Resumo A pandemia do novo coronavírus enfatizou a importância que a discussão e a vigilância de doenças emergentes representam para a sociedade científica, especialmente no caso de doenças zoonóticas. Mesmo no atual cenário de evolução da pesquisa biomédica, as doenças surgem na natureza e infectam os seres vivos em todos os continentes. Entre as doenças animais emergentes mais estudadas estão as doenças virais suínas, devido à sua alta ocorrência e gravidade. Soma-se a isso o impacto econômico na saúde dos suínos e, em alguns casos, na saúde humana. Os desafios da saúde suína incluem doenças endêmicas, doenças transmitidas por alimentos e doenças transfronteiriças. Além disso, doenças vesiculares idiopáticas e doenças subclínicas foram identificadas isoladamente ou em co-infecções. Vários fatores desencadearam esses fenômenos, mas falhas na biossegurança, biocontenção e desequilíbrio na imunidade do rebanho são fundamentais e devem ser corrigidos. Os vírus evoluem naturalmente, por mutação, rearranjo ou recombinação, para se tornarem mais virulentos ou mais transmissíveis, ou não. Esta revisão discutirá o amplo campo de infecções virais suínas emergentes e como o monitoramento da evolução desses agentes virais é de suma importância. Além disso, quando considerar uma nova doença ou agente emergente um risco para a suinocultura. A evolução dos sistemas de produção de suínos é admirável, mas as doenças dos animais ainda respondem por 20% das perdas. Portanto, as organizações internacionais trabalham com os países membros para prevenir doenças animais, garantir o abastecimento de alimentos, manter a renda familiar, a saúde e preservar o futuro. Saúde Única não é apenas um conceito, mas uma ação de vigilância e controle que todos os países devem implementar.

Abstract The novel coronavirus pandemic highlighted the importance of discussing and monitoring emerging diseases to scientific society, particularly in the case of zoonotic diseases. Diseases emerge in nature and infect living beings current on all continents, even in the current scenario of biomedical research evolution. Among the most studied emerging animal diseases are the swine viral diseases, due to their high occurrence and severity. Added to this, is the economic impact on the health of pigs and in some cases on human health. The challenges of swine health include endemic diseases, foodborne and transboundary diseases. Idiopathic vesicular diseases and subclinical diseases have also been identified, either alone or in combination with other infections. Several factors have contributed to these phenomena, but failures in biosecurity, biocontainment, and herd immunity imbalances are critical and must be addressed. Viruses evolve naturally, through mutation, rearrangement, or recombination, either to become more virulent or more transmissible, or not. This review will discuss the broad field of emerging swine viral infections, how monitoring the evolution of these viral agents is of supreme importance. Also, when should a new disease or emerging agent is considered a risk to swine production? Although the evolution of pork production systems is admirable, animal diseases continue to account for 20% of the losses. Therefore, international organizations work with member countries to prevent animal diseases, ensure food supply, maintain household income, health, and preserve the future. One Health is not just a concept, but an action of surveillance and control that all countries must implement.

Abstract The novel coronavirus pandemic highlighted the importance of discussing and monitoring emerging diseases to scientific society, particularly in the case of zoonotic diseases. Diseases emerge in nature and infect living beings current on all continents, even in the current scenario of biomedical research evolution. Among the most studied emerging animal diseases are the swine viral diseases, due to their high occurrence and severity. Added to this, is the economic impact on the health of pigs and in some cases on human health. The challenges of swine health include endemic diseases, foodborne and transboundary diseases. Idiopathic vesicular diseases and subclinical diseases have also been identified, either alone or in combination with other infections. Several factors have contributed to these phenomena, but failures in biosecurity, biocontainment, and herd immunity imbalances are critical and must be addressed. Viruses evolve naturally, through mutation, rearrangement, or recombination, either to become more virulent or more transmissible, or not. This review will discuss the broad field of emerging swine viral infections, how monitoring the evolution of these viral agents is of supreme importance. Also, when should a new disease or emerging agent is considered a risk to swine production? Although the evolution of pork production systems is admirable, animal diseases continue to account for 20% of the losses. Therefore, international organizations work with member countries to prevent animal diseases, ensure food supply, maintain household income, health, and preserve the future. One Health is not just a concept, but an action of surveillance and control that all countries must implement.

