Resumo A raposa-vermelha (Vulpes vulpes) é um carnívoro de médio porte que ocorre em diferentes regiões do Paquistão, porém ainda carece de dados científicos sobre sua ecologia e distribuição. O presente estudo investigou o status filogenético e a dieta da raposa-vermelha (V.v. griffithii) que ocorre no Parque Nacional de Ayubia, Paquistão. Por meio de armadilhas fotográficas e análises moleculares, confirmamos a ocorrência de raposa-vermelha na área de estudo. Com base no citocromo B mitocondrial (304 bp) e amostragem limitada, quase todas as raposas-vermelhas do Parque Nacional de Ayubia e áreas circundantes do Himalaia se enquadram na linhagem materna holártica, enquanto as raposas-vermelhas encontradas nas planícies do Paquistão fazem parte da linhagem materna basal paleártica. Usando 32 fezes, descobrimos que a dieta da raposa-vermelha compreende 80% de espécies de presas de origem animal (selvagens e domésticas) e 19% de matéria vegetal. As espécies de presas de animais selvagens incluíram a lebre-do-cabo (Lepus capensis) e o esquilo-voador (Pteromyini sp.), que constituíram 17% e 15% da dieta, respectivamente. As raposas-vermelhas consumiam raramente ratos domésticos (Mus musculus), algas do Himalaia (Paguma larvata) e ovelhas (Ovis aries), cada um compreendendo cerca de 6% a 9% da dieta da raposa-vermelha. A espécie de raposa também se alimentava de burros domésticos de forma oportunista. Com base em nossa amostragem, nosso estudo sugere que a raposa-vermelha (V.v. griffithii) que ocorre no Parque Nacional de Ayubia e nas cordilheiras menores do Himalaia pertence à linhagem materna holártica. O estudo também destaca o consumo de sementes de plantas por raposas-vermelhas, indicando que pode desempenhar um papel ecológico importante na dispersão de sementes no Parque Nacional de Ayubia.

Abstract The red fox (Vulpes vulpes) is a medium-sized carnivore that occurs in different regions of Pakistan, however, still lacks scientific data on its ecology and distribution. The current study investigated the phylogenetic status and diet of the red fox (V.v. griffithii) occurring in Ayubia National Park, Pakistan. Through camera trapping and molecular analysis, we confirmed the occurrence of red fox in the study area. Based on mitochondrial cytochrome B (304 bp) and limited sampling, nearly all red foxes of Ayubia National Park and surrounding Himalayan ranges fall within Holarctic maternal lineage, whereas red foxes found in plains of Pakistan are part of the basal Palearctic maternal lineage. Using 32 scats, we found that red fox diet comprises of 80% animal-based prey species (both wild and domestic) and 19% plant matter. The wild animal prey species included Cape hare (Lepus capensis) and flying squirrel (Pteromyini sp.), which constituted 17% and 15% of diet, respectively. Red foxes infrequently consumed House mouse (Mus musculus), Himalayan Palm civet (Paguma larvata) and sheep (Ovis aries), each comprising around 6% to 9% of red fox diet. The fox species also scavenged on domestic donkey opportunistically. Based on our sampling, our study suggests that the red fox (V.v. griffithii) that occurs in Ayubia National Park and across the lesser Himalayan ranges belongs to Holarctic maternal lineage. The study also highlights consumption of plant seeds by red foxes, indicating it may play an important ecological role in seed dispersal in Ayubia National Park.

Resumo O câncer é uma doença maligna fatal e sua crescente prevalência mundial exige a descoberta de biomarcadores moleculares mais sensíveis e confiáveis. Investigar o nível de expressão de GINS1 e seu valor prognóstico em cânceres humanos distintos, usando uma série de abordagens in silico em várias camadas, pode ajudar a estabelecê-lo como um potencial biomarcador de diagnóstico e prognóstico compartilhado de diferentes subtipos de câncer. O mRNA de GINS1, a expressão da proteína e a metilação do promotor foram analisados usando UALCAN e Human Protein Atlas (HPA), enquanto a expressão de mRNA foi posteriormente validada via GENT2. Os valores prognósticos potenciais de GINS1 foram avaliados por meio do plotter KM. Em seguida, o cBioPortal foi utilizado para examinar as mutações genéticas relacionadas ao GINS1 e as variações do número de cópias (CNVs), enquanto a análise de enriquecimento da via foi realizada usando DAVID. Além disso, uma análise correlacional entre a expressão de GINS1 e células imunes T CD8 + e a construção de uma rede de interação gene-droga foi realizada usando TIMER, CDT e Cytoscape. O GINS1 foi encontrado regulado negativamente em um único subtipo de câncer humano, enquanto comumente regulado positivamente em 23 outros subtipos diferentes. A regulação positiva de GINS1 foi significativamente correlacionada com a sobrevida global pobre (OS) de Carcinoma Hepatocelular de Fígado (LIHC), Adenocarcinoma de Pulmão (LUAD) e Carcinoma de Células Claras Renais de Rim (KIRC). O GINS1 também foi encontrado regulado positivamente em pacientes LIHC, LUAD e KIRC de diferentes características clínico-patológicas. A análise de enriquecimento de vias revelou o envolvimento de GINS1 em duas vias diversas, enquanto poucas correlações interessantes também foram documentadas entre a expressão de GINS1 e seu nível de metilação do promotor, nível de células imunes T CD8 + e CNVs. Além disso, também previmos poucos medicamentos que poderiam ser usados no tratamento de LIHC, LUAD e KIRC, regulando a expressão de GINS1. O perfil de expressão de GINS1 no estudo atual sugeriu que é um novo biomarcador de diagnóstico e prognóstico compartilhado de LIHC, LUAD e KIRC.

