related to severe gastropathies, such as gastric cancer. Objective: The aim of this study was to evaluate the association of the oipA gene with the severity of gastroduodenal diseases in dyspeptic patients in region Central Brazil. Methods: The polymerase chain reaction (PCR) was used to determine the presence of H. pylori. Samples positives were used for molecular screening of the oipA gene. Gastropathies were categorized as non-severe and severe diseases. Results: Approximately 68% of patients had H. pylori and 36% were infected with H. pylori oipA+ strains. Infection was significantly associated in patients aged over 44 years (P=0.004). However, there was no association between oipA and patients’ age (P=0.89). Approximately 46% of patients infected with oipA+ strains had some severe illness. Gastric adenocarcinoma was the most frequent severe gastropathy. The H. pylori oipA genotype was inversely associated with the severity of gastroduodenal diseases (OR=0.247, 95%CI: 0.0804-0.7149 and P=0.007). Conclusion: The characterization of possible molecular markers will contribute to personalized medicine, impacting the prognosis of patients. Background microorganism carcinogen 50 population H infection (oipA gastropathies cancer Objective Brazil Methods PCR (PCR nonsevere non Results 68 36 4 P=0.004. P0004 P P=0.004 . 0 004 (P=0.004) However P=0.89. P089 P=0.89 89 (P=0.89) 46 illness gastropathy OR=0.247, OR0247 OR 247 (OR=0.247 95%CI 95CI CI 95 0.08040.7149 0080407149 0.0804 0.7149 0804 7149 0.0804-0.714 P=0.007. P0007 P=0.007 007 P=0.007) Conclusion medicine 5 6 3 P000 P=0.00 00 (P=0.004 P08 P=0.8 8 (P=0.89 OR=0.247 OR024 24 (OR=0.24 9 08040 0.08040.714 008040714 00804 0.080 07149 0.714 080 714 0.0804-0.71 P00 P=0.0 (P=0.00 P0 P=0. (P=0.8 OR=0.24 OR02 2 (OR=0.2 0.08040.71 00804071 0080 0.08 0714 0.71 08 71 0.0804-0.7 (P=0.0 P=0 (P=0. OR=0.2 OR0 (OR=0. 0.08040.7 0080407 008 0.0 071 0.7 7 0.0804-0. P= (P=0 OR=0. (OR=0 0.08040. 008040 0. 07 0.0804-0 (P= OR=0 (OR= 0.08040 0.0804- (P OR= (OR

RESUMO Contexto: Helicobacter pylori é um agente etiológico de doenças gastroduodenais. O microrganismo, considerado cancerígeno tipo I, afeta cerca de 50% da população mundial. Os fatores de virulência do H. pylori são determinantes para o desfecho clínico da infecção. O gene da proteína inflamatória externa A (oipA) codifica uma adesina da membrana externa e está relacionado a gastropatias severas, como o câncer gástrico. Objetivo: O objetivo deste estudo foi avaliar a associação do gene oipA com a gravidade das doenças gastroduodenais em pacientes dispépticos na região Brasil Central. Métodos: A reação em cadeia da polimerase (PCR) foi utilizada para determinar a presença de H. pylori. Amostras positivas foram utilizadas para triagem molecular do gene oipA. As gastropatias foram categorizadas como doenças não severas e severas. Resultados: Aproximadamente 68% dos pacientes apresentaram H. pylori e 36% estavam infectados com cepas H. pylori oipA+. A infecção foi significativamente associada em pacientes com idade superior a 44 anos (P=0,004). No entanto, não houve associação entre oipA e a idade dos pacientes (P=0,89). Aproximadamente 46% dos pacientes infectados com cepas oipA+ tiveram alguma doença severa. O adenocarcinoma gástrico foi a gastropatia severa mais frequente. O genótipo oipA de H. pylori foi inversamente associado à gravidade das doenças gastroduodenais (OR=0,247, IC95%: 0,0804-0,7149 P=0,007). Conclusão: A caracterização de possíveis marcadores moleculares contribuirá para a medicina personalizada, impactando no prognóstico dos pacientes. Contexto microrganismo I 50 mundial H (oipA Objetivo Central Métodos PCR (PCR Resultados 68 36 4 P=0,004. P0004 P P=0,004 . 0 004 (P=0,004) entanto P=0,89. P089 P=0,89 89 (P=0,89) 46 frequente OR=0,247, OR0247 OR 247 (OR=0,247 IC95% IC95 IC 0,08040,7149 0080407149 0,0804 0,7149 0804 7149 0,0804-0,714 P=0,007. P0007 P=0,007 007 P=0,007) Conclusão personalizada 5 6 3 P000 P=0,00 00 (P=0,004 P08 P=0,8 8 (P=0,89 OR=0,247 OR024 24 (OR=0,24 IC9 08040 0,08040,714 008040714 00804 0,080 07149 0,714 080 714 0,0804-0,71 P00 P=0,0 (P=0,00 P0 P=0, (P=0,8 OR=0,24 OR02 2 (OR=0,2 0,08040,71 00804071 0080 0,08 0714 0,71 08 71 0,0804-0,7 (P=0,0 P=0 (P=0, OR=0,2 OR0 (OR=0, 0,08040,7 0080407 008 0,0 071 0,7 7 0,0804-0, P= (P=0 OR=0, (OR=0 0,08040, 008040 0, 07 0,0804-0 (P= OR=0 (OR= 0,08040 0,0804- (P OR= (OR

ABSTRACT: Trypanosoma evansi, the hemoflagellate pathogen that causes “surra,” is a protozoan that infects the widest variety of mammals worldwide, primarily horses, camels, dogs, and wild animals. Cases of canine trypanosomiasis caused by T.evansi have been reported in the Brazilian pantonal region. This study determined the prevalence of T.evansi and investigate risk factors. The study used blood samples from dogs in the municipality of Barão de Melgaço in the pantonal of the state of Mato Grosso, Brazil. The owner was given a structured epidemiological questionnaire containing information about the risk factors. The quantitative polymerase chain reaction technique was used to detect T.evansi DNA using species-specific oligonucleotides TevF and TevR of the gene encoding a 227-bp portion of the glycoprotein of the variant surface (VSG) T.evansi Rode Trypanozoon (RoTat) 1.2. Two (prevalence of 0.5%) genetic materials of T.evansi were reported in the403 samples. Although, no risk factor was associated with infection (P > 0.05), proximity to vegetation and streams, as well as the presence of tabanids, rodents, and marsupials, which are factors in the occurrence of infection, were observed in positive dogs, implying that the municipality of Barão de Melgaço has epidemiological characteristics that allow canine infection by T.evansi. ABSTRACT evansi surra, surra “surra, worldwide horses camels animals Tevansi T region Grosso Brazil speciesspecific species specific 227bp bp 227 VSG (VSG RoTat (RoTat 12 1 2 1.2 0.5% 05 0 5 the40 Although P 0.05, 005 0.05 , 0.05) streams tabanids rodents marsupials “surra 22 1. 0.5 the4 00 0.0 0.

