RESUMO Objetivo: Verificar a utilização e identificar as vantagens dos métodos moleculares para diagnóstico de infecções congênitas no líquido cefalorraquidiano de neonatos. Fontes de dados: A revisão foi registrada na base PROSPERO (International Prospective Register of Systematic Reviews) sob CRD42021274210. A busca bibliográfica foi realizada nas bases de dados PubMed, Biblioteca Virtual em Saúde/ Centro Latino-Americano e do Caribe de Informação em Ciências da Saúde (BVS/BIREME), Scopus, Web of Science, Excerpta Medica database (EMBASE), Cochrane, ProQuest, e EBSCOhost. A busca foi feita no período de agosto a outubro de 2021 e atualizada em dezembro de 2022, respeitando as orientações do Preferred Reporting Items for Systematic Reviews e Meta-Analyises (PRISMA). A sequência da seleção dos estudos foi: 1) Remoção de duplicatas; 2) Exame de títulos e resumos; 3) Recuperação dos textos completos potencialmente relevantes; e 4) Avaliação do texto completo conforme critérios de elegibilidade por dois autores independentes. O critério de inclusão considerou ensaios clínicos randomizados e não randomizados, estudos longitudinais, transversais, revisados por pares, estudos em humanos, publicados em inglês, espanhol, italiano e português, com recém-nascidos de até 28 dias que sofreram neuroinfecções congênitas pelos agentes toxoplasmose, rubéola, citomegalovírus, herpes simples (TORCH), e outros como Treponema pallidum, Zika, parvovírus B-19, varicela zoster, Epstein-Barr, e SARS-CoV-2, diagnosticadas por reação em cadeia de polimerase (PCR). Dois avaliadores extraíram as seguintes informações: autor, ano de publicação, nacionalidade, sujeitos, tipo de estudo, métodos, resultados e conclusão. Síntese dos dados: O patógeno mais estudado foi Herpes Simples. Muitos artigos relataram somente sintomas iniciais inespecíficos, motivando a coleta de líquido cefalorraquidiano e realização da PCR para investigação etiológica. Conclusões: Os métodos moleculares são eficazes para detectar o genoma do patógeno no líquido cefalorraquidiano, o que pode impactar na evolução clínica e no prognóstico neurológico. Objetivo neonatos International CRD42021274210 CRD PubMed LatinoAmericano Latino Americano BVS/BIREME, BVSBIREME BVS/BIREME , BVS BIREME (BVS/BIREME) Scopus Science EMBASE, EMBASE (EMBASE) Cochrane ProQuest EBSCOhost 202 2022 MetaAnalyises Meta Analyises PRISMA. PRISMA . (PRISMA) 1 duplicatas 2 resumos 3 relevantes 4 independentes longitudinais transversais pares humanos inglês espanhol português recémnascidos recém nascidos toxoplasmose rubéola citomegalovírus TORCH, TORCH (TORCH) pallidum Zika B19, B19 B 19, 19 B-19 zoster EpsteinBarr, EpsteinBarr Epstein Barr, Barr Epstein-Barr SARSCoV2, SARSCoV2 SARSCoV SARS CoV 2, SARS-CoV-2 PCR. (PCR) informações autor publicação nacionalidade sujeitos estudo conclusão Simples inespecíficos etiológica Conclusões neurológico CRD4202127421 (BVS/BIREME (EMBASE 20 (PRISMA (TORCH B1 B-1 SARS-CoV- (PCR CRD420212742 B- SARS-CoV CRD42021274 CRD4202127 CRD420212 CRD42021 CRD4202 CRD420 CRD42 CRD4

ABSTRACT Objective: To verify the use and identify advantages of molecular methods for congenital infections diagnosis in cerebrospinal fluid of neonates. Data source: The review was registered in the International Prospective Register of Systematic Reviews (PROSPERO), under CRD42021274210. The literature search was performed in databases: PubMed, Virtual Health Library/ Latin American and Caribbean Center on Health Sciences Information (VHL/BIREME), Scopus, Web of Science, Excerpta Medica database (EMBASE), Cochrane, ProQuest, and EBSCOhost. The search was carried out from August to October 2021 and updated in December 2022, respecting the Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses (PRISMA) guidelines. The selection sequence was: 1) Duplicate title removal; 2) Examination of titles and abstracts; 3) Full-text retrieval of potentially relevant reports; and 4) Evaluation of the full text according to eligibility criteria by two independent authors. Inclusion criteria considered randomized and non-randomized control trials, longitudinal, cross-sectional, and peer-reviewed studies in humans, published in English, Spanish, Italian, and Portuguese, with newborns up to 28 days old who had congenital neuroinfections by toxoplasmosis, rubella, cytomegalovirus, herpes simplex (TORCH), and others such as Treponema pallidum, Zika, parvovirus B-19, varicella zoster, Epstein-Barr, and SARS-CoV2, diagnosed by polymerase chain reaction (PCR). Two evaluators extracted the following information: author, year of publication, nationality, subjects, study type, methods, results, and conclusion. Data synthesis: The most studied pathogen was herpes simplex. Several articles reported only nonspecific initial symptoms, motivating the collection of cerebrospinal fluid and performing PCR for etiological investigation. Conclusions: Molecular methods are effective to detect pathogen genomes in cerebrospinal fluid, which can impact clinical evolution and neurological prognosis. Objective neonates source PROSPERO, PROSPERO , (PROSPERO) CRD42021274210 CRD databases PubMed Library VHL/BIREME, VHLBIREME VHL/BIREME VHL BIREME (VHL/BIREME) Scopus Science EMBASE, EMBASE (EMBASE) Cochrane ProQuest EBSCOhost 202 2022 MetaAnalyses Meta Analyses PRISMA (PRISMA guidelines 1 removal 2 abstracts 3 Fulltext Full reports 4 authors nonrandomized non trials longitudinal crosssectional, crosssectional cross sectional, sectional cross-sectional peerreviewed peer reviewed humans English Spanish Italian Portuguese toxoplasmosis rubella cytomegalovirus TORCH, TORCH (TORCH) pallidum Zika B19, B19 B 19, 19 B-19 zoster EpsteinBarr, EpsteinBarr Epstein Barr, Barr Epstein-Barr SARSCoV2, SARSCoV2 SARSCoV SARS CoV2, CoV2 CoV SARS-CoV2 PCR. . (PCR) information author publication nationality subjects type results conclusion synthesis symptoms investigation Conclusions prognosis (PROSPERO CRD4202127421 (VHL/BIREME (EMBASE 20 (TORCH B1 B-1 SARS-CoV (PCR CRD420212742 B- CRD42021274 CRD4202127 CRD420212 CRD42021 CRD4202 CRD420 CRD42 CRD4

Abstract Despite of the global unity against COVID-19 pandemic, the threat of SARS-CoV-2 variants on the lives of human being is still not over. SARS-CoV-2 pandemic has urged the need of rapid viral detection at earliest. To cope with gradually expanding scenario of SARS-CoV-2, accurate diagnosis is extremely crucial factor which should be noticed by international health organizations. Limited research followed by sporadic marketing of SARS-CoV-2 rapid pharmaceutical detection kits raises critical questions against quality assurance and quality control measures. Herein we aimed to interrogate effectivity and specificity analysis of SARS-CoV-2 pharmaceutical rapid detection kits (nasopharyngeal swab based) using conventional gold standard triple target real-time polymerase chain reaction (USFDA approved). A cross-sectional study was conducted over 1500 suspected SARS-CoV-2 patients. 100 real time-PCR confirmed patients were evaluated for pharmaceutical RDT kits based upon nasopharyngeal swab based kits. The SARS-CoV-2 nasopharyngeal swab based rapid diagnostic kit (NSP RDTs) analysis showed 78% reactivity. Among real time PCR confirmed negative subjects, 49.3% represented false positivity. The positive predictive analysis revealed 67.82%, while negative predictive values were 64.40%. The NSP RDTs showed limited sensitivities and specificities as compared to gold standard real time PCR. Valid and authentic detection of SARS-CoV-2 is deemed necessary for accurate COVID-19 surveillance across the globe. Current study highlights the potential consequences of inadequate detection of SARS-CoV-2 and emerging novel mutants, compromising vaccine preventable diseases. Current study emphasizes need to wake higher authorities including strategic organizations for designing adequate measures to prevent future SARS-CoV-2 epidemics. COVID19 COVID 19 COVID-1 SARSCoV2 SARSCoV SARS CoV 2 SARS-CoV- earliest SARSCoV2, 2, realtime USFDA approved. approved . approved) crosssectional cross sectional 150 10 timePCR 78 reactivity subjects 493 49 3 49.3 positivity 6782 67 82 67.82% 6440 64 40 64.40% globe mutants diseases epidemics COVID1 1 COVID- SARS-CoV 15 7 4 49. 678 6 8 67.82 644 64.40 67.8 64.4 67. 64.