Abstract Cancer is a fatal malignancy and its increasing worldwide prevalence demands the discovery of more sensitive and reliable molecular biomarkers. To investigate the GINS1 expression level and its prognostic value in distinct human cancers using a series of multi-layered in silico approach may help to establish it as a potential shared diagnostic and prognostic biomarker of different cancer subtypes. The GINS1 mRNA, protein expression, and promoter methylation were analyzed using UALCAN and Human Protein Atlas (HPA), while mRNA expression was further validated via GENT2. The potential prognostic values of GINS1 were evaluated through KM plotter. Then, cBioPortal was utilized to examine the GINS1-related genetic mutations and copy number variations (CNVs), while pathway enrichment analysis was performed using DAVID. Moreover, a correlational analysis between GINS1 expression and CD8+ T immune cells and a the construction of gene-drug interaction network was performed using TIMER, CDT, and Cytoscape. The GINS1 was found down-regulated in a single subtypes of human cancer while commonly up-regulated in 23 different other subtypes. The up-regulation of GINS1 was significantly correlated with the poor overall survival (OS) of Liver Hepatocellular Carcinoma (LIHC), Lung Adenocarcinoma (LUAD), and Kidney renal clear cell carcinoma (KIRC). The GINS1 was also found up-regulated in LIHC, LUAD, and KIRC patients of different clinicopathological features. Pathways enrichment analysis revealed the involvement of GINS1 in two diverse pathways, while few interesting correlations were also documented between GINS1 expression and its promoter methylation level, CD8+ T immune cells level, and CNVs. Moreover, we also predicted few drugs that could be used in the treatment of LIHC, LUAD, and KIRC by regulating the GINS1 expression. The expression profiling of GINS1 in the current study has suggested it a novel shared diagnostic and prognostic biomarker of LIHC, LUAD, and KIRC.

Resumo Bemisia tabaci é um complexo de espécies que causa danos a uma ampla gama de hospedeiros vegetais por meio de alimentação séria. Ele transmite vírus de plantas de diferentes grupos para importantes safras agrícolas. Algumas safras comerciais importantes do Paquistão são cana-de-açúcar, arroz, tabaco e óleo de semente. Apresenta alta variabilidade genética e é diferenciado em raças ou biótipos. Os biótipos são: biótipo Q, biótipo B, biótipo B2, biótipo M, biótipo L, biótipo A, biótipo H, biótipo C, biótipo K, biótipo N, biótipo R, biótipo E, biótipo P, biótipo J, biótipo S, biótipo AN . Embora o relatório atual baseado no estudo bayesiano das sequências de DNA do gene 1 da oxidase do citocromo mitocondrial (CO1) tenha classificado as diferentes populações de moscas-brancas em doze grupos genéticos, que são Mediterrâneo, África Subsaariana com folha de prata, Oceano Índico, Ásia II, Ásia I, Austrália, Novo Mundo, Itália, China, África Subsaariana sem folha prateada, Batata-doce Mediterrâneo / Ásia Menor / África e Uganda. Os begomovírus são o maior grupo de vírus transmitidos por B. tabaci e causam as principais doenças de culturas, como a doença do cacho do tomate e da pimenta-malagueta, doença do mosaico da mandioca, doença do mosaico amarelo de leguminosas e doença do enrolamento da folha do algodão. O principal objetivo do presente estudo é inculpar conhecimento sobre a diversidade genética da mosca-branca em campos de algodão em todo o Paquistão por meio da análise da sequência parcial de DNA do gene mitocondrial Citocromo Oxidase I (mtCO1).

Abstract Bemisia tabaci is a species complex that causes damage to its broad range of plant hosts through serious feeding. It transmits plant viruses of different groups to important agricultural crops. Some important cash crops of Pakistan are sugar cane, rice, tobacco and seed oil. It shows high genetic variability and is differentiated as races or biotypes. Biotypes are, biotype Q, biotype B, biotype B2, biotype M, biotype L, biotype A, biotype H, biotype C, biotype K, biotype N, biotype R, biotype E, biotype P, biotype J, biotype S, biotype AN. Although the current report based on the Bayesian study of mitochondrial cytohrome oxidase gene1 (CO1) DNA sequences has classified the different populations of whiteflies into twelve genetic groups which are Mediterranean, Sub-Saharan Africa silverleafing, Indian Ocean, Asia II, Asia I, Australia, New World, Italy, China, Sub-Saharan Africa non-silverleafing, Mediterranean/Asia Minor/Africa and Uganda sweet potato. Begomoviruses is largest group of viruses transmitted by B. tabaci and cause major diseases of crops such as tomato and chili leaf curl disease, cassava mosaic disease; yellow mosaic disease of legumes and cotton leaf curl disease. The main objective of current study is to inculpate knowledge regarding genetic diversity of whitefly in cotton fields across Pakistan via analysis of partial DNA sequence of mitochondrial gene Cytochrom Oxidase I (mtCO1).

Resumo Magnolia biondii Pamp é uma importante espécie de árvore ornamental muito cultivada e utilizada como porta-enxerto na propagação de diferentes variedades de Magnolia. Nos estudos atuais, hormônios anatômicos, fisiológicos e endógenos foram estudados para verificar o efeito do AIB na dose de 750 mg / L no enraizamento adventício e fornecer suporte teórico e técnico para a propagação de M. biondii Pamp por meio de estacas. Duas mil estacas foram preparadas e divididas em dois grupos, ou seja, tratadas com AIB e controle de água. Para a avaliação das atividades das enzimas antioxidantes e dos níveis de hormônios endógenos, as amostras foram coletadas no dia do plantio e a cada 5 dias, enquanto as demais etapas foram realizadas em laboratório de acordo com os protocolos e os devidos cuidados. Para as observações anatômicas, as amostras foram coletadas no 13º, 15º e 17º dias para estacas tratadas com AIB e no 21º, 23º e 25º dias para o controle. As amostras coletadas foram preservadas em solução FAA, e outras observações foram realizadas em laboratório. Observações anatômicas mostraram a necessidade de 13 dias para a diferenciação dos primórdios radiculares até o aparecimento de raízes adventícias jovens em estacas tratadas com AIB e de 21 dias para o desenvolvimento dos primórdios no controle. As atividades das enzimas antioxidantes envolvidas nas ROS foram significativamente maiores nas estacas tratadas com AIB em comparação com o controle. A POD apresentou pico no 13º dia antes da emergência das raízes nas estacas tratadas com AIB, enquanto no 21º dia apresentou pico no controle. A PPO teve pico no 21º dia nas estacas tratadas com AIB e no 29º dia no controle. A SOD apresentou pico no 17º dia nas estacas tratadas com AIB e no 25º dia no controle. A aplicação exógena de AIB aumentou os níveis endógenos de IAA e GA3 em relação ao controle, enquanto reduziu os níveis de ABA continuamente no momento do enraizamento e, em seguida, aumentou gradativamente. Inclusive, nosso estudo sugere que o AIB na dose de 750 mg / L é eficiente para o enraizamento de estacas de M. biondii Pamp, visto que potencializou o processo de atividades de enzimas antioxidantes e os níveis de hormônios endógenos, além de reduzir o tempo de formação de raízes, o que fica evidente nas observações anatômicas.

