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ABSTRACT Background: This study aimed to describe the kinetics of Leishmania parasite load determined using kinetoplast DNA (kDNA)-based quantitative polymerase chain reaction (qPCR) in visceral leishmaniasis (VL) patients. Methods: Parasite load in blood was assessed by qPCR at five time points, up to 12 months post-diagnosis. Sixteen patients were followed up. Results: A significant reduction in the parasite load was observed after treatment (P < 0.0001). One patient had an increased parasite load 3 months post-treatment and relapsed clinically at month six. Conclusions: We have described the use of kDNA-based qPCR in the post-treatment follow-up of VL cases.

https://doi.org/10.1590/0037-8682-0456-2022

A Risk Prediction Score for Renal Replacement Therapy in Critically Ill Septic - Acute Kidney Injury Patients
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Marques, Filipe

; Fonseca, José Agapito

; Gameiro, Joana

; Gouveia, João

; Lopes, José António

Portuguese Journal of Nephrology & Hypertension

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Dez 2022, Volume 36 Nº 4 Páginas 215 - 222

Resumo: En | Texto: En | PDF: En

ABSTRACT Introduction: Acute kidney injury (AKI) is a major complication in critically ill septic patients and is associated with increased morbidity and mortality. A recent study suggested a risk score based on patient’s chronic comorbidities and acute events at intensive care unit (ICU) admission as a reliable tool for predicting AKI in critically ill adult population. The aim of this study was to adapt this score to septic-AKI patients and evaluate its prognostic value as predictor of the need for renal replacement therapy (RRT) at ICU admission. Methods: This is a retrospective analysis of 399 septic-AKI patients admitted to the Division of Intensive Medicine of the Centro Hospitalar Universitário Lisboa Norte between January 2008 and December 2014. The Kidney Disease Improving Global Outcomes (KDIGO) classification was used to define AKI. The Renal Replacement Therapy Risk Score was adapted from the AKI risk prediction score proposed by Malhotra et al (Nephrol Dial Transplant. 2017;32:814-22). Results: Fifty two percent of patients were KDIGO stage 3, 25.8% KDIGO stage 2 and 22.3% KDIGO stage 1. Twenty seven percent of patients required RRT. Patients requiring RRT had higher risk score than those who did not (6.6±2.5 vs 5.1 ±2.6, p<0.001). An optimal cut-off value of ≥ 6 in this score predicted the need for RRT with sensitivity 0.630 and specificity 0.391. Conclusion: The RRT risk score at ICU admission was independently associated with the requirement of RRT septic-AKI patients. The assessment of this ratio is simple and can prove useful in identifying patients at risk for need of RRT.

https://doi.org/10.32932/pjnh.2022.11.208

O que mudou entre os períodos de pico e de platô durante a primeira onda do SARS-CoV-2? Estudo multicêntrico português em unidades de cuidados intensivos
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Pereira, Rui Antunes

; Sousa, Marta

; Cidade, José Pedro

; Melo, Luís

; Lopes, Diogo

; Ventura, Sara

; Aragão, Irene

; Lima Neto, Raul Miguel de Freitas

; Molinos, Elena

; Marques, Ana

; Cardoso, Nelson

; Marino, Flávio

; Monteiro, Filipa Brás

; Oliveira, Ana Pinho

; Silva, Rogério C

; Real, André Miguel Neto

; Banheiro, Bruno Sarmento

; Reis, Renato

; Adão-Serrano, Maria

; Cracium, Ana

; Valadas, Ana

; Ribeiro, João Miguel

; Póvoa, Pedro

; Tapadinhas, Camila

; Mendes, Vítor

; Coelho, Luís

; Maia, Raquel

; Freitas, Paulo Telles

; Ferreira, Isabel Amorim

; Ramires, Tiago

; Val-Flores, Luís Silva

; Cascão, Mariana

; Alves, Rita

; Rodeia, Simão C

; Barrigoto, Cleide

; Cardiga, Rosa

; Silva, Maria João Ferreira da

; Vale, Bruno

; Fonseca, Tatiana

; Rios, Ana Lúcia

; Camões, João

; Pérez, Danay

; Cabral, Susana

; Ribeiro, Maria Inês

; Mendes, João João

; Gouveia, João

; Fernandes, Susana Mendes

Revista Brasileira de Terapia Intensiva

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Dez 2022, Volume 34 Nº 4 Páginas 433 - 442

Resumo: En Pt | Texto: En Pt | PDF: En | PDF: Pt

ABSTRACT Objective: To analyze and compare COVID-19 patient characteristics, clinical management and outcomes between the peak and plateau periods of the first pandemic wave in Portugal. Methods: This was a multicentric ambispective cohort study including consecutive severe COVID-19 patients between March and August 2020 from 16 Portuguese intensive care units. The peak and plateau periods, respectively, weeks 10 - 16 and 17 - 34, were defined. Results: Five hundred forty-one adult patients with a median age of 65 [57 - 74] years, mostly male (71.2%), were included. There were no significant differences in median age (p = 0.3), Simplified Acute Physiology Score II (40 versus 39; p = 0.8), partial arterial oxygen pressure/fraction of inspired oxygen ratio (139 versus 136; p = 0.6), antibiotic therapy (57% versus 64%; p = 0.2) at admission, or 28-day mortality (24.4% versus 22.8%; p = 0.7) between the peak and plateau periods. During the peak period, patients had fewer comorbidities (1 [0 - 3] versus 2 [0 - 5]; p = 0.002) and presented a higher use of vasopressors (47% versus 36%; p < 0.001) and invasive mechanical ventilation (58.1 versus 49.2%; p < 0.001) at admission, prone positioning (45% versus 36%; p = 0.04), and hydroxychloroquine (59% versus 10%; p < 0.001) and lopinavir/ritonavir (41% versus 10%; p < 0.001) prescriptions. However, a greater use of high-flow nasal cannulas (5% versus 16%, p < 0.001) on admission, remdesivir (0.3% versus 15%; p < 0.001) and corticosteroid (29% versus 52%, p < 0.001) therapy, and a shorter ICU length of stay (12 days versus 8, p < 0.001) were observed during the plateau. Conclusion: There were significant changes in patient comorbidities, intensive care unit therapies and length of stay between the peak and plateau periods of the first COVID-19 wave.

