Resumo A complexa interação entre parasitas gastrointestinais e hospedeiros ovinos envolve comunidades de bactérias, gêneros de parasitas, genes parasitários e vias biológicas. Haemonchus contortus representa um desafio global para ruminantes, e a comunidade bacteriana pode influenciar a resistência e a suscetibilidade a esses parasitas. Assim, uma melhor compreensão dessa complexa interação pode contribuir para o desenvolvimento de uma nova abordagem para o controle desse parasito. Este estudo avaliou a comunidade bacteriana em ovinos Corriedale, naturalmente infectados com H. contortus, classificados em baixas cargas parasitárias (LC), intermediárias (IC) ou altas (HC), ao longo de dez meses. Amostras de fezes foram coletadas mensalmente para a contagem de ovos (OPG), e o sequenciamento do gene 16S rRNA foi realizado em cinco animais de cada grupo. O OPG médio foi de 2.635 ± 105 para HC, 845 ± 129 para IC e 110 ± 70 para LC, com uma diferença significativa (p = 0,0001). Firmicutes, Proteobacteria e Spirochaetes foram mais abundantes no grupo HC. 102 gêneros bacterianos apresentaram diferenças significativas entre os grupos LC e HC. A Beta diversidade foi estatisticamente diferente (p<0,005) para HC em comparação com os outros dois grupos. Também encontraram-se comunidades diferentes entre LC e HC. Sediminispirochaeta, Oribacterium, Alloprevotella, Prevotellaceae_UCG-001, Prevotellaceae_UCG-003, Ruminiclostridium_6 e Ruminococcus_1 foram significativamente mais abundantes no grupo LC e IC. Acetobacter e Methanocorpusculum tiveram uma redução significativa no grupo LC. Gêneros bacterianos relacionados à baixa emissão de metano e melhor eficiência alimentar estavam significativamente presentes no grupo LC. Portanto, uma melhor compreensão do papel da interação hospedeiro-parasita pode contribuir para melhorar o controle de H. contortus.

Abstract A complex interaction of gastrointestinal parasites with sheep hosts may involve bacteria communities, parasite genera, parasitic genes, and biological pathways. Haemonchus contortus presents a global challenge for ruminants, and the bacterial community can influence sheep's resistance and susceptibility to these parasites. Thus, a better understanding of this complex interaction could contribute to the development of a new approach to parasite control. This study evaluated the bacterial community of Corriedale sheep naturally infected with H. contortus based on the fecal egg counts over ten months and then classified as having low (LC), intermediate (IC), or high (HC). Stool samples were collected monthly for egg counts (EPG), and 16S rRNA gene sequencing was performed on five animals from each group. The average EPG was 2,635 ± 105 for HC, 845 ± 129 for IC, and 110 ± 70 for LC, with a significant difference (p = 0.0001). Firmicutes, Proteobacteria, and Spirochaetes were more abundant in the HC group. 102 bacterial genera showed significant differences between the LC and HC groups. Beta diversity was statistically different (p<0.005) for HC compared with the other two groups; also, different communities were found between LC and HC. Sediminispirochaeta, Oribacterium, Alloprevotella, Prevotellaceae_UCG-001, Prevotellaceae_UCG-003, Ruminiclostridium_6 and Ruminococcus_1were significant more abundant in LC, and IC group. Acetobacter and Methanocorpusculum had a significant reduction in the LC group. Thus, bacterial genera related to low methane emission and food efficiency were significantly present in the LC group. Therefore, a better understanding of the role of host-bacterial community-parasite interaction could contribute to improving parasite control management.

Resumo: Os padrões alimentares impactam significativamente os desfechos de saúde e a composição da microbiota intestinal. No entanto, estudos longitudinais sobre o consumo de alimentos ultraprocessados e a composição da microbiota intestinal, especialmente entre adolescentes em países de baixa e média renda, são escassos. Este estudo teve como objetivo explorar essa associação utilizando dados coletados de 364 participantes aos 6, 11 e 12 anos, da Coorte de Nascimentos de Pelotas (Brasil) de 2004. Os dados sobre microbiota foram obtidos aos 12 anos por meio de sequenciamento do gene 16S rRNA de amostras fecais autocoletadas. Modelos de regressão linear e logística avaliaram a relação entre faixas etárias e resultados da microbiota intestinal (diversidade alfa, diversidade beta e abundâncias relativas nos níveis de filo e gênero), considerando fatores demográficos, socioeconômicos, relacionados à saúde, comportamentais e covariáveis dietéticas. Não foram observadas associações significativas entre o consumo de alimentos ultraprocessados e a diversidade alfa após correção para múltiplos testes, e não foram encontradas evidências de uma ligação entre o consumo de alimentos ultraprocessados e a diversidade beta, com as métricas não ponderadas explicando pouca variância aos 11 e 12 anos. Foram encontradas associações nominais entre o consumo de alimentos ultraprocessados e as abundâncias relativas de Actinobacteria (p = 0,032) e Proteobacteria (p = 0,045) (filos), assim como entre Bacteroides (p = 0,037 aos 6 anos; p = 0,015 aos 11 anos) e Peptostreptococcus (p = 0,025 aos 6 anos; p = 0,010 aos 11 anos) (gêneros). No entanto, essas associações perderam significância estatística após os ajustes para comparações múltiplas. Esses achados destacam a necessidade de mais estudos longitudinais para compreender melhor a complexa interação entre o consumo de alimentos ultraprocessados e a composição da microbiota intestinal em populações adolescentes de países de baixa e média renda.