Abstract Magnolia biondii Pamp is an important ornamental tree species widely grown and used as a rootstock in the propagation of different Magnolia varieties. In the current studies, anatomical, physiological and endogenous hormones were studied to check the effect of IBA 750 mg/L on the adventitious rooting and to provide theoretical and technical support for the propagation of Magnolia biondii Pamp through stem cuttings. Two thousand stem cuttings were prepared and divided into two groups i.e., IBA treated cuttings and water control. For the evaluation of antioxidant enzyme activities, and endogenous hormones levels, samples were collected on the day of planting and each 5th day and further steps were carried out in the laboratory according to the protocols and proper precautions. For the anatomical observations, samples were collected on the 13th, 15th, and 17th day for IBA treated cuttings while 21st, 23rd, and 25th day for control. Collected samples were preserved in the FAA solution and further observations were carried out in the laboratory. Anatomical observations showed that it took 13 days for the differentiation of root primordia to the appearance of young adventitious roots in IBA treated cuttings, while it took 21 days to develop primordia in the control. Antioxidant enzyme activities involved in ROS were significantly higher in the IBA treated cuttings compared to control. POD showed a peak on the 13th day before the emergence of roots in IBA treated cuttings while it showed a peak on the 21st day in the control. PPO showed a peak on the 21st day in the IBA treated cuttings while it showed a peak on the 29th day in the control. SOD showed a peak on the 17th day in IBA treated cuttings, while it showed a peak on the 25th day in the control. Exogenous application of IBA enhanced the endogenous IAA and GA3 levels compared to CK, while it reduced the levels of ABA continuously at the time of rooting and then increased gradually. Inclusively, our study suggests that IBA 750 mg/L is efficient for the rooting of Magnolia biondii Pamp cuttings, as it enhanced the process of antioxidant enzyme activities, endogenous hormones levels and reduced the time of root formation which is evident from the anatomical observations.

Resumo Os cupins são conhecidos como insetos sociais em todo o mundo. Atualmente na China foram relatadas 473 espécies, 44 gêneros e 4 famílias de cupins. Destas, 111 espécies de Reticulitermes estão amplamente distribuídas em diferentes zonas da China. A temporada de voo de dispersão dessas espécies chinesas de Reticulitermes geralmente começa de fevereiro a junho, mas em algumas regiões diferentes espécies são distribuídas, compartilhando seus limites e tendo temporadas de voo sobrepostas. Essas razões tornam-se importantes fontes de hibridização entre duas populações heteroespecíficas de cupins. Foi confirmado que os ovos fertilizados e não fertilizados de alguns cupins Reticulitermes possuem capacidade de clivagem. Já os ovos não fertilizados de R. aculabialis, R. chinensis e R. labralis clivaram normalmente, e os únicos ovos não fertilizados de R. aculabialis se desenvolvem em embriões. R. flaviceps e R. chinensis foram observados com desenvolvimento embrionário anormal, e não eclosão de ovos por partenogênese. Eles foram relatados como mais ameaçadores para os recursos chineses à medida que se propagam com partenogênese, hibridização e reprodução sexual. Casca de ovo e macrófilos de ovos desempenham papéis importantes na identificação e controle de espécies, embora sejam pragas graves e causem uma ampla gama de danos a estruturas e produtos de madeira em residências, edifícios, materiais de construção, árvores, plantações e florestas na China continental.

Abstract Termites are known as social insects worldwide. Presently in China 473 species, 44 genera and 4 families of termites have been reported. Of them, 111 Reticulitermes species are widely spread in different zones of China. The dispersion flight season of these Chinese Reticulitermes species are usually started from February to June, but in some regions different species are distributed, sharing their boundaries and having overlapping flight seasons. These reasons become important sources of hybridization between two different heterospecific populations of termites. It was confirmed that the fertilized eggs and unfertilized eggs of some Reticulitermes termites have the capacity of cleavage. While the unfertilized eggs of R. aculabialis, R. chinensis and R. labralis cleaved normally and the only R. aculabialis unfertilized eggs develop in embryos. While, the R. flaviceps and R. chinensis were observed with their abnormal embryonic development, and not hatching of eggs parthenogenetically. They were reported more threatening to Chinese resources as they propagate with parthenogenesis, hybridization and sexual reproduction. Eggshell and macrophiles of eggs play important roles in species identification and control. Although, they are severe pests and cause a wide range of damages to wooden structures and products in homes, buildings, building materials, trees, crops, and forests in China’s Mainland.

Resumo Os antioxidantes são materiais que eliminam ou removem os radicais livres dos sistemas vivos. O processo de oxidação termina na produção de radicais livres. Esses radicais livres são o principal local de nascimento das células cancerosas. Os agentes antioxidantes removem os intermediários dos radicais livres ao encerrar os processos de oxidação ao serem eles próprios oxidados. Por outro lado, as doenças infecciosas afetam o mundo em grande escala. Para combater essas doenças, diversos compostos sintéticos têm sido utilizados. Os medicamentos à base de plantas desempenham um papel importante a este respeito. Assim, o objetivo da pesquisa atual é investigar o efeito antibacteriano e antioxidante do extrato da casca da raiz de Berberis lycium Royle (BLR). Berberis lycium Royle foi utilizado para análises fitoquímicas e também como agentes antimicrobianos e antioxidantes. A atividade antimicrobiana foi avaliada pelo método de difusão em ágar em poço. A partir do estudo atual, observou-se que o BLR era rico em fitoquímicos e tóxico contra bactérias patogênicas testadas. BLR apresentou maior atividade contra S. pyogenes (13,3 ± 0,8 mm). A menor atividade antibacteriana foi relatada contra E. coli (0 ± 0 mm). No caso de concentração inibitória mínima, observou-se que BLR com concentração de 10 μg / mL apresentou maior atividade, enquanto BLR 2,5 μg / mL apresentou menor atividade inibitória. A maior atividade antioxidante in vitro foi registrada como 65% a 100 µg / mL. No caso do nível de atividade antioxidante in vivo de CAT, GSH e SOD diminuiu, enquanto o de MDA aumentou nos grupos tratados com CCl4 em comparação com o grupo controle. O tratamento com extrato de BLR reverteu todas essas mudanças significativamente. Os resultados atuais indicam que o BLR é eficaz contra patógenos bacterianos e também tem atividade antioxidante.