RESUMO Objetivo: Analisar e comparar as características de pacientes críticos com a COVID-19, a abordagem clínica e os resultados entre os períodos de pico e de platô na primeira onda pandêmica em Portugal. Métodos: Este foi um estudo de coorte multicêntrico ambispectivo, que incluiu pacientes consecutivos com a forma grave da COVID-19 entre março e agosto de 2020 de 16 unidades de terapia intensiva portuguesas. Definiram-se as semanas 10 - 16 e 17 - 34 como os períodos de pico e platô. Resultados: Incluíram-se 541 pacientes adultos com mediana de idade de 65 [57 - 74] anos, a maioria do sexo masculino (71,2%). Não houve diferenças significativas na mediana de idade (p = 0,3), no Simplified Acute Physiology Score II (40 versus 39; p = 0,8), na pressão parcial de oxigênio/fração inspirada de oxigênio (139 versus 136; p = 0,6), na terapia com antibióticos na admissão (57% versus 64%; p = 0,2) ou na mortalidade aos 28 dias (24,4% versus 22,8%; p = 0,7) entre o período de pico e platô. Durante o período de pico, os pacientes tiveram menos comorbidades (1 [0 - 3] versus 2 [0 - 5]; p = 0,002); fizeram mais uso de vasopressores (47% versus 36%; p < 0,001) e ventilação mecânica invasiva na admissão (58,1% versus 49,2%; p < 0,001), e tiveram mais prescrição de hidroxicloroquina (59% versus 10%; p < 0,001), lopinavir/ritonavir (41% versus 10%; p < 0,001) e posição prona (45% versus 36%; p = 0,04). Entretanto, durante o platô, observou-se maior uso de cânulas nasais de alto fluxo (5% versus 16%; p < 0,001) na admissão, remdesivir (0,3% versus 15%; p < 0,001) e corticosteroides (29% versus 52%; p < 0,001), além de menor tempo de internação na unidade de terapia intensiva (12 versus 8 dias; p < 0,001). Conclusão: Houve mudanças significativas nas comorbidades dos pacientes, nos tratamentos da unidade de terapia intensiva e no tempo de internação entre os períodos de pico e platô na primeira onda da COVID-19.

https://doi.org/10.5935/0103-507x.20210037-pt

Reinventando a pandemia. Desobediência alternativa
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Gouveia, João Tiago

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Dez 2021, Nº 27 Páginas 53 - 78

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

Resumo A epidemia de coronavírus desencadeou uma vasta epidemia de vírus ideológicos que se insinuavam há algum tempo a partir da psicopolítica atual, dominada pelo avanço neoliberal e tecnológico, conducentes a ampliar os fenómenos que caracterizam a denominada época da pós-verdade. Pondo a tónica nos discursos dos grupos que reinventam a pandemia através dessa lógica, desenvolve-se o conceito de desobediência alternativa, entendido como uma reificação das novas formas de subjetividades impulsionadas pela psicopolítica segundo Byung-Chul Han, questionando-se acerca da sua legitimidade moral tendo em consideração as definições distintas de desobediência civil de Henry David Thoreau e Hannah Arendt. Conclui-se que a pandemia veio revelar não só desigualdades e contradições que atravessam o mundo, mas também os entraves ao surgimento de um projeto comum assente numa consciência global. Neste sentido, a crescente falta de comprometimento para com a verdade é geradora de mudanças políticas e sociais que colocam em causa a própria democracia liberal.

Abstract The spread of the coronavirus epidemic eventually triggered ideological reactions that had been taking hold for some time as a consequence of neoliberal and technological advances, conducive to amplifying the phenomena that characterize what has been called the Post-truth Era. Focusing on the discourses of the groups that reinvent the pandemic through of this logic, we seek to develop the concept of alternative disobedience, understood as a reification of the new forms of subjectivities driven by psychopolitics, according to Byung-Chul Han, questioning their moral legitimacy taking into consideration Henry David Thoreau’s and Hannah Arendt’s distinct definitions of civil disobedience. It can be concluded that the pandemic has revealed not only inequalities and contradictions across the world, but also the obstacles to the emergence of a common project based on a global conscience. In this sense, the growing lack of commitment to the truth generates political and social changes that call into question liberal democracy itself.

https://doi.org/10.30553/sociologiaonline.2021.27.3 18 downloads

Atualização das recomendações da Sociedade Portuguesa de Cuidados Intensivos e do Grupo de Infeção e Sépsis para a abordagem da COVID-19 em Medicina Intensiva
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Mendes, João João

; Paiva, José Artur

; Gonzalez, Filipe

; Mergulhão, Paulo

; Froes, Filipe

; Roncon, Roberto

; Gouveia, João

Revista Brasileira de Terapia Intensiva

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Out 2021, Volume 33 Nº 4 Páginas 487 - 536