Resumo Apesar da unidade global contra a pandemia de COVID-19, a ameaça das variantes do SARS-CoV-2 na vida do ser humano ainda não acabou. A pandemia de SARS-CoV-2 alertou para a necessidade de detecção viral rápida o mais cedo possível. Para lidar com o cenário de expansão gradual do SARS-CoV-2, o diagnóstico preciso é um fator extremamente crucial que deve ser observado pelas organizações internacionais de saúde. Pesquisa limitada seguida de comercialização esporádica de kits de detecção farmacêutica rápida de SARS-CoV-2 levanta questões críticas contra a garantia de qualidade e as medidas de controle de qualidade. Aqui, objetivamos questionar a eficácia e a análise de especificidade dos kits farmacêuticos de detecção rápida de SARS-CoV-2 (baseados em swab nasofaríngeo) usando a técnica de reação em cadeia da polimerase em tempo real padrão-ouro convencional (aprovado pelo USFDA). Um estudo transversal foi realizado em 1.500 pacientes suspeitos de SARS-CoV-2. Cem pacientes confirmados por PCR em tempo real foram avaliados para kits farmacêuticos de RDT baseados em kits baseados em swabs nasofaríngeas. A análise do kit de diagnóstico rápido baseado em swab nasofaríngeo SARS-CoV-2 (NSP RDTs) mostrou 78% de reatividade. Entre os indivíduos negativos confirmados por PCR em tempo real, 49,3% representaram falsa positividade. A análise preditiva positiva revelou 67,82%, enquanto os valores preditivos negativos foram de 64,40%. Os NSP RDTs mostraram sensibilidades e especificidades limitadas em comparação com a PCR em tempo real padrão-ouro. A detecção válida e autêntica do SARS-CoV-2 é considerada necessária para a vigilância precisa de COVID-19 em todo o mundo. O estudo atual destaca as possíveis consequências da detecção inadequada de SARS-CoV-2 e novos mutantes emergentes, comprometendo doenças evitáveis por vacina. O estudo atual enfatiza a necessidade de alertar autoridades superiores, incluindo organizações estratégicas, para projetar medidas adequadas para prevenir futuras epidemias de SARS-CoV-2. COVID19, COVID19 COVID 19, 19 SARSCoV2 SARSCoV SARS CoV 2 SARS-CoV- acabou possível SARSCoV2, 2, saúde Aqui padrãoouro padrão ouro aprovado USFDA. USFDA . USFDA) 1500 1 500 1.50 SARSCoV2. 2. nasofaríngeas 78 reatividade 493 49 3 49,3 positividade 6782 67 82 67,82% 6440 64 40 64,40% padrãoouro. ouro. COVID-1 mundo emergentes vacina superiores estratégicas COVID1 SARS-CoV 150 50 1.5 7 4 49, 678 6 8 67,82 644 64,40 COVID- 15 5 1. 67,8 64,4 67, 64,

Abstract The paper presents data on phytosanitary monitoring of garden cenoses for fire blight in the Turkestan, Zhambyl, and Almaty regions of Kazakhstan. The purpose of this study is to assess the phytosanitary situation in various regions of Kazakhstan, determine the extent of fire blight spread, and isolate and identify the fire blight pathogen. During the study, methods such as hypersensitivity, pathogenicity, and fluorescent simplification-based specific hybridization polymerase chain reaction (FLASH-PCR) were used. It was found that in all the surveyed areas, disease foci were identified. For the first time, the fire blight pathogen was detected on fruit crops such as plum, peach, cherry plum, and quince, as well as on wild apricots. 274 plant samples were collected from which microorganisms were isolated. Isolates related to the fire blight pathogen Erwinia amylovora were identified by methods of hypersensitivity, pathogenicity, and FLASH-PCR diagnostics. Of the 156 isolates of microorganisms isolated from apple tree plant samples, 21 inhibited the in vitro growth of E. amylovora to varying degrees. Isolates 16.2 and 19.2 with maximum antagonistic activity were selected, where the pathogen growth inhibition zones were 52.2 ± 2.58 mm and 45.6 ± 0.55 mm, respectively. Based on the obtained sequence of nucleotides of the 16SpRNA gene site, it was found that the selected isolates with high antagonistic activity belonged to the Pseudomonas genus. In the future, based on these isolates, a new biological product for fire blight control can be created and adapted to the natural and climatic conditions of Kazakhstan. Turkestan Zhambyl Kazakhstan spread hypersensitivity pathogenicity simplificationbased simplification FLASHPCR FLASH PCR (FLASH-PCR used areas time plum peach quince apricots 27 diagnostics 15 2 E degrees 162 16 16. 192 19 19. 522 52 52. 258 58 2.5 456 45 6 45. 055 0 55 0.5 respectively SpRNA site genus future 1 5 25 2. 4 05 0.

Resumo O presente artigo apresenta dados sobre o monitoramento fitossanitário da biocenose de um jardim em relação à doença do fogo bacteriano nas regiões do Turquestão, Zhambyl e Almaty no Cazaquistão. O objetivo deste estudo é avaliar a situação fitossanitária em diversas regiões do Cazaquistão, além de determinar a extensão da propagação, isolar e identificar o patógeno da doença do fogo bacteriano. Durante este estudo, foram usados métodos como hipersensibilidade, patogenicidade e reação em cadeia da polimerase com hibridização específica baseada em simplificação fluorescente (FLASH-PCR). Foram identificados focos da doença em todas as áreas pesquisadas. Pela primeira vez, o patógeno da doença do fogo bacteriano foi detectado em culturas de frutas como ameixa, pêssego, abrunheiro-de-jardim e marmelo, bem como em damascos silvestres. Foram coletadas 274 amostras de plantas das quais foram isolados os microrganismos. Os isolados relacionados ao patógeno Erwinia amylovora foram identificados por métodos de hipersensibilidade, patogenicidade e diagnóstico com FLASH-PCR. Dos 156 microrganismos isolados de amostras de macieira, 21 inibiram o crescimento in vitro de E. amylovora em graus variados. Os isolados 16.2 e 19.2 com máxima atividade antagônica foram selecionados, apresentando zonas de inibição do crescimento do patógeno de 52,2 ± 2,58 mm e 45,6 ± 0,55 mm, respectivamente. Com base na sequência obtida de nucleotídeos do local do gene 16SpRNA, verificou-se que os isolados selecionados com alta atividade antagônica pertenciam ao gênero Pseudomonas. Com base nos isolados supracitados, um novo produto biológico para o controle da doença do fogo bacteriano poderá ser criado no futuro, estando adaptado às condições naturais e climáticas do Cazaquistão. Turquestão Cazaquistão propagação hipersensibilidade FLASHPCR. FLASHPCR FLASH PCR . (FLASH-PCR) pesquisadas vez ameixa pêssego abrunheirodejardim abrunheiro marmelo silvestres 27 PCR. FLASH-PCR 15 macieira 2 E variados 162 16 16. 192 19 19. 522 52 52, 258 58 2,5 456 45 6 45, 055 0 55 0,5 respectivamente 16SpRNA SpRNA verificouse verificou se Pseudomonas supracitados futuro (FLASH-PCR 1 5 25 2, 4 05 0,

