Resumen El estudio tuvo como objetivo presentar los nuevos registros de Pucciniales recolectados en el departamento de Antioquia en los páramos de Santa Inés, Serranía de las Baldías, Sonsón y del Sol sobre plantas de las familias Araceae, Bromeliaceae, Dryopteridaceae, Grossulariaceae, Juncaceae, Lamiaceae y Poaceae. Se destacan dos nuevos registros para Colombia (Puccinia pseudoatra y Puccinia pygmaea) y catorce nuevos huéspedes parasitados con roya en el país. Estos nuevos huéspedes evidencian cómo los páramos son refugios de royas de importancia económica tales como Kweilingia divina, Puccinia coronata, Puccinia menthae, Puccinia recóndita, Puccinia striiformis y Uredo anthurii.

Abstract This paper aims to present the new Pucciniales records collected in the department of Antioquia at the páramos of Santa Inés, Serranía de las Baldías, Sonsón, and Sol on plants from the families Araceae, Bromeliaceae, Dryopteridaceae, Grossulariaceae, Juncaceae, Lamiaceae, and Poaceae. We report two new species for Colombia (Puccinia pseudoatra and Puccinia pygmaea) and fourteen new hosts parasitized with rust in the country. These new hosts show how the páramos are shelters for rusts of economic importance such as Kweilingia divina, Puccinia coronata, Puccinia menthae, Puccinia recondita, Puccinia striiformis, and Uredo anthurii.

In this paper, a morphologic evaluation of indeterminate rust fungi (Pucciniales) on the Fabaceae family deposited in the Museo Micológico of the Universidad Nacional de Colombia, Sede Medellín (MMUNM) is presented. Taxonomic analysis, in combination with review of specialized literature resulted in the following new species records for Colombia: Puccinia arachidis var. offuscata , Ravenelia conhiana , Ravenelia mirandensis , Uredo cubensis , Uromyces crotalariae and Uropyxis farlowii. Four new hosts records were also found: Mucuna holtonii , Macroptilium lathyroides , Crotalaria anagyroides and Desmodium adscendens. This work is increases the current knowledge of the Pucciniales mycobiota in Colombia, as well as their geographical distribution and life cycles.

El objetivo de este trabajo es hacer una revisión morfológica de las royas (Pucciniales) indeterminadas recolectadas en Colombia sobre la familia Fabaceae y depositadas en el Museo Micológico de la Universidad Nacional de Colombia, Sede Medellín (MMUNM). A partir del trabajo taxonómico y la literatura especializada sobre Pucciniales se encontraron los siguientes nuevos registros de especies para Colombia: Puccinia arachidis var. offuscata , Ravenelia conhiana , R. mirandensis , Uredo cubensis , Uromyces crotalariae y Uropyxis farlowii; además, se hacen 4 nuevos registros de hospedantes parasitados por royas ya documentadas: Mucuna holtonii , Macroptilium lathyroides , Crotalaria anagyroides y Desmodium adscendens. Este trabajo ha permitido aumentar el conocimiento de la micobiota de Pucciniales colombianos, su distribución geográfica y sus ciclos de vida.

Colletotrichum lindemuthianum, agente causal de la antracnosis del frijol, es uno de los patógenos más limitantes en la producción de este cultivo. La detección y correcta identificación de este hongo resulta fundamental para el manejo de la enfermedad, siendo las pruebas moleculares alternativas rápidas y sensibles para este fin. Mediante la técnica de PCR se evaluaron cuatro juegos de cebadores (CY1/CY2, CD1/CD2, ClF4/ITS4 y ClF432/ClR533) para la detección de C. lindemuthianum a partir de tejidos foliares, de vainas y de semillas procedentes de cultivos de frijol de Antioquia, Colombia. Los resultados indicaron que el par CD1/CD2, dirigido al pseudogen de permeasa de hierro Ftr1, fue el más efectivo para detectar el hongo en tejidos y semillas de frijol, así como para identificar aislamientos en cultivos microbiológicos. Para los cebadores CY1/CY2, dirigidos a los ITS del rDNA, se recomienda un esquema de PCR-RFLPs con MseI (=Tru1I) para la diferenciación con las especies C. orbiculare y C. trifolii. Estos cebadores generaron resultados consistentes cuando se utilizaron en combinación con ITS1 (ITS1/CY2) e ITS4 (CY1/ITS4). Finalmente, los cebadores ClF4/ITS4 resultaron en amplificaciones inespecíficas y ClF432/ClR533 en fragmentos de difícil resolución en electroforesis de agarosa. Este estudio servirá de apoyo para los programas de certificación de semilla y mejoramiento genético de frijol.