Resumo: En Pt | Texto: En Pt | PDF: En | PDF: Pt

ABSTRACT Introduction: The Sociedade Portuguesa de Cuidados Intensivos and the Infection and Sepsis Group have previously issued health service and management recommendations for critically ill patients with COVID-19. Due to the evolution of knowledge, the panel of experts was again convened to review the current evidence and issue updated recommendations. Methods: A national panel of experts who declared that they had no conflicts of interest regarding the development of the recommendations was assembled. Operational questions were developed based on the PICO methodology, and a rapid systematic review was conducted by consulting different bibliographic sources. The panel determined the direction and strength of the recommendations using two Delphi rounds, conducted in accordance with the principles of the GRADE system. A strong recommendation received the wording “is recommended”, and a weak recommendation was written as “is suggested.” Results: A total of 48 recommendations and 30 suggestions were issued, covering the following topics: diagnosis of SARS-CoV-2 infection, coinfection and superinfection; criteria for admission, cure and suspension of isolation; organization of services; personal protective equipment; and respiratory support and other specific therapies (antivirals, immunomodulators and anticoagulation). Conclusion: These recommendations, specifically oriented to the Portuguese reality but that may also apply to Portuguese-speaking African countries and East Timor, aim to support health professionals in the management of critically ill patients with COVID-19. They will be continuously reviewed to reflect the progress of our understanding and the treatment of this pathology.

RESUMO Introdução: A Sociedade Portuguesa de Cuidados Intensivos e o Grupo de Infeção e Sépsis emitiram previamente recomendações visando à organização dos serviços de saúde e ao manejo dos doentes críticos com COVID-19. Em virtude da evolução do conhecimento, o painel de peritos voltou a se organizar para rever a atual evidência e emitir recomendações atualizadas. Métodos: Foi reunido um painel nacional de peritos que declararam não ter conflitos de interesse para o desenvolvimento das recomendações. Foram desenvolvidas perguntas operacionais conforme a metodologia PICO, e foi conduzida uma revisão sistemática rápida por meio da consulta de diferentes fontes bibliográficas. O painel determinou a direção e a força das recomendações com a utilização de duas rodadas de um método Delphi, conduzido seguindo princípios do sistema GRADE. Uma recomendação forte recebeu a redação “recomenda-se”, e uma recomendação fraca foi redigida como “sugere-se”. Resultados: Foram emitidas 48 recomendações e 30 sugestões abrangendo os seguintes tópicos: diagnóstico de infecção por SARS-CoV-2, coinfecção e superinfecção; critérios de admissão, cura e suspensão de isolamento; organização dos serviços; Equipamentos de Proteção Individual; terapêuticas de suporte respiratório e outras e terapêuticas específicas (antivirais, imunomodeladores e anticoagulação). Conclusão: Essas recomendações, especificamente orientadas para a realidade portuguesa, mas que podem se aplicar também aos Países Africanos de Língua Oficial Portuguesa e ao Timor-Leste, visam apoiar os profissionais de saúde no manejo de doentes críticos com COVID-19. Pretende-se que sejam constantemente revistas, de modo a refletir o avanço de nossa compreensão e o da terapêutica dessa patologia.

https://doi.org/10.5935/0103-507x.0103-507x-rbti-20210080

Recomendações da Sociedade Portuguesa de Cuidados Intensivos e Grupo de Infeção e Sépsis para a abordagem do COVID-19 em medicina intensiva
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Mendes, João João

; Mergulhão, Paulo

; Froes, Filipe

; Paiva, José Artur

; Gouveia, João

Revista Brasileira de Terapia Intensiva

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Mar 2020, Volume 32 Nº 1 Páginas 2 - 10

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

RESUMO A atual epidemia de COVID-19 foi declarada em 31 de dezembro de 2019 no mercado de frutos do mar da cidade de Wuhan, com rápida disseminação na China e, posteriormente, envolvendo múltiplos países (como maior expressão na Coreia do Sul, Japão, Itália e Irã) incluindo, desde 1º de março, Portugal. A maioria dos doentes infetados apresenta doença ligeira sem necessidade de hospitalização. Dentre os internados, de 6% a 10% necessitam de cuidados intensivos. As presentes recomendações visam facilitar a organização dos serviços de medicina intensiva para a resposta ao COVID-19, proporcionado os melhores cuidados aos doentes e protegendo os profissionais de saúde.

ABSTRACT Current COVID-19 epidemics was declared on December 31, 2019 at the Wuhan city seafood market, rapidly spreading throughout China, and later reaching several countries (mainly South Korea, Japan, Italy and Iran) and, since March 1, reaching Portugal. Most of the infected patients present with mild symptoms, not requiring hospitalization. Among those admitted to the hospital, 6% to 10% require admission to the intensive care unit. These recommendations are aimed to support the organization of intensive care services to respond COVID-19, providing optimized care to the patient and protection for healthcare professionals.

https://doi.org/10.5935/0103-507x.20200002 3608 downloads

Diretrizes da Sociedade Portuguesa de Cuidados Intensivos para profilaxia da úlcera de estresse na unidade de terapia intensiva
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Mendes, João João

; Silva, Mário Jorge

; Miguel, Luís Silva

; Gonçalves, Maria Albertina

; Oliveira, Maria João

; Oliveira, Catarina da Luz

; Gouveia, João

Revista Brasileira de Terapia Intensiva

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Mar 2019, Volume 31 Nº 1 Páginas 5 - 14