Abstract Antioxidants are materials that scavenge or remove free radicals from living systems. The oxidation process ends in the production of free radicals. These free radicals are the chief birthplace of cancerous cells. Antioxidizing agents remove free radical intermediates by terminating oxidation processes by being oxidized themselves. On the other hand, infectious diseases affect the world on a large scale. To fight these diseases several synthetic compounds have been used. Plant based medications play important role in this regard. So, the current research aimed to investigate the antibacterial and antioxidant effect of Berberis lycium Royle root bark (BLR) extract. Berberis lycium Royle was used for phytochemical analysis and also as antimicrobial and antioxidant agents. The antimicrobial activity was evaluated by the agar well diffusion method. Current study revealed that BLR was rich in phytochemicals and toxic against tested pathogenic bacteria. BLR showed the highest activity against S. pyogenes (13.3±0.8 mm). The lowest antibacterial activity was reported against E. coli (0±0 mm). In case of minimum inhibitory concentration, it was observed that BLR with 10 μg/mL concentration showed the highest activity while 2.5 μg/mL of BLR showed the least inhibitory activity. The highest In vitro antioxidant activity was recorded as 65% at 100 µg/mL. In case of in vivo antioxidant activity level of CAT, GSH and SOD were decreased while that of MDA was enhanced in groups treated with CCl4 as compared to the control group. BLR extract treatment reversed all these changes significantly. Current results indicate that BLR is effective against bacterial pathogens and also has antioxidant potential.

Resumo Os produtos naturais têm se mostrado muito eficazes contra várias doenças desafiadoras, incluindo câncer e infecções bacterianas. O gálio tricorne é uma importante fonte de produtos naturais, ainda pouco explorada, apesar de sua profunda proeminência etnomedicinal. O presente estudo foi desenvolvido para explorar o potencial biológico de G. tricorne e extrair e isolar constituintes químicos de sua parte aérea e sementes, respectivamente, juntamente com a identificação de seus constituintes químicos. A triagem fitoquímica foi realizada para descobrir a presença de metabólito secundário em G. tricorne, extrato metanólico bruto (Gt.Crd) que foi obtido da parte aérea enquanto os ácidos graxos foram extraídos das sementes, que posteriormente foram analisadas por GCMS. Da mesma forma, os métodos Well Diffusion e MTT foram usados para atividade antibacteriana e ensaio de linha de células cancerígenas, respectivamente. Para avaliar o potencial citotóxico, foram utilizadas artémias. Da mesma forma, na análise de cromatografia gasosa-espectroscopia de massa (GC-MS) um número total de 23 compostos foi identificado no extrato de Gt.Crd, dos quais 7 compostos foram selecionados para ter algum tipo de perfil de toxicidade. Da mesma forma, 5 ácidos graxos foram identificados nas sementes de G. tricorne. Além disso, entre as frações, a fração clorofórmio (Gt.Chf) apresentou maior zona de inibição (ZOI), 20,37 mm, seguida de Gt.Crd 18,40 mm contra S. aureus e S. pyogenes, respectivamente. Na citotoxicidade Gt.Chf foi mais ativo seguido pela fração acetato de etila (Gt.Eta), exibindo 88,32±0,62% (LC50=60 µg/mL) e 73,95±2,25% (LC50=80 µg/mL) respectivamente a 1000 µg/ concentração de mL da amostra testada. Gt.Chf exibiu maior atividade inibitória da linha celular (IC50 = 61 µg/mL) contra a linha celular HeLa. Da mesma forma, Gt.Crd apresentou valores de IC50 de 167,84 µg/mL e 175,46 µg/mL contra linha celular HeLa e NIH/3T3, respectivamente. Com base na revisão de literatura e triagens, pode-se concluir que a parte aérea e as sementes de G. tricorne são as ricas fontes de compostos bioativos. Os resultados do presente estudo também autenticam a base científica para os usos etnomedicinais de G. tricorne.

Abstract Natural products have long been proven very effective against various challenging diseases including cancer and bacterial infections. Galium tricorne is one of the important source of natural products, which has not been explored till date in spite of its profound ethnomedicinal prominence. The current study has been designed to explore the biological potential of G. tricorne and to extract and isolate chemical constituents from its aerial part and seeds respectively along with identification of their chemical constituents. Phytochemical screening was performed to figure out the presence of secondary metabolite in G. tricorne. Crude Methanolic extract (Gt.Crd), which was obtained from the aerial part while the fatty acids were extracted from the seeds, which were later on analyzed by GCMS. Similarly, Well Diffusion and MTT method were used for antibacterial activity and cancer cell line assay respectively. To evaluate the cytotoxic potential, brine shrimps were used. Likewise, in Gas Chromatography-Mass Spectroscopy (GC-MS) analysis a total number of 23 compounds were identified in Gt.Crd extract out of which 7 compounds were sorted out to have some sort of toxicity profile. In the same fashion, 5 fatty acids were identified in the seeds of G. tricorne. Moreover, among the fractions, chloroform fraction (Gt.Chf) exhibited greater zone of inhibition (ZOI) 20.37 mm followed by Gt.Crd 18.40 mm against S. aureus and S. pyogenes respectively. In cytotoxicity Gt.Chf was more active followed by ethyl acetate fraction (Gt.Eta) by exhibiting 88.32±0.62% (LC50=60 µg/mL) and 73.95±2.25% (LC50=80 µg/mL) respectively at 1000 µg/mL concentration of the tested sample. Gt.Chf exhibited greater cell line inhibitory activity (IC50=61 µg/mL) against HeLa cell line. Similarly, Gt.Crd displayed IC50 values of 167.84 µg/mL and 175.46 µg/mL against HeLa and NIH/3T3 cell line respectively. Based on the literature review and screenings, it may be concluded that the aerial part and seeds of G. tricorne are the rich sources of bioactive compounds. The results of the current study also authenticate the scientific background for the ethnomedicinal uses of G. tricorne.