RESUMO: Trypanosoma evansi, o patógeno hemoflagelado que causa a “surra”, é um protozoário que infecta a mais ampla variedade de mamíferos em todo o mundo, principalmente cavalos, camelos, cães e animais selvagens. Casos de tripanossomíase canina causada por T. evansi têm sido relatados na região pantaneira brasileira. Este estudo tem como objetivo determinar a prevalência de T. evansi e investigar fatores de risco. O estudo utilizou amostras de sangue de cães do município de Barão de Melgaço, no pantanal do estado de Mato Grosso, Brasil. O proprietário recebeu um questionário epidemiológico estruturado contendo informações sobre os fatores de risco. A técnica quantitativa de reação em cadeia da polimerase foi utilizada para detectar DNA de T. evansi utilizando oligonucleotídeos específicos da espécie TevF e TevR do gene que codifica uma porção de 227 pb da glicoproteína da superfície variante (VSG) T. evansi Rode Trypanozoon (RoTat) 1.2. Dois (prevalência de 0,5%) materiais genéticos de T. evansi foram encontrados nas 403 amostras. Embora nenhum fator de risco tenha sido associado à infecção (P > 0,05), a proximidade de vegetação e riachos, bem como a presença de tabanídeos, roedores e marsupiais, fatores na ocorrência de infecção, foram observadas em cães positivos, implicando que o município de Barão de Melgaço apresenta características epidemiológicas que permitem a infecção canina por T. evansi. RESUMO surra, surra , “surra” mundo cavalos camelos selvagens T brasileira Grosso Brasil 22 VSG (VSG RoTat (RoTat 12 1 2 1.2 0,5% 05 0 5 40 P 0,05, 005 0,05 0,05) riachos tabanídeos marsupiais positivos “surra 1. 0,5 4 00 0,0 0,

Abstract The paper presents data on phytosanitary monitoring of garden cenoses for fire blight in the Turkestan, Zhambyl, and Almaty regions of Kazakhstan. The purpose of this study is to assess the phytosanitary situation in various regions of Kazakhstan, determine the extent of fire blight spread, and isolate and identify the fire blight pathogen. During the study, methods such as hypersensitivity, pathogenicity, and fluorescent simplification-based specific hybridization polymerase chain reaction (FLASH-PCR) were used. It was found that in all the surveyed areas, disease foci were identified. For the first time, the fire blight pathogen was detected on fruit crops such as plum, peach, cherry plum, and quince, as well as on wild apricots. 274 plant samples were collected from which microorganisms were isolated. Isolates related to the fire blight pathogen Erwinia amylovora were identified by methods of hypersensitivity, pathogenicity, and FLASH-PCR diagnostics. Of the 156 isolates of microorganisms isolated from apple tree plant samples, 21 inhibited the in vitro growth of E. amylovora to varying degrees. Isolates 16.2 and 19.2 with maximum antagonistic activity were selected, where the pathogen growth inhibition zones were 52.2 ± 2.58 mm and 45.6 ± 0.55 mm, respectively. Based on the obtained sequence of nucleotides of the 16SpRNA gene site, it was found that the selected isolates with high antagonistic activity belonged to the Pseudomonas genus. In the future, based on these isolates, a new biological product for fire blight control can be created and adapted to the natural and climatic conditions of Kazakhstan. Turkestan Zhambyl Kazakhstan spread hypersensitivity pathogenicity simplificationbased simplification FLASHPCR FLASH PCR (FLASH-PCR used areas time plum peach quince apricots 27 diagnostics 15 2 E degrees 162 16 16. 192 19 19. 522 52 52. 258 58 2.5 456 45 6 45. 055 0 55 0.5 respectively SpRNA site genus future 1 5 25 2. 4 05 0.

Resumo O presente artigo apresenta dados sobre o monitoramento fitossanitário da biocenose de um jardim em relação à doença do fogo bacteriano nas regiões do Turquestão, Zhambyl e Almaty no Cazaquistão. O objetivo deste estudo é avaliar a situação fitossanitária em diversas regiões do Cazaquistão, além de determinar a extensão da propagação, isolar e identificar o patógeno da doença do fogo bacteriano. Durante este estudo, foram usados métodos como hipersensibilidade, patogenicidade e reação em cadeia da polimerase com hibridização específica baseada em simplificação fluorescente (FLASH-PCR). Foram identificados focos da doença em todas as áreas pesquisadas. Pela primeira vez, o patógeno da doença do fogo bacteriano foi detectado em culturas de frutas como ameixa, pêssego, abrunheiro-de-jardim e marmelo, bem como em damascos silvestres. Foram coletadas 274 amostras de plantas das quais foram isolados os microrganismos. Os isolados relacionados ao patógeno Erwinia amylovora foram identificados por métodos de hipersensibilidade, patogenicidade e diagnóstico com FLASH-PCR. Dos 156 microrganismos isolados de amostras de macieira, 21 inibiram o crescimento in vitro de E. amylovora em graus variados. Os isolados 16.2 e 19.2 com máxima atividade antagônica foram selecionados, apresentando zonas de inibição do crescimento do patógeno de 52,2 ± 2,58 mm e 45,6 ± 0,55 mm, respectivamente. Com base na sequência obtida de nucleotídeos do local do gene 16SpRNA, verificou-se que os isolados selecionados com alta atividade antagônica pertenciam ao gênero Pseudomonas. Com base nos isolados supracitados, um novo produto biológico para o controle da doença do fogo bacteriano poderá ser criado no futuro, estando adaptado às condições naturais e climáticas do Cazaquistão. Turquestão Cazaquistão propagação hipersensibilidade FLASHPCR. FLASHPCR FLASH PCR . (FLASH-PCR) pesquisadas vez ameixa pêssego abrunheirodejardim abrunheiro marmelo silvestres 27 PCR. FLASH-PCR 15 macieira 2 E variados 162 16 16. 192 19 19. 522 52 52, 258 58 2,5 456 45 6 45, 055 0 55 0,5 respectivamente 16SpRNA SpRNA verificouse verificou se Pseudomonas supracitados futuro (FLASH-PCR 1 5 25 2, 4 05 0,

Abstract Sand flies, vectors capable of transmitting Leishmania spp. and causing leishmaniasis, have been a concern in the central region of Rio Grande do Sul, where canine leishmaniasis (CanL) has been documented since 1985. Notably, there has been a surge in CanL cases since 2017, with two autochthonous cases of human visceral leishmaniasis reported in the area in 2021. This study aimed to identify the sand fly fauna potentially involved in disease transmission. Modified Centers for Disease Control light traps were deployed in three neighborhoods of the city where CanL cases had been previously reported, spanning January 2021 to December 2022. Of the 89 collections conducted, 119 sand flies belonging to five species were captured: Pintomyia fischeri (76/119, 63.86%), Migonemyia migonei (23/119, 19.33%), Lutzomyia longipalpis (16/119, 13.45%), Brumptomyia sp. (2/119, 1.68%), and Psathyromyia lanei (2/119, 1.68%), predominantly between February and April in 2021 and 2022. Polymerase chain reaction testing on all female specimens yielded negative results for Leishmania spp. DNA. Although Leishmania spp. was not detected in these vectors, these findings underscore the imperative to implement measures aimed at curtailing the proliferation of these insects. spp Sul (CanL 1985 Notably 2017 transmission 202 2022 8 conducted 11 captured 76/119, 76119 76 (76/119 63.86%, 6386 63.86% , 63 86 63.86%) 23/119, 23119 23 (23/119 19.33%, 1933 19.33% 19 33 19.33%) 16/119, 16119 16 (16/119 13.45%, 1345 13.45% 13 45 13.45%) sp 2/119, 2119 2 (2/119 1.68%, 168 1.68% 1 68 1.68%) DNA insects 198 201 20 76/119 7611 7 (76/11 638 63.86 6 23/119 2311 (23/11 193 19.33 3 16/119 1611 (16/11 134 13.45 4 2/119 211 (2/11 1.68 76/11 761 (76/1 63.8 23/11 231 (23/1 19.3 16/11 161 (16/1 13.4 2/11 21 (2/1 1.6 76/1 (76/ 63. 23/1 (23/ 19. 16/1 (16/ 13. 2/1 (2/ 1. 76/ (76 23/ (23 16/ (16 2/ (2 (7 (1 (

