Objetivou-se estimar as herdabilidades para as características de carcaça de área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EG) e espessura de gordura subcutânea na garupa (EGP8), medidas por ultrassonografia, em bovinos da raça Nelore Mocho, criados em bioma Cerrado. As informações utilizadas foram provenientes de criatórios da raça Nelore Mocho, participantes do Programa Nelore Brasil, da Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP), localizados nos estados que representam as maiores áreas contínuas do bioma Cerrado. As estimativas de herdabilidade foram obtidas mediante análises bi-características, sob modelo animal, utilizando a estatística bayesiana por meio do aplicativo MTGSAM. As estimativas de herdabilidade foram de média magnitude para a AOL (0,25), EG (0,19) e EGP8 (0,25). Os resultados obtidos sugerem que as características de carcaça, avaliadas por ultrassonografia, apresentam grande variabilidade genética e podem ser incluídas em programas de melhoramento genético de bovinos da raça Nelore Mocho.

The purpose of this study was to estimate the genetic parameters for carcass traits of longissimus muscle area (LMA), backfat thickness (BF) and rump fat thickness (RF), measured by ultrasound in Polled Nelore cattle raised in the Cerrado biome. The data set was obtained from bovines Polled Nelore, proceeding from participant farms of the Nelore Brazil Program of the National Association of Breeders and Researchers, raised on pasture, from the Brazilian states that have the largest continuous areas of the Cerrado. Heritabilities were estimated by Gibbs Sampling using the MTGSAM software (Multiple Trait using Gibbs Sampler under Animal Model). The heritability estimates were 0.30, 0.17 and 0.25 for LMA, BF and RF, respectively. The results indicate that carcass traits have high genetic variability and should be included in breeding programs.

Objetivou-se analisar os inter-relacionamentos entre as variáveis, além de estimar as correlações genéticas entre os grupos de características de maciez (FC), crescimento (PI, PF e GPD) e carcaça (EG, P8 e AOL). Foi proposto também, identificar indivíduos que apresentem alta probabilidade de serem portadores de genes favoráveis à maciez. Analisou-se dados de 415 animais Nelore Mocho, filhos de touros representativos das principais linhagens Nelore, avaliados para características de crescimento, carcaça e maciez. Para análises de relacionamentos fenotípicos foram utilizadas análises de fatores e correlações canônicas. Os componentes de variância necessários à obtenção dos parâmetros genéticos foram estimados pelo método da Amostragem de Gibbs. Observou-se ausência de correlações fenotípicas entre FC e as outras características produtivas. As correlações genéticas entre FC e PI, PF, GPD, EG, P8 e AOL foram de baixa magnitude (-0,15; -0,18; -0,13; 0,10; -0,12 e 0,18). A seleção para a maciez não influenciará na seleção de outras características de interesse econômico e vice-versa, porém serão necessários mais estudos para melhor conhecimento sobre as relações genéticas da maciez e outras características produtivas em bovinos Nelore Mocho. A estimativa de herdabilidade para a característica FC foi de baixa magnitude (0,11 ± 0,022). Baseando-se no princípio da probabilidade de genes idênticos por descendência, identificou-se indivíduos com alta probabilidade de possuírem genes favoráveis à maciez. Posterior trabalho irá incluir a criação de uma população segregante a partir desses animais identificados, que irá servir como população experimental para posterior pesquisa de prospecção e identificação de genes para maciez da carne em bovinos Nelore Mocho.

The aim of the present study was to analyze the interrelationships among the variables and also estimate the genetic correlations between tenderness (WBSF), growth (ILW, FLW and ADG) and carcass (BF, RF and LMA) features. Other purpose was to identify individuals who were more likely to be carriers of favorable genes for tenderness. Growth, carcass and tenderness data from 415 Polled Nellore animals was analyzed. Factor analysis and canonical correlations were used to analyze the phenotypic relationships. The covariance components and genetic parameters were estimated using Gibbs Sampling method. Lack of phenotypical correlations between the WBSF and the other traits were observed. The genetic correlations between WBSF and the other evaluated traits were of a low magnitude, with values of -0.15; -0.18; -0.13; 0.10; -0.12 and 0.18, between WBSF and ILW, FLW, ADG, BF, RF and LMA, respectively. The results support the conclusion that tenderness selection will not affect the selection of other economic traits and vice-versa, but for a better knowledge of the genetic relationships between meat tenderness and other traits for Polled Nellore more studies are required. The heritability estimated for WBSF was of a low magnitude (0.11 ± 0.022). Based on the principle of probability of identical genes by ancestry individuals who were more likely to be carriers of favorable genes for tenderness were identified. Further work will include creation of a segregating population that will serve as experimental material for future gene prospecting and identification research.