Abstract The work aims to analyze the associations of polymorphic variants of the PRL and BLG genes with resistance and susceptibility to mastitis in Holstein cows. The experimental study consisted of the selection of biomaterial samples from 250 heads of Holstein cows aged 3 years divided into two groups (healthy and with a confirmed diagnosis of mastitis). The determination of animal genotypes was carried out using polymerase chain reaction and restriction fragment length polymorphism. The study of the nature of the association of polymorphic variants of the PRL and BLG gene with resistance/increased risk of mastitis established a significant deviation from the theoretically expected distribution of bBLG-HaeIII genotypes in the group of animals suffering from mastitis (the value of χ2 was 0.24). The bBLG-HaeIIIBB genotype can act as a marker of an increased risk of developing mastitis in Holstein cows; its frequency in the group of sick animals exceeds the frequency in the control group by more than 2 times (44.0 compared to 17.0%, respectively). The bBLG-HaeIIIAB genotype is significantly associated with mastitis resistance in Holstein cows; its frequency is 2 times lower than in the control group (28.0 compared to 54.0%). 25 healthy mastitis. . mastitis) polymorphism resistanceincreased bBLGHaeIII bBLG HaeIII χ 0.24. 024 0.24 0 24 0.24) bBLGHaeIIIBB HaeIIIBB 44.0 440 44 (44. 170 17 17.0% respectively. respectively respectively) bBLGHaeIIIAB HaeIIIAB 28.0 280 28 (28. 54.0%. 540 54.0% 54 54.0%) 02 0.2 44. 4 (44 1 17.0 28. (28 54.0 5 0. (4 17. (2 54. (

Resumo O trabalho tem como objetivo analisar as associações de variantes polimórficas dos genes PRL e BLG com resistência e suscetibilidade à mastite em vacas holandesas. O estudo experimental consistiu na seleção de amostras de biomateriais de 250 cabeças de vacas holandesas com 3 anos de idade divididas em dois grupos (saudáveis e com diagnóstico confirmado de mastite). A determinação dos genótipos dos animais foi realizada utilizando reação em cadeia da polimerase e polimorfismo de comprimento de fragmentos de restrição. O estudo da natureza da associação de variantes polimórficas do gene PRL e BLG com resistência/risco aumentado de mastite estabeleceu um desvio significativo da distribuição teoricamente esperada dos genótipos bBLG-HaeIII no grupo de animais que sofrem de mastite (o valor de χ2 foi 0,24). O genótipo bBLG-HaeIIIBB pode atuar como marcador de risco aumentado de desenvolvimento de mastite em vacas holandesas; sua frequência no grupo de animais doentes excede a frequência no grupo controle em mais de duas vezes (44,0% contra 17,0%, respectivamente). O genótipo bBLG-HaeIIIAB está significativamente associado à resistência à mastite em vacas holandesas; sua frequência é duas vezes menor que no grupo controle (28,0% contra 54,0%). 25 saudáveis mastite. . mastite) restrição resistênciarisco bBLGHaeIII bBLG HaeIII o χ 0,24. 024 0,24 0 24 0,24) bBLGHaeIIIBB HaeIIIBB 44,0% 440 44 (44,0 170 17 17,0% respectivamente. respectivamente respectivamente) bBLGHaeIIIAB HaeIIIAB 28,0% 280 28 (28,0 54,0%. 540 54,0% 54 54,0%) 2 02 0,2 44,0 4 (44, 1 17,0 28,0 (28, 54,0 5 0, 44, (44 17, 28, (28 54, (4 (2 (

Resumo Este trabalho apresenta o isolamento de fungos endofíticos de folhas de Campomanesia adamantium(Cambess.) O. Berg (Myrtaceae), espécie nativa encontrada no Brasil, com distribuição abundante no Cerrado brasileiro, popularmente conhecida como “guabiroba-do-campo. Têm sido utilizadas popularmente por suas atividades anti-reumáticas anti-inflamatórias, antidiarreicas, redutoras de colesterol no sangue, antisséptica urinária e depurativas. Fungos endofíticos são microrganismos que vivem no interior de plantas superiores, ao menos por um período de seu ciclo de vida, ocupando os espaços intercelulares dos tecidos vegetais, como folhas e caules. Esses fungos, além de serem inofensivos à planta hospedeira, produzem benefícios a partir de metabólitos secundários que promovem proteção, regulam o crescimento, combatem bactérias, vírus e fungos e promovem resistência a estresse abiótico, além de efeitos inseticidas. Os fungos endófitos associados às folhas de C. adamantiumforam isolados utilizando-se a técnica de isolamento em meio de cultura. Logo após o crescimento, os fungos foram divididos em grupos baseados em morfotipos. O DNA genômico fúngico foi extraído A reação em cadeia da polimerase (PCR) foi conduzida para amplificação da região ITS-1-5.8S-ITS2 de rRNA e as sequências de nucleotídeos obtidas foram comparados com aqueles disponíveis na base de dados GenBank para a identificação molecular dos isolados. A construção da filogenia da árvore foi realizada utilizando o software MEGA 11. Os resultados apresentaram representantes do filo Ascomycota e em nível de gênero foi possível identificar 18 fungos dos gêneros Colletotrichum, Diaporthe, Epicoccum e Neofusicoccum. adamantiumCambess. adamantiumCambess adamantium Cambess. Cambess adamantium(Cambess. Myrtaceae, Myrtaceae , (Myrtaceae) Brasil brasileiro guabirobadocampo. guabirobadocampo guabiroba campo. campo “guabiroba-do-campo antireumáticas anti reumáticas antiinflamatórias, antiinflamatórias inflamatórias, inflamatórias anti-inflamatórias antidiarreicas sangue depurativas superiores vida vegetais caules hospedeira proteção crescimento bactérias abiótico inseticidas C utilizandose se cultura morfotipos PCR (PCR ITS15.8SITS2 ITS158SITS2 ITSSITS ITS 1 5.8S ITS2 5 8S S ITS-1-5.8S-ITS 11 Colletotrichum Diaporthe Neofusicoccum adamantium(Cambess (Myrtaceae ITS15 8SITS2 SITS ITS15.8SITS ITS158SITS 58S ITS1 8SITS

Abstract This work presents the isolation of endophytic fungi from the leaves of Campomanesia adamantium (Cambess.) O. Berg (Myrtaceae), a native species found in Brazil and popularly known as “guabiroba-do-campo”, with abundant distribution in the Brazilian Cerrado. It has been popularly used for its anti-rheumatic, anti-inflammatory, antidiarrheal, blood cholesterol-reducing, urinary antiseptic, and depurative properties. Theese fungi are microorganisms that live inside higher plants, at least for a period of their life cycle, occupying the intercellular spaces of plant tissues such as leaves and stems. These fungi are harmless to the host plant, and their secondary metabolites promote protection, regulate growth, combat bacteria, viruses, and fungi, and promote resistance to abiotic stress, as well as insecticidal effects. Endophytic fungi associated with the leaves of C. adamantium were isolated using the culture medium isolation technique. After growth, the fungi were divided into groups based on morphotypes. Fungal genomic DNA was extracted, and a polymerase chain reaction (PCR) was conducted to amplify the ITS1-5.8S-ITS2 regions of rRNA, and the nucleotide sequences obtained were compared with those available in the GenBank database for molecular identification of the isolates. The phylogenetic tree was constructed using MEGA 11 software. The results showed representatives of the Ascomycota phylum, and it was possible to identify at the genus level 18 fungi of the genera Colletotrichum, Diaporthe, Epicoccum, and Neofusicoccum. Cambess. Cambess (Cambess. O Myrtaceae, Myrtaceae , (Myrtaceae) guabirobadocampo, guabirobadocampo guabiroba do campo “guabiroba-do-campo” Cerrado antirheumatic, antirheumatic anti rheumatic, rheumatic anti-rheumatic antiinflammatory, antiinflammatory inflammatory, inflammatory anti-inflammatory antidiarrheal cholesterolreducing, cholesterolreducing cholesterol reducing, reducing cholesterol-reducing antiseptic properties plants cycle stems protection growth bacteria viruses stress effects C technique morphotypes extracted PCR (PCR ITS15.8SITS2 ITS158SITS2 ITSSITS ITS1 5.8S ITS2 5 8S ITS S ITS1-5.8S-ITS rRNA isolates 1 software phylum Colletotrichum Diaporthe Epicoccum Neofusicoccum (Cambess (Myrtaceae “guabiroba-do-campo ITS15 8SITS2 SITS ITS15.8SITS ITS158SITS 58S 8SITS