Resumo Este estudo tem como objetivo relatar o conhecimento indígena sobre a flora medicinal dos habitantes do entorno da maior floresta artificial plantada do mundo, a Changa Manga, no Paquistão. Os dados foram coletados por meio de entrevistas diretas e reuniões em grupo de 81 habitantes, incluindo 32 curandeiros locais, com informações sobre o uso de plantas medicinais indígenas durante o período de um ano. Diferentes ferramentas estatísticas foram aplicadas para analisar os dados, incluindo citação de frequência (FC), citação de frequência relativa (RFC), valor de uso, fator de consenso dos informantes e nível de fidelidade. Este estudo relatou 73 espécies de plantas pertencentes a 37 famílias de plantas e 46 gêneros. A maioria das espécies de plantas pertence à família Compositae. As plantas medicinais mais utilizadas foram P. hysterophorus L., P. dactylifera L., S. indicum L., P. harmala L., P. emblica L. e A. indica A. Juss. O maior número de espécies foi usado para curar distúrbios gastrointestinais. O maior nível de fidelidade (68,18%) foi de E. helioscopia para cura de distúrbios gastrointestinais. Os usos máximos em fresco (17) foram relatados por C. dactylon (L.) Pars. enquanto o maior número de espécies relatando usos frescos em número semelhante foi de 13. Neste estudo, cinco novas plantas estão sendo relatadas pela primeira vez no Paquistão por seu valor etnomedicinal. Nossos dados refletem o uso exclusivo das plantas medicinais na área de estudo. As ferramentas estatísticas utilizadas no estudo mostraram-se úteis para apontar as plantas mais importantes e específicas da categoria de doença. Plantas de alto valor de uso e as novas plantas medicinais relatadas podem ser uma importante fonte de isolamento de compostos farmacologicamente ativos.

Abstract This study aims at reporting the indigenous knowledge of the medicinal flora from the inhabitants of surroundings of the World’s largest artificial planted forest “Changa Manga”, Pakistan. Data were collected by direct interviews and group meetings from 81 inhabitants including 32 local healers having information regarding the use of indigenous medicinal plants over a period of one year. Different statistical tools were applied to analyze the data including Frequency citation (FC), Relative frequency citation (RFC), Use Value, Factor of informants consensus and fidelity level. This study reported 73 plant species belonging to 37 plant families and 46 genera. The majority of plant species belong to compositae family. The most commonly used medicinal plants were P. hysterophorus L., P. dactylifera L., S. indicum L, P. harmala L., P. emblica L., and A. indica A.Juss. The greatest number of species was used to cure gastrointestinal disorders. The highest fidelity level (68.18%) was of E. helioscopia to cure gastrointestinal disorders. Maximum fresh uses (17) were reported by C. dactylon (L.) Pars. While the highest number of species reporting fresh uses in similar number was 13. In this study, five novel plants are being reported for the first time in Pakistan for their ethnomedicinal worth. Our data reflect unique usage of the medicinal plants in the study area. The statistical tools used in the study proved useful in pointing the most important and disease category specific plants. High use value plant and the new reported medicinal plants might prove an important source of the isolation of pharmacologically active compounds.

Resumo A cultura do milho é utilizada na alimentação humana, pecuária e avícola, bem como na panificação, flocos de milho, xarope de milho, amido de milho e óleos de milho. O estudo de campo consistiu em um ensaio experimental sobre a incidência desse complexo de insetos-praga na cultivar de milho Azam durante a temporada de Kharif 2020 na Estação de Pesquisa Agrícola, Baffa, Mansehra. O ensaio foi estabelecido no Randomized Complete Block Design (RCBD) e, em seguida, dividido em três repetições. O resultado obtido no ensaio mostrou que várias espécies de pragas foram registradas durante o período experimental; no entanto, foi observado um baixo nível da população. As espécies de insetos obtidas foram pulgão-da-folha-do-milho (6,90 ± 5,5) – por polegada quadrada –, cigarrinha-do-milho (1,32 ± 0,63), broca-do-caule-do-milho (0,63 ± 0,29), besouro-da-pulga-do-milho (0,43 ± 0,28), tripses (0,38 ± 0,22), lagarta-cabeluda (0,21 ± 0,22), gafanhoto (0,17 ± 0,11) e mosca (0,11 ± 0,08) ao longo da temporada

Abstract The maize crop is used as food for humans, livestock and poultries forms, it is also used in bread making, corn flakes, corn syrup, corn starch and corn oils. The field study consisted of one experimental trial, about the incidence of that insect pest complex on maize cultivar Azam during the Kharif season 2020 at the Agricultural, Research Station, Baffa, Mansehra. The trial was laid out in the Randomized Complete Block Design (RCBD), and then it was divided into three replications. The result obtained from the trial showed that a number of the pest species were recorded during the experimental period; however, the population was noticed at a low level. The obtained insect species were corn leaf aphid (6.90 ± 5.5) per square inch, corn leafhopper (1.32 ± 0.63), maize stem borer (0.63 ± 0.29), corn flea beetle (0.43 ± 0.28), Thrips (0.38 ± 0.22), Hairy caterpillar (0.21 ± 0.22), Grasshopper (0.17 ± 0.11) and shoot fly (0.11 ± 0.08) throughout the season