Resumo Os flebotomíneos, vetores capazes de transmitir Leishmania spp. e causar leishmaniose, têm sido uma preocupação na região central do Rio Grande do Sul, onde a leishmaniose canina (CanL) é documentada desde 1985. Notavelmente, houve um aumento nos casos de CanL desde 2017, com dois casos autóctones de leishmaniose visceral humana relatados na área, em 2021. Este estudo teve como objetivo identificar a fauna de flebotomíneos potencialmente envolvida na transmissão da doença. Armadilhas luminosas modificadas, do Centro de Controle de Doenças, foram implantadas em três bairros da cidade onde casos de CanL haviam sido relatados anteriormente, no período de janeiro de 2021 a dezembro de 2022. Das 89 coletas realizadas, 119 flebotomíneos de cinco espécies foram capturados: Pintomyia fischeri (76/119, 63,86%), Migonemyia migonei (23/119, 19,33%), Lutzomyia longipalpis (16/119, 13,45%), Brumptomyia sp. (2/119, 1,68%) e Psathyromyia lanei (2/119, 1,68%), predominantemente, entre fevereiro e abril de 2021 e 2022. Testes de reação em cadeia da polimerase em todos os espécimes fêmeas resultaram negativos para DNA de Leishmania spp. Embora Leishmania spp. não tenha sido detectada nesses vetores, esses achados destacam a necessidade imperativa de implementar medidas destinadas a conter a proliferação desses insetos. spp Sul (CanL 1985 Notavelmente 2017 área doença modificadas Doenças anteriormente 202 2022 8 realizadas 11 capturados 76/119, 76119 76 (76/119 63,86%, 6386 63,86% , 63 86 63,86%) 23/119, 23119 23 (23/119 19,33%, 1933 19,33% 19 33 19,33%) 16/119, 16119 16 (16/119 13,45%, 1345 13,45% 13 45 13,45%) sp 2/119, 2119 2 (2/119 1,68% 168 1 68 1,68%, predominantemente insetos 198 201 20 76/119 7611 7 (76/11 638 63,86 6 23/119 2311 (23/11 193 19,33 3 16/119 1611 (16/11 134 13,45 4 2/119 211 (2/11 1,68 76/11 761 (76/1 63,8 23/11 231 (23/1 19,3 16/11 161 (16/1 13,4 2/11 21 (2/1 1,6 76/1 (76/ 63, 23/1 (23/ 19, 16/1 (16/ 13, 2/1 (2/ 1, 76/ (76 23/ (23 16/ (16 2/ (2 (7 (1 (

Abstract The work aims to analyze the associations of polymorphic variants of the PRL and BLG genes with resistance and susceptibility to mastitis in Holstein cows. The experimental study consisted of the selection of biomaterial samples from 250 heads of Holstein cows aged 3 years divided into two groups (healthy and with a confirmed diagnosis of mastitis). The determination of animal genotypes was carried out using polymerase chain reaction and restriction fragment length polymorphism. The study of the nature of the association of polymorphic variants of the PRL and BLG gene with resistance/increased risk of mastitis established a significant deviation from the theoretically expected distribution of bBLG-HaeIII genotypes in the group of animals suffering from mastitis (the value of χ2 was 0.24). The bBLG-HaeIIIBB genotype can act as a marker of an increased risk of developing mastitis in Holstein cows; its frequency in the group of sick animals exceeds the frequency in the control group by more than 2 times (44.0 compared to 17.0%, respectively). The bBLG-HaeIIIAB genotype is significantly associated with mastitis resistance in Holstein cows; its frequency is 2 times lower than in the control group (28.0 compared to 54.0%). 25 healthy mastitis. . mastitis) polymorphism resistanceincreased bBLGHaeIII bBLG HaeIII χ 0.24. 024 0.24 0 24 0.24) bBLGHaeIIIBB HaeIIIBB 44.0 440 44 (44. 170 17 17.0% respectively. respectively respectively) bBLGHaeIIIAB HaeIIIAB 28.0 280 28 (28. 54.0%. 540 54.0% 54 54.0%) 02 0.2 44. 4 (44 1 17.0 28. (28 54.0 5 0. (4 17. (2 54. (

Resumo O trabalho tem como objetivo analisar as associações de variantes polimórficas dos genes PRL e BLG com resistência e suscetibilidade à mastite em vacas holandesas. O estudo experimental consistiu na seleção de amostras de biomateriais de 250 cabeças de vacas holandesas com 3 anos de idade divididas em dois grupos (saudáveis e com diagnóstico confirmado de mastite). A determinação dos genótipos dos animais foi realizada utilizando reação em cadeia da polimerase e polimorfismo de comprimento de fragmentos de restrição. O estudo da natureza da associação de variantes polimórficas do gene PRL e BLG com resistência/risco aumentado de mastite estabeleceu um desvio significativo da distribuição teoricamente esperada dos genótipos bBLG-HaeIII no grupo de animais que sofrem de mastite (o valor de χ2 foi 0,24). O genótipo bBLG-HaeIIIBB pode atuar como marcador de risco aumentado de desenvolvimento de mastite em vacas holandesas; sua frequência no grupo de animais doentes excede a frequência no grupo controle em mais de duas vezes (44,0% contra 17,0%, respectivamente). O genótipo bBLG-HaeIIIAB está significativamente associado à resistência à mastite em vacas holandesas; sua frequência é duas vezes menor que no grupo controle (28,0% contra 54,0%). 25 saudáveis mastite. . mastite) restrição resistênciarisco bBLGHaeIII bBLG HaeIII o χ 0,24. 024 0,24 0 24 0,24) bBLGHaeIIIBB HaeIIIBB 44,0% 440 44 (44,0 170 17 17,0% respectivamente. respectivamente respectivamente) bBLGHaeIIIAB HaeIIIAB 28,0% 280 28 (28,0 54,0%. 540 54,0% 54 54,0%) 2 02 0,2 44,0 4 (44, 1 17,0 28,0 (28, 54,0 5 0, 44, (44 17, 28, (28 54, (4 (2 (