Abstract Emergence of plasmid mediated colistin and extended spectrum β-lactamases (ESBL) resistant genes has been impacted the efficacy of colistin and β-lactams drugs like 3rd, 4th generation cephalosporin. Current study was aimed to investigate antimicrobial resistance genes (ARGs) among Escherichia coli isolates from meat producing commercial broilers in Pakistan. Two hundred (n=200) fecal samples were collected during January-2018 to August-2019. For isolation of E. coli, pink colonies on MacConkey agar were transferred to EMB agar. Metallic sheen color colonies were tested biochemically using API-20E kit. The molecular identification of E. coli (n=153) was targeted by amplification of uid gene through polymerase chain reaction (PCR) and different ARGs i.e. gentamicin, streptomycin, tetracycline, colistin, β-lactams drugs, quinolone and ampicillin followed by sequence analysis. Genotypically, followed by phenotypically of resistant ARGs of isolated PCR-confirmed E. coli (153) shoed resistant against gentamicin (aac(3)-IV), streptomycin (aadA1), tetracycline (tetA), colistine (mcr-1), ampicillin (bla-TEM) and bla-CTX-M were 86%, 88%, 86%, 88%, 83% & 77% respectively. 33/38 (86%) of the isolate was positive for quinolone resistance. Colistine (mcr-1), ESBLs (bla-TEM) and (bla-CTX-M) resistance genes were 88%, 83% and 77% respectively. About 33 isolated E. coli harbored the both mcr-1 and ESBLs genes. All of E. coli isolates were found sensitive to ceftriaxone (CTX-30) and imipenem (IMP-10). The Isolated E. coli showed single or multi clade decadency. The E. coli and ARGs sequences showed single or multi clade decadency. This is first comprehensive study from Pakistan that described the molecular evidences of ARGs and their co-existence in single isolates originated from commercial poultry. Commercial chicken (Broilers) can act as melting pot of antibiotic resistance genes for human being. It is alarming situation for surveillance of antibiotic resistance program because of more regulated prescription of antimicrobial agents in Pakistan βlactamases β lactamases ESBL (ESBL βlactams lactams 3rd rd th cephalosporin (ARGs n=200 n200 n 200 (n=200 January2018 January 2018 January-201 August2019. August2019 August 2019. 2019 August-2019 E API20E APIE API 20E kit n=153 n153 153 (n=153 PCR (PCR ie i e i.e analysis Genotypically PCRconfirmed confirmed (153 aac3IV, aac3IV aacIV aac 3 IV , (aac(3)-IV) aadA1, aadA1 aadA (aadA1) tetA, tetA (tetA) mcr1, mcr1 mcr 1 (mcr-1) blaTEM bla TEM (bla-TEM blaCTXM CTX M 86 86% 88 88% 83 77 respectively 3338 38 33/3 (86% (bla-CTX-M mcr- CTX30 30 (CTX-30 IMP10. IMP10 IMP 10 . (IMP-10) decadency coexistence co existence poultry Broilers (Broilers being n=20 n20 20 (n=20 January201 201 January-20 August201 August-201 n=15 n15 15 (n=15 (15 (aac(3)-IV (aadA1 (tetA (mcr-1 8 7 333 33/ (86 CTX3 (CTX-3 IMP1 (IMP-10 n=2 n2 2 (n=2 January20 January-2 August20 August-20 n=1 n1 (n=1 (1 (aadA (mcr- (8 (CTX- (IMP-1 n= (n= January2 January- August2 August-2 ( (mcr (CTX (IMP- (n August- (IMP

Resumo O surgimento de colistina mediada por plasmídeo e genes de resistência a β-lactamases de espectro estendido (ESBL) afetou a eficácia de medicamentos colistina e β-lactâmicos, como as cefalosporinas de 3ª e 4ª geração. O presente estudo teve como objetivo investigar genes de resistência antimicrobiana (ARGs) entre isolados de Escherichia coli em frangos de corte comerciais no Paquistão. Duzentas (n = 200) amostras fecais foram coletadas durante janeiro de 2018 a agosto de 2019. Para o isolamento de E. coli, colônias rosas em ágar MacConkey foram transferidas para ágar EMB. As colônias de cores de brilho metálico foram testadas bioquimicamente usando o kit API-20E. A identificação molecular de E. coli (n = 153) foi direcionada pela amplificação do gene uid através da reação em cadeia da polimerase (PCR) e diferentes ARGs, ou seja, gentamicina, estreptomicina, tetraciclina, colistina, medicamentos β-lactâmicos, quinolona e ampicilina, seguido de análise de sequência. Genotipicamente, seguido por fenotipicamente de ARGs resistentes de E. coli isoladas foram confirmadas por PCR (153) como resistente contra gentamicina (aac(3)-IV), estreptomicina (aadA1), tetraciclina (tetA), colistina (mcr-1), ampicilina (bla-TEM) e bla-CTX-M, demonstrando resultados de 86%, 88%, 86%, 88%, 83% e 77%, respectivamente. Cerca de 33/38 (86%) do isolado foi positivo para resistência às quinolonas. Os genes de resistência à colistina (mcr-1), ESBLs (bla-TEM) e (bla-CTX-M) foram 88%, 83% e 77%, respectivamente. Cerca de 33 E. coli isoladas continham os genes mcr-1 e ESBLs. Todos os isolados de E. coli foram considerados sensíveis à ceftriaxona (CTX-30) e imipenem (IMP-10). A E. coli isolada apresentou decadência de um ou vários clados. As sequências de E. coli e ARGs apresentaram decadência de um ou vários clados. Este é o primeiro estudo abrangente do Paquistão que descreveu as evidências moleculares de ARGs e sua coexistência em isolados únicos originados de aves comerciais. Dessa forma, é possível concluir que o Frango comercial (Broilers) pode atuar como caldeirão de genes de resistência a antibióticos para o ser humano. É uma situação alarmante para a vigilância do programa de resistência a antibióticos devido à prescrição mais regulamentada de agentes antimicrobianos no Paquistão βlactamases β lactamases ESBL (ESBL βlactâmicos, βlactâmicos lactâmicos, lactâmicos β-lactâmicos ª geração (ARGs n 200 201 2019 E EMB API20E. API20E APIE API 20E. 20E API-20E 153 (PCR seja sequência Genotipicamente (153 aac3IV, aac3IV aacIV aac 3 IV , (aac(3)-IV) aadA1, aadA1 aadA (aadA1) tetA, tetA (tetA) mcr1, mcr1 mcr 1 (mcr-1) blaTEM bla TEM (bla-TEM blaCTXM, blaCTXM CTX M, M bla-CTX-M 86 86% 88 88% 83 77 77% respectivamente 3338 38 33/3 (86% quinolonas (bla-CTX-M mcr- CTX30 30 (CTX-30 IMP10. IMP10 IMP 10 . (IMP-10) clados forma Broilers (Broilers humano 20 15 (15 (aac(3)-IV (aadA1 (tetA (mcr-1 8 7 333 33/ (86 CTX3 (CTX-3 IMP1 (IMP-10 2 (1 (aadA (mcr- (8 (CTX- (IMP-1 ( (mcr (CTX (IMP- (IMP

Resumo O Paquistão é um país agrícola, onde a pesca desempenha um papel muito importante para o desenvolvimento econômico. Diferentes doenças são prevalentes em peixes do Paquistão, mas as informações relacionadas aos agentes causadores não são bem conhecidas. Tendo em vista a importância dos patógenos bacterianos como agentes causadores de múltiplas doenças em peixes, o presente estudo foi conduzido para identificação, caracterização e análise de genes de virulência de isolados de Aeromonas spp. de peixes doentes. Foram coletadas 50 amostras de peixes com múltiplas indicações clínicas em diferentes fazendas do distrito de Kasur, Punjab, Paquistão. Para isolar Aeromonas spp., as amostras foram enriquecidas e inoculadas em meio de isolamento. Os isolados foram identificados e caracterizados por diferentes testes bioquímicos, kit Analytical Profile Index (API) 20E, e ensaios de reação em cadeia da polimerase (PCR). Todos os isolados foram selecionados para três genes de virulência putativos, incluindo aerolisina (aer), hemolisina (hyl) e enterotoxina citotônica termolábil (alt). Sete isolados de Aeromonas hydrophila foram recuperados e identificados com base no API 20E. Esses isolados foram posteriormente confirmados como A. hydrophila de acordo com ensaios de PCR. Três isolados indicaram a presença de genes de virulência (alt e hyl), enquanto o gene aerolisina (aer) não esteve presente em nenhum dos isolados de A. hydrophila. O presente estudo confirmou A. hydrophila como o agente causador da síndrome ulcerativa epizoótica e septicemia móvel por Aeromonas em fazendas de peixes, no distrito de Kasur, Punjab, Paquistão. Além disso, a detecção de dois genes de virulência (alt e hyl) em isolados de A. hydrophila é uma ameaça para os consumidores de peixes da área de estudo.