Resumo Nigella sativa é conhecida pelo perfil de segurança, contendo uma grande variedade de compostos antivirais úteis. A principal protease (Mpro, 3CLpro) da síndrome respiratória aguda grave 2 (SARS-CoV-2) está sendo considerada como um dos alvos virais mais atraentes, processando as poliproteínas durante a patogênese e replicação viral. Na presente investigação analisamos a potência do componente ativo, timoquinona (TQ) de Nigella sativa contra SARS-CoV-2 Mpro. As estruturas de TQ e Mpro foram recuperadas de PubChem (CID10281) e Protein Data Bank (PDB ID 6MO3), respectivamente. O Mpro e o TQ foram acoplados e o complexo foi submetido a simulações de dinâmica molecular (MD) por um período de 50ns. O efeito de dobramento de proteínas foi analisado usando o raio de giração (Rg) enquanto a estabilidade e a flexibilidade foram medidas usando a raiz quadrada média dos desvios (RMSD) e a raiz média quadrada da flutuação (RMSF), respectivamente. Os resultados da simulação mostram que o TQ está exibindo boa atividade de ligação contra o SARS-CoV-2 Mpro, interagindo em muitos resíduos presentes no sítio ativo (His41, Cys145) e também o Glu166, facilitando o formato da bolsa. Além disso, são necessárias abordagens experimentais para validar o papel do TQ contra a infecção pelo vírus. O TQ está interferindo nos resíduos de manutenção do bolso, bem como no sítio ativo do vírus Mpro, que pode ser usado como um potencial inibidor contra o SARS-CoV-2 para um melhor gerenciamento da Covid-19.

Abstract Nigella sativa is known for the safety profile, containing a wealth of useful antiviral compounds. The main protease (Mpro, 3CLpro) of severe acute respiratory syndrome 2 (SARS-CoV-2) is being considered as one of the most attractive viral target, processing the polyproteins during viral pathogenesis and replication. In the current investigation we analyzed the potency of active component, thymoquinone (TQ) of Nigella sativa against SARS-CoV-2 Mpro. The structures of TQ and Mpro was retrieved from PubChem (CID10281) and Protein Data Bank (PDB ID 6MO3) respectively. The Mpro and TQ were docked and the complex was subjected to molecular dynamic (MD) simulations for a period 50ns. Protein folding effect was analyzed using radius of gyration (Rg) while stability and flexibility was measured, using root means square deviations (RMSD) and root means square fluctuation (RMSF) respectively. The simulation results shows that TQ is exhibiting good binding activity against SARS-CoV-2 Mpro, interacting many residues, present in the active site (His41, Cys145) and also the Glu166, facilitating the pocket shape. Further, experimental approaches are needed to validate the role of TQ against virus infection. The TQ is interfering with pocket maintaining residues as well as active site of virus Mpro which may be used as a potential inhibitor against SARS-CoV-2 for better management of COVID-19.

Resumo A produção de plantas transgênicas com características agronômicas e hortícolas desejadas vem ganhando grande importância por atender às demandas da crescente população. A transformação genética também é um passo fundamental para estudar os fundamentos das ciências das plantas. Foram desenvolvidos e utilizados diferentes protocolos de transformação, que são confiáveis e eficientes. Esses protocolos usaram genes de resistência a antibióticos ou herbicidas incorporados ao gene de interesse para identificar plantas transformadas e não transformadas. Esses genes marcadores podem representar uma ameaça ao ser humano e ao meio ambiente. O uso de marcadores visuais permite a observação direta e fácil de plantas transformadas com mais precisão. No estudo atual, foi projetado um cassete de genes com o gene da hidroxilase de produção de pigmentos (PPH) sob promotor específico de fibra (GhSCFP) e terminador NOS a jusante. Após verificar a eficiência estrutural e funcional do gene otimizado por códons usando ferramentas de bioinformática, o cassete foi enviado para síntese química a partir de fonte comercial. O cassete do gene do pigmento (PPH_CEMB), clonado em pCAMBIA-1301, foi transformado em Agrobacterium por eletroporação. O método de imersão floral mediado por Agrobacterium foi usado para transformar a inflorescência de Camelina sativa. Após a formação de sementes, foi observado um total de 600 sementes com mudança de cor, das quais 19 desenvolveram uma coloração marrom-avermelhada, enquanto as 581 restantes permaneceram amarelas. A eficiência de transformação calculada com base na mudança de cor foi de 1%. A análise de PCR das folhas obtidas após a semeadura de sementes avermelhadas confirmou a transformação do gene produtor de pigmentos, enquanto não foi observada amplificação por PCR em folhas de plantas de sementes do tipo selvagem. A partir dos resultados, é evidente que a transformação da inflorescência de C. sativa mediada por Agrobacterium é uma técnica muito eficiente e favorável ao ambiente não só para a detecção de plantas transformadas, mas também para estudar processos celulares básicos.

Abstract Production of transgenic plants with desired agronomic and horticultural traits has gained great importance to fulfill demands of the growing population. Genetic transformation is also a fundamental step to study basics of plant sciences. Different transformation protocols have been developed and used which are reliable and efficient. These protocols used antibiotic or herbicide resistance genes incorporated along with gene of interest to identify transformed plants from non-transformed ones. These marker genes may pose a threat to human and environment. Use of visual markers enables direct and easier observation of transformed plants with more precision. In current study a gene cassette with ‘pigment production hydroxylase (PPH) gene under fiber specific promoter (GhSCFP) and downstream Nos-terminator was designed. After checking the structural and functional efficiency of codon optimized gene using bioinformatics tools, the cassette was sent for chemical synthesis from commercial source. The pigment gene cassette (PPH_CEMB), cloned in pCAMBIA-1301, was transformed into Agrobacterium through electroporation. Agrobacterium-mediated floral dip method was used to transform Camelina sativa inflorescence. After seed setting a total of 600 seed were observed for change in color and out of these, 19 seeds developed a reddish-brown coloration, while the remaining 581 seeds remained yellow. The transformation efficiency calculated on basis of color change was 1.0%. PCR analysis of leaves obtained after sowing reddish seeds confirmed the transformation of pigment production gene, while no PCR amplification was observed in leaves of plants from wild type seeds. From the results it is evident that Agrobacterium-mediated transformation of C. sativa inflorescence is very efficient and environment friendly technique not only for detection of transformed plants but also to study basic cellular processes.

