Resumo Phytophthora cinnamomi é um Oomiceta diploide que vive no solo e é o causador da morte de inúmeras plantas em todo o mundo. Em Portugal a produção de castanheiro europeu encontra-se sobretudo na região norte onde mais de 80% está concentrada principalmente na região de Trás-os-Montes, tornando-se uma fonte económica muito valiosa para a região. A doença da tinta do castanheiro europeu é uma patologia causada principalmente por P. cinnamomi e representa uma ameaça para a preservação do castanheiro europeu (Castanea sativa Miller). O principal objetivo deste trabalho é a identificação de genes que expressam proteínas relacionadas com o metabolismo fundamental de P. cinnamomi, através da utilização de ferramentas bioinformáticas. O genoma deste microrganismo encontra-se depositado na base de dados biológicos NCBI (National Center for Biotechnology Information) e através das sequências desse genoma foram identificadas as ORFs (open reading frames - fases de leitura aberta) que codifiquem para proteínas associadas ao metabolismo fundamental. Com ferramentas bioinformáticas conseguimos ainda predizer a localização subcelular, a estrutura tridimensional, as características físico-químicas e a caracterização dos domínios dessas proteínas.

Abstract Phytophthora cinnamomi is a diploid Oomycete that lives in the soil and is the cause of the death of countless plants worldwide. In Portugal the production of European chestnut is found mainly in the northern region where more than 80% is concentrated mainly in the region of Trás-os-Montes, making it a very valuable economic source for the region. European chestnut ink disease is a pathology caused mainly by P. cinnamomi and poses a threat to the preservation of chestnut (Castanea sativa Miller). The main objective of this work is the identification of genes that express proteins related to the fundamental metabolism of P. cinnamomi, using bioinformatics tools. The genome of this microorganism is deposited in the biological database NCBI (National Center for Biotechnology Information) and through the sequences of this genome, ORFs (open reading frames) that code for proteins associated with fundamental metabolism were identified. With bioinformatics tools we can also predict the subcellular location, the three-dimensional structure, the physical-chemical characteristics and the characterization of the domains of these proteins.

Resumo O objetivo deste trabalho foi estudar as possibilidades tecnológicas de produção de extrudidos à base de farinha de castanha. Usou-se uma extrusora de parafuso único. Numa primeira etapa (teste A), testaram-se diferentes proporções de mistura de farinha de castanha e de milho, e, nas diferentes misturas foram ensaiados o teor de humidade e a temperatura de processamento. Avaliaram-se os produtos extrudidos quanto à taxa de expansão, quanto ao perfil de viscosidades obtido com o amilógrafo e quanto à textura estimada pelos parâmetros força e energia de rutura recorrendo a um texturómetro. Numa segunda etapa (teste B), fixou-se a composição de 100% de farinha de castanha, e testou-se a velocidade do parafuso. Os extrudidos obtidos foram avaliados como foi referido anteriormente. O delineamento experimental considerou assim três fatores (X1- humidade inicial das misturas, X2- temperatura de processamento e X3- incorporação de farinha de castanha no teste A ou velocidade do parafuso no teste B), com cinco níveis por fator e seis repetições para o ponto central. A farinha de castanha crua apresentou uma temperatura de gelatinização relativamente baixa (59 °C) e originou pastas de viscosidade elevada. O seu amido apresentou uma concentração de amilose de 43%, caracterizando-se por uma relação amilose/amilopectina de 0,75, a qual é superior à da maioria dos amidos dos cereais. O comportamento amilográfico das misturas e as características de textura dos extrudidos mostraram que a farinha de castanha tem potencial para ser utilizada como ingrediente na formulação de alimentos cozidos extrudidos. A análise sensorial revelou significativa aceitabilidade pelos elementos do painel para produtos processados a baixa humidade e temperatura intermédia.

Abstract The objective of this work was to study the technological possibilities of producing extrudates based on chestnut flour. A single screw extruder was used. In a first step (test A), different mix ratios of chestnut and corn flours were analysed. The moisture content and the processing temperature were tested in the different mixtures. The extruded products were evaluated for the expansion rate, the viscosity profile obtained with amilograph and the texture estimated by the parameters breaking strength and energy using a texturometer. In a second step (test B), the composition of 100% chestnut flour was fixed and the screw speed was tested. The obtained extrudates were evaluated as previously mentioned. The experimental design thus considered three factors (X1- moisture content of the mixtures, X2- processing temperature and X3 - incorporation of chestnut flour in test A or screw speed in test B), with five levels per factor and six repetitions for the central point. Raw chestnut flour had a relatively low gelatinization temperature (59 °C) and gave pastes with high viscosity. Its starch had an amylose content of 43%, characterized by an amylose / amylopectin ratio of 0.75, which is higher than most of the cereal starches. The amylographic behavior of the mixtures and the texture characteristics of the extrudates showed that chestnut flour has potential to be used as an ingredient in the formulation of extruded cooked foods. Sensory analysis revealed significant acceptability by the panel elements for products processed at low moisture content and intermediate temperature.

