Resumen El declinamiento y muerte de palmeras (Phoenix canariensis) en la Ciudad de México ha aumentado en los últimos cinco años hasta alcanzar la muerte de más de 500 palmeras y otras más con diferentes grados de daño. El o los agentes causales no han sido determinados, por lo que el presente estudio tuvo como objetivo identificar los hongos asociados al declinamiento y muerte de palmeras (Phoenix canariensis) en la Ciudad de México. Muestras de tejido vegetal sintomático del tronco, peciolo, raquis y foliolos, fueron colectadas en nueve sitios de muestreo representativos, en siete Alcaldías de la Ciudad de México, de febrero a agosto de 2022. Se obtuvieron 144 aislados de hongos que comprendieron 11 especies. Las especies identificadas con mayor frecuencia fueron Nalanthamala vermoesenii, Lasiodiplodia sp., Neopestalotiopsis sp., y Serenomyces sp., presentes principalmente en peciolo y raquis; y Alternaria alternata y Phoma glomerata en foliolos, dichas especies han sido reportadas como agentes causales de enfermedades en palmeras en otros países y reportadas por primera vez en México asociadas a P. canariensis. La información generada permitirá establecer medidas de manejo tendientes a reducir la muerte de palmeras.

Abstract. The decline and death of palms (Phoenix canariensis) in Mexico City is a problem that has increased in the last five years, causing the death of more than 500 palms and others with different degrees of damage. The causal agent has not been determined, so the present study aimed to identify the associated fungi of the decline and death of palms (Phoenix canariensis) in Mexico City. From February to August 2022, samples of symptomatic plant tissue from the trunk, petiole, rachis, and leaflets were collected at nine representative sampling sites in seven Boroughs of Mexico City. A total of 144 fungal isolates were obtained, comprising 11 different species. The species with the highest frequency were: Nalanthamala vermoesenii, Lasiodiplodia sp., Neopestalotiopsis sp., and Serenomyces sp., present mainly on the petiole and rachis; and Alternaria alternata and Phoma glomerata in the leaflets, these species have been reported as causative agents of different diseases in other countries and are reported for the first time in Mexico associated with P. canariensis. The information generated will allow establishing management measures tending to reduce the death of palms.

Resumen Los esclerocios de algunos hongos albergan bacterias nativas para el control biológico de hongos fitopatógenos. Los objetivos de esta investigación fueron: i) explorar poblaciones bacterianas asociadas a esclerocios de Claviceps gigantea en maíces de seis localidades del Estado de México, ii) evaluar el antagonismo in vitro de estas poblaciones bacterianas contra tres especies de Fusarium fitopatógenos de maíz, iii) identificar molecularmente los antagonistas más eficientes y caracterizar la producción de metabolitos in vitro. Poblaciones bacterianas en los esclerocios se calcularon por conteo directo en placa; el antagonismo in vitro contra Fusarium graminearum, F. sublgutinans y F. verticillioides se evaluó por confrontación en medio Waksman agar. Las bacterias antagonistas se identificaron por secuenciación parcial del gen 16S rRNA y se evaluaron in vitro para la producción de ácido indol-3-acético, sideróforos, actividad lipolítica, proteolítica y solubilización de fosfato mineral. La densidad bacteriana estuvo entre 2.023 a 2.397 Log10UFC g-1 de esclerocio. Veintidos cepas mostraron antagonismo in vitro contra al menos una especie de Fusarium. Se identificaron como miembros de los géneros Bacillus, Delftia, Micromonospora, Pseudomonas, Sphingobacterium, Staphylococcus y Stenotrophomonas. Los 22 antagonistas mostraron in vitro actividad lipolítica, proteolítica, produjeron sideróforos y solubilizaron fosfato; únicamente 12 (55%) produjeron ácido indol-3-acético. Las cepas Bacillus subtilis (BA1), Pseudomonas syringae (BA2) y Bacillus amyloliquefaciens (BA18) fueron antagonistas contra las tres especies de Fusarium y produjeron todos los metabolitos evaluados.

Abstract Fungal sclerotia house native bacterial populations of interest for biological control of plant pathogenic fungi. The objectives of this research were: i) to explore the bacterial populations associated with Claviceps gigantea sclerotia in maize from six locations in the State of Mexico, ii) to evaluate the in vitro antagonism of these bacterial populations against three species of Fusarium phytopathogens of maize, iii) to molecularly identify the more efficient antagonists and characterize the in vitro production of metabolites. Bacterial populations in the sclerotia were calculated by direct plate count; in vitro antagonism against Fusarium graminearum, F. sublgutinans, and F. verticillioides was evaluated by confrontation in Waksman agar medium. Antagonistic bacteria were identified by partial sequencing of 16S rRNA gene and evaluated in vitro for the production of indole-3 acetic acid, siderophores, lipolytic and proteolytic activity, and mineral phosphate solubilization. The bacterial density ranged from 2.023 to 2.397 Log10UFC g-1 of sclerotia. Twenty-two strains showed in vitro antagonism against at least one Fusarium species and were identified as members of the genera Bacillus, Delftia, Micromonospora, Pseudomonas, Sphingobacterium, Staphylococcus, and Stenotrophomonas. The 22 antagonists showed in vitro lipolytic, proteolytic, siderophore-producing and phosphate-solubilizing activity; only 12 (55%) produced indole-3-acetic acid. Bacillus subtilis (BA1), Pseudomonas syringae (BA2), and Bacillus amyloliquefaciens (BA18) strains were antagonists against the three Fusarium species and produced all the metabolites evaluated.

