RESUMO A doença manchada de vinagreira causada por Corynespora cassiicola afeta a produção de cálice no México. O objetivo deste estudo foi avaliar vinte e dois genótipos de vinagreira contra C. cassiicola em casa de vegetação. Com base nas área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD) foi possível detectar genótipos suscetíveis, tolerantes e resistentes. Dada a incidência nas folhas, os genótipos suscetíveis foram Conpoz, Sudlaz, Morcot e Sudigua (valores de AACPD 7379,2 a 5891,7); tolerantes foram Conayu e Chinxal (AACPD 1341,6 e 1313,2). Enquanto isso, pela severidade nas folhas, os suscetíveis foram Sudigua, Conpoz e Morena2 (AACPD de 788,4 a 436,3); tolerantes foram Almatech, Crioxal, Rojatec e Conayu (37,7 a 28,76 de AACPD). Enquanto, avaliando a incidência em cálices, genótipos suscetíveis foram; Morena2, Morena, Conpoz, Descop e Chinayu (AACPD de 6572,1 a 2319,4); para a gravidade suscetível foram Morena2, Descop, Morena, Cabxal, Chinayu e Conpoz (AACPD de 3355,4 a 779,2). A incidência e severidade nos cálices detectaram genótipos resistentes, que foram Almatech, Criolaz2, Criocot, Criolaz, Rojatec, Criopoz, Crioxal, Chinxal e Conayu (0,0 de AACPD). Neste estudo, foram detectados genótipos tolerantes e resistentes à mancha foliar e cálice causada por C. cassiicola em vinagreira.

ABSTRACT Roselle spot caused by Corynespora cassiicola affects calyx production in Mexico. The aim of the present study was to evaluate twenty-two roselle genotypes against C. cassiicola under greenhouse conditions. The area under the disease progress curve (AUDPC) was used to detect susceptible, tolerant and resistant genotypes. Considering the incidence in leaves, susceptible genotypes were Conpoz, Sudlaz, Morcot and Sudigua (AUDPC values of 7379.2 to 5891.7); tolerant genotypes were Conayu and Chinxal (AUDPC 1341.6 and 1313.2). Based on the severity in leaves, susceptible genotypes were Sudigua, Conpoz and Morena2 (AUDPC from 788.4 to 436.3); tolerant genotypes were Almatech, Crioxal, Rojatec and Conayu (37.7 to 28.76 AUDPC). Assessment of the incidence in calyces indicated that susceptible genotypes were Morena2, Morena, Conpoz, Descop and Chinayu (AUDPC from 6572.1 to 2319.4); for the severity in calices, susceptible genotypes were Morena2, Descop, Morena, Cabxal, Chinayu and Conpoz (AUDPC from 3355.4 to 779.2). Incidence and severity on calyces evidenced resistant genotypes, which were Almatech, Criolaz2, Criocot, Criolaz, Rojatec, Criopoz, Crioxal, Chinxal and Conayu (0.0 AUDPC). In the present study, tolerant and resistant genotypes were detected to leaf and calyx spot caused by C. cassiicola in roselle.

Abstract. Since the start of the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) causing the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic, the concepts of serial and generation intervals have been used as key epidemiological measures to understand the transmission dynamics of the disease. We carefully examined and repurposed these concepts to the understanding of the transmission chain and dynamics of two major citrus diseases: tristeza virus (caused by Citrus tristeza virus, CTV) and Huanglongbing (caused by Candidatus Liberibacter asiaticus). Following the fundamental definition of the concepts, the review delineates the transmission chain in the SARS-CoV-2 and that of CTV and CLas, pointing out their major similarities and differences. Then, it discusses estimation of the serial and generation intervals and their distributions for both plant diseases. Identification of infector-infectee tree pairs in a transmission chain within orchards is proposed through use of disease incidence data from intensive mapping, spatial pattern analysis, conditional probability, and simulation approaches. Like in SARS-CoV-2 dynamics, pre-symptomatic transmission in these two plant pathosystems is of epidemiological significance. Hence, estimation of the serial and generation interval can lay the foundations to understanding of early disease transmission dynamics, thus the implementation of vector control measures or eradication of infected trees. We hope this review motivates discussions on estimation and usage of these concepts to enhance understanding of the epidemiology of both of the herein examined citrus diseases.