Phytophthora cinnamomié um patógeno do solo que possui uma ampla gama de hospedeiros em diversos países de diferentes climas. Esse fungo é responsável pela doença da tinta do castanheiro europeu (Castanea sativaMiller) e conduz à morte da árvore. Portugal se destaca na produção do castanheiro europeu. Entretanto, entre 2002 e 2004, houve uma redução de 27.3% na área de distribuição dessa área devido ao P. cinnamomi. O objetivo deste trabalho foi identificar fatores moleculares possivelmente associados à patogenicidade do fungo através de sequências genômicas depositadas no NCBI utilizando ferramentas de bioinformática. O primeiro contig foi utilizado e as ORFs presentes nas sequências foram identificadas. Foi utilizado o smartBlast em busca de proteínas homólogas. A predição da localização celular das proteínas foi feita através de quatro ferramentas: SignalP 4.1, Cello v.2.5, LOCTree3, Euk-mPLoc 2.0. A caracterização dos domínios dos produtos foi realizada utilizando o PROSITE e a predição das estruturas foi realizada utilizando o servidor Phyre2. Foram encontradas 13 proteínas provavelmente associadas com a patogenicidade de P. cinnamomie as suas propriedades relacionadas com a infecção foram analisadas in silico.Esses resultados são importantes uma vez que são uma primeira etapa na busca por fatores patogênicos.

Phytophthora cinnamomiis soil pathogen that has a wide range of hosts in several countries and different climates. This fungus is responsible for the chestnut ink disease (Castanea sativaMiller) and death of the tree. Portugal stands out in the production of the European chestnut tree. However, between 2002 and 2004, there was a decrease of 27.3% in the distribution area of this tree due to P. cinnamomi. The aim of this study was to identify molecular factors possibly associated with the fungal pathogenicity through genomic sequences deposited at NCBI using bioinformatics tools. The first contig was used and the OFRs present in de sequences were identified. SmartBlast was used for homologous proteins. The prediction of cellular localization prediction of proteins was performed using four different tools: SignalP 4.1, Cello v.2.5, LOCTree3, Euk-mPLoc 2.0. Protein domains characterization was accomplished using PROSITE and the structure prediction was performed using Phyre2 server. We found 13 proteins probably associated with the pathogenicity of P. cinnamomi and its properties related to the infection were analyzed in silico.These results are important since they are a first step in the search for pathogenic factors.

O objetivo deste trabalho é avaliar o potencial nutricional e de saúde da castanha doce europeia, sendo grande parte dos resultados apresentados fruto de pesquisa bibliográfica. A castanha é um fruto suave e doce que já desempenhou um papel importante na alimentação de muitas regiões europeias continuando a ser um fruto muito popular. Análises clássicas foram usadas para determinar a composição química e nutricional da castanha europeia. Já para a determinação do teor de amido, utilizou-se o método polarimétrico de Lintner. A amilose/amilopectina do amido foram determinadas por cromatografia de filtração em gel, sendo posteriormente calculada a sua relação. Dos valores para a composição química da castanha, pesquisados na bibliografia, são de realçar os valores de vitamina C e a abundância de sais minerais. Também é importante o valor de amido e neste a razão amilose/amilopectina, quando comparado com a mesma proporção na maioria dos cereais. A relação amilose/amilopectina do amido de castanha-europeia pode ajudar-nos a explicar muitas das suas propriedades nutricionais benéficas e pode revelar-se de grande importância no uso industrial da castanha. Devido às suas características químicas e nutricionais, a castanha europeia é um alimento recomendado especialmente para pacientes com colesterol alto, diabéticos e pacientes que sofrem de doença celíaca, uma vez que a castanha não tem glúten.

Chestnut is a crisp, sweet soft fruit that has already played an important role in the feeding of many European regions and is still a very popular fruit. Classical analyzes were used to determine the chemical and nutritional composition of European sweet chestnut. Already, for the determination of the starch content, we use the Lintner polarimetric method. However, the amylose/amylopectin ratio of the starch was measured by gel filtration chromatography. The values for the chemical composition of sweet chestnut were found very interesting, particularly, the values of vitamin C such as the abundance of mineral salts. Were also surprising the starch value and in this the amylose/amylopectin ratio, when compared with the same ratio in most cereals. The amylose/amylopectin ratio of European sweet chestnut starch may help us to explain many of its beneficial nutritional properties and may prove to be of great importance in the industrial use of chestnut. Due to the chemical and nutritional characteristics, European sweet chestnut is a recommended food, especially for patients with high cholesterol, diabetics, and patients suffering from celiac disease, since the chestnut does not have gluten. The aim of this work is to evaluate the nutritional and health potential of sweet chestnut being a great part of the results presented the fruit of bibliographical research.