Objetivou-se avaliar os efeitos das interações genótipo-ambiente sobre as estimativas de componentes de (co)variâncias e predição dos valores genéticos para o peso ao desmame de bovinos Nelore, sob enfoque bayesiano. Foram utilizados 16.644 registros de pesos ao desmame de bovinos provenientes de dez rebanhos participantes do Programa Nelore Brasil. Os parâmetros genéticos foram estimados sob modelo animal, considerando a estatística bayesiana. Para verificar o efeito da interação genótipo-ambiente, foram analisados os seguintes modelos matriciais: sem a inclusão dos efeitos de interação genótipo-ambiente; com a inclusão dos efeitos de interação genótipo-ambiente, em que se considerou o efeito de touro-ano, touro-rebanho e ambos os efeitos. De modo geral, verifica-se que a inclusão da interação genótipo-ambiente na análise genética para o peso ao desmame, tende a alterar as estimativas de (co)variâncias genéticas e ambientais. As correlações de Spearman entre os valores genéticos foram acima de 97%, indicando que, praticamente, não houve mudança na classificação dos animais avaliados. Pode se inferir que os efeitos de interação touro-ano e touro-rebanho não alteram as classificações dos animais, e a não-inclusão destes efeitos na avaliação genética, não afetam a seleção baseada nas predições dos valores genéticos para o peso ao desmame.

The objective was to evaluate the interactions of genotype-environment effects on the components of (co)variance estimates and the prediction of breeding values for weaning weight in Nelore cattle, using a Bayesian approach. Records of 16,644 weaning weights were used from cattle distributed in ten ranches across six Brazilian states. The genetic parameters were estimated under an animal model considering Bayesian statistics. To verify genotype-environment interaction effects, we analyzed the following matrix model: without the inclusion of genotype-environment interaction effects, and with the inclusion of genotype-environment interaction effects, which considered the effect of sire-year, sire-herd, and both effects. In general, the results suggest that the inclusion of genotype-environment interaction in genetic analysis for weight at weaning tends to alter the estimates of genetic and environment (co)variances. The Spearman correlations between the breeding values were above 97%, indicating practically no change in the classification of animals evaluated. It can be inferred that the interaction effects of sire-year and sire-herd do not change the animals rank, and if not included in the genetic evaluation, the selection based on predictions of breeding values for weaning weight will not be affected.

O objetivo neste estudo foi estimar as correlações genéticas entre escores visuais e características de carcaça medidas por ultrassonografia em bovinos da raça Nelore utilizando a estatística bayesiana por meio da Amostragem de Gibbs, sob modelo animal linear-limiar. Foram estudadas as características categóricas morfológicas de musculosidade, estrutura física, conformação e sacro, avaliadas aos 15 e 22 meses de idade. Para as características de carcaça, foram avaliadas as características área de olho-de-lombo, espessura de gordura subcutânea, espessura de gordura subcutânea na garupa e altura na garupa. Os escores visuais devem ser empregados como critérios de seleção para aumentar o progresso genético para a característica área de olhode-lombo e, consequentemente, melhorar o rendimento de carcaça. As estimativas de correlação genética obtidas para musculosidade com espessura de gordura subcutânea e espessura de gordura subcutânea na garupa indicaram que a seleção para musculosidade pode levar a animais com melhor acabamento de carcaça. A seleção para a estrutura física e conformação aos 15 e 22 meses de idade pode promover resposta correlacionada para o aumento da altura na garupa.