Colletotrichum lindemuthianum, the causal agent of anthracnose in common bean, is one of the most important pathogens of this crop around the world. Accurate detection and identification of this fungus is of paramount importance for adequate management of this disease; in this respect, molecular tests are the fastest and most sensitive methods. In this work, the usefulness of four primer sets (CY1/CY2, CD1/CD2, ClF4/ITS4 and ClF432/ClR533) for PCR detection and identification of C. lindemuthianum was evaluated using leaf, pod and seed tissues of common bean crops from Antioquia, Colombia. The results suggest that primers CD1/CD2, targeting iron permease pseudogen Ftr1, were the most effective in detecting DNA from both microbiological isolates and infected bean tissues, including seeds. In the case of primers CY1/CY2 targeting the rDNA ITS region, a PCR-RFLP strategy is recommended using MseI (=Tru1I) to differentiate C. lindemuthianum from C. orbiculare and C. trifolii. These primers produced better results when combined with universal primers ITS1 (ITS1/CY2) and ITS4 (CY1/ITS4). Primers ClF4/ ITS4 were non-specific while ClF432/ClR533 result in bands with poor resolution in agarose gels. This study will serve as support of seed certification and genetic improvement programs in common bean.

Colletotrichum lindemuthianum, the causal agent of anthracnose in common bean (Phaseolus vulgaris), is one of the most yield-limiting factors worldwide. Anthracnose affects the quality of pods by inducing black, sunken cankers and can also affect petioles, leaf veins and stems where it induces the typical anthracnose sunken lesions. A few years ago, a duplex PCR method that combines amplification of an ITS rDNA segment (CY1/CY2) together with an uncharacterized RAPD-derived amplicon (CD1/CD2) was developed for specific detection of C. lindemuthianum. This study shows that the CD1/CD2 marker corresponds to a portion of an iron permease (Ftr1) pseudogene in the vicinity of the gene encoding for a polyhydroxyproline-rich protein in Colletotrichum. Discrimination with Colletotrichum orbiculare is due to a 15 nt deletion in the CY1 annealing region. The potential of using this genomic region for phylogenetic analysis of the C. orbiculare species complex and detection of their related species is discussed.

En este estudio se realizó el aislamiento de hongos en tejidos foliares y vainas de fríjol con síntomas de antracnosis, procedentes de cultivos de diferentes municipios del departamento de Antioquia (Colombia). La identificación de los aislamientos se realizó con base en la secuenciación de las regiones ITS del ADN ribosomal y se confirmó por observación microscópica de estructuras reproductivas en aquellos aislamientos que esporulaban en medios de cultivo. En todas las muestras sintomáticas, se logró el aislamiento del agente causal de la antracnosis, .Colletotrichum lindemuthianum, siendo confirmada su identidad por PCR dúplex con cebadores específicos CD1/CD2 y CY1/CY2. En adición se obtuvieron 17 hongos endófitos, 14 de los cuales no esporularon en medio de cultivo (.Myceliasterilia), siendo identificados mediante análisis filogenéticos de regiones ITS como miembros de los Ascomycetes .Leptosphaerulina (tres aislamientos), .Diaporthe (tres aislamientos), .Gibberella (un aislamiento), .Plectosphaerella (un aislamiento) y .Biscogniauxia (un aislamiento); y de los géneros mitospóricos: Phoma (dos aislamientos), .Alternaria (dos aislamientos) y .Stemphylium (un aislamiento). Los tres hongos restantes se identificaron con base en caracteres morfológicos y secuenciación como miembros de los géneros Fusarium (dos aislamientos) y de la especie Curvularia lunata (un aislamiento). Este estudio aumenta el conocimiento de la micobiota de leguminosas, como base para el desarrollo de estudios futuros que permitan evaluar el efecto de estos hongos sobre el desarrollo de enfermedades como la antracnosis y de otros problemas bióticos y abióticos del cultivo del fríjol.