Resumen: Los patrones dietéticos afectan significativamente la salud y la composición de la microbiota intestinal. No obstante, se observan escasos estudios longitudinales sobre el consumo de alimentos ultraprocesados y la composición de la microbiota intestinal, especialmente entre adolescentes de países de ingresos bajos y medianos. Este estudio tuvo como objetivo explorar esta asociación a partir de datos recopilados de 364 participantes de 6, 11 y 12 años de edad de la Cohorte de Nacimientos de Pelotas (Brasil), 2004. Los datos de la microbiota se obtuvieron a los 12 años mediante la secuenciación del gen ARNr 16S de muestras fecales autorecogidas. Los modelos de regresión lineal y logística evaluaron la relación entre los grupos de edad y los resultados de la microbiota intestinal (diversidad alfa, diversidad beta y abundancias relativas a nivel de filo y género) teniendo en cuenta las covariables demográficas, socioeconómicas, relacionadas con la salud, el comportamiento y la dieta. No se observaron asociaciones significativas entre el consumo de alimentos ultraprocesados y la diversidad alfa después de la corrección para múltiples pruebas, y no se encontró evidencia de un vínculo entre el consumo de alimentos ultraprocesados y la diversidad beta, con métricas no ponderadas que explican poca varianza a los 11 y 12 años. Se encontraron asociaciones nominales entre el consumo de alimentos ultraprocesados y las abundancias relativas de Actinobacteria (p = 0,032) y Proteobacteria (p = 0,045) (filos), así como entre Bacteroides (p = 0,037 a los 6 años; p = 0,015 a los 11 años) y Peptostreptococcus (p = 0,025 a los 6 años; p = 0,010 a los 11 años) (géneros). Sin embargo, estas asociaciones perdieron significación estadística después de los ajustes para comparaciones múltiples. Estos hallazgos resaltan la necesidad de realizar más estudios longitudinales para conocer mejor la compleja interacción entre el consumo de alimentos ultraprocesados y la composición de la microbiota intestinal en poblaciones de adolescentes de países de ingresos bajos y medianos.

Abstract: Dietary patterns significantly impact health outcomes and gut microbiota composition. However, longitudinal studies associating ultra-processed food consumption with gut microbiota composition, especially among adolescents in low- and middle-income countries, are lacking. This study aimed to explore this association using data collected from 364 participants at ages 6, 11, and 12 years from the 2004 Pelotas (Brazil) Birth Cohort. Microbiota data was obtained at age 12 after 16S rRNA gene sequencing of self-collected fecal samples. Linear or logistic regression models evaluated the relationship between age groups and gut microbiota outcomes (alpha diversity, beta diversity and relative abundances at the phylum and genus levels), considering dietary covariates and demographic, socioeconomic, health-related, and behavioral factors. No significant associations between ultra-processed food consumption and alpha diversity were observed after multiple testing corrections, and there was no strong evidence linking ultra-processed food consumption and beta diversity, with unweighted metrics explaining little variance at ages 11 and 12. Nominal associations were found between ultra-processed food and relative abundances of Actinobacteria (p = 0.032) and Proteobacteria (p = 0.045) (phyla), Bacteroides (p = 0.037 at age 6; p = 0.015 at age 11) and Peptostreptococcus (p = 0.025 at age 6; p = 0.010 at age 11) (genera). However, these associations lost statistical significance after adjustments for multiple comparisons. These findings highlight the need for more longitudinal studies to better understand the complex interaction between ultra-processed food intake and gut microbiota composition in adolescent populations in low- and middle-income countries.

Resumen Introducción: Varias presiones antrópicas sufren los ecosistemas acuáticos del piedemonte llanero en Colombia. La respuesta a estresores ambientales aún se desconoce en organismos bioindicadores como Leptohyphidae. Objetivo: Determinar la diversidad de ninfas de Leptohyphidae del río Quenane-Quenanito, en dos periodos hidrológicos contrastantes y su relación con algunas variables fisicoquímicas. Métodos: En diciembre (2014) y febrero (2015) se recolectaron organismos con red Surber en seis estaciones a lo largo del río. Se analizó la diversidad alfa y beta y se aplicó análisis de redundancia y modelos lineales generalizados con el fin de establecer la relación entre los taxones y las variables ambientales. Resultados: Se identificaron 369 organismos pertenecientes a cuatro géneros (Amanahyphes, Traverhyphes, Tricorythopsis y Tricorythodes), dos especies y ocho morfoespecies. Se reporta por primera vez para el departamento del Meta Amanahyphes saguassu. Se registró la mayor diversidad de ninfas en la transición a la sequía y la mayor abundancia en sequía. La diversidad beta señaló que la configuración del ensamblaje cambia a nivel espacial y temporal. Conclusiones: Los organismos de Leptohyphidae prefieren hábitats de corrientes, particularmente en el periodo de sequía, donde hallan alimento (hojarasca, detritos) y refugio para establecerse exitosamente; actividades antrópicas como la urbanización afectan notablemente la diversidad. La alta diversidad registrada en este pequeño río de piedemonte llanero refleja la necesidad de incrementar este tipo de trabajos y esfuerzos de recolección de material de estudio en la región.

Abstract Introduction: Various anthropic pressures affect the aquatic ecosystems of the foothills of Colombia. The response to environmental stressors is still unknown in bioindicator organisms such as Leptohyphidae. Objective: To determine the diversity of Leptohyphidae nymphs of the Quenane-Quenanito river, in two contrasting hydrological periods and its relationship with some physicochemical variables. Methods: In December (2014) and February (2015), organisms were collected with a Surber net at six stations along the current. Alpha and beta diversity was analyzed and redundancy analysis and generalized linear model were applied to establish the relationship between taxa and environmental variables. Results: Were identified 369 organisms belonging to four genera (Amanahyphes, Traverhyphes, Tricorythopsis, and Tricorythodes), two species, and eight morphospecies. Amanahyphes saguassu is reported for the first time for the Meta department. High diversity of Leptohyphidae nymphs was recorded in the transition to drought season and greater abundance in drought. Beta diversity indicated that the configuration of the assemblage changes spatially and temporally. Conclusions: Leptohyphidae organisms prefer fast habitats, particularly in the dry period where they find food (leaf litter, detritus) and shelter to establish themselves successfully; anthropic activities such as urbanization notably affect diversity. The high diversity recorded in this small river in the foothills of the plains reflects the need to increase this type of works and collection efforts of study material in the region.

