Foi utilizada a reação em cadeia da polimerase via transcriptase reversa (RT-PCR) seguida por eletroforese capilar em microchip para avaliar a viabilidade de esporos de Alicyclobacillus acidoterrestris após a inativação com saponina e temperatura. O método demonstrou ser adequado para tal propósito, além de ser mais rápido e sensível que a tradicional técnica de plaqueamento usado como padrão na indústria de alimentos. Os limites de quantificação e detecção foram 0,0107 e 0,0039 ng µL-1 de DNA amplificado, respectivamente. O coeficiente de correlação (r) entre plaqueamento e o método desenvolvido foi 0,9977, o qual indica uma excelente correspondência entre eles. Assim, é possível avaliar com confiança a viabilidade da bactéria usando a reação de RT-PCR para detecção. Para avaliação do potencial deste método molecular sobre microbiologia tradicional na inativação de A. acidoterrestris foi utilizado saponina como agente de inativação, potencializado com temperatura.

It was used reverse-transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) followed by capillary electrophoresis on a microchip to probe the viability of Alicyclobacillus acidoterrestris spores after inactivation with saponin and heat. The method was shown to be suitable for the purpose, and was faster and more sensitive than the traditional plating technique, the standard of the food industry. The limits of quantification and detection were 0.0107 and 0.0039 ng µL-1 of amplified DNA, respectively. The correlation coefficient (r) between traditional plating and our method was 0.9977, which indicates an excellent correspondence between them. Consequently, it was possible to assess, with confidence, the viability of bacteria using the RT-PCR reaction for detection. It was evaluated the potential of this molecular method over traditional microbiology in the inactivation of A. acidoterrestris by saponin as an effective agent, potentiated by heat.

A presença de Brucella spp. entre animais silvestres pode influenciar a taxa de reprodução destes hospedeiros, além de atuarem como fonte de infecção natural para os animais domésticos e humanos. O objetivo deste estudo foi identificar a presença de Brucella spp. em 44 amostras de sangue de veado campeiro (Ozotoceros bezoarticus) do Pantanal do Sul-Mato-Grossense, utilizando a técnica de PCR. Observou-se que 20,4% (9/44) das amostras foram positivas. A sequência consenso de nucleotídeo obtida no sequenciamento do isolado de veado campeiro apresentou 514 pb e 95% de identidade com virB5 de B. abortus (best hits acesso nr AF226278, e-value 0.0), já na análise filogenética a amostra de Brucella isolada de veado campeiro apresentou-se muito próximo de B. suis. A alta porcentagem de amostras positivas sugere que a brucelose pode ser um problema entre os veados campeiros na área estudada e que estes animais podem representar riscos para outros animais domésticos e silvestres.

The presence of Brucella spp. in wild animals can influence their reproduction rate and may be a source of infection for domestic animals and humans. The objective of this study was to identify the presence of Brucella spp. in 44 blood samples from the deer Ozotoceros bezoarticus in the southern Pantanal of Sul-Mato-Grossense, using the PCR technique. It was seen that 20.4% (9/44) of the samples were positive. The consensus sequence was obtained by sequencing these samples, which then showed 514 pb and 95% of identity with gene virB5 of B. abortus (best hits accession nr AF226278, e-value 0.0). The phylogenetic analysis of the sample isolated from deer revealed the Brucella to be very close to B. suis. The high percentage of positive samples suggests that brucellosis may be a concern in deer within the studied area, and that these animals may poses a risk for other domestic and wild ones.