In this work, endophytic fungi from leaves and pods of bean presenting anthracnose symptoms were isolated from plants collected at different municipalities in the province of Antioquia (Colombia). Isolates were identified by sequencing the rDNA ITS regions together with the examination of reproductive structures during sporulation in culture media.Colletotrichum lindemuthianum, the causal agent of anthracnose was isolated in all samples showing symptoms of this disease. These results were confirmed by duplex PCR using the specific primers CD1/CD2 and CY1/CY2. Additionally, 17 endophytic fungi were obtained. Fourteen isolates did not sporulate in culture media (.Myceliasterilia) but were identified by phylogenetic analysis of the ITS regions as the Ascomycetes: .Leptosphaerulina (3), .Diaporthe (3), .Gibberella (1), .Plectosphaerella (1) and .Biscogniauxia (1) and the mitosporic genera Phoma (2), .Alternaria (2) and .Stemphylium (1). Three isolates were identified combining morphological and molecular analysis as Fusarium (2) and Curvularia lunata (1). This work increases our knowledge of the mycobiota of legume plants and will serve as support of future studies aimed at determining the effect of these fungi on the development of anthracnose as well as other problems affecting the bean crop.

La antracnosis del frijol causada por Colletotrichum lindemuthianum, es una de las enfermedades más limitantes de este cultivo. El patógeno se dispersa principalmente por semilla, por lo que la siembra de material certificado es fundamental para su manejo. La detección de C. lindemuthianum se basa en el uso de medios de cultivo y en los últimos años en técnicas de PCR; siendo la PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR) una alternativa que ofrece altos niveles de especificidad, sensibilidad y rapidez. En este trabajo se evaluó dicha técnica utilizando los cebadores ClF432/ClR533 y el compuesto orgánico SYBR Green. Para esto se probó la especificidad de los cebadores a partir de ADN de micelio del hongo y de tejidos infectados de frijol (foliar y vainas), construyéndose una curva estándar basada en diluciones seriadas de ADN. Finalmente, se evaluó la presencia de C. lindemuthianum en muestras de semillas de frijol variedad Cargamanto comerciales y obtenidas directamente del campo. Las pruebas de qPCR detectaron C. lindemuthianum en las ocho muestras de micelio [Ciclo Umbral (Ct): 4,3-9,85] y en 17 de las 18 muestras de tejidos de frijol, independientemente de que éstas fueran o no sintomáticas (Ct: 16,71-29,38). El patógeno fue detectado en el 84 % del total de semillas evaluadas y en 85 % de las muestras comerciales, aunque la concentración de ADN del patógeno en estas últimas fue inferior que para las semillas no-comerciales (1-32,2 pg·µL-1 vs 1-279,3 pg·µL-1). Estos resultados enfatizan la necesidad de fortalecer los programas de certificación de semilla de frijol en Colombia.

Colecciones de plantas con síntomas de hongos royas (Uredinales, Basidiomycota) realizadas en los últimos años en los departamentos de Amazonas, Antioquia, Caldas, Cundinamarca, Tolima y Valle del Cauca han sido estudiadas y depositadas en el Museo Micológico de la Universidad Nacional de Colombia, Sede Medellín (MMUNM). Entre las novedades encontradas, se registran por primera vez para Colombia las royas: Puccinia investita, Sphenospora pallida, Crossopsora piperis, Uredo psychotriicola y Pucciniosira solani. Se adiciona la familia botánica Dioscoreaceae para la Biota de Uredinales colombianos. Se hace la corrección del nombre anamórfico Uredo parthenii publicado para Colombia en 2003, por el nombre teliomorfico válido Puccinia schileana. Son registrados seis nuevos hospedantes parasitados por royas en Colombia, entre estos reviste importancia la colección sobre Origanum vulgare L. una planta aromática y medicinal cultivada mundialmente.

Plant collections with symptoms of rusts fungi (Uredinales, Basidiomycota) made during recent years in provinces of Amazonas, Antioquia, Caldas, Cundinamarca, Tolima and Valle del Cauca have been studied and deposited in Museo Micológico of Universidad Nacional de Colombia, Sede Medellín (MMUNM). The rusts species Puccinia investita, Sphenospora pallida, Crossopsora piperis, Uredo psychotriicola and Pucciniosira solani are new records for Colombia. A first record for this country of rust fungi in plants of family Dioscoreaceae has been also made. The anamorphic name Uredo parthenii published in 2003 in Colombia, has been corrected by the valid teleomorph Puccinia schileana. Finally, six new hosts parasitized by rusts are recorded, including Origanum vulgare L. a world-wide important aromatic and medicinal plant.