Abstract The aim of this study was to investigate the DGAT1 gene polymorphism and its effects on lamb weight in kazakh and tajik sheep breeds. A total of 97 blood samples were collected from purebred (еdilbay х еdilbay) and crossbred lambs (еdilbay x gissar) breеd by the Baiserke Agro Scientific and Production Center in the Talgar District of the Almaty Region of Kazakhstan. Animals were genotyped for DGAT1-AluI polymorphism using the polymerase chain reaction-restriction length polymorphism (PCR-RFLP) method. The result of PCR-RFLP showed that purebred (еdilbay х еdilbay) sheep had three genotypes (CC, CT and TT) and crossbred sheep had two genotypes (CC and CT). The predominant genotype was CC with a frequency of 0.70 and 0.58 in purebred sheep and crossbred sheep breeds, respectively. The DGAT1 gene showed no significant association with live weight of lambs at different times in both breeds studied. However, the study showed that the CC genotype produced higher live weight at day 60 in purebred sheep (CC: 33,668 kg and CT: 32,444) and at day 120 (CC: 41,487 and CT: 40,929) in crossbred lambs. The present study was the first to investigate the polymorphism and relationships between genotypes and lamb live weights for DGAT1 gene in sheep breeds, purebred and crossbred. We conclude that further comprehensive investigations should be done for the exact evidence of the effects of DGAT1/Aluı polymorphism on lamb live weights. DGAT 9 еdilbay gissar Kazakhstan DGAT1AluI DGATAluI AluI reactionrestriction reaction restriction PCRRFLP PCR RFLP (PCR-RFLP method CC, TT CT. . CT) 070 0 70 0.7 058 58 0.5 respectively studied However 6 33668 33 668 33,66 32,444 32444 32 444 12 41487 41 487 41,48 40,929 40929 40 929 DGAT1Aluı DGATAluı Aluı 07 7 0. 05 5 3366 3 66 33,6 32,44 3244 44 1 4148 4 48 41,4 40,92 4092 92 336 33, 32,4 324 414 41, 40,9 409 32, 40,

Resumo O objetivo deste estudo foi investigar o polimorfismo do gene DGAT1 e seus efeitos no peso do cordeiro em duas raças de ovelhas cazaques e tadjiques. Um total de 97 amostras de sangue foram coletadas de cordeiros de raça pura (еdilbay × еdilbay) e mestiços (еdilbay × gissar) criados pelo Baiserke Agro Scientific and Production Center no distrito de Talgar da região de Almaty do Cazaquistão. Os animais foram genotipados para o polimorfismo DGAT1-AluI usando o método de reação em cadeia da polimerase-polimorfismo de comprimento de restrição (PCR-RFLP). O resultado da PCR-RFLP mostrou que ovelhas de raça pura (еdilbay × еdilbay) tinham três genótipos (CC, CT e TT) e ovelhas mestiças tinham dois genótipos (CC e CT). O genótipo predominante foi CC com uma frequência de 0,70 e 0,58 em ovelhas de raça pura e mestiças, respectivamente. O gene DGAT1 não mostrou associação significativa com o peso vivo dos cordeiros, em diferentes momentos, em ambas as raças estudadas. No entanto, o estudo mostrou que o genótipo CC produziu maior peso vivo no dia 60 em ovelhas de raça pura (CC: 33,668 kg e CT: 32,444 kg) e, no dia 120, (CC: 41,487 kg e CT: 40,929 kg) em cordeiros mestiços. O presente estudo foi o primeiro a investigar o polimorfismo e as relações entre genótipos e pesos vivos de cordeiros para o gene DGAT1 em raças de ovelhas, puras e mestiças. Concluímos que investigações mais abrangentes devem ser feitas para a evidência exata dos efeitos do polimorfismo DGAT1/AluI nos pesos vivos dos cordeiros. DGAT tadjiques 9 еdilbay gissar Cazaquistão DGAT1AluI DGATAluI AluI polimerasepolimorfismo polimerase PCRRFLP. PCRRFLP PCR RFLP . (PCR-RFLP) CC, TT CT. CT) 070 0 70 0,7 058 58 0,5 respectivamente momentos estudadas entanto 6 33668 33 668 33,66 32444 32 444 32,44 120 41487 41 487 41,48 40929 40 929 40,92 (PCR-RFLP 07 7 0, 05 5 3366 3 66 33,6 3244 44 32,4 12 4148 4 48 41,4 4092 92 40,9 336 33, 324 32, 1 414 41, 409 40,

ABSTRACT Purpose: The regulatory effect of microRNA on diseases has been confirmed. This study aimed to evaluate the expression of microRNA-210-3p in age-related cataracts and assess the effect of abnormal miR-210-3p expressions on H2O2-induced SAR01/04 cells. Methods: Reverse-transcription quantitative polymerase chain reaction method was performed to assess the levels of miR-210-3p in aqueous humor samples. Receiver operating characteristic analysis was employed to assess the discrimination ability of miR-210-3p between patients with age-related cataracts and healthy people, and Pearson correlation analysis was used to identify the correlation between miR-210-3p and oxidative stress indices such as superoxide dismutase, glutathione peroxidase, malonaldehyde. Cell counting kit-8 assay and Transwell assay were used to estimate the biological function of H2O2-induced age-related cataract cell model. The levels of oxidative stress indices such as superoxide dismutase, glutathione peroxidase, and malonaldehyde were measured to evaluate the degree of oxidative stress damage in the age-related cataract cell model. The relationship between miR-210-3p and its target gene was verified by luciferase reporter gene analysis. Results: The miR-210-3p expression was elevated in the aqueous humor of patients with age-related cataracts. A high miR-210-3p expression showed a high diagnostic value for age-related cataracts and was significantly associated with the level of oxidative stress markers in patients with age-related cataracts. The inhibition of miR-210-3p can reverse oxidative stress stimulation and adverse effects on H2O2-induced cell function. Conclusions: The results suggested that miR-210-3p could promote cell viability, cell migration, and oxidative stress by targeting autophagy-related gene 7 in in vitro age-related cataract cell model. Purpose confirmed microRNA2103p microRNAp 210 3p p agerelated age related miR2103p miRp miR H2O2induced HOinduced H2O2 induced H O SAR0104 SAR SAR01 04 SAR01/0 cells Methods Reversetranscription Reverse transcription samples people dismutase peroxidase kit8 kit 8 kit- model Results Conclusions viability migration autophagyrelated autophagy 21 HO H2O SAR010 SAR0 0 SAR01/ 2