Resumo A pandemia do novo coronavírus enfatizou a importância que a discussão e a vigilância de doenças emergentes representam para a sociedade científica, especialmente no caso de doenças zoonóticas. Mesmo no atual cenário de evolução da pesquisa biomédica, as doenças surgem na natureza e infectam os seres vivos em todos os continentes. Entre as doenças animais emergentes mais estudadas estão as doenças virais suínas, devido à sua alta ocorrência e gravidade. Soma-se a isso o impacto econômico na saúde dos suínos e, em alguns casos, na saúde humana. Os desafios da saúde suína incluem doenças endêmicas, doenças transmitidas por alimentos e doenças transfronteiriças. Além disso, doenças vesiculares idiopáticas e doenças subclínicas foram identificadas isoladamente ou em co-infecções. Vários fatores desencadearam esses fenômenos, mas falhas na biossegurança, biocontenção e desequilíbrio na imunidade do rebanho são fundamentais e devem ser corrigidos. Os vírus evoluem naturalmente, por mutação, rearranjo ou recombinação, para se tornarem mais virulentos ou mais transmissíveis, ou não. Esta revisão discutirá o amplo campo de infecções virais suínas emergentes e como o monitoramento da evolução desses agentes virais é de suma importância. Além disso, quando considerar uma nova doença ou agente emergente um risco para a suinocultura. A evolução dos sistemas de produção de suínos é admirável, mas as doenças dos animais ainda respondem por 20% das perdas. Portanto, as organizações internacionais trabalham com os países membros para prevenir doenças animais, garantir o abastecimento de alimentos, manter a renda familiar, a saúde e preservar o futuro. Saúde Única não é apenas um conceito, mas uma ação de vigilância e controle que todos os países devem implementar.

Abstract The objective of this work was to develop an index of adequacy to minimum biosecurity conditions (IAB) to express the external biosecurity level of pig farms in the state of Santa Catarina, Brazil. Pig farms of producers registered in the database of Companhia Integrada de Desenvolvimento Agrícola de Santa Catarina were sampled through an online questionnaire, with 76 questions on farm identification, production system, relationship with the agroindustry, herd size, and external biosecurity. One hundred questionnaires were answered by the farmers, showing the existence, partial existence, or absence of biosecurity practices, with scores of 1.0, 0.5, and 0.0, respectively, used to calculate the IAB of each farm. The farrow to weaning farms were grouped into three categories of production units (farrow to finishing, farrow to rearing, or farrow to weaning) and two of relationships with the production chain (integrated or independent). The investments necessary to achieve the ideal biosecurity practices were estimated. The farms with a low IAB (< 40%) represented 33% of the total, and the remaining 67% of the farms were classified with a medium or high index, evidencing a good external biosecurity. The IAB can be used to measure the biosecurity of pig farms and, based on their classification, to support the design of intervention plans.

Resumo O objetivo deste trabalho foi desenvolver um índice de adequação às condições mínimas de biossegurança (IAB) para expressar o nível de biossegurança externa de granjas suinícolas, no estado de Santa Catarina, Brasil. Foram amostradas granjas de produtores registrados no banco de dados da Companhia Integrada de Desenvolvimento Agrícola de Santa Catarina, por meio de questionário online com 76 perguntas sobre identificação da granja, sistema de produção, relação com a agroindústria, tamanho do rebanho e biossegurança externa. Foram respondidos 100 questionários pelos produtores, tendo mostrado a existência, a existência parcial ou a ausência de práticas de biossegurança, com pontuações de 1,0, 0,5 e 0,0, respectivamente, utilizadas para calcular o IAB de cada granja. As granjas de produção foram agrupadas em três categorias de unidades de produção (ciclo completo, creche ou desmame) e duas de relação com a cadeia produtiva (integrada ou independente). Estimaram-se os investimentos necessários para atingir as práticas ideais de biossegurança. As granjas com baixo IAB (< 40%) representaram 33% do total, e o restante das 67% propriedades foram classificadas com índice médio ou alto, tendo evidenciado boa biossegurança externa. O IAB pode ser usado para medir a biosseguridade de granjas suinícolas e, com base na classificação delas, apoiar a elaboração de planos de intervenção.

