Resumo O relato descrebeu o primeiro curso presencial visando capacitar profissionais de saúde pública na realização de vigilância genômica em tempo real, durante períodos pandêmicos. Relato de experiência sobre um curso teórico-prático com foco em pesquisa e vigilância genômica, incluindo tecnologias de sequenciamento móvel, bioinformática, filogenética e modelagem epidemiológica. O evento contou com 162 participantes e foi o primeiro grande treinamento presencial realizado durante a epidemia de covid-19 no Brasil. Não foi detectada infecção pelo SARS-CoV-2 ao final do evento em nenhum participante, sugerindo a segurança e efetividade de todas as medidas de segurança adotadas. Os resultados do evento sugerem que é possível executar capacitação profissional com segurança durante pandemias, desde que seguidos todos os protocolos de segurança.

Resumen Este estudio tuvo como objetivo describir el primer curso presencial para capacitar a los profesionales de la salud pública para llevar a cabo la vigilancia genómica en tiempo real durante los períodos de pandemia. Este es un informe de experiencia en un curso teórico-práctico centrado en la investigación y vigilancia genómica, que incluye secuenciación móvil, bioinformática, filogenética y tecnologías de modelado epidemiológico. Este evento contó con la asistencia de 162 participantes y fue la primera gran capacitación presencial realizada durante la epidemia de COVID-19 en Brasil. No se detectó infección por SARS-CoV-2 al final del evento en ningún participante, lo que sugiere la seguridad y efectividad de todas las medidas de seguridad adoptadas. Por lo tanto, los resultados del evento sugieren que es posible realizar entrenamientos profesionales de manera segura durante pandemias, siempre y cuando se sigan todos los protocolos de seguridad.

Abstract The objective of this report was to describe the first face-to-face course aimed at training public health professionals in performing real-time genomic surveillance during the pandemic period. Experience report on a theoretical-practical course focusing on genomic research and surveillance, including mobile sequencing technologies, bioinformatics, phylogenetics and epidemiological modeling. There were 162 participants in the event and it was the first major face-to-face training course conducted during the COVID-19 epidemic in Brazil. No cases of SARS-CoV-2 infection was detected among the participants at the end of the event, suggesting the safety and effectiveness of all safety measures adopted. The results of this experience suggest that it is possible to conduct professional training safely during pandemics, as long as all safety protocols are followed.

Abstract The objective of this report was to describe the first face-to-face course aimed at training public health professionals in performing real-time genomic surveillance during the pandemic period. Experience report on a theoretical-practical course focusing on genomic research and surveillance, including mobile sequencing technologies, bioinformatics, phylogenetics and epidemiological modeling. There were 162 participants in the event and it was the first major face-to-face training course conducted during the COVID-19 epidemic in Brazil. No cases of SARS-CoV-2 infection was detected among the participants at the end of the event, suggesting the safety and effectiveness of all safety measures adopted. The results of this experience suggest that it is possible to conduct professional training safely during pandemics, as long as all safety protocols are followed.

Resumen Este estudio tuvo como objetivo describir el primer curso presencial para capacitar a los profesionales de la salud pública para llevar a cabo la vigilancia genómica en tiempo real durante los períodos de pandemia. Este es un informe de experiencia en un curso teórico-práctico centrado en la investigación y vigilancia genómica, que incluye secuenciación móvil, bioinformática, filogenética y tecnologías de modelado epidemiológico. Este evento contó con la asistencia de 162 participantes y fue la primera gran capacitación presencial realizada durante la epidemia de COVID-19 en Brasil. No se detectó infección por SARS-CoV-2 al final del evento en ningún participante, lo que sugiere la seguridad y efectividad de todas las medidas de seguridad adoptadas. Por lo tanto, los resultados del evento sugieren que es posible realizar entrenamientos profesionales de manera segura durante pandemias, siempre y cuando se sigan todos los protocolos de seguridad.

Resumo O relato descrebeu o primeiro curso presencial visando capacitar profissionais de saúde pública na realização de vigilância genômica em tempo real, durante períodos pandêmicos. Relato de experiência sobre um curso teórico-prático com foco em pesquisa e vigilância genômica, incluindo tecnologias de sequenciamento móvel, bioinformática, filogenética e modelagem epidemiológica. O evento contou com 162 participantes e foi o primeiro grande treinamento presencial realizado durante a epidemia de covid-19 no Brasil. Não foi detectada infecção pelo SARS-CoV-2 ao final do evento em nenhum participante, sugerindo a segurança e efetividade de todas as medidas de segurança adotadas. Os resultados do evento sugerem que é possível executar capacitação profissional com segurança durante pandemias, desde que seguidos todos os protocolos de segurança.

ABSTRACT Background: An outbreak of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Omicron variant was detected in the psychiatric ward of a general hospital in Brasília, Brazil. Methods: We report the investigation, clinical outcomes, viral sequencing, and control measures applied to outbreak containment. Results: The overall attack rate was 95% (23/24) in a period of 13 days. Among the cases, 78% (18/23) were vaccinated and 17% (4/23) required intensive care. The Omicron variant was isolated from the 19 sequenced samples. Conclusions: The findings highlight the potential harm that highly transmissible variants may generate among hospitalized populations, particularly those with comorbidities.