Resumo O estudo transversal atual foi realizado entre setembro de 2019 e janeiro de 2020 no Departamento de Patologia Mardan Medical Complex (MMC), Mardan, e no District Headquarter Hospital North Waziristan, Khyber Pakhtunkhwa (KP), Paquistão. Os objetivos do presente estudo foram determinar a prevalência da leishmaniose e seus fatores de risco associados em distritos selecionados da província de KP, Paquistão. Ao todo, 374 (n = 374) pacientes com leishmaniose foram incluídos no presente estudo. Amostras de pele da borda da úlcera foram coletadas. As lâminas foram coradas pelo corante Giemsa e examinadas quanto à presença de amastigotas. As prevalências de pacientes infectados por leishmania em diferentes regiões de KP foram as seguintes: região do Waziristão Norte 53,7 (n = 201), distrito Mardan 34,7% (n = 130); distrito Nowshera 6,7% (n = 25), distrito Swabi 1,1% (n = 4) e outros distritos, ou seja, Dir, Malakand, Buner e Bajawarr foram 3,7% (n = 14). A frequência de leishmaniose foi maior no sexo masculino e a maioria dos pacientes infectados estava na faixa etária < 10 anos. Entre n = 374 pacientes, 95,7% (n = 358) tinham leishmaniose cutânea enquanto 3% (n = 11) tinham infecção do tipo mucocutâneo e 1,3% (n = 5) pacientes tinham infecção cutânea e mucocutânea. Após tratamento com estibogluconato de sódio (SSG), 97% (n = 362) apresentaram sinais clínicos de recuperação completa ou parcial de suas lesões cutâneas. Conclusivamente, a maior incidência de infecção por leishmania ocorreu durante o curto período de estudo e a maioria dos casos apresentou resposta positiva ao tratamento.

Abstract Current cross-sectional study was carried out between September 2019 to January 2020 at the Department of Pathology, Mardan Medical Complex (MMC), Mardan, and District Headquarter Hospital North Waziristan, Khyber Pakhtunkhwa (KP), Pakistan. The objectives of the current study were to determine the prevalence of leishmaniasis and its associated risk factors in selected districts of KP province, Pakistan. Altogether, three hundred and seventy-four (n=374) leishmaniosis patients were included in the current study. Skin specimen from the ulcer border were collected. The slides were stained by Giemsa stain and examined for the presence of amastigote. The prevalence of leishmania infected patients in different region of KP were as follows: North Waziristan region 53.7 (n=201) District Mardan 34.7% (n=130); District Nowshera 6.7% (n=25), District Swabi 1.1% (n=4) and other Districts i.e. Dir, Malakand, Buner and Bajawarr were 3.7% (n=14). The frequency of leishmaniasis were more in male and majority of the infected patients were in the age group of <10 years. Among n=374 patients 95.7% (n= 358) had cutaneous leishmaniasis while 3% (n= 11) had mucocutaneous type of infection and 1.3% (n= 5) patients had both cutaneous and mucocutaneous infection. Upon treatment by Sodium stibogluconate (SSG) 97% (n=362) showed clinical signs of complete or partial recovery of their skin lesions. Conclusively, highest incidence of leishmania infection occurred during short study period and majority of the cases showed positive response to treatment.

Resumo Os faisões estão diminuindo em todo o mundo, por isso informações atualizadas sobre sua população e seus habitats são importantes para conservação e manejo. O presente estudo foi realizado no vale Palas, distrito de Kohistan, Paquistão, no final da primavera (maio e junho) de 2020 e início da primavera (março e abril) de 2021 para avaliar a população e o estresse antropogênico. O foco principal foram três espécies simpátricas de faisão, incluindo Tragopan de Chifres Ocidental (Tragopan melanocephalus), Monal-do-Himalaia (Lophophorus impejanus) e Faisão Koklass (Pucrasia macrolopha). Foi utilizado o “Método de Contagem de Chamadas” para avaliar a população em campo, e foi realizada uma pesquisa por questionário para documentar a avaliação de risco dos moradores locais do vale. As avaliações populacionais revelaram que o Faisão Koklass está mais adaptado às crescentes atividades antrópicas e que sua população se mantém mais ou menos semelhante à população de 22 anos atrás. Nos últimos 22 anos, Tragopan de Chifres Ocidental e Monal-do-Himalaia perderam cerca de 40 a 50% de suas populações. A interferência humana, sob a forma de caça ilegal, desmatamento e sobrepastoreio, era comum no vale. O estudo conclui que o habitat do vale Palas é ideal para espécies de faisão; no entanto, a interferência humana, por meio de urbanização, fragmentação de habitat, caça ilegal e desmatamento, está ocorrendo em ritmo acelerado, causando estragos na população de faisões.

Abstract Pheasants are declining everywhere in the world and therefore updated information about their population and habitats are important for conservation and management. The present study was conducted in the Palas Valley, District Kohistan, Pakistan in late spring (May and June) 2020 and early spring (March and April) 2021 to assess the population and anthropogenic stress. The major focus was on three sympatric pheasant species, including Western Horned Tragopan (Tragopan melanocephalus), Himalayan Monal (Lophophorus impejanus), and Koklass Pheasant (Pucrasia macrolopha). We used the “Call Count Method” for the population assessment in the field, and a questionnaire survey was conducted to document the risk assessment of local residents of the valley. The population assessments revealed that the Koklass Pheasant is more adapted to increasing anthropogenic activities and its population appeared more or less similar as 22 years ago. In the past 22 years, Western Tragopan and Himalayan Monal have lost about 40–50% of their populations. Human interference in the form of illegal hunting, deforestation, and overgrazing was found to be common in the valley. The study concludes that the Palas Valley habitat is ideal for pheasant species; however, human interference in the form of urbanization, habitat fragmentation, illegal hunting, and deforestation is occurring at a rapid pace, causing havoc in the pheasant population.