Abstract Fluorescent Pseudomonas and Bacillus spp. are among the bacteria with the greatest potential for the biological control of plant diseases. The objectives of this research were: i) to identify fluorescent Pseudomonas and Bacillus species from the rhizosphere of wild agaves antagonists of pectinolytic bacteria, and ii) to detect the presence of genes for the biosynthesis of antimicrobial lipopeptides (AMPs) in the antagonist strains. The in vitro antagonist efficiency index (IEA) of 109 strains of fluorescent Pseudomonas and 119 of Bacillus spp. isolated from the rhizosphere of wild agaves against five pectinolytic bacterial strains of the genera Pectobacterium and Dickeya were evaluated. By PCR, antagonistic bacteria were identified by sequencing the 16S rRNA gene and AMPs genes: fenD (fengicin), ituC (iturin), srfAA (surfactin), and bmy (bacillomycin) for Bacillus spp., prnD (pyrrolnitrin), and phlD (2,4-diacetiylphloroglucinol) for fluorescent Pseudomonas were detected with specific primers. The in vitro IEA resulted in the selection of 25 antagonist strains against one or more pectinolytic bacteria. Comparison of the 16S rRNA gene sequences identified 11 (44%) strains in the Bacillus genus and 14 (56%) in Pseudomonas with similarities between 97 and 100%. Among the Bacillus and Pseudomonas species, most harbored between two to four AMPs genes. The ItuC, srfAA, and phlD genes were more frequent in all antagonist strains; all the genes evaluated were detected in the Bacillus subtilis (9B14) and Pseudomonas fluorescens (G3, D4, and H6) strains.

Resumen Pseudomonas fluorescentes y Bacillus spp. se encuentran entre las bacterias con mayor potencial para el control biológico de enfermedades en plantas. Los objetivos de esta investigación fueron: i) identificar especies de Pseudomonas fluorescentes y Bacillus de la rizósfera de agaves silvestres antagonistas de bacterias pectinolíticas, y ii) detectar la presencia de genes para la biosíntesis de lipopéptidos antimicrobianos (AMPs) en las cepas antagonistas. Se evaluó el índice de eficiencia antagonista (IEA) in vitro de 109 cepas de Pseudomonas fluorescentes y 119 de Bacillus spp. aisladas de la rizósfera de agaves silvestre contra cinco cepas bacterianas pectinolíticas de los géneros Pectobacterium y Dickeya. Por PCR, las bacterias antagonistas se identificaron por secuenciación del gen 16S rRNA y se detectaron los genes AMPs: fenD (fengicina), ituC (iturina), srfAA (surfactina), y bmy (bacilomicina) para Bacillus spp.; prnD (pirrolnitrina) y phlD (2,4 diacetilfloroglucinol) para Pseudomonas fluorescentes con iniciadores específicos. Los resultados del IEA in vitro resultó en la selección de 25 cepas antagonistas contra una o más bacterias pectinolítcas. La comparación de las secuencias del gen 16S rRNA identificaron 11 (44%) cepas en el género Bacillus y 14 (56%) en Pseudomonas con similitud entre el 97 y 100%. Entre las especies de Bacillus y Pseudomonas, la mayoría albergó entre dos a cuatro genes AMPs. Los genes ItuC, srfAA y phlD fueron de mayor frecuencia en todas las cepas antagonistas; en las cepas Bacillus subtilis (9B14) y Pseudomonas fluorescens (G3, D4 y H6) se detectaron todos los genes evaluados.

RESUMO O virus do tomate rugoso marrom (tomato brown rugose fruit virus - ToBRFV) é um vírus emergente que ameaça a produção de tomate e pimenta em diferentes países. Este trabalho teve como objetivo avaliar o efeito da infecção do ToBRFV na morfologia vegetal e na qualidade do fruto em oito variedades de pimenta malagueta e propor uma escala diagramatica para avaliar a severidade em folhas infectadas considerando a porcentagem de área foliar afetada. Dezesseis tratamentos foram testados, que incluíram oito variedades de pimentão e duas condições experimentais (inoculadas e não inoculadas). Cinco dias após o transplante, plantas de cada variedade de pimenta foram inoculadas mecanicamente com ToBRFV e as variáveis morfológicas e de qualidade dos frutos foram avaliadas. A comparação das médias de cada variedade inoculada versus não inoculada foi realizada com o teste t de Student (P ≤ 0,05) para grupos independentes. O ToBRFV infectou todas as variedades inoculadas causando lesões necróticas locais, clorose, mosaico, mosqueamento, necrose do caule, ampulação, deformação, enrolamento e necrose da folha; da mesma forma, foram observadas plantas assintomáticas. O ToBRFV afetou significativamente a altura, número de entrenós, número de flores, peso fresco da raiz, peso médio do fruto, número de sementes e diâmetro polar-equatorial do fruto. A variedade de pimenta habanero apresentou a menor severidade da doença, enquanto a maior severidade foi observada na variedade de pimenta serrano ‘Tampiqueño’.