Resumo O objetivo deste trabalho foi avaliar a infecção por subtipos do vírus influenza A (IAV) e a sua incidência em creches de suínos, no estado de Santa Catarina, Brasil. Foram amostrados 423 leitões de creche em 11 granjas, e foram identificados circulação de IAV, RNA viral e anticorpos. A transcriptase reversa seguida de quantificação por reação em cadeia da polimerase (RT-qPCR) foi utilizada para detectar o RNA viral em amostras de swab nasal (70,2%) e para subtipar 33 vírus, dos quais 18 (54,5%) de seis creches eram o vírus H3N2, 6 (18,1%) de duas creches eram o H1N1pdm e 9 (27,2%) de três creches não puderam ser subtipificados. O ensaio de imunoabsorção enzimática (ELISA) detectou a presença de anticorpos IAV (68%), a qual foi confirmada pelo teste de inibição da hemaglutinação, tendo revelado maior prevalência de anticorpos para o vírus H3N2 (38,0%), seguido por H1N1pdm (23,8%) e H1N2 (3,23%). Os dados obtidos mostraram que 10,3% dos suínos reagiram a pelo menos dois antígenos virais. Há alta prevalência de infecção pelo vírus influenza A em todas as 11 creches de leitões amostradas por RNA viral e detecção de anticorpos. H3N2 e H1N1pdm, nesta ordem, são os subtipos virais mais detectados nas 11 creches amostradas.

Abstract The objective of this work was to evaluate the infection caused by influenza A virus (IAV) subtypes and its incidence in pig nurseries in the state of Santa Catarina, Brazil. A total of 423 nursery pigs were sampled in 11 farms, and IAV circulation, viral RNA, and antibodies were identified. Reverse transcriptase quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) was used to detect viral RNA in nasal swab samples (70.2%) and to subtype 33 viruses, of which 18 (54.5%) from six nurseries were the H3N2 virus, 6 (18.1%) from two nurseries were H1N1pdm, and 9 (27.2%) from three nurseries could not be subtyped. The enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) detected the presence of IAV antibodies (68%), which was confirmed by the hemagglutination inhibition test, revealing a higher prevalence of antibodies for the H3N2 virus (38.0%), followed by H1N1pdm (23.8%) and H1N2 (3.23%). The obtained data showed that 10.3% of the swine reacted to at least two viral antigens. There is a high prevalence of influenza A virus infection in all 11 piglets nurseries sampled by viral RNA and antibody detection. H3N2 and H1N1pdm, in this order, are the most detected viral subtypes in the 11 sampled nurseries.

RESUMO Objetivos: Analisar os resultados de morbidade e sobrevida após cirurgias curativas e paliativas em pacientes com câncer cervical recidivado após tratamento primário com radioterapia e quimioterapia. Outro objetivo foi avaliar os fatores associados aos procedimentos curativos e não curativos. Métodos: Coorte retrospectiva de pacientes submetidos à cirurgias curativas e paliativas, entre janeiro de 2011 a dezembro de 2017, em um centro de alta complexidade em oncolologia. O desfecho da morbidade foi relatado de acordo com a classificação de Clavien-Dindo e a análise de sobrevida foi realizada pelo método de Kaplan-Meir. Para avaliar os fatores associados aos procedimentos, foi realizada análise univariada pelo teste U de Mann-Whitney. Resultados: Foram realizadas duas histerectomias radicais, três exenterações pélvicas com intenção curativa e cinco exenterações pélvicas paliativas. No grupo curativo, houve complicações maiores em 40% dos casos, e o tempo mediano de sobrevida foi 16 meses. No grupo paliativo, houve complicações maiores em 60% dos casos, e o tempo mediano de sobrevida foi 5 meses. Estadiamento avançado (p=0,02), sintomas (p=0,04), tamanho do tumor maior que cinco centímetros (p=0,04) e mais de três órgãos envolvidos (p=0,003) foram fatores significativamente associados a cirurgia não curativa. Conclusões: As taxas de morbidade foram maiores no grupo paliativo, e o tempo mediano de sobrevida foi menor no grupo paliativo do que no grupo curativo, entretanto esta diferença na sobrevida não teve significância estatística. Estádio avançado, sintomas, tamanho tumoral e número de órgãos envolvidos são fatores que devem ser levados em consideração na indicação de resgate cirúrgico.

ABSTRACT Objectives: To analyze the results of morbidity and survival after curative and palliative surgery in recurrent cervical cancer patients who underwent chemoradiation as their primary treatment. Another goal was to assess the factors associated with curative and non-curative procedures. Methods: This was a retrospective cohort consisting of patients undergoing surgery curative and palliative from January 2011 to December 2017 at a high complexity oncology center. Outcome of morbidity was reported according to the Clavien-Dindo classification, and survival analysis was carried out using the Kaplan-Meir method. To assess the factors associated with the procedures, a univariate analysis using the Mann-Whitney U test was performed. Results: Two radical hysterectomies, three pelvic exenterations with curative intent, and five palliatives pelvic exenterations were performed. In the curative group, there were major complications in 40% of the cases, and the median survival time was 16 months. In the palliative group, there were major complications in 60% of the cases, and the median survival time was 5 months. Advanced staging (p-value= 0.02), symptoms (p-value=0.04), tumor size greater than five centimeters (p-value=0.04), and more than three organs involved (p-value=0.003) were factors significantly associated with non-curative surgery. Conclusions: The morbidity rates of this study were higher in palliative group, and the median survival time was lower in the palliative group than the curative group, but this difference in survival was not statistically significant. Advanced stage, symptoms, tumor size and number of organs involved are factors that should be taken into consideration when indicating surgical salvage.