Abstract Pakistan is an agricultural country and fisheries play a very important role in the economic development of the country. Different diseases are prevalent in Pakistani fish but information related to the causative agents is not well-known. Keeping in view the significance of bacterial pathogens as the causative agents of multiple fish diseases, the present study was conducted for identification, characterization and analysis of virulence genes of Aeromonas spp. isolated from diseased fishes. A total of fifty fish samples having multiple clinical indications were collected from different fish farms of district Kasur, Punjab Pakistan. For isolation of Aeromonas spp. samples were enriched and inoculated on Aeromonas isolation medium. Isolates were identified and characterized by different biochemical tests, Analytical Profile Index (API) 20E kit and Polymerase Chain Reaction (PCR) assays. All isolates were screened for three putative virulence genes including aerolysin (aer), haemolysin (hyl) and heat labile cytotonic enterotoxin (alt). Seven isolates of Aeromonas (A.) hydrophila were retrieved and identified based on API 20E. These isolates were further confirmed as A. hydrophila on the basis of PCR assays. Three isolates were detected positive for the presence of virulence genes (alt and hyl). Whereas aerolysin (aer) gene was not present in any of A. hydrophila isolates. The present study confirmed A. hydrophila as the causative agent of epizootic ulcerative syndrome and motile Aeromonas septicemia in fish farms of district Kasur, Punjab Pakistan. Moreover, detection of two virulence genes (alt and hyl) in A. hydrophila isolates is a threat for fish consumers of study area.

Resumo A doença de Newcastle (DN) é uma doença infecciosa, altamente contagiosa e letal de espécies aviárias. Considera-se que os patos são reservatórios ou portadores naturais do vírus da doença de Newcastle (VDN) e são resistentes a diferentes cepas de VDN. O presente estudo foi desenvolvido para avaliar a patogênese da DN em patos domésticos por meio de histopatologia, imuno-histoquímica (IHQ) e alterações bioquímicas séricas. Para este propósito, 80 patos foram criados por 42 dias e divididos em dois grupos A e B. Os patos do grupo A foram submetidos ao VDN a uma taxa de 0,1 ml de ELD50 (título viral de 107,32 / 100 µl) na segunda semana de idade, enquanto o Grupo B foi controle negativo. Esplenomegalia, atrofia do timo e lesão necrótica no rim foram observadas no 9º dia pós-infecção. Degeneração hepática e infiltração de células mononucleares foram observadas no proventrículo e intestino em patos infectados. Antígeno viral foi detectado em pulmões, intestino, proventrículo e órgãos linfoides de patos infectados por IHQ. Os valores de albumina e proteína total foram significativamente baixos no grupo A infectado em comparação com o grupo B. Os valores de ALT, AST e ALP foram significativamente altos no grupo A. No 5º e no 7º dia após a infecção, os esfregaços orofaríngeos foram negativos para VDN, enquanto os esfregaços cloacais foram positivos para VDN por meio da reação em cadeia da polimerase via transcriptase reversa. Conclui-se que os patos são suscetíveis ao VDN e à cepa virulenta de VDN que causou doenças em patos.

Abstract Newcastle disease (ND) is an infectious, highly contagious and lethal disease of avian species. It is considered that ducks are natural reservoir or carrier for Newcastle disease virus (NDV) and are resistant against different strains of NDV. Current study was designed to evaluate the pathogenesis of Newcastle disease in domestic ducks through histopathology, immunohistochemistry (IHC) and serum biochemical changes. For this purpose, eighty ducks were reared for 42 days and divided in two groups A and B. Ducks in group A were challenged with (NDV) at rate of 0.1 ml of ELD50 (virus titer 107.32/100µl) on second week of age, whereas Group B was control negative. Splenomegaly, atrophy of thymus and necrotic lesion in kidney were observed on 9th day of post infection. Hepatic degeneration and mononuclear cell infiltration were noticed in proventriculus and intestine in challenged ducks. Viral antigen detected in lungs, intestine, proventriculus and lymphoid organs of infected ducks through IHC. Albumin and total protein values were significantly low in infected groups A as compared to control group B. ALT, AST, and ALP values were significantly high in infected group A. On 5th and 7th day of post infection oropharyngeal swabs were negative for NDV and cloacal swabs were positive for NDV through Reverse transcriptase polymerase chain reaction. It is concluded that ducks are susceptible to NDV and virulent strain of NDV caused disease in ducks.

Resumo O número de produtos alimentícios com culturas geneticamente modificadas (GM) no mercado global cresceu devido aos avanços na tecnologia de engenharia genética. A legislação que regulamenta a rotulagem e o uso de culturas GM aumentou consideravelmente em todo o mundo para fornecer aos consumidores garantia de saúde e segurança. Ainda não está claro se organismos geneticamente modificados (OGM) estão presentes no mercado de alimentos do Reino da Arábia Saudita em razão da falta de estudos científicos. Este trabalho foi planejado para detectar arroz e batatas GM no mercado de alimentos saudita. Cem amostras de arroz e produtos de arroz não rotulados e 50 amostras de batata e produtos à base de batata foram coletadas aleatoriamente de diferentes mercados de Meca, Riad e Jeddah durante 2022-2023. O método de brometo de cetiltrimetilamônio (CTAB) foi usado para extrair DNA. O kit de extração de DNA Viviants foi usado para extrair DNA de amido de arroz e batatas fritas. Para encontrar OGMs em amostras, foram utilizados os kits de teste CMOScreen 35S e NOS. Abordagens qualitativas e quantitativas baseadas em DNA foram usadas para rastrear alvos para detecção de PCR de sequências de arroz GM. Os resultados indicaram que 32 (32%) amostras de arroz foram positivas para o promotor CaMV 35S, enquanto nenhum resultado positivo foi detectado para o terminador NOS. Além disso, 30% das amostras de batata foram positivas para o promotor CaMV 35S, e as mesmas amostras foram positivas para a presença do gene Cry V. Pode-se concluir que havia arroz e batatas GM nos mercados de alimentos do Reino da Arábia Saudita. É recomendável estabelecer regulamentações rigorosas e laboratórios certificados para monitorar alimentos geneticamente modificados (GMF) ou safras no mercado saudita. (GM genética segurança OGM (OGM científicos saudita 5 Meca 20222023. 20222023 2022 2023. 2023 2022-2023 CTAB (CTAB fritas S NOS 3 32% (32% disso 30 V Podese Pode GMF (GMF 2022202 202 2022-202 (32 202220 20 2022-20 (3 20222 2 2022-2 ( 2022-

Abstract The number of food products with genetically modified (GM) crops on the global market has increased due to advancements in genetic engineering technology. Legislation regulating the labeling and use of GM crops has increased considerably worldwide to provide consumers with health and safety assurance. It is still unclear whether genetically modified organisms (GMOs) are present in the food market of the Kingdom of Saudi Arabia due to a lack of scientific studies. This work was planned to detect GM rice and GM potatoes in the Saudi food market. One hundred non-labeled rice and rice product samples and 50 potato and potato samples were collected randomly from different market sites of Makkah, Riyadh and Jeddah during 2022-2023. The cetyl trimethyl ammonium bromide (CTAB) method was used to extract DNA. Viviants DNA extraction kit was used to extract DNA from rice starch and potato chips. To find GMOs in samples, CMOScreen 35S and NOS test kits were utilized. DNA-based qualitative and quantitative approaches were used to screen targets for PCR detection of GM rice sequences. The results indicated that 32 (32%) rice samples were positive for CaMV 35S promoter, while no positive result was detected for the NOS terminator. Besides, 30% of potato samples were positive for the CaMV 35S promoter, and the same samples were positive for the presence of the Cry V gene. It could be concluded that there were GM rice and potatoes in the Kingdom of Saudi Arabia's food markets. Establishing strong regulations and certified laboratories to monitor genetically modified foods (GMF) or crops in the Saudi market is recommended. (GM technology assurance (GMOs studies nonlabeled non labeled 5 Makkah 20222023. 20222023 2022 2023. 2023 2022-2023 CTAB (CTAB chips S utilized DNAbased based sequences 3 32% (32% promoter terminator Besides 30 gene Arabias s markets GMF (GMF recommended 2022202 202 2022-202 (32 202220 20 2022-20 (3 20222 2 2022-2 ( 2022-