ABSTRACT Tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV) is an emerging virus that threatens tomato and chili production worldwide. The objective of this work was to evaluate the effect of ToBRFV infection on plant morphology and fruit quality in eight varieties of pepper and to propose a diagrammatic scale to evaluate severity in infected leaves considering the percentage of affected leaf area. Sixteen treatments were tested, consisting in eight varieties of chili and two experimental conditions (inoculated and non-inoculated). Five days after transplanting, each chili variety was mechanically inoculated with ToBRFV and morphological and fruit quality variables were evaluated. The comparison of means of each inoculated versus non-inoculated variety was performed with the t-Student test (P ≤ 0.05) for independent groups. ToBRFV infected all inoculated plants causing local necrotic lesions, chlorosis, mosaic, mottling, stem necrosis, ampulation, deformation, rolling and leaf necrosis depending of the variety; likewise, asymptomatic plants were observed. ToBRFV significantly affected height, number of internodes, number of flowers, fresh root weight, average fruit weight, number of seeds, and polar-equatorial diameter of the fruit. The habanero chili showed the least severity, while the highest severity was shown in the serrano chili ‘Tampiqueño’.

RESUMEN El Tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV) es un virus emergente que amenaza la producción de tomate y chile en todo el mundo. Esta investigación tuvo como objetivo evaluar el efecto de la infección del ToBRFV en la morfología de la planta y calidad de frutos en ocho variedades de chile y proponer una escala diagramática para evaluar la severidad en hojas infectadas considerando el porcentaje de área foliar afectada. Se probaron 16 tratamientos, que incluyeron ocho variedades de chile y dos condiciones experimentales (inoculado y no inoculado). Cinco días después del trasplante, cada variedad de chile se inoculó mecánicamente con ToBRFV y se evaluaron variables morfológicas y de calidad de frutos. La comparación de medias de cada variedad inoculada versus no inoculada se realizó con la prueba t-Student (P ≤ 0.05) para grupos independientes. El ToBRFV infectó a todas las variedades inoculadas ocasionando lesiones locales necróticas, clorosis, mosaico, moteado, necrosis de tallo, ampulación, deformación, enrollamiento y necrosis de hoja; asimismo, se observaron plantas asintomáticas. El ToBRFV afectó significativamente la altura, número de entrenudos, número de flores, peso fresco de raíz, peso promedio de fruto, número de semillas y diámetro polar-ecuatorial del fruto. La variedad chile habanero mostró la menor severidad, mientras que la mayor severidad se observó en la variedad de chile serrano ‘Tampiqueño’.

Abstract Hevea brasiliensis is the most economically important species of the Hevea genus, from which 99 % of the world's natural rubber production is obtained. During 2018, total production was 75 922 tons obtained from 28 172 ha planted in five states of Mexico: Chiapas, Oaxaca, Tabasco, Veracruz and Puebla. Veracruz is in first place with 66 % production. The diseases in the rubber tree affect the optimal production of latex worldwide. In 2018, the incidence in nursery of a rot in rubber stumps grafted with the clone IAN-873 in Martínez de la Torre municipality was detected; therefore, the objective of this investigation was to identify the agent associated to stump rot in this place. Samples of woody tissue with rot and mycelium were cultured in Malta Agar medium (MA) and incubated at 28 ± 1 °C for 72 h from which colonies with white-cream, cottony mycelium developed. Based on the culture morphology in the MA medium and the phylogenetic analysis by amplification of the ITS region with the ITS5 and ITS4 universal primers from the isolation, Schizophyllum commune was identified as the fungus associated to H. brasiliensis stump rot, thus becoming the first report in Mexico.

Resumen Hevea brasiliensis es la especie de mayor importancia económica del género Hevea, de la cual se obtiene 99 % de la producción mundial de hule natural. En México, durante 2018 se registró una producción total de 75 922 toneladas que se obtuvieron de 28 172 ha plantadas en cinco estados: Chiapas, Oaxaca, Tabasco, Veracruz y Puebla. De ellos, Veracruz ocupa el primer lugar, con 66 % de la producción. Las enfermedades en el árbol del hule afectan la óptima producción de látex en todo el mundo. En 2018, se detectó la incidencia en vivero de una pudrición en tocones de hule injertados con el clon IAN-873 en el municipio Martínez de la Torre; por lo anterior, el objetivo de esta investigación fue identificar el agente asociado a la pudrición de tocones en dicho lugar. Se cultivaron muestras de tejido leñoso con pudrición y micelio en medio Extracto de Malta Agar (MEA) y se incubaron a 28 ± 1 °C por 72 h; se desarrollaron colonias algodonosas, con micelio color blanco-crema. Con base en la morfología del cultivo en el medio MEA y el análisis filogenético cono la secuencia de la región ITS, obtenida mediante la amplificación con los primers ITS5/ITS4 del aislamiento, se identificó a Schizophyllum commune como el hongo asociado a la pudrición de los tocones de H. brasiliensis, lo que corresponde al primer registro para México.

Resumen Durante la producción y manejo postcosecha del nopal verdura (Opuntia ficus-indica) existe el riesgo de contaminar el producto con microorganismos patógenos como Salmonella. Actualmente, se carece de un producto efectivo para eliminar a Salmonella de nopal verdura. Para prevenir enfermedades a los consumidores de este producto en fresco es importante contar con un desinfectante efectivo que elimine a la bacteria sin que se afecte el color del cladodio. El objetivo del estudio consistió en evaluar el efecto de diferentes compuestos orgánicos como extractos de cálices de jamaica (Hibiscus sabdariffa), mezcla de vinagre blanco y jugo de limón (Citrus × latifolia) 1:1 (v/v), y solución de ácido láctico 1.5 %, sobre cultivos de Salmonella, además de identificar su efecto sobre el color del tejido de nopal verdura fresco, sin espinas. Para las pruebas se utilizaron cladodios de nopal de las variedades Atlixco, Copena V1, Milpa alta y Villanueva, inoculados con una mezcla (7.6 log10 UFC) de cepas de los serotipos S. Javiana y S. Typhimurium, resistentes a Kanamicina (Km50). Posterior al tiempo de incubación, los cladodios se pusieron en contacto con la solución desinfectante por 10 min, inmediatamente se lavaron con agua destilada estéril y se realizó la cuenta de bacterias al inocular en cajas con agar entérico Hektoen adicionado con Km50 las muestras previamente tratadas. Los resultados obtenidos mostraron reducción significativa (P ≤ 0.05) de 2.4 log10 mL-1 en la población de Salmonella con todas las soluciones evaluadas (extractos de cálices de jamaica, mezcla de vinagre blanco y jugo de limón, y de ácido láctico). La luminosidad del tejido resultó afectada (P ≤ 0.05) sólo con la mezcla de vinagre y jugo de limón, por lo que se concluye que todos los desinfectantes probados son adecuados para mantener la inocuidad y la calidad del nopal verdura.