Resumo A endometriose é caracterizada pela presença de tecido endometrial fora do útero. Quando os implantes endometriais penetram mais de 5 mm no peritônio, são definidos como endometriose pélvica profunda. O exame padrão ouro para estabelecer seu diagnóstico é a laparoscopia, mas a ultrassonografia transvaginal pode contribuir na detecção da doença, por ser um exame acessível, de menor custo, não invasivo e por possibilitar o planejamento pré-operatório nos casos em que é necessário o tratamento cirúrgico. Entretanto, este método como primeiro exame a ser solicitado na suspeita de endometriose precisa ser mais considerado na prática clínica. Este ensaio descreve os achados da endometriose profunda na ultrassonografia transvaginal, com o intuito de difundir a importância da técnica para o diagnóstico dessa doença.

Abstract Endometriosis is characterized by the presence of endometrial tissue outside the uterus. When endometrial implants penetrate more than 5 mm into the peritoneum, the condition is referred to as deep pelvic endometriosis. Although laparoscopy is the gold standard test to establish a diagnosis of deep endometriosis, transvaginal ultrasound represents an alternative that can contribute to detection of the disease, because it is an accessible, low-cost, noninvasive examination that allows preoperative planning in cases requiring surgical treatment. However, in clinical practice, transvaginal ultrasound is still not widely used as the first-line examination in suspected cases of endometriosis. This essay describes the findings of deep endometriosis on transvaginal ultrasound, in order to disseminate knowledge of the utility of the technique for the diagnosis of this disease.

RESUMO Objetivo: Abordar as principais metodologias que podem ser utilizadas para o rastreamento do câncer anal em mulheres vivendo com HIV/AIDS, que têm sido publicadas atualmente na literatura científica. Metodologia: Trata-se de uma revisão integrativa de literatura, realizada através de pesquisa de artigos nas bases de dados PUBMED, EBSCO e LILACS, publicados entre os anos de 2013 a 2017. Resultados: A partir da aplicação dos critérios de inclusão e exclusão, foram selecionados oito estudos para compor essa revisão. Todos possuíam nível de evidência IV. As metodologias que predominaram nos estudos foram a citologia anal e o teste DNA-HPV. O número de participantes nos estudos variou de 35 até 863, e todos envolveram mulheres vivendo com HIV/AIDS. A maioria tinha o objetivo de avaliar a prevalência de alterações citológicas anais ou infecção pelo HPV em mulheres vivendo com HIV/AIDS. Conclusão: Os estudos apontaram que há uma preocupação com os altos índices de câncer anal e infecção anal por HPV. Também registram a importância do rastreamento para prevenção do câncer anal, através da citologia associada ou não a métodos moleculares de detecção do HPV.

ABSTRACT Aim: Addressing the main methodologies published in the scientific literature and used to screen anal cancer in women living with HIV/AIDS. Methodology: The current study is an integrative literature review applied to articles published between 2013 and 2017 in databases such as PUBMED, EBSCO and LILACS. Results: Eight studies were selected to compose the current review after the inclusion and exclusion criteria were applied. All the articles had evidence level IV. Anal cytology and the DNA-HPV test were the methodologies prevailing in the studies. The number of participants in the studies ranged from 35 to 863, and all the studies involved women living with HIV/AIDS. The aim of most of the herein reviewed studies was to assess the prevalence of anal cytologic changes or HPV infection in women living with HIV/AIDS (WLHA). Conclusion: Studies have pointed out that there is concern about high anal cancer and anal HPV infection rates. They also highlighted the importance of the screening procedure for anal cancer prevention through cytology associated, or not, with molecular HPV detection methods.