Resumo Surtos frequentes do vírus da gripe aviária H9N2 no Paquistão revelaram que esse subtipo se tornou endêmico na avicultura e, além das perdas econômicas, representa uma ameaça à saúde pública. O presente estudo descreve a caracterização molecular e as alterações patológicas em frangos de corte naturalmente infectados com a atual cepa H9N2 e sua dinâmica filogenômica. Neste estudo, amostras de tecidos (traqueia, pulmões, rim e intestino) de 100 lotes comerciais de frangos foram coletadas de julho de 2018 a agosto de 2019. As amostras foram submetidas à detecção molecular, filogenia e posterior exame patológico. O comprimento completo do gene HA foi amplificado com sucesso em cinco amostras. O sequenciamento de nucleotídeos revelou amostras positivas colocadas em um clado pertencente à sublinhagem B2 do genótipo G1 e categorizado como LPAIV com base na sequência de aminoácidos do gene da hemaglutinina (HA) no local de clivagem (PAKSSR/G). A análise genética do gene da HA revelou: nt = 80,5%-99,5%; aa = 83,8%-98,9% de homologia com cepas de H9N2 relatadas anteriormente no Paquistão e em países vizinhos (A/Quail/Hong Kong/G1/97). As lesões macroscópicas incluíram aerossaculite leve, hemorragias leves, congestão difusa e exsudato purulento na mucosa traqueal, cilindro fibrinonecrótico no lúmen da traqueia e congestão pulmonar leve. As alterações histopatológicas incluíram descamação de células epiteliais, infiltração de células inflamatórias na traqueia, infiltração de células mononucleares (MNCs), congestão pulmonar e exsudato no lúmen dos parabrônquios, congestão peritubular nos rins com degeneração das células epiteliais tubulares, alterações degenerativas nas células epiteliais das vilosidades intestinais e hiperplasia de células caliciformes. A análise imunoistoquímica confirmou a presença do antígeno AIVH9N2 na traqueia, nos pulmões, no rim e no intestino. A microscopia eletrônica revelou alterações ultraestruturais na traqueia, incluindo cílios degenerados, inchaço mitocondrial e retículo endoplasmático aumentado. Com base em todas as análises, o presente estudo revelou a distribuição do vírus H9N2 do genótipo G1 em Punjab, Paquistão, com patogenicidade de leve a moderada.

Abstract Frequent outbreaks of avian influenza H9N2 virus in Pakistan revealed that this subtype has become endemic in the poultry industry and, besides economic losses, poses a threat to public health. The present study describes the molecular characterization and pathological alterations in naturally infected broiler chickens with the current H9N2 field strain and their phylogenomic dynamics. In this study, tissue samples (trachea, lung, kidney and intestine) from 100 commercial chicken flocks were collected from July 2018 to August 2019. Samples were subjected to molecular detection, phylogeny and subsequent pathological examination. The complete length of the HA gene was successfully amplified in five samples. Nucleotide sequencing revealed positive samples placed in a clade belonging to the B2 sub-lineage of the G1 genotype and categorized as LPAIV based on the amino acid sequence of the HA gene at the cleavage site (PAKSSR/G). Genetic analysis of the haemagglutinin (HA) gene revealed nt: 80.5%-99.5%; aa: 83.8%-98.9% homology to H9N2 strains reported previously from Pakistan, neighbouring countries, and (A/Quail/Hong Kong/G1/97). Gross lesions include a slight airsacculitis, mild hemorrhages, diffuse congestion and purulent exudate in tracheal mucosa, fibrinonecrotic cast in the trachea lumen and mild pulmonary congestion. Histopathological alterations include sloughing of epithelial cells and infiltration of inflammatory cells in the trachea, mononuclear cells (MNCs) infiltration, pulmonary congestion and exudate in the lumen of parabronchi, peritubular congestion in the kidneys with degeneration of tubular epithelial cells and degenerative changes in the intestinal villi epithelial cells and goblet cell hyperplasia. Immunohistochemistry analysis confirmed the presence of AIVH9N2 antigen in the trachea, lungs, kidney and intestine. Electron microscopy revealed ultrastructural changes in the trachea, including degenerated cilia, mitochondrial swelling and enlarged endoplasmic reticulum. Based on all essential analysis, the present study revealed the distribution of the H9N2 virus of G1 genotype in Punjab, Pakistan, with mild to moderate pathogenicity.

Resumo Mutações de ocorrência natural na proteína morfogenética 15 (BMP15) estão associadas à diminuição da taxa de ovulação (TO), tamanho da ninhada (TN) e esterilidade. Estudar a BMP15 na raça Cholistani para elevar o status socioeconômico e o conhecimento da criação de ovinos Cholistani no sul de Punjab, Paquistão. Em nosso estudo, 50 ovelhas Cholistani inférteis sem parentesco sanguíneo foram rastreadas para mutações BMP15. Para tanto, um DNA de alta qualidade foi extraído do sangue dessas ovelhas, seguido de concepção do primer, amplificação da reação em cadeia da polimerase (PCR), sequenciamento de DNA e análises in silico. Do total de 50 amostras, 9, incluindo caso 1 (T3), caso 2 (T8), caso 3 (T17), caso 4 (T22), caso 5 (T25), caso 6 (T33), caso 7 (T40), caso 8 (T44) e caso 9 (T47), foram consideradas positivas para uma variedade de mutações BMP15 novas e já relatadas. Mais análises in silico das mutações observadas mostraram o impacto funcional dessas mutações em diferentes características (peso molecular, PI teórico, meia-vida estimada, índice de instabilidade, localização subcelular e confirmação 3D) das proteínas codificadas, possivelmente alterando a funcionalidade normal. Nossos achados confirmaram o possível papel essencial das mutações BMP15 na infertilidade de ovelhas Cholistani.

Abstract Naturally occurring mutations in morphogenetic protein 15 (BMP15) are associated with decreased ovulation rate (OR), litter size (LS), and sterility. It is of a great interest to elucidate BMP15 gene in Cholistani sheep breed to uplift socio-economic status and the knowledge of Cholistani sheep breeding in Southern Punjab, Pakistan. In our study, a total of 50 infertile Cholistani sheep aged between 2-6 years and having no blood relation were screened for BMP15 mutations. For this purpose, a high-quality DNA was extracted from the blood of sheep followed by primer designing, Polymerase Chain Reaction (PCR) amplification, DNA sequencing, and in silico analyses. Out of total 50 samples, 9 samples including case 1 (T3), case 2 (T8), case 3 (T17), case 4 (T22), case 5 (T25), case 6 (T33), case 7 (T40), case 8 (T44), and case 9 (T47) were found positive for a variety of already reported and novel BMP15 mutations. Further in silico analyses of the observed mutations have shown the functional impact of these mutations on different characteristics (molecular weight, theoretical PI, estimated half-life, instability index, sub-cellular localization, and 3D confirmation) of the encoded proteins, possibly altering the normal functionality. In a nutshell, findings of this study have confirmed the possible essential role of the BMP15 mutations in the infertility of the Cholistani sheep.