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

RESUMO O paciente crítico corre risco de desenvolver úlceras de estresse do trato gastrintestinal. Antiácidos e antiulcerosos de diferentes classes são frequentemente prescritos para reduzir a incidência de hemorragia gastrintestinal clinicamente significativa associada à úlcera de estresse. No entanto, o uso indiscriminado deste tipo de profilaxia em todos os pacientes admitidos a unidades de terapia intensiva não só não se justifica, como tem potenciais efeitos adversos e implicações de custo. As presentes diretrizes da Sociedade Portuguesa de Cuidados Intensivos resume a evidência atual e fornece seis afirmações clínicas e um algoritmo com o objetivo de fornecer uma política padronizada para prescrição de profilaxia da úlcera estresse em unidades de terapia intensiva.

ABSTRACT Critically ill patients are at risk of developing stress ulcers in the upper digestive tract. Agents that suppress gastric acid are commonly prescribed to reduce the incidence of clinically important stress ulcer-related gastrointestinal bleeding. However, the indiscriminate use of stress ulcer prophylaxis in all patients admitted to the intensive care unit is not warranted and can have potential adverse clinical effects and cost implications. The present guidelines from the Sociedade Portuguesa de Cuidados Intensivos summarizes the current evidence and gives six clinical statements and an algorithm aiming to provide a standardized prescribing policy for the use of stress ulcer prophylaxis in the intensive care unit.

https://doi.org/10.5935/0103-507x.20190002 3053 downloads

MINIMUM BACTERICIDAL CONCENTRATION OF COMMERCIAL DISINFECTANTS ON STAPHYLOCOCCUS SPP. ISOLATED FROM MASTITIS IN GOATS AND DETECTION OF THE icaD GENE
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Silva, Welington Erasmo de Lima e

; Amanso, Evandro Santos

; Peixoto, Rodolfo de Moraes

; Gouveia, João José de Simoni

; Gouveia, Gisele Veneroni

; Costa, Mateus Matiuzzi da

Ciência Animal Brasileira

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2019, Volume 20 elocation e53193

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

Resumo O presente trabalho objetivou avaliar a eficácia in vitro de desinfetantes comerciais frente à Staphylococcus spp. isolados de casos de mastite em cabras e, relacionar a resistência observada com a presença do gene icaD. A microdiluição em caldo foi utilizada para avaliar a atividade antimicrobiana in vitro dos desinfetantes, enquanto a técnica de vermelho congo para a avaliação da produção de biofilme e amplificação do gene icaD. Todas as amostras avaliadas foram sensíveis aos desinfetantes, com as seguintes faixas de atividade: amônia quaternária (0,13 - 21,33 µg/ml), clorexidina (4,00 - 313,00 µg/ml) e iodo (190,00 - 12500,00 µg/ml), no entanto o desinfetante a base de hipoclorito de sódio não apresentou atividade bactericida na faixa de concentração 15,0 a 0,03 µg/ml. O gene icaD apresentou frequência de 14,7% nos isolados. O teste exato de Fisher apontou efeito significativo da relação entre o valor da concentração bactericida mínima do desinfetante à base de amônia quaternária e a presença/ausência do gene icaD (P<0,01). Os desinfetantes comerciais com os princípios ativos amônia quaternária, clorexidina e iodo, apresentaram atividade in vitro até mesmo em concentrações inferiores às preconizadas pelos fabricantes o que torna necessária a realização periódica da avaliação do perfil de sensibilidade dos desinfetantes.

Abstract This study aimed to evaluate the in vitro efficacy of commercial disinfectants on Staphylococcus spp., isolated from mastitis cases in goats, and to associate the observed resistance with the presence of the icaD gene. Broth microdilution was employed to evaluate the in vitro antimicrobial activity of the disinfectants, whereas the Congo Red technique was used for the evaluation of biofilm production and amplification of the icaD gene. All evaluated samples were sensitive to disinfectants, with the following ranges of activity: quaternary ammonium (0.13 - 21.33 µg/ml), chlorhexidine (4.00 - 313.00 µg/ml) and iodine (190.00 - 12500.00 µg/ml); however, the sodium hypochlorite-based disinfectant showed no bactericidal activity in the concentration range from 15.0 to 0.03 µg/ml. The icaD gene presented a frequency of 14.7% in the isolate samples. Fisher’s exact test showed a significant effect of the relation between the minimum bactericidal concentration value of the quaternary ammonium-based disinfectant and the presence/absence of the icaD gene (P <0.01). Commercial disinfectants with quaternary ammonium, chlorhexidine and iodine active ingredients presented in vitro activity even at concentrations lower than those recommended by the manufacturers. Therefore, the periodic evaluation of the sensitivity profile of the disinfectants must be performed.

https://doi.org/10.1590/1089-6891v20e-53193 565 downloads

Resistance of Corynebacterium pseudotuberculosis in the Brazilian semiarid environment
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Sá, Maria C.A.

; Oliveira, Samily A.S.

; Dantas Jr, Edmilson M.

; Gouveia, Gisele V.

; Gouveia, João J.S.

; Veschi, Josir L.A.

; Costa, Mateus M.