Abstract Economic losses with high mortality rate associated with Porcine circovirus type 2 (PCV2) is reported worldwide. PCV2 commercial vaccine was introduced in 2006 in U.S. and in 2008 in Brazil. Although PCV2 vaccines have been widely used, cases of PCV2 systemic disease have been reported in the last years. Eleven nursery or fattening pigs suffering from PCV2 systemic disease were selected from eight PCV2-vaccinated farms with historical records of PCV2 systemic disease in Southern Brazil. PCV2 genomes were amplified and sequenced from lymph node samples of selected pigs. The comparison among the ORF2 amino acid sequences of PCV2 isolates revealed three amino acid substitutions in the positions F57I, N178S and A190T, respectively. Using molecular modeling, a structural model for the capsid protein of PCV2 was built. Afterwards, the mutated residues positions were identified in the model. The structural analysis of the mutated residues showed that the external residue 190 is close to an important predicted region for antibodies recognition. Therefore, changes in the viral protein conformation might lead to an inefficient antibody binding and this could be a relevant mechanism underlying the recent vaccine failures observed in swine farms in Brazil.

Resumo: O Brasil se destaca por ser o quarto maior produtor e exportador de carne suína. A ocorrência de determinadas doenças na produção animal é um dos fatores mais importantes para a suinocultura. Os patógenos de suínos podem ser divididos em três grupos: agentes de doenças transmitidas por alimentos de origem animal; agentes de doenças de importância estratégica para o sistema de defesa sanitária; e agentes de doenças responsáveis por prejuízos na produção animal. Algumas enfermidades, como a peste suína clássica e a febre aftosa, impactam duramente o mercado exportador; doenças endêmicas ou enzoóticas deterioram os índices produtivos e aumentam o custo de produção, com perda da competitividade; e doenças transmitidas por alimentos, embora não afetem os índices produtivos, podem causar danos à saúde humana e prejudicar as relações comerciais. O Brasil, por ser um expoente na produção e na exportação de suínos e derivados, deve estar atento a alguns aspectos relacionados à infraestrutura laboratorial, às medidas de biossegurança e aos cuidados necessários para impedir que determinadas doenças, ainda exóticas, infectem o rebanho brasileiro. Este artigo de revisão aborda as principais doenças endêmicas ou enzoóticas que causam prejuízo à produção de carne suína no Brasil.

Abstract: Brazil stands out as the fourth largest producer and exporter of pork. The occurrence of certain diseases in animal production is one of the most important factors for swine production. Swine pathogens can be divided into three groups: agents of foodborne illnesses of animal origin; agents of strategically important diseases for the health protection system; and agents of diseases responsible for losses in animal production. Some diseases, such as classical swine fever and foot-and-mouth disease, impact heavily the export market; endemic or enzootic diseases deteriorate production rates and increase production costs, reducing competitiveness; and foodborne illnesses, despite not affecting production indexes, can cause damages to human health and harm commercial relations. Brazil, being an exponent in the production and export of pork and derivatives, must be aware of some aspects related to laboratory infrastructure, biosecurity measures, and care necessary to prevent certain, still exotic, diseases from infecting the Brazilian herd. This review addresses the main endemic or enzootic diseases that cause losses in pork production in Brazil.

Resumo: Os fatores para a emergência ou a reemergência de doenças são pouco conhecidos e entendidos, mas o principal é a expansão da população humana. Outros fatores incluem mudanças climáticas, globalização e intensificação da produção animal. Isto é preocupante, já que 75% das doenças humanas emergentes ou reemergentes do último século são zoonoses, isto é, doenças de origem animal, que, além de causarem fatalidades humanas e animais, afetam a economia de países. Estima-se que o impacto das doenças animais exceda 20% das perdas na produção animal mundialmente. O Brasil é um grande produtor agrícola e tem grande parte de seu território em região tropical, abrigando a maior biodiversidade ambiental do globo. Estudos tem apontado a região Amazônica entre um dos "hot spots" onde doenças surgiram ou poderão emergir. Nesse contexto, recomenda-se a formação de uma rede de cooperação com ações estratégicas em vigilância, pesquisa, comunicação e capacitação. É fundamental fomentar parcerias nas áreas de saúde, agricultura e meio-ambiente para pronta-resposta nacional e global. O objetivo deste trabalho foi abordar os principais fatores envolvidos na emergência ou na reemergência de zoonoses, bem como as ameaças futuras e a importância estratégica da pesquisa e da vigilância no Brasil.

Abstract: The factors for disease emergence or reemergence are little known and understood, but the main one is the expansion of the human population. Other factors include climate change, globalization, and intensification of animal production. This is disturbing, given that 75% of emerging or reemerging human diseases of the last century are zoonoses, that is, animal diseases, which, besides causing human and animal fatalities, affect the economy of countries. It is estimated that the impact of animal diseases exceeds 20% of the losses in animal production worldwide. Brazil is a major agricultural producer and has most of its territory in the tropical region, harboring the greatest environmental biodiversity of the globe. Studies have pointed the Amazon region as a hot spot where diseases have emerged or will emerge. In this context, the formation of a cooperation network with strategic actions for monitoring, research, communication, and training is recommended. It is essential to foster partnerships in the areas of health, agriculture, and environment for a prompt national and global response. The objective of this work was to address the main factors involved in the emergence or reemergence of zoonoses, as well as future threats and the strategic importance of Brazilian research and surveillance.