Summary During the production and post-harvest handling of the nopal vegetable (Opuntia ficus-indica) there is a risk of contaminating this product with pathogenic microorganisms such as Salmonella. Currently, there is no effective product to eliminate Salmonella from fresh nopal vegetable. To prevent illnesses to consumers of this fresh product, it is important to have an effective disinfectant that eliminates the bacteria without affecting the color of the cladode. This research aimed to evaluate the effect of organic compounds such as hibiscus (Hibiscus sabdariffa) calyx extracts, a mixture of white vinegar and lemon (Citrus × latifolia) juice 1:1 (v/v), and 1.5 % lactic acid solution on Salmonella cultures, as well as identify their effect on the color of fresh vegetable nopal tissue, without thorns. Nopal cladodes of the Atlixco, Copena V1, Milpa alta and Villanueva varieties were used for the tests, inoculated with a mixture (7.6 log10 CFU) of strains of the serotypes S. Javiana and S. Typhimurium, resistant to Kanamycin (Km50). After the incubation time, cladodes were put in contact with the disinfectant solution for 10 min, they were immediately washed with sterile distilled water and the bacterial count was performed by inoculating the previously treated samples in boxes with Hektoen enteric agar added with Km50. Results obtained showed a significant reduction (P ≤ 0.05) of 2.4 log10 mL-1 in the Salmonella population with all the solutions evaluated (extracts of hibiscus calyces, a mixture of white vinegar and lemon juice, and lactic acid). The luminosity of the tissue was affected (P ≤ 0.05) only with the mixture of vinegar and lemon juice; thus, it is concluded that all the disinfectants tested are suitable to maintain the safety and quality of the nopal vegetable.

Abstract Individuals of the genus Burkholderia, sensu lato, are characterized by colonizing various, ecological, niches. The purpose of this research was to characterize Burkholderia gladioli morphologically, physiologically, biochemically, and molecularly, isolated from rotten onion bulbs, and to determine its potential as a pathogen of other plant species. B. gladioli also promoted soft rot in purple onion bulbs (Allium cepa), leek stalks (A. ampeloprasum), inflorescences of broccoli (Brassica oleracea), cladodes of cactus (Opuntia indica), carrot roots (Daucus carota), ginger rhizomes (Zingiber officinale) and mushroom sporocarps (Agaricus bisporus). B. gladioli colonized bean plants (Phaseolus vulgaris) in a greenhouse, and showed natural resistance in vitro to copper: agricultural cuprimicin, cuprimicin 500, phyton, copper oxychloride; antibiotics: bactrol, agricultural bactriomicin, kasumin, final bacter, quartz and biological: serenade powder, fungifree and bacterbest. This study reports for the first time the polyphasic characterization of B. gladioli in Mexico. This bacterial species grew at pH 4.0 and 42 °C, which could give it competitive ability in acid soils and semi-arid conditions. It is shown that it had a wide range of hosts in postharvest conditions, in addition to being resistant to different products used in the field for phytopathogens control.

Resumen Los individuos del género Burkholderia, sensu lato, se caracterizan por colonizar diversos nichos ecológicos. Esta investigación tuvo como objetivos caracterizar morfológica, fisiológica, bioquímica y molecularmente a Burkholderia gladioli, aislada de bulbos podridos de cebolla blanca (Allium cepa), y determinar su potencial como patógeno de otras especies vegetales. Burkholderia gladioli promovió, igualmente, la pudrición blanda en bulbos de cebolla morada (A. cepa), tallos de puerro (A. ampeloprasum), inflorescencias de brócoli (Brassica oleracea), cladodios de nopal (Opuntia indica), raíces de zanahoria (Daucus carota) y esporocarpos de champiñón (Agaricus bisporus). Burkholderia gladioli colonizó plantas de frijol (Phaseolus vulgaris) en invernadero y mostró resistencia natural in vitro a productos a base de cobre: cuprimicin agrícola, cuprimicin 500, phyton, oxicloruro de cobre; antibióticos: bactrol, bactriomicin agrícola, kasumin, final bacter, quartz y biológicos: serenade polvo, fungifree y bacterbest. Este estudio reporta por primera vez la caracterización polifásica de B. gladioli en México. Este aislado bacteriano creció a pH 4.0 y 42 °C, lo que podría conferirle habilidad competitiva en suelos ácidos y condiciones semiáridas. Se demostró que tiene un amplio rango de hospederos en condiciones postcosecha, además de ser resistente a diferentes productos usados en campo para el control de fitopatógenos.