Pesquisa Veterinária Brasileira

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Jun 2018, Volume 38 Nº 6 Páginas 1091 - 1096

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

RESUMO: O semiárido nordestino do Brasil possui um bioma exclusivo, a caatinga, que apresenta temperatura máxima de 40oC e uma umidade relativa do ar de 56%. A caatinga é caracterizada por uma diversidade de plantas, entre elas Cereus jamacaru DC. (mandacaru), Poincianella microphylla Mart ex G. Don (catingueira), Pilosocereus gounellei F.A.C. Weber (xique-xique) e Mimosa tenuiflora (Willd.) Poir (jurema preta). A produção de ovinos e caprinos está em franca expansão, porém a linfadenite caseosa é uma enfermidade de alta prevalência na região. Objetiva-se com o presente estudo, verificar a sobrevivência e produção de biofilme em isolados de Corynebacterium pseudotuberculosis em temperaturas de 28oC, 37oC e 42oC, quando inoculado em superfícies de solo, madeira, arame e espinho e em plantas nas condições ambientais da caatinga. Além disto, foi verificado o efeito da aplicação dos desinfetantes clorexidine, hipoclorito e amônia quaternária sobre o solo, piso (lajota), madeira e vegetação de cobertura do solo. Foram selecionadas quatro amostras de C. pseudotuberculosis (dois caprinos e dois ovinos) para inoculação de acordo com a sua produção in vitro de biofilme. A adesão a microplacas foi utilizado para avaliar a capacidade de formação de biofilme das bactérias. As menores taxas de sobrevivência foram observadas quando isolados de C. pseudotuberculosis foram submetidos a uma temperatura de 42°C. Com relação as plantas do bioma caatinga, a contaminação na planta jurema-preta apresentou menores índices de sobrevivência. O desinfetante amônia quartenária promoveu uma menor sobrevivência do inóculo em todas as superfícies. Os desinfetantes e temperatura contribuíram para a redução na produção de biofilme nos isolados de Corynebacterium pseudotuberculosis. O conhecimento destes padrões é importante para o estabelecimento de medidas de controle da enfermidade, dada a eficiência questionável do tratamento e imunoprofilaxia da linfadenite caseosa.

ABSTRACT: The semiarid northeast of Brazil contains a unique biome known as caatinga, with a maximum temperature of 40 ºC and a relativity humidity of 56%. The caatinga is characterized by a variety of plants, including Cereus jamacaru Dc (mandacaru), Poincianella microphylla Mart. ex G. Don (catingueira), Pilosocereus gounellei FAC Weber (xique-xique) and Mimosa tenuiflora (Willd.) Poir (jurema preta). Sheep and goat industries are economically strong in that region, despite the fact that caseous lymphadenitis is highly prevalent. The aim of the present study was to assess the survival and biofilm production of Corynebacterium pseudotuberculosis isolates in the environment and under controlled temperatures (28°C, 37°C and 42°C) under different surfaces (plants, soil, wood, wire and thorns). In addition, we investigated the effects of applying the disinfectants chlorhexidine, hypochlorite and quaternary ammonia in soil, tiles, wood and vegetation cover. Four strains of C. pseudotuberculosis were selected (two from goats and two from sheep) for inoculation according to their in vitro biofilm production. Adherence to microplates was used to assess the biofilm-forming ability of the bacteria. Lower survival rates were observed when isolates of C. pseudotuberculosis were subjected to a temperature of 42°C. In terms of caatinga biome plants, contamination of jurema-preta plants resulted in the lowest survival rates. The disinfectant quaternary ammonia promoted a lower inoculum survival in all surfaces. The disinfectants and the higher temperature contributed to the reduction of biofilm production in isolates of C. pseudotuberculosis. knowledge of these patterns is important for the establishment of disease control measures, given the questionable efficacy of the treatment and the immuno-prophylaxis of caseous lymphadenitis.

https://doi.org/10.1590/1678-5150-pvb-4960 1038 downloads

10.

Gene floR e a resistência ao florfenicol em isolados de Aeromonas spp. autóctones de organismos aquáticos
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Silva, Naedja C.S.L.

; Nogueira, Joel F.

; Gouveia, João J.S.

; Costa, Mateus M.

; Gouveia, Gisele V.

Pesquisa Veterinária Brasileira

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Mar 2018, Volume 38 Nº 3 Páginas 357 - 366