Resumen Introducción: El monitoreo de bioindicadores es una herramienta importante para la conservación de áreas naturales protegidas. Diferentes grupos taxonómicos fueron estudiados como bioindicadores por presentar: facilidad de muestreo, respuestas variadas a la perturbación, riqueza asociada a otras especies, y taxonomía accesible. Objetivo: Comparar el potencial de cuatro taxones (Chilopoda, Scarabaeidae, Carabidae y Pompilidae) como bioindicadores ambientales, tomando en cuenta su facilidad de recolección, presencia de cambios en la composición de sus comunidades por perturbaciones, presencia de especies con preferencia por áreas perturbadas o conservadas; y diversidad correlacionada con la diversidad de los otros taxones. Métodos: El trabajo se realizó en la estación Biológica Manu Learning Centre en la Reserva de Biosfera del Manu, que comprende tres áreas en un gradiente de perturbación. Los ejemplares fueron recolectados con trampas pitfall, bandejas amarillas, trampas Malaise y monolitos, de mayo a diciembre del 2021. La facilidad de recolección se midió en términos de riqueza y abundancia; los cambios en la composición de sus comunidades mediante el análisis de similitud, escalamiento no métrico multidimensional, y partición de la diversidad beta; presencia de especies con preferencia con el análisis de correspondencia y el ajuste de bondad G de Williams; y finalmente la correlación de las diversidades con el índice de Spearman. Resultados: De los taxones estudiados, las de más fácil recolección fueron Scarabaeidae y Pompilidae. Existen cambios en la composición en todos los taxones, pero son importantes solo en Chilopoda y Scarabaeidae. En todos los taxones hay especies con preferencia por ambientes perturbados y no perturbados. Existe una alta correlación de las diversidades de Carabidae, Scarabaeidae y Chilopoda. Conclusiones: Todos los grupos responden de diferente forma a los gradientes de perturbación, Scarabaeidae y Chilopoda fueron los que tuvieron mejores características para ser considerados buenos bioindicadores.

Abstract Introduction: Bioindicator monitoring is a crucial conservation strategy within natural protected areas. Various taxonomic groups have been investigated as bioindicators due to their distinctive attributes, including ease of sampling, differential responses to disturbances, associations with species richness, and accessible taxonomy. Objective: To compare the potential of four taxa (Chilopoda, Scarabaeidae, Carabidae, and Pompilidae) as environmental bioindicators, considering their ease of collection, presence of changes in community composition due to disturbances, including species with preferences for disturbed or conserved areas; and to correlate their diversity with the diversity of other taxa. Methods: The study was conducted at the Manu Learning Centre Biological Station in the Manu Biosphere Reserve, which comprises three areas along a disturbance gradient. Specimens were collected using pitfall traps, yellow pan traps, Malaise traps, and monoliths from May to June in 2021. Ease of collection was measured in terms of richness and abundance; changes in the community composition were assessed using similarity analysis, non-metric multidimensional scaling, and beta diversity partitioning; presence of species with preferences was analyzed using correspondence analysis and G. Williams’ goodness-of-fir test; and diversity correlation using the Spearman index. Results: Among the taxa investigated, Scarabaeidae and Pompilidae were the easiest to collect. Changes in composition were observed in all taxa but were significant only in Chilopoda and Scarabaeidae. All taxa exhibited species with preferences for disturbed and undisturbed environments. There was a high correlation in diversities among Carabidae, Scarabaeidae, and Chilopoda. Conclusions: Our findings underscore the diverse responses exhibited by taxa along a disturbance gradient. Notably, Scarabaeidae and Chilopoda emerged as particularly robust bioindicators within the studied ecosystem.

Resumen Introducción: La creación de espacios naturales protegidos en entornos urbanos desempeñan un papel esencial, proporcionando reservorios de vegetación autóctona y refugios de fauna endémica. Sin embargo, es escaso el conocimiento sobre cómo la gestión del suelo y el diseño del paisaje influye en las diferentes estructuras comunitarias de parques urbanos. Objetivo: Analizar a través de comunidades de hormigas la influencia de la urbanización en un área natural protegida en zona urbana. Métodos: De abril a julio de 2022, en transectos de 100 m se colocaron trampas de cebo y Pitfall, se registró la presencia de especies de hormigas del Parque Estatal “El Refugio” (PER), Tamaulipas, México. La diversidad Alfa se evaluó mediante números de Hill y la diversidad Beta con el índice de Jaccard. Se identificaron especies indicadoras con el Valor Indicador (IndVal). Se realizó un análisis de correspondencia múltiple asociando la presencia de especies con variables ambientales y tipos de vegetación. Se realizó una tabla de contingencia para relacionar la presencia de hormigas con el tamaño de cobertura vegetal. Resultados: En total, se capturaron 18 565 individuos (cinco subfamilias, 22 géneros y 29 especies). La riqueza y diversidad de especies disminuyó en sitios con baja cobertura vegetal, como en matorral espinoso tamaulipeco; la vegetación secundaria conservó mayor riqueza de especies. Áreas de vegetación secundaria y pastizal registraron especies indicadoras, principalmente especies generalistas y tolerantes a las altas temperaturas como Forelius mccooki y Tetramorium spinosum. La presencia de especies está asociada con la temperatura, humedad y cobertura vegetal. Se evidenció una relación entre presencia de especies de hormigas y tamaño de cobertura vegetal. Conclusiones: La estructura y composición de las comunidades de hormigas varía de acuerdo con la estructura vegetal, principalmente en áreas que han sufrido mayor daño antropogénico. La conservación de los paisajes y el monitoreo de estas áreas, deben ser considerados en futuras investigaciones.