Resumo Objetivo Explorar a reorganização do sistema de saúde voltado para a pandemia de COVID-19. Métodos Realizou-se estudo ecológico, descritivo-explicativo, com análise de aglomerados espaço-temporais por semana epidemiológica nos municípios brasileiros. Foram utilizadas fontes de dados secundárias, do Cadastro Nacional de Estabelecimentos de Saúde (abril de 2020) e de casos de COVID-19 (fevereiro a agosto de 2020). As áreas quentes de incidência e mortalidade foram sobrepostas com a disponibilidade de unidades de tratamento intensivo (UTIs), para se avaliar a ampliação do acesso em regiões críticas. Resultados Dos 5.570 municípios analisados, 54% foram identificados como áreas quentes para incidência e 31% para mortalidade. Dos municípios em áreas quentes para incidência e com escassez de acesso, 28% foram contemplados pela ampliação de UTIs. Para mortalidade, esse valor foi de 14%. Conclusão A abertura de novos leitos não conseguiu abranger amplamente as regiões críticas, entretanto poderia ser otimizada com o uso de técnicas de análise espacial.

Abstract Objective To explore the reorganization of the health system in response to the COVID-19 pandemic. Methods We conducted an ecological, descriptive-exploratory study with analysis of spatio-temporal clusters by epidemiological week in Brazilian municipalities. Secondary data sources were used, from the National Health Establishment Registry (April 2020) and on COVID-19 cases, February to August 2020. Intensive Care Units (ICU) availability was overlaid on incidence and mortality hot spots in order to assess expanded access in critical regions. Results Of the 5,570 municipalities analyzed, 54% were identified as incidence hot spots and 31% as mortality hot spots. Of the municipalities in incidence hot spots and with scarce access, 28% were covered by ICU expansion, while with regard to mortality 14% were covered. Conclusion The opening of new beds was not able to provide broad coverage for critical regions and could be optimized with the use of spatial analysis techniques.

Resumen Objetivo Explorar la reorganización del sistema sanitario centrada en la pandemia de COVID-19. Métodos Se realizó un estudio ecológico, descriptivo-exploratorio con análisis de clusters espacio-temporales, por semana epidemiológica en los municipios brasileños El análisis utilizó fuentes de datos secundarias, del Registro Nacional de Establecimientos de Salud y de los casos de COVID-19, para los meses de abril y agosto de 2020, respectivamente. Las áreas vulnerables a incidencia y mortalidad se superpusieron a la disponi-bilidad de UCIs para evaluar la expansión del acceso en las regiones críticas. Resultados De los 5.570 municipios analizados, 54% fueron identificados como zonas vulnerables a incidencia y 31% a mortalidad. De los municipios en zonas calientes de incidencia y con escaso acceso, el 28% estaba contemplados por la ampliación de la UCI. En cuanto a la mortalidad, este valor fue del 14%. Conclusión La apertura de nuevos lectores no consiguió ampliar las regiones críticas y podría ser optimizada con el uso de técnicas de análisis espacial.

Resumo Objetivo Explorar a reorganização do sistema de saúde voltado para a pandemia de COVID-19. Métodos Realizou-se estudo ecológico, descritivo-explicativo, com análise de aglomerados espaço-temporais por semana epidemiológica nos municípios brasileiros. Foram utilizadas fontes de dados secundárias, do Cadastro Nacional de Estabelecimentos de Saúde (abril de 2020) e de casos de COVID-19 (fevereiro a agosto de 2020). As áreas quentes de incidência e mortalidade foram sobrepostas com a disponibilidade de unidades de tratamento intensivo (UTIs), para se avaliar a ampliação do acesso em regiões críticas. Resultados Dos 5.570 municípios analisados, 54% foram identificados como áreas quentes para incidência e 31% para mortalidade. Dos municípios em áreas quentes para incidência e com escassez de acesso, 28% foram contemplados pela ampliação de UTIs. Para mortalidade, esse valor foi de 14%. Conclusão A abertura de novos leitos não conseguiu abranger amplamente as regiões críticas, entretanto poderia ser otimizada com o uso de técnicas de análise espacial.

Abstract Objective To explore the reorganization of the health system in response to the COVID-19 pandemic. Methods We conducted an ecological, descriptive-exploratory study with analysis of spatio-temporal clusters by epidemiological week in Brazilian municipalities. Secondary data sources were used, from the National Health Establishment Registry (April 2020) and on COVID-19 cases, February to August 2020. Intensive Care Units (ICU) availability was overlaid on incidence and mortality hot spots in order to assess expanded access in critical regions. Results Of the 5,570 municipalities analyzed, 54% were identified as incidence hot spots and 31% as mortality hot spots. Of the municipalities in incidence hot spots and with scarce access, 28% were covered by ICU expansion, while with regard to mortality 14% were covered. Conclusion The opening of new beds was not able to provide broad coverage for critical regions and could be optimized with the use of spatial analysis techniques.