The objective of this study was to estimate the genetic correlations between visual scores and the carcass traits measured by ultrasound, in Nellore breed cattle, using the bayesian statistics by Gibbs Sampling, in the linear-threshold model. The morphological categorical traits of musculature, physical structure, conformation and sacrum were studied, evaluated at 15 and 22 months. The carcass traits of the longissimus muscle area, backfat thickness, rump fat thickness and hip height were evaluated. Visual scores should be used as selection criterion to increase genetic progress for the longissumus muscle area. The estimates of genetic correlations obtained between musculature and backfat thickness and rump fat thickness indicated that the selection for musculature may lead to animals with better carcass finishing. Selection for physical structure and conformation, at 15 and 22 months, should promote response correlated with the hip height.

Os objetivos neste estudo foram estimar parâmetros genéticos das características categóricas musculosidade, estrutura física, aspectos raciais, conformação, ônfalo, pigmentação e sacro e predizer os valores genéticos utilizando-se a estatística bayesiana sob modelo animal de limiar, considerando diferentes idades de bovinos da raça Nelore. As informações de escores visuais foram obtidas nos anos de 2000 a 2005 de bovinos provenientes de 13 fazendas participantes do Programa Nelore Brasil. Nas análises bicaracterísticas, foram utilizados 500.000 até 1.100.000 ciclos para alcançar a convergência da cadeia de Gibbs. O descarte inicial e o intervalo amostral foram de 100.000 e 1.000 ciclos, respectivamente. As características de escores visuais avaliadas aos 8 e 22 meses de idade apresentaram estimativas de herdabilidades moderadas, indicando resposta rápida à seleção direta. Os escores visuais indicaram possibilidade de resposta rápida à seleção direta e, portanto, devem ser incorporados em programas de melhoramento genético como critérios de seleção. As estimativas de correlações genéticas entre musculosidade, estrutura física e conformação também indicam que a seleção direta para uma destas características trará progresso genético às outras. Recomenda-se utilizar os escores visuais como critérios de seleção em pelo menos duas fases de vida do animal, na desmama e ao sobreano.

The objectives of this study were to estimate the genetic parameters of the following categorical traits: musculature, physical structure, racial breed aspects, conformation, navel, pigmentation and sacrum, and predict breeding values, using bayesian statistics under threshold animal models, considering different ages of cattle of the Nelore breed. The information concerning visual scores were obtained from 2000 to 2005 from cattle of the Nelore breed from thirteen participant farms of the Brazilian Nelore Program. In the two-trait analyses, 500,000 rounds up to 1,100,000 cycles were used to reach the convergence of the Gibbs chain. The burn-in and thinning interval were 100,000 and 1,000 cycles, respectively. The evaluated visual scores at the age of 8 and 22 months presented moderate heritability estimates, suggesting that these traits can be used to promote genetic gain by direct selection. The genetic correlations between the morphological traits of musculature, physical structure and conformation were moderate, indicating correlated responses between the traits. The use of the visual scores is recommended, as selection criteria, in at least two phases of the animal life, at weaning and yearling time.

The aim of this study was to estimate the components of variance and genetic parameters for the visual scores which constitute the Morphological Evaluation System (MES), such as body structure (S), precocity (P) and musculature (M) in Nellore beef-cattle at the weaning and yearling stages, by using threshold Bayesian models. The information used for this was gleaned from visual scores of 5,407 animals evaluated at the weaning and 2,649 at the yearling stages. The genetic parameters for visual score traits were estimated through two-trait analysis, using the threshold animal model, with Bayesian statistics methodology and MTGSAM (Multiple Trait Gibbs Sampler for Animal Models) threshold software. Heritability estimates for S, P and M were 0.68, 0.65 and 0.62 (at weaning) and 0.44, 0.38 and 0.32 (at the yearling stage), respectively. Heritability estimates for S, P and M were found to be high, and so it is expected that these traits should respond favorably to direct selection. The visual scores evaluated at the weaning and yearling stages might be used in the composition of new selection indexes, as they presented sufficient genetic variability to promote genetic progress in such morphological traits.

