ABSTRACT Health data science aims to extract knowledge from data allowing better decision-making, using multidisciplinary approaches from fields such as computation, statistics, epidemiology, and several medical knowledge domains. We live in the ‘big data’ era, with a growing availability of health data, in volume, variety, and velocity, also for tasks such as kidney transplantation. Hereby, secondary use of this health data must be encouraged to improve patient care planning, disease research, and policymaking around transplantation. This article presents the Transplant Open Registry (TxOR) website where some health data science applications on kidney transplantation are available. With it, we try to answer, some of the remaining questions on kidney transplantation in Portugal, with a new approach.

RESUMO A família Callichthyidae compreende um grupo monofilético bem corroborado, dividida em duas subfamílias: Corydoradinae e Callichthyinae. Uma proposta recente, baseada em dados moleculares, sugeriu que a subfamília Corydoradinae é composta por nove linhagens, possivelmente gêneros. As espécies pertencentes a cada uma destas linhagens possuem extensivas modificações no tamanho do genoma, incluindo espécies diplóides, tetraplóides e octaplóides. Considerando a ocorrência dessas diferentes linhagens e que as extremas variações em conteúdo de DNA podem implicar em alterações significativas na estrutura dos espermatozoides, o presente estudo analisou a morfologia do sistema reprodutor masculino e a morfometria da cabeça dos espermatozoides de representantes das nove linhagens de Corydoradinae, procurando características particulares em cada uma. Os dados morfológicos revelaram a ocorrência de grande variação dentro das linhagens, maior que aquela observada entre espécies de diferentes linhagens. Diferentemente, os dados morfométricos obtidos para oito das nove linhagens revelaram grande congruência com a atual proposta para Corydoradinae. Estes resultados demonstram que há correlação entre as variações em conteúdo de DNA e o tamanho da cabeça dos espermatozoides, fornecendo, assim, subsídio adicional para a definição das nove linhagens de Corydoradinae.

ABSTRACT Callichthyidae comprises a well-corroborated monophyletic group divided into two subfamilies: Corydoradinae and Callichthyinae. A recent proposal, based on molecular data, suggests that Corydoradinae is composed by nine monophyletic lineages, possibly genera. The species pertaining to those lineages have extensive modification in the size of genome, including diploid, tetraploid and octoploid species. Considering the occurrence of these monophyletic lineages and that the variations in DNA content may imply in significant alterations on the structure of spermatozoa, this study analyzed the morphology of the male reproductive system and the morphometry of the head of the spermatozoa of representatives of the nine lineages of Corydoradinae, seeking for particular characteristics of each lineage. Morphological data revealed a high intra-lineage variation, larger than that observed among species of different lineages. In contrast, morphometric data obtained for eight out of the nine lineages, revealed large congruency with the hypothesis that Corydoradinae is composed by different lineages. These results demonstrate that there is a correlation among variations in DNA content and the size of the spermatozoon head, thus providing additional subsides for the definition of the Corydoradinae lineages.

INTRODUÇÃO: Fístula faringocutânea após cirurgia de câncer de laringe e hipofaringe causa diversos danos. Nosso objetivo foi derivar uma regra de decisão clínica (RDC) para predizer o desenvolvimento da fístula faringocutânea após cirurgia.MÉTODO: Estudo de coorte retrospectivo incluindo todos os pacientes submetidos à laringectomia total e faringolaringectomia (n = 171). Analisou-se a associação entre as variáveis pertinentes e o desenvolvimento da fístula e foi proposto um modelo preditivo.RESULTADOS: Na análise univariada, a ASA, quimioradioterapia (QRT) e traqueostomia antes da cirurgia foram associadas à fístula. Na análise multivariada, somente a ASA manteve-se estatisticamente significante. Por regressão logística, derivamos um modelo preditivo incluindo: ASA, álcool, QRT, traqueostomia, hemoglobina e albumina pré-operatórias, extensão local, N, DM. A curva ROC do modelo foi 0,76 (95% CI 0,64−0,87). O grupo de alto risco teve especificidade 93%, Likelihood positivo 7,10 e valor preditivo positivo 76%. Incluindo os grupos de médio baixo, médio alto e alto risco, temos sensibilidade de 92%, Likelihood negativo 0,25 e valor preditivo positivo 89%.CONCLUSÃO: Criamos uma RDC para identificar os pacientes de alto risco ao desenvolvimento da fístula faringocutânea. As medidas de acurácia prognóstica foram substanciais. Entretanto, é essencial conduzir estudos prospectivos maiores para validação/refinamento do modelo.