Resumen Xylella fastidiosa es una bacteria Gram negativa que infecta plantaciones de vid (Vitis vinifera L.) en el municipio de Parras, Coahuila, México. La presente investigación tuvo como objetivo identificar la subespecie de X. fastidiosa y determinar su asociación con diferentes especies de plantas cultivadas y silvestres en el municipio. Durante el verano y otoño de 2018 se obtuvieron, en dos predios del municipio de Parras, 83 muestras procedentes de árboles frutales (n = 36), incluyendo vid, árboles forestales (n = 4), plantas ornamentales (n = 2) y plantas silvestres (n = 41). Para la identificación de la bacteria se amplificaron por PCR secuencias parciales de los genes gyrB, HL y 16S rRNA, así como de los genes de mantenimiento (MLST) leuA, petC, malF, cysG, holC, nuoL y gltT, además del gen de adherencia a superficies pilU. La reconstrucción filogenética mostró que las secuencias amplificadas correspondieron a X. fastidiosa subsp. fastidiosa. El clado X. fastidiosa subsp. fastidiosa mostró que las secuencias concatenadas de los genes MLST se agruparon con las secuencias ST1, ST2 y ST3, y las del gen pilU con la secuencia ST1. Los resultados confirmaron la presencia de X. fastidiosa subsp. fastidiosa en las especies cultivadas de Carya sp., Cydonia sp., Ficus carica, Olea europaea y V. vinifera, y en las especies silvestres Celtis pallida, Baccharis sp., Phragmites sp. y Rubus sp. Sólo en Cydonia sp., O. europaea, Phragmites sp. y V. vinifera se registró síntoma de escaldadura en las hojas, característico de X. fastidiosa. Los resultados indican que en el municipio de Parras, Coahuila se presentan infecciones recurrentes que representan una fuente de inóculo de la bacteria para los viñedos, principal cultivo de la región. Este es el primer reporte de X. fastidiosa subsp. fastidiosa en Cydonia sp., la cual se propone como nuevo hospedante de la bacteria.

Summary Xylella fastidiosa is a Gram negative bacterium that infects vine plantations (Vitis vinifera L.) in the municipality of Parras, Coahuila, México. This research aimed to identify the subspecies of X. fastidiosa and determine its association with different species of cultivated and wild plants in the municipality. During Summer and Autumn 2018, 83 samples of fruit trees (n = 36), including vine, forest trees (n = 4), ornamental plants (n = 2) and wild plants (n = 41) were collected from two sites in the municipality of Parras. For bacterial identification, partial sequences of the gyrB, HL, and 16S rRNA genes were amplified by PCR, as well as the housekeeping genes (MLST) leuA, petC, malF, cysG, holC, nuoL and gltT, in addition to the pilU adherence to surface gene. Phylogenetic reconstruction showed that the amplified sequences corresponded to X. fastidiosa subsp. fastidiosa. Clade X. fastidiosa subsp. fastidiosa and that the concatenated sequences of the MLST genes were grouped with the sequences ST1, ST2 and ST3, and those of the pilU gene with ST1. Results confirmed the presence of X. fastidiosa subsp. fastidiosa in the cultivated species of Carya sp., Cydonia sp., Ficus carica, Olea europaea and V. vinifera, and in the wild species Celtis pallida, Baccharis sp., Phragmites sp. and Rubus sp. Only in Cydonia sp., O. europaea, Phragmites sp. and V. vinifera scalding symptom was registered on the leaves, a characteristic of X. fastidiosa. Results show the presence of recurrent infections in the municipality of Parras, Coahuila, that represent a source of inoculum of the bacteria for the vineyards, the main crop in the region. This is the first report of X. fastidiosa subsp. fastidiosa in Cydonia sp., which is proposed as a new host for the bacterium.

Abstract. Currently the presence of diseases in wheat caused by bacteria has increased up to 15%, probably due to factors such as: low resistance, climate change and seed contamination. The objective was to evaluate chemical treatments for bacterial control in wheat seed. Seed of three varieties (Gálvez M87, Tlaxcala F2000 and Nana F2007) from four locations were used. Treatments were: hydrogen peroxide, sodium hypochlorite (2% and 5%) at three-time intervals (1, 2 and 3 min), Metacaptan (80, 90 and 100 g/100 kg seed), Cupravit Hydro (200, 300 and 400 g/100 kg seed) and untreated check. The treated seed was sown in Petri plates with nutritious Agar. The infected seed percentage (PSI) and the germination percentage (PG) were evaluated. The variance analysis showed high significance for PSI and PG. The product with the highest control of bacteria (Tukey, p≤0.05) was sodium hypochlorite at 5% at 2 and 3 min which reduced the PSI by 80% compared to the check, followed by sodium hypochlorite at 2% at 2 min and Metacaptan at 90 g, and the least effective was hydrogen peroxide at 2 min. None of the products evaluated were 100% effective.

Resumen. Actualmente la presencia de enfermedades en trigo causadas por bacterias ha incrementado hasta un 15%, debido probablemente a factores como: baja resistencia, cambio climático y contaminación de semilla. El objetivo fue evaluar tratamientos químicos para control de bacterias en semilla de trigo. Se utilizó semilla de tres variedades (Gálvez M87, Tlaxcala F2000 y Nana F2007) y cuatro localidades. Los tratamientos fueron: peróxido de hidrógeno, hipoclorito de sodio (2% y 5%) en tres intervalos de tiempo (1, 2 y 3 min), Metacaptan (80, 90 y 100 g/100 kg de semilla), Cupravit Hidro (200, 300 y 400 g/100 kg de semilla) y testigo sin tratamiento. La semilla tratada fue sembrada en cajas Petri con Agar nutritivo. Se evaluó porcentaje de semilla infectada (PSI) y porcentaje de germinación (PG). El análisis de varianza mostró alta significancia para PSI y PG. El producto con mayor control de bacterias (Tukey, p≤0.05) fue hipoclorito de sodio al 5% a 2 y 3 min que redujo 80% el PSI en comparación con el testigo, seguido de hipoclorito de sodio al 2% 2 min y Metacaptan a 90 g, el menos efectivo fue peróxido de hidrogeno a 2 min. Ninguno de los productos evaluados fue efectivo al 100%.