Resumen. Desde el inicio del síndrome respiratorio agudo grave del Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) responsable de la pandemia COVID-19, los conceptos de intervalo serial e intervalo de generación se han usado como medidas epidemiológicas clave para entender la dinámica de transmisión de la enfermedad. En esta revisión, estos conceptos se han examinado y reorientado al entendimiento de la cadena de transmisión y dinámica de dos enfermedades importantes de los cítricos: la tristeza de los cítricos (causada por Citrus tristeza virus, CTV) y el Huanglongbing (causado por Candidatus Liberibaster asiaticus). Basados en la definición fundamental de los conceptos, la revisión define la cadena de transmisión del SARS-CoV-2 y del CTV y CLas, señalando sus mayores diferencias y similitudes. Posteriormente, la revisión discute el cálculo de los intervalos y sus distribuciones para ambas enfermedades. La identificación de pares de árboles infector-infectado en una cadena de transmisión dentro de huertos se propone a través del uso de datos de incidencia de enfermedad de mapeos intensivos, análisis de patrón espacial, probabilidad condicional y métodos de simulación. Al igual que en la dinámica del SARS-CoV-2, la transmisión pre-sintomática en estos dos patosistemas es de significancia epidemiológica. De ahí que el cálculo del intervalo serial y de generación puede ayudar a sentar las bases para el entendimiento de la dinámica de transmisión temprana, y con ello, la implementación de medidas de control del vector o la erradicación de árboles enfermos. Se espera que esta revisión motive discusiones sobre el cálculo y uso de estos conceptos para mejorar el entendimiento de la epidemiología de las enfermedades examinadas en este trabajo.

Abstract The citrus tristeza virus (CTV) is a pathogen present in almost all citrus areas. It reduces production in plantations with susceptible rootstocks, such as sour orange trees. The aim of this study was to temporally characterize the behavior of CTV considering its population structure (PS), vigor, concentration in tissues and availability of vectors, this on the basis of an analysis of the thermal conditions in Yucatán. In two sweet orange (C. sinensis) orchards in Yucatán, trees grafted onto sour orange (C. aurantium) were sampled and evaluated in terms of vigor for 12 years. Samples were analyzed by immunoprinting, single-strand conformation polymorphism (SSCP), and specific amplifications by real-time and conventional polymerase chain reaction (PCR). The incidence of CTV increased 40 % in four years. All samples analyzed (81) were negative for severe isolates; only T-30 isolates and minor changes in tree vigor were identified. The PS indicated changes with a tendency towards complexity (11 electrophoretic patterns in six haplotypes), a similarity coefficient of 0.80 and intrapopulation diversity of 65 %. The thermal regime (TR) was restrictive during 75 % of the year for CTV transmission and the optimum development of vector aphids. Pathogen PS and TR have contributed to the fact severe CTV epidemics have not been recorded; therefore, sour orange continues as a key element in the region’s citrus production despite the risk involved (commercializing propagating material that does not comply with NOM 079-FITO-2002).