Resumen Objetivo Explorar la reorganización del sistema sanitario centrada en la pandemia de COVID-19. Métodos Se realizó un estudio ecológico, descriptivo-exploratorio con análisis de clusters espacio-temporales, por semana epidemiológica en los municipios brasileños El análisis utilizó fuentes de datos secundarias, del Registro Nacional de Establecimientos de Salud y de los casos de COVID-19, para los meses de abril y agosto de 2020, respectivamente. Las áreas vulnerables a incidencia y mortalidad se superpusieron a la disponi-bilidad de UCIs para evaluar la expansión del acceso en las regiones críticas. Resultados De los 5.570 municipios analizados, 54% fueron identificados como zonas vulnerables a incidencia y 31% a mortalidad. De los municipios en zonas calientes de incidencia y con escaso acceso, el 28% estaba contemplados por la ampliación de la UCI. En cuanto a la mortalidad, este valor fue del 14%. Conclusión La apertura de nuevos lectores no consiguió ampliar las regiones críticas y podría ser optimizada con el uso de técnicas de análisis espacial.

Sequences of the cytochrome c oxidase subunit I (COI) mitochondrial gene from adults of 22 Culex ( Culex ) species from Argentina and Brazil were employed to assess species identification and to test the usefulness of COI for barcoding using the best close match (BCM) algorithm. A pairwise Kimura two-parameter distance matrix including the mean intra and interspecific distances for 71 COI barcode sequences was constructed. Of the 12 COI lineages recovered in the Neighbour-joining topology, five confirmed recognised morphological species ( Cx. acharistus , Cx. chidesteri , Cx. dolosus , Cx. lygrus and Cx. saltanensis ) with intraspecific divergences lower than 1.75%. Cx. bilineatus is formally resurrected from the synonymy of Cx. dolosus . Cx. maxi , Cx. surinamensis and the Coronator group species included were clustered into an unresolved lineage. The intraspecific distance of Cx. pipiens (3%) was almost twice the interspecific between it and Cx. quinquefasciatus (1.6%). Regarding the BCM criteria, the COI barcode successfully identified 69% of all species. The rest of the sequences, approximately 10%, 18% and 3%, remained as ambiguously, mis and unidentified, respectively. The COI barcode does not contain enough information to distinguish Culex ( Cux. ) species.

This study analyzed the importance of zoonoses and communicable diseases common to man and animals as potential Public Health Emergencies of International Concern to build an evidence base for future efforts to reduce risk of infection at the animal/human health interface. The events recorded in the World Health Organization (WHO) Event Management System (EMS) database for the Americas during the 18 months since the implementation of the 2005 revised version of WHO's International Health Regulations (15 June 2007-31 December 2008) were the main source for this analysis. Of the 110 events recorded by the EMS for the Americas during the study period, 86 were classified as communicable diseases-77 (70.0%) "within the animal/human health interface," 9 (8.2%) "not common to man and animals," 16 (14.5%) "syndromes with unknown etiologies," and 8 (7.3%) "product-related/ other." Of the 77 events within the animal/human health interface, 48 were "substantiated" (the presence of hazard was confirmed and/or human cases occurred clearly in excess of normal expectancy). These results confirm previous research and underscore the importance of the animal/human health interface as well as inter-sectoral collaboration.

En este estudio se analizó la importancia de las zoonosis y las enfermedades transmisibles comunes a los seres humanos y los animales como posibles emergencias de salud pública de importancia internacional, a fin de sentar una base científica para las actividades futuras destinadas a reducir el riesgo de infección en la interfaz entre animales y seres humanos. La fuente principal para este análisis fueron los eventos registrados en la base de datos del Sistema de Gestión de Eventos de la Organización Mundial de la Salud (OMS) para las Américas durante los 18 meses que transcurrieron (15 de junio del 2007 al 31 de diciembre del 2008) desde la puesta en marcha del Reglamento Sanitario Internacional de la OMS (versión revisada en el 2005). De los 110 eventos registrados por el Sistema de Gestión de Eventos para las Américas durante el período de estudio, 86 se clasificaron como enfermedades transmisibles -77 (70,0%) como "dentro de la interfaz entre animales y seres humanos" y 9 (8,2%) como "no comunes a seres humanos y animales"-, 16 (14,5%) como "síndromes de etiología desconocida", y 8 (7,3%) como "relacionados con productos/otros". De los 77 eventos comprendidos dentro de la interfaz entre animales y seres humanos, se fundamentaron 48 (se confirmó la presencia del riesgo u ocurrieron casos en seres humanos que claramente superaron los casos esperados). Estos resultados confirman las investigaciones anteriores y destacan la importancia de la interfaz entre la salud humana y la sanidad animal, así como la importancia de la colaboración intersectorial.