Abstract Introduction: The creation of protected natural areas within urban environments has played an essential role in providing small reservoirs of native vegetation and refuges for endemic species. However, knowledge of how land management and landscape design can influence the different community structures of urban parks is scarce. Objective: To analyze, through ant communities, the influence of urbanization in a protected natural area (PNA) located in an urban zone. Methods: From April to July 2022, using bait traps and pitfall traps along 100 m transects, the presence of ant species was recorded in the El Refugio State Park Natural Area in Tamaulipas, Mexico. Alpha diversity was assessed using Hill numbers, while beta diversity was evaluated using the Jaccard index. Additionally, indicator species were identified through the indicator value (IndVal). Multiple correspondence analysis was conducted to associate the presence of species with environmental variables and vegetation types, and contingency tables were created to relate ant presence to vegetation cover size. Results: In total 18 565 individuals were captured (five subfamilies, 22 genera, and 29 species). Species richness and diversity decreased in sites with low vegetation cover, such as in Tamaulipan thornscrub; secondary vegetation retained greater species richness. Indicator species found in secondary vegetation and grassland areas were mainly composed of species that tolerate high temperatures and generalists such as Forelius mccooki and Tetramorium spinosum. The presence of these species is primarily associated with temperature, humidity, and vegetation cover. A relationship between the presence of ant species and vegetation cover size was evident. Conclusion: The structure and composition of ant communities vary according to the type of vegetation structure, particularly in areas that have undergone greater anthropogenic damage. Therefore, the conservation of landscapes, as well as monitoring of these areas, should be considered in future research.

Resumen Introducción: Cada vez son más los estudios que incluyen la diversidad funcional para comprender los patrones de la biodiversidad. Sin embargo, en el departamento del Tolima, se ha investigado poco este aspecto en las comunidades de aves, lo que crea un vacío de conocimiento acerca de esta faceta de la diversidad biológica. Objetivo: Determinar cambios o patrones en la diversidad taxonómica y funcional de la avifauna del Centro Universitario Regional del Norte del Tolima (CURDN) durante un periodo de ocho años. Métodos: Los datos fueron organizados de manera que permitieran determinar cambios en la comunidad de aves a lo largo del tiempo y en diferentes épocas climáticas (alta y baja precipitación). Se emplearon diferentes índices de diversidad taxonómica y funcional (alfa y beta). Para evaluar el efecto de las temporadas climáticas y establecer diferencias entre los años, se utilizó el Escalamiento Multidimensional No Métrico (NMDS) y el Análisis de Similitud no paramétrico (ANOSIM). Resultados: Durante el periodo de estudio, se registraron 2 691 individuos. No se encontraron diferencias en la diversidad alfa, tanto taxonómica como funcional. Sin embargo, los resultados de estas dos facetas de la biodiversidad revelaron patrones opuestos que están estructurando la comunidad de aves. El análisis de partición de la diversidad taxonómica beta reveló un proceso de recambio de especies, mientras que la diversidad beta funcional determinó un anidamiento funcional. Conclusión: La diversidad funcional señaló la posibilidad de que las actividades antropogénicas llevadas a cabo en el CURDN actúan como filtros que estructuran la comunidad de aves. Estos hallazgos resaltan la importancia de considerar estas dos facetas de la biodiversidad para determinar cambios o patrones de las comunidades de aves durante un amplio periodo de estudio.

Abstract Introduction: More and more studies include functional diversity to understand biodiversity patterns. However, in Tolima department, little research has been conducted on this aspect in bird communities, creating a knowledge gap to this important facet of biodiversity. Objective: To determine changes or patterns in the taxonomic and functional diversity of bird communities at the Centro Universitario Regional del Norte (CURDN) for eight years. Methods: The data were organized to identify changes in the bird community over time and during different climatic periods (high and low precipitation). Several indices of taxonomic and functional diversity (alpha and beta) were used. Non-Metric Multidimensional Scaling (NMDS) and Non-Parametric Analysis of Similarity (ANOSIM) were applied to evaluate the impact of climatic periods and temporal variation. Results: During the sampling, 2 691 individuals were recorded. We found that there was no difference in the taxonomic and functional alpha diversity. However, the results of these two facets of biodiversity revealed opposing patterns that are structuring bird communities. The partitioning analysis of taxonomic beta diversity revealed a process of species turnover, while functional beta diversity revealed functional nestedness. Conclusions: Functional diversity suggested that anthropogenic activities in the CURDN act as filters that structure bird communities. These findings highlight the importance of considering these two facets of biodiversity to determine changes or patterns in bird communities over a long period.