Os oomicetas causam enormes perdas na agricultura e degradação generalizada em áreas de crescimento natural, sendo responsáveis pela morte de milhares de árvores por ano. Duas das espécies representativas de oomicetas são Phytophthora infestans, que provoca o míldio da batateira, e Phytophthora cinnamomi, que causa a doença da tinta do castanheiro, responsável por perdas de produção de castanha na Europa. Os esforços de sequenciação de genomas de oomicetas têm estado focados no estudo de três espécies: P. infestans, P. sojae e P. ramorum. Phytophthora infestans foi considerada como espécie modelo para o género, pois possui excelentes recursos genéticos e de genómica, incluindo mapas genéticos, bibliotecas BAC, e sequências de EST. Esta equipa de investigadores procura sequenciar o genoma de P. cinnamomi, a fim de obter uma melhor compreensão deste oomiceta, para estudar mudanças nas relações planta-patogénio, incluindo as resultantes das alterações climáticas, e tentando diminuir o impacto do patogénio nas culturas e plantas em ecossistemas naturais em todo o mundo. É apresentada uma abordagem preliminar do DNA genómico parcialmente sequenciado a partir de P. cinnamomi, o qual codifica possíveis sequências de proteínas e tRNAs. As análises em bases de dados revelam a presença de genes conservados em oomicetas.

Members of the oomycete cause extensive losses in agriculture and widespread degradation in natural plant communities, being responsible for the death of thousands of trees every year. Two of the representative species are Phytophthora infestans, which causes late blight of potato, and Phytophthora cinnamomi, which causes chestnut ink disease, responsible for losses on sweet chestnut production in Europe. Genome sequencing efforts have been focused on the study of three species: P. infestans, P. sojae and P. ramorum. Phytophthora infestans has been developed as the model specie for the genus, possessing excellent genetic and genomics resources including genetic maps, BAC libraries, and EST sequences. Our research team is trying to sequence the genome of P. cinnamomi in order to gain a better understanding of this oomycete, to study changes in plant-pathogen relationships including those resulting from climate change and trying to decrease the pathogen’s impact on crops and plants in natural ecosystems worldwide. We present here a preliminary report of partially sequenced genomic DNA from P. cinnamomi encoding putative protein-coding sequences and tRNAs. Database analysis reveals the presence of genes conserved in oomycetes.

A extrusão de alimentos envolve transformações moleculares complexas que permitem grande diversidade nos produtos extrudidos existentes e nas suas propriedades físicas, químicas, sensoriais e nutricionais. Neste artigo são apresentadas aplicações atuais da extrusão na indústria alimentar, assim como as características dos produtos extrudidos e descrevem-se as interações entre os parâmetros que as influenciam. Por fim, são ainda apresentadas as tendências que se têm vindo a impor na formulação dos produtos extrudidos.

Food extrusion involves complex molecular transformations that allow diversity in the existing extruded products and in their physical, chemical, sensory and nutritional properties. In this article, current applications of extrusion in food industry are presented, as well as the characteristics of the extruded products; it also describes the interactions between the relevant parameters involved in this particular food processing operation. Finally, future trends in the extruded products formulation are presented.

A extrusão é uma etapa do processamento industrial de matérias-primas sólidas, a qual junta várias operações e processos num único equipamento, denominado extrusora ou extrusor. A extrusão apresenta várias vantagens na indústria alimentar, em termos operacionais e tecnológicos, pelo que o seu uso tem vindo a aumentar. Neste trabalho são apresentados os diferentes tipos de extrusão empregues na área alimentar, a sua classificação e respetivos equipamentos, assim como o seu modo de funcionamento, as suas vantagens e os parâmetros mais importantes para a sua regulação.

Extrusion is a step in the industrial processing of bulk solid materials, which joins various operations and processes on single equipment, called the extruder. The extrusion has several advantages in the food industry, in operational and technological terms, so their use has been increasing. In this paper the different kinds of extrusion used in the food area, their classification and their respective equipment, as well as its mode of operation, its advantages and the most important parameters for its regulation are presented.

Doença da tinta é um das doenças mais destrutivas em Castanea sativa. Os sintomas mais comuns são necroses e uma redução em crescimento da raiz que invariavelmente leva à morte das plantas. Phytophthora cinnamomi é o oomycete associado a esta doença cujo ciclo de vida acontece integralmente no solo. Foi obtido um fragmento com 1231pb do gene glucan endo-1,3-β-D-glucosidase por amplificação usando oligonucleotidos conservados e a sequência completa do gene foi obtido flanqueando esta sequência conhecida por PCR assimétrico. Este fragmento foi obtido de ADN genómico de Phytophthora cinnamomi isolado por nós nas Regiões Europeias de Castilla-Léon (Espanha) e Trás-os-Montes (Portugal) e associado à doença da tinta da Castanea sativa Mill.

Ink disease is one of the most destructive diseases in Castanea sativa. The most common symptoms are root necrosies and a reduction in root growth, which invariably lead to the death of the trees. Phytophthora cinnamomi is an oomycete associated with this disease whose life cycle develops integrally in the soil. In the present work, was a fragment with 1231bp of the glucan endo-1,3-β-D-glucosidase gene obtained by amplification, using conserved primers and the full-length gene sequence by flanking this known sequence by asymmetric PCR. This fragment was obtained from genomic DNA of Phytophthora cinnamomi isolated in the European Regions of Castilla-Leon (Spain) and Trás-os-Montes (Portugal) and associated with the ink disease of Castanea sativa Mill.