RESUMO Objetivo: O efeito regulador do microRNA em doenças tem sido confirmado, e este artigo tentou avaliar a expressão do microRNA-210-3p na catarata relacionada à idade e avaliar o efeito da expressão anormal do miR-210-3p em células SAR01/04 induzidas por H2O2. Métodos: O método de transcrição reversa seguida de reação em cadeia da polimerase (RT-PCR) quantitativa foi realizado para avaliar os níveis de miR-210-3p em amostras de humor aquoso. Análise de características operacionais do receptor foi feita para avaliar a capacidade de discriminação do miR-210-3p entre pacientes com catarata relacionada à idade e pessoas saudáveis. A análise de correlação de Pearson identificou a correlação do miR-210-3p e índices de estresse oxidativo, como superóxido dismutase, glutationa peroxidase, malonaldeído. O ensaio de contagem de células kit-8 (cck-8) e o ensaio no sistema Transwell foram utilizados para estimar a função biológica do formato de células de catarata relacionada com a idade induzida por H2O2. Os níveis de índices de estresse oxidativo como superóxido dismutase, glutationa peroxidase e malonaldeído foram detectados para avaliar o grau de dano do estresse oxidativo em formato de células de catarata relacionada à idade. A relação entre miR-210-3p e seu gene alvo foi verificada por análise do gene repórter luciferase. Resultados: A expressão miR-210-3p foi elevada no humor aquoso de pacientes com catarata relacionada à idade. A expressão miR-210-3p altamente expressiva mostrou alto valor diagnóstico para catarata relacionada à idade e foi significativamente associado ao nível de marcadores de estresse oxidativo em pacientes com catarata relacionada à idade. A inibição de miR-210-3p pode reverter a estimulação do estresse oxidativo e os efeitos adversos da função celular induzida por H2O2. Conclusões: Esses dados sugeriram que a expressão miR-210-3p poderia promover a viabilidade celular, migração celular e estresse oxidativo ao direcionar genes ATG 7 relacionados à autofagia em modelo in vitro de células de catarata relacionadas à idade. Objetivo confirmado microRNA2103p microRNAp 210 3p p miR2103p miRp miR SAR0104 SAR SAR01 04 SAR01/0 H2O2 HO H Métodos RTPCR RT PCR (RT-PCR saudáveis dismutase kit8 kit 8 kit- cck8 cck (cck-8 luciferase Resultados Conclusões 21 SAR010 SAR0 0 SAR01/ H2O (cck- 2 (cck

ABSTRACT Purpose: This study aimed to evaluate the pre-sence of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) RNA in the ocular surface of individuals clinically suspected of coronavirus disease 2019 (COVID-19) and determine the accuracy of different approaches of molecular testing on the ocular surface based on the nasopharyngeal positivity status for COVID-19. Methods: A total of 152 individuals with suspected COVID-19 symptoms who simultaneously underwent nasopharyngeal and two different tear film collection techniques for quantitative reverse-transcriptase polymerase chain reaction (RT-qPCR) were included. Tears were collected and randomized: one eye had the filter strip for the Schirmer test and the contralateral eye had conjunctival swab/cytology in the inferior fornix. All patients underwent slit lamp biomicroscopy. The accuracy of various ocular surface collection techniques used for the detection of SARS-CoV-2 RNA was determined. Results: Of the 152 patients enrolled in the study, 86 (56.6%) had COVID-19 confirmed by nasopharyngeal PCR. Both tear film collection techniques detected viral particles: the Schirmer test was positive in 16.3% (14/86) and the conjunctival swab/cytology in 17.4% (15/86), with no statistically significant differences. No positive ocular tests were found among those with negative nasopharyngeal PCR tests. The overall agreement of the ocular tests was 92.7%, and in combination, the sensitivity would increase to 23.2%. The mean cycle threshold values in the nasopharyngeal, Schirmer, and conjunctival swab/cytology tests were 18.2 ± 5.3, 35.6 ± 1.4, and 36.4 ± 3.9, respectively. Compared with the nasopharyngeal test, the Schirmer (p=0.001) and conjunctival swab/cytology (p<0.001) tests had significantly different Ct values. Conclusion: The Schirmer (16.3%) and conjunctival swab (17.4%) tests were comparably capable of detecting SARS-CoV-2 RNA in the ocular surface by RT-PCR accurately based on nasopharyngeal status and demonstrated indistinct sensitivity and specificity. Simultaneous specimen sampling and processing from the nasopharyngeal, Schirmer, and conjunctival swab/cytology tests demonstrated significantly lower viral load in both ocular surface approaches than in the nasopharyngeal test. Ocular manifestations detected by slit lamp biomicroscopy were not associated with ocular RT-PCR positivity. Purpose presence pre sence SARSCoV2 SARSCoV SARS CoV (SARS-CoV-2 201 COVID19 COVID 19 (COVID-19 COVID19. 19. Methods 15 COVID-1 reversetranscriptase reverse transcriptase RTqPCR RT qPCR (RT-qPCR included randomized swabcytology cytology fornix SARS-CoV- determined Results 8 56.6% 566 56 6 (56.6% particles 163 16 3 16.3 14/86 1486 14 (14/86 174 17 4 17.4 15/86, 1586 15/86 , (15/86) differences 927 92 7 92.7% combination 232 23 23.2% 182 18 18. 53 5 5.3 356 35 35. 1 1.4 364 36 36. 39 9 3.9 respectively p=0.001 p0001 p 0 001 (p=0.001 p<0.001 (p<0.001 Conclusion (16.3% (17.4% RTPCR specificity (SARS-CoV- 20 COVID1 (COVID-1 COVID- SARS-CoV 56.6 (56.6 16. 14/8 148 (14/8 17. 158 15/8 (15/86 92.7 23.2 5. 1. 3. p=0.00 p000 00 (p=0.00 p<0.00 (p<0.00 (16.3 (17.4 (SARS-CoV (COVID- 56. (56. 14/ (14/ 15/ (15/8 92. 23. p=0.0 p00 (p=0.0 p<0.0 (p<0.0 (16. (17. (COVID (56 (14 (15/ p=0. p0 (p=0. p<0. (p<0. (16 (17 (5 (1 (15 p=0 (p=0 p<0 (p<0 ( p= (p= p< (p< (p

RESUMO Objetivo: Avaliar a presença de RNA de coronavírus 2 causador de síndrome respiratória aguda grave (SARS-CoV-2) na superfície ocular de indivíduos clinicamente suspeitos com COVID-19 e determinar a precisão de diferentes abordagens de testes moleculares na superfície ocular com base no status de positividade do RT-qPCR de nasofaringe para COVID-19. Métodos: 152 indivíduos com sintomas suspeitos para a COVID-19 foram submetidos a coleta de reação em cadeia da polimerase de nasofaringe simultaneamente a duas técnicas diferentes de coleta de filme lacrimal para RT-qPCR: aleatoriamente, um olho com a tira filtro do teste de Schirmer e, o olho contralateral, com citologia (swab) conjuntival no fórnice inferior. Todos os indivíduos foram submetidos à biomicroscopia com lâmpada de fenda. Resultados: Dos 152 pacientes, 86 (56,6%) tiveram a COVID-19 confirmada por PCR de nasofaringe. Ambas as técnicas de coleta detectaram partículas virais: o teste de Schirmer foi positivo em 16,3% (14/86) e a citologia conjuntival em 17,4% (15/86), sem diferenças estatisticamente significativas. Não houve testes oculares positivos entre aqueles com reação em cadeia da polimerase de nasofaringe negativo. A concordância geral dos testes oculares foi de 92,7% e, em combinação, a sensibilidade aumentaria para 23,2%. Os valores médios do limiar de ciclo nos testes de nasofaringe, Schirmer e citologia conjuntival foram 18,2 ± 5,3, 35,6 ± 1,4 e 36,4 ± 3,9, respectivamente. Conclusão: Os testes de Schirmer (16,3%) e swab conjuntival (17,4%) foram igualmente capazes de detectar RNA de SARS-CoV-2 na superfície ocular por RT-PCR e demonstraram sensibilidade e especificidade indistintas. A coleta simultânea de amostras ao processamento dos testes de RT-PCR de nasofaringe, Schirmer e citologia (swab) conjuntival demonstraram carga viral significativamente menor em ambas as abordagens da superfície ocular em comparação com o teste de nasofaringe. As manifestações oculares detectadas pela biomicroscopia com lâmpada de fenda não foram claramente associadas à positividade do RT-PCR ocular. Objetivo SARSCoV2 SARSCoV SARS CoV (SARS-CoV-2 COVID19 COVID 19 COVID-1 RTqPCR RT qPCR COVID19. 19. Métodos 15 aleatoriamente contralateral (swab inferior Resultados pacientes 8 56,6% 566 56 6 (56,6% virais 163 16 3 16,3 14/86 1486 14 (14/86 174 17 4 17,4 15/86, 1586 15/86 , (15/86) significativas negativo 927 92 7 92,7 combinação 232 23 23,2% 182 18 18, 53 5 5,3 356 35 35, 1 1, 364 36 36, 39 9 3,9 respectivamente Conclusão (16,3% (17,4% SARS-CoV- RTPCR indistintas (SARS-CoV- COVID1 COVID- 56,6 (56,6 16, 14/8 148 (14/8 17, 158 15/8 (15/86 92, 23,2 5, 3, (16,3 (17,4 SARS-CoV (SARS-CoV 56, (56, 14/ (14/ 15/ (15/8 23, (16, (17, (56 (14 (15/ (16 (17 (5 (1 (15 (