Resumen Introducción: Los isópodos terrestres (Oniscidea) juegan un papel importante en los procesos ecológicos del suelo en ecosistemas tropicales y han sido empleados como indicadores de impacto ambiental. A pesar de su importancia, los estudios sobre la ecología de este suborden en el Neotrópico son escasos. Objetivo: Evaluar los cambios espaciales en la diversidad alfa y beta de Oniscidea en la zona supralitoral en las ecorregiones Archipiélagos Coralinos (ARCO), Magdalena (MAG) y Morrosquillo (MOR) en el Caribe colombiano. Métodos: Realizamos Búsquedas Intuitivas Directas de especímenes y medimos la temperatura y la humedad del suelo en 19 transectos con troncos, hojarasca, restos de coral y material vegetal en descomposición. Resultados: Recolectamos un total de 1 970 individuos representando 17 especies, siendo Tylidae, Halophilosciidae y Ligiidae las familias más abundantes. Los órdenes de diversidad alfa fueron mayores en ARCO, en comparación con las ecorregiones MAG y MOR. MAG y MOR difirieron en la riqueza observada. La estructura del ensamblaje varió en especies dominantes y sus abundancias. En ARCO las especies indicadoras fueron Tylos niveus, Littorophiloscia denticulata, Halophiloscia trichoniscoides y Ligia baudiniana; en MOR fue Tylos marcuzzii y en MAG fue Littorophiloscia tropicalis. El NMDS confirmó una alta diversidad beta (> 60%), con diferencias en la estructura del ensamblaje entre ecorregiones, que separó claramente cada grupo. El ACC reveló una relación negativa entre la mayoría de las especies con la temperatura y humedad del suelo, observándose una relación positiva con T. marcuzzii. Conclusiones: Este es el primer esfuerzo por describir los cambios espaciales en la diversidad de oniscídeos en la zona supralitoral de la región Neotropical, proporcionando una línea base para futuros estudios. Esta información podría ser fundamental para identificar áreas prioritarias para los esfuerzos de conservación.

Abstract Introduction: Terrestrial isopods (Oniscidea) play important roles in the ecological processes of the soil in tropical ecosystems and are employed as indicators of environmental impact. Despite their importance, studies on the ecology of this suborder in the Neotropics are scarce. Objective: To assess spatial changes in alpha and beta diversity of Oniscidea in the supralittoral zone across Archipiélagos Coralinos (ARCO), Magdalena (MAG), and Morrosquillo (MOR) ecoregions in the Colombian Caribbean. Methods: We conducted Direct Intuitive Searches of specimens and measured soil temperature and moisture in 19 transects with logs, leaf litter, coral remains, and decomposing plant material. Results: A total of 1 970 individuals representing 17 species were collected, with Tylidae, Halophilosciidae, and Ligiidae being the most abundant families. Alpha diversity orders were higher in ARCO than MAG and MOR ecoregions. MAG and MOR differed in observed richness. The structure of the assemblage varied in dominant species and abundances. In ARCO, the indicator species were Tylos niveus, Littorophiloscia denticulata, Halophiloscia trichoniscoides, and Ligia baudiniana; in MOR, it was Tylos marcuzzii, and in MAG, it was Littorophiloscia tropicalis. High beta diversity (> 60 %), with significant differences in the assemblage structure among ecoregions, was confirmed by the NMDS, which distinctly separated each group. CCA analysis revealed a negative relationship between most species with soil temperature and moisture, with a positive relationship observed with T. marcuzzii. Conclusions: This is the first effort to describe spatial changes in the diversity of oniscideans in the supralittoral zone of the Neotropical region, providing a baseline for future studies. This information could be instrumental in identifying priority areas for conservation efforts.

Abstract: Fodder beet is a crop of interest in the Norpatagonia Argentina, since it is used for feeding cattle in winter. Although it offers nutritional advantages and significant yields, its slow establishment and competition with weeds pose challenges to producers, and thus the application of herbicides is essential for proper crop management. The objective of this study was to evaluate the effect of replacing the pre-emergent herbicide S-metolachlor by pendimethalin on the establishment of fod- der beer. Pot and field experiments were carried out. The pot experiment consisted of 3 treatments of pre-emergent herbicides (PRE): S-metolachlor 1 L ha-1 (M) and pendimethalin in two doses: 4 and 6 L ha-1 (P4 and P6), and a post-emergent herbicide (POS): Betanal 1 L ha-1 (B). The field experiment was conducted using a split-plot design, with PRE (P4, P6 and M) as the main factor, and with and without POS (B) as the secondary factor. Crop emergence dynamics and weed control were evaluated by comparing richness, abundance and diversity between treatments. In the pot trial, treatment P4 showed crop emergence dynamics similar to the control treatment (T), being less phytotoxic than M. In both experiments, the treatments did not show significant differences in weed species richness, while P4 without POS was the treatment exhibiting the highest abundance and diversity of species. The replacement of M by P4 would be a suitable alternative for the establishment of fodder beet crop accompanied by a post-emergence herbicide.

Resumen: La remolacha forrajera es un cultivo de interés en la Norpatagonia Argentina, ya que es usada para la alimentación del ganado bovino en invierno. Aunque ofrece ventajas nutricionales y rendimientos significativos, su lenta implantación y la competencia con malezas presenta algunas dificultades para los productores, por lo que la aplicación de herbicidas es fundamental para el adecuado manejo del cultivo. El objetivo de esta investigación fue evaluar el efecto de sustituir el herbicida preemergente S-metalocloro por pendimetalin en la implantación del cultivo. Se llevaron a cabo experimentos en maceta y de campo. El experimento en macetas consistió en tres tratamientos de herbicidas preemergentes (PRE): S-metalocloro 1 L ha-1 (M) y pendimetalin en dos dosis: 4 y 6 L ha-1 (P4 y P6); y un herbicida posemergente (POS): Betanal 1 L ha-1 (B). El experimento de campo se realizó usando un diseño de parcelas divididas donde el factor principal fue PRE (P4, P6 y M), y el factor secundario fue POS: con y sin (B). Se evaluó la dinámica de emergencia del cultivo y el control de malezas, comparando riqueza, abundancia y diversidad entre tratamientos. En el experimento en macetas, el tratamiento P4 mostró una dinámica de emergencia del cultivo similar al tratamiento testigo (T), siendo menos fitotóxico que M. En ambos experimentos, los tratamientos no evidenciaron diferencias significativas en riqueza de especies de malezas, mientras que P4 sin POS fue el que presentó mayor abundancia y diversidad. La sustitución de M por P4 sería una alternativa adecuada para la implantación del cultivo de remolacha forrajera, acompañada de un herbicida de posemergencia.