Abstract The bacteria Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis (Cmm) and Xanthomonas vesicatoria (Xv) are of great interest in tomato production because they cause major economic losses worldwide. They are transmitted by seeds and the management strategies for these pathogens in tomato production systems are not completely effective. Therefore, the objective of this research was to identify fluorescent Pseudomonas strains of different ecological origin and evaluate their antagonism against Cmm and Xv and their effect as growth promoters on tomato seed germination and seedling vigor. We evaluated 356 fluorescent Pseudomonas strains isolated from different ecological niches: roselle (Hibiscus sabdariffa L.) rhizosphere, tomato (Solanum lycopersicum L.) rhizosphere and Claviceps gigantean sclerotium mycosphere. Antagonism against C. michiganensis and Xanthomonas vesicatoria was evaluated in in vitro dual confrontation tests in King’s B culture medium, which generated 20 fluorescent P. strains antagonistic to one or both bacteria. The antagonistic strains (n = 20) were characterized metabolically by their production of 3-indole acetic acid (IAA) and siderophores (SID), and were identified genetically by the polymerase chain reaction (PCR) technique with the amplification and sequencing of the 16S rRNA gene by primers FD1 and RD1. The results of the metabolic characterization of the strains indicated that 65 % produced IAA and 100 % SID. Inoculation of these bacteria, by the Bio-priming technique, in tomato var. Rio Grande seeds showed that 95 % of them significantly (P ≤ 0.05) increased the germination rate (T50) and the dry biomass production of the seedling roots. The partial sequencing of the 16S rRNA gene identified the bacterial strains as Pseudomonas sp. (65 %), P. putida (25 %) and P. fluorescens (10 %).

Resumen Las bacterias Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis (Cmm) y Xanthomonas vesicatoria (Xv) son de gran interés en la producción de jitomate ya que ocasionan grandes pérdidas económicas a nivel mundial. Se transmiten por semillas y las estrategias de manejo para estos patógenos en sistemas de producción de jitomate no son completamente eficaces. Por lo anterior, el objetivo de esta investigación fue identificar cepas de Pseudomonas fluorescentes de diferente origen ecológico, evaluar su antagonismo contra Cmm y Xv, y su efecto como promotoras de crecimiento en la germinación de semilla y vigor en plántula de jitomate. Se evaluaron 356 cepas de Pseudomonas fluorescentes aisladas de diferentes nichos ecológicos: rizósfera de jamaica (Hibiscus sabdariffa L.), jitomate (Solanum lycopersicum L.) y micósfera de esclerocios de Claviceps gigantea. El antagonismo contra C. michiganensis y Xanthomonas vesicatoria se evaluó en ensayos de confrontación dual in vitro en medio de cultivo B de King, el cual generó 20 cepas de P. fluorescentes antagonistas a una o ambas bacterias. Las cepas antagonistas (n = 20) se caracterizaron metabólicamente por su producción de ácido-3-indol acético (AIA) y sideróforos (SID), y se identificaron genéticamente por la técnica de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) con la amplificación y secuenciación del gen 16S rRNA mediante los iniciadores FD1 y RD1. Los resultados de la caracterización metabólica de las cepas indicaron que 65 % produjeron AIA y 100 % SID. La inoculación de estas bacterias, por la técnica Bio-priming, en semillas de jitomate var. Río Grande mostró que 95 % de ellas aumentaron significativamente (P ≤ 0.05) la velocidad de germinación (T50) y la producción de biomasa seca de las raíces de las plántulas. La secuenciación parcial del gen 16S rRNA identificó las cepas bacterianas como Pseudomonas sp. (65 %), P. putida (25 %) y P. fluorescens (10 %).

Abstract: Maize (Zea mays) ranks second as food in the world and drought limits its productivity. Plants harbor endophytic bacteria that influence health and drought tolerance. The goal of this research was to estimate the density and diversity of cultivable endophyte bacteria from the root system of seven homozygous maize drought-tolerant and seven drought-susceptible lines in three locations of Mexico during three crop cycles. The density and diversity of bacterial populations was assessed by direct counting on plates and identified by PCR. The results identified three groups of endophytic bacteria: 1) highly frequent (Bacillus subtilis, Bacillus megaterium y Pseudomonas geniculata), 2) frequent (Bacillus firmus, Pseudomonas hibiscola y Sinorhizobium meliloti) y 3) low frequency (Acinetobacter soli, Stenotrophomonas maltophila y Burkholderia gladioli. The analysis of variance (ANOVA) showed significant differences (p≤0.05) in density (Log10 CFU g-1 root) of population by location, crop cycle, days after sowing and maize lines. The density of Bacillus subtilis, Pseudomonas hibiscola at El Batán and Bacillus megaterium, Sinorhizobium meliloti in Tlaltizapán, were significantly higher in drought-tolerant maize lines compared to drought-susceptible lines.

