Este trabalho objetivou caracterizar acessos de C. canephora oriundos de cultivos comerciais e bancos de germoplasma brasileiros. Um total de 130 acessos das coleções do IAC (São Paulo), UFV (Minas Gerais) e coletados em plantios comerciais no Espírito Santo e Rondônia foram genotipados com 20 novos microssatélites. Métodos multivariados foram utilizados para estimar a relação entre os acessos. Foi observado alto nível de polimorfismo e dois grupos foram identificados: o primeiro foi constituído pelos genótipos conservados nas coleções de germoplasma do IAC e UFV e o segundo foi composto pelos acessos coletados em plantios comerciais. Os acessos do Espírito Santo e de Rondônia formaram dois subgrupos distintos. Apesar do grande polimorfismo encontrado nas lavouras brasileiras de café canéfora, incrementar essa diversidade é necessário, pois um novo limiar de ganhos genéticos é esperado nos programas de melhoramento com a intensificação do uso do germoplasma conservado.

This work aimed to characterize accessions that represent the C. canephora germplasm conserved and cultivated in Brazil. A total of 130 accessions from germplasm banks of IAC (São Paulo), UFV (Minas Gerais) and also collected in plantations of the State of Espírito Santo and Rondônia were evaluated with a set of 20 new microsatellite primers. Multivariate methods were used to estimate the relationship among the accessions. High level of polymorphism and two major diversity clusters were identified. First cluster was composed by the accessions conserved in the IAC and UFV collections and the second was formed by accessions collected in areas under cultivation. Accessions from Espírito Santo and Rondônia were clear separated, composing two subclusters. Despite the great polymorphism found in Brazilian plantations, the diversity may be increased, because a new threshold in the genetic gains is expected on breeding programs with the intensification of the use of conserved germplasm.

Marcadores moleculares AFLP, RAPD e SSR foram usados para estudo da diversidade e estrutura genética do germoplasma de Híbrido de Timor. As análises de coordenadas principais, de agrupamento UPGMA baseado na dissimilaridade genética de Jaccard, de agrupamento baseado no modelo Bayesiano, a percentagem de locos polimórficos, o índice de Shannon e a diversidade genética de Nei foram utilizadas para acessar a diversidade genética. As análises demonstraram alta diversidade genética entre os acessos de Híbrido de Timor. A análise de agrupamento UPGMA e o modelo Bayesiano permitiram a alocação dos acessos em três grupos. A estrutura genética dos acessos de Híbrido de Timor foi descrita. A manutenção e manuseio da variabilidade do germoplasma de Híbrido de Timor e seu potencial uso nos programas de melhoramento de cafeeiro foram discutidos.

AFLP, RAPD and SSR molecular markers were used to study the genetic diversity and genetic structure of the Híbrido de Timor germplasm. The principal coordinate analysis, UPGMA cluster analysis based on genetic dissimilarity of Jaccard, Bayesian model-based cluster analysis, percentage of polymorphic loci, Shannon's information index and Nei gene diversity were employed to assess the genetic diversity. The analyses demonstrated a high genetic diversity among Híbrido de Timor accessions. UPGMA and Bayesian cluster analyses grouped the accessions into three clusters. The genetic structure of Híbrido de Timor is reported. The management of Híbrido de Timor germplasm variability and its potential use in breeding programs are discussed.

No estudo da diversidade genética entre e dentro de populações de café, foram usados marcadores EST-SSR, visando avaliar seu potencial para identificar cultivares comerciais e assistir programas de melhoramento. Os 17 marcadores utilizados foram desenvolvidos a partir das seqüências ESTs do Projeto Brasileiro do Genoma Café. Em todos os marcadores observou-se polimorfismo entre os genótipos avaliados, com um número médio de 5,1 alelos por primer. Os maiores polimorfismos foram constatados dentro de C. canephora (88,2%) e em variedades resistentes à ferrugem (35,3%). Dos marcadores analisados, 29,4% distinguiram C. arabica dos Híbridos de Timor (HDT), sendo possível identificar os mais próximos e os mais distantes de C. arabica . A análise dos genótipos agrupados por população revelou diversidade genética de 64% entre populações e 36% dentro delas, com um índice de diferenciação de 0,637. Em seis marcadores distinguiram-se quatro variedades resistentes à ferrugem, constando seu potencial para fingerprint. Esses resultados demonstram a utilidade dos EST-SSR para orientações dos cruzamentos e estudos de diversidade, introgressão e mapeamento genético.

