Abstract The gall wasp, Leptocybe invasa, poses a significant global threat to Eucalyptus cultivation, by causing substantial economic losses. The objective of this study was to differentiate between resistant and susceptible genotypes by morphological characteristics using image analysis based on the damage caused by the gall wasp. In addition, consensus sequences derived from transposable elements (TEs) and the genome of Eucalyptus spp. Were identified by in silico analysis. Furthermore, another objective was to discriminate Eucalyptus genotypes in response to Leptocybe invasa by conducting molecular analyses involving transposable elements and inter simple sequence markers. For image analysis, the GroundEye ® system was used to collect images of 60 leaves from six genotypes, three of which were resistant and three susceptible. Eucalyptus spp. sequences were obtained from the GenBank database by in silico analysis and pairwise alignments with TE sequences were conducted using BLASTN. Multiple sequence alignment was performed with Clustal Omega, followed by the identification of conserved regions in Jalview. A motif signature was generated using Weblogo. For molecular characterization using ISSR markers and TEs, samples of young leaves were obtained from a total of 80 Eucalyptus seedlings, of which 50 were classified as resistant and 30 as susceptible to L. invasa. It was possible to distinguish gall wasp susceptible and resistant genotypes by image analysis. In silico analysis enabled the identification of conserved regions in the Eucalyptus spp. genome, which were associated with proteins involved in secondary metabolite production, e.g., terpenes, which play a role in the response to L. invasa. The discrimination capacity of TEs and ISSR primers was demonstrated and bands were generated that could be used to identify resistant genotypes. However, increasing the number of markers required to discriminate genotypes in both cases is suggested. cultivation losses addition (TEs spp Furthermore 6 BLASTN Omega Jalview Weblogo 8 seedlings 5 3 L production eg e g e.g. terpenes However suggested e.g
Resumo A vespa-da-galha, Leptocybe invasa, representa uma ameaça global significativa para o cultivo de Eucalyptus, causando consideráveis prejuízos econômicos. O objetivo deste estudo foi diferenciar entre genótipos resistentes e suscetíveis por meio de características morfológicas, usando análise de imagem com base nos danos causados pela vespa-da-galha. Além disso, sequências de consenso derivadas de elementos transponíveis (TEs) e do genoma de Eucalyptus spp. foram identificadas por análise in silico. Outro objetivo foi discriminar genótipos de Eucalyptus em resposta a L. invasa, por meio de análises moleculares envolvendo elementos transponíveis e marcadores de sequências simples intercaladas (ISSR). Para a análise de imagem, o sistema GroundEye® foi utilizado para coletar imagens de 60 folhas de seis genótipos, sendo três resistentes e três suscetíveis. Sequências de Eucalyptus spp. foram obtidas do banco de dados GenBank por análise in silico, e alinhamentos de sequências em pares com sequências de TE foram conduzidos usando o BLASTN. Alinhamento de múltiplas sequências foi realizado com Clustal Omega, seguido pela identificação de regiões conservadas no Jalview. Uma assinatura de motivo foi gerada usando o Weblogo. Para a caracterização molecular usando marcadores ISSR e TEs, amostras de folhas jovens foram obtidas de um total de 80 mudas de Eucalyptus, das quais 50 foram classificadas como resistentes e 30 como suscetíveis a L. invasa. Foi possível distinguir genótipos suscetíveis e resistentes à vespa-das-galhas por meio da análise de imagem. A análise in silico permitiu a identificação de regiões conservadas no genoma de Eucalyptus spp., associadas a proteínas envolvidas na produção de metabólitos secundários, como terpenos, que desempenham um papel na resposta a L. invasa. A capacidade de discriminação de TEs e iniciadores ISSR foi demonstrada, e bandas foram geradas que poderiam ser usadas para identificar genótipos resistentes. No entanto, sugere-se aumentar o número de marcadores necessários para discriminar genótipos em ambos os casos. vespadagalha, vespadagalha vespa galha, galha vespa-da-galha invasa econômicos morfológicas vespadagalha. galha. disso (TEs spp L ISSR. . (ISSR) GroundEye 6 BLASTN Omega Jalview Weblogo 8 5 3 vespadasgalhas galhas secundários terpenos demonstrada entanto sugerese sugere se casos (ISSR