Resumen: El maíz (Zea mays) ocupa el segundo lugar como alimento en el mundo y la sequía limita su productividad. Las plantas albergan bacterias endófitas que influyen en la sanidad y tolerancia a la sequía. El objetivo de esta investigación fue estimar la densidad y diversidad de las bacterias endófitas cultivables de la raíz en siete líneas homocigóticas de maíces tolerantes y siete susceptibles a sequía en tres localidades de México durante tres ciclos del cultivo. La densidad y diversidad de las poblaciones bacterianas se evaluó mediante conteo directo en placas y se identificaron por PCR. Los resultados identificaron tres grupos de bacterias endófitas: 1) altamente frecuentes (Bacillus subtilis, Bacillus megaterium y Pseudomonas geniculata), 2) frecuentes (Bacillus firmus, Pseudomonas hibiscola y Sinorhizobium meliloti) y 3) baja frecuencia (Acinetobacter soli, Stenotrophomonas maltophila y Burkholderia gladioli. El análisis de varianza (ANOVA) mostró diferencias significativas (p≤0,05) en la densidad (Log10 UFC g-1 de raíz) de población por localidad, ciclo de cultivo, días después de siembra y líneas de maíz. La densidad de Bacillus subtilis, Pseudomonas hibiscola en la localidad de El Batán y Bacillus megaterium, Sinorhizobium meliloti en Tlaltizapán, fueron significativamente mayores en las líneas de maíz tolerantes que en las susceptibles a sequía.

Abstract: In onion Allium cepa crops in the state of Morelos, Mexico, typical and severe symptoms associated with Iris yellow spot virus (IYSV) are observed. In this work the alterations caused by IYSV isolates from typical and severe symptoms in Nicotiana benthamiana, the differences in the N gene and their phylogeny were studied. Four typical and five severe isolates mechanically inoculated caused systemic infection. Severe isolates caused more severe symptoms in bioclimatic chamber. The N gene sequence of both isolates had 98-99% identity with the IYSV nucleoprotein and no changes in nucleotide sequence between them were observed. Both isolates were grouped with the IYSVBR genotype and had greater similarity with those reported in Canada and the United States.

Resumen: En cultivos de cebolla Allium cepa del estado de Morelos, México, se observan síntomas típicos y severos asociados a Iris yellow spot virus (IYSV). En esta investigación se estudiaron las alteraciones que ocasionan los aislamientos de IYSV procedentes de síntomas típicos y severos en Nicotiana benthamiana, las diferencias en el gen N y su filogenia. Cuatro aislamientos típicos y cinco severos inoculados mecánicamente causaron infección sistémica. En cámara bioclimática los aislamientos severos ocasionaron mayor severidad de síntomas. La secuencia del gen N de ambos aislamientos tuvo 98-99% de identidad con la nucleoproteína de IYSV y no se observaron cambios en la secuencia de nucleótidos entre ellos. Ambos aislamientos se agruparon con el genotipo IYSVBR y tuvieron mayor similitud con los reportados en Canadá y Estados Unidos.

SUMMARY Xanthomonas fragariae is the causal agent of angular leaf spot in strawberry (Fragaria × ananassa Duch) in Mexico. The aim of this study was to characterize and identify isolated bacteria based on physiological, biochemical, morphological traits, as well as pathogenicity and genetic tests by PCR. Colonies of bacteria with similar morphology to that described for X. fragariae were isolated from leaf tissue of different strawberry genotypes in Cd. Guzmán, Jalisco, Mexico with symptoms of aqueous angular spots on the adaxial area of leaves, exudate in primary and secondary veins and necrotic spots. The results of the characterization of bacterial isolates identified them as X. fragariae, which was confirmed by genetic analysis through the amplification of the hrp gene, as well as the amplification and sequencing of the 16S rDNA gene. Inoculation of the X. fragariae-22 strain produced angular lesions and necrosis adjacent to the leaf vein on susceptible strawberry plants cv. Jacona.

RESUMEN Xanthomonas fragariae es el agente causal de la mancha angular de la hoja en el cultivo de fresa (Fragaria × ananassa Duch) en México. El objetivo de este estudio fue caracterizar e identificar las bacterias aisladas basadas en la caracterización fisiológica, bioquímica, morfológica y en pruebas de patogenicidad y genética por PCR. Se aislaron colonias de bacterias con morfología similar a la descrita para X. fragariae a partir de tejido foliar de diferentes genotipos de fresa en Cd. Guzmán, Jalisco, México con síntomas de manchas angulares acuosas en el área adaxial, exudado en nervaduras primarias y secundarias y manchas necróticas. Los resultados de la caracterización de los aislamientos bacterianos los identificaron como X. fragariae, lo cual fue confirmado por el análisis genético con la amplificación del gen hrp y la amplificación y secuenciación del gen 16S rADN. La inoculación de la cepa X. fragariae-22 produjo lesiones angulares y necrosis adyacentes a la nervadura de las hojas en plantas susceptibles de fresa var. Jacona.

Abstract Xanthomonas fragariae is the causative agent of the angular leaf spot of strawberries (Fragaria×ananassa Duch). This microorganism is subject to quarantine for the mobilization and transport of propagation plant material in several countries. There is no information about the pathogen’s genetic diversity and its severity on commercial varieties in Mexico. The objective of this study was to find out X. fragariae’s genetic variability and evaluate its severity on different strawberry genetic materials. To achieve this, a phylogenetic analysis was carried out with partial sequences of the hrp and gyrB genes from 14 X. fragariae isolates collected from production locations in the Mexicans states of Michoacán, Jalisco, and Puebla. The phylogenetic tree showed 99 % similarity among the isolates analyzed. In order to obtain X. fragariae-resistant strawberry genotypes, for commercial use and in genetic improvement programs, a X. fragariae suspension was inoculated, injected and sprayed, in two commercial varieties and five genotypes. The symptom severity was evaluated using a diagrammatic scale. FragLa and FragMa strawberry genotypes showed the lowest severity values. This is the first study in Mexico about the X. fragariae’s genetic variability and its severity on strawberry genotypes.