INTRODUCTION: Pharyngocutaneous fistula after larynx and hypopharynx cancer surgery can cause several damages. This study's aim was to derive a clinical decision rule to predict pharyngocutaneous fistula development after pharyngolaryngeal cancer surgery.METHODS: A retrospective cohort study was conducted, including all patients performing total laryngectomy/pharyngolaryngectomy (n = 171). Association between pertinent variables and pharyngocutaneous fistula development was assessed and a predictive model proposed.RESULTS: American Society of Anesthesiologists scale, chemoradiotherapy, and tracheotomy before surgery were associated with fistula in the univariate analysis. In the multivariate analysis, only American Society of Anesthesiologists maintained statistical significance. Using logistic regression, a predictive model including the following was derived: American Society of Anesthesiologists, alcohol, chemoradiotherapy, tracheotomy, hemoglobin and albumin pre-surgery, local extension, N-classification, and diabetes mellitus. The model's score area under the curve was 0.76 (95% CI 0.64-0.87). The high-risk group presented specificity of 93%, positive likelihood ratio of 7.10, and positive predictive value of 76%. Including the medium-low, medium-high, and high-risk groups, a sensitivity of 92%, negative likelihood ratio of 0.25, and negative predictive value of 89% were observed.CONCLUSION: A clinical decision rule was created to identify patients with high risk of pharyngocutaneous fistula development. Prognostic accuracy measures were substantial. Nevertheless, it is essential to conduct larger prospective studies for validation and refinement.

Objetivo: Fístula faringocutânea é uma das maiores complicações pós-operatórias de laringectomia total e faringolaringectomia, podendo causar graves efeitos adversos ao paciente e à sociedade. Nosso objetivo é identificar todos os fatores preditivos e as classificações do risco descrito para a formação da fístula. Método: Pesquisa racional foi realizada para identificação de todos os estudos sobre fatores preditivos e classificações/probabilidade de risco ao desenvolvimento da fistula faringocutânea, publicados até abril de 2012 (n = 846). Os estudos incluídos foram analisados e os dados, a identificação, a qualidade metodológica e os resultados foram registrados. Resultados: Um total de 39 estudos foi incluído. As variáveis relacionadas foram deficiência nutricional, ASA, alto consumo de álcool, anemia e hipoalbuminemia, comorbilidades, N avançado, localização/extensão do tumor primário, tratamentos pré- cirúrgicos radioterapia/ quimioradioterapia, traqueostomia de emergência, status das margens cirúrgicas, duração da cirurgia, experiência do cirurgião, complicações locais da ferida cirúrgica, transfusão de sangue intraoperatória e relação entre sonda nasogástrica e alimentação oral. Conclusão: Nos estudos, muitos fatores de risco são associados ao desenvolvimento da fístula faringocutânea. Entretanto, ainda não existe um consenso sobre a seleção dos fatores mais influentes. Foram encontrados somente dois sistemas de classificações de riscos, e nenhum deles foi preditivo do desenvolvimento da fístula faringocutânea.

Objective: Pharyngocutaneous fistula is considered one of the major complications in the postoperative period after total laryngectomy/pharyngolaryngectomy, leading to a severe adverse impact for the patient and society. This study aimed to identify all the described pharyngocutaneous fistula predictive factors and risk classifications. Methods: Research was conducted to identify all the studies assessing predictive factors and risk classification for pharyngocutaneous fistula development published until April of 2012 (n = 846). The included studies were analyzed and data regarding their identification, methodological quality and results were recorded. Results: A total of 39 studies were included. The variables consistently reported as associated with fistula development were nutritional deficiency, American Society of Anesthesiologists (ASA) classification, high consumption of alcohol, anemia and hypoalbuminemia, co-morbidities, advanced N stage, location and extent of primary tumor, pre-radiotherapy and pre-chemoradiotherapy treatment, emergency tracheotomy, surgical margin status, surgery's duration, surgeon's experience, local complications of the wound, performance of intraoperative blood transfusion and relationship between nasogastric tube and oral feeding. Conclusion: Several risk factors were associated with pharyngocutaneous fistula formation in the included studies. However, there is still no consensus in the most pertinent selection. Only two classification systems were retrieved and they were not able to accurately predict pharyngocutaneous fistula.