Resumo Surtos frequentes do vírus da gripe aviária H9N2 no Paquistão revelaram que esse subtipo se tornou endêmico na avicultura e, além das perdas econômicas, representa uma ameaça à saúde pública. O presente estudo descreve a caracterização molecular e as alterações patológicas em frangos de corte naturalmente infectados com a atual cepa H9N2 e sua dinâmica filogenômica. Neste estudo, amostras de tecidos (traqueia, pulmões, rim e intestino) de 100 lotes comerciais de frangos foram coletadas de julho de 2018 a agosto de 2019. As amostras foram submetidas à detecção molecular, filogenia e posterior exame patológico. O comprimento completo do gene HA foi amplificado com sucesso em cinco amostras. O sequenciamento de nucleotídeos revelou amostras positivas colocadas em um clado pertencente à sublinhagem B2 do genótipo G1 e categorizado como LPAIV com base na sequência de aminoácidos do gene da hemaglutinina (HA) no local de clivagem (PAKSSR/G). A análise genética do gene da HA revelou: nt = 80,5%-99,5%; aa = 83,8%-98,9% de homologia com cepas de H9N2 relatadas anteriormente no Paquistão e em países vizinhos (A/Quail/Hong Kong/G1/97). As lesões macroscópicas incluíram aerossaculite leve, hemorragias leves, congestão difusa e exsudato purulento na mucosa traqueal, cilindro fibrinonecrótico no lúmen da traqueia e congestão pulmonar leve. As alterações histopatológicas incluíram descamação de células epiteliais, infiltração de células inflamatórias na traqueia, infiltração de células mononucleares (MNCs), congestão pulmonar e exsudato no lúmen dos parabrônquios, congestão peritubular nos rins com degeneração das células epiteliais tubulares, alterações degenerativas nas células epiteliais das vilosidades intestinais e hiperplasia de células caliciformes. A análise imunoistoquímica confirmou a presença do antígeno AIVH9N2 na traqueia, nos pulmões, no rim e no intestino. A microscopia eletrônica revelou alterações ultraestruturais na traqueia, incluindo cílios degenerados, inchaço mitocondrial e retículo endoplasmático aumentado. Com base em todas as análises, o presente estudo revelou a distribuição do vírus H9N2 do genótipo G1 em Punjab, Paquistão, com patogenicidade de leve a moderada.

Abstract Frequent outbreaks of avian influenza H9N2 virus in Pakistan revealed that this subtype has become endemic in the poultry industry and, besides economic losses, poses a threat to public health. The present study describes the molecular characterization and pathological alterations in naturally infected broiler chickens with the current H9N2 field strain and their phylogenomic dynamics. In this study, tissue samples (trachea, lung, kidney and intestine) from 100 commercial chicken flocks were collected from July 2018 to August 2019. Samples were subjected to molecular detection, phylogeny and subsequent pathological examination. The complete length of the HA gene was successfully amplified in five samples. Nucleotide sequencing revealed positive samples placed in a clade belonging to the B2 sub-lineage of the G1 genotype and categorized as LPAIV based on the amino acid sequence of the HA gene at the cleavage site (PAKSSR/G). Genetic analysis of the haemagglutinin (HA) gene revealed nt: 80.5%-99.5%; aa: 83.8%-98.9% homology to H9N2 strains reported previously from Pakistan, neighbouring countries, and (A/Quail/Hong Kong/G1/97). Gross lesions include a slight airsacculitis, mild hemorrhages, diffuse congestion and purulent exudate in tracheal mucosa, fibrinonecrotic cast in the trachea lumen and mild pulmonary congestion. Histopathological alterations include sloughing of epithelial cells and infiltration of inflammatory cells in the trachea, mononuclear cells (MNCs) infiltration, pulmonary congestion and exudate in the lumen of parabronchi, peritubular congestion in the kidneys with degeneration of tubular epithelial cells and degenerative changes in the intestinal villi epithelial cells and goblet cell hyperplasia. Immunohistochemistry analysis confirmed the presence of AIVH9N2 antigen in the trachea, lungs, kidney and intestine. Electron microscopy revealed ultrastructural changes in the trachea, including degenerated cilia, mitochondrial swelling and enlarged endoplasmic reticulum. Based on all essential analysis, the present study revealed the distribution of the H9N2 virus of G1 genotype in Punjab, Pakistan, with mild to moderate pathogenicity.

Resumo Mutações de ocorrência natural na proteína morfogenética 15 (BMP15) estão associadas à diminuição da taxa de ovulação (TO), tamanho da ninhada (TN) e esterilidade. Estudar a BMP15 na raça Cholistani para elevar o status socioeconômico e o conhecimento da criação de ovinos Cholistani no sul de Punjab, Paquistão. Em nosso estudo, 50 ovelhas Cholistani inférteis sem parentesco sanguíneo foram rastreadas para mutações BMP15. Para tanto, um DNA de alta qualidade foi extraído do sangue dessas ovelhas, seguido de concepção do primer, amplificação da reação em cadeia da polimerase (PCR), sequenciamento de DNA e análises in silico. Do total de 50 amostras, 9, incluindo caso 1 (T3), caso 2 (T8), caso 3 (T17), caso 4 (T22), caso 5 (T25), caso 6 (T33), caso 7 (T40), caso 8 (T44) e caso 9 (T47), foram consideradas positivas para uma variedade de mutações BMP15 novas e já relatadas. Mais análises in silico das mutações observadas mostraram o impacto funcional dessas mutações em diferentes características (peso molecular, PI teórico, meia-vida estimada, índice de instabilidade, localização subcelular e confirmação 3D) das proteínas codificadas, possivelmente alterando a funcionalidade normal. Nossos achados confirmaram o possível papel essencial das mutações BMP15 na infertilidade de ovelhas Cholistani.

Abstract Naturally occurring mutations in morphogenetic protein 15 (BMP15) are associated with decreased ovulation rate (OR), litter size (LS), and sterility. It is of a great interest to elucidate BMP15 gene in Cholistani sheep breed to uplift socio-economic status and the knowledge of Cholistani sheep breeding in Southern Punjab, Pakistan. In our study, a total of 50 infertile Cholistani sheep aged between 2-6 years and having no blood relation were screened for BMP15 mutations. For this purpose, a high-quality DNA was extracted from the blood of sheep followed by primer designing, Polymerase Chain Reaction (PCR) amplification, DNA sequencing, and in silico analyses. Out of total 50 samples, 9 samples including case 1 (T3), case 2 (T8), case 3 (T17), case 4 (T22), case 5 (T25), case 6 (T33), case 7 (T40), case 8 (T44), and case 9 (T47) were found positive for a variety of already reported and novel BMP15 mutations. Further in silico analyses of the observed mutations have shown the functional impact of these mutations on different characteristics (molecular weight, theoretical PI, estimated half-life, instability index, sub-cellular localization, and 3D confirmation) of the encoded proteins, possibly altering the normal functionality. In a nutshell, findings of this study have confirmed the possible essential role of the BMP15 mutations in the infertility of the Cholistani sheep.