Resumo A administração pós-natal precoce de antibióticos tem sido associada a efeitos duradouros no desenvolvimento e comportamento do cérebro. Pesquisas conduzidas em animais livres de germes demonstraram que o impacto da colonização do microbioma na regulação do eixo hipotálamo-hipófise-adrenal (HPA) e nas vias neuroendócrinas é substancial, o que desempenha um papel crucial no gerenciamento do estresse. No entanto, ainda é incerto se a exposição a antibióticos em ratas mães (geração F0) antes do desmame está associada a mudanças neurocomportamentais em filhotes (geração F1) durante a idade adulta. Para investigar os efeitos, perturbamos a microbiota intestinal de ratas (geração F0) administrando cefixima (CEF), um antibiótico comumente usado para fins obstétricos, em doses clinicamente relevantes (1 mg/kg, 2,5 mg/kg ou 5 mg/kg). Comportamentos semelhantes à ansiedade em descendentes adultos foram avaliados por meio da utilização do labirinto em cruz elevado (EPM) e paradigma de campo aberto (OFP) após um intervalo de seis semanas a partir do nascimento (PND42). Após as avaliações comportamentais, os ratos foram sacrificados, e seus cérebros e sangue coletados para análise bioquímica. A concentração plasmática de corticosterona foi usada para avaliar a atividade do HPA, enquanto a reação em cadeia da polimerase quantitativa em tempo real (PCR) foi empregada para determinar os níveis de transcrição do receptor de glicocorticoide (GR) Nr3c1. Os descendentes de F1 que receberam antibióticos antes do desmame passaram menos tempo no braço aberto do EPM. As alterações foram acompanhadas por níveis aumentados de corticosterona na corrente sanguínea. O estudo da expressão gênica revelou diminuição nos níveis de transcrição do mRNA de Nr3c1. Esta pesquisa enfatiza os possíveis efeitos a longo prazo da exposição a antibióticos antes do desmame no desenvolvimento de ansiedade na prole na idade adulta. pósnatal pós natal cérebro hipotálamohipófiseadrenal hipotálamo hipófise adrenal HPA (HPA substancial estresse entanto geração F0 F adulta CEF, CEF , (CEF) obstétricos 1 ( mgkg mg kg 25 2 2, mg/kg. . mg/kg) EPM (EPM OFP (OFP PND42. PND42 PND (PND42) comportamentais sacrificados bioquímica PCR (PCR GR (GR Nr3c1 Nrc Nr c sanguínea (CEF PND4 (PND42 Nr3c (PND4 (PND

Abstract Early postnatal administration of antibiotics has been linked to lasting effects on brain development and behavior. Research conducted on animals that are free from germs has demonstrated that the impact of microbiome colonization on the regulation of the hypothalamic-pituitary-adrenal (HPA) axis and neuroendocrine pathways is substantial, which play a crucial role in stress management. Nevertheless, it is still uncertain if the exposure to antibiotics in rat dams (F0-generation) before weaning is associated with neurobehavioral changes in rat offspring (F1-generation) during adulthood. In order to investigate the effects, we perturbed the intestinal microbiota of rat dams (F0 generation) by administering cefixime (CEF), an antibiotic commonly used for obstetric purposes, at clinically relevant doses (1 mg/kg, 2.5 mg/kg or 5 mg/kg). Anxiety-like behaviors in adult offspring was evaluated through the utilization of elevated plus maze (EPM) and open field paradigm (OFP) following a six-week interval from birth (PND42). Subsequent to behavioral assessments, the rats were euthanized, and their brains and blood was collected for biochemical analysis. Plasma corticosterone concentration was used to assess HPA activity, whereas the quantitative real-time polymerase chain reaction (PCR) was employed to determine the transcription levels of the glucocorticoid receptor (GR) Nr3c1. The offspring of F1 that were administered antibiotics before being weaned spent less time in the EPM open arm. The alterations were accompanied by increased levels of corticosterone in the bloodstream. The gene expression study revealed a decrease in the levels of mRNA transcription of Nr3c1. This research emphasizes the possible long-term effects of antibiotic exposure before weaning on the development of anxiety in offspring upon adulthood. behavior hypothalamicpituitaryadrenal hypothalamic pituitary adrenal (HPA substantial management Nevertheless F0generation Fgeneration F0 generation F (F0-generation F1generation (F1-generation adulthood (F CEF, CEF , (CEF) purposes 1 ( mgkg mg kg 25 2 2. mg/kg. . mg/kg) Anxietylike Anxiety like (EPM OFP (OFP sixweek six week PND42. PND42 PND (PND42) assessments euthanized analysis activity realtime real PCR (PCR GR (GR Nr3c1 Nrc Nr c arm bloodstream longterm long term (CEF PND4 (PND42 Nr3c (PND4 (PND

Abstract Heart and blood vessel disorders, such as coronary heart disease, brain vessel disease, rheumatic heart disease, and others, are together referred to as cardiovascular disease (CVD). In this study, we sought to determine how mitochondrial Leucine Transfer RNA genes and CVDs are related (MT-L1 and MT-L2). From CVD patients in Peshawar, a total of 27 saliva samples were taken. Leu-tRNA genes expressed by mitochondria were amplified using polymerase chain reaction after DNA was removed. Ten samples were sent for sequencing after PCR and gene cleaning. We obtained all of the sequenced results, which were subsequently aligned and evaluated against the mitochondrial revised Cambridge Reference Sequence (rCRS). However, in our sequenced samples, Leu-tRNA MT-L1 and MT-L2 genes were determined to be unaltered. Thus, it is suggested that a large population be taken into account while screening for mutations in the mitochondrial encoded Leu-tRNA MT-L1 and MT-L2 genes of cardiac patients in areas of Pakistan. Additionally, it is recommended that patients with cardiac problems should also have other mitochondrial encoded genes checked for potential mutations. This could result in the identification of genetic markers that could be used for early CVD screening in Pakistan. disorders others CVD. . (CVD) study MTL1 MTL MT L1 L (MT-L MTL2. MTL2 L2 MT-L2) Peshawar 2 LeutRNA Leu tRNA removed cleaning results rCRS. rCRS (rCRS) However MT-L unaltered Thus Pakistan Additionally (CVD (rCRS

Resumo Distúrbios do coração e dos vasos sanguíneos, como doença cardíaca coronária, doença dos vasos cerebrais, doença cardíaca reumática entre outros, são referidos juntos como doença cardiovascular (DCV). Neste estudo, procuramos determinar como os genes mitocondriais do RNA de transferência de leucina e as DCVs estão relacionados (MT-L1 e MT-L2). Foi coletado um total de 27 amostras de saliva de pacientes com DCV em Peshawar. Genes de Leu-tRNA expressos por mitocôndrias foram amplificados usando reação em cadeia da polimerase (PCR) após a remoção do DNA. Dez amostras foram enviadas para sequenciamento após PCR e limpeza gênica. Obtivemos todos os resultados sequenciados, que foram posteriormente alinhados e avaliados em comparação com a Sequência de Referência de Cambridge revisada (rCRS). No entanto, em nossas amostras sequenciadas, os genes Leu-tRNA MT-L1 e MT-L2 foram determinados como inalterados. Assim, sugere-se que uma grande população seja levada em consideração durante a triagem de mutações nos genes Leu-tRNA MT-L1 e MT-L2 mitocondriais codificados de pacientes cardíacos em áreas do Paquistão. Além disso, recomenda-se que outros genes mitocondriais codificados de pacientes com problemas cardíacos também sejam verificados quanto a possíveis mutações. Isso pode resultar na identificação de marcadores genéticos que podem ser usados para triagem precoce de DCV no Paquistão. sanguíneos coronária cerebrais DCV. . (DCV) estudo MTL1 MTL MT L1 L (MT-L MTL2. MTL2 L2 MT-L2) 2 Peshawar LeutRNA Leu tRNA (PCR DNA gênica sequenciados rCRS. rCRS (rCRS) entanto sequenciadas MT-L inalterados Assim sugerese sugere se Paquistão disso recomendase recomenda (DCV (rCRS

Abstract On March 11, 2020, the World Health Organization (WHO) declared a new coronavirus infection caused by the SARS-CoV-2 virus as a pandemic, making it the 11th pandemic of the 20th and 21st centuries. This study investigated the clinical and laboratory results (D-dimer, conventional coagulation, and HbA1c biomarker concentrations) of 150 patients (75 male and 75 female) with confirmed COVID-19 pneumonia and 50 controls (25 male and 25 female). For disease diagnosis, all COVID-19 patients were given a Real-Time Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction Assay (RT-PCR). The findings revealed that D-dimer and HbA1c levels in COVID-19 patients were significantly higher (P 0.001) at the time of admission; In COVID-19 patients, there was also a strong correlation between D-dimer levels and HbA1c levels (P 0.001). In conclusion, COVID-19 patients are more likely to have a poor prognosis if their D-dimer and HbA1c levels remain uncontrolled over a lengthy period. To lower the likelihood of a bad prognosis in COVID-19, patients with higher levels of D-dimer and HbA1c should be continuously monitored. 11 2020 WHO (WHO SARSCoV2 SARSCoV SARS CoV 2 SARS-CoV- th st centuries Ddimer, Ddimer D dimer, dimer (D-dimer coagulation HbAc HbA c concentrations 15 (7 7 female COVID19 COVID 19 COVID-1 5 (2 female. . diagnosis RealTime Real Time RTPCR. RTPCR RT PCR (RT-PCR) P 0.001 0001 0 001 admission 0.001. conclusion period COVID19, 19, monitored 1 202 SARS-CoV ( COVID1 COVID- (RT-PCR 0.00 000 00 20 0.0 0.