Resumen Antecedentes: Los musgos epífitos son uno de los grupos más comunes en ambientes forestales, pero de los más desatendidos de México. Preguntas: ¿Cuál es la riqueza, recambio y composición de la comunidad de musgos epífitos en los bosques de México? Especies de estudio: Musgos epífitos. Sitios y años de estudio: Bosque húmedo de montaña, de pino-encino y tropical perennifolio. Periodo de estudio: 2015-2021. Métodos: Mediante una revisión bibliográfica y trabajo de campo recopilamos datos de musgos epífitos en tres tipos de bosques de México. Evaluamos los datos mediante análisis de diversidad alfa y beta, especies indicadoras y composición de la comunidad. Además, exploramos la influencia de la altitud y el tipo de bosque en los patrones de diversidad observados. Resultados: Reportamos una riqueza de 147 especies de musgos epífitos para tres tipos de bosques de México. El bosque húmedo de montaña es el mejor muestreado y con la mayor riqueza de musgos. El recambio de especies es similar entre los bosques estudiados. Constatamos que la elevación y el tipo de bosque están relacionados con la riqueza de musgos epífitos. Conclusiones: Los musgos epífitos estudiados aquí representan más del 15 % de la riqueza de musgos de México. El tipo de bosque y la elevación parecen ser los impulsores de esta riqueza ampliamente distribuida. Finalmente, continuar la exploración de los bosques estudiados aquí, así como de aquellos en otras latitudes incluyendo variables como la humedad y rasgos de los árboles hospederos, es urgente para mejorar el conocimiento de esta flora mexicana.

Abstract Background: Epiphytic mosses are one of the most common groups in forest environments but among the most neglected by researchers in Mexico. Questions: What is the epiphytic mosses diversity, measured in richness, turnover, and community composition in Mexican forests? Species of study: Epiphytic mosses. Study site and years: Humid mountain forest, pine-oak and tropical evergreen forests. Study period: 2015 to 2021. Methods: Through a literature review and field work we compiled data on epiphytic mosses in three forest types in Mexico. We assessed the data using alpha and beta diversity analysis, indicator species, and community composition. Additionally, we explored the influence of elevation and forest type on the observed diversity patterns. Results: We report a richness of 147 species of epiphytic mosses across three types of Mexican forests. The humid mountain forest was the best sampled forest with the highest moss species richness. Although species richness is different for the forests studied, species turnover is similar among them. We demonstrated that elevation and forest type are highly correlated with species richness of epiphytic mosses. Conclusions: The epiphytic mosses studied here collectively represent over 15 % of the moss richness of Mexico. Forest type and elevation seem to be the drivers of this widely distributed richness. Finally, we call for more in-depth studies of the forests presented here, as well as those in other latitudes including variables such as humidity and host traits, to provide a more complete picture of an overlooked Mexican flora.

Resumen Monteleón es considerado un relicto de bosque subandino, y su biodiversidad está amenazada por distintos factores antropogénicos, lo que causa su fragmentación y la pérdida del hábitat de las especies que allí habitan. Con el objetivo de conocer su actual composición, estructura y diversidad florística, se establecieron tres parcelas de 0.1 ha en zonas con distintos grados de perturbación. En total se registraron 941 individuos y 116 especies, donde la parcela con perturbación baja presentó la mayor diversidad alfa. Según el análisis de la diversidad beta, entre las comunidades, los individuos de las especies que se pierden son en su mayoría sustituidos por individuos de otras especies, y un pequeño porcentaje se pierde sin sustitución. En conclusión, se registró un estado de afectación en el bosque debido a su heterogeneidad, que aun así se encuentra en un estado natural de recuperación.

Abstract Monteleon is considered to be a sub-Andean forest remnant, and its biodiversity is threatened by various anthropogenic factors, leading to forest fragmentation and habitat loss for the species inhabiting it. In order to contribute to the knowledge of its composition, structure, and floristic diversity, three 0.1 ha plots were established in areas with different degrees of disturbance. A total of 941 individuals and 116 species were recorded, where with the plot with low disturbance exhibiting the highest richness and the highest alpha diversity (0D, 1D, and 2D). According to the beta diversity analysis, among the communities, the individuals of the species that are lost are mostly replaced by individuals of other species, and a small percentage is lost without replacement. In conclusion, a state of affectation is reported in the forest due to its heterogeneity, even though it is in a natural state of recovery.

Abstract This work aimed to characterize the structure of Salticidae (Araneae) communities in forest foliage and leaf litter, and grassland habitats, in protected and unprotected environments in the Eastern Chaco of Argentina. To this end, the hypothesis was raised that the types of environments and conservation conditions differentially impact the diversity and structure of the salticid communities. Sampling was carried out in the Chaco National Park, the Pampa del Indio Provincial Park, and two unprotected sites located between these two parks: Intermediate Site I and Intermediate Site II. To evaluate alpha diversity within each site, Shannon's diversity index and Simpson's inverse, as well as their true diversity derivatives, were used. To evaluate equity, ranking-abundance graphs were made. To calculate gamma diversity total richness, the Shannon index and the inverse Simpson index were used. The Jaccard and Bray-Curtis dissimilarity indices and their components were calculated. Furthermore, the correlation of geographical distance with all of them was evaluated. A total of 1,697 spiders of the family Salticidae (523 adults) were collected and 68 species (57 adults) were identified. The resulting values of the diversity indices did not reflect differences in the conservation status of the sites. However, beta and gamma diversity were high in the study area, which is indicative of a highly heterogeneous environment.