Este trabalho descreve a colheita adequada de amostras, as técnicas/procedimentos disponíveis para o diagnóstico de influenza A em suínos, assim como os resultados e suas respectivas interpretações, para auxiliar médicos veterinários de campo na identificação dessa doença. Em suínos vivos, as amostras adequadas são: secreção nasal, fluido oral e sangue (soro). Para suínos mortos, colher preferencialmente amostras de pulmão com consolidação cranioventral. Secreção nasal e fragmentos de pulmão refrigerado são utilizados para detectar partícula viral viável (isolamento viral - IV) ou ácido nucleico viral (RT-PCR convencional e RT-PCR em tempo real). As amostras não devem ser congeladas, pois o vírus é inativado a -20°C. A caracterização molecular dos isolados é feita pela análise filogenética obtida pelo sequenciamento de DNA. O soro é utilizado para a detecção de anticorpos (Acs) por meio do teste da inibição da hemaglutinação e ELISA. O fluido oral pode ser utilizado para detecção de anticorpo (ELISA) ou de vírus. Fragmentos de pulmão fixados em formol a 10% são examinados microscopicamente para identificar pneumonia broncointersticial e para detecção de antígeno viral pela imuno-histoquímica (IHQ). Para o sucesso do diagnóstico, as amostras devem ser colhidas de suínos que estão preferencialmente na fase aguda da doença, para aumentar as chances de detecção viral. As melhores opções para o diagnóstico de influenza A em suínos vivos são RT-PCR e isolamento viral de amostras de swab nasal ou fluido oral. Pulmão para análise por RT-PCR, isolamento viral ou IHQ é a amostra de escolha em suínos mortos. Testes sorológicos têm valor diagnóstico limitado e são utilizados apenas para determinar o estado imune do rebanho, não indicando doença clínica, pois os Acs são detectados 7-10 dias pós-infecção (fase subaguda). O diagnóstico de influenza é importante para avaliar o envolvimento desse agente no complexo de doença respiratória suína. Além disso, o isolamento do vírus influenza é essencial para o monitoramento dos principais subtipos circulantes em uma determinada região ou país, assim como para a detecção de novos rearranjos virais, já que influenza é considerada uma zoonose.

This article is intended to describe the adequate sample collection, the laboratory procedures/techniques, the expected results and their interpretation for diagnosis of influenza infection in swine, serving as a support for field veterinarians. In live pigs, the samples to be taken are nasal secretions, oral fluids and blood. For dead pigs, preference should be given to samples of cranioventral lung consolidation. Nasal discharge and chilled lung fragments are used for detection of virus (virus isolation - VI) or viral nucleic acids (conventional RT-PCR and real-time RT-PCR). Samples should not be frozen, because the virus is inactivated at -20°C. Molecular characterization of isolates is performed by phylogenetic analysis of gene sequences obtained by DNA sequencing. Serum is used for the detection of antibodies using hemagglutination inhibition (HI) test and ELISA. Oral fluid may be used for either antibody (ELISA) or viral detection. Fragments of lung fixed in 10% formaldehyde are used for histopathological analysis to identify bronchointerstitial pneumonia, and for immunohistochemistry (IHC) for antigens. For a successful diagnosis, sampling should be preferably performed in the acute phase of the disease to improve chances of virus detection. The best options to perform the diagnosis of influenza A in a swine herd are RT-PCR and VI from nasal swabs or oral fluid in live pigs and/or lung tissue for RT-PCR, VI or IHC in dead pigs. Serological tests are of very limited diagnostic value and are useful only to determine the immune status of the herd, not indicating clinical disease, because antibodies are detected after 7-10 days post infection (subacute phase). The diagnosis of influenza is important to evaluate the involvement of this agent in the complex of respiratory diseases in pigs. Furthermore, the isolation of influenza virus is essential for monitoring the main subtypes circulating in a given region or country, as well as for the detection of potential new viral reassortants, because influenza is considered a zoonosis.