EST-SSR markers were used to investigate the genetic diversity among and within coffee populations, to explore the possibility of their use for fingerprinting of cultivars and to assist breeding programs. Seventeen markers, developed from ESTs (Expressed Sequence Tags) from the Brazilian Coffee Genome Project, were used. All markers showed polymorphism among the genotypes assessed. The average number of allele per primer was 5.1. The highest polymorphisms were found within C. canephora (88.2%) and rust-resistant varieties (35.3%). About 29.4% of the markers differentiated C. arabica from Híbrido de Timor; it was also possible to identify those closest and farthest from C. arabica . The analysis of population-grouped genotypes revealed a 64.0% genetic diversity among and a 36.0% genetic diversity within populations. The differentiation index was 0.637. Six markers distinguished four rust-resistance varieties, showing their fingerprinting potential. These results demonstrate the usefulness of EST-SSR markers for cross orientation, in diversity and introgression studies, and in genetic mapping.

O objetivo deste trabalho foi caracterizar a herança da resistência do Híbrido de Timor UFV 443-03 à ferrugem-do-cafeeiro (Hemileia vastatrix). Para isso, a raça II e o patótipo 001 de ferrugem foram inoculados em 246 plantas da população F2, 115 plantas do retrocruzamento suscetível (RC S) e 87 plantas do retrocruzamento resistente (RC R), originadas do cruzamento entre o genótipo suscetível cv. Catuaí Amarelo IAC 64 e a fonte de resistência Híbrido de Timor UFV 443-03. Para ambos os inóculos, a cv. Catuaí Amarelo IAC 64 foi suscetível, enquanto o Híbrido de Timor UFV 443-03, a planta representante da geração F1 e as plantas do RC R foram resistentes. As plantas F2, quando inoculadas com a raça II, apresentaram dois padrões de segregação significativos: 15:1 e 61:3. A herança da resistência foi confirmada pela inoculação das plantas do RC S, que segregaram na proporção de 3:1, padrão esperado para herança condicionada por dois genes. A hipótese de segregação 7:1 para três genes foi rejeitada. Resultados semelhantes foram obtidos para o patótipo 001. Dois genes dominantes e independentes conferem a resistência genética do Híbrido de Timor UFV 443-03 à raça II e ao patótipo 001 de H. vastatrix.

The aim of this work was to characterize the resistance inheritance of the Timor Hybrid UFV 443-03 to coffee leaf rust (Hemileia vastatrix). For this, the race II and pathotype 001 of coffee leaf rust were inoculated in 246 F2 plants, 115 susceptible backcrossing (BCS) plants, and 87 resistant backcrossing (BC R) plants, derived from the crossing between the susceptible genotype 'Catuaí Amarelo' IAC 64 and the resistance source Timor Hybrid UFV 443-03. For both inoculums, the 'Catuaí Amarelo' IAC 64 was susceptible, while the Timor Hybrid, the plant representing F1 generation, and the BC R plants were resistant. The F2 plants inoculated with race II presented two significant segregation ratios: 15:1 and 61:3. The resistance inheritance was verified by the inoculation of the BCS plants, which segregated at a 3:1 ratio, an expected pattern for the inheritance controlled by two genes, whereas the segregation hypothesis of 7:1 for three genes was rejected. Two independent and dominant genes confer the genetic resistance of Timor Hybrid UFV 443-03 to race II and pathotype 001 of H. vastatrix.