Resumen El objetivo de este trabajo fue caracterizar la estructura de las comunidades de Salticidae (Araneae) en los hábitats follaje y hojarasca de bosque, y pastizal, en ambientes protegidos y no protegidos en el Chaco Oriental de Argentina. Para ello se planteó la hipótesis de que los tipos de ambientes y condiciones de conservación impactan diferencialmente sobre la diversidad y estructura de las comunidades de saltícidos. Se realizaron muestreos en el Parque Nacional Chaco, Parque Provincial Pampa del Indio y dos sitios no protegidos ubicados entre estos dos parques: Sitio Intermedio I y Sitio Intermedio II. Para evaluar la diversidad alfa dentro de cada sitio se utilizó el índice de diversidad de Shannon y el inverso de Simpson, así como sus derivados de diversidad verdadera. Para evaluar la equidad, se hicieron gráficos de ranking-abundancia. Para calcular la diversidad gamma se utilizó la riqueza total, el índice de Shannon y el inverso de Simpson. Se calcularon los índices de disimilitud de Jaccard y Bray-Curtis, y sus componentes. Además, se evaluó la correlación de la distancia geográfica con todos ellos. Se recolectó un total de 1.697 arañas de la familia Salticidae (523 adultos) y se identificaron 68 especies (57 adultos). Los valores resultantes de los índices de diversidad no reflejaron diferencias en el estado de conservación de los sitios. Sin embargo, la diversidad beta y gamma fueron altas en el área de estudio, lo que es indicativo de un ambiente altamente heterogéneo.

Abstract Maize is considered the third most important grain crop in the world due to its economic, food and industrial interest. Throughout its phenology this crop is attacked by pests and diseases, which could have adverse effects on production. In order to control these problems, conventional management is generally used, causing ecological imbalances. For this reason, it is necessary to consider sustainable alternatives based on the knowledge of beneficial entomofauna. This research aimed to conduct a prospective analysis of the coccinelides associated with maize cultivation in the canton of Santa Ana, Ecuador. For this purpose, the coccinelides present under two different conditions were evaluated; with and without insecticide application. Five sampling techniques were used according to the research protocol and taxonomic classification was carried out. The data were interpreted using descriptive statistics, in addition, alpha and beta diversity was assessed. In the study, 297 individuals were found, gathered to: 1 order,1 family, 13 genera and 11 species. The greatest abundance was found in undisturbed conditions, determining that the most efficient trapping technique for their capture was the use of chromatic traps. This type of research is important to derive biological control programs in economically important crops.

Resumen El maíz es considerado el tercer cultivo de grano más importante del mundo debido a su interés económico, alimentario e industrial. A lo largo de su fenología este cultivo es atacado por plagas y enfermedades, que pueden generar efectos adversos sobre la producción. Para el control de estos problemas, generalmente se acude al manejo convencional, los cuales ocasionan desequilibrios ecológicos. Por esta razón, es necesario considerar alternativas sostenibles fundamentadas en el conocimiento de la entomofauna benéfica. Esta investigación tuvo por objetivo realizar un análisis prospectivo de los coccinélidos asociados al cultivo de maíz en el cantón Santa Ana, Ecuador. Para su efecto, se evaluaron los coccinélidos presentes en dos condiciones distintas: con y sin aplicación de insecticida. Se utilizaron cinco técnicas de muestreo, de acuerdo con el protocolo de investigación, y se procedió con la clasificación taxonómica. Los datos fueron interpretados mediante estadística descriptiva; además, se valoró la diversidad alfa y beta. En el estudio se encontraron 297 individuos, congregados a: 1 orden,1 familia, 13 géneros y 11 especies. La mayor abundancia se presentó en condiciones no intervenidas, determinándose que la técnica de trampeo más eficiente para su captura fueron las trampas cromáticas. Este tipo de investigación es importante para derivar programas de control biológico en cultivos de importancia económica.

ABSTRACT Introduction: The development of safe and effective vaccines against SARS-CoV-2 posed a huge challenge to face the COVID-19 pandemic. The appearance of new variants of SARS-CoV-2 represents a challenge in evaluating the effectiveness of vaccines, different vaccine and therapeutic candidates developed by the scientific community. Objectives: Characterize and analyze the genetic diversity of Cuban viral isolates, in the period between June 2020 and December 2022. Methods: SARS-CoV-2 RNA was obtained from 27 isolates from cell culture supernatant and the S gene was sequenced. The generated sequences were used for the identification and subsequent molecular characterization of the genetic variants of the virus through phylogenetic analysis and the use of the tools available in the GISEAD database. Results: The variants detected in the Cuban SARS-CoV-2 isolates corresponded to those identified in the genomic surveillance studies carried out in the different stages of the COVID-19 pandemic in Cuba. 33.3% of the sequenced isolates corresponded to the different lineages of the Omicron variant, followed by Beta B 1.351 (29.6%), other SARS-CoV-2 lineages (25.9%), Alpha B 1.1.7 (7.4%) and Delta B.1.575 (3.7%). The D614G mutation was detected in all SARS-CoV-2 isolates studied. Conclusions: The molecular characterization of the Cuban isolates of SARS-CoV-2 has a high genetic diversity. It makes it possible to evaluate in vitro and in vivo vaccine candidates and therapeutic agents developed by the Cuban biopharmaceutical industry.