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

RESUMO: O gene floR descrito é descrito pela literatura como o responsável pela resistência ao florfenicol, que é um antimicrobiano amplamente utilizado na aquicultura. Esse gene já foi relatado em muitas espécies de bactérias, inclusive no gênero Aeromonas. Essas bactérias causam alta mortalidade na piscicultura trazendo prejuízos econômicos. É importante que haja estudos sobre esse gene e possíveis mutações que possam levar a alterações na estrutura e função da proteína. Os objetivos desse estudo foram caracterizar o gene floR em isolados de Aeromonas spp. obtidas do Vale do São Francisco e verificar se a presença desse gene está associada com a resistência ao florfenicol. Foram realizadas reações em cadeia da polimerase (PCR) para a presença do gene floR em 27 isolados de Aeromonas spp.. Amostras positivas para a presença do gene foram sequenciadas e analisadas quanto à presença de polimorfismos por meio de alinhamentos. Os diferentes haplótipos detectados foram utilizados para análises com os programas SIFT e PolyPhen para predição de alteração de função proteica. A modelagem estrutural da proteina codificada pelo gene floR foi realizada com o programa Modeller e, os modelos foram avaliados pelo Procheck, Verify3D e Whatif. A similaridade da estrutura tridimensional da proteína referência com as estruturas tridimensionais das proteínas codificadas pelos diferentes haplótipos foi comparada através do TM-align. A resistência das bactérias ao florfenicol foi avaliada através do teste de microdiluição em caldo, o qual também foi realizado na presença do carbonil cianeto m-clorofenil hidrazona para verificar o efeito da inibição da bomba de efluxo sobre tal resistência. Dos vinte e sete isolados avaliados quanto a presença do gene floR, 14 isolados foram positivos e 10 foram sequenciados, o que permitiu a identificação de três polimorfismos no gene floR, que levaram a construção de três haplótipos diferentes (TAA, TTA e CTG). As análises realizadas com os programas SIFT e PolyPhen apontaram que os haplótipos TTA e TAA provavelmente poderiam alterar a estrutura e função da proteína. As proteínas modeladas para os três haplótipos demonstraram possuir praticamente a mesma conformação estrutural entre si. Todos os isolados que apresentaram o gene foram resistentes ao florfenicol e aqueles que não apresentavam foram sensíveis. O teste na presença do Carbonil Cianeto m-Clorofenil Hidrazona foi realizado para três isolados, cada isolado representando um haplótipo, sendo possível observar a inibição do crescimento bacteriano em todas as concentrações independente do haplótipo. Os resultados obtidos nesse estudo mostram que a resistência ao flofenicol em Aeromonas spp. pode ser explicada pela presença do gene floR, e que esse gene está relacionado com uma bomba de efluxo. As mutações verificadas no gene floR, parecem não estar envolvidas com alteração de estrutura e função da proteína codificada por esse gene.

ABSTRACT: The floR gene is described in related literature as responsible for resistance to florfenicol, which is a widely used antimicrobial agent in aquaculture. This gene has been reported in many species of bacteria, including the genus Aeromonas. These bacteria cause high mortality in fish farming bringing economic losses. It is important that studies of this gene and possible mutations that can lead to changes in the structure and function of the protein. The aim of this study was to characterize the floR gene in isolates of Aeromonas spp. and check if the presence of this gene is associated with resistance to florfenicol in Aeromonas spp. obtained from the San Francisco Valley. PCR (Polymerase Chain Reaction) were also performed to verify the presence of the floR gene in 27 isolates of Aeromonas spp. Positive samples for the presence of the gene were sequenced and analyzed for the presence of polymorphisms using alignments. Different haplotypes detected were used for analysis with the SIFT and PolyPhen programs for prediction of changes in protein function. The structural modeling of protein encoded by the floR gene was performed using the Modeller software, and the models were evaluated by Procheck, Verify3D and Whatif. The similarity of the dimensional structure of reference protein with the dimensional structures of the proteins encoded by the different haplotypes was compared by TM-align. Bacterial resistance to florfenicol was assessed by the microdilution test, which was also performed in the presence of carbonyl cyanide m-chlorophenyl hydrazone to verify the effect of inhibiting the efflux pump. 14 isolates were positive for the presence of floR gene and 10 were sequenced and allowed the identification of three polymorphisms in the floR gene, which led to construction of three different haplotypes (TAA TTA and CTG). The analyzes carried out with the SIFT and PolyPhen programs showed that the TTA and TAA haplotypes could probably change the protein structure-function. Proteins modeled for the three haplotypes were found to have substantially the same structural conformation with each other. All isolates presenting the gene were resistant to florfenicol and those who did not have were sensitive. The test in the presence of carbonyl cyanide m-chlorophenylhydrazone was conducted for three isolates, representing each single haplotype and was observed inhibition of bacterial growth at all concentrations independent of the haplotype. The results of this study show that resistance to flofenicol in Aeromonas spp. may be explained by the presence of floR gene and that this gene is associated with an efflux pump. Mutations observed in floR gene do not appear to be involved with chenges in structure and function of the protein encoded by gene.

https://doi.org/10.1590/1678-5150-pvb-4842 939 downloads

11.

The presence of plasmids in Aeromonas hydrophila and its relationship with antimicrobial and heavy metal-resistance profiles
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Freitas, Mariana Ramos

; Freire, Naiana Braga

; Peixoto, Luciana Jatobá e Silva

; Oliveira, Samira Teixeira Leal de

; Souza, Renilde Cordeiro de

; Gouveia, João José de Simoni

; Costa, Mateus Matiuzzi da

; Gouveia, Gisele Veneroni

Ciência Rural

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2018, Volume 48 Nº 9 elocation e20170813

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

RESUMO: Bactérias da espécie Aeromonas hydrophila são patógenos que atacam peixes, causando grandes prejuízos à piscicultura. Entender os perfis de resistência dessa bactéria e a capacidade da mesma em transferir tal resistência é importante para implantação de um manejo adequado na produção de peixes. Os objetivos desse estudo foram analisar a resistência de isolados de Aeromonas hydrophila à antimicrobianos e metais pesados e, correlacionar os perfis encontrados com a presença de plasmídeos. A resistência dos isolados aos antimicrobianos (oxacilina, gentamicina, tetraciclina e ácido nalidíxico) e metais pesados (cádmio, chumbo, cobre e manganês) foi verificada pelas técnicas da Concentração Bactericida Mínima (CBM) e Concentração Inibitória Mínima (CIM). Foi calculado o Índice de Resistência Múltipla aos Antimicrobianos (IRMA). Os plasmídeos foram extraídos por metodologias descritas pela literatura. A relação entre a resistência aos antimicrobianos e metais pesados com a presença de plasmídeos foi determinada pelo teste de Mann-Whitney utilizando o ambiente R. Foi observada alta resistência aos antimicrobianos e metais pesados testados, com exceção à gentamicina e cádmio. No IRMA os isolados apresentaram resistência a todos os perfis de antimicrobianos possíveis. Quatorze isolados apresentaram plasmídeos, mas não foi encontrada relação dos perfis de resistência com a presença destes, o que indica que os genes de resistência a esses compostos estejam presentes no DNA cromossômico. Porém apontam a possibilidade de transferência dos genes de resistência entre os isolados. Estes resultados apontam alta resistência dos isolados e capacidade de transmissão dessa resistência a outras bactérias. A resistência aos metais pesados, pode estar ligada ao uso de fertilizantes nas plantações localizadas próximas as margens do Rio São Francisco.