Resumen Xanthomonas fragariae es el agente causal de la mancha angular de la hoja en fresa (Fragaria×ananassa Duch) y es un microorganismo sujeto a cuarentena para la movilización y transporte de material vegetal de propagación en varios países. En México, la información sobre la diversidad genética del patógeno y su severidad en variedades comerciales es desconocida. Este estudio tuvo como objetivo conocer la variabilidad genética de X. fragariae y evaluar su severidad en diferentes materiales genéticos de fresa. Para ello se realizó un análisis filogenético con secuencias parciales de los genes hrp y gyrB de 14 aislamientos de X. fragariae recolectados en localidades productoras de los estados de Michoacán, Jalisco y Puebla, México. El árbol filogenético mostró similitud de 99 % entre los aislamientos analizados. Con el propósito de contar con genotipos de fresa, con resistencia a X. fragariae para uso comercial y en programas de mejoramiento genético, se inoculó por inyección y aspersión una suspensión de X. fragariae en dos variedades comerciales y cinco genotipos y se evaluó la severidad de los síntomas mediante una escala diagramática. Los genotipos de fresa FragLa y FragMa tuvieron los valores menores de severidad. Este es el primer estudio sobre la variabilidad genética de X. fragariae y de su severidad en genotipos de fresa en México.

Abstract: Microbial communities in the rhizosphere are important in nutrition and plant health. In this research, culturable native bacterial populations in the roselle (Hibiscus sabdariffa L.) var. Tecoanapa rhizosphere were evaluated in the growth stages of initial growth, bud development and flowering at the locations: Las Ánimas, Saucitos, Pueblo Largo, Santa Rosa and Xalpatláhuac in the Tecoanapa county, Guerrero in southern México. Rhizobacteria antagonistic to Phytophthora parasitica was characterized in vitro phenotypically and genotypically. The total bacterial population density in the rhizosphere was log 3.50 and 6.56 CFU g-1 root. The comparative study between sites showed that the average root CFU g-1 in the early growth stage was statistically highest (P > 0.05), and both magnesium (r = 0.92) and phosphorus content in the soil (r = 0.80) were significantly correlated with CFU values. According to the in vitro evaluation antagonism of 450 bacterial isolates to P. parasitica, we selected the 18 most efficient strains. The selected bacteria expressed lipolytic and proteolytic enzyme activity: 88.8 % produced siderophores, 44.4 % produced indole-3-acetic acid, and 72.2 % solubilized phosphates. Out of these 18 isolates, six strains expressed the five activities related with antagonism or growth promoters. Strains (n = 18) were genetically identified by polymerase chain reaction (PCR) by amplification and sequencing of the 16S rDNA region with primers 27F and 1492R. The genus identified in roselle rhizosphere with antagonist activity to P. parasitica and plant growth promotion were Serratia, Pseudomonas and Stenotrophomonas with a homology of 99 %. This is the first study that has been published on native culturable bacterial communities in the roselle rhizosphere.

Resumen: Las comunidades microbianas en la rizosfera son importantes en la nutrición y sanidad de las plantas. En esta investigación se estudiaron las poblaciones bacterianas cultivables nativas en la rizosfera de jamaica (Hibiscus sabdariffa L.) var. Tecoanapa en los estados fenológicos de crecimiento inicial, desarrollo de botones florales y floración, en las localidades: Las Ánimas, Saucitos, Pueblo Largo, Santa Rosa y Xalpatláhuac municipio de Tecoanapa, Guerrero, con el objetivo de caracterizar fenotípica y genotípicamente rizobacterias antagonistas in vitro a Phytophthora parasitica. La densidad de población bacteriana total en la rizosfera fue log 3.50 y 6.56 UFC g-1 de raíz. El estudio comparativo entre sitios mostró que el promedio de UFC g-1 de raíz en la etapa de crecimiento inicial fue estadísticamente mayor (P > 0.05) y que el magnesio (r = 0.93) y el fósforo en el suelo (r = 0.81) tienen una correlación significativa con los valores de UFC. El antagonismo de 450 aislados bacterianos a P. parasitica mediante ensayos in vitro generó 18 cepas bacterianas eficientes. La caracterizaron de las bacterias mostró que 100 % de ellas expresaron actividad enzimática lipolítica y proteolítica, 88.9 % produjeron sideróforos, 44.4 % produjeron ácido indol-3-acético, y 72.2 % solubilizaron fosfatos. De las 18 cepas iniciales, seis expresaron las cinco actividades relacionadas con el antagonismo o promoción del crecimiento. Las cepas (n = 18) se identificaron genéticamente por la técnica de reacción en cadena de la polimerasa (PCR, por sus siglas en inglés) mediante la amplificación y secuenciación de la región 16S rADN con los iniciadores 27F y 1492R. Los géneros identificados en la rizosfera de jamaica y con actividad antagonista a P. parasitica y promotoras del crecimiento vegetal fueron Serratia, Pseudomonas y Stenotrophomonas con una homología del 99 %. Este estudio es el primero que se ha publicado sobre las comunidades bacterianas cultivables nativas en la rizosfera de jamaica.