RESUMEN Introducción: El desarrollo de vacunas seguras y eficaces contra el SARS-CoV-2 supuso un enorme reto para enfrentar la pandemia de la COVID-19. La aparición de nuevas variantes del SARS-CoV-2 representa un reto en la evaluación de la efectividad de las vacunas, diferentes candidatos vacunales y terapéuticos desarrollados por la comunidad científica. Objetivos: Caracterizar la diversidad genética de aislamientos virales cubanos en el periodo comprendido entre junio de 2020 y diciembre de 2022. Métodos: Se obtuvo el ARN de SARS-CoV-2 de 27 aislamientos a partir de sobrenadante de cultivo celular y se secuenció el gen S. Las secuencias generadas se emplearon para la identificación y posterior caracterización molecular de las variantes genéticas del virus mediante análisis filogenético y el uso de las herramientas disponibles en la base de datos GISEAD. Resultados: Las variantes detectadas en los aislamientos cubanos de SARS-CoV-2 estudiados se correspondieron a las identificadas en los estudios de vigilancia genómica realizados en las diferentes etapas pandémicas de la COVID-19 en Cuba. El 33,3 % de los aislamientos secuenciados correspondieron a los diferentes linajes de la variante Ómicron, seguido de la variante Beta B 1.351 (29,6 %), otros linajes de SARS-CoV-2 (25,9 %), Alfa B 1.1.7 (7,4 %) y Delta B.1.575 (3,7 %). Se detectó la mutación D614G en todos los aislamientos de SARS-CoV-2 estudiados. Conclusiones: La caracterización molecular de los aislamientos cubanos de SARS-CoV-2 tiene una elevada diversidad genética. Posibilita evaluar in vitro e in vivo los candidatos vacunales y agentes terapéuticos desarrollados por la industria biofarmacéutica cubana.

ABSTRACT Acute hepatopancreatic necrosis disease (AHPND), attributed to the production of PirA/PirB toxins by certain Vibrio sp. strains, poses a significant threat to global shrimp aquaculture, causing substantial mortality and economic losses. To enhance our understanding of this disease within a closed culture system on the northern coast of Peru, we conducted a comparative analysis of the gut microbiomes between healthy and diseased postlarvae. Diseased postlarvae were obtained through exposure to an AHPND-causing strain of Vibrio parahaemolyticus. Five healthy and five diseased postlarvae were randomly sampled from experimental rearing tanks, and their medial guts were extracted. High-throughput sequencing targeting the V4 region of the 16S rRNA gene was employed for amplicon library construction, and assessments of alpha and beta diversities and taxonomic composition were conducted. Our results revealed reduced diversity and distinct compositional profiles in the gut microbiomes of diseased postlarvae. The order Rhodobacteriales was dominant in the gut microbiomes of healthy postlarvae. In contrast, the order Vibrionales (including an unassigned genus within Vibrionales, Vibrio, and Pseudoalteromonas) exhibited the highest abundance in diseased postlarvae. In conclusion, exposure to an AHPND-causing strain of V. parahaemolyticus induces significant dysbiosis in the gut microbiome of whiteleg shrimp postlarvae.

RESUMEN: El objetivo de la investigación fue determinar la diversidad alfa y beta de los árboles de mangle en el manglar de Tumbes. El área del manglar se dividió en tres zonas: A, B y C, en ellas se tomaron 41 puntos de muestreo (PM). Se contaron y midieron los árboles de mangle y se determinaron los índices de diversidad alfa: Shannon-Wiener (H’), Simpson (DS) y Pielou (J’), así como la similitud de los PM. La diversidad beta se determinó con los índices: de Jackard (IJ) y cuantitativo de Sorensen (S). Se determinó que la diversidad alfa del manglar fue baja (H’=1,0260, DS=0,6158 y J’=0,9339), siendo la zona A la de menor diversidad (H’=0,3048, DS=0,8531 y J’=0,2774), por su menor impacto antrópico y por el dominio de Rhizophora mangle sobre las otras especies, se observó que los PM fueron muy similares dentro de cada zona, con menor diversidad en la zona A. La diversidad beta evaluada mediante IJ fue de 1, indicando que la diversidad de especies no cambia entre las zonas, en tanto que el índice S mostró que hay un mayor cambio en diversidad entre la zona A y las restantes zonas. Estos resultados pueden permitir a las autoridades locales y regionales tomar decisiones a fin de poder proteger a dicho manglar. Por otro lado, también sería conveniente realizar investigación para determinar el impacto que la alteración de la biodiversidad de las especies de mangles pueda tener en los organismos que habitan en este manglar.

ABSTRACT: The aim of this research was to determine the alpha and beta diversity of mangrove trees in the Tumbes mangrove forest. The mangrove forest area was divided into three zones: A, B and C, in which 41 sampling points (PM) were taken. Mangrove trees were counted and measured, and the alpha diversity indices were determined: Shannon-Wiener (H'), Simpson (DS) and Pielou (J’), as well as the similarity of the PM. Beta diversity is determined with the indices: Jackard (IJ) and quantitative Sorensen (S). It is considered that the alpha diversity of the mangrove forest was low (H'=1.0260, SD =0.6158 and J’=0.9339), with zone A being the one with the lowest diversity (H'=0.3048, SD=0.8531 and J’=0.2774), due to its less anthropic impact and due to the dominance of Rhizophora mangle over the other species, it was observed that the PM were very similar within each zone, with lower diversity in zone A. The beta diversity evaluated using IJ was 1, indicating that the diversity of species does not change between the zones, while the S index showed that there is a greater change in diversity between zone A and the remaining zones. These results can allow local and regional authorities to make decisions to protect said mangrove forest. On the other hand, it would also be advisable to carry out research to determine the impact that alterations in mangrove species biodiversity may have on the organisms that inhabit this mangrove forest.