O objetivo deste trabalho foi comparar as estimativas de parâmetros genéticos obtidas em análises bayesianas uni-característica e bi-característica, em modelo animal linear e de limiar, considerando-se as características categóricas morfológicas de bovinos da raça Nelore. Os dados de musculosidade, estrutura física e conformação foram obtidos entre 2000 e 2005, em 3.864 animais de 13 fazendas participantes do Programa Nelore Brasil. Foram realizadas análises bayesianas uni e bi-características, em modelos de limiar e linear. De modo geral, os modelos de limiar e linear foram eficientes na estimação dos parâmetros genéticos para escores visuais em análises bayesianas uni-características. Nas análises bi-características, observou-se que: com utilização de dados contínuos e categóricos, o modelo de limiar proporcionou estimativas de correlação genética de maior magnitude do que aquelas do modelo linear; e com o uso de dados categóricos, as estimativas de herdabilidade foram semelhantes. A vantagem do modelo linear foi o menor tempo gasto no processamento das análises. Na avaliação genética de animais para escores visuais, o uso do modelo de limiar ou linear não influenciou a classificação dos animais, quanto aos valores genéticos preditos, o que indica que ambos os modelos podem ser utilizados em programas de melhoramento genético.

The objective of this work was to compare the estimates of genetic parameters obtained in single-trait and two-trait bayesian analyses, under linear and threshold animal models, considering categorical morphological traits of bovines of the Nelore breed. Data of musculature, physical structure and conformation were obtained between years 2000 and 2005, from 3,864 bovines of the Nelore breed from 13 participant farms of the Nelore Brazil Program. Single-trait and two-trait bayesian analyses were performed under linear and threshold animal models. In general, the linear and threshold models were efficient in estimating genetic parameters for visual scores under single-trait bayesian analyses. In the two-trait analyses, it was observed that: using continuous and categorical data, the threshold model provided greater estimates of genetic correlation than those of the linear model; with categorical data, the heritability estimates were similar. One major advantage of the linear models was its smaller requirements in the analyses processing time. In the genetic evaluation of animals for visual scores, the use of the linear or threshold model did not influence the classification of the animals, based on their predicted breeding values, which suggests that both models can be used in genetic improvement programs.

We used Gibbs sampling in single and two-trait animal models to estimate genetic parameters for some reproductive and related traits of Nellore cattle (Bos indicus). Female traits were age at first calving (AFC), cumulative productivity (CP) and adult weight (AW). For males, scrotal circumferences at 365 and 450 days of age were analyzed. Gibbs sampling using the ‘Multiple Trait using Gibbs Sampling under Animal Model’ (MTGSAM) program of Van Tassel and Van Vleck was used to estimate the (co)variance components of the traits and conduct genetic analyses. Heritabilities were AFC = 0.26, AW = 0.36 and CP = 0.25 under the single-trait animal model. The mean, mode and median estimates for genetic parameters obtained from the marginal posterior distributions were similar for all traits except AW, which presented lower values for the mode than the mean and median. However, the marginal posterior distributions for the traits studied presented a tendency toward normality. Favorable, but low, negative genetic correlations were found between male scrotal circumference and female age at first calving. The reproductive traits showed medium-magnitude heritabilities, which indicates that these traits should respond to selection and therefore should be included in genetic improvement programs.

The objective of this study was to estimate (co)variance components and genetic parameters for weights (W) and scrotal circumferences (SC) at 365 and 450 days of age, of Nelore (Bos indicus) cattle, using Bayesian inference in single and multiple-trait animal models. The fitted linear models included, besides the animal and residual random effects, the contemporary group (herd-year-season-sex-management group) and age-of-dam as "fixed effects". The analyses were carried out using a Gibbs sampler implemented through the MTGSAM program. The heritabilities (in parentheses) obtained fitting single-trait models were W365 (0.49), W450 (0.52), SC365 (0.68) and SC450 (0.66). Estimates of means, modes and medians for genetic parameters obtained from marginal posterior distributions were similar for all traits. The W365 and SC365 can be considered as suitable traits to be included as selection criteria in genetic improvement programs, not only because of their relatively high heritabilities but also due to the fact that they can be measured when the animals are relatively young compared to the corresponding traits W450 and SC450. The Bayesian approach appears to be an appropriate alternative for estimating genetic parameters, and has the advantage over point estimation methods of allowing inferences on marginal posterior distributions.