No presente trabalho foram estudadas as mudanças na densidade e na diversidade de zooplâncton dos rios Salado e Negro no período de março de 1993 a outubro de 1994. As amostragems quantitativas de zooplâncton foram realizadas com uma bomba de sucção usando uma rede de 53 µm de abertura de poro. Densidades muito altas foram encontradas na cabeceira do rio Salado. A densidade média nos rios Negro e Salado foi variável na fase de enchente. As mudanças na abundância do zooplâncton estiveram relacionadas com as varíaveis hidrológicas, mudanças na condutividade e as estações do ano. A densidade do zooplâncton foi correlacionada positivamente com a temperatura, transparência da água e flutuações da densidade do fitoplâncton. Em ambos os rios, os rotíferos foram o grupo dominante do zooplâncton. No período de enchente, as espécies abundantes foram limnoplanctônicas e algumas ticoplanctônicas. Na vazante dominaram as espécies eurihalinas e limnoplanctônicas. No rio Negro, com uma maior planície de inundação, registrou-se a máxima diversidade e riqueza específica. Não se encontrou similaridade na composição específica entre os rios Salado e Negro.

Zooplankton abundance and diversity of Salado and Negro rivers were compared in relation to the water level fluctuations. The zooplankton pumper samples were collected between March, 1993 and October, 1994. Mean zooplankton density at Salado river was very higher in upstreem. Zooplankton density in the Negro and Salado rivers were variable in the high water phase. Changes in the density appeared to be related to the hydrologic phases, seasonal cycle and conductivity variation. The zooplankton abundance was positively correlated with the abiotic and biotic factors (temperature, transparency and fitoplankton). The dominant group in the two studied rivers were the rotifers. The dominant species in the high water phase were limnoplanktonic and scarce ticoplanktonic organisms, in the low water phase the present organisms were euryhalin. The highest diversity was taken in the Negro river with major floodplain. The Jaccard Index (1908 ) showed no similarity zooplankton between Salado and Negro rivers.