Resumen El virus de la tristeza de los cítricos (CTV) es un patógeno presente en casi todas las áreas citrícolas; el cual, reduce la producción en plantaciones con portainjertos susceptibles, como el naranjo agrio. El objetivo de este estudio fue caracterizar temporalmente el comportamiento del CTV considerando su estructura poblacional (EP), vigor, concentración en tejidos y disponibilidad de vectores. Esto último a partir del análisis de las condiciones térmicas en Yucatán. Se muestrearon y evaluaron en vigor durante 12 años los árboles de dos huertas de naranjo dulce (C. sinensis), injertados en agrio (C. aurantium) en Yucatán. Las muestras se analizaron por inmunoimpresión, polimorfismo de conformación de cadena simple (SSCP) y amplificaciones específicas por la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) en punto final y tiempo real. La incidencia de CTV se incrementó 40 % en cuatro años. Todas las muestras analizadas (81) fueron negativas para aislados severos; solo se identificaron aislados tipo T-30 y cambios menores en el vigor de los árboles. La EP indicó cambios con tendencia a la complejidad (11 patrones electroforéticos en seis haplotipos), coeficiente de similaridad de 0.80 y diversidad intrapoblacional de 65 %. El régimen térmico (RT) fue restrictivo durante 75 % del año para la transmisión del CTV y el desarrollo óptimo de áfidos vectores. La EP del patógeno y el RT han contribuido a que no se registren epidemias severas de CTV; por lo cual, el naranjo agrio continúa como un elemento clave en la producción citrícola de la región con el riesgo que esto implica (comercializar material propagativo que no cumple la NOM 079-FITO-2002).

The aim of this study was to estimate yield losses induced by the agent associated with Huanglongbing, Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas) in Persian lime (Citrus latifoliaTanaka) in Mexico, by evaluating morphological and organoleptic fruit variables. A four-year old Persian lime orchard in the state of Yucatán, Mexico, was selected; the trees were under same disease management and infection; this feature was verified by qPCR. The study was conducted under four severity levels (0=healthy, 1=25, 2=50, 3=75, 4=100, percentage of canopy with HLB symptoms). Eight morphological and organoleptic variables were evaluated in a restricted random block design with healthy and CLas infected trees. The values of weight, size, skin thickness, juice volume (JV) and pH were statistically higher in fruits from healthy trees as well as in asymptomatic branches of positive trees, in comparison with symptomatic branches (Tukey, P=0.05). CLas induced reduction on weight (17.3 %) and JV (18.6 %), with more damage in trees showing 100 % of canopy with HLB symptoms; the regression models were: Yweight= 217.2-4.2x+0.03x2, R2= 0.86; Yvolume= 645.4-11.7x+0.09x2, R2= 0.82. The weight reduction implicate a 2.4 tons/ha yield loss. The detrimental effect was associated with severity level and CLas concentration, we found that the intensity of the symptoms of HLB is a function of the bacterial concentration in the model Y[bacteria] = 1.174+0.8x-0.0067x2, R2= 0.91. This is the first quantitative study of CLas effects on production of Persian lime.

El objetivo de este estudio fue estimar pérdidas productivas inducidas por el agente asociado al Huanglongbing, Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas) en limón persa (Citrus latifolia Tanaka) en México, mediante la evaluación de variables morfológicas y organolépticas en frutos. En el estado de Yucatán, México, se seleccionó una huerta de limón persa de cuatro años, con árboles bajo un mismo manejo e infección, esta característica se verificó por PCR cuantitativo. El estudio se condujo bajo cuatro niveles de severidad (0=sano, 1=25, 2=50, 3=75 y 4=100, porcentaje de síntomas de HLB en dosel). Se evaluaron ocho variables morfológicas y organolépticas en un diseño de bloques con tratamientos apareados. Los valores de peso, tamaño, grosor de cáscara, volumen de jugo (VJ) y pH fueron estadísticamente mayores en frutos de árboles sanos y en ramas asintomáticas de árboles positivos, en comparación con los frutos de ramas sintomáticas (Tukey, P=0.05). CLas indujo reducción en peso (17.3 %) y VJ (18.6%), con mayor daño en árboles con 100 % de síntomas de HLB en dosel; los modelos de regresión fueron: Ypeso=217.2-4.2x+0.03x2, R2=0.86; YVJ= 645.4-11.7x+0.09x2, R2=0.82. La reducción en peso implicó una pérdida en producción de 2.4 toneladas/ha. El efecto perjudicial se asoció al nivel de severidad y concentración de CLas, ya que se detectó que la intensidad de los síntomas de HLB están en función de la concentración bacteriana mediante el modelo Y[bacteria]=1.17+0.77x-0.0067x2, R2=0.91. El presente documento constituye el primer estudio cuantitativo del efecto de CLas en la producción de limón persa.