O propósito desse estudo foi avaliar as lesões histológicas observadas em rins condenados por nefrite pelo Serviço de Inspeção Federal, em dois frigoríficos de Mato Grosso, Brasil. Foram coletados 400 rins condenados por nefrite e submetidos aos exames de histologia, imuno-histoquímica (IHC) para Circovirus suíno Tipo 2 (PCV2), imunofluorescência direta (IF) para Leptospira sp. e reação em cadeia pela polimerase (PCR) para detecção de PCV2, Parvovirus suíno (PPV) e Torque teno vírus Tipo 1 e 2 (TTV1 e TTV2). Foram observadas lesões histológicas em 81% das amostras, sendo nefrite intersticial mononuclear a mais freqüente (77,50%). Das lesões de nefrite intersticial encontradas, 40,97% apresentaram padrão folicular. Através da PCR foi observada ampla distribuição dos agentes (PCV2, PPV, TTV1 e TTV2) nas propriedades e municípios, com ocorrência de 27,25%, 28,50%, 94% e 87,50%, respectivamente. Leptospira sp. não foi detectada através da IF. Houve associação significativa da infecção do PCV2 com presença de lesão histológica (P=0,008) e de células gigantes (P=0,0016). Também houve associação entre a co-infecção TTV2 e TTV1 (P<0,0001). Esses achados indicam que os vírus PCV2, PPV, TTV1 e TTV2 devem ser considerados no diagnóstico diferencial de rins com nefrite intersticial em suínos.

This study evaluated histological lesions in kidney samples from pigs with nephritis in two slaughterhouses in the State of Mato Grosso, Brazil. Four hundred samples were subjected to histology, anti-porcine circovirus type 2 (PCV2) immunohistochemistry (IHC), anti-Leptospira sp. immunofluorescence (IF), and polymerase chain reaction (PCR) for PCV2, porcine parvovirus (PPV), and Torque teno virus type 1 and 2 (TTV1, TTV2) detection. Histological lesions were found in 81% of the samples, and mononuclear interstitial nephritis was the most frequent lesion (77.50%). A follicular pattern was observed in 40.97% of the interstitial nephritis lesions. PCV2, PPV, TTV1, and TTV2 were identified in the kidneys by PCR in 27.25%, 28.50%, 94%, and 87.5% of the samples, respectively. Leptospira sp. was not detected through IF. Infection by PCV2 (PCR) and the presence of histological lesions (P=0.008) and giant cells (P=0.0016) were significantly associated. An association was observed between the TTV2-TTV1 co-infection (P<0.0001) and the risk for pathogenesis. These findings indicated that PCV2, PPV, TTV1, and TTV2 were widely distributed among pigs in the local farms and that the presence of these agents should be considered in the differential diagnosis of kidneys with interstitial nephritis in pigs.

Acanthamoeba are abundant in a wide range of environments, and some species are responsible for cutaneous infections, keratitis, and granulomatous amoebic encephalitis (GAE). The conventional detection and isolation of amoeba from clinical and environmental samples involves sampling and culture on non-nutrient Ágar medium. Although efficient, this system requires several transfers in order to eliminate contaminants, and is not appropriate for the isolation of individual amoeba from samples with a biodiverse community. In this study we propose an alternative method for the isolation of monocystic clones of Acanthamoeba. The propose method involves sampling, enrichment, encystment induction, and direct cysts micromanipulation and culture on Ágar plates.

A infecção causada pelo vírus Influenza A (IAV) é endêmica em suínos no mundo inteiro. O surgimento da pandemia de influenza humana pelo vírus A/H1N1 (pH1N1) em 2009 levantou dúvidas sobre a ocorrência deste vírus em suínos no Brasil. Durante o desenvolvimento de um projeto de pesquisa do vírus de influenza suína em 2009-2010, na Embrapa Suínos e Aves (CNPSA), foi detectado em um rebanho de suínos em Santa Catarina, Brasil, um surto de influenza altamente transmissível causado pelo subtipo viral H1N1. Este vírus causou uma doença leve em suínos em crescimento e em fêmeas adultas, sem mortalidade. Tres leitões clinicamente afetados foram eutanasiados. As lesões macroscópicas incluiam consolidação leve a moderada das áreas cranioventrais do pulmão. Microscopicamente, as lesões foram caracterizadas por bronquiolite necrosante obliterativa e pneumonia broncointersticial. A imunohistoquímica, utilizando um anticorpo monoclonal contra a nucleoproteína do vírus influenza A, revelou marcação positiva no núcleo das células epiteliais bronquiolares. O tecido pulmonar de três leitões e os suabes nasais de cinco fêmeas e quatro leitões foram positivos para influenza A pela RT-PCR. O vírus influenza foi isolado de um pulmão, mais tarde sendo confirmado pelo teste de hemaglutinação (título HA 1:128) e por RT-PCR. A análise das seqüências de nucleotídeos dos genes da hemaglutinina (HA) e proteína da matriz (M) revelou que o vírus isolado foi consistente com o vírus pandêmico A/H1N1/2009 que circulou em humanos no mesmo período. Este é o primeiro relato de um surto de influenza causado pelo vírus pandêmico A/H1N1 em suínos no Brasil.