ABSTRACT: Aeromonas hydrophila is a common fish pathogen that causes extensive damage to aquaculture. To develop and implement a more adequate strategy to farm fish, it is crucial to understand the bacterial-resistance levels and their transference dynamics. The objective of this study was to analyze the resistance profile of isolated Aeromonas hydrophila to antimicrobial agents and heavy metals and draw a correlation of the observed profiles with the presence of plasmids. Resistance of the isolated bacteria to antimicrobial agents (oxacilin, gentamicin, tetracycline, and nalidixic acid) and heavy metals (cadmium, lead, copper, and manganese) was verified using the minimum bactericidal concentration (MBC) and minimum inhibitory concentration (MIC) standards. The Multiple Antibiotic Resistance Index (MAR Index) was calculated. Plasmids were extracted by using a common methodology described elsewhere. Mann-Whitney Test, implemented in the R environment, was used to determine the correlation between resistance and plasmids presence. A high resistance to almost all antimicrobial agents and heavy metals was observed, except to gentamicin and cadmium. The MAR index results showed resistance to all antimicrobial profiles. Of the isolated bacteria, 14 showed the presence of plasmids. However, no correlation was noted between the resistance profile and the plasmid presence for these isolates, indicating that the genes responsible for resistance to microbial agents and heavy metals are present in the cromossomic DNA, which in turn suggested the possibility of gene transfer between the isolated bacteria. The resistance to heavy metals can be linked to heavy utilization of fertilizers along the Sao Francisco River.

https://doi.org/10.1590/0103-8478cr20170813 1194 downloads

12.

A Propósito do Reconhecimento em Portugal da Especialidade de Medicina de Emergência
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Gouveia, João França

Medicina Interna

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Set 2017, Volume 24 Nº 3 Páginas 235 - 236

Resumo: Pt | Texto: Pt | PDF: Pt

https://doi.org/10.24950/rspmi/CE/2017 419 downloads

13.

In vitro antimicrobial activity of the organic extract of Cladonia substellata Vainio and usnic acid against Staphylococcus spp. obtained from cats and dogs
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Moura, Jusciêne B.

; Vargas, Agueda C. de

; Gouveia, Gisele V.

; Gouveia, João J. de S.

; Ramos-Júnior, Juracy C.

; Botton, Sônia de A.

; Pereira, Eugênia C.

; Costa, Mateus M. da

Pesquisa Veterinária Brasileira

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Abr 2017, Volume 37 Nº 4 Páginas 368 - 378

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

RESUMO: Cladonia substellata Vainio é um líquen encontrado em diversos continentes do mundo, inclusive no nordeste do Brasil, possui vários metabólitos secundários com atividade biológica, entre eles, o ácido úsnico, que tem apresentado uma vasta gama de atividades biológicas. O objetivo deste trabalho foi avaliar a atividade antimicrobiana in vitro do extrato orgânico de C. substellata e do ácido úsnico purificado. Para isto, foram isolados Staphylococcus spp. de amostras de pele e orelha de cães e gatos com suspeita de piodermatite e otite. No teste de sensibilidade aos antimicrobianos frente Staphylococcus spp., 77% (105/136) foram resistentes. Na avaliação da produção de biofilme 83% (113/136) foram classificadas como produtoras de biofilme. Na caracterização genotípica, 32% (44/136) foram positivos para o gene blaZ, nenhum isolado (n=136) foi positivo para o gene mecA, e 2% (3/136) foram positivos para o gene icaD. A atividade antimicrobiana in vitro do extrato orgânico de C. substellata e do ácido úsnico purificado para Staphylococcus spp. variou de 0,25mg/ml a 0,0019mg/ml, inibindo o crescimento bacteriano em baixas concentrações. Foram mais eficazes contra bactérias produtoras de biofilme (0,65mg/ml-0,42mg/ml) quando comparadas às não produtoras de biofilme (2,52mg/ml-2,71mg/ml). Viabilizando a utilização do ácido úsnico e do extrato orgânico de C. substellata, no tratamento de otite e piodermatite em cães e gatos com o envolvimento de Staphylococcus spp.

ABSTRACT: Cladonia substellata Vainio is a lichen found in different regions of the world, including the Northeast of Brazil. It contains several secondary metabolites with biological activity, including usnic acid, which has exhibited a wide range of biological activities. The aim of this study was to evaluate the in vitro antimicrobial activity of the organic extract of C. substellata and purified usnic acid. Initially, Staphylococcus spp., derived from samples of skin and ears of dogs and cats with suspected pyoderma and otitis, were isolated and analyzed. In antimicrobial susceptibility testing against Staphylococcus spp., 77% (105/136) of the isolates were resistant to the antimicrobials tested. In the assessment of biofilm production, 83% (113/136) were classified as producing biofilm. In genetic characterization, 32% (44/136) were positive for blaZ, no isolate (0/136) was positive for the mecA gene, and 2% (3/136) were positive for the icaD gene. The in vitro antimicrobial activity of the organic extract of C. substellata and purified usnic acid against Staphylococcus spp. ranged from 0.25mg/mL to 0.0019mg/mL, inhibiting bacterial growth at low concentrations. The substances were more effective against biofilm-producing bacteria (0.65mg/mL-0.42mg/mL) when compared to non-biofilm producing bacteria (2.52mg/mL-2.71mg/mL). Usnic acid and the organic extract of C. substellata can be effective in the treatment of pyoderma and otitis in dogs and cats caused by Staphylococcus spp.

https://doi.org/10.1590/s0100-736x2017000400011 1512 downloads

14.