ABSTRACT This report was aimed at presenting a case of neurotrophic keratitis and concomitant SARS-CoV-2 infection in a patient who has recently undergone a corneal DALK transplant. One month after corneal transplantation with adequate corneal epithelialization, the patient presented neurotrophic keratitis with a torpid course of the corneal transplant coinciding with a SARS-CoV-2 infection, with an excessive host immune response. In addition, the patient presented a re-positivization of nasopharyngeal polymerase chain reaction of SARS-CoV-2 with past disease after starting treatment with autologous serum eye drops. The implications at the ophthalmological level of SARS-CoV-2 infection may be clarified as the time the illness progresses and we learn more about how it acts. In this case, the disparity of signs and symptoms, the antecedent of corneal surgery, and the possibility of a herpetic infection as a cause of the primary leukoma suggested neurotrophic keratitis. Nonetheless, the involvement of systemic SARS-CoV-2 infection in the process, triggering an excessive host immune response at the corneal level with an increase in inflammatory cytokines must be taken into account. No relationship was found between treatment with autologous serum and re-positivization of nasopharyngeal polymerase chain reaction, presenting the patient a favorable response to treatment. SARSCoV2 SARSCoV SARS CoV 2 SARS-CoV- epithelialization addition repositivization re positivization drops acts symptoms surgery Nonetheless process account SARS-CoV

RESUMO O objetivo deste relato foi apresentar um caso de ceratite neurotrófica e infecção concomitante por SARS-CoV-2 em paciente submetido recentemente a transplante de córnea DALK. Um mês após o transplante de córnea com adequada epitelização da córnea, o paciente apresentou ceratite neurotrófica com curso tórpido do transplante de córnea, coincidindo com infecção por SARS-CoV-2, com resposta imune excessiva do hospedeiro. Além disso, o paciente apresentou repositivização da reação em cadeia da polimerase nasofaríngeo de SARS-CoV-2, com doença pregressa após iniciar tratamento com colírio de soro autólogo. As implicações a nível oftalmológico da infecção por SARS-CoV-2, podem ser esclarecidas à medida que a doença progride e aprendemos mais sobre sua forma de atuação. Neste caso, a disparidade de sinais e sintomas, o antecedente de cirurgia de córnea e a possibilidade de infecção herpética como causa do leucoma primário sugeriram ceratite neurotrófica. No entanto, deve-se levar em consideração o envolvimento da infecção sistêmica por SARS-CoV-2 no processo, desencadeando uma resposta imune excessiva do hospedeiro no nível da córnea, com aumento de citocinas inflamatórias. Não foi encontrada relação entre o tratamento com soro autólogo e a repositivização da reação em cadeia da polimerase nasofaríngea, apresentando ao paciente uma resposta favorável ao tratamento. SARSCoV2 SARSCoV SARS CoV 2 SARS-CoV- DALK SARSCoV2, 2, disso atuação sintomas entanto devese deve se processo inflamatórias nasofaríngea SARS-CoV

ABSTRACT During screening laboratory mice (Mus musculus) at the Zoology Department of the College of Science, King Saud University, some tiny oxyurid nematodes were detected from the large intestine of these rodents. Worms were identified using morphological and morphometric description. Furthermore, DNA was extracted from worms and subjected to polymerase chain reaction to amplify 18S rDNA and ITS (ITS1, 5.8S and ITS2) regions. Worms detected from caecum and colon of mice were detected in 80% of mice investigated. Morphologically, worms showed elongated body with tapered anterior end and narrow posterior part with cuticular annulations. Male worms measured 0.71-1.12 (0.90) long and 0.01-0.12 (0.11) wide. Female worms measured 3.12-5.011 (4.30) long and 0.13-0.29 (0.17) wide. Esophagus followed by intestine which opens at the posterior end via anal opening in females and via cloacal opening in males. Males have a single spicule with a gubernaculum and an accessory hook. Females’ uteri were pack with eggs. Data from 18S rDNA revealed a sequence which was identical to Syphacia obvelata in NCBI GenBank. Similarly, sequences from ITS regions grouped with sequences from S. obvelata confirming the morphological identity of the worm. However, it showed 3 mutations at the ITS2 region from related sequences from S. obvelata at NCBI GenBank. Mus musculus Science University rodents description Furthermore S ITS1, ITS1 (ITS1 58S 5 8S 80 investigated Morphologically annulations 0.711.12 071112 0.71 1.12 0 71 1 12 0.71-1.1 0.90 090 90 (0.90 0.010.12 001012 0.01 0.12 01 0.01-0.1 0.11 011 11 (0.11 wide 3.125.011 3125011 3.12 5.011 3.12-5.01 4.30 430 4 30 (4.30 0.130.29 013029 0.13 0.29 13 29 0.13-0.2 0.17 017 17 (0.17 males hook Females eggs GenBank Similarly worm However (ITS 8 711 0.711.1 07111 071 0.7 112 1.1 7 0.71-1. 0.9 09 9 (0.9 010 0.010.1 00101 001 0.0 012 0.1 0.01-0. (0.1 125 3.125.01 312501 312 3.1 5011 5.01 3.12-5.0 4.3 43 (4.3 130 0.130.2 01302 013 029 0.2 2 0.13-0. 0.711. 0711 07 0. 1. 0.71-1 (0. 0.010. 0010 00 0.01-0 3.125.0 31250 31 3. 501 5.0 3.12-5. 4. (4. 0.130. 0130 02 0.13-0 0.711 0.71- (0 0.010 0.01- 3.125. 3125 50 5. 3.12-5 (4 0.130 0.13- ( 3.125 3.12-