Influenza A virus (IAV) infections are endemic in pork producing countries around the world. The emergence of the pandemic 2009 human H1N1 influenza A virus (pH1N1) raised questions about the occurrence of this virus in Brazilian swine population. During a 2009-2010 swine influenza virus research project at Embrapa Swine and Poultry (CNPSA), an outbreak of a highly transmissible H1N1 influenza A virus disease was detected in a pig herd in Santa Catarina State, Brazil. The virus caused a mild disease in growing pigs and sows without mortality. Three clinically affected piglets were euthanized. Gross lesions included mild to moderate consolidation of cranioventral areas of the lung. Microscopically, the lesions were characterized by necrotizing obliterative bronchiolitis and bronchointerstitial pneumonia. Immunohistochemistry using a monoclonal antibody against type A influenza virus nucleoprotein revealed positive staining in the nuclei of the bronchiolar epithelial cells. Lung tissue from three piglets and nasal swabs from five sows and four piglets were positive for influenza A by RT-PCR. Influenza virus was isolated from one lung, later confirmed by the hemagglutination test (HA titer 1:128) and RT-PCR. Sequence analyses of Hemmaglutinin (HA) and Matrix (M) genes revealed that the virus was consistent with the pandemic (A/H1N1) 2009 influenza virus strain that circulated in humans. This is the first report of an outbreak of pandemic A/H1N1 influenza virus in pigs in Brazil.

A pseudoraiva (PR) é uma enfermidade viral responsável por consideráveis perdas econômicas na indústria de suínos. O vírus da pseudoraiva (PrV) apresenta apenas um sorotipo, mas, por análise de restrição enzimática, foi classificado em quatro genótipos denominados I, II, III e IV. Os métodos usados para genotipagem dependem do isolamento do vírus, da purificação do DNA viral, da restrição enzimática do genoma completo e da visualização após eletroforese. O objetivo deste trabalho foi estabelecer um método mais rápido e sensível para detectar e genotipar o PrV por nested-PCR e análise de restrição enzimática. Vinte isolados do PrV das regiões Sul e Sudeste do Brasil e a estirpe padrão Shope foram replicadas em células PK-15 e submetidas à nested-PCR para o gene da glicoproteína E. Além desses vírus previamente isolados, foram avaliadas 75 amostras clínicas de cérebro de suíno em um total de 25 animais positivos para a PR no isolamento e na soroneutralização viral e 50 amostras negativas provenientes de animais negativos na soroneutralização viral e de granjas sem histórico de PR. Todas as amostras clínicas tiveram resultados compatíveis com o isolamento e a soroneutralização, e a totalidade das amostras positivas foi classificada como genótipo II. A sensibilidade analítica da nested-PCR foi de 10-1,3 TCID50 mL-1. A combinação da nested-PCR e da restrição enzimática foi capaz de detectar e genotipar o vírus com resultados em um a dois dias, sendo mais rápida que os métodos convencionais de restrição do genoma completo que podem demorar até sete dias.

Pseudorabies is a disease caused by Suid herpesvirus 1 (PrV) and is responsible for considerable economic losses in the swine industry. The PrV has only one serotype, but based on RFLP (restriction fragment length polymorphism) the virus was divided into four genotypes named I, II, III, IV. The classical methods for PrV genotyping usually require virus isolation, DNA purification enzyme restriction analysis and a long electrophoresis. The aim of this research was to describe a faster and more sensitive method to detect and genotype PrV based on nested-PCR and restriction enzyme analysis. Twenty PrV isolates from south and southeast regions of Brazil, and the standard strain Shope were grown in PK-15 cells and submitted to PCR for glycoprotein E gene amplification. Additionally were tested 75 clinical samples (swine brain), with 25 positives for virus isolation and seroneutralization, and 50 negatives from a flock free PR with negative results in seroneutralization test. There was 100% of agreement between results of nested-PCR and virus isolation and seroneutralization and all samples detected were classified as genotype II. The nested-PCR, combined with restriction enzyme analysis, was able to detect and genotype PrV in 1-2 days with a sensitivity of 10-1,3 TCID50 mL-1. It was faster than classical methods described in the literature that require at least 7 days to be completed.