Identification of selection signatures in livestock species
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Gouveia, João José de Simoni

; Silva, Marcos Vinicius Gualberto Barbosa da

; Paiva, Samuel Rezende

; Oliveira, Sônia Maria Pinheiro de

Genetics and Molecular Biology

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Jun 2014, Volume 37 Nº 2 Páginas 330 - 342

Resumo: En | Texto: En | PDF: En

The identification of regions that have undergone selection is one of the principal goals of theoretical and applied evolutionary genetics. Such studies can also provide information about the evolutionary processes involved in shaping genomes, as well as physical and functional information about genes/genomic regions. Domestication followed by breed formation and selection schemes has allowed the formation of very diverse livestock breeds adapted to a wide variety of environments and with special characteristics. The advances in genomics in the last five years have enabled the development of several methods to detect selection signatures and have resulted in the publication of a considerable number of studies involving livestock species. The aims of this review are to describe the principal effects of natural/artificial selection on livestock genomes, to present the main methods used to detect selection signatures and to discuss some recent results in this area. This review should be useful also to research scientists working with wild animals/non-domesticated species and plant biologists working with breeding and evolutionary biology.

4427 downloads

15.

Effect of irrigation on soil water depletion, vegetative growth, yield and berry composition of the grapevine variety Touriga Nacional
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Gouveia, João

; Lopes, Carlos M.

; Pedroso, Vanda

; Martins, Sérgio

; Rodrigues, Pedro

; Alves, Isabel

Ciência e Técnica Vitivinícola

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Dez 2012, Volume 27 Nº 2 Páginas 115 - 122

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

Com o objectivo de estudar a influência da rega no crescimento vegetativo, rendimento e composição da uva da casta Touriga Nacional foi instalado um ensaio numa vinha do Centro de Estudos Vitivinícolas do Dão, Nelas, Portugal. Compararam-se os efeitos de três modalidades de rega (DI30 - 30% ETc; DI50 - 50% ETc e FI - 100% ETc) com uma testemunha não regada (NI) durante três anos consecutivos (2006 a 2008.). A rega influenciou de forma significativa quer a fracção de água disponível no solo quer o seu padrão de extracção na linha e entrelinha. O potencial hídrico foliar de base também foi influenciado pela rega tendo-se observado as maiores diferenças entre a modalidade FI (maiores valores) e a modalidade NI (menores valores). A modalidade FI apresentou um maior vigor quando comparada com a modalidade não regada enquanto as modalidades de rega deficitária (DI30 & DI50) apresentaram valores intermédios. Quando comparadas com a testemunha não regada, as modalidades de rega deficitária não apresentaram diferenças significativas quer no rendimento quer na composição das uvas à vindima. A modalidade FI conduziu à obtenção de um maior rendimento e de mostos com acidez total mais elevada e teores em açúcar e antocianinas mais baixos que as restantes modalidades. Com excepção do maior rendimento obtido na modalidade FI, nestes três anos de ensaio a rega não proporcionou outras vantagens agronómicas pelo que podemos concluir que, nas condições ecológicas e vitícolas do ensaio, a rega parece ser uma técnica cultural desnecessária. No entanto são necessários mais estudos, sobretudo em solos com menor capacidade de retenção de água e em anos mais secos, cuja frequência se prevê que venha a aumentar no futuro próximo em consequência das alterações climáticas.

Aiming to assess the effects of irrigation amount on vegetative growth, yield and berry composition of the red variety Touriga Nacional (Vitis vinifera L.) a field trial was installed at the “Centro de Estudos Vitivinícolas do Dão”, Nelas, Portugal. The effects of three irrigation treatments (DI30 - 30% of ETc; DI50 - 50% ETc and FI - 100% ETc) were compared to a control non-irrigated (NI) during three growing seasons (2006-2008). Irrigation affected significantly the fraction of available soil water and the pattern of soil water extraction by the roots either in the row and interrow. Predawn leaf water potential was also influenced by irrigation amount being the main differences observed between FI (highest values) and NI (lowest values). Compared to NI, the full irrigation treatment (FI) induced a significantly higher vigour while the deficit irrigation treatments (DI30 & DI50) returned intermediate values. The FI treatment induced a significantly higher yield as compared to the other treatments which returned similar values. Compared to the control non-irrigated, the deficit irrigation treatments presented similar berry composition during all the three seasons while the FI treatment showed a significantly higher total acidity, lower total soluble solids and anthocyanins concentration. With the exception of the higher yield observed in FI treatment, in these three seasons irrigation had no other agronomical advantages enabling us to conclude that, in the ecological and viticultural conditions of the experiment, irrigation seems not to be necessary. However, further studies are needed mainly in soils with lower water holding capacity and in dryer years which frequency are expected to increase in the near future as a consequence of the climate change.

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