RESUMO Durante a triagem de camundongos de laboratório (Mus musculus) no Departamento de Zoologia da Faculdade de Ciências da Universidade King Saud, alguns minúsculos nematoides oxiurídeos foram detectados no intestino grosso desses roedores. Os vermes foram identificados por meio de descrição morfológica e morfométrica. Além disso, o DNA foi extraído dos vermes e submetido à reação em cadeia da polimerase para amplificar as regiões 18S rDNA e ITS (ITS1, 5.8S e ITS2). Os vermes detectados no ceco e no cólon dos camundongos foram detectados em 80% dos camundongos investigados. Morfologicamente, os vermes apresentaram corpo alongado com extremidade anterior afilada e parte posterior estreita com anulações cuticulares. Os vermes machos mediam 0,71-1,12 (0,90) de comprimento e 0,01-0,12 (0,11) de largura. As fêmeas mediram 3,12-5,011 (4,30) de comprimento e 0,13-0,29 (0,17) de largura. O esôfago é seguido pelo intestino, que se abre na extremidade posterior por uma abertura anal nas fêmeas e por uma abertura cloacal nos machos. Os machos têm uma única espícula com um gubernáculo e um gancho acessório. Os úteros das fêmeas estavam repletos de ovos. Os dados do rDNA 18S revelaram uma sequência idêntica à Syphacia obvelata no NCBI GenBank. Da mesma forma, as sequências das regiões ITS foram agrupadas com as sequências de S. obvelata, confirmando a identidade morfológica do verme. No entanto, ele apresentou 3 mutações na região ITS2 em relação às sequências relacionadas de S. obvelata no NCBI GenBank. Mus musculus Saud roedores morfométrica disso S ITS1, ITS1 (ITS1 58S 5 8S ITS2. . ITS2) 80 investigados Morfologicamente cuticulares 0,711,12 071112 0,71 1,12 0 71 1 12 0,71-1,1 0,90 090 90 (0,90 0,010,12 001012 0,01 0,12 01 0,01-0,1 0,11 011 11 (0,11 largura 3,125,011 3125011 3,12 5,011 3,12-5,01 4,30 430 4 30 (4,30 0,130,29 013029 0,13 0,29 13 29 0,13-0,2 0,17 017 17 (0,17 acessório ovos GenBank forma verme entanto (ITS 8 711 0,711,1 07111 071 0,7 112 1,1 7 0,71-1, 0,9 09 9 (0,9 010 0,010,1 00101 001 0,0 012 0,1 0,01-0, (0,1 125 3,125,01 312501 312 3,1 5011 5,01 3,12-5,0 4,3 43 (4,3 130 0,130,2 01302 013 029 0,2 2 0,13-0, 0,711, 0711 07 0, 1, 0,71-1 (0, 0,010, 0010 00 0,01-0 3,125,0 31250 31 3, 501 5,0 3,12-5, 4, (4, 0,130, 0130 02 0,13-0 0,711 0,71- (0 0,010 0,01- 3,125, 3125 50 5, 3,12-5 (4 0,130 0,13- ( 3,125 3,12-

ABSTRACT Objective: To determine the role of the IL8 rs4073 polymorphism in predicting the risk of central nervous system (CNS) toxicity in patients receiving standard pharmacological treatment for multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB). Methods: A cohort of 85 consenting MDR-TB patients receiving treatment with second-line antituberculosis drugs had their blood samples amplified for the IL8 (rs4073) gene and genotyped. All patients were clinically screened for evidence of treatment toxicity and categorized accordingly. Crude and adjusted associations were assessed. Results: The chief complaints fell into the following categories: CNS toxicity; gastrointestinal toxicity; skin toxicity; and eye and ear toxicities. Symptoms of gastrointestinal toxicity were reported by 59% of the patients, and symptoms of CNS toxicity were reported by 42.7%. With regard to the genotypes of IL8 (rs4073), the following were identified: AA, in 64 of the study participants; AT, in 7; and TT, in 11. A significant association was found between the dominant model of inheritance and CNS toxicity for the crude model (p = 0.024; OR = 3.57; 95% CI, 1.18-10.76) and the adjusted model (p = 0.031; OR = 3.92; 95% CI, 1.13-13.58). The AT+TT genotype of IL8 (rs4073) showed a 3.92 times increased risk of CNS toxicity when compared with the AA genotype. Conclusions: The AT+TT genotype has a tendency to be associated with an increased risk of adverse clinical features during MDR-TB treatment. Objective IL rs rs407 (CNS multidrugresistant multidrug resistant MDRTB. MDRTB MDR TB . (MDR-TB) Methods 8 secondline second line (rs4073 genotyped accordingly assessed Results categories toxicities 59 427 42 7 42.7% rs4073, , identified 6 participants AT TT 11 p 0.024 0024 0 024 3.57 357 3 57 95 CI 1.1810.76 1181076 1.18 10.76 1 18 10 76 1.18-10.76 0.031 0031 031 392 92 1.1313.58. 1131358 1.13 13.58 13 58 1.13-13.58) ATTT 3.9 Conclusions rs40 (MDR-TB (rs407 5 4 42.7 0.02 002 02 3.5 35 9 1810 1.1810.7 118107 118 1.1 1076 10.7 1.18-10.7 0.03 003 03 39 1313 1.1313.58 113135 113 1358 13.5 1.13-13.58 3. rs4 (rs40 42. 0.0 00 181 1.1810. 11810 1. 107 10. 1.18-10. 131 1.1313.5 11313 135 13. 1.13-13.5 (rs4 0. 1.1810 1181 1.18-10 1.1313. 1131 1.13-13. (rs 1.181 1.18-1 1.1313 1.13-13 1.18- 1.131 1.13-1 1.13-

RESUMO Objetivo: Determinar o papel do polimorfismo rs4073 do gene IL8 na previsão do risco de toxicidade do sistema nervoso central (SNC) em pacientes em tratamento farmacológico padrão para tuberculose multirresistente (TBMR). Métodos: Amostras de sangue de uma coorte de 85 pacientes com TBMR que assinaram um termo de consentimento livre e esclarecido e que estavam recebendo tratamento com medicamentos antituberculosos de segunda linha foram amplificadas para o gene IL8 (rs4073) e genotipadas. Todos os pacientes foram avaliados clinicamente quanto a evidências de toxicidade do tratamento e categorizados de acordo com os achados. Foram avaliadas as associações brutas e ajustadas. Resultados: As principais queixas enquadraram-se nas seguintes categorias: toxicidade do SNC; toxicidade gastrointestinal; toxicidade cutânea; e toxicidade ocular e ototoxicidade. Sintomas de toxicidade gastrointestinal foram relatados por 59% dos pacientes, e sintomas de toxicidade do SNC foram relatados por 42,7%. Foram identificados os seguintes genótipos de IL8 (rs4073): AA, em 64 dos participantes; AT, em 7; TT, em 11. Houve associação significativa entre o modelo dominante de herança e toxicidade do SNC no modelo bruto (p = 0,024; OR = 3,57; IC95%: 1,18-10,76) e no ajustado (p = 0,031; OR = 3,92; IC95%: 1,13-13,58). O genótipo AT+TT do gene IL8 (rs4073) apresentou risco 3,92 vezes maior de toxicidade do SNC que o genótipo AA. Conclusões: O genótipo AT+TT tende a se associar a um maior risco de características clínicas adversas durante o tratamento da TBMR. Objetivo rs rs407 IL (SNC . (TBMR) Métodos 8 (rs4073 genotipadas achados ajustadas Resultados enquadraramse enquadraram categorias cutânea ototoxicidade 59 427 42 7 42,7% AA 6 participantes AT TT 11 p 0,024 0024 0 024 3,57 357 3 57 IC95% IC95 IC 1,1810,76 1181076 1,18 10,76 1 18 10 76 1,18-10,76 0,031 0031 031 392 92 1,1313,58. 1131358 1,13 13,58 13 58 1,13-13,58) ATTT 3,9 Conclusões rs40 (TBMR (rs407 5 4 42,7 0,02 002 02 3,5 35 IC9 1810 1,1810,7 118107 118 1,1 1076 10,7 1,18-10,7 0,03 003 03 39 9 1313 1,1313,58 113135 113 1358 13,5 1,13-13,58 3, rs4 (rs40 42, 0,0 00 181 1,1810, 11810 1, 107 10, 1,18-10, 131 1,1313,5 11313 135 13, 1,13-13,5 (rs4 0, 1,1810 1181 1,18-10 1,1313, 1131 1,13-13, (rs 1,181 1,18-1 1,1313 1,13-13 1,18- 1,131 1,13-1 1,13-