Resumo Em 11 de março de 2020, a Organização Mundial da Saúde (OMS) declarou uma nova infecção por coronavírus causada pelo vírus SARS-CoV-2 como uma pandemia, tornando-a a 11ª pandemia dos séculos XX e XXI. Este estudo investigou os resultados clínicos e laboratoriais (D-dímero, coagulação convencional e concentrações de biomarcadores HbA1c) de 150 pacientes (75 homens e 75 mulheres) com pneumonia por COVID-19 confirmada e 50 controles (25 homens e 25 mulheres). Para o diagnóstico da doença, todos os pacientes com COVID-19 receberam um Ensaio de Reação em Cadeia da Polimerase com Transcrição Reversa em Tempo Real (RT-PCR). Os achados revelaram que os níveis de D-dímero e HbA1c em pacientes com COVID-19 foram significativamente maiores (P 0,001) no momento da admissão. Em pacientes com COVID-19, também houve uma forte correlação entre os níveis de D-dímero e os níveis de HbA1c (P 0,001). Em conclusão, os pacientes com COVID-19 têm maior probabilidade de ter um prognóstico ruim se seus níveis de D-dímero e HbA1c permanecerem descontrolados por um longo período. Para diminuir a probabilidade de um mau prognóstico na COVID-19, os pacientes com níveis mais altos de D-dímero e HbA1c devem ser monitorados continuamente. 1 2020 OMS (OMS SARSCoV2 SARSCoV SARS CoV 2 SARS-CoV- tornandoa tornando ª XXI Ddímero, Ddímero D dímero, dímero (D-dímero HbAc HbA c 15 (7 7 mulheres COVID19 COVID 19 COVID-1 5 (2 mulheres. . doença RTPCR. RTPCR RT PCR (RT-PCR) P 0,001 0001 0 001 admissão COVID19, 19, 0,001. conclusão período continuamente 202 SARS-CoV ( COVID1 COVID- (RT-PCR 0,00 000 00 20 0,0 0,

ABSTRACT: Canine parvovirus 2 (CPV-2) is a highly contagious enteric virus that causes high morbidity and mortality, especially in dogs under six months of age. Recovery from this illness is dependent on several factors, including the patient’s prognosis for adequate therapy. The aim of this study was to evaluate the risk factors associated with the death outcome in CPV-2 positive dogs in a case-control study conducted at the Veterinary Hospital of the Universidade Federal de Lavras (HV-UFLA) in Lavras, Minas Gerais, Brazil. Twenty-six dogs with CPV-2 symptoms that arrived at the HV-UFLA between 2017 and 2018 were evaluated for inclusion in the study. Data on medical history, clinical signs, blood count and rapid test of parvovirus and faecal test for polymerase chain reaction (PCR) were collected for all the animals. All the dogs received treatment at the HV-UFLA, and the overall fatality rate due to canine parvovirus was 30.77%. Descriptive analysis and univariate and multivariate statistical analyses (logistic regression) were performed to assess the variables that were possibly associated with an unfavourable prognosis (death). In the univariate and multivariate analyses, Systemic Inflammatory Response Syndrome (SIRS) was observed to be a significant risk factor for an unfavourable prognosis in canine parvovirus, as it increased the risk of death by 12.96 times (95% CI 1.85-133.70; P < 0.01) compared with patients who did not exhibit SIRS. Thus, SIRS was strongly associated with an unfavourable prognosis, suggesting that it can be used as a prognostic indicator for canine parvovirus in veterinary practice. ABSTRACT CPV2 CPV (CPV-2 mortality age patient s therapy CPV- casecontrol case control HVUFLA HV UFLA (HV-UFLA Gerais Brazil Twentysix Twenty 201 history signs PCR (PCR animals HVUFLA, UFLA, 3077 30 77 30.77% logistic regression death. . (death) (SIRS 1296 12 96 12.9 95% 95 (95 1.85133.70 18513370 1.85 133.70 1 85 133 70 1.85-133.70 0.01 001 0 01 Thus practice (CPV- 20 307 3 7 30.77 (death 129 9 12. (9 85133 1.85133.7 1851337 185 1.8 13370 133.7 8 13 1.85-133.7 0.0 00 (CPV 30.7 ( 8513 1.85133. 185133 18 1. 1337 133. 1.85-133. 0. 30. 851 1.85133 18513 1.85-133 1.8513 1851 1.85-13 1.851 1.85-1 1.85-

RESUMO: O parvovírus canino 2 (CPV-2) é um vírus entérico altamente contagioso que causa alta morbidade e mortalidade, principalmente em cães com menos de seis meses de idade. A recuperação desta doença é dependente de vários fatores, incluindo a determinação do prognóstico do paciente para terapia adequada. O objetivo deste estudo foi avaliar os fatores de risco associados ao desfecho óbito em cães com CPV-2 em um estudo de caso-controle realizado no Hospital Veterinário da Universidade Federal de Lavras (HV-UFLA), em Lavras, Minas Gerais. Vinte e seis cães com sintomas de CPV-2 que chegaram entre 2017 e 2018 ao HV-UFLA foram avaliados para inclusão no estudo. Dados sobre histórico médico, sinais clínicos, hemograma e teste rápido de parvovirose e fezes para reação em cadeia da polimerase (PCR) foram coletados para todos os animais. Todos os cães receberam tratamento estabelecido pelo HV-UFLA e a taxa geral de letalidade por parvovirose canina foi de 30,77%. Análise descritiva e análise estatística univariada e multivariada (regressão logística) foram utilizadas para avaliar variáveis possivelmente associadas a um prognóstico desfavorável (óbito). Na análise univariada e multivariada, a Síndrome da Resposta Inflamatória Sistêmica (SIRS) foi observada como fator de risco significativo para prognóstico desfavorável na parvovirose canina, pois aumentou 12,96 vezes o risco de morte (95% IC 1,85-133,70; P < 0,01) em comparação com aqueles pacientes que não apresentaram SIRS. Assim, a SIRS foi fortemente associada com um prognóstico desfavorável, sugerindo que pode ser utilizada como indicador prognóstico na parvovirose canina na prática veterinária. RESUMO CPV2 CPV (CPV-2 mortalidade idade adequada CPV- casocontrole caso controle HVUFLA, HVUFLA HV UFLA , (HV-UFLA) Gerais 201 médico clínicos PCR (PCR animais 3077 30 77 30,77% regressão logística óbito. . (óbito) (SIRS 1296 12 96 12,9 95% 95 (95 1,85133,70 18513370 1,85 133,70 1 85 133 70 1,85-133,70 0,01 001 0 01 Assim veterinária (CPV- (HV-UFLA 20 307 3 7 30,77 (óbito 129 9 12, (9 85133 1,85133,7 1851337 185 1,8 13370 133,7 8 13 1,85-133,7 0,0 00 (CPV 30,7 ( 8513 1,85133, 185133 18 1, 1337 133, 1,85-133, 0, 30, 851 1,85133 18513 1,85-133 1,8513 1851 1,85-13 1,851 1,85-1 1,85-