Resumen: Brasil tiene el segundo mayor número de casos de lepra (enfermedad con carga significativa) del mundo. A pesar de los esfuerzos globales y locales para eliminar ese problema de salud pública, el diagnóstico inadecuado o tardío contribuye a perpetuar su transmisión, sobre todo entre contactos intradomiciliarios. Los exámenes como la prueba rápida de anticuerpos IgM (RT) y la reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real (RT-PCR) se desarrollaron para superar las barreras del diagnóstico precoz de la lepra. El objetivo de este estudio fue analizar la relación de costo-efectividad de un nuevo algoritmo de diagnóstico recomendado por el gobierno brasileño para diagnosticar la lepra en contactos domiciliarios de casos confirmados de lepra, que incluye las pruebas RT y RT-PCR. Se construyó un modelo de árbol de decisión y se adoptó la perspectiva del Sistema Único de Salud (SUS) teniendo en cuenta el periodo de un año. Solo se incluyeron los costos médicos directos relacionados con los exámenes diagnósticos. Se midió la efectividad teniendo en cuenta el número de casos de lepra evitados. Se analizaron distintos escenarios. Se comparó el uso secuencial de RT, baciloscopia y RT-PCR, conforme el Ministerio de Salud recomienda, con un caso base (baciloscopia aislada), y se obtuvo un cociente de costo-efectividad incremental de USD 616,46 por cada caso de lepra evitado. El análisis de sensibilidad univariante mostró que la prevalencia de lepra entre contactos intradomiciliarios fue la variable que más influyó el modelo. Este es el primer modelo económico que analiza un algoritmo diagnóstico de lepra. Los resultados podrán ayudar los gestores a definir políticas y estrategias para erradicar la lepra en Brasil. Resumen enfermedad significativa mundo pública transmisión (RT RTPCR PCR (RT-PCR costoefectividad costo RTPCR. PCR. RT-PCR SUS (SUS año diagnósticos evitados escenarios RTPCR, PCR, recomienda aislada, aislada , aislada) 61646 616 46 616,4 evitado 6164 61 4 616, 6

Abstract: Brazil has the second largest number of leprosy cases (a disease with a significant burden) in the world. Despite global and local efforts to eliminate this public health problem, inadequate or late diagnosis contribute to perpetuate its transmission, especially among household contacts. Tests such as the rapid IgM antibody detection (RT) and real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) were developed to overcome the challenges of early diagnosis of leprosy. This study aimed to analyze the cost-effectiveness of a new diagnostic algorithm recommended by the Brazilian government to diagnose leprosy in household contacts of confirmed leprosy cases, which includes the RT and RT-PCR tests. A decision tree model was constructed and the perspective of the Brazilian Unified National Health System (SUS) and a 1-year time horizon were adopted. Only direct medical costs related to diagnostic tests were included. Effectiveness was measured as the number of avoided undiagnosed leprosy cases. Different scenarios were analyzed. The sequential use of RT, slit-skin smear (SSS) microscopy, and RT-PCR as recommended by the Brazilian Ministry of Health was compared to a base case (isolated SSS microscopy), yielding an incremental cost-effectiveness ratio of USD 616.46 per avoided undiagnosed leprosy case. Univariate sensitivity analysis showed that the prevalence of leprosy among household contacts was the variable that influenced the model the most. This is the first economic model to analyze a diagnostic algorithm of leprosy. Results may aid managers to define policies and strategies to eradicate leprosy in Brazil. Abstract burden world problem transmission (RT realtime real RTPCR PCR (RT-PCR costeffectiveness cost effectiveness SUS (SUS 1year year 1 adopted included analyzed slitskin slit skin (SSS microscopy isolated , microscopy) 61646 616 46 616.4 most 6164 61 4 616. 6

Resumo: O Brasil tem o segundo maior número de casos de hanseníase (doença com carga significativa) do mundo. Apesar dos esforços globais e locais para eliminar esse problema de saúde pública, o diagnóstico inadequado ou tardio contribui para perpetuar sua transmissão, especialmente entre contatos intradomiciliares. Exames como o teste rápido de anticorpos IgM (RT) e a reação em cadeia da polimerase em tempo real (RT-PCR) foram desenvolvidos para superar as barreiras do diagnóstico precoce da hanseníase. Este estudo teve como objetivo analisar a relação custo-efetividade de um novo algoritmo de diagnóstico recomendado pelo governo brasileiro para diagnosticar a hanseníase em contatos domiciliares de casos confirmados de hanseníase, que inclui os testes RT e RT-PCR. Foi construído um modelo de árvore de decisão e adotada a perspectiva do Sistema Único de Saúde (SUS) considerando o período de um ano. Foram incluídos apenas os custos médicos diretos relacionados aos exames diagnósticos. A efetividade foi medida considerando o número de casos evitados de hanseníase. Diferentes cenários foram analisados. O uso sequencial de RT, baciloscopia e RT-PCR, conforme recomendado pelo Ministério da Saúde, foi comparado a um caso base (baciloscopia isolada), obtendo-se uma razão de custo-efetividade incremental de USD 616,46 por caso evitado de hanseníase. A análise de sensibilidade univariada mostrou que a prevalência de hanseníase entre contatos intradomiciliares foi a variável que mais influenciou o modelo. Este é o primeiro modelo econômico a analisar um algoritmo diagnóstico da hanseníase. Os resultados poderão auxiliar os gestores na definição de políticas e estratégias para a erradicação da hanseníase no Brasil. Resumo doença significativa mundo pública transmissão (RT RTPCR PCR (RT-PCR custoefetividade custo RTPCR. PCR. RT-PCR SUS (SUS ano diagnósticos analisados RTPCR, PCR, isolada, isolada , isolada) obtendose obtendo se 61646 616 46 616,4 6164 61 4 616, 6